5JTYA

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
283
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQEKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 66
structure length 262
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA02
3TEPA 1JEVA 1MQDA 1O64A 3MWBA 1J1NA 3KZGA 3S2VA 2RINA 1LLSA 3Q26A 5I56A 1FQBA 1Y4TA 4ZEDA 5AA2D 2VD3A 1LGBC 4LZ7A 1O7TA 2R71A 1B3HA 4ZEIA 4P0IA 4YKIA 1IQ7A 4U1ZA 1IIWA 3UGWA 2NUVA 4Z7EA 4O3AA 3SEWA 3GBBA 2ONSA 2HAVA 4BDQA 2XXYA 2Z8DA 3KG2A 1YCJA 2DP8A 3BFUA 3IOWA 4GFRA 3IB1A 1JVYA 4FEDA 1UIVA 4HS7A 2IEEA 4BDNA 3R7XA 3UIFA 4IO6A 2UXAA 3C32A 4BDRA 1IITA 1SQYA 2F7AA 1VFDA 1XVYA 4F18A 4OETA 4F3GA 1CE2A 1NNFA 3IB0A 2Z8EA 1FQEA 1XS5A 3A3CA 2RF1A 2HZKA 3L6HA 1DTGA 3N26A 3RNNA 1D9VA 1ZBMA 1US5A 4NF4B 3OO8A 4P11A 1LB8A 4C1TA 4OERA 1LCFA 1OIBA 2XXVA 3TODA 3ONMA 3U93A 4NF6B 4NF8A 4KR5A 2RC7A 4GF8A 4ZS9A 2UVHA 3CVGA 4XKRA 5L9MA 1A99A 2F6PA 4YU0A 3CIJA 1M5FA 2PT2A 1VSOA 1YPNA 3IO6A 4ONYA 1IUDA 1AIVA 1MG1A 1VE4A 3OO9A 3TMGA 3IJOB 5IKBA 3HO7A 2XXWA 4G8NA 5CBSA 3QK6A 2QMWA 4M1VA 4IO2A 3O6GA 4G68A 1CB6A 1I69A 1QVSA 1Z7ME 2THIA 2KLFA 2I0BA 4G8MA 5BWJA 2O84X 3OSQA 1EZPA 3FXQA 3IOTA 3FJGA 3BKIB 3FV2A 3PUZE 5DTBA 3WAFA 3W9WA 2ABHA 3OXNA 4ELPA 3DELB 3HHGA 3N6UA 1H45A 2B65A 3MBPA 2XXRA 4NWDA 4I1DA 1MH3A 1OVBA 2ANJA 2O7IA 4Q5TA 5F7VA 1N0TA 2ONKE 1DSNA 5CC2A 3TFLA 2XD2A 2UYFA 3LSWA 4GOTA 4ZEKA 3CG1A 3S9MC 4OHNA 5DT6A 2DVZA 2DWHA 1UQWA 5CMMA 1D9YA 1MQHA 3MZBA 3Q28A 1B32A 3QAXA 2DWAA 5TPAB 4F3PA 3MP8A 3M3LA 1FTJA 3C35A 4KHZE 4EQ7A 3CR9A 4ESXA 1XC1A 2I48A 3RN8A 2PBWA 4F2OA 4F22A 3B6WA 1UTBB 4DE8A 4QRZA 4DLDA 1SYIA 4ZECA 3ECRA 5JTYA 1MDQA 1KWHA 1HSJA 4I8CA 2VHAA 2X7PA 3RGYA 5EHMA 4MFIA 4XTCQ 5CI5A 1IXCA 3F11A 1NH7A 3MZ1A 1MH4A 4HCYA 2HQ0A 4ECFA 2I3VA 2Y7IA 2ZXTA 1OVTA 3DM0A 5KCJB 4IY5A 4DDDA 2O1MA 2O6AA 2VOZA 1MQGA 4GIZA 1IEJA 1DTZA 4H8IA 2OZZA 4OFLA 3T9HB 1Y4CA 4I62A 3AXFA 2I58A 4R2BA 3I3VA 4XKPA 4YB5A 1TFAA 2DE3A 5L9SA 3PV0E 1ZMGA 3LBSA 1WVJA 4JB7A 1FW0A 2QJEA 3TTNA 3KN7A 2XXHA 4FATA 4XXUA 3TQLA 3KBRA 2ZYOA 3MP1A 1B3EA 4X48A 2REGA 3MQ9A 4FORA 3TPAA 3V8XB 