5I59A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx 007
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
282
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 262
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i59A02
4ZEKA 1ZBMA 3IB0A 3KN7A 5KZTA 4LONB 3LSXA 1Q35A 4ZEDA 4N13A 4U1OA 3SETA 2O68A 5I56B 4KQPA 3A3CA 3PPRA 4KCCA 1KWHA 1IXGA 1RYXA 2ONSA 4RJZA 4KHZE 5I2KB 1LGBC 1SYIA 4ELQA 1EU8A 3OO6A 4C0RA 3S9MC 4RPOA 1DTGA 3PD8A 4YMAA 4EQ7A 4F2OA 1RKMA 5FHNA 4BDOA 2ZNTA 5TPAA 4NTLA 2H98A 1BP5A 3MVYA 2REGA 1T0KA 3G3FA 5I59B 1IQ7A 4X48A 4DIGA 2X7QA 2FNCA 3G3GA 3O6IA 3O9PA 1I69A 3HHFA 2FYIA 4OMBA 1YPNA 3G7WA 2QS3A 1LCTA 1JVYA 4G68C 2D5WA 3HSTA 3TCGA 1ZJLA 3IOTA 1FCKA 2VHAA 3C32A 3M3KA 2I58A 3C36A 4NF8A 3WAEA 3S9EA 4KFQA 3KOTA 3EHTA 1M5EA 1OQGA 1ZMGA 2V25A 3BFTA 5EHMA 3QSLA 2DVCA 2XXVA 2DXRA 5KCJB 3IOWA 5AA4B 1QULA 2AYSA 5ISUA 2DQVA 2O51A 5JTYB 3RTFB 4U21A 4GL8A 3RT8A 3SEUA 3R6UA 3QUFA 1QKBA 1Y9UA 3RTWB 4QHQA 2PT2A 3OOAA 1N76A 4LVQA 4KYDA 5L9SA 4NE4A 2QS1A 4BDRA 1PDAA 1R9LA 3UGWA 4LZ7A 2WKYA 1SI0A 4GFRA 3RPWA 2NXOA 2DS9A 1FQFA 4OENA 1PBQA 1QUJA 3KSJA 5F1QA 1FQBA 3RNNA 3UA8A 3VDFA 2CMOA 3K4UA 1FTOA 4U4XA 2X26A 3Q29A 1EZ9A 1SYHA 4RYAA 1JEUA 5FHOA 4QFOA 1Y1ZA 1JW5A 3K6XA 3TFLA 1B7UA 4XKQA 1MS7A 4F3SA 1I6QA 2FA7A 1R9QA 5I58A 3W9WA 4IGTA 3PD9A 4P11A 1S9TA 4NF5A 3PUWE 3AXFA 1LAFE 2OK2A 4EF2A 2XXQA 4MBPA 2HQ0A 3PPNA 1PB9A 3KJTA 1II5A 3T9XB 3JYRA 4JBZA 3FXRA 2UVIA 5JEIA 2QPQA 2O6AA 2F36A 4R6KA 4FEDA 3K1NA 2Q2AA 1B46A 1NFTA 2DSFA 2F78A 4I9DA 1B3EA 3KFMA 3PUZE 1LCFA 2G93A 3RY3A 2I0BA 1AL3A 1M5BA 2P0SA 3OEMA 4OETA 3K1MA 3T9VA 3IJOB 4GOTA 5LOMA 3PPOA 3H6VA 4ONYA 2D21A 4F2QA 5HM4B 3MAMA 1H43A 2OWTA 1ZIUA 3C9HA 3FJ7A 3TODA 4RXLA 2RC7A 1BKAA 1USYE 1QW0A 4GLIA 1TFAA 4RA1A 4F3BA 1B32A 4OQOA 2UXAA 3MP1A 4ZEFA 5CI5A 2B65A 3A3UA 3FASA 2PYYA 1B51A 2I48A 3H6TA 3OSRA 1LAGE 1QUKA 3E3KA 5I57B 1O64A 1JNFA 2E0SA 1H76A 2R71A 1IXCA 1PB8A 2REJA 4JSDA 1B3HA 4QSEA 3JZJA 1N0TA 2DE2A 4EUOA 4AB6A 1D9YA 5H8FB 3FVKA 3GXAA 2XD3A 3DP6A 3TELA 2AL5A 4YKIA 2D3IA 2OBGA 1I6AA 4GD5A 1GVCA 1MG1A 4OXVA 5AA2A 