5I57A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
285
structure length
281
Chain Sequence
STRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 281
sequence length 285
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57A02
2W7YA 4WKMA 4DCXA 3LBSA 4N07A 5BUUA 4XKPA 2Y7PA 2DE4A 4NE4A 1BP5A 3W15C 4KYSA 1Z7ME 1B4HA 3H6VA 5AA4B 4LZ7A 3IB1A 3GLBA 4BDOA 1FTJA 4JWYA 1MXUA 3WAEA 1BLFA 3RQTA 4EXKA 3JV9A 1MY2A 3O6HA 3RLFE 2VP1A 1OVBA 3ODBA 1TWYA 3G3GA 4PFUA 4H0WA 4ELPA 4BDRA 2P0SA 1Y4CA 1DSNA 3TZAA 2XXHA 1QW0A 1Y20A 1LFIA 1NKXA 3QK6A 1FQFA 5DVIA 4YMBA 3PGFA 5B70A 1JETA 1Q35A 3FVKA 1EH3A 4N6PA 4POXA 1IXGA 2OWTA 3C32A 4F2QA 1MXVA 2ONSA 2O1MA 1P1QA 1Y9UA 2ESNA 3MPKA 3KFMA 4X1DA 3VLWA 5DEXA 1FTOA 2ZNTA 1HSEA 4GLIA 4OMBA 3MP8A 4G4PA 3BFTA 2GHBA 2OBGA 1B3GA 1B9JA 4R2FA 3EHTA 3Q25A 4THIA 2O7IA 3MWBA 4LA9A 4R2BA 4F39A 1I69A 5I2NA 3CFLA 5H8QB 1ZJLA 1B1HA 5CBRA 3S9LC 4KD5A 3QUJA 3OD7A 3T22A 1BKAA 3DLNA 3QSLA 4JSDA 4GL8A 4IO6A 4OTEA 3E9XA 4YKKA 2O69A 3O29A 1UIUA 1LAXA 1B52A 2BJJX 1ATGA 2XD2A 1UTBA 4ESXA 4QSEA 2ZNSA 5I58A 3FASA 1QUJA 2RCAA 4ZE9A 2H5YA 1CE2A 4NWCA 2UVHA 4O3AA 4E0XA 3DP6A 2RCBA 3RNNA 3KN8A 1MM6A 5CM6A 3EN3A 2OWSA 1CB6A 3TCFA 4IO3A 4MH5A 1SW5A 4FEDA 4EF1A 2ZMBA 4Q5TA 3VFJA 5L9MA 2AYSA 3H3GA 2O6AA 4F31B 3SKPA 2I3VA 3KEIA 1SW4A 1FTKA 3K6UA 4GIZA 3O2AA 3H6TA 3TTLA 1UIVA 4FJPA 3FXQA 3IAZA 1AL3A 3DM0A 4OENA 4OERA 1ZTYA 3KSXA 5DT6A 1VFEA 1B7ZA 3T9XB 3OSQA 4NF5A 4Q30B 5B7DA 4P0IA 5DTBA 3T96B 1B3EA 4NF8A 2F34A 1MY0A 2VD2A 1LCFA 1H43A 3K6XA 3VXBA 2XD3A 2PBWA 3FATA 2AIXA 2I6EA 3ILUB 1UQWA 1Z7NE 2YJPA 3PU5A 4XKRA 4YB6A 3IORA 3S9NC 2VD3A 3P7IA 3D4GA 1B0LA 2Y7WA 1EU8A 4UA8A 5AA3A 4WXJA 3EQ1A 5FHMA 2PYYA 1QULA 5A5XA 4Z0IA 1EZ9A 3V5AA 3VLUA 1N7WA 2B3BA 2F8DA 3KBRA 5CI5A 4BDQA 4TOZA 2A5SA 1B6HA 3IO4A 1VFDA 4JWXA 5F7VA 4NF4B 2DWJA 2V25A 2UYEA 2H9BA 4QFNA 2DE3A 2AL4A 1PB9A 4IB2A 3IO6A 5TPAB 1A99A 4F29A 2F78A 1URDA 4G68B 3TCHA 4BLAA 1UTHA 4MLVA 3MZ9A 3RN8A 4ZEDA 3BBRA 1TT1A 2RC9A 1N0TA 3MVYA 2HFBA 2HAUA 1SI1A 4ELRA 4HS7A 3RY3A 2THIA 3I3VA 3QXMA 2Q9TA 1FQEA 4GL0A 3A09A 1B40A 5JEIA 4OHNA 