5I84A

Structure of the xanthomonas citri phosphate-binding protein phox
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
DVTGAGASFIYPVMSKWSADYNAATKKQVNYQSIGSGGGIAQIKAASVDFGSSDAPLKPEELAAAGLAQFPSVIGGVVPVVNVPGIAAGTLKLDGKTLGDIFLGKVSTWNDPAIAALNPGVKLPEGKITVVHRSDGSGTSFNFTNYLSKVNPDWKGKVGEGTAVQWPTGIGGKGNEGVAAYVKQIKGGIGYVELSYALQNKMAYTAMKNAAGKFVQPSDETFAAAANSADWGTAKDFYLVMTNAAGDNAWPITATNFILVQKKPKNPAGLKNTLEFFRWVYTKGDAQAKQLDYVPLPDTLVTQIEAYWAKNLPH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Phosphate-binding protein PstS
publication title A gene duplication in phosphate-binding proteins from pho regulon of Xanthomonas citri: functional and structural studies
rcsb
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
total genus 81
structure length 314
sequence length 314
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i84A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i84A02
3KBRA 4TLMB 4RPOA 3K1MA 2VD3A 5L9SA 1IIWA 2UYEA 1QW0A 1MDP1 2IA4A 3E4RA 4QFNA 1ANFA 1UTBB 4ESXA 1SW1A 3G3IA 2OBGA 1OVBA 3FJ7A 4R75A 4EQ7A 5TU0A 3VVDA 4F2OA 4EQ9A 2I4CA 4IO6A 3PPQA 3MUQA 3MWBA 3GBBA 2OJTA 4R6YA 4R6KA 2PBWA 3HHFA 1S7YA 5I59A 4IGTA 3FD3A 4YKPA 4Q8RA 3KOTA 1Q35A 1LLSA 2Q2AA 3IOVA 3TTNA 1QULA 4IY6A 1MY4A 1Q1KA 1I6BA 1M5FA 1N84A 2NVUB 2PMSA 1B3HA 2Q89A 3EPEA 3LSLA 3UK4A 3H7MA 3T96B 3QK6A 4IO4A 2A5SA 3WAFA 1RKMA 3K4UA 1USYH 3S9LC 4EQBA 3N26A 2HQ0A 3VE1B 1KWHA 3UP9A 4H5GA 4NE4A 5I58A 4HTGA 4U23A 1FTKA 3MJNA 5EYFA 2F8DA 3TQWA 4F31B 4F3GA 4LQ2A 3IOTA 4QSEA 3MW0A 2XX9A 2AL5A 4F1UA 3FV2A 4ESWA 3C34A 3ZKKA 3HCQA 3QUJA 1UTBA 5A5XB 3L6HA 2I4BA 2M8CA 1RYXA 3BFUA 4LZ7A 1VR5A 2QRYA 1POY1 1ZLQA 1JEVA 2XX8A 3CI8A 4U4SA 2FYIA 1MH4A 1I69A 1MY0A 4F19A 3AXFA 3G3HA 5CMMA 1TFAA 4WXJA 1SI1A 3D4CA 4RA1A 2QL3A 2DE2A 4TQUQ 4EDPA 4OFOA 1B1HA 