5KCJA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne6901
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
279
structure length
279
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 279
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjA02
4OFJA 1P1UA 2IA4A 1SW5A 2GHAA 3E13X 4H8JA 3FD3A 4F2QA 2I0BA 3DP4A 2REJA 2RC8A 3K6XA 4POWA 4F3SA 1B7HA 5ISUA 1NNFA 1VR5A 1SYIA 3S2VA 4RJZA 3BFTA 1LSTA 1ATGA 1M5FA 4YICA 4JWOA 1QUJA 4OEVA 1IITA 1MDP1 2VGQA 4FIMA 4OYVA 2OWTA 2F34A 5TU0A 1JW4A 1DMBA 2Y84A 4QFLA 3K6WA 3H7MA 1B9JA 1Q1KA 2I4BA 3OXNA 5FHOA 3CFXA 4F39A 4ZEBA 5KZTA 3V8XB 1B2HA 3LSFB 3FVKA 3HSTA 3BKIB 4ND9A 3MPLA 3TCGA 5KDTA 2IEEA 2O51A 1MH4A 1B3GA 4F2OA 4HTGA 1FQFA 2O1MA 2OZZA 4ISUA 3B6WA 5H8QA 1QKBA 4F3GA 5AA2A 1S7YA 1Y20A 3TUSA 1AL3A 3U94A 1B5HA 2HEUA 3K2DA 2AL5A 3IJXB 1B1XA 4PE5B 4P11A 4DLDA 5FHMA 4H6DA 3H6WA 1M5DA 1IXCA 4THIA 1NL5A 4KCDA 3KG2A 3SEWA 2UYEA 3TDJA 3C36A 2Q2CA 2XXHA 3O6GA 3VDFA 2VD2A 1DTGA 2V25A 3SEYA 3RLFE 1JW1A 4AB5A 3ZKLA 2F7AA 1FCKA 3PUYE 4XKPA 2I48A 3KOSA 3RT6B 4FE8A 5I57A 3I5OA 5CC2A 3N5LA 1OLAA 3B7DA 2X26A 2FYIA 2QS4A 3C4MA 3HO7A 4BDOA 1B7ZA 4I9DA 4H5GA 3CFLA 3T96B 3M3KA 1Y3NA 3WAFA 1SI0A 1TWYA 1L5TA 4GL0A 5CM6A 2XXPA 2PX1A 4KR5A 2YLNA 3MP6A 4F1YA 2DSFA 4G2ZA 5DYHA 2XXYA 1GR2A 3OD7A 1FTLA 2BJJX 4U22A 3MZ1A 4F18A 1N76A 3K00A 1RKMA 4JXIA 5DEXB 2CMOA 4BLAA 5I84A 1N3WA 3K1MA 4GD5A 2RCBA 3MAMA 4R2FA 3WAEA 1B0HA 1NH8A 1MH3A 2F97A 2GH9A 3RY3A 3CG1A 1SQYA 1JEVA 3FXRA 1D9YA 4BDQA 4JWXA 5I2NB 4IGTA 3O28A 2FNCA 1GV8A 3PGFA 3IL1B 2DS9A 1B32A 2Z23A 3EF7A 4NTLA 1B40A 1QJMA 1URSA 5H8NB 1JW5A 3IOVA 2ZNUA 1JQFA 1HSJA 3TAJA 1DTZA 2WKYA 3O6IA 3W9WA 3FZVA 3VE1B 3LUYA 3L6HA 4NF6B 2H9BA 4R72A 4DXBA 3UIFA 2I4CA 2UVGA 3EHUA 1JEUA 4ZEDA 2A5TB 1H45A 5BWJA 3LSXA 1FQDA 3ZSFA 4DIGA 2NUVA 1BKAA 1OQHA 3PD9A 2DXYA 2DOJA 4IO7A 1O7TA 1JETA 1SYHA 3IAZA 1H44A 3G3JA 4ELRA 1LLSA 3MBPA 5CBSA 1VE4A 3O29A 1A8FA 5I59A 4R74A 3HN0A 3TCHA 1R6ZA 2R9JA 1H3DA 3RT8A 1LAXA 2X7QA 2A5SA 2G29A 3ILUB 3MVWA 1NH7A 2O7UA 4OQOA 4TOZA 3DM0A 3UN6A 5J1DA 3SETA 3PD8A 1FQBA 1NNKA 5I56B 1LAGE 5KDTB 1ZLQA 