The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
63
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structure length |
63
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Chain Sequence |
MVWLNGEPRPLEGKTLKEVLEEMGVELKGVAVLLNEEAFLGLEVPDRPLRDGDVVEVVALMQG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| molecule keywords |
unknown function protein
|
| publication title |
Crystal structure of TT1568 from Thermus thermophilus HB8
rcsb |
| source organism |
Thermus thermophilus
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| total genus |
13
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02597 | ThiS | ThiS family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FXI A; 2G1E A; 1NI3 A; 2WLB A; 3AN1 A; 2W55 A; 3NS1 A; 3VR9 B; 4C7Z A; 3AEA B; 2MJ3 A; 3B2F A; 4LTU A; 4US9 A; 1CZP A; 1QOA A; 1DOY A; 5GXG B; 1TKG A; 5EE3 A; 3NVY A; 3ETR A; 1KF6 B; 2WS3 B; 1B9R A; 1RWS A; 1KFY B; 1L6U A; 4P6V F; 5H8Y E; 3NRZ A; 2PIA A; 1WGK A; 5EE1 A; 3WCQ A; 2KAJ A; 1J7A A; 1QF6 A; 1XLO A; 1UWM A; 1T3Q A; 3DWG C; 4JWU C; 4N58 A; 1FFV A; 1VJK A; 1WWT A; 1FO4 A; 2BS3 B; 1AYF A; 1SF0 A; 3P4R B; 3AMZ A; 1AWD A; 4ZHO A; 1PDX A; 2MJD A; 3AE4 B; 3HRD D; 2L52 A; 1TKE A; 3L4P A; 1SIJ A; 1TYG B; 4HRS A; 2EKI A; 4WWM A; 4ITK A; 2Q5W D; 2AX5 A; 2LEK A; 1NYR A; 3PO0 A; 2W54 A; 1VDV A; 3AV8 A; 1WRI A; 1YQ4 B; 3FC4 A; 1YJJ A; 1QOB A; 3P1M A; 4YTP B; 1XLQ A; 1FM0 D; 1YQ3 B; 1J7C A; 1L5P A; 2M56 B; 2MH7 A; 3NVZ A; 2H88 B; 1JAL A; 1R7S A; 1L0V B; 1ZUD 2; 1FIQ A; 2PVG C; 3W5V B; 2WDV B; 1ZP0 B; 3P63 A; 3ABV B; 1JQ4 A; 3W9C B; 3AB5 A; 1QLB B; 1JWA D; 4N59 A; 2CJN A; 2QJL A; 4YSX B; 1DOI A; 4C7Y A; 4ZHP A; 1ROE A; 5MPO A; 3P4P B; 1PUT A; 5G5H A; 5H92 C; 1A70 A; 1NYQ A; 3AEE B; 4IDI A; 1QOG A; 4USA A; 2B76 B; 3AEF B; 1CJE A; 3KWL A; 4YTM B; 1QOF A; 1V97 A; 1IUE A; 2OHF A; 2MJE A; 3FAH A; 3LB8 C; 1FRD A; 1XLP A; 1PFD A; 1WXQ A; 2FBW B; 2K22 A; 3AE6 B; 3DWM A; 4KX6 B; 4YTN B; 1NVI D; 3VRA B; 1JRP A; 5EE0 A; 1NEK B; 1E7P B; 2DWQ A; 