5I57B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
278
structure length
277
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 277
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B02
1WVJA 2D21A 1NNFA 5DEXB 2DVCA 2OZZA 3OOAA 4NF8B 2R71A 1PB7A 1NNTA 2PBWA 2RKMA 3C9HA 3ILTB 3CFZA 3O2AA 4F31B 4FATA 2A5SA 2Y84A 4ISUA 5ICQA 4I62A 2F78A 3S9NC 5L8DA 3SEXA 1ZBMA 3L6HA 5JTYB 4GOTA 2NUVA 5IAIA 4PP0A 3RY3A 4R73A 3EHUA 1EU8A 4X1BA 5JK4A 1OQHA 3KSJA 3G3JA 4GQOA 3Q25A 3VLWA 3G3FA 2FNCA 4U1OA 3PMVA 1B3HA 5AA3A 2REJA 1BP5A 1NL5A 3DP8A 4NMYA 1N0TA 5B7DA 3KJ7A 1B58A 5F1QA 2F35A 4DDDA 1NNPA 1PEBA 1Y1MA 1NNKA 4ELOA 4EQ9A 3PMXA 4ZE9A 2I58A 3G3GA 5BUUA 1DOTA 3K6XA 4ZEIA 3M3KA 4OFJA 2I0BA 2H99A 1POTA 5EHMA 5JEIA 3PMWA 2HZLA 4LA9A 4N6PA 5DTBA 2Y7WA 3SKPA 3K6VA 2ANJA 1QUIA 3OSQA 2E0SA 4GF8A 3SERA 4UACA 3U8QA 1JEVA 3MVXA 4ESWA 1LSTA 1II5A 1D9VA 1XVXA 1B3FA 4WXJA 1PB8A 2ALUA 3CG1A 2PT1A 3N6TA 2ZXTA 4TQUQ 3LSLA 3SEWA 4THIA 4YICA 4BDMA 4NF5A 3WAFA 2VOZA 2ZYOA 3KN3A 3B6TA 3FATA 3R26A 4IB2A 3TTRA 3P7IA 1AIVA 1MQGA 4YMBA 3O97A 3K0VA 2DP8A 2X7QA 4OENA 1SDXA 2UYEA 5ITPA 4XKNA 2DSFA 1B4HA 3PPQA 4JDFA 2Q8JA 4POWA 3N94A 3H03A 2Z8DA 4I1DA 3K6UA 1B7ZA 1MY1A 2G29A 5H8FB 2HXWA 2AYSA 3MZBA 4ZEBA 3CVGA 3SEYA 3W15C 1SW1A 2F7CA 3MWBA 3BFTA 3CIJA 4YKIA 2OCUA 2XD2A 1MQDA 4KI0E 4ND9A 1SVXB 2RC7A 4NF4A 4FECA 4OFOA 1Y3PA 2IEEA 4QFLA 2G93A 1MG1A 1FCKA 3E13X 3M8UA 3K1MA 1FTKA 1SW5A 4GL0A 2GHBA 1A8FA 1MY4A 1XVYA 4YB6A 3IX1A 4OVJA 2P0SA 3PPRA 5H8SA 5AA2B 2B3BA 1L5TA 4FORA 2XXRA 2NOOA 3C32A 2Q9TA 3N5LA 2ZYNA 5L9OA 1FQAA 1AL3A 5DVIA 3U94A 4PFTA 2Z8FA 3S9LC 3OENA 1NFTA 3MVWA 4WKMA 1LFHA 3ZSFA 3U72A 3KBRA 5FHMA 5I58A 3T9VA 1NKXA 1TT1A 3HO7A 5KZTA 4YKJA 5I2NB 4XKQA 5J1DA 3UIFA 2OJTA 3KZGA 2UXAA 4QF9A 3SEUA 4BDNA 4DXUA 3LC8A 3V5AA 3C36A 4KD5A 4GFRA 1S7YA 3H6WA 2I0CA 1P99A 1BLFA 3O66A 4OYVA 3IB0A 3OEMA 1LCFA 4H5GA 1SYIA 1P1WA 4KCDA 3V8XB 4F29A 3WAEA 3T9HB 3MP6A 4H65A 1FTOA 2O1LA 3OEKA 1NH8A 3KGCA 5AA1A 5B70A 1QULA 3IOUA 4OETA 1BIYA 3RUMA 2UVGA 3C35A 5ITOA 3CG3A 3TFLA 5I58B 2NVUB 3M3FA 3H6UA 2XX7A 4QSCA 3TAJA 