The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWCYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
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| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| total genus |
15
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MPE A; 2KQ4 X; 1F2R I; 1Q10 A; 2ZW0 A; 1PGX A; 2IGH A; 1IGC A; 4KGS A; 3MP9 A; 2ON8 A; 1FD6 A; 5BMI A; 2NMQ A; 2KDM A; 1MVK A; 2J53 A; 5HG2 A; 2I2Y A; 5HFY A; 3UI3 A; 1XCQ L; 2KN4 A; 2PW9 A; 1UWX A; 1F2R C; 1FCL A; 1K50 A; 2IGG A; 4OZA A; 2LUM A; 4KGT A; 2ZW1 A; 2RPV A; 5BMG A; 1IBX A; 2EEL A; 2I38 A; 1HZ6 A; 2QMT A; 2RMM A; 1IGD A; 2ONQ A; 4OZB A; 2JWU A; 1P7E A; 1K51 A; 1ZXH A; 4MAC A; 2PLP A; 4IKG A; 1KH0 A; 1JML A; 1D4B A; 2LGI A; 1GB4 A; 1PGA A; 3FIL B; 4D2K A; 1QKZ A; 4KGR A; 1HZ5 A; 4OZC A; 1MHH E; 2PTL A; 2GI9 A; 2LHD A; 1XCT L; 2J52 A; 3FIL A; 5HI1 A; 5JXV A; 1K53 A; 2JSV X; 2GB1 A; 1C9F A; 1P7F A; 2N9K A; 4WH4 A; 2N7J A; 2JU6 X; 2JXT A; 2KAC A; 1GB1 A; 2LHE A; 5BMH A; 3V3X A; 2JZP A; 1MHX A; 1K52 A; 1YMH E; 1IBX B; 4HJG E; 4GLS C; 2N9L A; 1XF5 L; 1YNT E; 1FCC C; 2OED A; 1HEZ E; 2QSD A; 2IGD A; 1EM7 A; 3GB1 A; 2K0P A; 2KWD A; 4HKZ E; 1MI0 A; 5HHD G; 4IOI E; 1PGB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4IM0 A; 5DCN A; 3PRP B; 1MPE A; 3CSF A; 3RNE C; 3BK1 A; 2L1A A; 5GMV A; 2IO2 B; 2BW2 A; 2FCQ A; 3U52 E; 3I63 C; 1WYW B; 2IYD B; 5TR5 A; 2I1J A; 3MP9 A; 2WXO A; 3P63 A; 3DVG Y; 4HRO A; 5HG2 A; 4KDI C; 3W5V B; 1I4Q A; 3BIN A; 1F2R C; 3LDZ E; 1TKY A; 1YX5 B; 3PPA A; 3NRZ A; 1JWS D; 4KGT A; 2ICI A; 2RPV A; 1IGD A; 2KMM A; 1PYW D; 1E8X A; 2RDB C; 1XQQ A; 3TCA A; 1HE8 A; 2KT7 A; 3TEZ A; 5C2T B; 1WGH A; 2LGX A; 3PLV A; 3VUW A; 1IPG A; 4K7U A; 4W9L A; 2YEP B; 1I4H A; 4X57 B; 4ZHO A; 1IP9 A; 1TY0 A; 3Q8F A; 4LNN A; 2Z0E B; 1MHH E; 1SF0 A; 4O1N A; 2JVC A; 4EUT A; 4L23 A; 4LNK A; 1GJZ A; 2BYV E; 3LJ3 A; 1V1O A; 3QHT A; 2KLC A; 2NCN A; 1YOV B; 