5JEIA

Crystal structure of the glua2 lbd in complex with fw
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIACFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of partial agonism in AMPA-type glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 264
sequence length 264
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA02
3O6GA 3PUWE 1Y1ZA 2THIA 5DT6A 2Z8FA 2DVZA 1I69A 2ZYOA 1JNFA 1LBBA 3RTFB 4OENA 4BDOA 3R7XA 4KI0E 1XOCA 4Z7EA 2GHBA 4ELPA 2Q88A 4U1ZA 4OVJA 3B7DA 4XKQA 3G3GA 1VFEA 1MXZA 1ZMGA 3C4MA 3TKDA 5TP9B 1YCJA 3IO6A 1PB7A 3T96B 4GL0A 4EQ7A 2XXYA 3PUVE 5H8FB 5J1DA 4U1OA 3IB0A 3PPPA 4OESA 1MY2A 4ZEFA 4C0RA 1P99A 3PD8A 2NOOA 4PQJA 2HCAA 3QXMA 2I4BA 3KBRA 3TDJA 4U22A 5HPQA 4EF2A 1BKAA 4NF8B 5H8HB 2F34A 1VSOA 3T66A 1MPDA 1MXVA 3SETA 4RNSA 2Q2AA 3G7WA 3KJTA 1B6HA 4ESWA 1QKBA 3MZ1A 1OVBA 5I2NB 2Y84A 3O2AA 3FXRA 3OSQA 2X26A 4Q30B 5KCJA 4FORA 2OWTA 3TTKA 2Q8JA 5CRYA 4YKIA 3RPWA 3EQ1A 2O1LA 1HSLA 2ONKE 1YPNA 5H8SA 2XXIA 5BWJA 1P1UA 4RK2A 5DVIA 1URGA 2I3VA 4M4GA 2NXOA 5I58B 4QFPA 2HQ0A 2I0CA 1VR5A 1NNKA 4DZ1A 4QSDA 3Q27A 4ZECA 1B40A 3TUSA 2LAOA 1MQIA 1AOVA 3IJXB 3ILUB 5AA2B 4GIZA 1A54A 2QMXA 3UGWA 4DLDA 3UORA 3PGFA 2VD3A 4OZ9A 4ELRA 1J1NA 4FATA 3WAFA 4F3BA 2DS9A 1MDP1 1S9TA 3IX1A 3MJNA 4NEDA 1B1HA 1LAXA 3FJ7A 1LGBC 3DP4A 4OWDA 1M5CA 3D4GA 1UIVA 3TQLA 2XXPA 1DSNA 3IB1A 1IITA 3UK4A 4ESXA 2DE4A 3N6UA 1Q1KA 1DMBA 4KR5A 3R26A 4G68B 4LA9A 1OVTA 2B3FA 1OLCA 1FQEA 4RA1A 3UIFA 2W7YA 5CM6A 1P1OA 1RYOA 3SKPA 1IXGA 1B7HA 2F7BA 4IGRA 4POXA 1XS5A 3KOSA 4OFOA 3LC8A 4WEPA 2QSXA 2RCBA 4GOTA 4HTGA 4OHNA 2D21A 2FYIA 4PP0A 4GD5A 3VLVA 4F39A 3LSWA 3ZKLA 4R6KA 1VFDA 3S9LC 1LLSA 3MVYA 3K00A 2G29A 2DSFA 4ZEDA 3MC2A 