The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
TTYKLVINGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Complex (antibody/antigen)
|
| molecule keywords |
IGG1 MO61 FC
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| publication title |
Crystal structure of the C2 fragment of streptococcal protein G in complex with the Fc domain of human IgG.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
14
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-01-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1KH0 A; 1PGX A; 2IGD A; 1K50 A; 5JXV A; 2IGH A; 2J53 A; 2GI9 A; 2PW9 A; 1Q10 A; 4OZC A; 4KGS A; 1MHH E; 2IGG A; 4IOI E; 4KGT A; 1PGB A; 2ONQ A; 1IGD A; 2NMQ A; 2JXT A; 4KGR A; 1K53 A; 1MPE A; 2PTL A; 1XF5 L; 2QSD A; 5BMH A; 5HI1 A; 3V3X A; 1K51 A; 3UI3 A; 2RMM A; 1D4B A; 1MI0 A; 1HZ6 A; 1XCQ L; 2JSV X; 2OED A; 4D2K A; 1ZXH A; 2N7J A; 2N9L A; 2N9K A; 2JU6 X; 2QMT A; 1GB1 A; 2RPV A; 4OZA A; 1FCL A; 2I2Y A; 1FD6 A; 1P7E A; 2KWD A; 1MHX A; 2LHE A; 2KAC A; 2ON8 A; 2KQ4 X; 2ZW0 A; 4GLS C; 4OZB A; 5BMI A; 3MP9 A; 1MVK A; 2GB1 A; 2I38 A; 1IGC A; 5HFY A; 3FIL B; 4HKZ E; 1HEZ E; 2JZP A; 2J52 A; 4HJG E; 2ZW1 A; 1YNT E; 2JWU A; 2PLP A; 3GB1 A; 2EEL A; 2KN4 A; 4WH4 A; 1FCC C; 1JML A; 1HZ5 A; 5HG2 A; 3FIL A; 1QKZ A; 1IBX A; 1F2R C; 5BMG A; 5HHD G; 2LHD A; 1P7F A; 1EM7 A; 1XCT L; 1IBX B; 2LUM A; 2KDM A; 1F2R I; 4MAC A; 2LGI A; 1PGA A; 1C9F A; 1UWX A; 4IKG A; 1GB4 A; 1K52 A; 2K0P A; 1YMH E; #chains in the Genus database with same CATH topology 2IGD A; 3E56 A; 1TS4 A; 4EE2 A; 1E8Y A; 1UGJ A; 1ZPS A; 2WP9 B; 4B6W A; 4A6Q A; 2R2Q A; 4LJP B; 4C7Z A; 2MP2 B; 5TR5 A; 2ONQ A; 3HM3 A; 1DGJ A; 3AE6 B; 1V49 A; 1BML C; 4FA6 A; 4XC2 A; 1JWM D; 4TV3 A; 1RWS A; 1GNU A; 1WM2 A; 3NVV A; 2KYW A; 4K3C A; 2MEK A; 5T8I A; 1R4M I; 3Q3O C; 1IP9 A; 3U30 A; 2M19 A; 3I5J C; 1VLB A; 5JH5 C; 5AZF A; 4DHZ E; 1FD6 A; 5I4D A; 4WJP A; 1SEB D; 2OJW A; 4O1N A; 1F77 A; 2M1M A; 4P1C C; 2UU7 A; 3BK2 A; 3E9S A; 3AU4 