3AE5 B; 1E6E B; 1L6V A; 3EUB 2; 1RM6 C; 2CJO A; 3AED B; 2WU5 B; 2WDR B; 1XO3 A; 3VR8 B; 1WYG A; 1N63 A; 1TJE A; 3NVV A; 1ZOY B; 2JX5 A; 3LXF A; 4YSZ B; 1DOX A; 3AEC B; 1OQR A; 2M19 A; 4WQM A; 1N60 A; 1RFK A; 3B2G A; 1FFU A; 2HTM E; 2E3T A; 1N5W A; 2W3S A; 1EWY C; 2Y5C A; 3B9J A; 1KRH A; 1ZXI A; 2WP9 B; 2W3R A; 3BII D; 1VLB A; 3AEG B; 2BS4 B; 1I7H A; 4JX1 C; 1JW9 D; 5C2T B; 4YXD B; 1F0Z A; 5AUI A; 1YJI A; 4FXC A; 3AE8 B; 3HUI A; 1JRO A; 2QIE B; 1NEN B; 1N62 A; 1JWB D; 1XLN A; 2L83 A; 2PVO D; 3AE7 B; 3VRB B; 1GPX A; 2K5P A; 1J7B A; 2ACZ B; 1OQQ A; 1GAQ B; 3AEB B; 1QT9 A; 1OFF A; 2BS2 B; 1E10 A; 1FXA A; 4C80 A; 5EE9 A; 1FRR A; 1SB3 C; 3AH7 A; 3AE1 B; 3P4Q B; 2JQR B; 4HRO A; 3AE3 B; 1RYJ A; 2WQY B; 2N0S B; 3AE9 B; 4JWS C; 4YSY B; 2WDQ B; 3P4S B; 2WU2 B; 3HVZ A; 4A9A A; 1E9M A; 1V8C A; 3AE2 B; 3SFE B; 1E0Z A; 2CU3 A; 3RPF C; 3ZYY X; 1N5X A; 2BT6 A; 1DGJ A; 3SR6 A; 5G5G A; 1N61 A; 3AM9 A; 1TKY A; 3W5U B; 2K9X A; 4ZOH C; 4YT0 B; 2H89 B; 1FMA D; 2PKO A; 3NVW A; 5AUK A; 3CWI A; 5C3J B; 4N6E B; 2KMM A; 2DBY A; 3SFD B; 4US8 A; 3CIR B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2G1E A; 2JYT A; 2LUE A; 3B2F A; 3ENE A; 1WM3 A; 3PV1 A; 1TS4 A; 2ZEQ A; 2BTE A; 4FA6 A; 2INP E; 1FNW A; 3Q8A A; 2JZP A; 2CKH B; 3PPA A; 4JWU C; 2N9P C; 1WWT A; 4AP4 C; 1WX7 A; 4IG7 B; 4CQN A; 4KIK B; 3W2D A; 1KLV A; 4EFO A; 1P1A A; 2ZZP B; 4HRS A; 4ITK A; 2KAC A; 1VDV A; 2ZCB A; 1YQ4 B; 1SE4 A; 2AL6 A; 2MH7 A; 4HKZ E; 3HVD A; 3WAM A; 1ENF A; 1WXS A; 1ACC A; 3LDZ E; 2R61 A; 3RUL A; 1IBX B; 1AW7 A; 3ALB A; 4EZL A; 1A70 A; 5BYQ A; 2ICI A; 3N3K B; 1ZDX A; 2MBQ A; 1V80 A; 2OHF A; 1WXQ A; 3AE6 B; 2KTF A; 1A5R A; 3DDC B; 1SBB B; 3PRM B; 4MGK E; 4MGZ E; 3SHQ A; 2LAS A; 1E8W A; 3AU4 A; 1JWM D; 4PS3 A; 2KLC A; 1EWY C; 3DBH B; 3TEX A; 3DBL B; 3AEG B; 3RFZ B; 1FEH A; 3AE7 B; 2PE6 B; 1AN8 A; 3H7P A; 2WXI A; 5CHV C; 1FXA A; 4C80 A; 4RF1 A; 3W1S A; 3JVZ X; 3ECI A; 2PW9 A; 1RYJ A; 4MGI E; 1WZ0 A; 1H8C A; 2FAZ A; 1HTQ A; 3ZNI D; 4K1R B; 2MBO A; 1V1O A; 2N7J A; 1TTN