The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
EVTIKVNLIFADGKIQTAEFKGTFEEATAEAYRYADLLAKVNGEYTADLEDGGNHMNIKFA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Antibody
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| molecule keywords |
KAPPA LIGHT CHAIN OF IG
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| publication title |
Complex between Peptostreptococcus Magnus Protein L and a Human Antibody Reveals Structural Convergence in the Interaction Modes of Fab Binding Modes
pubmed doi rcsb |
| total genus |
15
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-11-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LHD A; 1F2R I; 5HFY A; 1KH0 A; 4OZB A; 1IGC A; 1K51 A; 2KN4 A; 2JU6 X; 4D2K A; 2PTL A; 1C9F A; 1MHH E; 2JSV X; 4KGT A; 1FD6 A; 2ONQ A; 1F2R C; 2N7J A; 2J53 A; 2LHE A; 2LGI A; 2K0P A; 1PGA A; 2J52 A; 2JXT A; 2I38 A; 4OZA A; 4IOI E; 1XF5 L; 1PGB A; 1D4B A; 4OZC A; 1Q10 A; 1K53 A; 4KGR A; 1XCQ L; 2QSD A; 2ON8 A; 1IGD A; 1YNT E; 2PLP A; 5HG2 A; 4GLS C; 2GI9 A; 2ZW1 A; 1PGX A; 3MP9 A; 4IKG A; 1HZ6 A; 2IGH A; 4HKZ E; 1IBX A; 2JZP A; 2GB1 A; 5JXV A; 4WH4 A; 1K50 A; 2ZW0 A; 1MPE A; 2QMT A; 1IBX B; 1HZ5 A; 1XCT L; 2I2Y A; 2IGG A; 4MAC A; 5BMG A; 1GB1 A; 1GB4 A; 1HEZ E; 1P7F A; 4KGS A; 5BMI A; 2RMM A; 1QKZ A; 2N9L A; 2KQ4 X; 1P7E A; 1MI0 A; 1ZXH A; 1K52 A; 2KWD A; 2PW9 A; 1FCL A; 2LUM A; 3V3X A; 4HJG E; 1UWX A; 2KDM A; 1JML A; 1FCC C; 2KAC A; 5BMH A; 5HHD G; 2EEL A; 1YMH E; 5HI1 A; 3UI3 A; 2JWU A; 2N9K A; 2NMQ A; 3FIL A; 1MHX A; 2OED A; 2IGD A; 3GB1 A; 1EM7 A; 2RPV A; 3FIL B; 1MVK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LHD A; 3NJT A; 2ZPN A; 4C80 A; 2DYB A; 3AXC A; 3DWG C; 4GDL A; 1E8X A; 4D2K A; 1MHH E; 3RNA C; 3DBR I; 1KRH A; 2CHX A; 3MC0 B; 1NI3 A; 4NQK E; 4JLC A; 2FUH B; 1WX7 A; 4URK A; 2WXM A; 1STE A; 2N4F A; 3NVY A; 2MJ3 A; 1WE7 A; 1FXT B; 3R7R A; 5H92 C; 4NAM A; 4XYC A; 1TY2 A; 1WXM A; 3PZ7 A; 5AZF A; 5FK9 C; 1GPX A; 1V9J A; 2KXJ A; 4JPS A; 4US8 A; 3ZNZ B; 