A; 3BVG A; 2BQQ A; 4JX1 C; 3DBR B; 1DOI A; 1L0Y B; 2QHO A; 3B1L X; 2L00 B; 4B0E A; 3VDZ A; 2R61 A; 1XLN A; 1HEZ E; 3BK1 A; 4M0W A; 5LXH A; 1WMH B; 4EUT A; 3AE5 B; 2NBV B; 2G4D B; 2BBC A; 3L10 B; 2O2V B; 4LJO B; 2H88 B; 3EHV A; 4TSS A; 4LDT D; 2M56 B; 3VTW A; 1QZE A; 1KLV A; 1L4Z B; 1JRP A; 3LDZ E; 1F0Z A; 2LUM A; 4LCD E; 4PS7 A; 1YJ1 A; 4DXG A; 1CJE A; 2DAJ A; 1TKY A; 2KJ6 A; 3AI5 A; 1K50 A; 1WGR A; 1XO3 A; 1YMH E; 5G5H A; 2GBM A; 1N5X A; 3DPD A; 1L4D B; 2Z0E B; 4KIK A; 3U7D A; 2IO2 B; 3SU8 X; 3T9L A; 3IAS 1; 4GIV A; 3DOW A; 3VQI A; 3RZF A; 2N9P C; 2CS4 A; 2WXM A; 1WZ0 A; 4W9D A; 1V1O A; 1HE8 A; 3OLM D; 3APD A; 2NPT B; 2DZI A; 2MHJ A; 2FCQ A; 3DBS A; 5E6N A; 3BVM A; 3GE3 C; 4REZ A; 4ITK A; 3VAW A; 5BO4 B; 2JYT A; 1C4A A; 4FHK A; 1JWB D; 2KAN A; 1VDV A; 3OG5 A; 2LI5 A; 3EFU A; 3U52 E; 2QC8 A; 5LNK 1; 3R2I A; 2NCN A; 3I9V 1; 4EEW A; 2KVZ A; 4FBJ B; 3ZNI D; 3VUW A; 1RLF A; 2CKH B; 2W55 A; 3A9J B; 3ZRC A; 5C1Z A; 1ET6 A; 1VJK A; 1TGZ B; 3N3K B; 1E9M A; 2GLS A; 4HLE A; 1B9R A; 1J7A A; 3TIX A; 1EWY C; 3UGB B; 2WWZ A; 4WAA A; 4MH8 A; 5BYR A; 1WYG A; 4DXF A; 3HVZ A; 4JQW C; 4P6V F; 2XEW A; 3N9Y C; 3PZ7 A; 1XT9 B; 4FHJ A; 3ZNH B; 1T0S C; 1UNS A; 2XK5 B; 4M01 A; 1SE9 A; 4AOF A; 3L13 A; 4YTM B; 3IAM 1; 5H92 C; 3QA8 A; 1F2R C; 3TEY A; 4RMA A; 2LJI A; 4WJQ A; 3VH3 B; 1YJJ A; 3BY4 B; 1F52 A; 2CHZ A; 1IBX B; 1NYR A; 1WX8 A; 4OHJ A; 1UEL A; 2KVR A; 2JQR B; 4FUL A; 3TMP B; 3AB5 A; 2VH1 A; 3ENE A; 4XE0 A; 3WAP A; 3KLS X; 1V5T A; 1MHH E; 4MEL A; 2IGG A; 4HVB A; 2WGS A; 2B3A A; 3GE8 C; 2K1F A; 1T3Q A; 4HPL B; 2NTS A; 1IGD A; 3ZO5 B; 3AXC A; 4GGQ A; 1E6E B; 2FUH B; 2DZM A; 2LRW A; 3AE3 B; 5J2R A; 1RFK A; 1FRD A; 2QDF A; 4IW0 A; 4WWP A; 2WX1 A; 4ZRP A; 4HKQ A; 4W9L A; 3ZDT A; 4KX6 B; 1QIL A; 2BT6 A; 4YL8 A; 4D2K A; 4WJO A; 3JVZ X; 2JU6 X; 1AAR A; 5G2N A; 5BYS A; 2V9H A; 2O6V A; 2DNF A; 3CSF A; 4GDL B; 1XEE A; 2J42 A; 2I2Y A; 3KQ4 A; 3P2B A; 3GS2 A; 3HRD D; 3Q8C A; 1WH3 A; 4DBG A; 1FNV A; 4NQL B; 5CX3 A; 