5KDTB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne0723
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
287
structure length
284
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 284
sequence length 287
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtB02
4IB2A 3IL1B 2YJPA 2XXXA 4OEVA 4O3CA 1M5BA 3W9VA 4G8MA 1N76A 4HTGA 3PPOA 3PPPA 4OETA 1UTBB 3EHTA 1JQFA 4LQ2A 3VV5A 4IY6A 4U4XA 1MQDA 1AH5A 4QFLA 3ZS6A 4NEDA 5H8HB 1TT1A 1ZLQA 4EF2A 3MJNA 5EHMA 3HCQA 4LP2B 1PEBA 4RNSA 1JVXA 4EXLA 1JW1A 4DCXA 4Q8RA 2UVHA 4M1VA 3CVGA 1OLCA 3F11A 3S2VA 3T66A 4ONYA 3MP6A 1VFEA 3CG3A 1UTBA 4XKRA 1D3KA 4PFTA 3FGSA 1OVBA 4JSOA 1QUJA 2DYXA 4GLIA 5H8HA 3OSRA 3EHSA 4NF4B 3JZJA 3CFLA 2XXPA 3KSXA 3LSWA 4P0GA 3FATA 3N94A 4KYEA 3V5AA 4LZ8A 5DTBA 1B7UA 4ESWA 3PMWA 1Y9UA 1Y20A 1HSLA 1JETA 3R7XA 3A3UA 3G7WA 3OOAA 2IEEA 2I49A 5I2NB 3VDFA 3H6UA 1FTJA 1B3FA 2H4IA 2XXYA 1M5FA 2F7AA 4ZEFA 4NF4A 4HCYA 3GZGA 4JWOA 5A5XA 1A54A 4XTCQ 4XKPA 1HSJA 2E0SA 3LSXA 4GWOA 3D4CA 3FD3A 1Y3QA 3KSJA 5ICQA 4IO2A 3VFJA 2Q2AA 5KCJB 4MLVA 5CMMA 4XKNA 1N7XA 5I2NA 4TQUQ 3M8UA 1PBQA 2CZLA 1RKMA 1L5TA 4G68B 3T9UA 3H3GA 4OFLA 2DOJA 3C35A 3MQ9A 1MY4A 5F7VA 2D3IA 4E0XA 1QKAA 3KGCA 4FJPA 3MC2A 2DWHA 3RQTA 5KCJA 3Q28A 2PYYA 2OJTA 1NNKA 1B7HA 4F3GA 2THIA 4YKIA 4G68A 3TYHA 4R2FA 5I58B 1Y1MA 4NF8B 3TFLA 3CSBA 3K2DA 4WKMA 2ONSA 4F1VA 1JEVA 1URSA 4ZZEA 3OXNA 4OZ9A 4ZECA 3LR1A 3TQWA 4M4GA 4PE5B 1YCJA 3FZVA 5I58A 3RUMA 4NF8A 1B52A 5L9MA 3N6UA 2XX8A 3CRBA 2WKYA 1URDA 3C4MA 3TCHA 3BBRA 3EQ1A 3HSTA 1H76A 1PB7A 4YICA 1PC3A 3RGYA 3S4UA 1WDNA 1IQ7A 4ND9A 4DXCA 4KCCA 1NH8A 4Q5TA 1A40A 3KN3A 3O6GA 1M5DA 4BDRA 1ZTYA 2B65A 4ISUA 3IOUA 1KWHA 1R1NA 3ECRA 1FTKA 3KJ7A 4RJZA 1MM6A 3HHFA 2ZYOA 3K01A 1QJMA 5IAIA 3PPQA 3I6VA 1SD3A 3IORA 1FQCA 3HO7A 3UIFA 2NWJA 2H5YA 3D4GA 3M3KA 1DOTA 4HW8A 3IR1A 2V93A 3PPRA 4OESA 2RF1A 3GBBA 4QRZA 3RY3A 3O6IA 5JK4A 4JB7A 4OQOA 1LAGE 2RC8A 2W7YA 4FORA 3T96B 1DMBA 4H8JA 4MH5A 4ZE9A 3FASA 2VHAA 2VD2A 2Z22A 1B5HA 2REJA 3VE1B 4ECFA 4GF8A 3T22A 3N26A 3OMBA 4OTEA 3MZBA 5TU0A 1CE2A 3IB0A 4EF1A 1MY3A 3FJMA 2XXIA 3UP9A 1NNFA 4FIMA 