3LUYA 2Y7PA 5BUUA 2ESNA 4TQUQ 1MPBA 1PBPA 4K3FA 1MPCA 3MP8A 4L17A 1URSA 3PMVA 1FQFA 2XD2A 2YJPA 2E1SA 5FHOA 2P2AA 4OXVA 1H44A 2RCAA 3PV0E 4IGTA 4H6DA 4POWA 4RPNA 4F3SA 3R6UA 2DYXA 1USYE 1NKXA 1MQJA 3SESA 5KCJB 2OLBA 2NUVA 1LFIA 2PT2A 2I48A 4MLVA 2NWJA 4EXLA 2PMSA 5K2YA 4LATA 4KYDA 3LSXA 1FQAA 3OD7A 4H8IA 2Y7WA 3E9XA 4G2ZA 2QMWA 2F36A 2UVGA 3TCHA 4ZEIA 4LUBA 3B6QA 3SEYA 3LSLA 3DP6A 1NL5A 4FEDA 2UYFA 3C36A 3PPQA 1B7UA 3T9XB 1MXUA 2A5SA 4U21A 5AA3A 4NE4A 5IAIA 3DP8A 1Y3NA 1B51A 3Q28A 3PUXE 5L9OA 1SDXA 2O84X 1MXYA 3CSGA 3M3FA 2IEEA 3HCQA 3U93A 1LAHE 3B6WA 3K0VA 4R2FA 5EHSA 5H8QA 4ZE9A 2XHDA 3VVFA 3KG2A 4OYVA 2BJJX 1OMPA 1NFTA 1PEBA 1MM6A 4G77A 2Y7KA 3U72A 1SYHA 1QKAA 4DDDA 1UTHA 1Z7NE 1N0TA 3SERA 1D4NA 1B1XA 1IQ7A 4F31B 1SI0A 3D4CA 2X7QA 1SYIA 3K6WA 1SVXB 5EYFA 3FV2A 5I2KA 4Q8RA 3ZKKA 2DXRA 4FAJA 3HN0A 4DXUA 3FIRA 5TU0A 1IUDA 1MQDA 1DTZA 4IO6A 4YZZA 2RC8A 3DELB 2V25A 3EPEA 3V8XB 3RY3A 3THIA 1PDAA 5JTYA 2KLFA 1DPEA 1B9JA 3IK6B 4IO2A 4ND9A 3GXAA 3MVZA 1RYXA 3I3VA 4YAHX 2ZYMA 1LBCA 4NTLA 1BIYA 3PMXA 3N5LA 1R1NA 4R9FA 1R9LA 1QUJA 1LSTA 3IL1B 1Q35A 2V3TA 3SEUA 2VP1A 3VLUA 3T9UA 3CI8A 3O6IA 1Y4TA 5JK4A 1B32A 3EF7A 2UVJA 4F3PA 2XXTA 1KWHA 3K6UA 1ZJLA 1MH4A 3RNNA 3FV1A 4QRZA 4H65A 4O3CA 4RXLA 1PC3A 4AB5A 1IIWA 1ZBMA 2VOZA 4JWYA 3IORA 4I62A 2O69A 4H67A 2ZXTA 3VVDA 4G68C 1P1NA 5TPAA 2CZLA 1M5FA 3OMBA 4KYEA 3CIJA 4LQ5A 5DYHA 4P0IA 1TFDA 4YMBA 1SW2A 3A3CA 3ILTB 2B65A 2V3QA 3HHFA 4QFOA 2Z8EA 3T93B 1JVXA 5ELVA 4F18A 2ONSA 3QUFA 3G3FA 4XKRA 4R6HA 5CBRA 4TLLB 1B3EA 3LSFB 4MFIA 3FZVA 1MS7A 5FTHA 3RGYA 4BDRA 3KSJA 1NNFA 5ITOA 2O7UA 1UTBA 5FHMA 3TTRA 1ZIUA 1P1WA 3TEPA 1XHYA 4GF8A 3TODA 1GTKA 4QFKA 4DCYA 3H3GA 4YB7A 3IO4A 