5JK4A

Phosphate-binding protein from stenotrophomonas maltophilia.
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
ETAVTGGGASLPADLYKGSADSILPANFSYAVTGSGTGKKAFLENNSALFSTTGTVHFAGSDSVLSSTELNTYNSTYNVSGDANRYGALVQIPSVATSVTIPFNKAGSAVDLSVTQICGIFSGKINNWSQLAGLGRTGAIQVVYRGESSGTSELLTRFLTSACQPADVSGTNLKLANGVPAFSVQSTFANLFTTVPSNFVAAPATGGSALYNAVYAVDGRVGYVGPDVIPSLTDATKVAKVKSFSPDEVSVQATLETAAPPTGAAAENPANWVPVFGNPSAGYPIAGYTNFVFGQCYKNATVGANVRGFLTRHYGSTVVNGVEQGPNDDAIRAHKFIPLTKAWRDAVRARFATATNAGAVNNPSTCSGIGRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Alkaline phosphatase
publication title The 1.1 angstrom resolution structure of a periplasmic phosphate-binding protein from Stenotrophomonas maltophilia: a crystallization contaminant identified by molecular replacement using the entire Protein Data Bank.
pubmed doi rcsb
total genus 116
structure length 373
sequence length 373
ec nomenclature ec 3.1.3.1: Alkaline phosphatase.
pdb deposition date 2016-04-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jk4A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 5jk4A01
2ZYKA 1I6AA 2Y7RA 5DVIA 3RUMA 4YB5A 3KJTA 5CM6A 4I62A 3A3CA 4FECA 3OELA 1MG1A 4BDRA 4TQUQ 5L9MA 3TQWA 3QK6A 1B52A 2P1SA 2RC9A 2V3UA 5I56A 4L17A 3H6TA 2OLBA 1DTZA 1ZBMA 2GHBA 1EH3A 5ISUA 3LSFB 2A5TB 3RQTA 4FAJA 1R1NA 1YAEA 4Q0CA 1MPDA 1UTHB 5ICQA 4OERA 2RKMA 1Y4CA 1IXHA 4R6HA 5AE4A 2O84X 1H43A 1S9TA 1PB9A 2UYFA 4R72A 5I2NB 2W7YA 1XVXA 3TCHA 5KZTA 4PFWA 5I2KB 4RK9A 2O1LA 1LLSA 4OFLA 3OEKA 4KHZE 4H0WA 3FD3A 4LZ5A 3G3JA 1Y4TA 4ELPA 5FHNA 5I84A 3VFJA 2A5TA 3KOTA 4MLQA 4GXAA 1UTHA 3QYTA 1ZU0A 1FTOA 3O97A 3PUYE 1MS7A 5I58B 3VVDA 4Q30B 1N3WA 1A8EA 3G3KA 4U22A 3VVEA 4I8CA 1Z7ME 1VFDA 4YAHX 3QAXA 1CE2A 4F2OA 5I2NA 4LQ5A 5I2KA 4BDOA 2HXWA 3RT6B 2X7QA 5ITPA 1I69A 3FJMA 4O3CA 2DWAA 2Q9TA 1P1UA 2F6GA 4ZEKA 2ESNA 4JWYA 3MZ1A 1JQFA 4DLDA 3OEMA 1H44A 1SW1A 3R26A 3B6TA 4F39A 1IITA 5CBSA 3U94A 3RTWB 3GBAA 4MF3A 5I58A 1MQIA 4LUBA 1LSTA 4X1DA 1BP5A 3GLBA 1BLFA 3PMXA 2YPNA 1A99A 4AB5A 2X26A 4Z0IA 1MXZA 3FJGA 1MRPA 3TKDA 