1K53 A; 4UDU C; 5G2N A; 5T8I A; 4C00 A; 3W1S A; 1L0V B; 4MGK E; 3U8Z A; 2KFK B; 4WJQ A; 2JZ3 B; 2KAC A; 1EUV B; 1FXT B; 5BMH A; 4JIO U; 2ZJD A; 2KX0 A; 5CHF A; 3QX1 A; 1XF5 L; 4JL9 A; 1FCC C; 1E0Z A; 1E8Z A; 1WR6 E; 2KMA A; 4US8 A; 4CQN A; 1ZPS A; 3AXC A; 3NY5 A; 2RR9 A; 2WXI A; 3VTV A; 4XDD A; 3L13 A; 3TL5 A; 4IOI E; 3LYY A; 1EU4 A; 1C4P A; 2M1M A; 4GB9 A; 4ANV A; 3RNG C; 3ZTD A; 1F2R I; 4FJV B; 3MJW A; 1H4R A; 2KWV B; 2AX5 A; 5AUI A; 3TSS A; 3TJP A; 2MWS B; 3NVV A; 2WX1 A; 3C19 A; 4JE3 B; 3ZNI D; 4PYZ A; 2N9X A; 3EUB 2; 4NY0 A; 1P9D U; 1SE4 A; 1D5X C; 5CTR C; 4FA6 A; 4DHJ B; 2IY1 B; 2LVP A; 2GOW A; 2WNM A; 2QMT A; 4J6I A; 3RNA C; 2ONQ A; 3NOB A; 1AN8 A; 1D5Z C; 4WUR A; 3CST A; 4IKG A; 1SEB D; 4GDK A; 1ZE3 D; 3HUI A; 1CJE A; 4A3P A; 4HPM B; 1ZUD 2; 1YQB A; 3N3K B; 3ZVV A; 4RGM A; 4D2K A; 2KQ7 A; 3PVL A; 2KTR B; 1N5X A; 2W3S A; 3P1M A; 1UZX B; 1QT9 A; 2BB5 A; 4IWP A; 1BT0 A; 2VZK D; 3NJT A; 3ALB A; 4EOY A; 4BVU C; 3EA6 A; 2MSE D; 3AU4 A; 4KV2 A; 1V86 A; 2GB1 A; 3AE5 B; 3TEY A; 1LM8 B; 3ZLZ A; 2WYQ A; 4HWI B; 4US9 A; 3MHS D; 2LUE A; 2KFJ A; 1YX6 B; 2KJ6 A; 3R2T A; 1ZDV A; 4NAW B; 1R7S A; 2YLM A; 4ZDV A; 4MGY E; 2KO3 A; 2K39 A; 2REX A; 2KDE B; 1GUA B; 3QC8 B; 4RGT A; 5JHB A; 2PPH A; 4WQO B; 4LNF A; 2KQS A; 2OOB B; 1I35 A; 4AWJ A; 1ESF A; 3ZW3 A; 1WM3 A; 3PZ8 A; 5JH5 C; 1PGX A; 1CMX B; 2IGH A; 4JX1 C; 2KX3 A; 2JXX A; 4ZRK A; 5BYR A; 5HFY A; 1NDD A; 3A4R A; 1YN3 A; 4HK2 A; 4C4V B; 3Q3M C; 1PFD A; 2LWP A; 2G3Q B; 2D5G A; 3AU5 A; 1KTK A; 3V6E B; 1HZ6 A; 1EWY C; 4OZB A; 1ZXH A; 2WXF A; 1VCB A; 2M17 A; 3ZO5 B; 4JLC A; 1TGZ B; 1L2N A; 1OEY J; 4ANU A; 2WXL A; 2L83 A; 4HKQ A; 1WE6 A; 2GBR A; 3AEA B; 2DZI A; 5EE1 A; 3BYT B; 3TEW A; 2WU2 B; 2JX5 A; 1IUE A; 1OQY A; 2IBI B; 2L76 A; 1V8C A; 3PZD A; 2KHW B; 2RPQ A; 4PS3 A; 1HZ5 A; 4HLE A; 3W5U B; 4LNI A; 2BTE A; 1NBF C; 4TQ1 A; 1C78 A; 2RD0 A; 1SSN A; 1UBI A; 2CU3 A; 1RLF A; 2L05 A; 1WXV A; 2N0S B; 3L0W