4X48A 3UORA 2UXAA 1OMPA 2V84A 4EF1A 1XHYA 3HSTA 2OWTA 2XXVA 3B6WA 1SYIA 1Y20A 1IXIA 5CRYA 2ZNUA 4EXKA 3N6TA 1PC3A 2LAOA 1PEBA 2ABHA 2A5TB 4LUBA 3OXNA 3H6WA 5FHNA 3OELA 4KR5A 5CBRA 1MPBA 3VV5A 4QFKA 3H6TA 1MRPA 2GH9A 2X26A 4XKQA 1OQGA 1NL5A 3RTFB 4FIMA 3MAMA 2B3BA 3N6UA 3U93A 1H3DA 2RC9A 2YLNA 4NWCA 3WAEA 4O3BA 4ONYA 1FQCA 2F97A 4M4GA 3PUWE 3C33A 4R9FA 5TP9B 3VXBA 1B7HA 1SW2A 4YB5A 4BDRA 4LQ5A 3ILUB 4C1TA 1JNFA 1T0KA 4N6PA 2O1LA 5KZTA 1D9VA 3IJOB 5CI5A 4C1UA 3CIJA 2UVGA 4G8HA 1LAGE 2AYSA 3TODA 1N7XA 2XD2A 2D3IA 4YKKA 1B7ZA 4HS7A 4LONB 2E1SA 2RCAA 1B0HA 4QSCA 5L8DA 1XC1A 4OERA 1LAHE 4WEDA 1Y1MA 1UTHB 1H44A 3SKPA 2VP1A 4GIZA 2KLFA 3LR1A 4MLVA 4WEPA 4POWA 1O64A 1S50A 3H6UA 3W9VA 5H8QB 2Z8FA 3ECRA 4R73A 5KDTB 2Q2CA 4E0XA 2P0SA 4RK9A 2Q8JA 1MXYA 2OLBA 2RC8A 4RXLA 3QIMA 1US4A 2WKYA 3O28A 4G8NA 4RNSA 3K00A 2F7AA 1MQHA 4ZEBA 3E3KA 4GD5A 1FQDA 1II5A 4ELQA 1B4HA 3MZ1A 4EUOA 5L9MA 1XVYA 2XXIA 1VSOA 3PMVA 1FW0A 4XKNA 1CE2A 1QUIA 2O7UA 2CZLA 1MQDA 4G2ZA 1D9YA 4Z7EA 1JVXA 1SD3A 5JTYB 3FJGA 1LBCA 4GXAA 4XKPA 1D4NA 5AA3A 3TPAA 3IB1A 3LC8A 1MM7A 1DPPA 3FVKA 2V3QA 3V5AA 1SVXB 3PD8A 3FIRA 2I0BA 1MY2A 4PFTA 1UTHA 3H03A 3OEMA 3C36A 3IO4A 3SERA 5LOMA 3UIFA 1B52A 1VFDA 2H25A 3B6QA 3MP6A 5KDTA 1BKAA 1JQFA 4KFQA 3RPWA 4OEVA 3HPIA 1O63A 2THIA 3C31A 4RPNA 4LA9A 4YB6A 1YAEA 3IR1A 3BKIB 3VVFA 5ITOA 5ELVA 5I84A 2ZNTA 2ONRA 4EXLA 3FUZA 2UVIA 4K3FA 2DVZA 2Q9TA 3K6UA 3P7IA 4G4PA 3PMXA 3PU5A 1TT1A 1B2HA 4IO3A 3W15C 2HFBA 3SEYA 1MXWA 4QFLA 1MG1A 1FQBA 5JTYA 5FHOA 1LFIA 4RJZA 1BIYA 4IB2A 3G3KA 3IJXB 1Y3QA 3D4GA 4OXVA 3USDA 4JBZA 3N94A 1QVSA 1OLAA 4TLLB 3PV0E 5I56B 2HEUA 1Y1ZA 2G29A 5B70A 2ZXTA 2DS9A 2P1SA 4ND9A 2ZNSA 2QS3A 3G7WA 3PUXE 1B3EA 5ISUA 4IO2A 4ECFA 5HPQA 2BJJX 1P1WA 3L6GA 3IO6A 1B1XA 1LBBA 2XXRA 2Y84A 3T9UA 4G68C 4KYSA 2O68A 3K6XA 4G68B 