A; 3QK0 A; 2RDH A; 1FMA D; 2G9H D; 4MT5 A; 1I4G A; 3IHP C; 3NS1 A; 4B0E A; 1CZP A; 4ANX A; 2KJR A; 3UIN B; 2A4Z A; 2DEN B; 1BXT A; 2KZR A; 4EEW A; 1HZ6 A; 4RM9 A; 4AWJ A; 1STE A; 3APD A; 5D7G A; 1AYF A; 1F2R I; 4NQL B; 3P2B A; 4FJV B; 1QZE A; 5FK9 C; 4S17 A; 1SE3 A; 1MG4 A; 4YTP B; 2MCN B; 1L5P A; 2L1A A; 1WJU A; 1UWX A; 3HK0 A; 1KH0 A; 1S1Q B; 2PTL A; 3VAW A; 1LFD A; 3KYD D; 2BW2 A; 5BYS A; 3WA0 A; 1SEB D; 4FUL A; 5T8I A; 1WGH A; 1YQB A; 4W9D A; 1V5O A; 1F52 A; 2WXP A; 4KVG B; 2B3A A; 1KRH A; 3A4R A; 1T6B X; 4WIP A; 4JX1 C; 3QAR A; 2FE8 A; 2QEJ C; 4A3P A; 2BYF A; 4WQO B; 1JRO A; 1VCB A; 1JRU A; 4PYU A; 4RGT A; 2LXA A; 3NJT A; 1MG8 A; 1WRD B; 3AE3 B; 2WQY B; 3ZNH B; 3PGE A; 2K39 A; 3R3M A; 3PLV A; 3SFE B; 4XDD A; 4K7S A; 1TKY A; 3Q3J A; 2H89 B; 2KWU B; 2NPT B; 1XCT L; 3UIP B; 2DNF A; 4HPM B; 2KMC A; 2DBY A; 4RF0 A; 2RMM A; 2ZVN A; 3UQB A; 1D6E C; 3MC8 A; 4OW0 A; 2WXG A; 1WX8 A; 3VXW A; 3A4S C; 1DYQ A; 1P7F A; 2GBM A; 2J7Q B; 3ZRF A; 4W9E A; 2LVQ A; 1FD6 A; 5E6P A; 1VZ8 A; 2WGS A; 5JZE B; 4MM3 B; 2EKI A; 2AX5 A; 3P42 A; 2KHW B; 2GBJ A; 3BIN A; 2BQQ A; 4FN2 A; 2Z0E B; 1R4N I; 4OVV A; 2BPS A; 3T8M A; 1JWA D; 2DZI A; 4NNJ B; 3M62 B; 2KLG A; 4JE3 B; 1QOF A; 1IYF A; 3AU5 A; 2IO3 B; 2BYE A; 2BVC A; 2M4N A; 3NOB A; 2O2V A; 3NVV A; 4B0M A; 3AEC B; 1I4H A; 2VZK B; 5AZG A; 2HTM E; 3N1Y C; 4LNF A; 4ASW C; 2MP2 A; 1TGZ B; 3R7Q A; 2LGY A; 1F0Z A; 2ON8 A; 1SJH D; 4RM8 A; 3TSS A; 1ET6 A; 1MFW A; 2K5P A; 4TV3 A; 5IP4 D; 4XE0 A; 1FRR A; 1SB3 C; 4XC2 A; 5CHF A; 3RUI B; 3VDZ A; 3Q8F A; 2KNB A; 3P4S B; 4JL9 A; 1WGY A; 4PK1 A; 1DGJ A; 2FCS A; 2KTR A; 4CO7 A; 3ONS A; 3PRP B; 2D3B A; 2JT4 B; 2KMM A; 3SFD B; 4WJP A; 2W55 A; 4WWN A; 4A3O A; 2MJ3 A; 3DCG A; 2O6V A; 4HWI B; 4A20 A; 3CST A; 5JH5 C; 5CTR C; 4FJZ A; 4C4V A; 3R2I A; 3TL5 A; 1EU3 A; 1CMX B; 4HPL B; 5L95 C; 1FNV A; 4LNO A; 2WX0 A; 1FFV A; 1FNU A; 2LGS A; 1FO4 A; 2BS3 B; 3IFW B; 2KJ6 A; 3A9K B; 4ZHO A; 3WAL A; 3AE4 B; 1I35 A; 3TJP A; 1AAR A; 1TYG B; 2J53 A; 4WWM A; 2Q5W D; 3HIZ A; 2W54 