1IZ1A 1B6HA 1OLAA 1H43A 2ZNTA 5L9OA 2QPQA 5CMCA 1MY0A 2VP1A 1MXVA 4JWXA 4G68C 4EQ9A 1B3GA 4LVQA 4O3CA 5I56B 3FGSA 1JEUA 3HSTA 1A54A 5AA3A 3CFXA 1A40A 3MZ9A 5DEXB 3K01A 4IGRA 5TU0A 2PYYA 4H1XA 2UYEA 3T66A 2H5YA 2IA4A 1H3DA 2DWJA 4KPTA 3EHUA 4YKJA 4EXKA 1ZIUA 4F3BA 5ELVA 2YJPA 3RQTA 3T96B 1P1OA 2DYXA 1URSA 4RPNA 2DS9A 5I57A 3ZKLA 4FE8A 4R9FA 4UA8A 4F31B 2Z23A 5B7DA 3ILTB 1FTKA 1R9LA 4LUBA 1A8EA 2HAUA 3T9UA 4XKQA 3OO6A 2GFEA 1JNFA 3H7MA 2GH9A 3FD3A 3VLVA 2DWIA 3CSBA 3OO7A 2H25A 1PB8A 4PFTA 5EYFA 4U23A 3H6UA 4POWA 3RT8A 4OFJA 1P1QA 1A8FA 2ALUA 3IO4A 3G3KA 1QUKA 3PMXA 4JSDA 2UVJA 3TAJA 1F9BA 1IXGA 4X9TA 4NF8B 2I3WA 4U2RA 3IJXB 4IO4A 3H6WA 1A7LA 2R6GE 1NFTA 2PX1A 1N7XA 5CBRA 4LATA 1B58A 2Q2AA 3RLFE 4AB6A 4EDPA 4Z0IA 1ZTYA 1EZOA 4DXBA 4PQJA 3RT6B 3TZAA 4QHQA 3MUQA 4ZDMA 3HV1A 4AQ4A 3FVOA 4ELQA 3TTMA 1D4NA 4PFWA 3IOUA 1FQDA 3UA8A 1BP5A 5KDTA 2H4IA 5DVIA 5K2XA 4BDOA 2QSXA 5CM6A 2XHDA 4GQOA 2P0SA 4IO5A 2FA7A 5H8QA 2O51A 4TOZA 1SYHA 3O9PA 3UK4A 4ELRA 3H6VA 2G29A 1SD3A 4LQ5A 3K6VA 4JWOA 3VFJA 1DOTA 4EF1A 5DEXA 1N7WA 3USDA 3EQ1A 2XXPA 4GL0A 2F34A 4G77A 4OESA 3E3KA 3B6TA 5AA1A 2AYSA 1GGGA 2CMOA 4F3SA 4YKKA 3K0VA 3KN8A 5JEIA 2DE2A 1POTA 1LSTA 4KFQA 4F1VA 4KCCA 2QL3A 4RYAA 3VVEA 4KI0E 1B7ZA 3MVZA 4G2ZA 3JZJA 1B9JA 2DVCA 1B0LA 3MVWA 3MVYA 4H0WA 2E1SA 1B46A 3O66A 4MF3A 3GXAA 1PDAA 1SI1A 3R26A 4C0RA 4N07A 3FVGA 3ZKKA 4MLVA 1POY1 2NWJA 3O29A 4U21A 2PMSA 2Q9TA 1LB9A 1B5IA 1SI0A 4LA9A 5JTYB 2V3UA 1XHYA 1USYE 1LFHA 3S4UA 4F1UA 2A5SA 1VFEA 2QS4A 3CFZA 3IAZA 4YKPA 4FJPA 1Y20A 4IGTA 5I59A 4OVJA 1QW0A 1BTJA 3PPQA 4PFUA 3SETA 2F35A 1NNKA 1YTVA 1BLFA 3W9VA 2DSFA 5AA2A 4QFKA 2XXXA 3MC2A 1O63A 1D3KA 2Z22A 1AOVA 4ZE9A 3C33A 3K1MA 2DXRA 3KFMA 1I6AA 3M3FA 4G8HA 2OCUA 5CMBA 4GXAA 4NEDA 1DMBA 4O3BA 2I4BA 3Q29A 2ESNA 1FCKA 1EH3A 3ILUB 2AL5A 3L6GA 3W15C 1S9TA 3FJ7A 3VDFA 4NF5A 4IO3A 4EXLA 4GRKA 3GZGA 1MXYA 4N6PA 2V84A 4TLMB 4U4XA 4QFNA 2Y84A 5TP9A 2FNCA 4MH5A 3K2DA 1H44A 1SVXB 2ZNSA 4IY6A 4HTGA 2Q88A 2AL4A 5I2NA 2NXOA 1SW2A 3FJMA 1N04A 3DP6A 4AB5A 3Q27A 1FQFA 3V83A 4DXCA 3OENA 3FASA 3T9VA 5H8HA 3O28A 2CZLA 2O69A 