2HAUA 2I4BA 3PPQA 1VE4A 3H7MA 4Q8RA 4OFLA 2ONRA 3EHSA 3T22A 2I3VA 2XXPA 3TDJA 5K2YA 1Z7NE 3K6UA 2O1MA 4EQBA 2Y7PA 4QF9A 3Q28A 3S2VA 5H8HA 1Y20A 4OHNA 4XKRA 2V93A 3N94A 3H4ZA 2PVUA 1FQAA 4H8JA 4OWDA 2XXHA 4N6PA 3VVDA 1PC3A 3D4GA 4XXUA 1Y4CA 2V84A 2QSXA 1MM6A 2RCAA 4F22A 5ITPA 3JV9A 1P1QA 2HCAA 2Z22A 3K02A 3DLNA 1MY1A 1WDNA 3T93B 1UTHA 1IZ1A 4PP0A 4ESXA 3SERA 3T66A 4F1VA 1NH7A 5TPAB 3SEVA 1MY4A 1FTKA 3OSQA 3T9UA 3ILTB 1DPEA 1N3XA 3FJGA 2F7AA 4I62A 4WKMA 2H25A 3C33A 1IEJA 2UVGA 4ZZAA 3ZKKA 2X7PA 2XXYA 1SVXB 3R26A 2PBWA 3FJMA 4JB7A 1BIYA 4NF4A 2NOOA 3K0VA 3HCQA 1Q1KA 3LSFB 4JSOA 4Q0CA 3MPKA 2Y7WA 3VLVA 3OXNA 1LB8A 2ZYOA 2F6PA 4K3FA 4NF8B 4F1YA 3TTKA 1H45A 1MY2A 2A5SA 3N26A 5AA1A 3THIA 3M3LA 4TLMB 4DXCA 3I5OA 4BDLA 2F5XA 1GR2A 1Y3NA 3GBAA 1ZLQA 1LFIA 1S50A 1A7LA 4M1VA 1MPBA 3EQ1A 4QFPA 1URSA 4RPNA 4IB2A 1B4ZA 1B6HA 3CFLA 2Q88A 2NVUB 4JDFA 4IO5A 2ZNUA 3TCHA 1XVYA 5L9MA 4O3CA 2XXWA 2Y7IA 4GL0A 3M3FA 4LUBA 2Y7KA 4C1UA 1GGGA 1ZU0A 3BFUA 3V8XB 4R2FA 5DVJA 1MY3A 4NMYA 3W9VA 4TLLB 1UQWA 1P1OA 1B7HA 3U92A 4BDNA 1B3GA 5A5XB 3FVOA 4YKKA 1US4A 1URDA 2OCUA 5H8QA 4E0WA 2XX7A 1B3LA 3Q27A 4FAJA 1LSTA 2PX1A 1JW4A 1OLAA 3RT6B 5AA2D 5I58B 4IY5A 3O6GA 4UACA 1MXYA 1MQJA 4RK9A 4QRZA 4NF5B 1H44A 3T9HB 3IAZA 4ZEIA 3TTNA 1NH8A 1NNKA 3KN8A 1M5FA 1P1UA 1LBCA 1S7YA 2YJPA 4ZE9A 2RC9A 4Z7EA 2R9JA 4H1XA 4OVJA 3HHGA 3KOSA 4OFOA 1LAXA 3FUZA 4GRKA 1B1HA 3MZ1A 4DE8A 4KI0E 4U1ZA 1MM7A 4YAHX 3IB1A 4DZ1A 2ZYNA 1Y3QA 1NNPA 1M5CA 5ICTA 5BUUA 1US5A 5FHMA 4ZEBA 1USYH 3K00A 3N6UA 4LZ5A 3M8UA 4OESA 1EZOA 1OIBA 1OMPA 4BDQA 3H6UA 4YB6A 4R6YA 1FTLA 3QIMA 5KDTA 4Q5TA 3ZSFA 4HCYA 1CB6A 1N7WA 1SW1A 1D9VA 5H8NA 4IO7A 1B9JA 1IITA 4IO2A 1L5TA 3OELA 4L17A 5L9OA 4KYSA 3ZS6A 3UP9A 4POXA 1A8EA 2UYEA 4IY6A 1B3FA 4ELOA 5IAIA 1MRPA 3EPEA 3OO9A 3VLWA 2F7BA 1NMUA 3QAXA 4R74A 3C34A 3V89B 1UTBA 2O69A 1P1NA 1Y4TA 1A40A 5CM6A 1XC1A 2PMSA 3TTRA 1JETA 3ILUB 3PMVA 1QKAA 1VSOA 2HZLA 3UORA 1DMBA 3B7DA 3G3JA 3VXBA 2XD2A 3IOVA 2GRVA 4FE8A 5AA2B 3K01A 3IORA 2GHBA 4MF3A 4G4PA 2Q89A 2H99A 1ZTYA 2W7YA 4EDPA 4H67A 5IKBA 3C35A 2G29A 1MQHA 1AMFA 4OERA 1VFDA 