4RPOA 3Q26A 4M4GA 4IO6A 1MH4A 2DWHA 2PMSA 2ONSA 3CIJA 1QVSA 2F5XA 4IO3A 1AH5A 3TTKA 3FVGA 2O68A 1MQGA 3HHFA 2Q2CA 5CC2A 3OD7A 1A8FA 4H8IA 2XXTA 1YCJA 3O6HA 4OFJA 4G4PA 2ZYOA 2E1SA 3TELA 3WAEA 2RCAA 1MQDA 1HSLA 4F3PA 2P2AA 5DYHA 2XX7A 3CFXA 5F7VA 1JNFA 1A54A 3K0VA 1FTMA 4MLVA 1M5CA 4HTGA 4NMYA 1PB8A 4GVOA 4GQOA 3S9MC 2G29A 2XX8A 4PFUA 4FEBA 3O6GA 3B7DA 2GFEA 4KR5A 5A5XB 3RPWA 1LAXA 4QFOA 1MPCA 3OXNA 1IXIA 1XC1A 3OMBA 2THIA 3MJNA 3TQLA 1SI1A 2NWJA 2NVUB 3N94A 3G3GA 3PD8A 4LVQA 4JWXA 1II5A 4EXKA 4ZZEA 1LBCA 3CI8A 3IX1A 4N07A 2QS2A 3PUVE 3Q29A 1B1HA 1B0LA 4ZEBA 4ESXA 2XXHA 4X48A 1EZ9A 2OCUA 4KPTA 5A5XA 4X1BA 1B2HA 1URGA 1XHYA 1Q35A 4GWOA 4WEDA 4OFOA 1H45A 1MXWA 1PB7A 2Q88A 3SEWA 3OO6A 4GFRA 4OENA 4RPNA 2O51A 4LZ8A 2DE2A 3JV9A 2QSXA 4IGTA 1SYIA 4PETA 5H8QB 3S4UA 3K00A 2F7CA 3L6HA 2QS1A 3MQ9A 1WODA 3KG2A 4OWDA 2F36A 4F19A 3FASA 3RT8A 3UK4A 3K6XA 3ILUB 3H06B 5EHMA 5L9OA 2YJPA 2AIXA 2ZXTA 3TCGA 4THIA 1A40A 4H6DA 3PPOA 3PPPA 3OO8A 1LB9A 3IOTA 1URDA 2M8CA 3TCFA 1B7HA 1PEBA 1AL3A 1D3KA 2VHAA 3LC8A 5H8QA 3K6UA 2H99A 3BFTA 1P1QA 1VR5A 4HCYA 3FV2A 2NOOA 1QJMA 1TFDA 5JEIA 4H67A 4YZZA 3Q25A 1DOTA 1ATGA 4MBPA 4KCDA 5M2VA 2OZZA 3LSWA 4F3GA 1OLAA 1IQ7A 4PFTA 4NTLA 4K3FA 1USYE 5B70A 3TTNA 3RTFB 2GHAA 4NF4B 4POWA 4R9FA 2O1MA 1SW2A 2Y84A 3KFMA 4IY6A 3KN8A 3CSGA 3EPEA 1D4NA 4LONB 2D5WA 1SQYA 3S9NC 3VXCA 4F22A 5DVJA 2KLFA 1N76A 5TU0A 3TMGA 5CBRA 3DP6A 4FEDA 3IB2A 1IIWA 3PUXE 3VLVA 1FTLA 1I6BA 3M3LA 4QHQA 4YU0A 4NF4A 2QMWA 3K1MA 5CMCA 4AQ4A 2ZNTA 1P1WA 3S9EA 2Q89A 1AMFA 1UQWA 4NWDA 1FQFA 1USYH 2XX9A 4MH5A 1VE4A 4ZDMA 3Q28A 5CRYA 3TDJA 3DP4A 3TPAA 4YMBA 2H25A 3MZBA 3LSXA 3PPRA 1B58A 3SESA 3MUQA 3SEVA 5KDTB 4KYSA 5K2XA 4XKRA 3GBBA 3LR1A 3I3VA 5FTIA 1DPPA 4OHNA 2XD3A 1MM6A 3C33A 3UIFA 4RNSA 3AXFA 2GRVA 3UP9A 4YKIA 4JXIA 3M3FA 1BKAA 3FXQA 1B3HA 1Y3NA 3TTLA 2XXVA 3D4CA 1N3XA 3V8XB 3MPLA 2QMXA 3JZJA 4NEDA 2XXRA 1QKBA 4E0WA 2F78A 1SW5A 1ELJA 4KYDA 5KDTA 5LOMA 5HM4B 4QFNA 4KCCA 4XKQA 4IO7A 1MM7A 3KJ7A 4DZ1A 1J1NA 1WDNA 1B5HA 1QUKA 3MVXA 4R75A 1B32A 4TLMB 2HAVA 1KWHA 3EN3A 5CMKA 