4RK2A 5H8HA 1NMUA 3CR9A 1KWHA 2V84A 3FVKA 3VVEA 1B5JA 3C4MA 4XKPA 3IAZA 4RK9A 4GVOA 1S50A 3FV2A 1SI0A 2Q2AA 4O3AA 1FQFA 2H4IA 3FASA 4G8NA 5M2VA 3USDA 3LSFB 3MUQA 1DTZA 4OWDA 2XXWA 4YB5A 3Q26A 2NWJA 4KYDA 1JEUA 4H5FA 1B5IA 2XX8A 3FUZA 5FTIA 2H98A 1HSJA 1HSEA 4DLDA 3K4UA 3G3IA 4IGRA 1XHYA 2CZLA 2V3UA 5TP9B 1N3XA 3QK6A 5I57B 3B6QA 4LATA 4U1ZA 4H8JA 1YAEA 4ELPA 2PYYA 2PT2A 4ELRA 2H5YA 3HCQA 3O6IA 1B51A 1B05A 3OSRA 1TFAA 3MC2A 2ZNTA 2ESNA 3I3VA 3LUYA 4ZEKA 3MVZA 3TODA 5EHSA 3TMGA 4GD5A 4ONYA 2PMSA 4PE5B 4FEDA 1BTJA 3IJOB 3QYTA 3VFJA 3HHGA 3IR1A 3IOTA 4OESA 3KOTA 4LVQA 4F18A 3FIRA 1ZU0A 3TEPA 4RPNA 4EQ7A 1WDNA 4RA1A 2THIA 1QKBA 4PFUA 4OZ9A 3CI8A 3FGSA 1J1NA 4F19A 4U4SA 4FE8A 2DE4A 4IO4A 1OIBA 1GVCA 5BWJA 3C34A 3H3GA 2O51A 4XKRA 2M8CA 1B1HA 3LSXA 2GH9A 3RQTA 2QS2A 3VLVA 5DYHA 1MPDA 1RKMA 3UK4A 2Y7IA 3B7DA 3R6UA 2UVHA 4KPTA 1FTMA 4EUOA 1JVXA 1P1UA 4FAJA 4Q30B 1JVYA 1DTGA 2XXHA 3KOSA 1VFDA 4P0GA 2H9BA 1FQEA 3QXMA 2HAUA 1P1QA 3IO6A 3JV9A 3TCGA 3H4ZA 4BDQA 4U23A 3IJXB 1D4NA 3M3LA 3KEIA 3VDFA 3CFLA 4MLQA 4OMBA 1URSA 4GWOA 1RYOA 5A5XA 5DT6A 2ZMBA 3K1NA 2QSXA 4C1UA 3GBAA 4KFQA 2HQ0A 4M1VA 2H25A 1GGGA 3S4UA 1YPNA 2REGA 2D3IA 2HCAA 5H8FA 1MM7A 4GL8A 4ZECA 1OMPA 3PUXE 4NF6A 3SESA 5AE4A 1TWYA 3FD3A 4OHNA 3MQ9A 4WEDA 1ZMGA 1ZJLA 1SW2A 4HS7A 2P2AA 4NTLA 3OMBA 4R6HA 3OO9A 1B9JA 5KCJA 1R1NA 5ISUA 4G8MA 1LAXA 4TOZA 2V93A 3TCFA 1LAGE 2E1SA 2F34A 3GZGA 1WODA 3VVFA 4L17A 1I6BA 1N7WA 3K00A 4H0WA 4PQJA 3Q29A 1IXIA 3PD9A 3KJTA 1IXGA 3MZ1A 3PGFA 5AA2A 1QJMA 3PUZE 4PFWA 1UIVA 2AL5A 1O64A 3T9XB 1Y20A 1MRPA 1SYHA 1URGA 1GV8A 1O7TA 4KQPA 4JWOA 1LCTA 3MAMA 1R9LA 3G3HA 1XC1A 2ZYKA 5A5XB 4GRKA 3VV5A 4GIZA 3FV1A 1ZLQA 2A5TA 2V25A 3QUFA 3FJ7A 3PV0E 2GHAA 3DP6A 1QKAA 3HSTA 3QSLA 4LP2B 2I49A 1P1NA 4NEDA 1B52A 5I2NA 1B7HA 4F1UA 5EYFA 5I56A 4H1XA 4NF6B 4JWYA 4F39A 3OD7A 5FHOA 3MPLA 1B2HA 3U93A 3BKIB 3K1PA 4RPOA 3EPEA 3TQWA 3FVOA 1M5BA 5KCJB 2DOJA 5HPQA 3VE1B 3R7XA 5ELVA 4IY6A 1ZTYA 1Y4CA 2RC9A 3UN6A 2ABHA 4YU0A 3BFUA 4DZ1A 4EXKA 3HN0A 1B40A 3Q27A 1VFEA 4IO7A 1ELJA 3DLNA 3TPAA 3KFMA 3RT8A 4FIMA 2QL3A 4QFKA 