5I58A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-004
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
283
structure length
257
Chain Sequence
STRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCVKKVICTGPVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 71
structure length 257
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58A02
1H76A 2I6EA 3N6UA 4PQJA 1URGA 3RN8A 1MM7A 3KG2A 4F39A 1WVJA 2VD2A 1MQJA 4JWYA 1H44A 1XVYA 5FHNA 3Q29A 4YMBA 5A5XA 1LAXA 3CI8A 2O69A 4BDLA 1A54A 3AXFA 4ZE8A 2ESNA 1I6AA 4QSCA 4NF6A 5CMBA 1M5FA 4P11A 2DWHA 2DXRA 4ZZAA 5JK4A 3O9PA 3MQ9A 4F1VA 4BDNA 2UVGA 1N3WA 2RKMA 1XOCA 3IB1A 1NH8A 5DVIA 1B58A 5KCJA 1SW1A 3LSLA 3VXBA 3S9LC 3H3GA 2XX9A 4X48A 4N07A 3CSGA 3O2AA 3PD9A 4JBZA 1RYXA 4U21A 3Q27A 1B3FA 3TTNA 2V93A 2Z8EA 3MVYA 1Y3NA 4LZ5A 1MXZA 4H1XA 4DCYA 1ZJLA 1YCJA 2B65A 1IXGA 1B0LA 2I3WA 1LB8A 4OVJA 3TEPA 2RCBA 3OMBA 4KCDA 4NF8A 5I56B 1MXUA 1TXFA 3A3CA 2AL4A 3QAXA 3O66A 3IB0A 4E0WA 2NOOA 1FTLA 3FXUA 4ND9A 3TCGA 3LSXA 4F3BA 3MPKA 4THIA 1B32A 3IO4A 4F3GA 4R73A 1PDAA 3IL1B 5CBRA 3O6HA 2Z23A 2OWSA 4P0IA 4R6HA 1YTVA 2R71A 3C32A 4MF3A 3VVDA 3FD3A 3EN3A 1Y4CA 3B6QA 1N7XA 4NWDA 2Y7IA 1L5TA 1MH3A 5FTHA 1VFDA 4DXCA 1FQCA 5DEXB 1USYH 3CFXA 2DXYA 4IGRA 5B7DA 5F7VA 4O3AA 1XS5A 3ILUB 1B3HA 3PPNA 1Y3QA 3KN7A 1MRPA 1Y20A 1FTOA 3JV9A 4U22A 3BKIB 2X26A 1B51A 2FA7A 5FHOA 1DTZA 1B0HA 3V8XB 4XTCQ 2I0BA 2O1MA 3GXAA 4QSEA 1UQWA 1PB9A 1S7YA 2H5YA 3D4GA 1B40A 4F1YA 1TT1A 5AA3A 3M3KA 4IO6A 1H45A 3MP8A 3S9EA 2HFBA 4R2BA 2QMXA 4DZ1A 4BDMA 3VVEA 4YZZA 3B6WA 3MZBA 2XXRA 3VV5A 2QS4A 3PPPA 4YB5A 2PYYA 2O68A 2XXVA 2DWJA 3I3VA 4ZE9A 4G8NA 5I2KA 3PMWA 4OESA 1QUJA 3M3LA 1MDQA 4X1BA 4LP2B 2KLFA 2QS3A 2X7PA 1NNPA 3QSLA 3MZ9A 3OO8A 1US4A 1VR5A 5I57B 4UA8A 4OZ9A 3WAFA 2ZNSA 5H8NB 4RPOA 4ZECA 3U92A 4M4GA 1F9BA 4NF4A 1GGGA 4KD5A 1MY1A 2XXQA 3C31A 2D5WA 4H8JA 2H25A 3VVFA 1DOTA 3PPOA 1PBPA 1Y9UA 3BBRA 5HBCA 1VFEA 2ZXTA 3OSQA 2F34A 3M8UA 4IO5A 4DIGA 1I6BA 3U94A 2V25A 1MXWA 2RF1A 1ZIUA 1SW5A 1QW0A 2Q9TA 3FJGA 1JETA 1MQHA 1UTHB 5ITOA 4G68A 2GFEA 1MPCA 3LSWA 3SEWA 2A5SA 2QPQA 4NE4A 3C9HA 3KJTA 2H99A 3H7MA 