1JCK B; 3AM9 A; 4M0W B; 4MSM B; 1FNU A; 3C19 A; 3PRZ A; 5BMI A; 3ZVV A; 1WGY A; 2CU1 A; 3JSV B; 2HTM E; 2D10 A; 2WDT B; 2GBJ A; 1WY8 A; 2IZV B; 1WE7 A; 2UWQ A; 4ACF A; 3ZNZ B; 1VCB A; 5KHQ A; 1NBF C; 2AQ1 B; 4BFR A; 3ZTD A; 3O65 B; 4ANW A; 1QOB A; 3KUD B; 1I4Q A; 2BKR B; 1T5X D; 4KIK B; 1BXT A; 4RF1 A; 4NJC A; 2K39 A; 1RRB A; 2KQS A; 4MAC A; 2DYM A; 3H7P B; 1DOX A; 1GB4 A; 3T3N A; 1WGD A; 2WDR B; 5FR3 A; 4PYZ A; 5D3D A; 2C7M B; 4KDL B; 3U8Z A; 2KZR A; 2E3T A; 5JZE B; 4IOI E; 4GDK A; 1PGB A; 4RM9 A; 2JPH A; 3ZRF A; 3NZS A; 4KGR A; 1MPE A; 3QIJ A; 3AEF B; 2RMM A; 1D4B A; 1SB3 C; 1MI0 A; 4DDI D; 4KV2 A; 3PV1 A; 4CO7 A; 1OQR A; 2BYF A; 4AJY B; 2IBI B; 1E8X A; 4M8N A; 2LGD A; 2BVC A; 1EF1 A; 3ZKJ C; 3QCA A; 3QWZ B; 4ASW C; 1NI3 A; 3MC9 A; 4KSK C; 5GMV A; 3DBH I; 4B0M A; 3ZNG C; 2J4X A; 3TUO A; 1T0R C; 1KRH A; 4EOY A; 2LVQ A; 1IGC A; 1SBB B; 3KW5 B; 2J52 A; 1L0X B; 3AE7 B; 3QAR A; 3I3T B; 4OVZ A; 1BT0 A; 3Q8E A; 5H8Y E; 3GB1 A; 3M95 A; 1C4P A; 1QOF A; 4P16 A; 4ICU A; 1E10 A; 3X0W A; 2WXH A; 3HHM A; 1OQQ A; 3UIO B; 4E71 A; 1TY0 A; 3AE8 B; 3WAL A; 5DPS A; 3ZQ4 A; 3U2S C; 3WCQ A; 4YSZ B; 2XN9 C; 3MC0 B; 4LNN A; 4AWJ A; 3H1U A; 3R66 C; 1YJI A; 3H6N A; 3W5U B; 4KGS A; 2IY0 B; 2M4N A; 2EKE C; 2KDB A; 2V4I B; 2Z59 B; 3Q3M C; 5IOI A; 1OEY J; 4DHJ B; 1C3T A; 4IG7 B; 3GZN B; 3DHI C; 2KLG A; 3OAW A; 2WXJ A; 2WXI A; 4W9E A; 3IFW B; 2WS3 B; 3NZ3 A; 3NS8 A; 3PS6 A; 4FLH A; 3SHQ A; 2D3B A; 4DHZ B; 2TSS A; 4IWQ A; 5BYQ A; 1WJN A; 3C0R B; 2N9K A; 2OOB B; 3EA6 A; 1T0Y A; 2LEK A; 2ZJD A; 2DX5 B; 2L05 A; 4WWO A; 4LLG M; 3NY5 A; 3JYU A; 2L0T A; 3DWM A; 1J19 A; 1LFD A; 3ZDM C; 3T8M A; 1YIW A; 2KWU B; 1C79 A; 1SE3 A; 2JY6 A; 2MA9 B; 4YT0 B; 2KWD A; 3IBE A; 4IC7 B; 2JRH A; 4A3P A; 3L0W B; 3JW0 X; 4EZK A; 2GOW A; 4WJN A; 4JE3 B; 1ZOY B; 4NNJ B; 4BBN F; 1YQ4 B; 1FFV A; 4FJY A; 4ZRK A; 3Q6B A; 1MG8 A; 1FRR A; 2ASQ A; 4XX5 A; 2KX0 A; 4WQO B; 2N0S B; 5DPW A; 3P4Q B; 5CHW A; 3ZJU A; 2DHZ A; 3RUL A; 3AEC B; 3DBR I; 2KXJ A; 