2RINA 2XX7A 1IUDA 4XKNA 1D4NA 1N3XA 1P1OA 3UA8A 3TTRA 2XXVA 3RGYA 3FVOA 3VLVA 1AMFA 4GXSB 4RXLA 5AA2B 4JB7A 1H76A 2XXTA 2XXIA 3MP8A 4ONYA 1MXWA 4DDDA 4ZE9A 1N7XA 1Y4TA 2AL4A 2H98A 1Y3QA 4YB7A 4PFWA 3H4ZA 1MPDA 3RNNA 3LSLA 4QSEA 4OERA 2B65A 1B3FA 1IQ7A 1LCTA 1UIUA 1MQIA 1MY3A 4LZ7A 3M8UA 1XOCA 1PC3A 5HBCA 2Y7KA 4YKIA 4MLQA 4RPOA 3MC2A 1P1WA 5I57B 2Q89A 4YU0A 5AA3A 1YPNA 2DYXA 4H0WA 4Z7EA 2UYFA 4N07A 3IOTA 2F6PA 3L6GA 2QS1A 5KCJA 3MZ9A 1UTHA 2ZNSA 4G8HA 1Y1MA 3CVGA 1SD3A 2PT1A 4KFQA 4X9TA 4EQBA 1EZ9A 4OFLA 1LB9A 5L9OA 1RYOA 3K02A 4E0WA 4IO3A 3VLWA 3V5AA 2I3WA 1P99A 1FQAA 1QW0A 3IK6B 3IORA 2D3IA 4GXAA 3RTWB 3AXFA 4BDRA 4U1ZA 1EZOA 3FUZA 3C32A 3O97A 1TXFA 4G8NA 2OK2A 2RCAA 3Q29A 3D4CA 3MJNA 5AE4A 3Q25A 1B52A 4M1VA 4YZZA 2QS2A 2H4IA 1R9LA 3FASA 4H8IA 2HQ0A 3SERA 3QK6A 2CZLA 3KJTA 1Y1ZA 3TODA 2DWHA 3I6VA 4OXVA 4G68A 1MDQA 3M3LA 2ALUA 3KGCA 3JYRA 1I6AA 4LZ8A 5BUUA 1PB7A 3VFJA 1B3HA 2KLFA 1POTA 1ZIUA 5B70A 5ICQA 3B6TA 3SEVA 5EHSA 3OSQA 3MW0A 4P0GA 3OELA 3PMWA 4R9FA 4ZE8A 3MWBA 3UGWA 2DXRA 2F35A 3OO8A 3G3FA 2GFEA 3E4RA 5A5XA 1FTKA 1ZKBA 1EH3A 3IOUA 4EDPA 2W7YA 4OEUA 3R6UA 5I56A 2P2AA 1ZMGA 1HSEA 3S9NC 2P0SA 3MUQA 4HCWA 1PB8A 1B4ZA 1UTBA 3K1NA 1OIBA 1WVJA 1XVXA 3G3HA 2VD3A 4OMBA 3ZKKA 3PPOA 4XKRA 1Y4CA 2M8CA 4YB5A 4PP0A 3KOTA 4HCYA 2OBGA 4DCXA 5ICTA 1MQHA 5I59B 2XD3A 1N04A 3LR1A 1Y9UA 3T9UA 4O3CA 5ITPA 3U72A 1N0TA 3PV0E 4OESA 3K1PA 2Q9TA 3DLNA 4KCCA 1GVCA 3TTLA 1IXGA 2UVHA 5DVIA 4BDMA 4AQ4A 5H8HA 4RK9A 4R75A 2Y7RA 3P7IA 4UA8A 3GXAA 1PDAA 2V3QA 4TLLB 4LUBA 4NF4A 5DT6A 2Z8DA 4GOTA 1MM6A 1MXZA 2PMSA 2V3UA 3BBRA 4YKKA 4KHZE 3E9XA 2QS3A 1OQGA 3C9HA 4RA1A 1QKAA 1LGBC 3RPWA 3VVDA 3VV5A 2PVUA 4Q5TA 4NF8A 1PBPA 1LFIA 1IEJA 1MQJA 3VXBA 4G77A 4PFUA 2QSXA 2XX8A 3O66A 4GLIA 1FW0A 3QSLA 4EQ9A 1POY1 3USDA 3FVGA 3G3KA 1WDNA 3C35A 1MY2A 3K6VA 5I58A 3UP9A 2OCUA 2ZYMA 4KQPA 5KCJB 4TLMB 1DPPA 1UTHB 3HV1A 4C1TA 3BFUA 2ZYKA 3PU5A 5DVJA 2XXRA 5DTBA 4F1VA 4HS7A 1I6BA 1GGGA 3V89B 2YJPA 3S9MC 2XXXA 1NNTA 4RY1A 2O84X 3H6TA 3FJMA 4OENA 1A55A 4IGRA 2I58A 3A3UA 1BTJA 2NVUB 4KPTA 1XS5A 3CSGA 2UVIA 5TPAA 5CMKA 1R1NA 4H5FA 