2ZNSA 4U2RA 1ATGA 4ZEDA 1IZ1A 5H8NA 2DXYA 4LONB 4ZE8A 4JSDA 1H44A 2A5TB 4EF2A 3PD8A 3RN8A 4YB7A 2WKYA 3FJGA 1POY1 2X7PA 3FVNA 2O6AA 4AB5A 1D3KA 1UTHB 2VD3A 2VD2A 4FJPA 4ESXA 4ZDMA 5I56B 2I4BA 3PUWE 3D4GA 1IITA 4DXCA 4I9DA 1R6ZA 2RCAA 4KHZE 4LZ5A 2GRVA 3MP1A 1SD3A 2Y7KA 1Y3QA 3ILUB 3LR1A 1N84A 1S9TA 1M5CA 5CMMA 4EXLA 4C1TA 1TXFA 3T66A 1H76A 3UGWA 4H8IA 1MY3A 3MP8A 2XD3A 2D5WA 3TCHA 4RNSA 1B5HA 3RPWA 3B6WA 4HCYA 4R6YA 3HV1A 2IA4A 1MXWA 5DVJA 1M5EA 5HM4B 4E0XA 5TP9A 3OO7A 1B3GA 5I57A 4HW8A 1A99A 2NXOA 1EH3A 4KYSA 1A40A 1B32A 2R9JA 3O9PA 1DSNA 3I5OA 4JXIA 5H8NB 1UTBA 3QUJA 4I8CA 2DS9A 3N6UA 1MDQA 1Q35A 3KN7A 3MPKA 4OQOA 4Z0IA 4RY1A 1MXUA 2Z8EA 2F6PA 4DIGA 3E3KA 1IUDA 1VR5A 1T0KA 4LQ2A 4OERA 1FQDA 2B65A 3TTLA 3A09A 1FTLA 1Z7NE 2OBGA 2YLNA 3ZKLA 2LAOA 3EF7A 3THIA 1AOVA 4R9FA 4R6KA 3KG2A 1LB8A 3DP4A 4MBPA 4PETA 3TDJA 3GXAA 3V83A 4HCWA 2YJPA 4G4PA 2GFEA 1LFGA 2HZKA 4OFLA 5K2YA 4JBZA 4R72A 3TTKA 1CE2A 4GXSB 2VHAA 1QVSA 1ANFA 4OTEA 4P0IA 4F1YA 2X26A 4OXVA 3EHTA 3PPOA 3S9MC 2AIXA 2I3VA 2XXTA 1UTBB 2DWJA 1P1OA 3PPNA 5CMKA 2ZNUA 3DELB 3FXRA 3RTFB 4U21A 1OLAA 2O68A 3E4RA 4M4GA 1I69A 1MXYA 5TPAA 1FTJA 2PVUA 3CFXA 4K3FA 2RC8A 3LBSA 1PBQA 3H06B 1UIUA 3FXQA 4EDPA 3IO4A 3H6TA 4RJZA 1B0HA 2UYFA 4N07A 1LGBC 3HPIA 2XXVA 5H8QA 1ZIUA 3E9XA 3MJNA 1MY2A 2ONKE 4ECFA 1SI1A 1MPCA 1VSOA 1LBCA 4YMAA 1FW0A 4F22A 1LFIA 1M5FA 3ZS6A 4KYEA 2F36A 3MVYA 3W9VA 4AQ4A 1FQCA 3PUVE 5TU0A 1NH7A 5LOMA 3EQ1A 4QRZA 2KLFA 3O6GA 3H7MA 3K6WA 1CB6A 5L9SA 1JQFA 2QPQA 1LLSA 4QSEA 1H3DA 2DWIA 3IOVA 1Y4TA 3ODBA 1B3LA 1VE4A 3K01A 5L9MA 2I4CA 2Y7PA 2VGQA 1H43A 3KN8A 4GLIA 3IB1A 5TPAB 1URDA 1JNFA 2DQVA 2OLBA 4IO2A 3A3UA 4H6DA 2DWAA 1A55A 4KR5A 1LBBA 3OELA 1M5DA 5DVFA 4O3CA 5CI5A 5FTHA 1IXHA 4QFNA 5H8QB 5FHNA 3Q28A 3IOWA 1BKAA 3LSWA 4E0WA 2O84X 4C0RA 1A8EA 3GLBA 4JB7A 1MXZA 5I59A 3OO8A 3IB2A 4AB6A 1GTKA 3RNNA 3VXCA 1Y9UA 2F7BA 1AH5A 2Y7RA 1A54A 3VXBA 3TYHA 4IO3A 4DCYA 2UVIA 4R74A 4MF3A 1MPBA 2I3WA 4NWDA 4LUBA 3FVGA 3MZ9A 4MH5A 3T22A 3A3CA 3TZAA 1F9BA 3C31A 2O1MA 1SBPA 1MDP1 4X1DA 5CC2A 3TKDA 3UA8A 3VVDA 4U4XA 3KSXA 2QS1A 