4YSZ B; 1WGY A; 3Q8F A; 1DOX A; 4E3C A; 1MJD A; 3NVV A; 2W9N A; 1YD8 U; 1I4G A; 1VLB A; 1NI2 A; 5D2M B; 2L3Z A; 1YQ3 B; 3RMK C; 5IOI A; 3WAO A; 4BBN C; 1HZ5 A; 2LVO A; 2IGG A; 4E71 A; 1GB1 A; 3B9J A; 2KMM A; 3AEC B; 1UUP A; 2J0K A; 5DCN A; 3VUX A; 3IXS A; 2O6V B; 1PDX A; 2MRP A; 5D6J B; 3I3T B; 4ASW C; 2ZNV C; 1I4R A; 3AE2 B; 2WNM A; 4X57 B; 2KDM A; 4GSW A; 3PLV A; 3JYU A; 4FLH A; 3ZNH B; 3U8Z A; 4A20 A; 2OHF A; 2W3S A; 1E7U A; 3KWL A; 5AZH A; 3QA8 A; 1DYQ A; 1RYJ A; 5C23 A; 3UF8 A; 4FJZ A; 4WWN A; 1F2R I; 3TEW A; 1E7P B; 3JSV A; 3QHT A; 1CJE A; 4YXD B; 1WZ0 A; 1C9F A; 3FC4 A; 4C4V B; 4ZRK A; 2E6X A; 2O2V B; 2Y5P A; 3A4R A; 1VZ6 A; 4JWU C; 2WX1 A; 3KWV A; 4MJS A; 4MEM A; 5LNK 1; 2AEH A; 2BWF A; 2I38 A; 2DWQ A; 1QOF A; 3P4P B; 3RNG C; 3QAQ A; 2DZJ A; 5FR6 A; 1AYF A; 5CHV C; 2KO3 A; 3C0R B; 3T3O A; 4OZC A; 4DK5 A; 4PS7 A; 3JVZ X; 2LRW A; 1YN4 A; 2CHZ A; 2MX2 A; 1KM7 A; 4EE2 A; 4HPL B; 2IO0 B; 1BUI C; 3PRE A; 1VZ8 A; 1R4N B; 3SR6 A; 4RGM A; 2V3P A; 1I4X A; 2M8S A; 3AED B; 3IT4 B; 2UU7 A; 1NEK B; 1XEE A; 2KJH B; 1DGJ A; 4C7Y A; 2KTR B; 2MH7 A; 1EWC A; 3FKY A; 1MG4 A; 3WAM A; 1L6U A; 2QMT A; 4JL9 A; 4US9 A; 4G50 A; 2QCZ A; 3M63 B; 1Y8R C; 2WXQ A; 1P3Q U; 2BKF A; 5FKA C; 4MAC A; 1XLP A; 2LVQ A; 1XD3 B; 3IT6 B; 2DYO A; 1IPG A; 4KX6 B; 5LLI A; 4RM9 A; 1LGR A; 2KC1 A; 1E10 A; 1C78 A; 1ZE3 D; 2AL3 A; 2KK8 A; 3NZ3 A; 3KYD D; 1ET9 A; 2IND C; 2DZK A; 3QQ8 B; 4L2Y A; 3DCG A; 1VCB A; 2IDY A; 3PPA A; 5EE0 A; 2RR9 A; 2LGS A; 1T0Y A; 3UI3 A; 2NMQ A; 2LJ5 A; 4FBJ B; 4W9J A; 4MDK E; 3SD5 A; 1YQ4 B; 3VUY A; 3QIJ A; 2IY0 B; 1RFK A; 1NBF C; 1MVK A; 4PYZ A; 4H2A A; 2ZCB A; 3T8M A; 2JU6 X; 2K6Q A; 3E9S A; 3MJW A; 4S17 A; 4IC7 B; 4IM2 A; 4KGT A; 2Z8L A; 3HVZ A; 4RH6 A; 1WX9 A; 2JWZ A; 2Z0E B; 3PO0 A; 3CIR B; 4JIO U; 3RUL A; 3ZIM A; 2M1M A; 4W9H A; 2GOW A; 1L5P A; 4NNJ B; 1JAL A; 4ICU A; 2KN5 A; 1UBQ A; 1VRA B; 4OHJ A; 1WI0 A; 3DBS A; 4RF0 A; 3W1Y A; 1GOZ A; 3H9D A; 1XCQ L; 5IP4 D; 3FAH A; 4M01 A; 4IKG A; 1U4A A; 4AP4 C; 1J7B A; 1V86 