3TTRA 1MDP1 2I6EA 3TPAA 2F7CA 4YKJA 2VP1A 4X1BA 4KYSA 3DP8A 4EUOA 1I6BA 1XVXA 4UA8A 3K6WA 4GQOA 1QUKA 3UORA 2XXRA 3SEVA 4H1XA 4IGTA 3RN8A 2GHBA 3C36A 1MXXA 2YPNA 4LONB 5TP9B 4JWYA 3RT8A 3ZKLA 4Q30B 5AA3A 1FQEA 4EQ7A 1LLSA 3TMGA 3I5OA 4U1OA 3OO7A 3U8QA 3C34A 2DWIA 5EYFA 5TP9A 2O84X 3TEPA 5JTYA 1P99A 1Y3NA 3U72A 1LAFE 3N6TA 1SW5A 3OO8A 1T0KA 4YZZA 4F22A 3IOVA 5AE4A 3RTWB 2F6GA 4OERA 2CMOA 2NUVA 3VLVA 5B7DA 3K4UA 2PBWA 2LAOA 1A99A 5CMBA 2O7UA 1DSNA 5CI5A 2O1LA 2R71A 1US5A 3CG1A 1URGA 3IO6A 1Y3PA 3OO6A 2F5XA 1OQGA 2Z8EA 3KOSA 4YKPA 4YB7A 3VVEA 4OVJA 4RPNA 3VVDA 3K6UA 1MXZA 1I69A 4ZEDA 4U22A 3AXFA 1Y1ZA 1IXIA 4F31B 1D9YA 1M5CA 1P1QA 2QL3A 2AL4A 2DS9A 1QVSA 4BDOA 4EQ9A 5I57B 2OBGA 1MQJA 3T9XB 3TAJA 1EH3A 4YAHX 1N3XA 5CBSA 2O69A 3G3GA 4F3PA 3IAZA 2FA7A 3MUQA 4QHQA 4FAJA 2Y7WA 3FIRA 4IGRA 2F35A 2XXTA 3OEKA 3ILTB 1AOVA 1II5A 2XD2A 2F6PA 1B3GA 4XXUA 5I57A 4I1DA 3K1MA 3U1OA 2DP8A 1Z7NE 3BFTA 3PV0E 4ELOA 1LCTA 4R9GA 5I56B 1H45A 3V8XB 3CIJA 1B3HA 3TCGA 4ELQA 1ZBMA 4EQBA 3MVXA 2XHDA 3RLFE 4RK2A 3QYTA 1ATGA 3JV9A 1P1OA 2I4CA 4BLAA 3SERA 4ZE8A 1GTKA 4G68C 1TXFA 4C0RA 3DLNA 2D5WA 2XD3A 2G29A 5I56A 1SI1A 4DXUA 3ODBA 5AA2B 1SQYA 4PFWA 5A5XB 4U2RA 4BDMA 1MY2A 5L8DA 4LVQA 4LA9A 1EU8A 4RA1A 2DVCA 4OEUA 1DTZA 3VLUA 1IUDA 1YTVA 3KFMA 3L6HA 4X1DA 4R6YA 2Z23A 4FECA 4NF5A 4POWA 1NH7A 3SETA 5AA2A 2UYEA 2PT2A 4POXA 4XIGQ 1MPBA 5CMKA 5K2XA 2H99A 4KQPA 1SYIA 4EDPA 3UK4A 2R9JA 5L9SA 2RC9A 2VD3A 1JW4A 4G8HA 3RPWA 2UVGA 3KN8A 3MPKA 3O28A 3LBSA 5I2KB 1NKXA 3IX1A 3QUFA 1I6QA 2A5TB 1N04A 3KOTA 3C9HA 4Z7EA 2Q9TA 1Q1KA 2ZYNA 5ITPA 1US4A 1VSOA 1O64A 1BTJA 2UVJA 4N13A 3LC8A 5AA4B 2QS3A 4THIA 5ITOA 2QPQA 3O9PA 4OYVA 3H6WA 4QFOA 1A55A 4U21A 1LGBC 1B5IA 1PB9A 3K02A 5I2KA 2KLFA 5TPAB 1R6ZA 5CBRA 2V84A 4DLDA 2A5TA 3MVYA 1MM7A 2V25A 3FJGA 2OWTA 4PFUA 4F3SA 3QUJA 1XS5A 3MVZA 5AA4A 4OFJA 4XKQA 2VOZA 2YLNA 1GV8A 3H6TA 2O6AA 2X26A 1TFDA 5FHOA 2F8DA 1LAHE 2PT1A 5TPAA 4ELPA 3S9MC 1EZOA 3E13X 4NTLA 4F2QA 2O7IA 3HV1A 5FTIA 1LCFA 3W15C 4RK9A 1B5JA 4GVOA 4IO7A 3PMXA 4IO4A 1NNTA 2FYIA 1P1UA 4F39A 4U23A 2AYSA 2XXQA 1UTHB 3OENA 4QSDA 3OSQA 