1IUDA 5H8HB 4R73A 3O97A 4YKPA 3N6TA 1YAEA 2F8DA 4GF8A 1B52A 2YLNA 3MJNA 3BKIB 2HFBA 4DDDA 3SEYA 1JQFA 3HN0A 2ZNSA 3RN8A 4LQ2A 4N07A 2GFEA 3TTMA 3LUYA 1UTHB 3TMGA 4DCYA 3OD7A 5JTYA 1GV8A 3GBBA 4MLVA 1MQGA 1MXXA 3MBPA 3D4CA 2Z8EA 2RF1A 1N7XA 3H03A 2O1LA 3R7XA 2NUVA 4TQUQ 4GXSB 3SEWA 4NEDA 1B4HA 1XHYA 4EF1A 1GTKA 4G2ZA 3B6QA 1A55A 1O7TA 4MFIA 1UIVA 3MZBA 3GZGA 4NF6A 1VFEA 3CSGA 3KG2A 1P1WA 1MDQA 3EHUA 1B58A 3CVGA 1ELJA 2HAVA 1B7ZA 1QUIA 4MLQA 4NF4B 2RCBA 5HBCA 3H6WA 3TYHA 1RYOA 4ZS9A 4G68A 2OZZA 4PFTA 3VVFA 1SW4A 4GQOA 2Q9TA 2A5TA 2DWAA 3TUSA 3TCFA 4THIA 3VE1B 2F34A 3RQTA 2VD2A 4DLDA 1MQDA 3LC8A 2UYFA 2XX8A 3IOUA 4U4SA 2O84X 3LSWA 3G3IA 1BTJA 4LQ5A 4GXAA 1B05A 1CE2A 3IO4A 3OEKA 1J1NA 1TFDA 4YB5A 4X1DA 3PMWA 1R1NA 4IGRA 4G8NA 2AIXA 5TP9A 4P0GA 5K2XA 3TAJA 4ESWA 1WVJA 3FXQA 1ATGA 1AOVA 1N04A 2R6GE 3MWBA 3L6HA 4IO3A 3U93A 3MUQA 3RUMA 5F7VA 3TQWA 2Y84A 3HPIA 5DVIA 5ELVA 3LBSA 3O28A 4KYEA 5AA3A 3CR9A 3E13X 3C4MA 5H8QB 4EXLA 2DE4A 1MPDA 2ONKE 3IB2A 3OO8A 3KN3A 1OLCA 4LZ8A 2DP8A 4H8IA 1ANFA 5DEXA 2PT1A 3O66A 5EYFA 1XOCA 3VV5A 3S4UA 5I2NA 3CG1A 3S9LC 3MPLA 3MP8A 1SI1A 1F9BA 4OEUA 1PEBA 3VXCA 3U72A 4DXUA 3FIRA 4PFUA 1LAHE 2DE3A 2E1SA 4F3GA 2KLFA 5I84A 2DWJA 3SESA 3Q25A 1MQIA 4XIGQ 3L6GA 1BLFA 5H8FA 4BLAA 4JXIA 1XVXA 5EHSA 1JW1A 2VGQA 1LFHA 5CMMA 3DM0A 1MXWA 1OQHA 4O3AA 1NL5A 4OEVA 3Q26A 2LAOA 3BBRA 4R9FA 2Z23A 2DVZA 3W15C 5BWJA 1AH5A 4KCDA 4RK2A 2VP1A 3U94A 4JWXA 3G3HA 1SBPA 4KPTA 4YU0A 4NWDA 5KDTB 2HZKA 2QS2A 5CMKA 1DTZA 2H4IA 4ISUA 1Y1MA 5H8NB 1D4NA 3B6TA 3HO7A 4F39A 3TTLA 3VVEA 3MP6A 3O6HA 4NWCA 1NKXA 2DWHA 2OJTA 4RNSA 1LBBA 2XXTA 3EN3A 2Z8DA 5ICQA 1N3WA 1AIVA 2F7CA 1LLSA 3CIJA 3VLUA 1B2HA 4YICA 1POTA 4IO6A 4H65A 3PUYE 1SD3A 1UTBB 4JWYA 4OYVA 1FQCA 3GLBA 3FATA 4WEDA 1YTVA 2QMXA 3CFZA 5H8SA 4LP2B 3FD3A 4Z0IA 4PE5B 2GH9A 4PFYA 5J1DA 3SEXA 2ZXTA 1SW2A 1MPCA 1MXVA 5FTIA 3FV1A 3ONMA 4EQ9A 1M5DA 2YPNA 4KD5A 1SQYA 4R6HA 2QMWA 4ZZEA 3OENA 3IO6A 5HPQA 1PBPA 4KR5A 1B0HA 3PGFA 3FVNA 5DYHA 4HTGA 4DXBA 4WXJA 3E4RA 4ECFA 5ITOA 1ZKBA 2VD3A 4OZ9A 1QVSA 5CBSA 4C1TA 4F29A 1IXIA 4U23A 3ODBA 3PMXA 