4C1UA 1LAHE 2R6GE 3TPAA 3HN0A 4MBPA 1D3KA 1N0TA 4MFIA 3THIA 1WODA 4MLVA 2VHAA 4GRKA 3B7DA 4TQUQ 3SEUA 4G8MA 3FVGA 2YJPA 3TAJA 3LC8A 4GXAA 4LA9A 4F1UA 2H98A 3H06B 4RJZA 1JVXA 4KYEA 1B46A 5AA2D 2BJJX 5CMKA 4RA1A 3K6XA 3H6WA 4WKMA 2RC8A 3UP9A 4MH5A 1RYOA 3ODBA 1WDNA 1B3LA 3UGWA 2XXTA 1NNFA 4H5FA 4LQ2A 1B5JA 2HAUA 4R9FA 3CFZA 4IY6A 3S2VA 2ZMBA 3DM0A 1O64A 3OO9A 5H8HB 3B6TA 1GR2A 1LFGA 2AYSA 5J1DA 2RC7A 3MZ1A 1MY3A 2I3VA 3UIFA 4RYAA 3VDFA 1HSJA 4IO4A 1MQDA 4GL0A 3OXNA 3MVWA 4K3FA 5L9OA 1USYE 1FQBA 3R7XA 5DVJA 4G77A 5DVFA 2Q8JA 2DSFA 3G3FA 2OJTA 5AA4B 5I56A 5TP9B 2QJEA 4U23A 4I9DA 3OENA 4ZZEA 2CMOA 4RK2A 2Q88A 4YAHX 3TQLA 3SEXA 3MUQA 3CRBA 4MLQA 3OSRA 2HXWA 1AL3A 3WAEA 2HEUA 2W7YA 4FEBA 4FEDA 1DMBA 1OVBA 2QS2A 1AOVA 1YAEA 3U1OA 2F5XA 1OMPA 2ZYNA 2ONSA 1SYIA 3PUWE 4FORA 2DQVA 3FIRA 4G8HA 3RLFE 3LSFB 5CRYA 2DWAA 1POY1 3O6GA 3DP8A 1BP5A 3OEKA 4NEDA 3PUZE 5CBSA 1DPEA 3V5AA 3T9UA 1FQFA 1B9JA 3KN3A 1GTKA 5I59B 1LSTA 1BLFA 1NL5A 4PETA 2PBWA 5DEXA 4R72A 4R75A 3G3GA 2DOJA 4U1OA 2UYEA 2DS9A 4RPNA 1MY0A 1FTMA 4NF5B 3IR1A 2F36A 4JSOA 3IJXB 4QF9A 4ELPA 4EXLA 4YB6A 1UIUA 3C36A 3FVKA 5DYHA 3TDJA 5TPAB 1H43A 2XD2A 3E3KA 4ONYA 1VE4A 4GVOA 3G7WA 3T96B 3USDA 1LGBC 4IY5A 3VLUA 4H65A 2OWTA 1ZTYA 5TU0A 3DP4A 1NFTA 1P1OA 2HZKA 2R9JA 2VD3A 3H6TA 5ELVA 4ZS9A 3F11A 5H8QB 2I4CA 4DXBA 3EQ1A 1I69A 1NNKA 3OOAA 4DDDA 3RNNA 1MS7A 3S4UA 2F6PA 4HTGA 4BDQA 4TLMB 2X7QA 5I57A 5H8NA 2I49A 5H8SA 1XHYA 4RXLA 1JW1A 2DWIA 3PPRA 4ELQA 4KCCA 1ZU0A 5K2YA 4JDFA 2V3TA 1GV8A 1IXHA 4QFPA 4OTEA 5EHMA 3N94A 1T0KA 3I5OA 2F7AA 5KZTA 4F29A 3S9MC 3RTWB 1B5HA 1UTHA 3RQTA 3TCFA 1GVCA 1P1WA 2DYXA 2V3QA 3E13X 3MPLA 1FW0A 3FVOA 4GFRA 2DVCA 2Z8FA 3MP1A 4IB2A 3EF7A 1OVTA 2CZLA 4OYVA 1A55A 1FQDA 2Z22A 4OFOA 3O28A 2ZYKA 3SKPA 4F18A 3TTLA 1CB6A 1MXXA 3H6VA 5I2NB 1FTKA 1XT8A 4G4PA 3T9XB 1R9LA 4M1VA 1P1UA 3SEYA 4OMBA 4YU0A 1TWYA 3HV1A 4HS7A 4WXJA 2HQ0A 1XC1A 1FQAA 3FGSA 1BKAA 1B6HA 1LBBA 2OCUA 3C34A 2UYFA 4GLIA 1I6QA 3A09A 1D9YA 4ZEIA 5H8HA 4OEVA 1B7ZA 1OQHA 3OELA 1MH4A 2FYIA 3IX1A 3KFMA 3P7IA 2GHBA 2QS1A 3CG1A 1B7HA 3G3KA 2B3BA 4F2QA 2XXUA 3PGFA 2IEEA 4Q5TA 2XD3A 3G3HA 1PBQA 