4OQOA 2QJEA 3ZSFA 1MXVA 2B65A 1WVJA 1I6QA 2QS4A 2XXPA 2P2AA 2V3UA 3TFLA 1LGBC 3PPRA 2DWIA 5H8SA 4IO7A 3A09A 3TAJA 4FATA 4LATA 4NF5B 5CMCA 3CSGA 3RT8A 2OK2A 1SYHA 4H1XA 1LFHA 3LUYA 1ZTYA 2I6EA 1JEUA 3MVXA 3PMWA 3C9HA 1AMFA 1B05A 1Y4CA 5DVFA 1OLCA 3M3FA 4XKRA 1PDAA 3IAZA 2HZLA 3BBRA 4XIGQ 4YKJA 1SQYA 4KYEA 4AQ4A 5JEIA 1FTJA 2F35A 2IEEA 3GZGA 2GHBA 3ODBA 4JDFA 5I57A 3M3LA 2ZYKA 2QMWA 2QPQA 1B4ZA 3I3VA 3Q26A 4ELOA 1DPEA 3RGYA 1EH3A 1IXGA 4Q5TA 4PETA 2OCUA 2ZYNA 4LVQA 5H8NB 1MQGA 1XT8A 2XXTA 2REJA 2F78A 3RNNA 1IITA 3OO7A 4G68A 4O3CA 2VD2A 2ONKE 5I2KA 3OO8A 4BDMA 1DMBA 1NMUA 1QKBA 3FASA 4U1ZA 3T22A 1JETA 4KCDA 5F1QA 1A40A 2R71A 2V93A 1UIVA 1P99A 3EHSA 2H4IA 3OEKA 1MY1A 4OFJA 4GL0A 4EF2A 4GQOA 2Y7RA 3DM0A 1UIUA 3VLUA 2ZYMA 2H98A 1A8FA 4PFYA 3CR9A 1B46A 1P1NA 4FORA 2XXHA 3U92A 1RYOA 1P1OA 1M5CA 3C32A 4JXIA 2ONSA 1AIVA 1GTKA 3UA8A 4IY5A 2UVJA 3PPOA 2I3VA 4GWOA 4C0RA 1YPNA 1MM6A 2DE4A 2F34A 4OTEA 2I0CA 2VGQA 1N04A 1HSLA 1Z7NE 2HXWA 3PUZE 5H8NA 3O29A 2I48A 3H3GA 3U72A 5AA2B 1QUJA 1B32A 3SESA 4DLDA 1EZPA 5H8HB 2G93A 4FJPA 2NOOA 3K6WA 3TDJA 4KYDA 3O6GA 4YKIA 1R6ZA 1L5TA 3S9NC 3A3CA 4KQPA 1FTLA 5A5XA 2F6PA 4R74A 4KPTA 4DXCA 1EZ9A 3KFMA 2Z23A 3MZBA 3MVWA 2R9JA 2ANJA 1DTGA 3FXUA 1LB8A 5AA1A 3THIA 4IGRA 2OZZA 2Z22A 3SEUA 3MBPA 3KN3A 3OSQA 3TEPA 3E9XA 1UQWA 4X1DA 3FGSA 2O69A 1IQ7A 4MFIA 2HAUA 3LBSA 4FEDA 3O97A 3U94A 1SW4A 1H45A 4ELRA 5CBSA 3CFLA 4PQJA 1LCFA 2Z8DA 3EQ1A 2DOJA 4M1VA 2I58A 2XX7A 5H8HA 1N76A 4PP0A 5F7VA 1JW1A 2DWAA 5IKBA 3CG3A 1LSTA 2A5TA 1F9BA 3QAXA 2O51A 3H6VA 1MPCA 1B0LA 1HSEA 4OEUA 3KSJA 1GR2A 3OOAA 4DZ1A 4ZS9A 3ONMA 2H9BA 1XS5A 1MXUA 2GRVA 1GV8A 4OETA 3SEWA 4DXBA 1OQHA 3PPPA 3S4UA 5TP9A 4AB5A 2HAVA 4ZZEA 1DOTA 1VFEA 4U22A 5K2YA 3IB2A 1IXHA 4HW8A 2VOZA 1AL3A 4KCCA 2VHAA 1SW5A 5IAIA 3S9EA 3FJMA 1IEJA 4NF8B 1A99A 