4OXVA 1NNTA 4OEUA 4RPOA 1ATGA 2XX7A 1YAEA 2RCBA 4HCWA 1JETA 1EU8A 1PBPA 1SBPA 2F36A 5I57B 4GWOA 2HFBA 1PBQA 1RYOA 1PB7A 5I2KA 3A09A 4RK9A 2H98A 3TTLA 4ESWA 1DPEA 1IXHA 3HCQA 1GR2A 3GBAA 4OQOA 4GVOA 4JXIA 3C34A 1B52A 4PP0A 3G3FA 1LBBA 1TWYA 3TTKA 1NKXA 3QSLA 4R9GA 1I6BA 4Q8RA 1SW4A 4H8JA 4LZ8A 3VVDA 4RA1A 1Y3PA 3A3UA 1AMFA 4P0GA 1ELJA 2E0SA 5A5XA 2D5WA 3VLWA 3C9HA 4TQUQ 1P1UA 1QUJA 1IXIA 3S9NC 3SESA 4PETA 1Y3QA 1JW1A 4F1YA 4BDMA 3LSFB 2G93A 1B51A 2YLNA 1NH8A 2F8DA 2B3BA 1Z7NE 3MJNA 3TQWA 1L5TA 2A5TA 1LBCA 4LP2B 2Q89A 5F1QA 4YMBA 3O2AA 3OEMA 2FYIA 3N6TA 4RXLA 3PPPA 2QS3A 5DVFA 2Q8JA 1XVXA 3KJTA 2ZNUA 3QUFA 4R6KA 1Y9UA 3IX1A 1M5DA 3T22A 3PMVA 3HHFA 3D4GA 1BIYA 3U92A 2R9JA 1MPBA 3N94A 4R74A 5KDTB 1M5EA 1P1WA 3K6XA 3LR1A 4H65A 1R6ZA 4NWCA 1MY1A 3M8UA 1N3XA 5H8QB 4ND9A 4THIA 3E4RA 4DCYA 4NE4A 3LSLA 1Y1MA 1A55A 3MPLA 3D4CA 4MBPA 2DQVA 3Q25A 3T9XB 1B1HA 3HPIA 4FECA 5L8DA 1DPPA 3MVXA 1B5HA 1TXFA 2ZYMA 4ZZAA 3KOSA 1GTKA 3RY3A 2BJJX 1URDA 5I84A 2PT1A 2GRVA 3CFLA 1URGA 3TCHA 1ZJLA 1FQAA 1MRPA 3I6VA 5FTIA 3B6QA 3MPKA 4QFLA 1WDNA 3U8QA 4XIGQ 4XKNA 5I58A 4JDFA 4C1UA 1I6QA 1SW5A 2M8CA 3DLNA 3H03A 5AE4A 5HM4B 1MY2A 3TUSA 1P1NA 3OOAA 1BKAA 2I6EA 3ODBA 4RNSA 3PUYE 4U22A 1PEBA 3K6UA 4F19A 3H06B 5I59B 1R9QA 2OK2A 3CSGA 4YMAA 1B1XA 5FTHA 3QUJA 4FEBA 1S7YA 4Q30B 3DP8A 5AA2B 1B4HA 1XOCA 3V89B 4WXJA 5IAIA 2Y7PA 3RUMA 3I5OA 1NL5A 4Q0CA 5EHSA 1MY4A 4LQ2A 1B2HA 3K4UA 1OQHA 3PPOA 1B7UA 2OWSA 1Y1ZA 4MLQA 3PUXE 4R75A 4JWYA 4KYDA 4RK2A 1HSLA 4R72A 4NF5B 2ZMBA 1FQCA 2D3IA 2XX9A 3M3KA 5FHOA 1Y3NA 1P99A 4QFPA 4ELOA 5TP9B 3TCGA 3OMBA 1B0HA 1PC3A 3R6UA 4R73A 1LAHE 4WEPA 5H8FA 3FVKA 5HPQA 1MXZA 2F7BA 3PMWA 3VXCA 2HEUA 5B70A 5I2NB 5H8NA 5LOMA 1QKBA 4ISUA 2WKYA 4H6DA 3H4ZA 1OLCA 3E13X 5H8HB 4IB2A 3TYHA 4OFOA 1AL3A 1B05A 1GV8A 1B3FA 4KQPA 3MP6A 4FIMA 3CRBA 1LFGA 2GHBA 1MS7A 2QS2A 2X7QA 3G3GA 5FHNA 2H99A 4LZ5A 1SW1A 3PUVE 2LAOA 2RC8A 4U1OA 5I2KB 4E0WA 3SKPA 3FXUA 4WEDA 2F5XA 4KYEA 1MPDA 3TCFA 1Q35A 2RC9A 3O97A 3SERA 3WAEA 1MPCA 3C31A 1N76A 3VE1B 1S50A 3U72A 4X1BA 3IB2A 3BBRA 4H5GA 4RJZA 2V93A 3N5LA 3PGFA 3IORA 5A5XB 1B3LA 