4I8CA 3CFZA 2I6EA 4ZZAA 1QW0A 3MPKA 2QPQA 2H25A 3OO7A 5H8QB 3MUQA 4PFWA 1PB8A 3PU5A 2HEUA 2O51A 2O6AA 1MG1A 1B5HA 2PYYA 4JB7A 3OO9A 1BP5A 2PBWA 2V93A 1SI1A 1JQFA 3KSXA 3RTWB 1A99A 3SEVA 3CFXA 2DOJA 3PPRA 3TAJA 5I2KB 3AXFA 1MY3A 1ZKBA 1JETA 4F1UA 5ITPA 3FVGA 3S9EA 3FATA 2REGA 5H8NA 1PB9A 5L9SA 3Q29A 2QS2A 2F5XA 1YTVA 5DVFA 2ANJA 1TWYA 5JTYB 1B2HA 3O66A 1CB6A 3C35A 5L9MA 1SD3A 1MQHA 3C31A 3MZ9A 3V83A 2F97A 4BLAA 2GH9A 3V5AA 2ONRA 3OENA 2F6GA 4F1YA 1H45A 3T9VA 1ANFA 4R6YA 2DQVA 4OEVA 4HW8A 4H1XA 3N94A 3TZAA 1NH7A 1PBQA 3MP1A 1N3XA 4H0WA 3EHTA 4O3AA 5ICQA 3LBSA 2HZKA 1LAFE 3OO6A 2AIXA 4F2QA 1LCTA 4MLQA 2ZMBA 1A8FA 2I49A 2Y7IA 2H9BA 3UN6A 5TPAB 3CR9A 4LVQA 2R71A 1OQGA 3OOAA 5B70A 4NF5A 3IJOB 5IKBA 1LCFA 2H98A 1AIVA 3SEWA 1VE4A 1WODA 2O1MA 3VV5A 3IB2A 3TTNA 2Z23A 3S2VA 4XKNA 1USYH 1RKMA 2F7CA 4N6PA 4P0GA 3ZSFA 3BBRA 4RY1A 1B3GA 4H5GA 4X1BA 1MY4A 2XX7A 2Y7RA 3JV9A 5AA2D 2QS4A 5A5XA 4YICA 4KFQA 1CE2A 1BTJA 3QIMA 1IXIA 5EHMA 1JW5A 4OEUA 4WKMA 3T22A 4BDLA 2DE2A 3N6TA 3ECRA 2GHAA 1MRPA 3K6XA 3MPLA 1N76A 1UTBB 4YKJA 4YB6A 2QL3A 4G8NA 4KD5A 3G3JA 1DOTA 1IZ1A 3K01A 1OIBA 2OJTA 1FTLA 3L6GA 4DXBA 3IOTA 1OQHA 4G8HA 4LZ8A 2DP8A 1LB8A 4RJZA 3FVOA 4C1TA 3CRBA 1JW4A 1IXCA 3SDFA 4UACA 4UA8A 4LONB 2NVUB 1ATGA 3OEKA 2GRVA 5M2VA 1M5EA 3PUYE 4FIMA 3USDA 3RLFE 2X7PA 3CFLA 1OLAA 5AA4A 5I56A 1R6ZA 4RK9A 4KCDA 3RUMA 3H4ZA 5H8NB 3E13X 5F1QA 1IXHA 1QVSA 2F6PA 3OELA 5LOMA 3K6VA 2D3IA 2XXRA 3KEIA 1GR2A 2R9JA 3VVEA 3MBPA 2XXQA 2G93A 5F7VA 3H03A 4JBZA 3V89B 2RKMA 4OQOA 4H5FA 4GXSB 4MF3A 1DTGA 5CC2A 2P1SA 5K2XA 1N84A 4GFRA 3FD3A 4U4SA 3FVNA 1MY0A 2ABHA 4OMBA 2XXUA 1AH5A 5B7DA 1B4HA 4ZZEA 3FGSA 4YKKA 3I6VA 1B46A 1XVXA 5H8HA 2REJA 3Q26A 