B; 2MJD A; 4RGO S; 1EF1 A; 1V97 A; 3KH0 A; 1AW7 A; 2PMV A; 2N9E B; 4F7Z A; 4USA A; 4HJK A; 2LFI A; 3ZKJ C; 4EZL A; 1MHX A; 2MCN B; 4K81 A; 2MBE A; 4PK1 A; 1TKE A; 3AUL A; 1OQR A; 4K3C A; 2XK5 B; 4HKZ E; 4ZHP A; 2IJ0 A; 1KLV A; 4ICV A; 1E7U A; 2X8X X; 1VR9 A; 2CJO A; 2ZPY A; 1Y56 A; 2J0J A; 3OJ3 A; 4GDL B; 4II2 B; 1VZ8 A; 3AEE B; 3RNC C; 2PJH A; 3ZIM A; 1KOT A; 3RZF A; 3B1L X; 4I6P A; 4PT5 A; 3UF8 A; 2QEJ C; 3URY A; 5GXG B; 4A9A A; 1FNV A; 3A33 B; 3AE2 B; 2KN4 A; 2N7E A; 3RFZ B; 2C7H A; 1FCL A; 4GOC A; 1QOF A; 1RFA A; 3A9J A; 3SD5 A; 5AZF A; 5DPT A; 3CWI A; 4AS1 A; 3M62 B; 1UD7 A; 1J7C A; 2NPT A; 1TY2 A; 3DOW A; 2DWQ A; 1OFF A; 1WGD A; 2SEB D; 1JRU A; 3Q6B A; 2LGI A; 4BAX A; 2N7D A; 4HPP A; 1WX8 A; 3B9J A; 3WA0 A; 2PE9 A; 5L95 C; 2N9P C; 3ZNH B; 4E71 A; 1AWD A; 3ZXV A; 3V62 A; 2CHW A; 4YSX B; 1F0Z A; 2B76 B; 5HKH A; 3QWZ B; 3KLS X; 1JWA D; 2QHO A; 3L10 B; 4MT5 A; 4EEW A; 3DQV A; 3ZYY X; 1MG4 A; 4YTP B; 1UH6 A; 4N58 A; 4A20 A; 3RPF C; 4FUL A; 5J2R A; 1GNU A; 5IAA C; 3I9V 1; 4FJY A; 4S17 A; 4P6V F; 2LHE A; 2WHI A; 1K52 A; 2WXJ A; 2NS5 A; 4TMA B; 3UQB A; 3PHW B; 5FR3 A; 4PS7 A; 4LJP B; 3DBL I; 4YSZ B; 3N30 A; 4ZRJ A; 5E6J A; 2AQ3 B; 2G45 B; 4AP4 C; 2NBU A; 1LGR A; 3PS6 A; 3VTU A; 3KYD D; 1GC7 A; 4N6E B; 1N6Z A; 5DPR A; 2JYT A; 3VR8 B; 1L5P A; 2V3P A; 5EE0 A; 1DGJ A; 3IVF A; 2ZZP B; 4ICU A; 4WJP A; 1WGG A; 2JF5 A; 4K3B A; 1RAX A; 1XLP A; 3NZS A; 2W9N A; 1SE2 A; 3AE7 B; 2IZV B; 3IT4 B; 4ZRQ A; 5FR6 A; 3VFK A; 1B1Z A; 1NYQ A; 5IN7 A; 1IBX A; 1P0R A; 2I38 A; 2AWT A; 4M0W B; 2C7N B; 3IBE A; 4YT0 B; 4DXF A; 2KXJ A; 4JWS C; 2KJR A; 4A6Q A; 2WXP A; 1CQV A; 1XLQ A; 2KWU B; 4YL8 A; 4MM3 B; 4FLH A; 4ARI A; 2R2Q A; 2XN9 C; 1J7B A; 1R4M I; 2HTH A; 1QQR A; 2BS3 B; 3DBR B; 4KSL C; 2BYF A; 4AJY B; 2LXC A; 1SXT A; 2L00 B; 3EFU A; 1CZP A; 3RMK C; 2WGS A; 3AEG B; 3VQI A; 2MEK A; 3EC8 A; 3PRZ A; 3OAW A; 1V5T A; 3R2I A; 5G5G A; 2K6D B; 4OVU A; 3JW0 X; 4E3C A; 