2B3FA 2QS4A 2XXIA 3CSGA 1N76A 3UP9A 1DMBA 3AXFA 4IGTA 4G68C 3H6VA 2FYIA 1MS7A 3I6VA 1N3WA 2QMWA 1B7UA 3RTWB 3PPPA 5I2KA 2YPNA 1O63A 2OK2A 3JYRA 4F1VA 2P1SA 1LB9A 1XT8A 1PC3A 4BDLA 2Z23A 1UTHA 1MXXA 1JW5A 2F8DA 4F2OA 2QRYA 1PBPA 1IEJA 4JSOA 4RYAA 3TTNA 1DPEA 2Z22A 4LQ5A 3C33A 5I59B 2HEUA 2ONRA 3JZJA 4ZS9A 3O28A 1DPPA 3TELA 1US5A 2XXXA 3IL1B 3HHFA 3QIMA 4F3PA 3BBRA 4IO6A 4EQBA 3GBBA 4YZZA 1XOCA 2VP1A 1R9QA 3F11A 4MFIA 5I84A 4BLAA 1XS5A 2QS3A 4O3BA 3TQLA 1RYXA 4ELQA 5HBCA 1GR2A 3S9EA 5CM6A 4NF5B 1Y3NA 4EF1A 2O7UA 3IORA 1EZOA 2DE3A 1MXVA 1AMFA 4POXA 2O69A 4R75A 5I2KB 3UORA 4LZ7A 1YCJA 3FJMA 1UQWA 5CMCA 5CMBA 3S2VA 2XXUA 3FZVA 2XHDA 2R6GE 3SETA 1JW1A 4YKPA 3T93B 2W7YA 1B0LA 1D9YA 3ECRA 4QSDA 4F3SA 2CMOA 4G77A 3T96B 2QJEA 4ZEFA 2XXQA 4Q0CA 4G68A 1B1XA 3U92A 2FA7A 4NF4B 1N04A 4BDRA 4N13A 5AA4A 1USYE 1Q1KA 4FEBA 3EHSA 3MBPA 2OWTA 3G7WA 4KCCA 4IO5A 4UA8A 1OLCA 1I6AA 2ZYMA 4R2BA 4TLLB 5KDTA 1PDAA 5F7VA 2F97A 2QMXA 4YKKA 4U22A 3G3KA 3O29A 4QHQA 2DVZA 3K2DA 1OQGA 1MM6A 4OEUA 4XIGQ 4BDOA 3ZKKA 4LZ8A 4Q5TA 1B4ZA 3FXUA 2PX1A 3DM0A 3TTMA 2XXYA 5ICTA 3PUYE 2HFBA 2RF1A 3RGYA 3ONMA 4X9TA 1IXCA 5AA2D 1LAHE 4Q8RA 3D4CA 2DWHA 1USYH 4H67A 4WEPA 4DE8A 2BJJX 3N26A 5CBSA 1I6QA 1LAFE 4F2QA 3K02A 1MY0A 1US4A 3OXNA 1QUKA 3SEVA 2OWSA 5IKBA 3O6HA 3W9WA 4NE4A 4YAHX 3RT6B 1JW4A 4JWXA 1OVBA 1A7LA 4X48A 4PFYA 4QFOA 3T9UA 1MH3A 1IIWA 1HSLA 4G68B 4GXAA 3TUSA 2XXPA 5K2XA 1B6HA 4QFPA 1ZKBA 3CSBA 5AA4B 4IY5A 4TLMB 3RLFE 1MQJA 4F3BA 3OO6A 1SQYA 4R9GA 4ZZEA 2F5XA 5DEXA 4NF8A 2DYXA 4OEVA 4DXBA 2RINA 4NWCA 1JETA 5KDTB 1H45A 2HAVA 1IQ7A 3U1OA 3PU5A 3QAXA 2Q2CA 4Z7EA 2I48A 4G8HA 3V89B 1B3EA 1Y1ZA 2DXRA 5JTYA 1QUJA 5CRYA 2F6GA 4F3GA 4R2FA 2RCBA 3CRBA 1EZ9A 1MQHA 1OVTA 3VLUA 4HTGA 3IK6B 2ONSA 1N7XA 4XTCQ 2V3QA 3EN3A 2AL4A 1FQBA 3MW0A 2V3TA 3SDFA 4DCXA 1YTVA 1PB9A 4G2ZA 2DE2A 1B46A 1MH4A 1TFDA 2I6EA 2Q89A 2Q88A 2UVJA 1MQIA 1QW0A 1Z7ME 2F7AA 4ZZAA 5H8HB 2O7IA 4MLVA 4P11A 5CBRA 1SW4A 2XX9A 4RXLA 4XXUA 1EZPA 3L6GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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