2PVUA 1B51A 2IA4A 1IEJA 3MVWA 3QUFA 4LZ8A 4M1VA 4LP2B 4QSDA 4X9TA 4DXUA 4FE8A 1SW2A 4I62A 1IXCA 4FEBA 3PV0E 3DELB 3OOAA 3B6QA 1MXXA 1J1NA 4LQ5A 4HCWA 5CMCA 1XS5A 3VLVA 3ZKLA 1PBQA 4JBZA 5KCJA 1MDQA 2ZXTA 3KJTA 4U1ZA 2Z22A 4WEPA 5I2KA 2Z23A 3SERA 1SQYA 1XHYA 4KPTA 4R75A 5EHSA 1MQHA 3V89B 2ZYMA 1URSA 4BDNA 1QVSA 2Q88A 3SETA 1JEVA 1A40A 3SDFA 1R6ZA 3LSXA 2F35A 3MJNA 1JW5A 3PMVA 4QSCA 1ZMGA 1PB7A 2F36A 4F22A 3U72A 2ABHA 1IZ1A 2VOZA 2HZLA 3FGSA 4MBPA 1LFGA 3RTWB 3U8QA 4ELOA 4NF6B 4OEVA 2LAOA 1XVYA 1B2HA 3H06B 4IO7A 1SVXB 4HTGA 2UVIA 3SEVA 2FNCA 1SBPA 3C31A 1SYIA 3KN7A 3A3CA 3K02A 3IB0A 3S4UA 4P11A 1B5HA 4RY1A 5CBSA 3UIFA 1MS7A 2KLFA 4AB6A 4Q0CA 3S9MC 2P1SA 4UACA 3ZSFA 5CRYA 1NL5A 3IJOB 3G7WA 2A5TB 1FTLA 1B7HA 5CMMA 2QJEA 1MXWA 3M8UA 4C0RA 3I5OA 2DOJA 3CRBA 2XXQA 3MPLA 3HHFA 1DTZA 4H5FA 4TLMB 1A7LA 1LSTA 2QRYA 4MFIA 2ALUA 3U1OA 1OQGA 2M8CA 4F1VA 5I2NB 3K00A 4ZEIA 2HZKA 3PD8A 3LR1A 1BIYA 2CMOA 1JW4A 3C9HA 1LGBC 4IO4A 4NEDA 4I1DA 1I6BA 3UORA 3PUZE 3F11A 3QYTA 2NUVA 4PFTA 1M5EA 2NOOA 3OXNA 1DOTA 2XXWA 3FJGA 3JYRA 1MXZA 2DQVA 2R9JA 1UTBB 3LSLA 1A8FA 3T66A 2QPQA 4E0WA 1FQCA 3H6WA 4PFYA 2F6GA 5ISUA 1MH4A 1LAGE 3CG3A 1LBBA 3RPWA 2FYIA 3TTRA 5H8SA 4R6KA 4ZDMA 4Z7EA 4OESA 3HCQA 3TTNA 2XHDA 2AL5A 3C35A 1N04A 4U1OA 3GBAA 4LONB 2UXAA 5KDTA 2Z8DA 2DWHA 4F3PA 3PPPA 1B32A 3USDA 3CR9A 2HXWA 4FIMA 1TFDA 5IAIA 3D4CA 3TTKA 3OO9A 1WDNA 1ZU0A 3S2VA 3GZGA 1T0KA 4KR5A 2XXRA 4NF5B 2ZNUA 3AXFA 5AA1A 5ICQA 3MW0A 4I8CA 1B0HA 1JVXA 4NF8B 1D9YA 4G68C 5H8HB 3G3JA 1N3XA 1Y3NA 5AA2A 3FV1A 3OO8A 1ZIUA 1R9LA 1OMPA 2PMSA 3ONMA 4IGTA 1MY1A 4JSOA 3RT8A 1MPDA 2R6GE 1MPBA 1LBCA 3T93B 2IEEA 5DVFA 2ONKE 3CSBA 2Y7IA 3H4ZA 2QS4A 3TTMA 3OSRA 4YKPA 2Z8FA 2XXIA 1VSOA 4U4SA 1M5DA 2DXYA 3Q29A 1LB8A 4F3BA 1M5CA 5TU0A 4F18A 2ONRA 4ISUA 1II5A 3W9VA 4PFWA 2V93A 4R74A 1NFTA 3OEKA 5JTYA 4U2RA 2Y7RA 3FVOA 5LOMA 1UTHB 3DP4A 3H7MA 1Y1MA 3N5LA 4U4XA 1Y3QA 3MVZA 1PC3A 1OIBA 2F5XA 3UK4A 2HCAA 4YAHX 2X7PA 3M3FA 4DLDA 2Y84A 3K6WA 3SEXA 1FCKA 2OZZA 3KG2A 1R1NA 1L5TA 1NH7A 4GD5A 3RT6B 3R7XA 2QSXA 3O6GA 3B6WA 3HHGA 1AMFA 3EF7A 4QFPA 3FJ7A 2E0SA 