3U93A 1MQJA 1B40A 4F3BA 2H9BA 2AL4A 4G68C 3C9HA 3G3IA 2R9JA 3MAMA 2VGQA 1FTJA 4F29A 2HEUA 2WKYA 3T9HB 2QL3A 2DSFA 2X7PA 4R2BA 1LFHA 4F1YA 1B05A 5L8DA 2UXAA 2IA4A 1L5TA 1B9JA 3CR9A 4LA9A 3H03A 4TLLB 3OOAA 3DM0A 2I49A 3KN3A 3PD9A 2XHDA 1LCFA 3KEIA 1EZOA 2O7IA 4ZZAA 2ZYMA 1DPEA 2QS3A 3CFLA 2VOZA 2QS4A 4PP0A 4R73A 1XOCA 2AL5A 3FGSA 2UVGA 5F1QA 2PX1A 3K6VA 4IY5A 1BIYA 1D9VA 3DLNA 1M5DA 2I58A 4U4SA 5FHOA 1VSOA 3JYRA 2D3IA 1B4HA 3MVWA 3W9VA 5AA1A 4WKMA 4LQ2A 3BFUA 1LGBC 1B3GA 1GGGA 2RC8A 5EYFA 2QPQA 1Y1ZA 3MVZA 4ZEDA 4YB7A 1Z7NE 4HW8A 1FTKA 4QF9A 1N7XA 1O63A 2B3BA 3E13X 3E9XA 2GH9A 4P11A 4OVJA 2I0BA 3MBPA 3FVNA 4N13A 1P99A 3EHUA 1ZTYA 2VD2A 3GZGA 1HSEA 1M5BA 3ZS6A 1WVJA 2O69A 4IO4A 1PDAA 1LCTA 5JK4A 4UACA 2R71A 2PYYA 2ABHA 5K2YA 2XXWA 2HQ0A 5L9SA 3HCQA 3MVYA 4G77A 4KD5A 3HV1A 1NNPA 1M5EA 2ONKE 1B5IA 4OQOA 2REGA 1ZLQA 1LFGA 3SEUA 4ELOA 3FZVA 3EHSA 4U2RA 4LATA 4R6YA 2V25A 3N26A 3IB0A 3S2VA 2DOJA 3CRBA 3FV1A 4GOTA 1RYOA 1NKXA 2F7AA 3IJXB 3PUZE 1DSNA 4LP2B 4KQPA 4FE8A 4RA1A 4ELRA 1MXVA 3T9XB 3FATA 1SI0A 4WXJA 3MPKA 5TPAB 4LZ7A 3LSLA 4EQ9A 2I3WA 3D4GA 1ANFA 1MXXA 4PFYA 2R6GE 2VD3A 4NE4A 1DTGA 4FORA 3IOUA 3C32A 4PE5B 1NH8A 1F9BA 4NF5B 4OETA 1PBPA 3EQ1A 1EZPA 4Q8RA 4XIGQ 4H1XA 1NNTA 1MXUA 1RKMA 3O6IA 2A5SA 4GF8A 3K02A 3A3UA 2HCAA 4OMBA 2V93A 3IB1A 5CMMA 1MDQA 5TPAA 3U92A 2Y7PA 2FA7A 2PBWA 2DS9A 4U1OA 4P0GA 3KSJA 4ZECA 1GVCA 1B46A 2NXOA 2OWTA 3ZSFA 2ZNUA 2I4BA 3MWBA 1US4A 3T66A 1UTBB 3OSRA 2XXIA 2XXUA 4N6PA 3KZGA 3N5LA 4NF5A 3UORA 3QXMA 3PU5A 2IEEA 1POY1 2UVHA 1FQEA 1IXCA 1OIBA 3IOVA 3SERA 5DEXB 4Q5TA 2HZKA 3QUFA 3K6WA 4QFPA 1IZ1A 1H3DA 4KFQA 5HBCA 5H8NB 3IAZA 1JVXA 1US5A 2RC7A 3MW0A 5ICTA 5ELVA 1Y20A 3ZKKA 4M1VA 2DWIA 1UTBA 3USDA 5BWJA 4G8MA 3Q27A 3HHGA 3T9VA 2XXXA 3E3KA 5H8HB 2XD2A 4BDMA 1O7TA 1UIVA 4QSEA 2DP8A 3TZAA 5IKBA 5DEXA 1MY1A 5AA2B 3CG1A 4GD5A 1URSA 3R6UA 1O64A 5H8NA 4RY1A 1LFIA 3PV0E 2DVZA 2DE3A 4XXUA 3FJ7A 3G3HA 2DQVA 1B7UA 3TYHA 1XT8A 2Y7KA 2OK2A 1MY4A 1FW0A 3WAFA 4DDDA 4NWCA 4EDPA 2PT2A 4FIMA 2F7BA 5H8HA 3R7XA 2P0SA 2QRYA 1Y3PA 4EF2A 2RINA 3H7MA 4RJZA 