2O7UA 5AA4A 1JEVA 5TP9A 2XX7A 4U4SA 3QIMA 4C1TA 1LAFE 4LONB 2XHDA 2D21A 1IEJA 3IOWA 4JB7A 4ZEKA 4Z0IA 4OXVA 1B5IA 1EU8A 1NH7A 3V89B 2UVHA 3FUZA 4FE8A 3MJNA 4IGTA 4QFOA 1URDA 1DPPA 4HCYA 1MXVA 3H4ZA 1ZLQA 4PFYA 1MDP1 3RT8A 2P2AA 3KSXA 1LCFA 4U2RA 1PEBA 2ZYOA 1M5DA 2E1SA 2XXPA 4OWDA 3TYHA 2HAVA 5I59A 5AE4A 1FTJA 4XKRA 3W15C 2Z8DA 4R2FA 5ICQA 5EHSA 4RK9A 4NF5A 1P1NA 3KEIA 3ZKLA 1NNTA 1B3EA 2OLBA 1B4HA 2IA4A 3FV2A 4OETA 4LZ8A 1IXCA 2RC9A 1IXIA 1MM6A 4BDOA 5TPAA 4LVQA 2AL5A 4ISUA 3TTKA 3K02A 3TTMA 3CR9A 2VGQA 3IOVA 1AIVA 5LOMA 3K6VA 1NMUA 4Q0CA 1YPNA 4POXA 4GOTA 3EHTA 4TOZA 1N7WA 1N3XA 1TFDA 4DCXA 1QKBA 4WEDA 1OLCA 4ZDMA 2F78A 1LCTA 1B1XA 5H8QA 1SW2A 2DP8A 3JYRA 5FHMA 3KOTA 3K6WA 4KHZE 3U93A 4XXUA 2AIXA 5CC2A 4EQ7A 5I84A 3MBPA 2H4IA 3RTFB 3N26A 1PB8A 2F35A 1FCKA 2F7CA 4I8CA 2PX1A 4YKPA 2NWJA 3PMXA 1SI1A 4JWXA 2GHAA 3V83A 3A3UA 3EHSA 1B05A 1SD3A 1ELJA 4Q8RA 5F1QA 2NXOA 2I0CA 4EF2A 3HHGA 3PPQA 4L17A 1DSNA 5H8FB 5ICTA 1JW4A 1HSLA 3RPWA 3EHUA 1JEUA 4GF8A 5AA2B 3FXQA 2QSXA 4NWCA 3T9VA 4H8IA 5FTIA 3FVNA 2RCAA 1N84A 2ZNUA 1QVSA 1IITA 1UTBB 5K2XA 3HSTA 3TQWA 2Q89A 2ZYMA 4JSDA 3CFLA 3LUYA 3FATA 3MVZA 4E0XA 1S50A 4YICA 2DE4A 3SETA 3TUSA 5I2NA 2E0SA 4NMYA 3T93B 4GL8A 2OK2A 2F97A 2NUVA 1EZOA 3QYTA 3KBRA 2B3FA 5HM4B 1J1NA 3K1NA 1LFHA 4F19A 4H5GA 3U72A 4FAJA 1AH5A 4OEUA 4AB5A 3FJMA 1P1QA 2THIA 1OIBA 3MC2A 1S9TA 1IZ1A 1IQ7A 3QK6A 3FASA 1O63A 3L6HA 4DE8A 1JQFA 2V3UA 1A7LA 3K0VA 3KGCA 2REGA 2HCAA 1Q35A 4QRZA 2DE2A 4ZEFA 1LLSA 5JTYB 4ZEDA 5L8DA 3QUJA 4LQ5A 4G2ZA 1R1NA 4F22A 4PP0A 4YKIA 3C33A 3JZJA 3IK6B 4GQOA 3K2DA 2HZLA 4H67A 4QSDA 2A5TB 4ZEBA 3O29A 2ONRA 3ONMA 4Q30B 4PE5B 1VSOA 1SBPA 1M5CA 2FNCA 2QRYA 2Q2CA 2V84A 4KQPA 1Q1KA 3ZSFA 3BFUA 1O7TA 4RY1A 4OENA 1A99A 4YKKA 5KDTB 1A8FA 3VXCA 1SW4A 3ZS6A 4DXUA 2M8CA 4YMAA 3TMGA 3T9HB 1B2HA 4H0WA 4LZ7A 1Y1ZA 2OBGA 2ONKE 2H9BA 2PT2A 3H6UA 4DLDA 2ZNTA 1ATGA 3ZKKA 4FJPA 5JEIA 3R6UA 3U8QA 2YPNA 4I62A 1MY2A 3CVGA 5AA1A 5IKBA 1M5EA 4N13A 1SVXB 3UORA 3QUFA 4QFKA 4U1ZA 4PFWA 1LB9A 1UIVA 5I58B 1ZBMA 4GIZA 4ELRA 3L6GA 5EYFA 2G29A 3UN6A 3MW0A 1SQYA 4YB7A 2WKYA 3TKDA 2DVZA 4AQ4A 3K4UA 3G3IA 3RGYA 