3W9WA 3CFXA 2A5SA 4X9TA 4F1UA 1B46A 2ZYKA 1P1WA 4KPTA 1BKAA 2RINA 3OO9A 4OWDA 2ZNSA 1NFTA 5F1QA 3K6VA 5HM4B 2VGQA 5I59B 1B7ZA 1UTHA 1QULA 2ZXTA 4PQJA 3KEIA 3FVNA 3QAXA 1N84A 2HFBA 2XXVA 1ZJLA 2HAUA 4LQ5A 1I6AA 4IO3A 2QSXA 4DIGA 4G77A 3L6GA 3IB2A 2Y7RA 3MP1A 5KZTA 3K1NA 2AIXA 4PFYA 2GRVA 2PMSA 3V89B 1SVXB 4K3FA 4KFQA 1MPDA 3MZ1A 3FJ7A 4G8NA 5I59A 5L9OA 1OQHA 3KJTA 1AL3A 2HCAA 2I58A 1B9JA 3EF7A 1IEJA 3C31A 3MVWA 2XXHA 4I9DA 1POY1 2Q2CA 4G2ZA 4DZ1A 4F1YA 3B6QA 2HAVA 2ABHA 3K00A 1B51A 4PETA 3THIA 1GR2A 4C1UA 1ZU0A 3T9VA 4KHZE 1AIVA 4H5FA 3BFUA 5JTYB 4R9FA 4NF6A 5HBCA 4FE8A 3R6UA 3KG2A 1ZMGA 2OWSA 1IITA 3IOWA 3MW0A 4RPOA 2DXYA 4DE8A 4QFPA 5BWJA 1Y4TA 4ESXA 1SW1A 2Z8DA 1Z7ME 3H03A 3IK6B 4H5GA 3T93B 5AA2D 4DXBA 3PMVA 1B3LA 2DVZA 5M2VA 3O97A 4H0WA 2REGA 4BDQA 1JW5A 2V3TA 3FVGA 3Q29A 3E9XA 3TQLA 4NE4A 1NNPA 2DWAA 3O2AA 3PUXE 1VE4A 4JSDA 2G93A 1B1HA 4N07A 5CRYA 3SEUA 2QMXA 1N7WA 1ZIUA 5BUUA 3OELA 3O66A 3TDJA 1D4NA 2XXUA 4UACA 3ZKKA 1TFAA 3SEYA 1MH3A 1MY1A 4IY5A 4DCYA 1MRPA 2QS4A 4Z0IA 3IOTA 3B6TA 2HZKA 3G3HA 3EHUA 3C33A 5ICTA 2UXAA 4GRKA 3TKDA 5ISUA 3S9LC 4QSCA 4R74A 3TTKA 4G4PA 4YMBA 2GHAA 2RKMA 3MP8A 3Q27A 3KN7A 1LFGA 1FQFA 1YPNA 3IB1A 3IJXB 3TODA 1IIWA 2DE2A 3FXQA 5KDTA 4NMYA 4N6PA 1SBPA 3VVFA 2DWJA 4F29A 4C1TA 2NOOA 3CI8A 3G3KA 5I84A 2QJEA 1DPEA 1EZPA 1MDQA 2I48A 2H25A 2PX1A 3EPEA 1BLFA 1JVYA 1LB9A 3WAEA 1M5EA 2V3UA 2Y7IA 1UIVA 4X48A 3E3KA 1B1XA 2X7QA 2Q8JA 1O63A 1SYHA 1QKBA 3SKPA 1SW2A 3TCFA 3E4RA 2B3FA 3RNNA 4R2BA 3USDA 3G3FA 1SW4A 1RYOA 1NL5A 3TTNA 2F7BA 2UVIA 4OENA 1MQHA 3O29A 3PUZE 4LZ5A 3PUWE 4ZDMA 4E0WA 5DVFA 4TLMB 4GFRA 4F18A 2ZYMA 1HSEA 4GD5A 3TELA 2XXWA 3PGFA 1H3DA 4BDNA 3MZ9A 3B6WA 4I8CA 3GXAA 4HS7A 4F3BA 2ANJA 4WXJA 1LBCA 4NF5B 4OMBA 2OLBA 1WODA 3UGWA 2B3BA 1MPCA 1JEUA 1MS7A 2O51A 2RCAA 1S9TA 5H8NB 2DE3A 3HPIA 1R9QA 4NWCA 3U94A 4AB6A 2O1MA 1MQGA 2AL5A 4OFOA 3SDFA 1MG1A 1YAEA 3PD8A 4RYAA 2UYFA 4IO6A 4KD5A 3FV2A 4Q0CA 4H67A 1DPPA 2QS2A 2ONRA 4WEPA 3I3VA 2NXOA 3TTMA 3BKIB 1NMUA 1DTGA 2I3VA 5H8NA 1QUIA 5J1DA 5LOMA 3C32A 3VXCA 5B70A 5CC2A 3M3FA 4U1ZA 1A8EA 3S9EA 2NVUB 4ZEIA 4LZ7A 2OZZA 