5I58B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-004
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 76
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58B02
2V3QA 2OZZA 3E13X 2F34A 2I0CA 4DXUA 3MVYA 5IAIA 2DOJA 5DT6A 4NWCA 4RJZA 5I2KB 4IGRA 4WKMA 1RKMA 2D3IA 1FQCA 1Y9UA 1UTBB 2ZYKA 4JSOA 2Y7KA 4GL0A 3I5OA 3SEYA 2H98A 4OESA 4YMBA 1PB9A 1T0KA 1ZIUA 5ICTA 4OMBA 5CBRA 1II5A 2XXQA 2E0SA 3BKIB 3IORA 3OOAA 1MXXA 1NNTA 5I56A 4LZ8A 2DWIA 3UP9A 4HCYA 4LZ5A 4NE4A 3EHUA 2QL3A 1LB9A 2Q89A 2O69A 2A5TA 4ZEKA 3S9NC 3K1MA 4F19A 1DPEA 1M5CA 4G8NA 1A7LA 4OHNA 4NWDA 2RINA 2LAOA 3LC8A 4BDMA 2GRVA 3PPPA 3FGSA 2Z8FA 1HSJA 2CZLA 2HZKA 4TOZA 4ZZAA 3PMXA 3P7IA 2H25A 2PT2A 2ZYOA 3SEUA 2F8DA 4ND9A 3E3KA 3VLUA 1B40A 2Z22A 4ZDMA 3Q29A 1J1NA 3MZ1A 1DPPA 3RT6B 3USDA 2VGQA 3RLFE 4ZEFA 3FJ7A 1PBQA 3K6XA 4R74A 4F3BA 5B7DA 1FTLA 5DVFA 3VE1B 3RT8A 4OWDA 4LONB 1WVJA 5JTYB 4XKQA 4LQ2A 1MQHA 1P1WA 1OQHA 2DE3A 4POXA 3CG1A 3LSFB 4LP2B 2ZYNA 3KGCA 1P1UA 4EUOA 5H8SA 5KCJB 2I6EA 3B6QA 1Q35A 3QXMA 3MJNA 2HCAA 1SBPA 1RYXA 1VR5A 2RC8A 1VSOA 1UTBA 4ELPA 5DEXA 3A3UA 4G68B 3S2VA 1OMPA 4H1XA 1USYH 1JW1A 4RPNA 2XXIA 5FHMA 3UK4A 2H5YA 4KFQA 3U92A 2RCBA 5FTIA 4EQBA 3FXUA 1MY3A 2CMOA 1B32A 3Q25A 3ZKLA 5HPQA 3ILUB 1PB8A 2O1LA 4TLMB 4UACA 4OXVA 1PBPA 1US4A 4OENA 3VLVA 3FVNA 4GRKA 3W15C 2Z8EA 4BDQA 4FORA 4IO7A 5EHSA 3IOUA 1MS7A 1UTHB 1LCFA 4FAJA 2B65A 3K6VA 1IQ7A 2DWJA 4YZZA 4H65A 2HQ0A 4ZZEA 3H6UA 1B5HA 4R9GA 3KJ7A 5ELVA 5H8FA 3FD3A 1AIVA 2ESNA 5I2NB 3G3FA 1FQFA 1MQJA 3VVFA 3I3VA 5AA2D 4KD5A 3TUSA 4DCYA 2XD3A 3EN3A 5L9OA 3N6UA 3TKDA 3SKPA 3C31A 4YICA 2I3WA 4EF1A 3OD7A 4Q0CA 4YKKA 4QSEA 1N0TA 3M3FA 4RYAA 1HSLA 2DP8A 2DYXA 2DQVA 3RPWA 1WODA 5FTHA 2ZNUA 4U2RA 1Y4TA 2F7CA 1A99A 1Y20A 1FW0A 1SYHA 4NF4B 4X1DA 1POTA 4F3PA 5KCJA 3SEVA 5A5XA 1PC3A 3U72A 3E4RA 2PT1A 4LATA 4X1BA 3U8QA 3LUYA 1B05A 4QRZA 1B7ZA 2DE2A 4PFUA 2V25A 1Y3NA 3IL1B 2XD2A 3RTWB 1SI1A 1SYIA 4H8JA 2D5WA 3O28A 3D4CA 3VXBA 1VE4A 5CRYA 1O7TA 3K1NA 5M2VA 4YB5A 4QFNA 1N7XA 1B1HA 2H4IA 1LAXA 3MZ9A 3PPQA 1M5FA 2O1MA 3RQTA 1B58A 4NTLA 4F1UA 