3I5OA 2F8DA 1QKAA 5FHMA 2I0CA 4Z7EA 1HSJA 5AA2A 1QUJA 1NMUA 2E0SA 1Y3QA 2Z8DA 4QFLA 1YTVA 3VV5A 2F97A 1T0KA 4F3SA 2XXQA 4KYEA 3SEXA 1Y9UA 4JDFA 3CFZA 2DWJA 4OEUA 2Z22A 3IO4A 4RYAA 4OXVA 4XKNA 5BUUA 5DT6A 1PBQA 5AA4B 4G8NA 5CI5A 3LUYA 1MQHA 1NNFA 3G3FA 1LB8A 3FIRA 3SDFA 3MP6A 3RNNA 2O7UA 3GXAA 3BBRA 4ZS9A 4EF1A 2V3QA 2PVUA 2I3VA 4BDLA 1B1XA 3MP1A 4IO2A 4ONYA 1ZJLA 3QIMA 5JTYB 4C1TA 4HS7A 5I57B 2H4IA 4F31B 5HPQA 4DCYA 3BKIB 3PPQA 3HSTA 4WEPA 1SD3A 4G8HA 4U1ZA 5DTBA 4H5FA 1SVXB 1MY2A 3TEPA 1N0TA 5AA4A 2NUVA 1B4ZA 1N7WA 3M8UA 4R74A 1JETA 2UYEA 1LAFE 4GLIA 1MY0A 3N6TA 3HN0A 4GIZA 2Q2AA 5J1DA 4FJPA 1BTJA 5JTYA 2ANJA 5I57A 1B0HA 1OVBA 1POTA 2OWSA 3F11A 3QUJA 3U72A 3ZKLA 1FCKA 1OVTA 5AA2D 3TTRA 3QSLA 4BLAA 1R6ZA 2G93A 2RCBA 3U1OA 3C31A 1OQGA 3RY3A 5ITOA 1CB6A 3IK6B 4H5GA 3T93B 3FVKA 1ZMGA 1NFTA 3K4UA 1TFAA 2PT1A 1JW5A 2V84A 2DVCA 4NF8B 4XKPA 4ECFA 4UA8A 1JVYA 3IL1B 1N84A 3MP8A 1QULA 2XXPA 3K2DA 1TXFA 3V83A 2OBGA 3H6UA 1MY3A 1M5FA 3DP8A 5I59B 2BJJX 4GL8A 2F35A 4I9DA 5TP9B 4OESA 1JW1A 4F1VA 3IOWA 4QSDA 3HO7A 4F1UA 4R9GA 4ISUA 4G2ZA 3VVFA 2ALUA 1Q1KA 1B6HA 3RN8A 3H6VA 3RGYA 4YKJA 4NF8A 4IGRA 3C36A 3V5AA 4ND9A 3MC2A 1XVYA 4ZEFA 3U8QA 4U23A 3G7WA 4KI0E 3C34A 3UN6A 3W15C 4JB7A 3PGFA 2Y7WA 2F34A 5I59A 1B7ZA 1MPBA 3L6GA 5IAIA 1P1NA 3FXUA 3IO6A 3MZ9A 5TP9A 1ZIUA 4NF6B 4DIGA 2VP1A 4BDQA 3FXRA 1IUDA 3C35A 1JW4A 4GXSB 4R2FA 2CZLA 3O28A 4O3BA 4HCWA 4YICA 3B6WA 1ZKBA 1GV8A 2ZNSA 1GTKA 3EHTA 3UGWA 4JWOA 1AOVA 4FATA 2ZYNA 1R9QA 1QUIA 3ODBA 4RK2A 1XS5A 3KOSA 4YB6A 4ZE9A 1SYHA 1P1OA 1A7LA 2CMOA 4DXCA 1RYXA 3N6UA 3PMWA 4NF6A 5KCJB 1VFEA 2B65A 3H6WA 1FQDA 3E4RA 3LBSA 4POXA 4U4XA 2UVIA 4R6KA 2DE4A 4YKPA 2HZLA 4JSDA 2DXYA 4I1DA 1Y1MA 4ESWA 3CVGA 4DXUA 3VE1B 4QFKA 1AIVA 1LAGE 3O66A 3TODA 4XTCQ 4DE8A 5KCJA 4DCXA 3SKPA 3K01A 4F18A 2Z8EA 2F6PA 1SBPA 2Y7IA 1IEJA 3VDFA 3O29A 2I6EA 1OLCA 2XXYA 3CSBA 3ECRA 3THIA 3RLFE 2Q8JA 2OJTA 3V89B 1JEUA 4TOZA 3O2AA 1UIUA 2H5YA 4QRZA 3KN7A 2AYSA 4O3AA 3IR1A 4MFIA 1S7YA 3IORA 3OO9A 4P0IA 3KSXA 1NH7A 5CMBA 3VXBA 4OTEA 1I6QA 4EXLA 3H4ZA 4X9TA 4ZEIA 