2BWE S; 1SJE D; 4TQ0 A; 1ENF A; 1SE2 A; 3A1Q A; 1DOY A; 3OWE B; 1UBQ A; 2V3S A; 2LGI A; 2Y5P A; 3P4S B; 5J18 A; 2PVO D; 4A3O A; 3L08 A; 4WWN A; 1IPG A; 3U4E G; 1U4A A; 4FAD A; 1LM8 B; 2DEN B; 5CHF A; 1X1M A; 3AE4 B; 3AE1 B; 2MQJ A; 5G55 A; 1OTR B; 1XXG A; 4HWI B; 2DWQ A; 2AEH A; 2MWS B; 3MTN B; 1CK1 A; 1FFU A; 1J8C A; 4WAF A; 5MPO A; 1GPX A; 3DHH C; 4IUM B; 1IUE A; 1SSN A; 3L54 A; 2WXO A; 3M62 B; 3RFZ B; 1QOA A; 3N1Y C; 3IT6 B; 1WXQ A; 4HK2 A; 1Q1O A; 4OW0 A; 3U7Z A; 2C7H A; 2QIL A; 5AZG A; 1H4R A; 3AE9 B; 1M94 A; 1WFY A; 3DWG C; 4OZB A; 2WXK A; 1CMX B; 2BS4 B; 2BYV E; 4MJS A; 1AWD A; 1WXM A; 2JUO A; 3RZW C; 2I38 A; 4X57 B; 3I57 A; 4AQ7 A; 1F1H A; 4ZDV A; 2K6Q A; 4W9K A; 4MM3 B; 5CHV C; 1SXT A; 2NBU A; 4GOC A; 4LNI A; 3ONS A; 1TIF A; 4EFO A; 1E7V A; 1M4V A; 5HG2 A; 4HJK A; 1QKZ A; 2BF8 B; 4URK A; 2BGF A; 1GJZ A; 2SAK A; 5EE0 A; 4MGY E; 1TKG A; 1MG4 A; 2BWF A; 1VR9 A; 2Z8L A; 1QLB B; 4AP4 C; 3WA0 A; 3VTV A; 4N9F 4; 3DVN V; 4HDO A; 4ARI A; 3CST A; 1PGA A; 2K8C A; 1UWX A; 3RI7 C; 1EU4 A; 1R4N I; 1V86 A; 3NVY A; 3P42 A; 5JXV A; 2KTR A; 2IGH A; 1FMA D; 2GRI A; 4ZRJ A; 4W9G A; 4JIO U; 2WLB A; 3TBL D; 3KH0 A; 3PZ8 A; 2HJ1 A; 1D3Z A; 1HA5 A; 2KX3 A; 4BVU C; 3DVG X; 1C4C A; 2WXG A; 2C5L C; 3ECI A; 4RNA A; 4HDQ A; 2JT4 B; 3K9O B; 3LB8 C; 1I4G A; 3UI3 A; 1XQQ A; 2YLM A; 4HRO A; 1WJU A; 2ZPN A; 2NBW B; 2JSV X; 1V5O A; 2AYO B; 4G0N B; 4YSX B; 4KVG B; 3QAQ A; 2REX A; 2RPV A; 4OZA A; 1ISN A; 3MFG A; 1IYF A; 2DAF A; 2W3S A; 2KQ4 X; 4NAW B; 4P7I A; 1WX9 A; 2EMS A; 2WX0 A; 5AEK B; 2KQ7 A; 4NJ7 A; 3TSS A; 4MEM A; 1KJT A; 4JL9 A; 4ZYN A; 1YN4 A; 2M17 A; 3NZU A; 1JWU D; 4LNK A; 3URY A; 4M00 A; 4US9 A; 2D2Q A; 2FAZ A; 3FC4 A; 3H8H A; 4K1R B; 1TYG B; 2OJR A; 3L16 A; 1N6Z A; 1UH6 A; 3FIL A; 2LVP A; 5IAA C; 4BZA A; 4ZYS A; 5BMG A; 4TQ1 A; 4NQK E; 5HHD G; 1P7F A; 4EZJ A; 2CJO A; 1Q5W B; 1XLO A; 1LQB A; 2HDE A; 4HEA 1; 3LYY A; 3A4S C; 1GAQ B; 1R4M B; 2JX5 A; 5C2T B; 4NY0 A; 2LZ6 A; 1K52 A; 1JRU A; 4USA A; 1JQ4 