1ZLQA 3K4UA 4H5FA 3MAMA 5AE4A 1B3HA 4OFLA 4U21A 1SW5A 3IB0A 3T9XB 4JB7A 3DP6A 3C4MA 4QSDA 3HSTA 4PFTA 5AA4A 2IA4A 5TP9B 3THIA 1ANFA 3PD9A 5HBCA 3PUVE 5TPAA 4MF3A 3ONMA 3UIFA 2F97A 2V3UA 2YLNA 3TTRA 2GFEA 4R72A 1JW4A 1Z7NE 4LQ5A 1LGBC 4OZ9A 4IB2A 2F35A 5H8QA 1MH4A 3IK6B 3IOWA 3WAFA 1PEBA 2RF1A 3IOVA 4R6YA 5I56B 4Z0IA 4LA9A 4XXUA 3V8XB 4YB6A 5B70A 4IGTA 3JZJA 3H06B 2G29A 4NEDA 1A40A 4E0XA 1YAEA 1DOTA 5CM6A 4YKIA 1MPBA 3TQWA 3MPKA 3QUFA 4MBPA 3MPLA 4R73A 3TEPA 1QUIA 2A5TB 3QYTA 4Q30B 3JYRA 1PB7A 1R1NA 2ONRA 1JETA 4KYDA 2QMXA 2VHAA 4BDOA 1N84A 3K0VA 2FA7A 3PUZE 1P99A 2WKYA 2Q88A 2Y84A 3MW0A 3ZSFA 3HHFA 1JVXA 2UVIA 3OO6A 4KQPA 4P11A 1MY2A 3ECRA 1SW2A 2DE4A 1QW0A 5AA2B 5DVJA 4LVQA 5KZTA 3S4UA 4AB6A 3KN8A 1VFEA 4IO6A 1LAFE 4HS7A 4FATA 2NXOA 3K1PA 1MDQA 1DSNA 4U4SA 3H03A 4BDRA 3OXNA 1MQIA 3Q27A 4R6KA 1FTJA 4F3SA 2ZMBA 5TP9A 3TZAA 1MY4A 4PQJA 1GR2A 3VVEA 4XIGQ 1I6QA 4LUBA 2UYFA 5DEXB 4F1YA 3JV9A 1LFHA 3IOTA 4OETA 2Q9TA 1POY1 3C32A 4RXLA 1SDXA 4ZEDA 3DP8A 3K02A 1O63A 4F29A 1JEVA 1B51A 1IUDA 1DTGA 1MDP1 3D4GA 4OVJA 1OLCA 3MC2A 1MH3A 3OSQA 1XVYA 4ZEIA 1H76A 4UA8A 4O3BA 2ZNTA 1MPCA 3G3IA 3RN8A 3QSLA 3LBSA 4KYEA 3IO6A 4PP0A 3OEMA 4BLAA 1B5IA 4NF5A 2NUVA 5FHOA 2Y7RA 2QSXA 1JNFA 3MP6A 1L5TA 1CB6A 4I1DA 4OQOA 5DVIA 1B52A 4H6DA 5H8FB 2UVJA 5IKBA 4DCXA 1BIYA 4XKNA 2OBGA 3KZGA 4R75A 2AYSA 4R2BA 5CC2A 3TMGA 3GBAA 1ZMGA 4EQ7A 5JEIA 1B3LA 4AB5A 5AA2A 4WXJA 2AIXA 1NH8A 1IIWA 4HTGA 2QMWA 4F3GA 2XXYA 2FYIA 3O97A 2DS9A 3OO8A 3CIJA 4R9FA 4IO2A 4F2QA 2XXWA 3A3CA 3H6WA 3RTFB 3PPOA 1EZ9A 1N76A 5H8NA 5K2YA 4WEDA 4F18A 4Q5TA 4DXBA 1Z7ME 3SERA 4ZE9A 2FNCA 4F31B 4ONYA 3L6HA 3IR1A 1ATGA 4I62A 1ZU0A 4F39A 4GD5A 1LCTA 1TFAA 5A5XB 4IY5A 3UA8A 3VLWA 2F36A 3KN3A 3EPEA 1TFDA 2ONSA 3TCFA 2F7BA 5BUUA 4NMYA 3SETA 4EQ9A 4X9TA 2ZYMA 3SEWA 1RYOA 1FQBA 3W9WA 3V5AA 3N5LA 4F1VA 1R9QA 1FTMA 3VV5A 1AH5A 4TLLB 5CBSA 3FVKA 1O64A 1D9VA 3K01A 2B3FA 1SW4A 2Q2CA 4E0WA 1USYE 1B1XA 4ISUA 1NNPA 2F6GA 5AA4B 4GFRA 2Y7IA 4I8CA 3VDFA 1XHYA 1MPDA 3SDFA 5ITOA 2VP1A 1I69A 3OO9A 5TPAB 1LAGE 3OELA 2XX7A 5CMCA 2QS1A 3R7XA 3IJXB 2AL4A 