5ISUA

2.2 angstrom crystal structure of abc transporter substrate binding protein ctap (lmo0135) from listeria monocytogenes.
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
488
structure length
488
Chain Sequence
KDGGSLIIGVTGDPEVINPNYASDRVTLTIQQAVYAPLFWEVDGKPALAKSLDISDDNLTYTVKLKDGLTWHDGKPLTADDVVFTVNSILDTKQNSPNRGNFVFDDKPVKVEAVDDTTVKFTLPTVAPAFENTIKTFFPIPKHIFEGVENIEKSDKNKNPIGSGPYKFVEYKTGEYVSLERFNDYFDGKPKLDKVTFRITKDQNAANLALQNGEINLKSIQPSDRNKVEKASAVNIITYPENRLSYATFNENQPALKSKELRQALSYALDREEIIDAAYGSDEYAKPASSFLTENTKYFTDKVETYDQDIAKAKKLVKESGFDTSQKLTVYYLNNSKSQESIALYLQQQYKEIGVTLDLKPTDPNALSNITLDRKNADYSIALNGYIMGNDPDAYKSLYLSDAPYNYSNYHNKDLDALWEKGAVTADDKERQEIYEKIQNTIADDAVIYPISYDNAVLALDSRYGGQKAATPQPVTMFRDLSKLYLTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transport protein
molecule keywords Lmo0135 protein
publication title 2.2 Angstrom Crystal Structure of ABC Transporter Substrate Binding Protein CtaP (Lmo0135) from Listeria monocytogenes.
rcsb
source organism Listeria monocytogenes egd-e
total genus 169
structure length 488
sequence length 488
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 5isuA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5isuA01
3.90.76.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Dipeptide-binding Protein; domain 1 Dipeptide-binding Protein; Domain 1 5isuA02
4R6KA 2X7PA 1ZIUA 3QIMA 4QFNA 2E0SA 1YAEA 3PUXE 3R6UA 2PX1A 3PPOA 5BUUA 5KDTA 5TP9B 2Z23A 5L9OA 3O28A 2OWTA 4JSOA 1YTVA 2QPQA 4U4SA 1NKXA 4JB7A 3VXBA 3RY3A 5F1QA 5K2YA 4ZZEA 3QYTA 3TTRA 1JEVA 4ONYA 4YKIA 2I3WA 5I59A 3IK6B 3K6VA 3GBAA 1MQGA 3HCQA 1S50A 2R6GE 1PB9A 3BFUA 4ELPA 1IXHA 1Y3QA 4K3FA 4EF2A 5ISUA 1I69A 3ZKLA 2YPNA 1S9TA 1II5A 1B52A 4AB5A 1MXUA 1JQFA 3DRGA 1A8FA 4PFTA 2H99A 3OEKA 3DP8A 1B0LA 4LQ2A 2A5TA 1N04A 4IGRA 4P11A 4IY5A 4TLLB 2UXAA 5DVJA 3PAMA 5H8HA 1EZ9A 2HEUA 2UVJA 4QRZA 4TOZA 1O64A 4HS7A 3C4MA 4I1DA 4N07A 