4MBPA 5K2YA 2D21A 3M3LA 1IXCA 4O3BA 1XT8A 4FATA 1BP5A 3CR9A 1D9VA 2ZMBA 1IXHA 2OK2A 3KBRA 4H8IA 2M8CA 3LSLA 3GLBA 3PU5A 4BDLA 1H43A 3A3CA 1LFIA 1MXYA 3DP6A 4YB6A 3FUZA 2R6GE 2V3QA 3MPLA 2DXRA 4TOZA 3PUVE 2Y84A 2ESNA 2P0SA 5CM6A 4WEDA 4RY1A 4YKKA 2QRYA 1GVCA 3JYRA 4H6DA 1B3EA 1WVJA 3U92A 5JEIA 1LAXA 2F78A 3RTFB 3FVKA 4AQ4A 1FQDA 3LUYA 3SEWA 1TWYA 1LBBA 1UQWA 4F2OA 1OVTA 3TZAA 3EN3A 3H06B 2ONKE 4MFIA 1MH4A 1B6HA 3GBAA 3HN0A 3K6XA 1VFDA 3LSFB 3QXMA 3V83A 3FXUA 1OMPA 4QFKA 5HPQA 4ZZAA 1OIBA 4HCWA 5FHMA 4I62A 5DVIA 1MY0A 3Q26A 1ANFA 1QW0A 1B40A 1FQAA 1JNFA 2F36A 1POTA 2P1SA 3U93A 1A7LA 4ZS9A 3MBPA 1F9BA 4O3AA 3K0VA 2PVUA 4ZEBA 5DYHA 4NWDA 2ALUA 5H8FB 1LB8A 2XX9A 3A09A 3VXBA 1FCKA 2HEUA 4LATA 4JWXA 1VR5A 4KCDA 3K1PA 2I0CA 3QSLA 3H7MA 3UN6A 4P0IA 4YMAA 3H6VA 5FHNA 4GXSB 3S9NC 2ZNTA 4JDFA 1GGGA 3OEMA 5DEXB 5H8SA 4H65A 4PP0A 3G3JA 5H8FA 3CFZA 3Q25A 1B58A 3CSGA 5CMCA 4EXKA 3ZSFA 1FTOA 2FNCA 1XOCA 4YU0A 2F97A 3DELB 5EHSA 2BJJX 5DVJA 4GL8A 4NF6B 4TLLB 1N3WA 3MAMA 3N5LA 1RYXA 1H44A 1OLAA 2F34A 5DEXA 4GIZA 1UIUA 2E1SA 4ZEKA 4L17A 1CB6A 3RT6B 1B05A 1USYE 1ELJA 2QS1A 2HXWA 3SEXA 3QK6A 4F19A 3FVOA 4OXVA 3R26A 4R6HA 3H4ZA 3O6HA 1MXWA 1BIYA 4KYDA 5FTHA 1PDAA 4YB5A 1PBPA 2O68A 4ELRA 1USYH 2DSFA 1SDXA 2RCBA 1ZKBA 4MLQA 2DE4A 1MXVA 2HQ0A 4GXAA 4QSEA 3ILUB 2Q89A 3KZGA 3PPNA 2P2AA 5IKBA 4OHNA 4RXLA 2I3WA 3P7IA 4MF3A 3FV1A 2QMWA 4U4SA 3B7DA 1FTMA 3QIMA 4FEDA 4R6KA 5ELVA 4JXIA 3MWBA 2HZLA 2I4BA 4KI0E 3FXRA 1B0HA 1B2HA 4R75A 2Y7KA 1MQIA 3TTLA 1B4ZA 2H9BA 1XC1A 3VLWA 2Q88A 2X7PA 4IO5A 5DT6A 1A8FA 1MXUA 2GH9A 1EZ9A 1FTLA 1P1NA 1FW0A 4AB5A 3ONMA 1N0TA 1IXGA 3DP4A 1IZ1A 4DDDA 1S50A 5KDTB 4R73A 3PD9A 1FQBA 1S7YA 1SI0A 4FEBA 3IO4A 3TUSA 3SESA 1J1NA 1XVYA 1XHYA 1O7TA 5AA1A 4GL0A 5H8QB 2IA4A 1Y4CA 3UA8A 4KR5A 3WAFA 2DQVA 4LUBA 1R9LA 4QF9A 3OD7A 3G3IA 2Z8FA 3T9HB 1AMFA 1B0LA 4QFNA 2Y7PA 1LSTA 4P11A 4R72A 1LFHA 2OCUA 2XX7A 1B4HA 3PUYE 5H8QA 2H98A 4GOTA 4JBZA 2RC7A 2ZNUA 2I0BA 2GFEA 3IJOB 1PB8A 3HHGA 3DM0A 1Q35A 1B32A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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