1NNFA 1M5BA 1UIVA 1XOCA 2O7UA 1IXCA 4FE8A 1Y1MA 4JWOA 3UGWA 4JWXA 1UIUA 4ESXA 1B4HA 4PETA 5H8QB 2OCUA 2R6GE 3M3LA 4NF6A 1TXFA 4G8MA 3BBRA 4KR5A 1EZPA 4H5GA 3LSLA 3CI8A 4GLIA 1FQEA 2ZXTA 4OYVA 4IO5A 4AQ4A 1S50A 4EXLA 1YTVA 4MLVA 4JBZA 1QVSA 2NOOA 3FATA 1LLSA 2X7QA 3TELA 5AA3A 1OVTA 1BP5A 1IXHA 1MM6A 4XKPA 3GLBA 4GWOA 4KYSA 1AOVA 3O6IA 4U1OA 1P1NA 3IO4A 1BKAA 5AA1A 3KFMA 1B9JA 4GQOA 1QUKA 1A54A 3IAZA 3QK6A 3KEIA 4L17A 3KOSA 4BDLA 2XXVA 2O6AA 5ISUA 4QFKA 3C33A 3MUQA 5HM4B 2THIA 3CR9A 2PMSA 4ZS9A 2RKMA 2XXTA 3SEXA 4G4PA 3T9UA 2PVUA 3K2DA 1YCJA 2XXRA 3TTNA 1M5EA 2OK2A 4OEVA 3G3JA 1FTOA 2YJPA 3PPNA 3MVZA 4U4XA 1URDA 2VOZA 1JW5A 2VD2A 1H44A 2GHBA 4FEBA 1N04A 5I84A 3K6WA 3KSJA 3O29A 3CG3A 4ZECA 2ONKE 4GOTA 4YKJA 2ANJA 4PFYA 1Y4CA 3PUYE 4Z7EA 3OEKA 4ESWA 3FZVA 4QHQA 5F7VA 3OMBA 3MP8A 1FTKA 4NF8A 3DELB 3PUXE 2A5SA 4P0IA 1LFGA 3FXQA 1OIBA 3M8UA 3IX1A 2E1SA 4NF5B 1ZKBA 5FHNA 3EF7A 2I4BA 3CVGA 3VFJA 4N6PA 3C34A 4QFOA 3KSXA 1I6BA 2HZLA 4DZ1A 2QS2A 1XC1A 3MVXA 1EU8A 4OERA 2X7PA 1BLFA 3KG2A 3CFXA 4RA1A 5DTBA 3HO7A 3DP4A 4P0GA 2DWAA 5ITPA 2IEEA 1NMUA 2ZNSA 4KPTA 1URSA 2NVUB 5I57A 4FEDA 5I58A 2NWJA 5L8DA 5CMKA 1FQDA 3IJOB 1M5DA 1IITA 4H0WA 5L9SA 3CFZA 2I58A 5I59B 3O6HA 2V3TA 3RGYA 2B3BA 1B3EA 1N3WA 1MXUA 3BFTA 4LZ7A 1IXIA 5H8NB 1P1OA 3H4ZA 3S9EA 1XVXA 3V89B 3TQLA 2QRYA 1ZTYA 4I9DA 3QIMA 3UORA 1GV8A 2I4CA 3ZKKA 2ABHA 3HCQA 1AL3A 1S7YA 3RUMA 1B6HA 3U1OA 4QFPA 1Q1KA 3VVDA 1QJMA 2HXWA 3T9HB 4GIZA 3G7WA 4GXAA 1GGGA 2P2AA 4POWA 2P1SA 1ZJLA 1H3DA 2V84A 3RY3A 1NNKA 4U22A 2O84X 2OWSA 5LOMA 3CFLA 3MQ9A 2F78A 3H3GA 4YAHX 1US5A 2REGA 4OEUA 4YU0A 2I0BA 5H8HA 3CSBA 1GTKA 3WAEA 4YMAA 1XS5A 4FIMA 3HV1A 3B7DA 3R26A 1QUJA 2ALUA 4YB7A 2Z23A 2I48A 5F1QA 4GXSB 1R9LA 3OENA 1HSEA 2HAUA 3CRBA 2F7AA 1QULA 3I6VA 4EF2A 1R6ZA 4U1ZA 1H45A 3H7MA 1MM7A 2Z8DA 4JDFA 1FCKA 2UXAA 4DXCA 3QAXA 2HFBA 4NF6B 1D3KA 1MY0A 2Q2AA 2BJJX 3FIRA 2R71A 2GH9A 4PE5B 2OJTA 2GHAA 5I59A 4G68C 4DE8A 3LSXA 3T66A 4EDPA 4EXKA 2H99A 1NL5A 3LR1A 1QKAA 2AL5A 4IO3A 1OVBA 3GZGA 3PMWA 3FVGA 4KHZE 2XXHA 3MZBA 1MG1A 1URGA 1LSTA 3PV0E 5L9MA 