A; 1OEY J; 3BYY B; 2GI9 A; 5GMV A; 2EMT A; 4AUQ C; 2K6D B; 5KHQ A; 3ZRC A; 3RI7 C; 2KYW A; 2V9H A; 3U52 E; 2QJL A; 3U2S C; 3ZXV A; 4K81 A; 1YJ1 A; 1XEE A; 1IPG A; 2GLS A; 3IT4 B; 1FRD A; 4PS7 A; 1IBX A; 1RM6 C; 2BWF A; 2M8S A; 2JX5 A; 2RSU A; 3OWE B; 2IPK D; 2MRP A; 3QQ8 B; 3A1Q B; 2ZW1 A; 2Y5C A; 2I1J A; 1HQR D; 1ZXI A; 2D2Q A; 4NZL B; 2L0F A; 2HJ8 A; 3I3T B; 1I4X A; 3I9V 1; 2K8B A; 1WXV A; 3SD5 A; 4F1S A; 3QCA A; 5DPT A; 3VUY A; 4XX5 A; 3VTU A; 3R8B A; 3RNF C; 3TEZ A; 3HVZ A; 1K50 A; 1P3Q U; 3PZD A; 1GUA B; 2PMV A; 1VRA B; 2XNA C; 2JRI B; 3ZTC A; 1LGR A; 4DDG D; 4GDK A; 1VZ7 A; 2EKE C; 4RNA A; 3VQI A; 2IY0 B; 4ZYN A; 2DAF A; 5GXG B; 3NRZ A; 2L3Z A; 4LCD E; 3DQV A; 4L2Y A; 3VUX A; 1T3Q A; 1L2N A; 2KX0 A; 1XXG A; 5DPR A; 2JU6 X; 3QWZ B; 4HJK A; 2J0K A; 2CHW A; 4B6W A; 2Y5P A; 4MEM A; 4AJW A; 1MHX A; 4MH0 E; 1YQ3 B; 2DAJ A; 2HDE A; 1R7S A; 2Z59 B; 3PHW B; 1JML A; 3V61 A; 3PRE A; 1ROE A; 2GRI A; 2LVP A; 3URY A; 2AEH A; 3QX1 A; 4USA A; 3KQ4 A; 1EO6 A; 3BK1 A; 3BVM A; 3FAH A; 3N1X C; 4G50 A; 1GNU A; 1E6E B; 3V3X A; 4DQO C; 3V6E B; 2XBB C; 4I6P A; 5AZH A; 1I42 A; 4MH8 A; 4XWW A; 5LXH A; 2MSE D; 1V2Y A; 1YMH E; 2LHE A; 1ISN A; 1FCL A; 4JLC A; 3H8H A; 1M94 A; 3IT6 B; 1SSN A; 3BK2 A; 3X0W A; 4LNI A; 1GB1 A; 3JSV A; 1OFF A; 2KFK B; 5CHW A; 2M1M A; 2JQR B; 1HXY D; 3RNB C; 3AE9 B; 3MFG A; 1OTR B; 3QA8 A; 2C9W B; 4HCN B; 1E0Z A; 2GMI C; 2IJ0 A; 2G4S A; 3KUZ A; 3MC9 A; 1KJT A; 3CIR B; 1NI3 A; 2FCM A; 2FNJ B; 2IGH A; 1QOA A; 5CX3 A; 2JYE A; 4KGS A; 1GOZ A; 3M95 A; 2WS3 B; 1L6U A; 2MBH A; 2NPT A; 2D10 A; 2FCN A; 3PSE B; 3DWG C; 3A9J B; 2WX1 A; 3P4R B; 2UYZ B; 1TIF A; 1AWD A; 2JUO A; 4K7U A; 1OEY A; 2V4I B; 2LUM A; 5IA7 A; 2UWQ A; 2NBV B; 1C76 A; 1Q10 A; 3CSF A; 1FM0 D; 2V0G A; 2L05 A; 4JPS A; 4AS1 A; 2KXJ A; 3NUH B; 2WXK A; 4MM3 A; 2CJN A; 4EZK A; 2N4F A; 3M3J A; 4F8C B; 2J42 A; 2KO3 A; 3UGB B; 2K8H A; 3LB8 C; 2JPH A; 1LXD A; 2CR5 A; 4RCO A; 2W82 A; 4IWO A; 2C7N B; 2V4L A; 3DBR I; 1K52 A; 4ICU A; 3LXF A; 4IM0 A; 1DOX A; 2IND C; 1WF9 