3FVOA 2D21A 2HFBA 1D9YA 3B6QA 4QSCA 1NNKA 2FYIA 3TFLA 3P7IA 4GRKA 3KBRA 2B3FA 2H98A 5AA3A 1MH3A 5H8SA 3VLWA 1A55A 3HPIA 4JBZA 4BDNA 4F2QA 1S50A 3DELB 3PUWE 2YLNA 2I48A 1FQBA 3TAJA 4OZ9A 5EHSA 2ONRA 2ZMBA 2FNCA 2I4CA 1B3FA 1PC3A 5DVFA 1OMPA 4E0XA 3VLUA 4C1UA 1FQCA 1H76A 3A09A 1MXYA 3K1PA 1YPNA 1JEVA 3FUZA 5H8FB 4H8JA 3UA8A 3OO7A 3T96B 4GL0A 4H65A 4YMAA 1DMBA 3W9WA 3KGCA 4AB6A 5B7DA 4U21A 3ILTB 2UVJA 3S9LC 1R9LA 2REJA 2V3TA 3K1NA 2Z23A 1NL5A 4C0RA 1FQAA 1MDP1 3OENA 4YKKA 3OSQA 5FTHA 3TTMA 3PMVA 3O9PA 3SETA 1B3EA 3H3GA 4G68B 5H8FA 4IO5A 1TWYA 1N04A 2RF1A 2Z8FA 1GR2A 1TT1A 1OQHA 3CG3A 2DYXA 2HAUA 4ZE8A 1B3LA 3I6VA 1B51A 3C4MA 4RXLA 1IXGA 2LAOA 3SEYA 1SDXA 3EF7A 1LBBA 3ONMA 4EQ7A 2O6AA 3T22A 3TUSA 1EU8A 5I56B 4ELQA 3PPNA 4IB2A 2DXRA 3IJOB 4OYVA 3T9UA 4JSOA 4PQJA 4DXBA 4G68A 1LAHE 1B5JA 3M3KA 4EQBA 1QW0A 1SW4A 4EUOA 2QJEA 4OEVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZYKA 1I6AA 2Y7RA 5DVIA 3RUMA 4YB5A 3KJTA 5CM6A 4I62A 3A3CA 4FECA 3OELA 1MG1A 4BDRA 4TQUQ 5L9MA 2XWKA 3TQWA 3QK6A 1B52A 2P1SA 2RC9A 2V3UA 5LDZA 5I56A 5ET7A 1FBGA 4L17A 1FBPA 3H6TA 2OLBA 1DTZA 1ZBMA 3RYDA 2GHBA 1FBDA 1EH3A 5ISUA 3LSFB 2A5TB 3RQTA 2KR0A 4FAJA 1R1NA 4PFIA 1EYJA 1YAEA 4Q0CA 1MPDA 1UTHB 5ICQA 4OERA 2RKMA 1Y4CA 1IXHA 2QVRA 1IMBA 4R6HA 5AE4A 2O84X 1H43A 1S9TA 1PB9A 2UYFA 4R72A 5I2NB 2W7YA 1XVXA 3TCHA 5KZTA 4PFWA 5I2KB 4RK9A 2O1LA 1LLSA 4OFLA 1NUXA 3OEKA 4KHZE 4H0WA 4MMPA 3FD3A 4LZ5A 3G3JA 1Y4TA 4ELPA 5FHNA 5I84A 3VFJA 2A5TA 3KOTA 4MLQA 4GXAA 1UTHA 1FBCA 3QYTA 1ZU0A 1FTOA 3O97A 3PUYE 1LEVA 1MS7A 5I58B 3VVDA 4Q30B 1N3WA 1A8EA 3G3KA 3GYYA 4U22A 3VVEA 4I8CA 1Z7ME 1VFDA 4YAHX 3QAXA 4NGUA 1CE2A 4F2OA 5I2NA 4PFBA 4LQ5A 5I2KA 4BDOA 2HXWA 1FTAA 3RT6B 2X7QA 5ITPA 1I69A 3FJMA 1DCUA 4O3CA 2DWAA 2Q9TA 1P1UA 2F6GA 4ZEKA 3FXBA 2ESNA 4JWYA 3MZ1A 1JQFA 4DLDA 3OEMA 1H44A 1SW1A 3R26A 2VPNA 3B6TA 4F39A 1IITA 5CBSA 3U94A 3RTWB 3GBAA 4MF3A 5I58A 1MQIA 4LUBA 1LSTA 4X1DA 1BP5A 3GLBA 1BLFA 3PMXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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