3E3KA 2DXRA 1MRPA 4RJZA 5H8NB 5KCJB 3K01A 4YMAA 1XVXA 1USYH 1B1XA 1PB8A 3IL1B 1IXIA 2O84X 3LSWA 3K4UA 3OEMA 1MQGA 4P0GA 3R6UA 3MAMA 4L17A 1MM7A 5BWJA 4X48A 4G8HA 4JXIA 1A54A 3LC8A 1EZOA 3PUXE 3T9HB 2O1LA 5L8DA 4PETA 2O7UA 2Z8EA 4DXBA 3OO6A 3GBBA 4QRZA 3SESA 4ZZEA 1FW0A 3TDJA 5H8FB 3O28A 2XXVA 4ESWA 1A8EA 3CFXA 1KWHA 4U22A 3I6VA 2DWIA 4TLLB 2CZLA 1MH3A 1B4ZA 1VR5A 2X7QA 3MP1A 2F7AA 3VV5A 3PUWE 1US5A 3BFUA 3MUQA 3TYHA 2ZYNA 5I59A 3IJXB 3PD9A 4TQUQ 1JNFA 4R6YA 1RKMA 2F7CA 3JZJA 1XC1A 3EHSA 1O7TA 2REGA 4WEDA 3TFLA 3TQLA 1AOVA 3SEYA 2DS9A 3K1PA 1HSJA 4DCYA 1POTA 1LAHE 3H03A 3H6UA 1DMBA 1FQDA 4M4GA 4C1UA 1P1UA 3U93A 2XXYA 1M5BA 1MY3A 4OXVA 4R6HA 3TAJA 4ZEKA 2XXPA 1ZBMA 4GXAA 5AA2D 3SEUA 3C4MA 1P1OA 4GOTA 3T9VA 4EQ7A 2I4CA 4PE5B 3HSTA 4F3SA 1OQHA 3LSFB 3KOSA 1D3KA 2NXOA 2HEUA 1B3LA 1Y3PA 1NNKA 3FXUA 2UYFA 3G3FA 3ZS6A 5AE4A 4HW8A 1NNTA 1B5JA 4YKIA 1H76A 3SEWA 3MBPA 2D21A 4XIGQ 5DVJA 3OELA 4G2ZA 3TQWA 1I6QA 2YLNA 2B3FA 3CSGA 3IK6B 3FJMA 3VE1B 4RA1A 4F3GA 3K2DA 1IXHA 5I57A 2ZYKA 1H3DA 1MQDA 4XKNA 1URGA 3ILTB 2H99A 4EDPA 1DPEA 1P1NA 2GFEA 4MLQA 1TXFA 3KN3A 1GTKA 5IKBA 3MZ1A 1MXYA 2OLBA 1N84A 5EHMA 5J1DA 4FORA 4H67A 3S9EA 4F1YA 1IITA 1AH5A 4RPNA 3E13X 2F97A 3OMBA 1N3WA 2PT1A 1B3FA 4FECA 3FVGA 1MY4A 4IY5A 1HSLA 5HPQA 3FXRA 2I0BA 3MC2A 3K6VA 4GVOA 5CC2A 2I48A 2XX8A 2P2AA 3Q26A 4DXCA 3RTFB 4QF9A 5DEXB 3QIMA 5KDTB 5I84A 2F6PA 2OK2A 1S9TA 3FIRA 3FUZA 4GXSB 2V3TA 4DDDA 4H1XA 4KYEA 1OLAA 3CG1A 3PPRA 1EZPA 2UVJA 1YCJA 4JB7A 1XOCA 2D5WA 4YU0A 3GXAA 3BKIB 4AB5A 5TP9A 1MDP1 2VHAA 5AA2B 4ELQA 1MQIA 4YICA 2DVZA 5ITPA 1YTVA 4BDLA 1SDXA 3QAXA 4NF6A 4KQPA 1GR2A 3VVDA 3TELA 3ZKKA 5I58B 4POWA 3FD3A 2QL3A 3ECRA 4R9GA 1LFHA 4R73A 4U23A 1S7YA 1I6AA 5I56A 3EPEA 3C36A 3K1MA 3L6GA 1SI0A 3UN6A 4ZS9A 5CMBA 1PEBA 1NMUA 2RC8A 2I58A 4LZ5A 3M3LA 1LCTA 4LATA 2RF1A 5JTYB 5M2VA 2DE2A 4H5GA 4DZ1A 4QFKA 2Q2AA 1R9QA 3O97A 3MP6A 4RK9A 4O3CA 4G8MA 1RYXA 3K0VA 4R72A 3VVEA 3FZVA 4QFOA 4H8JA 2A5TA 1B7UA 1OVTA 4RK2A 4ECFA 3IOWA 3OO7A 3U94A 1Y4TA 2GHAA 1ANFA 2HAVA 2I3WA 4U21A 3HO7A 3VDFA 1POY1 1QUKA 3TKDA 5KZTA 2Y7KA 4R9FA 2QMWA 