4PETA 1JVXA 1TT1A 3CFLA 1GGGA 3C34A 2IA4A 3B6WA 1QW0A 2WKYA 4DZ1A 1N7XA 1H43A 4GL0A 5BWJA 3OO7A 1FW0A 3VVFA 1T0KA 3G3KA 1A55A 5CMCA 1RKMA 1M5CA 5CRYA 3B7DA 3VFJA 1RYOA 4IO7A 3IO6A 1SI1A 4F2QA 3TKDA 4F18A 3K01A 4KQPA 3V89B 1XVYA 5FHNA 1ZKBA 1URDA 1FQEA 1PDAA 1PBQA 2ZNUA 3KEIA 3O9PA 5DEXA 3W15C 3OMBA 1B7ZA 1RYXA 1QUIA 3MZ1A 3RPWA 3O6HA 3W9VA 3FD3A 1VFDA 2XXPA 5ICQA 3QXMA 4FE8A 1DOTA 1P99A 3DELB 1XT8A 2ABHA 1GR2A 1QJMA 2V93A 1QUJA 4LQ5A 3O66A 3RLFE 4QSEA 2RC7A 2F36A 4KYEA 1A54A 2XXUA 3MWBA 4F22A 3G3JA 1HSEA 3IB1A 3K1NA 1MPCA 1ZBMA 1ZMGA 2ZMBA 4R75A 2XD2A 2YLNA 4F39A 2RCBA 1MQJA 1FCKA 2V84A 4H5FA 5CBSA 2DWAA 1MQIA 3KJ7A 3ILTB 4NF8A 1I6QA 2DE2A 4OEVA 4NMYA 4EQ7A 1OVBA 4YB5A 4Q8RA 5CMMA 3FVNA 4JSDA 2GHAA 1MG1A 4OVJA 4LP2B 4XKRA 4XXUA 1NH8A 4G68A 2H25A 2DVZA 2IEEA 5AA4B 5ITOA 2DQVA 2ZYKA 3MZBA 3LC8A 1MQDA 4ELOA 1P1WA 3K1MA 2RINA 3SEYA 4QF9A 2HFBA 3CSBA 2FA7A 1B3EA 2HCAA 1UTBB 4TLMB 2QS4A 3E9XA 2QMXA 1B4ZA 4GVOA 4L17A 3FATA 1B32A 1MRPA 5FHOA 2DWJA 2H9BA 1LFGA 1Y4CA 2DXYA 2X7QA 4F2OA 1SD3A 4OFOA 1B5JA 5H8FB 3VLWA 4X9TA 1CB6A 3MP1A 1MH4A 4Q0CA 5EHMA 4E0XA 2DP8A 3S9MC 3EQ1A 3IORA 3HHGA 3EHUA 2R71A 1B51A 1DTZA 2UYFA 5H8NA 3O6GA 1LAFE 3ZSFA 2Q9TA 2DOJA 4OZ9A 1D9YA 1D4NA 3LR1A 1CE2A 3SKPA 3MJNA 4WKMA 4KCCA 4DE8A 3ILUB 2O51A 2A5SA 1EU8A 5CMBA 3TMGA 2XD3A 3OEMA 3RGYA 1B7UA 3T96B 2NOOA 4IB2A 2OWSA 3N6UA 3CVGA 3DLNA 3FVGA 3FASA 3IJOB 3HSTA 4ZDMA 1PB7A 3VVDA 4ZE9A 4FORA 4QFOA 4G2ZA 1FQAA 3EHTA 4F3BA 4H5GA 1LAGE 2GHBA 1JEUA 3DRIA 1IITA 3CRBA 5KCJB 1NFTA 2O6AA 2REJA 4MF3A 4JWYA 2V3QA 2E1SA 1SW1A 3C33A 2O84X 4LATA 1MPDA 4RK9A 3R7XA 2DYXA 4YKPA 4ZEKA 3WAEA 4RYAA 1H76A 4TQUQ 4MLVA 5TPAB 3N26A 3CSGA 3K2DA 1B6HA 2G29A 3PV0E 3P7IA 4YU0A 4U23A 3GXAA 2VGQA 3CR9A 2ZYMA 4LA9A 4R72A 2F7BA 4I8CA 3AXFA 3VLVA 3DRFA 1JW1A 4NE4A 3KBRA 2WOPA 2F78A 3FVOA 3BFTA 3V5AA 1GTKA 3UA8A 5I57B 2DWIA 1USYE 1B58A 4H8IA 1BP5A 1EZPA 5I58B 4DLDA 4KPTA 2PT2A 3HO7A 