5KCJB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne6901
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
283
structure length
280
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 280
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjB02
2DE3A 3MPLA 4FORA 4HTGA 1LAXA 3Q25A 2ANJA 2I4CA 4NF6A 4I62A 5H8QB 3RT8A 1FTJA 3ILTB 3LUYA 4DIGA 3SEYA 4RJZA 4BDQA 3LR1A 3KZGA 1B52A 1USYE 2Q88A 1A8FA 3RNNA 3R26A 4H8IA 3K1NA 1OVTA 4Z0IA 4O3BA 3H06B 5CBRA 2DVZA 3CRBA 3I6VA 4FE8A 4G8NA 3O28A 3HSTA 3JYRA 3QUJA 4GQOA 4U21A 3TMGA 1I69A 3PV0E 2O1LA 3GZGA 1JETA 3R7XA 4H5GA 2GHAA 3QAXA 4ZZAA 3VLVA 5IAIA 3PD9A 2RCBA 1B7ZA 2PYYA 4QSDA 5FTHA 3OO9A 4G68A 2DOJA 1SVXB 3KFMA 1M5EA 1PB7A 1Q35A 2XX7A 2G29A 3N6TA 3HCQA 4LA9A 5DT6A 3M8UA 4U4SA 1QJMA 4OWDA 3LC8A 2I0BA 3QIMA 3W9WA 5AA2A 4R2BA 1AL3A 4OEUA 2DS9A 3OENA 4MH5A 1ZTYA 1NNFA 5DTBA 1AH5A 1YAEA 2QS4A 4GRKA 4I8CA 1FCKA 4H8JA 2VHAA 4KHZE 5I2NB 4QSCA 4LQ5A 4XKRA 1LAGE 3T22A 5KDTA 1B1HA 4IY5A 1VE4A 4NF8A 3JV9A 2PVUA 4F29A 5CMBA 1MXWA 1LGBC 3IJOB 5H8QA 1DPEA 3H6WA 1HSLA 2I48A 4RK9A 3S9EA 2ZYNA 4F22A 1P1UA 4JWYA 2AL4A 3K00A 3O6GA 2F6GA 1HSEA 3PPOA 3MZBA 3TDJA 5I2KB 3RT6B 3RGYA 3E3KA 4AB5A 5CM6A 3V8XB 3T96B 3MWBA 4K3FA 3FATA 4IY6A 4RYAA 3OO8A 5CMKA 4IGTA 5TP9B 1H3DA 1I6BA 3W9VA 2DXRA 3TELA 1MY0A 5CMCA 1GVCA 5AA3A 4X1BA 3K4UA 4YICA 1P1NA 1MXVA 3G7WA 4MLQA 1NH7A 4R9GA 4HCYA 2DP8A 3C9HA 3CSBA 1N76A 1DPPA 2AYSA 1QUIA 1B3EA 4JBZA 3TCGA 1N0TA 3G3HA 1LCFA 3SESA 3TTNA 1B7UA 3A09A 1JW5A 3MQ9A 1IZ1A 4LZ8A 4PFYA 2UVGA 4G4PA 2V3UA 3OOAA 2OK2A 2E0SA 3CFZA 5I2NA 3PPRA 1SW4A 4ZECA 1D9VA 4PETA 1SW5A 4FAJA 4ZE9A 3TFLA 1IXIA 3PMWA 4H0WA 4QFOA 1B5HA 1YPNA 4FEBA 1DTGA 5K2YA 4GFRA 2QPQA 4JWXA 1SBPA 2W7YA 2F7AA 4X9TA 4FJPA 2HZKA 5FHMA 1N7XA 3PGFA 1B3HA 5HM4B 1PC3A 4MBPA 2V84A 3MVYA 1B4HA 2XXRA 1Y20A 1P1OA 3VLUA 1MH4A 2F78A 3G3IA 2YPNA 2F5XA 4FIMA 1WODA 1B40A 1RYXA 4NEDA 3U8QA 