3IOUA 2DXYA 2PX1A 4RK2A 2XHDA 3KOSA 5H8FB 4H5FA 1B5IA 1I6AA 1Y3NA 4JSDA 4OENA 5ICTA 1A54A 4OESA 4LP2B 2YJPA 3MP8A 2DYXA 2I3WA 1PBPA 4NF4B 4X1BA 5BWJA 4P11A 3C35A 2Y7KA 3K02A 5H8QA 2GHAA 4F22A 3FZVA 3G3FA 1S9TA 3O9PA 3TZAA 4F39A 2AL4A 5CM6A 1MS7A 2F5XA 4HCYA 3VVEA 3TELA 2PT1A 3CG1A 5M2VA 1MQJA 5HBCA 4H0WA 3TTKA 5TPAB 1Y9UA 2UYFA 1ZKBA 2QSXA 4XTCQ 1DTZA 4NF8A 4NWDA 2QS1A 2H5YA 3OD7A 1NNTA 4ZECA 1Z7ME 3OMBA 3FVNA 4QRZA 2DWJA 1B9JA 1LFGA 1MQIA 3KGCA 3MVZA 4H65A 2O7IA 2ALUA 3SDFA 3K2DA 3QSLA 3KEIA 2D21A 4JSOA 4NF4A 2F7CA 1BP5A 3O66A 4PE5B 1BTJA 2YPNA 3TCGA 1BLFA 1POTA 3TMGA 1A8EA 2NUVA 3MC2A 3RLFE 4HCWA 2ZYOA 4YZZA 4E0WA 1ZIUA 3O6IA 1B3LA 1R9QA 1ZMGA 4GFRA 3K6VA 1IZ1A 4L17A 4FAJA 5I59B 1XOCA 3SEXA 1B7UA 4DXUA 2CMOA 2HCAA 3G3JA 1WDNA 4JWXA 3CFZA 2E0SA 2NXOA 4I8CA 1URDA 4ZE8A 3RN8A 1YTVA 3TKDA 3PPNA 3R7XA 4O3AA 3VFJA 3T66A 2DVCA 5I58B 2XXXA 1QJMA 5EHSA 3KN8A 5ITPA 1N7WA 3MVYA 4F3SA 3HHGA 4BDQA 4P0IA 3CVGA 1MPDA 4YU0A 4DDDA 4NTLA 4G8MA 4ZE9A 3T9VA 2O1MA 3QXMA 2DP8A 1P1QA 3KSXA 4U1OA 2F36A 5I56A 4ELPA 3ZS6A 5JK4A 4FECA 1JW4A 2F7BA 5I2NB 4R9GA 4ISUA 3F11A 3MPKA 4F18A 5CC2A 3S9MC 1B40A 4Q0CA 4MBPA 3R26A 1SDXA 1OVTA 1LAXA 3TQLA 1B3GA 4QSDA 2XXWA 3IL1B 3LSFB 4FE8A 2RCBA 4QFOA 1B5HA 2V3TA 2X7PA 4PFWA 3MP1A 5DYHA 3G3GA 4ZEDA 1Y4TA 4GVOA 1O7TA 2RINA 5ICQA 4GXSB 3FVOA 4QFPA 3CSBA 4GLIA 4I9DA 4N13A 3QUFA 1LB9A 2ESNA 5FTHA 4BDNA 5CMKA 1LCTA 4YICA 4DCYA 4F1YA 4NF5A 2RC7A 5DVJA 2V25A 4R6HA 2W7YA 2XXUA 4GL8A 2PVUA 1EZOA 2FNCA 4UA8A 1QUKA 3B6TA 1LAFE 5J1DA 4OHNA 3TTLA 3K1NA 2D5WA 5I2NA 4OYVA 3HN0A 3DLNA 1IXCA 2RF1A 3KJTA 3DP4A 3RTWB 3PUYE 5DTBA 3DP8A 4NF6B 4G77A 1PB8A 5HM4B 2OWSA 3UGWA 4F3BA 1TFDA 1USYE 2O6AA 4F1VA 3CFXA 5L9OA 1FQEA 3V89B 3V83A 5B7DA 4YB7A 3FVGA 4UACA 3R6UA 5AA2D 1FCKA 4F3PA 4NEDA 2X7QA 1AH5A 2Y7WA 4OVJA 4P0GA 4JWOA 