1ET6 A; 4C80 A; 1WE7 A; 1WY8 A; 1C1Y B; 1TS2 A; 2WDT B; 4NPN A; 4DXA B; 4W9E A; 1C79 A; 5JZE B; 3T3N A; 1TS5 A; 2BYT A; 1TYG B; 2V3S A; 1UUP A; 1E7P B; 2K1F A; 5EE3 A; 4B95 A; 1WGR A; 3L54 A; 3VXW A; 1RYJ A; 1R4N I; 1XLO A; 2KDF B; 1D3Z A; 3C8Y A; 2WXG A; 4AJW A; 3IG3 A; 4M8M A; 4MH8 A; 5E6P A; 1YJ1 A; 4ITK A; 1I4X A; 1EWC A; 1Q10 A; 3A1Q B; 4AQ7 A; 2HE7 A; 4MJS A; 4G11 A; 3JSV B; 2PVG C; 5D94 A; 4JPS A; 1GOZ A; 1PQS A; 1N63 A; 2MBQ A; 2QIL A; 3ZJU A; 4RF0 A; 4KZC A; 2PLP A; 1E90 A; 4DHJ D; 2LEK A; 2E3T A; 1F77 A; 3TUO A; 2DYO A; 1PGA A; 4EZK A; 3QCA A; 1QKZ A; 2DX5 B; 3R3M A; 3H7P B; 4P1C C; 1WIA A; 3B08 A; 1V1P A; 3PTF C; 2JRH A; 1L4Z B; 5CHV C; 2EKE C; 4A55 A; 2V9H A; 3VDZ A; 4DDG D; 4A3O A; 4HEA 1; 3WAN A; 2PIA A; 1TS3 A; 1SBB B; 3P4S B; 1M94 A; 3VHT C; 4JWU C; 2KYW A; 3ML8 A; 1J0G A; 1SIF A; 3X23 A; 3N9Y C; 1V2Y A; 3V3X A; 2JZP A; 1T0Y A; 2ACZ B; 2GBM A; 3QIJ A; 1FRR A; 1P3Q U; 3VVW B; 4HVB A; 1WJN A; 1HEZ E; 2MA9 B; 3VAW A; 2O6V B; 1VD2 A; 2DZJ A; 1AAR A; 1KLU D; 2BGF A; 4NAW A; 5LLI A; 1ZDX A; 2ZCC A; 4XZ4 A; 2WQY B; 2WDQ B; 2Z59 B; 2E6X A; 3IXS A; 5D3I B; 3NG0 A; 1IGC A; 4KX6 B; 1JWB D; 5D6J B; 3OWE B; 3DHG C; 3UI3 A; 3MJ5 A; 2IDY A; 3Q8A A; 2IGG A; 4PYU A; 2LRW A; 2WXM A; 1OQQ A; 4W9I A; 2LUM A; 2H88 B; 2LJI A; 4BZA A; 2MW5 A; 3HVZ A; 3ABV B; 3I5J C; 1UEL A; 2MP2 A; 2CR5 A; 3V05 A; 3PHX B; 4RM9 A; 4C4V A; 3I3T B; 4XWT A; 2GMI C; 3D32 A; 4DHZ B; 4WWP A; 4BFR A; 4YTN B; 1N60 A; 1NI2 A; 3KUD B; 4IDI A; 3RT3 B; 2LHD A; 2V3N A; 1E8Y A; 2LVQ A; 4URK A; 1WXA A; 2N1V A; 3U2S C; 5BYQ A; 1LXD A; 2WP9 B; 1S3S G; 3N1Z C; 3J9C A; 2BS2 B; 3M95 A; 3ZQ4 A; 3Q3N C; 4C56 C; 3P42 A; 3M63 B; 2L32 A; 3V6C B; 1MG8 A; 1I4R A; 1Q1O A; 5AUK A; 1HA5 A; 3H6N A; 4KSK C; 2BYE A; 2D3A A; 2WXH A; 1FFU A; 5C1Z A; 4BBN F; 2H89 B; 2QDF A; 3Q2A C; 3Q14 C; 3NZU A; 4C7Y A; 3APF A; 2QSD A; 1V9J A; 1OGW A; 3EHV A; 1YQ3 B; 4ZYN A; 1M4V A; 4BBN C; 2KC1 A; 3KUZ A; 1GPX