1TT1A 2OBGA 3E9XA 2I49A 4KYSA 1MM6A 2Y7KA 3KOTA 4F29A 2V25A 4ZZEA 3RTFB 1QUIA 2H9BA 4GXSB 4YAHX 4NTLA 4QF9A 3KN3A 4YZZA 4L17A 3VV5A 1Q1KA 3TTRA 4YB7A 3OSRA 4OWDA 3TKDA 5AA4B 2A5TB 3OD7A 3FATA 3G7WA 1MY3A 5DYHA 3K1NA 2OJTA 3PU5A 1ZU0A 3LSXA 3RTWB 2YPNA 3H6TA 2DE4A 3TDJA 4G4PA 1QJMA 1MQIA 2XX8A 3PD8A 5H8SA 1NNPA 3IOVA 3IL1B 2VD2A 3P7IA 3PPRA 3SEXA 4YB6A 4OMBA 2V3QA 1NMUA 4N13A 2I4CA 3SEUA 3H3GA 2B3FA 3SEVA 3FZVA 2OWTA 2NOOA 1JW5A 3DP4A 2I0CA 2Y7RA 4BDLA 5CMKA 2D21A 3GLBA 3JYRA 1T0KA 4PFYA 2VGQA 2O68A 3KSXA 3LC8A 1JVXA 4E0XA 2V3TA 4DCXA 3IK6B 4IO7A 4BLAA 3THIA 4QSEA 3ZSFA 2O7UA 3K6WA 2X26A 3S9LC 3T93B 1USYH 2HZLA 3KSJA 2HXWA 1US4A 5K2YA 2DOJA 4OYVA 3EHTA 2O1LA 3JV9A 2AIXA 3U94A 3MW0A 4ZEFA 4M4GA 2XXTA 1B4ZA 5I58B 4WKMA 5ISUA 4NF4A 3EF7A 1B7HA 1RKMA 4QFOA 1EZ9A 4OTEA 3K02A 4RY1A 1UTHB 1LAXA 2Y7WA 4NF6A 5ITOA 3OELA 4YICA 2GHAA 1LAGE 4GD5A 4GL8A 4EUOA 5FHMA 3O6IA 1B5JA 5AA4A 3QYTA 3SDFA 4OEVA 2ZYNA 1R1NA 3FV1A 3PD9A 1N3WA 4EQBA 2ONRA 4HW8A 1JW4A 2W7YA 2XXUA 3VVFA 4KD5A 2Z8FA 3K00A 5ICTA 1FTMA 5M2VA 4F39A 2QMXA 3EPEA 4K3FA 1ZKBA 1LFIA 2RCAA 1M5BA 2XXQA 3SEYA 2QRYA 5J1DA 3UORA 1MXWA 4QSCA 4H5FA 4JSOA 2F78A 4R2FA 1OQGA 3OEKA 2OLBA 1SDXA 3CG3A 1FTLA 3KJ7A 1XT8A 5KZTA 4H67A 4I9DA 4JBZA 3QIMA 3UN6A 5H8FB 1MXXA 3FUZA 1FTOA 3EN3A 3FVNA 3G3IA 1M5CA 4PE5B 2REJA 3HN0A 3FXRA 1GVCA 5H8NB 1MM7A 4R6YA 4TLLB 3V5AA 5JK4A 1UIUA 5TPAA 1MDP1 1AH5A 5ICQA 1PB9A 3PUWE 5HBCA 4POXA 1OMPA 1QKAA 3RPWA 5DVJA 1MQJA 1UTBA 3IR1A 2UVIA 3FIRA 2UVGA 3EHSA 4GLIA 2Q2CA 1II5A 2F7CA 1UTHA 3MAMA 1RYXA 3S9EA 3QXMA 2RKMA 3K1PA 4NMYA 4UACA 4F2QA 4EF2A 3C4MA 1QULA 4QSDA 5KCJA 4OZ9A 1LCTA 2XXIA 1LAFE 1N84A 1H76A 1JQFA 2QS1A 4U4SA 4LONB 5CRYA 4R6HA 2F97A 1TFDA 5BUUA 2XD3A 1HSEA 4X1DA 3UP9A 4DIGA 2P2AA 3KEIA 3G3HA 2F6GA 4FAJA 3KGCA 3B7DA 1WODA 3O6HA 1VR5A 2PVUA 3CI8A 3PPNA 1MXUA 2NVUB 3C36A 3TELA 5ITPA 4ZEBA 3G3JA 3ZS6A 2HCAA 1ZLQA 4ZE8A 3VXBA 4DXUA 3VLUA 2P1SA 3U1OA 2DXYA 4KCDA 3BFTA 3LUYA 2ZYKA 4G68B 4OENA 4DZ1A 1ANFA 1B40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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