3RLFE 1RKMA 2KLFA 4GIZA 5I2KA 4PE5B 1BLFA 3VXCA 3MW0A 3VVEA 3USDA 4KR5A 3KN8A 4Z7EA 1MXXA 1SW1A 2XXUA 4WXJA 3S2VA 1OVBA 1N3WA 4LUBA 3N5LA 5I58B 3HN0A 3L6GA 5TP9A 4H5FA 4C1UA 4RK2A 1B4ZA 1FTOA 3VVDA 3GBBA 4KQPA 1QW0A 2HXWA 2YLNA 3K1PA 3SERA 5AE4A 3RY3A 3TQWA 3CI8A 2UVHA 1PBPA 3QK6A 1MS7A 3M3FA 4PFUA 4EXKA 1YTVA 2HFBA 2GRVA 4YMAA 4RPNA 2PT1A 3FJMA 3B6TA 2DWAA 1TXFA 4F1UA 3LSXA 3IO6A 4PP0A 1MY1A 4IO5A 5JTYB 3HHGA 5KZTA 1SI0A 3H7MA 1P99A 2XXTA 1LFGA 4HW8A 1OQGA 3FUZA 3U93A 2V3QA 1IUDA 2I3WA 4QF9A 1XC1A 4Q5TA 2PMSA 3HHFA 1DSNA 2PT2A 2V25A 4FEDA 2RF1A 2V3TA 3S9LC 3G3FA 1URDA 2A5SA 2D5WA 4BDMA 5CRYA 2ZNUA 4PFTA 2GHBA 3KN3A 5K2XA 3MZ9A 1PBQA 3VDFA 3ZKKA 4N6PA 3WAFA 3DP4A 5ICTA 4JSOA 3IR1A 1MM7A 1MXUA 4GL8A 1M5BA 5H8HB 4ESWA 2DQVA 4GXAA 1IEJA 3K6XA 4F3GA 3T93B 5CC2A 3K02A 5I58A 4C0RA 5JEIA 2UYFA 1QUJA 2F7BA 3UK4A 3U72A 1Y3PA 3FZVA 2X7PA 3KGCA 4U1OA 4OQOA 1B58A 1LCTA 5J1DA 4JWOA 1B3GA 1LBCA 4GLIA 4ZS9A 4P11A 1FTLA 3UN6A 4WEDA 4OZ9A 3MVXA 4DLDA 1ZU0A 5DVFA 4EQ7A 2F36A 4F1VA 4Q0CA 1YCJA 5ITPA 1I6QA 3UORA 3FXQA 3DELB 2QS2A 1XVXA 5JTYA 4F2OA 3RPWA 1S50A 3MVWA 5DEXB 3C34A 2VD3A 1MDP1 2I3VA 4LQ2A 5DYHA 1UTHB 3OD7A 4IO3A 1BKAA 3WAEA 3PPPA 4R74A 1BP5A 3G3KA 3KJTA 2AIXA 3FD3A 1UIUA 4EDPA 3O66A 1NH8A 5HPQA 1UIVA 1DOTA 1MY4A 4OENA 4DXCA 4I1DA 1FQEA 2QS1A 2Q9TA 1D4NA 5I59B 1BTJA 1SQYA 3IOWA 3TTKA 4QFKA 4XIGQ 1S9TA 5H8HA 5HBCA 4G2ZA 1LFHA 3TCHA 4QSEA 1ZMGA 4X48A 1LBBA 5A5XB 4BDRA 1N7WA 2ZYOA 4NMYA 1N84A 5H8NB 5ICQA 3PUYE 4NTLA 3IOVA 3VE1B 1B0LA 4N13A 1XS5A 1LB9A 4RNSA 1MG1A 2V93A 2Z8EA 3I3VA 1FTKA 3E13X 4JXIA 4KFQA 3CG3A 1AIVA 4ONYA 4G77A 2OCUA 3VXBA 3OEKA 3TZAA 4GL0A 1LLSA 1OLAA 5I84A 5CI5A 3F11A 3W15C 2LAOA 4F18A 4MF3A 2QRYA 4NE4A 3VLWA 5DEXA 2Y7KA 3O97A 1F9BA 4DE8A 3DM0A 3FIRA 1H76A 3K6WA 1UTHA 2ESNA 1HSJA 3C33A 4ELRA 4DZ1A 4XTCQ 4ZEBA 3OO7A 3ONMA 3R6UA 5H8SA 2ZYKA 3MC2A 3B6WA 3K2DA 2RC9A 1B5JA 3CSGA 2VGQA 2HQ0A 