1O63A 2DVCA 3OO6A 2XXWA 5ELVA 3RYAA 2ZYOA 3K6UA 2F6PA 3EN3A 2I0CA 5AA2A 3ZS6A 1FQBA 4XTCQ 4F29A 1N7WA 2I6EA 2DWHA 3VVEA 4THIA 2QRYA 4G8NA 4I62A 3ONMA 3IOUA 4OYVA 4DXUA 2WOKA 1MY0A 1Y1ZA 1URGA 3G3FA 4RXLA 2PVUA 3FZVA 2Q8JA 5M2VA 2OJTA 1NMUA 1UIUA 4PFUA 5AA1A 4O3AA 1D3KA 1Z7ME 4PP0A 3S9NC 1NNKA 4JBZA 2DSFA 3K6XA 5IKBA 2I4CA 3M3LA 1FTJA 2CZLA 3SDFA 2Y84A 3Q27A 3RYBA 3PMXA 4YMBA 1R9LA 1TXFA 2ESNA 5L8DA 3TTMA 3Q26A 3PPPA 4MBPA 3IX1A 1P1UA 1JW5A 1JETA 4RJZA 5TP9A 3GBBA 1XC1A 4GWOA 2Q2AA 3SEUA 2OBGA 4NWCA 3CIJA 4LVQA 3H6VA 5DYHA 1ZJLA 2Z8FA 5J1DA 3U1OA 3H6UA 3U8QA 1SW2A 3CFZA 3G3HA 4BDOA 4MH5A 1IZ1A 3IJXB 3K4UA 1NL5A 4XIGQ 3A3UA 1LCFA 2ONSA 3T66A 4E0WA 4G77A 2OCUA 3Q25A 2B4LA 4H6DA 2QS2A 1WODA 2VHAA 2HZKA 3N5LA 4H65A 4OHNA 1UTHB 1LFHA 4MLQA 2RC8A 2XXXA 4QHQA 4GRKA 1MQHA 4YZZA 1R9QA 4U4XA 2AL4A 2XXRA 3RN8A 1R6ZA 3OOAA 1Y20A 3TTNA 1IIWA 1MY2A 4R6HA 1SYHA 3OSRA 4NWDA 3G3IA 4OETA 1O7TA 4F3SA 2F34A 4F31B 2PMSA 2FNCA 2F5XA 3VLUA 4YKJA 2H5YA 1B5IA 3TELA 2PYYA 1LB9A 3LVUA 1UIVA 4RA1A 4C1UA 4ZEFA 2FYIA 2DXRA 2WOLA 4NEDA 3TUSA 1OLAA 1XS5A 1Q1KA 4EXLA 3JV9A 5B70A 2UVHA 5DVIA 1A7LA 3MBPA 3DRKA 3A3CA 3KSJA 1B3GA 2ZXTA 4OESA 4O3CA 1MS7A 4OQOA 4ESXA 4AB6A 2V25A 1MDP1 4F1YA 5AA3A 1NNFA 5CC2A 1MM6A 2D21A 1LBBA 2I3VA 3G7WA 4ZEIA 1LBCA 4DXCA 3SERA 4HCYA 2HXWA 2BJJX 1LAXA 4Q5TA 1N3WA 3K00A 3SETA 3RT6B 4PFYA 3DRJA 1MPBA 2PT1A 1POTA 3FUZA 4BDLA 2ALUA 3TYHA 3TEPA 1M5EA 2Z8EA 2ONKE 3QUFA 1DSNA 4LUBA 1BTJA 3M3FA 4ZZAA 1YCJA 1AMFA 1ATGA 1MXWA 2F7CA 3KJTA 4FATA 1GV8A 5AA4A 2ANJA 1HSLA 1MY1A 1JVYA 4JDFA 1Z7NE 1B40A 3VDFA 1SQYA 3SEXA 4LZ8A 4OMBA 5JTYB 3UIFA 2R9JA 3BBRA 4OFJA 1A40A 1UTBA 3O29A 2QSXA 3MPLA 3PD9A 1P1NA 1TFDA 3CG3A 4KFQA 1S7YA 5I2KB 3FXUA 2XX9A 4F3GA 5ITPA 4NF6B 2RKMA 5I84A 2W7YA 4Z0IA 4PE5B 5H8FA 3LSWA 1AIVA 5F7VA 5CM6A 4FIMA 3KOTA 4HTGA 5CI5A 1QKAA 3FVKA 2I49A 3MPKA 1MM7A 3DP4A 4NF4B 4YMAA 1SVXB 1BIYA 4F3PA 5TU0A 1P1OA 3JZJA 4NF5B 4Q30B 