3MP6A 2Z8DA 1O7TA 4I9DA 1SQYA 4IO5A 1D9YA 1MM7A 4XKPA 3BFUA 4PFTA 1YAEA 1H43A 4DIGA 2PT1A 4QSCA 1POTA 1O63A 2A5TA 1FQCA 3FJGA 1WVJA 1Y4CA 4ONYA 2P0SA 2RF1A 1A55A 2VGQA 1P1QA 1HSEA 1FTMA 3TELA 2FA7A 2RC7A 3FXUA 3TYHA 1FTJA 1ELJA 3W9VA 1QUKA 3MZBA 2ZNSA 4FECA 2ZYNA 1FTKA 2F35A 2RINA 3LR1A 2XXWA 4AB6A 3PUZE 1II5A 1TT1A 2I0BA 1EZOA 4F19A 1Y9UA 5A5XB 3K02A 2OWSA 3QAXA 3S9NC 2DWJA 1GGGA 2WKYA 3K2DA 1R9QA 2RC9A 4P11A 1T0KA 3PD9A 2UXAA 4KQPA 3GZGA 1Y1MA 3DLNA 4Q0CA 4U23A 5CMMA 5CMKA 4OERA 4X48A 5AE4A 2XXVA 4E0WA 4U2RA 2QJEA 1F9BA 2GFEA 1FQDA 4IO4A 5AA1A 2ZNUA 3E4RA 1MY1A 2ZNTA 2XD3A 3QUJA 2HZLA 1JW1A 2IA4A 3BKIB 3JYRA 4EF1A 4NF4A 2ALUA 2XXHA 2H4IA 4JXIA 4Z0IA 3VDFA 1NNTA 2O7IA 3G3HA 5AA4B 3EHUA 1WDNA 5I56B 2AL5A 4DXCA 3H7MA 3FJMA 1QJMA 3H6WA 1BLFA 3C32A 5I57A 3Q25A 1TFAA 1LFHA 2DVCA 2F7AA 1SBPA 3TMGA 1JEUA 5CI5A 3KN8A 5FTIA 1XC1A 3L6HA 2D5WA 3B6TA 1Y3QA 1B5IA 4H8JA 4XTCQ 4DE8A 3TCGA 3S4UA 2V84A 2QRYA 2Q89A 5I59A 4HCWA 4N13A 4F29A 3O9PA 3KOTA 1LB9A 4EQ9A 3G3IA 2AYSA 1A40A 1N3WA 2DE3A 1US4A 2DXYA 1M5DA 3TTMA 3S9MC 3TQWA 3TCFA 4AQ4A 4X9TA 1I6AA 2Z22A 2ZYKA 4YB5A 2E0SA 2UVHA 4I1DA 3U8QA 4R74A 4NMYA 1UTHB 2A5TB 2OK2A 3H6VA 4ZS9A 3K4UA 5JEIA 1ZU0A 3A09A 1Y3PA 3FUZA 1Y20A 3N26A 4E0XA 4BDQA 1LAGE 4NF6A 2DWHA 3M3LA 3MW0A 5CMCA 3RN8A 1B7ZA 4LQ2A 1B52A 3ZS6A 1JVYA 4PE5B 3JZJA 2O68A 3KJ7A 4GL8A 3HV1A 3IOUA 2R6GE 4HS7A 1NNPA 3TPAA 3MVXA 4PETA 5HBCA 4N07A 4Q5TA 4GRKA 1HSJA 2PX1A 3G3KA 1JEVA 4HCYA 1N04A 3DM0A 1D3KA 4IO3A 5DEXA 5KDTA 3WAEA 1TXFA 4YMAA 1H76A 1I6QA 3ODBA 1A8EA 4ZEKA 1ZTYA 4ZEBA 3KGCA 4F1VA 2VD2A 4ELQA 1S50A 2B3BA 3VXBA 4FEBA 4F2OA 2FNCA 3IOVA 3EN3A 3OEMA 4FE8A 4GXAA 4JSDA 4NF4B 3VFJA 2DWIA 4PFYA 1S7YA 4YU0A 