1H44A 3KJ7A 4G8NA 3IX1A 1B46A 4H65A 1S50A 3V8XB 2QMXA 4IGRA 2NVUB 1B3HA 3W9WA 1USYE 3K1NA 4KCCA 3HN0A 5AA4A 4F1UA 1JW1A 2DYXA 3V83A 4GF8A 1RYOA 5A5XB 4EUOA 2UVGA 4X1BA 4BDMA 1LAFE 1QKAA 2RKMA 4LVQA 3PMXA 3C34A 4ZECA 2QS2A 3KGCA 2R71A 4IO2A 5FHNA 4I9DA 2V84A 2D3IA 2PT2A 4PQJA 3MVXA 2WKYA 2V3QA 4OETA 5ITOA 4DE8A 1TFAA 1PDAA 5I59B 1PBPA 3CFZA 3VVFA 5L9SA 4KI0E 3MZBA 4ONYA 2DWAA 4ZZAA 2HQ0A 1SD3A 2H25A 3N6UA 4Q8RA 2QS3A 1MG1A 5FTIA 3CI8A 3PPQA 4K3FA 2E1SA 2G93A 5EYFA 4YZZA 2XX7A 2DP8A 2OCUA 1LB9A 5H8QA 4OFJA 3UGWA 3Q28A 5I2KB 4EQBA 5H8HA 4ZEFA 1B5IA 2I4BA 1IQ7A 4IO5A 4IY6A 1XT8A 1D4NA 5ICTA 2G29A 2Q89A 1YPNA 3G3IA 4FATA 4H6DA 1IIWA 2DVCA 5FTHA 3O66A 4GRKA 3HPIA 4OFOA 3IOVA 5FHOA 1B58A 4GWOA 5F1QA 4YB7A 1P1WA 3PPNA 4QHQA 1O64A 1P99A 3G3KA 4KFQA 5HBCA 4RXLA 4OVJA 4KYDA 3IOUA 1ZKBA 3N94A 4GFRA 2RC7A 3KOTA 1N7XA 1N76A 1JVYA 2VGQA 3G3HA 1B05A 2XXTA 3RGYA 4LQ2A 3Q27A 1ELJA 3TPAA 5I57B 2PX1A 2ANJA 4EF2A 3LUYA 3U92A 4N13A 4FAJA 2FA7A 1O63A 4DIGA 4PP0A 1DTGA 2XXXA 3IB2A 4NTLA 4C1TA 2XX9A 2GRVA 1GV8A 2XXUA 3VXCA 4LUBA 3L6HA 4ND9A 1GGGA 4OEUA 2ZYOA 1US4A 4AQ4A 4JDFA 3HV1A 3N6TA 4XKQA 1FQAA 2QS1A 4YB5A 1MPCA 4HCYA 4ZEBA 3TMGA 1JQFA 2NWJA 4OQOA 3A3UA 4O3BA 3UA8A 5H8NA 3OENA 2B65A 3TUSA 1VE4A 1NNFA 1D9VA 1LLSA 1FQBA 5K2XA 4EXLA 4GQOA 3C33A 1WVJA 2I0CA 2H98A 1IUDA 1NNPA 2X26A 1FTMA 1YAEA 1GVCA 1DPPA 1AIVA 3UP9A 3IR1A 4XTCQ 3E4RA 1QUIA 5TP9B 1BTJA 5ELVA 4MF3A 4EQ9A 2O68A 3KZGA 2H4IA 2I49A 4NF4A 5H8FA 1M5FA 2YPNA 4QFLA 3DP8A 1Q1KA 5TPAA 2DSFA 3PUYE 4G68A 3PMWA 3B6TA 3FVNA 4RNSA 4RPOA 1Y1ZA 1H45A 1JEUA 4OYVA 1NH8A 5I56B 1WODA 3M3KA 5K2YA 4F2OA 4OWDA 3O9PA 4YKJA 3TEPA 3IOTA 2REJA 4G77A 4RYAA 2Q2CA 4NWDA 1F9BA 5JK4A 4F19A 2GH9A 2V3UA 3WAFA 2F7BA 1SW1A 3N26A 4OFLA 3B7DA 3KSJA 5L9OA 2OJTA 3T9UA 3EHUA 4JWOA 4KHZE 1OLCA 4XXUA 3R26A 3CVGA 3PUVE 2Q8JA 1A55A 3PPOA 4NMYA 3THIA 1QJMA 3RUMA 2RINA 4KCDA 1ZLQA 3TCGA 1MQJA 5CMKA 5DYHA 3MQ9A 1QKBA 3TODA 1SYHA 4H8IA 4ZE8A 3CIJA 2O51A 4OZ9A 3FV2A 5HM4B 3O6IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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