A; 3ZLZ A; 4DDG D; 4HCN B; 3AEE B; 1V1P B; 2ACZ B; 2PW9 A; 3DDC B; 1Q10 A; 1QQR A; 2WDV B; 3OJ3 A; 4GB9 A; 2WU5 B; 3MHZ A; 1LGR A; 2MBH A; 2KJR A; 2WNM A; 1PFD A; 4P1B C; 2NMQ A; 3PHX B; 2V1Y A; 1WZ3 A; 3KVF B; 1I4R A; 2LGS A; 3APC A; 3ZJT A; 4C00 A; 5BMH A; 2LFI A; 2K25 A; 2HTH A; 1ZKH A; 2G4S A; 2G45 B; 2PE6 B; 5IP4 D; 1I35 A; 2OED A; 3RPF C; 1WI0 A; 2SEB D; 1P1A A; 2N9L A; 4BKS D; 2QMT A; 3AED B; 3DBL I; 4XYC A; 3O13 A; 2RSU A; 1J7C A; 3SFE B; 3EFC A; 4L23 A; 5DPR A; 2KJH B; 1WXV A; 4MT5 A; 1RYJ A; 1L2N A; 2PVG C; 2C60 A; 2VH2 A; 1WM3 A; 3RUI B; 1JAL A; 4YSY B; 2VRR B; 3RT3 B; 3P63 A; 1HXY D; 2M0A A; 1E7U A; 2JWU A; 2N1V A; 2KWV B; 4C56 C; 5EE3 A; 3W2D A; 1HZ5 A; 3IT4 B; 2J0K A; 3M63 B; 3RNB C; 4HXD A; 4WIP A; 2WXQ A; 2KK8 A; 1WXS A; 2KTR B; 2W9N A; 2LHD A; 1EM7 A; 3PRM B; 3WIM A; 4PK1 A; 3R7R A; 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4ZHP A; 1YN5 A; 1LXD A; 3SFD B; 2FID A; 4A90 A; 4II2 B; 3HM6 X; 5E6O A; 2JYE A; 1WGK A; 2AQ2 B; 4C80 A; 3BZD B; 3N1X C; 3QC8 B; 3SR6 A; 2MH7 A; 4LK0 M; 3N1Z C; 2UYZ B; 4FJZ A; 5DCN A; 2ZPY A; 1ET9 A; 1AW7 A; 4C4V A; 2NVU I; 1YN3 A; 1WJ6 A; 3V05 A; 3ZUN A; 3Q8F A; 1GB1 A; 2IJ0 A; 2PPH A; 1G6J A; 3KWL A; 2BB6 A; 2L7R A; 1E5W A; 4G11 A; 3UF8 A; 1CZP A; 1L6V A; 4M02 A; 1YD8 U; 2O6V B; 1MHX A; 1K8R B; 4DK5 A; 3RNC C; 1HTO A; 3AUL A; 3L4P A; 4YTP B; 2Y5B B; 3N32 A; 3MJ5 A; 1MVK A; 2DYO A; 1YX5 B; 4US8 A; 2KC2 A; 4B9K A; 1L7Y A; 4K7W A; 4BKG A; 4I6P A; 4K7U A; 5L95 C; 4HJG E; 2ZW1 A; 5EE9 A; 3Q2A C; 1D5M C; 2O2V A; 2PLP A; 1PDX A; 3AE2 B; 3ZGZ A; 3ETR A; 4LNO A; 2N7E A; 1TTN A; 2X8X X; 2K8B A; 4A9A A; 2N9E B; 2LUE A; 1E90 A; 4ZRI A; 1KM7 A; 3RNG C; 2QJL A; 4CYE A; 1ZDV A; 4LDT B; 2LWP A; 2H89 B; 3X23 A; 2J0M A; 3K9P B; 1UBI A; 2K8H A; 1PGX A; 1WX7 A; 4RGO S; 1ZE3 D; 3NHE B; 4L2Y A; 3N20 C; 4JWU C; 2AL6 A; 1ZDX A; 2JF5 A; 3DBH B; 2KDE B; 1WF9 A; 3VVW B; 2G3Q B; 2W82 A; 2KMM A; 3B2G A; 1J0G A; 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