4OHNA 4QFKA 4KYEA 4E0XA 4GVOA 3IJOB 1O64A 4PFYA 4NWDA 3CR9A 4LP2B 1JVYA 2QMXA 1DOTA 2DE3A 3TTNA 3I3VA 4F22A 1JVXA 2O1LA 4QSCA 1AOVA 2FA7A 3PUZE 2HAVA 4DXUA 4G68B 4XTCQ 3EHSA 5DVFA 4QFPA 5IKBA 4OFOA 3IO6A 4ESWA 3W15C 4MH5A 3OOAA 1ANFA 3MP1A 4EF2A 5HPQA 3EPEA 4KYDA 2HCAA 3TELA 3HHGA 5HM4B 2DQVA 5TP9A 2HZKA 2PBWA 1F9BA 1QUIA 2NOOA 4WEDA 5A5XB 4JSDA 4DE8A 3VLUA 1B58A 1IXIA 3PMVA 4I8CA 4IY6A 3Q27A 1UTBB 3QUFA 3O9PA 2E1SA 4GFRA 1J1NA 2Z8EA 3KJ7A 4IO4A 1GTKA 4GRKA 5H8FA 1IIWA 2V3TA 3VXCA 3PUXE 3C31A 3ECRA 3KN8A 4FATA 2DWIA 4R6HA 1DSNA 2QPQA 3OENA 1B05A 1II5A 1AH5A 3RQTA 5AA2D 2H25A 4U4SA 4KYSA 4Q30B 1I6QA 3RN8A 3HPIA 2QL3A 2XXWA 4C1UA 3JZJA 3FVNA 4GL8A 5K2XA 2D5WA 5H8HB 3A09A 1ZU0A 4F31B 4ZEIA 3PUVE 1MXUA 3FJ7A 5F1QA 3PUWE 2ONRA 4ZEKA 2X7PA 4AB6A 2B3FA 2Q2AA 1N84A 4RPNA 3TCFA 2Y7WA 1EU8A 3JV9A 1B51A 4NF4B 4R73A 1M5CA 3T9VA 1UIVA 4ZS9A 3MVZA 3O6HA 4R6KA 1A54A 1FTJA 1MXXA 1PB9A 4EQ7A 3GBBA 1LBBA 3CIJA 4R2BA 2Y7PA 4QF9A 4ZEFA 1B5IA 3Q28A 1DPEA 3F11A 1B5JA 1VFDA 2ZMBA 3PPRA 4R9GA 4U21A 5CMBA 1D9VA 1USYH 2DWJA 4F3PA 4YMBA 3T93B 4NF8B 4JBZA 4X48A 4ZECA 4OVJA 4FECA 3G7WA 3CFZA 3RTFB 4U4XA 1LCFA 4JWYA 4EXKA 4FEBA 1MY4A 2YPNA 3CRBA 3CG3A 1MXYA 1FQEA 1I69A 4TQUQ 4GWOA 4PFTA 4X1BA 4FJPA 2O7IA 5I58B 4LZ5A 2O6AA 2D21A 3EHTA 1SBPA 4IB2A 2GHBA 4OWDA 4NF5A 4NWCA 3H6VA 1PEBA 5ITOA 1JNFA 3S9LC 2XHDA 4XXUA 4OZ9A 1P1QA 5IAIA 3CI8A 4KI0E 4MBPA 5I2KA 5ELVA 4F1UA 4I1DA 2DP8A 1T0KA 3MQ9A 2DVZA 3T9XB 3TEPA 2DE4A 5TPAB 4H65A 3LBSA 1IXHA 2HFBA 3FV1A 4YB6A 4NMYA 3G3IA 2F8DA 1M5BA 3MVYA 1BP5A 1YCJA 3UK4A 4JSOA 3N94A 4EXLA 2O68A 1OLCA 2NWJA 3GLBA 2E0SA 4OETA 2AYSA 1US5A 3W9VA 3KEIA 4PQJA 1Z7ME 1IZ1A 3QIMA 1MY0A 3IB1A 5FHNA 2V93A 2I3VA 1USYE 2DE2A 3DELB 4F3BA 3EQ1A 1AIVA 2REGA 1NKXA 3U8QA 2QRYA 5L8DA 2PT2A 2P1SA 5K2YA 3U1OA 3FXQA 3HCQA 3SEXA 4O3BA 4POXA 1A99A 3TYHA 1QULA 4C0RA 3KN7A 1O63A 2VOZA 2NXOA 5TP9B 3U92A 1S50A 2F36A 4M4GA 2O69A 1WODA 5FTHA 2B3BA 3EN3A 3C33A 1FQCA 3E3KA 5CBRA 1ZBMA 1US4A 1LFGA 3N6UA 3TMGA 4XKQA 4IO5A 1BLFA 1LAFE 5H8SA 4GQOA 1OVTA 3PPPA 5AA1A 3N26A 1MS7A 2F78A 2RC7A 4R6YA 1OMPA 5JEIA 3U93A 1XVYA 