4XIGQ 1QULA 4XXUA 4OFLA 3UA8A 2V3UA 4FJPA 4NWCA 4NWDA 3P7IA 3I5OA 1B3FA 4R73A 1B5JA 4U4XA 2I4CA 4LZ5A 4C1UA 1LFGA 3E3KA 1FQBA 3A3UA 5I57B 4R2BA 4YKPA 4IY6A 3FASA 1B0HA 1B4ZA 1SW4A 3QSLA 3GBAA 1EZ9A 4PFUA 2H5YA 3SEXA 1EZPA 1AMFA 4OETA 1SW1A 5I59B 1B58A 3MAMA 3QYTA 4RYAA 2XX9A 1L5TA 1FCKA 3VXCA 1GV8A 3C33A 4OFJA 3GLBA 3H06B 4G4PA 1B3LA 2HAUA 3HHGA 4TLMB 1MH3A 1XT8A 3KFMA 1SW5A 3U94A 3KZGA 1MDQA 3OSRA 4F3GA 3MWBA 2I58A 1B3HA 4QSEA 4BDMA 4TOZA 3K1MA 3BFTA 4ZE8A 2YPNA 3IOWA 3K1NA 4QHQA 2YLNA 5ISUA 3H6UA 3UP9A 1NMUA 3VLWA 4KHZE 5CMBA 4BDNA 3HO7A 3M3KA 4NF6B 2OBGA 3RQTA 3PPNA 1UQWA 2Q9TA 1FW0A 1URDA 2QS1A 4R75A 4THIA 4LZ7A 1B05A 3ONMA 3W9WA 2F8DA 1AL3A 3FVKA 2UVIA 4ISUA 1DPPA 5TP9A 1B0LA 4JDFA 2CMOA 5DTBA 5H8FA 3KN7A 5FHNA 2AL4A 1EU8A 3CG3A 4F22A 4GWOA 3M8UA 2HXWA 3U92A 2XX8A 4R9GA 4DCXA 1XVYA 5DEXB 5KDTB 3PMWA 4NF8A 4GVOA 3KN3A 1D9VA 3TTLA 2F78A 4X1DA 4MH5A 2PVUA 2I3WA 4IB2A 4G8MA 4GQOA 2UYEA 3GBBA 5I2NA 4EDPA 2OZZA 5KZTA 2H99A 4EQBA 4NF5B 1O64A 5ICTA 3CG1A 3O6HA 3H6TA 3C34A 1M5BA 3VE1B 3FXQA 4GLIA 2Q2CA 3T9HB 3MVWA 4EXKA 5DVJA 3O29A 3QK6A 2DWAA 2M8CA 2HFBA 1Z7ME 1H3DA 4QF9A 3C9HA 3W15C 3RT6B 4ZDMA 3CSBA 3EHSA 5I58A 1MQGA 3MQ9A 4LP2B 1ZLQA 1EH3A 1US5A 3IAZA 4KPTA 2VHAA 4WXJA 3K1PA 4ECFA 1UIUA 5HM4B 4EUOA 4IO7A 2HAVA 4QFLA 2OCUA 4WEDA 4M1VA 5AA2A 5I84A 4R72A 1N7XA 3IR1A 4IY5A 3RT8A 4QFNA 5CBSA 4JWXA 3U1OA 4O3BA 3O97A 4ELOA 3HSTA 4RPOA 1GVCA 1MXWA 1MXXA 4MBPA 3HPIA 3O28A 1I6BA 4KCCA 1A7LA 1QUIA 2XXXA 4JSOA 5L8DA 1N7WA 3CVGA 3TFLA 1POY1 3OXNA 4JWOA 4KYSA 3F11A 1NH8A 4OTEA 1FTOA 1IEJA 4G68A 3OO8A 2QS3A 3PPOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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