1VR5A 2XXRA 4ELRA 1B0LA 3RLFE 2UVHA 1JEVA 1N84A 1SDXA 2F97A 3KSXA 4G8MA 1TWYA 5I56A 4H0WA 3TPAA 1HSLA 4LATA 4QFKA 2H9BA 3A09A 4QFNA 2XXXA 4XTCQ 2Z8FA 3OO7A 3RGYA 4AB5A 5I2KA 3VFJA 3MZ9A 1OVBA 5B70A 4NF6B 4G8HA 3UK4A 3S9NC 3O29A 1TT1A 2F6GA 4F31B 2RINA 1A99A 4R72A 4I8CA 1H3DA 2XXUA 4RY1A 1SW5A 3P7IA 3IK6B 2H5YA 3MQ9A 5I59A 3PUVE 3FGSA 3PV0E 4OFJA 4O3BA 2O7UA 4DCXA 1TXFA 4G68B 5A5XA 4ELPA 3F11A 1MY0A 3CSBA 3DP4A 4POWA 1A8FA 4XKNA 2B3BA 2QJEA 4PETA 3FXUA 2A5TB 4YZZA 1LFGA 3LSLA 1O63A 2Q2CA 4ZDMA 4UA8A 1POY1 3I6VA 2V3QA 4X9TA 5CMBA 1NNFA 1OVTA 3QUJA 4PFWA 3KBRA 3N5LA 4BDMA 1DOTA 1FQDA 4U22A 2QS4A 4MH5A 1PB7A 1IIWA 1B40A 2RKMA 1FTMA 2RC8A 2P1SA 3C31A 2HEUA 4I1DA 3KGCA 4QSCA 5JK4A 3T96B 1A54A 4LA9A 5KCJA 5AA4A 2DOJA 3E9XA 2XXIA 2ABHA 2DXYA 2ZMBA 1XS5A 4FATA 4R75A 3IX1A 4X1BA 5TP9B 2ZYMA 4FECA 2Q8JA 1MH4A 1JVXA 4GVOA 2ZYKA 3TKDA 2THIA 3WAFA 1UIUA 3UN6A 3KJ7A 2ANJA 3PUXE 2OWSA 4H5GA 3KZGA 5CBRA 1URGA 4GIZA 4JWOA 1FW0A 2QL3A 5DEXB 2NWJA 3K1PA 4XKPA 2V3UA 1NNTA 3CG3A 3DP8A 3FZVA 4Q30B 3QYTA 1MH3A 3U1OA 1D3KA 4HS7A 4QSDA 5I2NB 4ZE8A 3TEPA 2M8CA 4OTEA 2OLBA 4PQJA 2I0CA 4F19A 4YB7A 3TZAA 4HW8A 3USDA 3EF7A 3MVXA 1B5HA 5TU0A 3QXMA 3V83A 4R9GA 3CRBA 4G77A 3G3KA 1FQEA 1IXHA 4FJPA 2Y7RA 2UVJA 1EH3A 3PU5A 3IL1B 4IO4A 3CFXA 4YMBA 3ZKLA 2F35A 3MVWA 2CZLA 3V5AA 3DELB 5AE4A 2V3TA 4GWOA 3UIFA 3IR1A 1B5JA 2I3WA 1XT8A 3FV2A 4F3PA 4ZECA 3MVZA 1QJMA 2XX9A 4E0XA 2IA4A 3K2DA 3B6WA 2HXWA 5FTHA 2GHAA 4F18A 5B7DA 3SDFA 1Z7ME 5M2VA 4FEBA 1HSJA 1FTJA 4AQ4A 4ND9A 5DT6A 5CRYA 4F1UA 3I3VA 1DSNA 3QK6A 1LB9A 2QRYA 1YCJA 3H3GA 4TOZA 1MXZA 2I49A 1EZPA 2AL4A 1P99A 3K6VA 4H6DA 2ESNA 2O7IA 1HSEA 3SKPA 4U2RA 3U8QA 3OMBA 1B5IA 2BJJX 4M4GA 2DYXA 3H06B 1DPPA 3CI8A 3FVGA 1B1XA 4EXKA 2DWIA 1R6ZA 3KEIA 1Y3PA 3HV1A 5DVFA 5I57A 5CMCA 4FIMA 2I6EA 4WEPA 3ECRA 1WODA 4P0IA 2ALUA 4YKJA 3IJXB 3O2AA 2P2AA 2I4CA 3K6WA 1I6BA 3TQLA 3LR1A 2IEEA 2B3FA 3PPPA 5DTBA 4FORA 4R2BA 5CC2A 2XHDA 4QFLA 3MC2A 2VOZA 1MDP1 3MW0A 1MXUA 5L8DA 4HCWA 4H5FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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