1XOCA 2B3BA 3V83A 5I2NB 3FJGA 3L6HA 5JK4A 4KR5A 4XKQA 3PU5A 4RPNA 4GLIA 2G93A 4GD5A 1A8EA 3JYRA 5A5XB 5DVFA 5LOMA 3W9WA 4DCYA 3MVYA 1OIBA 4IO3A 1PEBA 3M8UA 3T9UA 4ZS9A 1AOVA 1OVTA 1VE4A 4POXA 4IO2A 5HPQA 2XXYA 4AQ4A 2Y7PA 3H4ZA 3MZ9A 2F35A 4EF1A 4ND9A 5H8SA 3OELA 4GXAA 4RNSA 3O6PA 3B6QA 3TQLA 1EH3A 4IO4A 2DE3A 2UVIA 4G4PA 1B1HA 2XXHA 4NTLA 3I6VA 3VXCA 3RTFB 1IQ7A 3CFXA 5KCJA 3LSFB 3RUMA 3TODA 3U93A 5H8QB 1MXXA 1LSTA 4P0GA 5K2XA 4R2BA 1M5DA 1DPEA 2CMOA 3TCGA 3LSLA 1Y4TA 1MDQA 3S2VA 3E3KA 3FJ7A 2VD3A 2OZZA 4R73A 2B65A 4OENA 4ECFA 5TPAA 2YJPA 4U21A 4EXKA 1DPPA 3GLBA 3MVZA 3FXRA 3T9VA 1L5TA 2V3TA 1VSOA 1H3DA 3T93B 2D3IA 3G3GA 3O97A 1BLFA 3O6IA 4HCWA 3H7MA 1USYH 5I57A 3UN6A 3PPQA 3MVWA 3IR1A 3U94A 5I58A 3RT8A 2I4BA 2Q88A 1OLCA 1BKAA 4JXIA 4H0WA 5L9MA 2ZNTA 3TFLA 4PFWA 1N3XA 2B4MA 3FV1A 2REGA 1LAHE 4DXBA 2V3UA 1N76A 3UORA 3WAFA 3FTOA 5AE4A 2O69A 4IY6A 4BLAA 3DP6A 2OK2A 5I56B 3N94A 1B9JA 2F7AA 4F1UA 3HV1A 4EQBA 4GF8A 4X1DA 1QVSA 1SYIA 4QFPA 4YKKA 2NWJA 4HW8A 3K02A 4ZE8A 4LONB 4IO6A 1LB8A 4N6PA 1OQGA 3KGCA 4FAJA 2XXIA 1PBPA 4DIGA 2GH9A 4OERA 2O7UA 2VD2A 1FQDA 3L6GA 4RK2A 1Y3NA 4KHZE 5KZTA 2QL3A 1VFEA 2VOZA 1TFAA 5KDTB 3R26A 1MXVA 2P1SA 4ISUA 4U22A 1FQCA 3H3GA 4BDNA 4U1ZA 4EDPA 2AYSA 3MC2A 1D9VA 4H8JA 3MVXA 1LFIA 4YB7A 4FECA 3S9EA 3SEWA 1AL3A 1I6BA 3KFMA 3Q28A 3I5OA 4OEUA 3OD7A 3FJMA 3CI8A 5I59B 1B2HA 3FXQA 3I3VA 3PGFA 1VR5A 2HQ0A 1EZOA 4GQOA 5DTBA 2F97A 1AH5A 2VP1A 3MP6A 2GFEA 2DE4A 1FTOA 2RCAA 4Z7EA 4WEDA 2UVGA 1SDXA 4JWXA 1UTHA 2GRVA 1SW4A 2I48A 3TTKA 3Q29A 4JWOA 4QSCA 3PD8A 3PUYE 2NVUB 3OO8A 4R6YA 5DT6A 5EHSA 1FTLA 3OXNA 2A5TB 4FJPA 3LSXA 3CG1A 2OLBA 1MY4A 2M8CA 3H6TA 5H8HB 1Y1MA 3N6TA 3MW0A 3C31A 4RPOA 1B3LA 3RQTA 2B3FA 1US5A 5ICTA 3FIRA 3FV2A 4OWDA 2P2AA 1B46A 4X48A 2HAUA 1GVCA 3TPAA 5EYFA 1YPNA 3C32A 2P0SA 1DTGA 3EF7A 3VV5A 3ECRA 3HN0A 2RF1A 5FHMA 5DEXB 1FTKA 1Y9UA 2HAVA 3KN3A 4UA8A 2AIXA 4C1TA 4IO5A 4GIZA 2Y7IA 