5AA4A 2ESNA 5H8FB 4G68C 2R6GE 4FAJA 1Q35A 1URDA 1CB6A 3R7XA 1HSLA 3O2AA 5JTYA 2AIXA 4F19A 2XXUA 1H43A 2RF1A 2F6GA 4YKPA 2VHAA 2ONSA 1VSOA 2OJTA 1MPBA 4ELPA 4QRZA 2Q8JA 3LC8A 5L9MA 3VVFA 2ABHA 1TFAA 4JDFA 1NMUA 3OEKA 1TT1A 4NEDA 3QXMA 3UORA 3ZS6A 5M2VA 1FTOA 3IX1A 3FJGA 2ZYNA 4RK2A 3T66A 3T9HB 1LB8A 4ECFA 2DVCA 2Q88A 5CMCA 3PPQA 5LOMA 5L9SA 4FEDA 1D3KA 3ODBA 3KSXA 3TFLA 4Z0IA 4DZ1A 1TFDA 4IY5A 1CE2A 3C34A 3G3GA 2PYYA 4QHQA 3ONMA 3K0VA 1LFHA 3QAXA 5B7DA 1PBQA 3KN3A 4YMAA 2XXQA 2I49A 3DP8A 3FXUA 3K6UA 4EF1A 4O3AA 3RUMA 1N7WA 4RNSA 3H03A 3D4GA 2OWSA 4PETA 4ELOA 4UACA 4LVQA 3HHFA 1M5EA 3T22A 1Y3PA 2XD2A 1A7LA 1FTMA 1B6HA 3FGSA 2R71A 3TQWA 1SDXA 3IR1A 3M3FA 1EZPA 1MY1A 3IO4A 2RKMA 1RYXA 1BIYA 4Q8RA 3ILTB 4DCYA 2I0CA 2I6EA 4N6PA 3Q26A 3R26A 3KFMA 3IB0A 4YKJA 3PPNA 4NF5B 2H5YA 1YTVA 3S9EA 4WEPA 3GBAA 3OSRA 2Y7IA 1QUKA 3N6TA 3OO6A 3TZAA 3CSBA 1NFTA 2RC9A 3GZGA 3TKDA 5I2KB 4L17A 4YAHX 1ZTYA 4MFIA 4NE4A 4KD5A 1UQWA 1MG1A 3OEMA 3SKPA 3MVXA 2ZNTA 1B4HA 4Q0CA 3K4UA 4G4PA 3FATA 3V83A 4U1OA 1Z7NE 4ZZAA 2HZLA 1NNPA 4WXJA 3KSJA 3OMBA 5EHMA 3FIRA 4U23A 4XIGQ 2F7CA 1OVBA 4ZZEA 4X1DA 1SVXB 1B3LA 3H6UA 5CMMA 1LAHE 4LQ2A 2XX9A 5JK4A 2HAUA 3TPAA 3DP6A 1B46A 1ZJLA 1XT8A 4HW8A 4LONB 4MLVA 1MPCA 2GRVA 3OO7A 1SW2A 4U2RA 3A3CA 4LA9A 3QUJA 1R9QA 3VVEA 1A8EA 4N13A 4F29A 1YAEA 2UXAA 1B1HA 4QFNA 2ZXTA 4WKMA 2Z22A 5H8QB 4QSDA 4BDLA 2UVJA 4H67A 4LQ5A 3TQLA 2THIA 1B3EA 1MM7A 3SDFA 3SEUA 2LAOA 3MPKA 2ANJA 4OTEA 3TTMA 3SESA 1B0LA 4EUOA 2QJEA 4GF8A 1URGA 4IO2A 2DWAA 1VFEA 3IOWA 4ESXA 4QFOA 5DEXA 3MZBA 4ELQA 3S4UA 1S9TA 4FORA 4GIZA 4G8MA 3KBRA 3H06B 4LATA 3IB2A 1KWHA 1SW4A 1XC1A 1MQDA 2Z8FA 2V84A 5AA4B 5CI5A 3LSWA 3KZGA 3B6QA 5I2NA 4P0IA 1MXVA 2G93A 5JTYB 2VP1A 4IO6A 5F7VA 2HXWA 3QYTA 2H99A 4BDNA 1QVSA 1P1NA 3H3GA 2F7BA 2ONKE 1MRPA 4DXCA 5FTIA 5H8NA 4H1XA 4RYAA 1B7UA 3FV2A 3TTKA 2F5XA 1ELJA 2QMWA 2ZYOA 2OLBA 4I62A 1MQGA 4NF6A 3THIA 1SW1A 3K01A 5CRYA 1SI1A 1A40A 1LBCA 4MF3A 3OO9A 4K3FA 4ZDMA 5EYFA 2A5TA 1XHYA 3PMXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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