A; 3U4E G; 3LXF A; 1L0Y B; 3OJ4 B; 3AE8 B; 2AYO B; 3PSE B; 4ASW C; 2V4I B; 5MPO A; 5FK9 C; 1TIF A; 2K9X A; 3RUL A; 1JCK B; 2KD0 A; 4P1B C; 2OJR A; 3UIO B; 3QK0 A; 2MJ3 A; 2ZW0 A; 2XK5 A; 3JVZ X; 2WXN A; 4LCD E; 2KWC A; 5E6N A; 3QA8 A; 2N4F A; 2IND C; 4FJZ A; 4YXD B; 1VLB A; 4M8N A; 4KVG B; 1E5W A; 1K50 A; 2LXA A; 1FM0 D; 4HXD A; 4YWG G; 2BWE S; 2WXQ A; 5BMG A; 2MBO A; 5LXH A; 2O2V B; 2W82 A; 1K51 A; 1YD8 U; 2D11 A; 4XWW A; 2RGF A; 4IM2 A; 4L1B A; 2D3G A; 4DHZ E; 1QOB A; 1TZ1 A; 3PZ7 A; 1GB4 A; 1WFY A; 4WIP A; 4RM8 A; 1TBE A; 5BO4 B; 5L83 A; 2K22 A; 3QQ8 B; 3L08 A; 2J42 A; 4KGR A; 1JRO A; 4LK0 M; 1B9R A; 4N9F 4; 5KHO A; 4GSW A; 2INP E; 2IY0 B; 1N61 A; 2WDR B; 3WCQ A; 4G3X B; 3RCZ A; 3L17 A; 1FFV A; 4EKU A; 4ANX A; 1L6U A; 4XX5 A; 1J8C A; 4OW0 A; 3P4Q B; 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3RI7 C; 5C23 A; 2OED A; 2RDH A; 3KUC B; 1YN4 A; 4TQ0 A; 2VH1 A; 3ONS A; 1XLN A; 3N1X C; 4B0E A; 3EEC A; 1TT5 B; 4JQW C; 4XC2 A; 4FXC A; 2G4S A; 4K7S A; 4I6N B; 1UGM A; 3MC0 B; 1YJJ A; 4H2A A; 4TUU A; 1EF5 A; 3C0R B; 5BYS A; 4NJC A; 3AE3 B; 2TSS A; 4KIK B; 1WMH B; 3R7Q A; 2BB6 A; 5IP4 D; 3AE6 B; 3AEB B; 4OZA A; 1VZ7 A; 2WU5 B; 1V49 A; 1A5R A; 3VH3 B; 3A1Q A; 1JWU D; 2J4X A; 2R2O A; 4MAC A; 3MC8 A; 1F1H A; 1KH0 A; 4NAM A; 4KDL B; 4EZJ A; 3JSV A; 1HXY D; 5E6O A; 1XXG A; 3V60 A; 2KAN A; 3H9D A; 4B0M A; 1WRD B; 1HTO A; 1TS4 A; 1DOI A; 2L7R A; 2PTL A; 3UIN B; 3R8B A; 2DLB A; 3AE4 B; 2FID A; 1AYF A; 4NNJ B; 2DEN B; 2NBV B; 4W9H A; 3APD A; 3HIZ A; 3H7P A; 4W9J A; 2HTM E; 1WGY A; 1SJE D; 1NI3 A; 4MEM A; 3ZJV A; 4YSY B; 1JAL A; 2JXT A; 2K6Q A; 4GGQ A; 1N62 A; 3NVZ A; 3ZNG C; 2HJ1 A; 3U7Z A; 3DVN U; 3R66 C; 2NPT B; 4XYC A; 2XEW A; 1P1A A; 2VH2 A; 1I7H A; 2K8B A; 1VZ6 A; 4IG7 B; 4OHJ A; 1S1Q B; 2FIF A; 4ZRP A; 1T0Q C; 3B2G A; 2BKR B; 1TZO A; 2O6V D; 4OVV A; 4MDK E; 3RN9 C; 1UWM A; 2JT4 B; 3JYU A; 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