3ZKKA 2XX8A 3TQWA 3PUVE 3H06B 2Q2CA 1PB8A 3D4GA 2O68A 1M5BA 4GXSB 4BDRA 1B3FA 3V8XB 1OMPA 3ODBA 3RTWB 1I6AA 4QFKA 1TWYA 1QKBA 2XHDA 4BDQA 2Z22A 1SBPA 4ZECA 4F19A 3OO9A 5IAIA 2KLFA 1IXIA 4C0RA 3KZGA 5HM4B 4M4GA 2O1LA 4NF8B 3E4RA 1ELJA 1ZU0A 2F8DA 1LCTA 4ZEDA 4H1XA 3HHFA 3IOTA 3IO4A 3LUYA 1JW4A 1XHYA 3M3KA 2UYEA 3DM0A 1ZLQA 2QS1A 4LZ5A 2Y7RA 5B7DA 4OTEA 3PPNA 4G68B 1QUKA 3PMVA 2QJEA 2QS3A 4RY1A 4ESWA 1FTMA 2ONRA 1JNFA 2XXQA 2THIA 5JTYA 2XX7A 4XKPA 1B5HA 3IB0A 2HZLA 1F9BA 1DMBA 1IEJA 1N84A 4KYDA 5I2KA 1B1XA 4U1OA 1P1QA 4NF6A 2QMWA 3C35A 5CBRA 4H67A 1B7HA 3DRHA 1ANFA 3KSXA 2PBWA 1IUDA 3TDJA 3CHGA 3EHSA 2I0BA 1URSA 1B4HA 4GFRA 4O3BA 1XVXA 3USDA 1LLSA 1Y3PA 3UGWA 1UQWA 4DDDA 4NF4A 3H6WA 1MXYA 3U92A 1MY3A 1Q35A 5AA2D 4NF5A 3PUWE 3THIA 3UK4A 4GOTA 3T22A 5I2NA 4P0IA 3S4UA 4WXJA 2O7IA 4XKNA 4F1VA 3U72A 5H8NB 5A5XA 2Y7KA 2NXOA 3T9HB 3IAZA 4UACA 4KD5A 1NH7A 2H4IA 2LAOA 3PPRA 2ZNSA 3K1PA 3QAXA 3SESA 1FQFA 4EUOA 1WVJA 3KG2A 3K0VA 4ZEBA 3HPIA 1LGBC 1MXZA 3EPEA 3RNNA 3IOWA 3KOSA 1WDNA 4N13A 1HSJA 2ZYNA 3MAMA 4YAHX 3PMWA 1POY1 1B3HA 1NNPA 1SW5A 4EQ9A 4KYSA 5H8QA 2D5WA 5FTHA 4QFLA 2XXVA 1B05A 5FTIA 4ELRA 3C9HA 3GZGA 1NNTA 1IXCA 3TCFA 4MFIA 3A09A 4YICA 4KCDA 4WEPA 4R2FA 4QSDA 1H45A 4R74A 4YB6A 2NUVA 4G68C 3MUQA 3QK6A 3K6WA 4IGTA 1R1NA 2Y7WA 4PQJA 4DCXA 3KN7A 1A99A 1OQHA 2H98A 4OXVA 3O2AA 3TAJA 3QUJA 1KWHA 4G8MA 2F6GA 3E13X 4M1VA 3IL1B 4KI0E 4LZ7A 1MH3A 1SI0A 2AL5A 2XXTA 2I58A 3IB2A 4ELQA 1H44A 4I9DA 1M5FA 3BKIB 2RC9A 5L9SA 3TCHA 3UP9A 3B6TA 3LBSA 3C36A 4POWA 1ZTYA 1N0TA 2DS9A 3F11A 2Q89A 3MP8A 5AA2B 4FEDA 3VE1B 3KN8A 3D4CA 2O1MA 3MQ9A 1IXGA 4GL8A 5I56A 3IOVA 1QULA 4BDMA 4R9GA 4U2RA 3PUZE 3S9LC 4R9FA 1B0HA 3SEVA 4X1BA 4OFLA 2Z8DA 1J1NA 5CMKA 3T9XB 3OENA 4FEBA 3FGSA 4G8HA 3TTLA 3OSQA 3TZAA 1US4A 2X26A 1PC3A 3QSLA 5HBCA 5JEIA 3H03A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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