A; 2KAN A; 3APF A; 3PLU A; 1D5Z C; 3IHP C; 2KZR A; 1SIF A; 4RMA A; 2KHW B; 1SSN A; 3AM9 A; 4HK2 A; 1SB3 C; 1UF0 A; 3LXF A; 4M0W A; 4ANV A; 1XQQ A; 2NTS A; 5EE1 A; 4RCO A; 4KIK A; 2MLB A; 1OQQ A; 2WXF A; 1BXT A; 4C00 A; 1DOY A; 2K8H A; 3ZQ4 A; 2WDQ B; 5TSS A; 4ZRQ A; 1E7V A; 2KVR A; 1H4R A; 1JQ4 A; 1ZDX A; 2IYD B; 3IAS 1; 2R2Q A; 4HJG E; 3NS1 A; 2DZI A; 4AJY B; 1L2N A; 3WAP A; 2H89 B; 3D32 A; 1YMH E; 2RDH A; 4WQM A; 4MSQ B; 3Q3F A; 4HCN B; 5BYR A; 1N60 A; 3X0W A; 2D3G A; 3QK0 A; 2HJ1 A; 4A90 A; 4DXA B; 2BF8 B; 4KDI C; 4K1R B; 1JWU D; 2GBM A; 1J7C A; 1JRP A; 3KLS X; 3P4R B; 3P1M A; 2VH2 A; 4KVG B; 3Q8A A; 1JW9 D; 1IP9 A; 2VH1 A; 3VRA B; 2L52 A; 2V4I B; 2J53 A; 2MEK A; 2IZV B; 1L7Y A; 4DHJ B; 1PGA A; 1K8R B; 2OJR A; 5MPO A; 4M00 A; 2MQJ A; 1Q1O A; 4K7U A; 4RM8 A; 1VJK A; 2L8J A; 1WWT A; 4KGR A; 2QSD A; 3MJ5 A; 1EF5 A; 2INP E; 1IGD A; 1ZUD 2; 1YN5 A; 2WS3 B; 4YWG G; 1PGX A; 3Q2A C; 3HVD A; 4FXC A; 2UWQ A; 4CQN A; 2OOB B; 4HKZ E; 3R7Q A; 1L0Y B; 4II3 B; 2GB1 A; 5DPT A; 4W9L A; 4HVB A; 2L05 A; 4JE3 B; 1FNV A; 1OEY J; 2D11 A; 3I9V 1; 3DQV A; 4F8C B; 3LYY A; 1TBE A; 2HDE A; 2AQ3 B; 2K8C A; 1ET6 A; 1T6B X; 1HEZ E; 4KSK C; 1UGM A; 2L76 A; 4TQ0 A; 4YSY B; 1P0R A; 2N7D A; 3RNF C; 3NUH B; 1XLQ A; 2N0S B; 2C9W B; 4XX5 A; 2WP9 B; 5EDS A; 1QOA A; 3V3X A; 4BVU C; 2CKH B; 1YJJ A; 3URY A; 5J2R A; 4CO7 A; 3H6N A; 2XK5 B; 2MCN B; 2INC C; 4W9I A; 5DPW A; 1SIJ A; 4TMA B; 1CZP A; 3ML8 A; 3O65 B; 2IO2 B; 4FHJ A; 2WXR A; 2RDG A; 1F1H A; 4GDK B; 2UYZ B; 1ZKH A; 2OJW A; 5E6O A; 4BKS D; 2LGY A; 2PTL A; 2SAK A; 1WZ3 A; 4XWW A; 4HPP A; 1SE9 A; 1C76 A; 3BYY B; 2TSS A; 5L95 C; 1RM6 C; 1I7H A; 2LGI A; 2K0P A; 4TQ1 A; 1KOT A; 1QOG A; 2MBH A; 2GBK A; 4MM3 B; 2K5P A; 3AU4 A; 3DHH C; 1FMA D; 4BKS A; 3ONS A; 4QAY A; 3GZN I; 3WA0 A; 3U30 A; 1K53 A; 5D3I B; 1QT9 A; 3ZJT A; 4GMV A; 3KUC B; 3QCA A; 3H1U A; 2BYV E; 3IAM 1; 2I1K A; 4WAA A; 3ZTD A; 4GOC A; 3TMP B; 5LXH A; 5AUK A; 1RFA A; 3AE4 B; 3HRD D; 1Z5S B; 3ENE A; 1SEB D; 3RT3 B; 4IWQ A; 3MC8 A; 