2IA4A 4GF8A 2I6EA 4IO7A 4ND9A 2O69A 3KOSA 1Y4CA 5B7DA 5I59A 4XXUA 3C32A 1A7LA 2H5YA 2ONSA 4NF5B 3T9HB 4NF4B 5F1QA 5A5XA 2OLBA 2NWJA 1B51A 4DCXA 1H44A 1SD3A 2ABHA 4R6KA 4YB6A 2I58A 3MJNA 5H8NA 2NVUB 1MQDA 1BIYA 2Y84A 2H99A 1Z7ME 2AL5A 3IJXB 3FGSA 3Q27A 3CVGA 1SYIA 2QJEA 4AQ4A 1URGA 4POWA 2O84X 4LZ5A 2Q2AA 1SDXA 3HO7A 3AXFA 2Z8FA 1Q1KA 3KSXA 1JNFA 3FVOA 1QULA 4DDDA 3C4MA 1ZLQA 1B6HA 2F7CA 3UGWA 2Q8JA 1CE2A 1PEBA 4Q8RA 3FVGA 4QFNA 3OEMA 4F3SA 4ZEDA 3TODA 4M1VA 4U23A 5DVIA 2GFEA 2Y7IA 3P7IA 2RINA 1TT1A 2FYIA 2B3BA 3D4GA 3DLNA 3IB1A 4OESA 5ELVA 4XKPA 2WKYA 3FVNA 3TCFA 5B70A 3KEIA 3M3KA 1VR5A 2F6PA 3H4ZA 4IO4A 3T9VA 1PB9A 3T9XB 3V89B 2XD3A 4XKQA 1SYHA 1AOVA 4EQ9A 3TQLA 4NF4A 2QSXA 4H1XA 3ODBA 1B5IA 2O7IA 1OMPA 4ZE8A 4HCWA 4O3CA 1TWYA 2Y7WA 1H45A 3ZSFA 3OELA 1MQHA 2IEEA 1S7YA 2QMWA 1GV8A 4LVQA 3PUXE 4FECA 3S9MC 2H9BA 4KD5A 1M5CA 4O3AA 4F2QA 2XXHA 1MXZA 4G8HA 3HPIA 5TPAB 5L8DA 3MUQA 4YKIA 3IO4A 2HAUA 1M5FA 3KOTA 4H67A 1B9JA 1L5TA 4ELOA 4X1DA 4YKPA 4OXVA 4BDLA 4WKMA 1NNPA 4ESXA 3K0VA 2R9JA 4MFIA 1JEUA 2QL3A 4U4XA 4P0IA 4ELQA 2F34A 4GXSB 1WDNA 3U92A 3QXMA 2OWSA 2A5TB 3CG1A 3LSLA 2XXWA 3RTWB 1RYOA 2I0CA 3H6TA 3IAZA 4EF1A 2THIA 1D3KA 1VSOA 3BFUA 2CZLA 2VP1A 3C36A 3RUMA 3PU5A 1WVJA 4NWCA 3SEUA 2NUVA 2G93A 1ZKBA 1B1XA 2XHDA 4MLVA 1B46A 2H98A 4UA8A 1DMBA 3DP6A 3Q26A 3UP9A 2UVJA 1P1WA 1EZOA 1R1NA 4OFJA 2QS3A 3ILUB 4M4GA 1XVYA 1UTBB 3PMXA 3HV1A 4YZZA 5EHSA 2GH9A 1QVSA 3FJGA 1MPCA 4YU0A 1Y4TA 4RA1A 2Y7RA 1LAFE 4R9FA 4ECFA 3RTFB 1GGGA 1MQGA 4BDNA 5M2VA 4EQBA 2FA7A 5TPAA 1PDAA 3QYTA 1MH3A 4OFOA 5TU0A 4F31B 1IXHA 4YKKA 3SEXA 4H6DA 1B7HA 1QKAA 2XX8A 3Q28A 1POTA 4KPTA 1QUKA 2ZYMA 1ZJLA 3EQ1A 3SEVA 2BJJX 1M5DA 1LSTA 2H25A 2H4IA 2ZNSA 4R73A 2O6AA 3RN8A 2F8DA 3L6HA 4IGRA 2PBWA 4HS7A 4YAHX 3BBRA 5L9OA 1TFAA 1R9QA 4ISUA 4DXBA 3GLBA 4F39A 1ZIUA 4TLLB 2A5TA 3A3CA 1MPBA 3BKIB 3KSJA 4GD5A 1XT8A 1EZPA 4THIA 4OEVA 3T9UA 1FQCA 2RCAA 1NNKA 3IK6B 2PX1A 2XD2A 3G3JA 5ITOA 1LB8A 5CBSA 1D9YA 2P1SA 2OJTA 4R6YA 4OTEA 3H3GA 2NXOA 4QRZA 1Y1ZA 1UTBA 4RY1A 4G68C 4H65A 4RPOA 4LZ7A 2XX9A 3H6UA 2NOOA 4PQJA 1B3FA 2FNCA 3K1MA 4TOZA 3OO6A 3H6VA 2RC8A 1IITA 3TKDA 3QSLA 1Y9UA 2ONRA 4KYSA 3VFJA 1O7TA 3TYHA 3S9NC 2O7UA 4KCCA 2UVIA 2ALUA 1USYH 4YKJA 2B3FA 5CMMA 1NKXA 4OMBA 1H43A 5DVJA 1IXCA 1Y3QA 5L9SA 2Z22A 3BFTA 1EU8A 5AA2D 2YJPA 4JB7A 4ZEIA 2XXPA 2DXYA 3PUWE 3LSFB 4KI0E 1O63A 3PUVE 3TTMA 1NMUA 2R71A 2ZNTA 4U2RA 3TTRA 1I6AA 1SI1A 1A8EA 3TAJA 4XKNA 2Q89A 3IB2A 1MM6A 4QFLA 4U1ZA 3MPKA 1T0KA 1II5A 4KCDA 2ONKE 2OWTA 4G8MA 3K6UA 3TTLA 3KJ7A 3G3GA 2O68A 3E9XA 4R72A 4EUOA 2QMXA 1AMFA 1OIBA 1JEVA 3B7DA 4BLAA 2XXVA 3EPEA 1A54A 4F3BA 3PPQA 1MY2A 1Y1MA 2E1SA 5FHOA 3IL1B 1JQFA 1JVXA 1LAHE 2ZMBA 3EHTA 4YB5A 4LATA 3SETA 1MQIA 3V83A 2OBGA 3FV2A 2X26A 3FV1A 3VVFA 5KCJB 2REGA 4ZEFA 1Z7NE 5BUUA 3KBRA 3VV5A 2B65A 2D3IA 2VOZA 2Y7PA 1FQBA 4P0GA 4EXLA 3ECRA 4ELPA 5I57B 3N6UA 1ANFA 4IO2A 3MBPA 1TFDA 1JVYA 3CFLA 2Q2CA 5ISUA 4JDFA 2DWHA 2XXQA 2M8CA 2UXAA 3UA8A 2HAVA 4ZDMA 2DSFA 3ZS6A 3IB0A 3UIFA 1NL5A 3U1OA 3FVKA 1ATGA 4C1TA 1FW0A 1B2HA 1P1QA 5LOMA 2P2AA 3KN7A 2CMOA 3U94A 3OMBA 3D4CA 4R75A 1N04A 2XXYA 1US4A 3LBSA 1KWHA 1A99A 4E0XA 1OLCA 4PFWA 4JSDA 5AA1A 1PB8A 4TLMB 3KG2A 1B32A 3FJ7A 3IX1A 4UACA 4NF5A 3V5AA 1B0HA 2Z23A 3IORA 4YMBA 2XXXA 1VFDA 3EHUA 1DTZA 1UQWA 3PMVA 4NWDA 1B3LA 4KYEA 1MDQA 3EF7A 1GTKA 5BWJA 3TUSA 3A3UA 5KCJA 3Q29A 4RXLA 5FHNA 5I56B 3SEWA 1ZBMA 3O2AA 1NNTA 3JZJA 4BDOA 3ZKLA 3MP8A 3RQTA 4WEPA 4OYVA 5H8FB 3O29A 5JK4A 3N94A 1EZ9A 3B6QA 4GVOA 3E4RA 4N07A 4QFPA 3K01A 4R2FA 5I57A 4L17A 2DE2A 1MRPA 1IXGA 4TQUQ 3MP1A 1OQHA 3FXUA 4LP2B 5AA4B 1NFTA 2P0SA 1XOCA 3I5OA 2DWJA 4F3PA 5EHMA 2X7QA 4POXA 3SDFA 1N3XA 2HEUA 3SKPA 4DCYA 3IOTA 1MXYA 3T66A 2DWIA 3TEPA 1FQDA 3C35A 4QHQA 1B05A 2Z8DA 5FTIA 2HZLA 3CIJA 4EF2A 1O64A 4OETA 3MP6A 3OXNA 3O6HA 1EH3A 