4HCWA 4MLQA 4KCCA 3TPAA 1LAHE 5JK4A 3IB2A 2RCAA 1N3XA 3IB1A 3PU5A 4WEPA 5I2KA 1NKXA 1LB8A 2W7YA 1B4ZA 4QFLA 5BWJA 5KDTB 3K00A 1TT1A 4QF9A 4DIGA 4M4GA 2UVGA 3OSRA 4O3CA 1ZBMA 3T22A 1LBCA 3Q26A 1TWYA 3C9HA 4OTEA 1OLAA 1MQGA 1Y3PA 4ELQA 1B7HA 1KWHA 1FQAA 4YKPA 4IO4A 4C1TA 1LBBA 5CI5A 2H9BA 3O6GA 4M1VA 2PBWA 3FUZA 3MVWA 4H67A 3AXFA 1XT8A 1MXVA 2XHDA 3GBBA 3HN0A 4OFOA 4N13A 3T93B 1YPNA 3BFUA 3G3KA 5TU0A 3M3KA 1SW1A 4F22A 4MH5A 5CMMA 1WDNA 1MQDA 3KN7A 4JXIA 3EHTA 3FJGA 3PPRA 3E9XA 3TDJA 2F6PA 5J1DA 3FJMA 1P1QA 2O7IA 3FVOA 1DMBA 2HEUA 1MY1A 4ZEBA 4GL8A 2YPNA 3FASA 1VFDA 4RY1A 4FECA 4ECFA 1D4NA 1H43A 4NF8B 2QS3A 4G77A 2V93A 2DVZA 5ICQA 4QSCA 1B46A 4H8IA 1MXYA 3PGFA 2F5XA 1B3FA 4JWYA 3S9MC 3F11A 3KBRA 1MXZA 3H6VA 3PUWE 1B0HA 3H6TA 5JTYA 3TCHA 3GXAA 3O2AA 3TAJA 3KOTA 4KCDA 4ELOA 5EYFA 4ZE8A 2QS4A 4Q8RA 2I3VA 1BTJA 2PX1A 3T9VA 1ELJA 5I57B 4K3FA 5I58B 2DXYA 3TODA 2PYYA 2X26A 2G93A 2VD3A 1MXWA 5KDTA 4F2OA 4THIA 4XTCQ 1I6AA 2UVHA 2REJA 4DDDA 4XKRA 3EQ1A 4G68A 5EHMA 2P0SA 4O3AA 4RK2A 3UN6A 1F9BA 1PDAA 3MP1A 3G3HA 3U94A 3DM0A 3OO7A 2XXPA 2OLBA 2I49A 3RNNA 4N07A 4GF8A 4PFWA 3L6GA 1A8EA 4U23A 4FJPA 3O9PA 3T96B 1SVXB 3TCGA 5K2XA 1A55A 3U93A 3W9VA 1UQWA 3B6TA 2XXXA 1Y1ZA 3R6UA 1A8FA 3N94A 2XX9A 2QJEA 2Y7PA 3MBPA 1UTHA 2UYEA 1SI0A 4GVOA 4X48A 3TTLA 3O66A 1JVYA 3EHSA 2DWHA 1S9TA 1Y3QA 3V83A 1GVCA 3ZS6A 2XXUA 3TFLA 4DLDA 2D21A 4BDNA 4OFJA 5I2NA 1SD3A 3TTKA 1IXGA 1LFIA 3N6TA 4RPOA 4G2ZA 4ELRA 1NH7A 2RC9A 1B0LA 2O51A 1B2HA 3SESA 1CE2A 3KJTA 1EZOA 1MRPA 5H8HB 3C35A 4TQUQ 3TYHA 3PMVA 2XX8A 2OWTA 3LSWA 3CSGA 3A09A 5DYHA 4IY6A 3HHGA 3VXCA 1JQFA 1B5JA 3ILTB 2M8CA 4RK9A 3B6WA 3ODBA 3QUJA 4JSDA 1N7WA 1JEUA 4R6HA 4C0RA 1IZ1A 1IEJA 1DTZA 4NF4A 2DVCA 4KI0E 3G3GA 3C36A 3DLNA 1B7UA 3TTMA 1SQYA 1EH3A 3FV1A 1OQGA 3HPIA 2DSFA 3K6UA 2O68A 3S9LC 1AMFA 3PD8A 3FV2A 2HAVA 2DXRA 3MWBA 2Q8JA 1B3GA 1NFTA 4MFIA 2QPQA 4RNSA 3Q28A 2RC7A 5CMBA 2R9JA 1D9YA 4HW8A 4C1UA 3FXRA 2Y7WA 4R2FA 2KLFA 1QKBA 3N26A 4G8HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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