1P99A 2UXAA 4U4XA 4FIMA 2I48A 1M5BA 4KI0E 1Y1MA 3MWBA 4PFTA 1SYHA 3MVXA 2XXXA 1ZMGA 2LAOA 2Q2AA 4OFJA 4ECFA 3TZAA 4BDRA 3SEVA 5B70A 3CIJA 4IO7A 4RNSA 3PUXE 5L9SA 3IOUA 4XKPA 1N04A 5H8FA 1BIYA 3GLBA 3VE1B 4KYDA 2QL3A 3K1MA 1II5A 4R6KA 4BLAA 5AA2A 2ALUA 2GRVA 4KYSA 3M3FA 4G68C 5L9MA 3R26A 2Y7PA 1KWHA 1UTBA 4KPTA 4Z7EA 2XXYA 1H3DA 3QXMA 1B52A 3HO7A 4KFQA 3HCQA 4O3BA 3IJOB 5CI5A 4OFLA 2QMWA 3TFLA 4EUOA 3CG3A 1BTJA 3MAMA 2O51A 4WEPA 3MP6A 1MPBA 3FZVA 2REJA 1US5A 4ESXA 4X1DA 3IORA 1SI0A 4JWOA 1DTGA 2P1SA 4GD5A 3KN8A 4X9TA 3UK4A 2RINA 2VOZA 1R9QA 3O97A 3EPEA 4XKNA 1NKXA 1IIWA 1B4ZA 3FXRA 3OEMA 3TTRA 3ILTB 3K00A 1ANFA 5A5XB 5DT6A 3TCHA 4QFNA 1B1HA 3K6UA 1EH3A 4ESWA 4NF6B 1SDXA 1Z7ME 4OERA 4IO2A 5CMMA 4POWA 4QHQA 1JVYA 3H03A 3PD8A 5BWJA 3PV0E 5KCJB 5ISUA 2Y7WA 5JTYA 3TELA 1Y4TA 1OQGA 1QJMA 3KJ7A 2D3IA 3DELB 1CE2A 4C0RA 4F2OA 5BUUA 1EZPA 2F6GA 1RKMA 1QUKA 3SERA 4O3CA 2O1LA 2A5TA 1R6ZA 4LUBA 4XKQA 4R9GA 3O6IA 3KSJA 2XX8A 1A40A 1MQIA 2UVIA 4H6DA 4NF8B 3TODA 3ECRA 3FJ7A 4F3PA 4PFUA 3RY3A 1QUIA 3K01A 4TLLB 2P0SA 5HPQA 3OO6A 4I1DA 3RT6B 1AMFA 3LBSA 2NVUB 4UACA 5KDTA 3RUMA 3W9VA 5M2VA 2O7IA 3OD7A 3HPIA 2XXIA 5CM6A 1MQGA 1B3GA 1POTA 4QFLA 3T22A 4F3SA 3SDFA 3GBBA 2Y7RA 2G93A 2XXWA 2VP1A 1MY4A 3GBAA 1URSA 3DLNA 1B7UA 3IOTA 3PMVA 3Q26A 4EQBA 5I58A 4FECA 2ANJA 2PVUA 2F7BA 3W9WA 3N5LA 3T66A 5IAIA 3E9XA 3N6TA 4IO3A 1D9VA 3UA8A 4YKJA 2GH9A 3C4MA 1TFAA 1JNFA 3CSBA 4LATA 3IB2A 3HHFA 3LR1A 2O6AA 2I58A 3FV1A 4AB6A 2Y7KA 3OO7A 4HW8A 3IAZA 2I4BA 4GWOA 3C35A 1LFIA 2UVJA 2ABHA 1QULA 1FQEA 1MG1A 3BFTA 1LAGE 3KOSA 1ZKBA 3SESA 2F8DA 5I2KB 1MXYA 4N6PA 1Y3PA 3D4CA 4FATA 3PUVE 1QKAA 3KZGA 3K1PA 4P0GA 4EDPA 2Y84A 3E4RA 4EQ9A 5CMCA 4OQOA 1EZ9A 4R74A 2PT1A 4ELOA 2O84X 4JXIA 1A8EA 4NF4B 4HCWA 3PUYE 5DTBA 1JW5A 4EF1A 4NTLA 4XIGQ 3DP6A 3PU5A 4GXSB 3GZGA 3Q28A 4KR5A 3VFJA 4OHNA 2OZZA 1OLAA 1XVXA 2DE3A 1N76A 3VLVA 3I6VA 4EXKA 3G3JA 2PMSA 2YLNA 3IO6A 1PC3A 2XXHA 1D4NA 4G68B 1Z7NE 1LBCA 3S9NC 1MPDA 3VLWA 1IUDA 1HSEA 1PB7A 4R6YA 5ITPA 4F31B 3Q25A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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