3N26A 5L9MA 4NF6B 1POY1 2F35A 4F1YA 1A40A 3CR9A 4GOTA 3OSRA 1JW1A 4Q30B 3H03A 2REJA 2I4BA 1JW4A 4KYDA 3IOUA 1IIWA 4ZZEA 1LFIA 3PD8A 4FATA 2O51A 1Y3NA 3M3LA 2DE4A 4OHNA 2HCAA 4YB7A 3S4UA 3LSWA 4I9DA 1QKBA 4U22A 5I56A 3DP8A 3EN3A 3CFXA 1SW2A 3FASA 4OERA 2OZZA 4GWOA 4E0WA 5H8FA 4IO6A 1J1NA 1MY3A 4DXUA 3TPAA 3MZ1A 4F19A 4ZEKA 1A55A 3OSQA 3MAMA 3K6VA 4G68B 2ZXTA 1FQAA 2D21A 5EYFA 2R6GE 3THIA 3FXRA 4IB2A 5IKBA 1US5A 2I49A 3O9PA 4OFLA 3QUFA 5AA4A 3GBAA 1IQ7A 2DVCA 1FTMA 5AA2B 1CB6A 3C31A 1URSA 1VFEA 1R6ZA 5F7VA 2F97A 2XXIA 3O6IA 4AB6A 3PUZE 2DYXA 2UYEA 2RC7A 3PPNA 3GXAA 2RKMA 2O1MA 1MQJA 4OVJA 2VD2A 1FQFA 1MPDA 1XHYA 5KDTB 4LONB 1R9LA 1ELJA 4NF8B 4R6HA 3EHSA 3MVZA 1GR2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PFIA 4XEQA 3QMFA 2DE3A 3MPLA 4FORA 4HTGA 1LAXA 2FVZA 3Q25A 2ANJA 2I4CA 4NF6A 4I62A 5H8QB 3RT8A 1FTJA 3ILTB 3LUYA 4DIGA 3SEYA 2F3BA 5DW8A 4RJZA 1LBXA 4BDQA 3LR1A 3KZGA 1B52A 1USYE 2Q88A 1A8FA 3RNNA 1FJ6A 3R26A 4H8IA 3K1NA 1OVTA 4Z0IA 4O3BA 4HE2A 3H06B 5CBRA 2DVZA 4I40A 3CRBA 3E78A 3I6VA 4PAIA 4FE8A 4G8NA 4N6KA 4PGNA 3O28A 3HSTA 4PDDA 3JYRA 2FIEA 3QUJA 4GQOA 4U21A 3TMGA 1I69A 3PV0E 2O1LA 3GZGA 1JETA 3R7XA 4H5GA 2GHAA 4MCOA 3QAXA 4ZZAA 3VLVA 5IAIA 3PD9A 2RCBA 1B7ZA 3KC1A 4PAKA 2PYYA 4QSDA 5FTHA 3OO9A 4G68A 2DOJA 4GX6A 1SVXB 3KFMA 1M5EA 1PB7A 1Q35A 2XX7A 2G29A 3N6TA 3HCQA 1FBEA 4LA9A 5DT6A 3M8UA 4U4SA 1QJMA 4OWDA 3LC8A 2I0BA 4O94A 3QIMA 3W9WA 5AA2A 4R2BA 4QBAA 1AL3A 4OEUA 5IZ3A 2CZIA 2DS9A 3OENA 4MH5A 1ZTYA 1NNFA 5DTBA 1AH5A 1YAEA 2QS4A 4GRKA 4I8CA 1FCKA 4H8JA 2VHAA 4KHZE 5I2NB 4HXVA 4QSCA 4LQ5A 4XKRA 1LAGE 2WBBA 3T22A 5KDTA 1B1HA 3SZPA 4IY5A 1VE4A 4NF8A 3JV9A 2PVUA 4PBQA 4F29A 2CEYA 5CMBA 1MXWA 1LGBC 3T0JA 3IJOB 5H8QA 1DPEA 3H6WA 1HSLA 2I48A 1FBHA 4RK9A 3A29A 3S9EA 2ZYNA 4F22A 4P47A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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