4QF9A 4N07A 3KN7A 3PUVE 1NKXA 3QYTA 5KCJB 4OMBA 3EF7A 3GXAA 4RY1A 1N3WA 3EHUA 2F6GA 3IORA 1D3KA 1FTMA 1CB6A 3Q29A 1M5BA 5EHMA 4MLQA 1MH3A 3PGFA 1ZU0A 3M8UA 3JV9A 1H76A 1PB9A 3VLWA 4BDOA 3FXRA 4U4XA 4NF6A 4H8IA 3IX1A 3OENA 2XXQA 1M5EA 3EN3A 4OZ9A 3E13X 4R2FA 4FEBA 1TWYA 3ZKLA 4XXUA 3RUMA 5AA2A 3H4ZA 1HSJA 4GRKA 3U8QA 3FV1A 2RKMA 3I5OA 3I6VA 3O6HA 4R72A 3Q27A 1YCJA 3OSRA 5AA4B 4ZEIA 3GBAA 3VXCA 4F29A 4MH5A 1A7LA 1IUDA 1MDQA 1SI0A 2UVHA 5KCJA 4H8JA 2H99A 3DP6A 3O2AA 1VE4A 2NWJA 5CMBA 1B51A 3TTMA 3JZJA 2Y7IA 3K1PA 4YMAA 1B58A 1DSNA 1URSA 4KI0E 1NH7A 5AE4A 4MF3A 1PBQA 3IOWA 1NNFA 2FA7A 1A55A 4RYAA 3MQ9A 1ZBMA 2XD3A 2I49A 4OFLA 4R2BA 3SEVA 4ZDMA 3HO7A 4AB6A 5DT6A 3SETA 5DEXB 4WKMA 4POXA 3ILTB 3KZGA 3T9HB 2Q88A 1NNPA 3T93B 5FHMA 4ZEFA 2GFEA 4ZEKA 1SBPA 1GGGA 4PFUA 3KJ7A 1Y3PA 4F2QA 3IK6B 5AA4A 1MY3A 2DXRA 1ELJA 3RQTA 2QMXA 3JYRA 1AOVA 3TCHA 4I1DA 4KD5A 1R9LA 4GOTA 1B6HA 3KG2A 2Y7PA 1OIBA 4DCXA 1JVYA 3RY3A 5FTIA 1NNKA 4QHQA 4GF8A 3M3KA 4Z0IA 1ATGA 3C4MA 4IO5A 3FATA 5BUUA 3DELB 3S2VA 3LSXA 2O84X 3W9WA 1ZJLA 1PB7A 4LZ8A 4KHZE 2DWHA 3GLBA 3PD9A 4I62A 1H43A 1GVCA 1WODA 3TUSA 4YAHX 5H8FA 2Z8EA 5DEXA 3MZ9A 4ZZAA 4JWYA 2DQVA 2DE3A 3K01A 4H6DA 1US5A 1M5DA 4X9TA 3RT6B 2REGA 3K0VA 4TOZA 4DIGA 1FQFA 2QS2A 2ZMBA 3OO6A 3VDFA 2AIXA 1TXFA 4JB7A 3Q28A 1JW5A 4NMYA 3U1OA 4THIA 1QKAA 3LSWA 4LZ5A 2R6GE 4Q30B 1NFTA 1XVXA 4YMBA 4BDLA 3B7DA 1FTOA 1EU8A 3Q25A 1N0TA 2B3FA 1P1UA 3OO9A 3HV1A 5I57B 1B3FA 5TPAA 3FXQA 3TCFA 4OWDA 1N3XA 5K2XA 1B5JA 3T9XB 1R1NA 3BFTA 1MXXA 2XXYA 3H06B 4U2RA 2HZKA 4U21A 3TYHA 2DSFA 5DVIA 3V8XB 3CRBA 3UN6A 3MPLA 2PT2A 3VLVA 3A3UA 4BLAA 3IB0A 4H67A 1MXZA 3TTRA 4DE8A 1URGA 1FQAA 5I2KB 2PYYA 1NH8A 1J1NA 3N5LA 3EHTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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