A; 1N60 A; 3PZ7 A; 3EC8 A; 1VD2 A; 2BS4 B; 3X23 A; 3DVG Y; 1NI2 A; 1JW9 D; 1YOV B; 4ZRJ A; 4II3 B; 3AE8 B; 1GC6 A; 2QIE B; 2L83 A; 4DXG A; 4DK5 A; 4NAW B; 3LYY A; 3L10 B; 3ZQ4 A; 1WJN A; 1OGW A; 2HE7 A; 5DCN A; 5EE9 A; 1EF1 A; 2LXC A; 4YSY B; 3PTF C; 4YWG G; 4BKS A; 4FJY A; 1WR1 A; 1V8C A; 2ZVO A; 2CU3 A; 3NHE B; 3RZW C; 4GDL A; 3ZVV A; 2DZM A; 4W9H A; 4ANW A; 3AN1 A; 3TIX A; 2IBI B; 1C4P A; 4JGH B; 4TMA B; 1K53 A; 1DOY A; 4TQ1 A; 1D3Z A; 2DLB A; 2QCZ A; 3MJ5 A; 1TZO A; 1GB4 A; 4BBN F; 1YX6 B; 1WGK A; 3FIL B; 3NS8 A; 3ZNZ B; 1VR9 A; 1V86 A; 4IM2 A; 4GOC A; 2J4X A; 2D3G A; 1XCQ L; 1V6E A; 2WXH A; 3ZDT A; 5IKC M; 4A6Q A; 1GC7 A; 3R2T A; 3Q3O C; 1E8Z A; 1H4R A; 2K25 A; 1HZ5 A; 1J7C A; 3RNG C; 1WJ6 A; 4E74 A; 2C60 A; 1ZUD 2; 4BFR A; 4EKU A; 1ZW7 A; 3ABV B; 2I38 A; 3DBH I; 3DBL I; 2PEA A; 2VH1 A; 4AOF A; 4DHJ D; 1V97 A; 4ZRQ A; 2G4D B; 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4EE2 A; 4MJS A; 4W9K A; 1PQS A; 2L32 A; 2W3R A; 2V3P A; 2WYQ A; 2DYO A; 4W9C A; 4FLH A; 1KLU D; 4KSL C; 5FR3 A; 4K7W A; 3VRB B; 2IO2 B; 1IP9 A; 1ZDV A; 4AJY B; 2GBR A; 2EMS A; 2KMA A; 2MHJ A; 2V3S A; 2MEK A; 4LDT D; 1ZPS A; 1E9M A; 2DHZ A; 2KJH B; 2E6X A; 3J9C A; 2WNM A; 1NDD A; 3BVG A; 2BKF A; 2IO0 B; 2KFK A; 2N1W A; 1LM8 B; 3CWI A; 1WFY A; 3Q3N C; 5D2M B; 5G2N A; 2MX2 A; 2N9K A; 3PHX B; 1XD3 B; 3AEA B; 1BUI C; 4LTU A; 1OQY A; 3JYU A; 3VTV A; 3V05 A; 3NVY A; 1KF6 B; 1B9R A; 2OJW A; 4M0W B; 4B9K A; 5H8Y E; 3WCQ A; 4K3B A; 2KAJ A; 3ML9 A; 1XLO A; 3DVN U; 2AL3 A; 5JHB A; 4YL8 A; 2KDI A; 2OJR A; 2L52 A; 3L4P A; 3Q8C A; 4HDQ A; 2LZ6 A; 2AWT A; 2NBU A; 3QJZ A; 3BYT B; 1YNT E; 2GOW A; 3FC4 A; 1YJJ A; 3NZ3 A; 1WY8 A; 4IM3 A; 4OZB A; 3H7P B; 3TUO A; 4WWO A; 2L00 B; 1JWS D; 4MGY E; 4ZHP A; 4HXD A; 3NG0 A; 3AXC A; 1CJE A; 4NJC A; 1ZGU B; 2MJE A; 2K22 A; 3ZJT A; 4YTN B; 1NVI D; 3MJW A; 4GU2 A; 4PT5 A; 3APF A; 3AE5 B; 1L6V A; 3AED B; 1WGG A; 1KLG D; 2LGI A; 5D3D A; 1Q1O A; 3TBL D; 4YSZ B; 3NZU A; 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