1ROE A; 2ZZP B; 1QIL A; 1OFF A; 4ZDV A; 3U52 E; 3UIO B; 2JZ3 B; 3N3K B; 3Q8C A; 4NJC A; 3BVZ A; 3ALB A; 3QX1 A; 3W1S A; 1YN3 A; 3PHX B; 2QHO A; 3LJ3 A; 1V1P A; 1S3S G; 3P4S B; 1WIA A; 2AYO B; 4HJK A; 4BKG A; 2JWU A; 1P98 A; 1X1M A; 4RGO S; 4AOF A; 3ZXV A; 3Q6B A; 2WDV B; 4IG7 B; 3B2F A; 4C7Z A; 2LJI A; 4AQ7 A; 1HXY D; 2NPT A; 2NR2 A; 2JRI B; 1J7A A; 1SXT A; 4WQO B; 2VRR B; 4XE0 A; 1G6J A; 1D5M C; 2J52 A; 2JXT A; 2KFK A; 3W5V B; 1C4A A; 4NAW A; 1XF5 L; 4PYU A; 3VTU A; 1SE2 A; 2G9H D; 3BVM A; 1TT5 B; 4G11 A; 1T0S C; 3LDZ E; 4A3O A; 4A3P A; 1T5X D; 2MJD A; 3PRM B; 4A6Q A; 2GI9 A; 3M95 A; 1ISN A; 4WUR A; 3ZVV A; 1N63 A; 3J9C A; 1L4D B; 2D3C A; 3A9K A; 4EOY A; 1L6V A; 4LTU A; 4BAX A; 4HKQ A; 4B95 A; 3ZDT A; 2MP2 A; 1WR1 A; 4KKI A; 4RGT A; 4F7Z A; 3AE6 B; 2LRU A; 1GC6 A; 2KT7 A; 3A1Q B; 2KVZ A; 1P7F A; 2HJ8 A; 4ARI A; 4W9K A; 2V3S A; 2Y5B B; 1TY0 A; 3N1X C; 4L23 A; 1SJE D; 5C1Z A; 1MI0 A; 1K52 A; 1TS3 A; 2LUM A; 4EUT A; 3DBH I; 1TYG B; 3TSS A; 2R61 A; 2G45 B; 3NOB A; 3SHQ A; 2M17 A; 1TKG A; 3VH3 B; 4ZHO A; 3GB1 A; 1T0R C; 1L0V B; 1BML C; 4HRO A; 2Y5C A; 2MBO A; 2XEW A; 1OEY A; 1HA5 A; 3P4Q B; 3X23 A; 1H8C A; 4GB9 A; 1T3Q A; 1V1O A; 2MJE A; 4LNO A; 1SE4 A; 2ONQ A; 3RZF A; 3BVG A; 1UZX B; 3DVG Y; 5G55 A; 1WXS A; 3M3J A; 3NY5 A; 3DOW A; 3MFG A; 4GIV A; 3Q8B A; 3NVW A; 1PGB A; 3KUZ A; 2X38 A; 3EC8 A; 1WRI A; 3HHM A; 2KX0 A; 4HXD A; 4HWI B; 2L0T A; 2MBQ A; 4RF1 A; 1FXI A; 3HM3 A; 2JQR B; 3JW0 X; 3TEY A; 1E6E B; 5IO9 A; 5JXV A; 2ZW0 A; 3PRZ A; 1GUA B; 1E8W A; 4YT0 B; 1WYG A; 3ZNI D; 3DPD A; 3AE8 B; 1WH3 A; 5GMV A; 3ZYY X; 1RAX A; 4WWP A; 4N59 A; 4II2 B; 4JQW C; 1UGJ A; 3A9J B; 1EUV B; 3ECI A; 5BMI A; 2VZK D; 2XBB C; 2WXP A; 2BWE S; 3R2T A; 4IM3 A; 1L4Z B; 5GXG B; 3NZU A; 2DLB A; 2D3A A; 2IPK D; 2K39 A; 3RD2 A; 2C7N B; 1UWX A; 3AEG B; 2B76 B; 3V60 A; 4ANW A; 2K9X A; 1EU3 A; 4G0N B; 1GG3 A; 2EKI A; 3AEE B; 1QOB A; 1AN8 A; 2CU1 A; 3IG3 A; 3RN9 C; 1UWM A; 2HD5 B; 2BKR B; 3ML9 A; 4IUM B; 2JX5 A; 3SU8 X; 4ZRI A; 2BS3 B; 4AWJ A; 4BFR A; 2NBW B; 3R3M A; 3RYT A; 2B3A A; 2M19 A; 2XNA C; 3SEB A; 1NEN B; 2FE8 A; 5CHW A; 5E6J A; 3AE1 B; 5H8Y E; 2JVC A; 2BQQ A; 2C60 A; 2LWP A; 1XT9 B; 3RUI B; 4WAF A; 4OVZ A; 3P2B A; 3U2S C; 2DX5 B; 2KJ6 A; 4HDO A; 1E5W A; 3I57 A; 2AQ2 B; 2FUG 1; 5FR3 A; 1YX6 B; 2QDF A; 4DHZ B; 1V49 A; 1IUE A; 1TIF A; 2KWU B; 4MSM B; 4TKN A; 3KYC D; 4P7I A; 4P1C C; 2ZW1 A; 3KVF B; 3DBL B; 3GE3 C; 2JZP A; 1DOI A; 2HTH A; 1WMH B; 3TBL D; 1I35 A; 2V3N A; 4YL8 A; 3DVN U; 1IBX B; 2Z0D B; 3UIP B; 3P42 A; 3EGR A; 1D5X C; 2K3U A; 2C7H A; 2ZCC A; 1AWD A; 1ZXI A; 2KTF A; 3H7P A; 3K9O B; 3ZUN A; 5BYQ A; 3VQI A; 3GP7 A; 4OW0 A; 3AE7 B; 1AW7 A; 2JZZ A; 3UIN B; 2RDB C; 3O13 A; 2WDT B; 1FFU A; 1F77 A; 2NPT B; 3ZNG C; 2AWT A; 3U7D A; 3VAW A; 4WJQ A; 2OED A; 1TS5 A; 2KDF B; 4DQO C; 2M4N A; 3FIL B; 2WXI A; 2PE6 B; 5HFY A; 4KZ0 A; 4OZB A; 1IGC A; 2KFK B; 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3PGE A; 1XO3 A; 5T8I A; 4MJS B; 4YTM B; 2D10 A; 4MEL A; 2LXA A; 2WXJ A; 4WJP A; 4FN2 A; 4B6W A; 4EZK A; 3HM6 X; 3NS8 A; 2W55 A; 2IO1 B; 4BZA A; 4XWT A; 3BZD B; 1EU4 A; 3RFZ B; 1PYW D; 2KTR A; 2WXG A; 3AB5 A; 3VR8 B; 2CR5 A; 4ZRP A; 2MBB B; 4NQL B; 1SF0 A; 2CHW A; 3EHV A; 2WLB A; 3Q14 C; 4PK1 A; 2GMI C; 1JWB D; 3ZGZ A; 2KX3 A; 2ZJD A; 3BY4 B; 4TV3 A; 3KH0 A; 2DYM A; 2QIL A; 3APC A; 1HE8 A; 4NZL B; 3BYT B; 2IO3 B; 1UNS A; 1WXV A; 5J18 A; 4PT5 A; 4FJV B; 4J6I A; 2DAF A; 2KD0 A; 2J0J A; 4N6E B; 4J3O D; 1FRD A; 5BMH A; 5HHD G; 5JHA A; 1F0Z A; 4EKU A; 3EUB 2; 3OG5 A; 2KQ7 A; 2WU5 B; 3BK2 A; 3Q3M C; 4HPM B; 4OVU A; 2WGS A; 4KZC A; 1ESF A; 2HE7 A; 3OAW A; 1EF1 A; 4WJN A; 1D6E C; 5D3D A; 4GXB A; 2NCN A; 3RNE C; 4XZ4 A; 3VXW A; 1C3T A; 3QAR A; 1A70 A; 5EE9 A; 1XXG A; 4I6L B; 2REX A; 1TS2 A; 3SFE B; 4OVV A; 2G3Q B; 1FM0 D; 1QZE A; 2G4S A; 2KWC A; 4ZYN A; 2ZNV B; 2DHZ A; 1I42 A; 1SGH A; 2WDR B; 4IDI A; 2ON8 A; 4TSS A; 2BPS A; 1LO5 D; 4PS3 A; 1TS4 A; 2FCQ A; 3PS6 A; 1HQR D; 3H7P B; 4TUU A; 1WJN A; 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