The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
54
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structure length |
52
|
Chain Sequence |
DTYKLILNGGLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDGTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
|
| molecule keywords |
Streptococcal Protein GB1 Backbone Modified Variant: Aib10,
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| publication title |
Protein-like Tertiary Folding Behavior from Heterogeneous Backbones.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
13
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| structure length |
52
|
| sequence length |
54
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-04-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4D2K A; 3GB1 A; 4IOI E; 1MPE A; 4KGS A; 4KGR A; 3FIL A; 1HZ5 A; 3MP9 A; 2EEL A; 2KAC A; 2RMM A; 2OED A; 2I38 A; 2N7J A; 1IGC A; 1MVK A; 1K53 A; 1XF5 L; 1P7E A; 1FD6 A; 2N9K A; 2JSV X; 1MI0 A; 2IGG A; 2JXT A; 2JZP A; 1K52 A; 2LGI A; 2QSD A; 1GB1 A; 1KH0 A; 4HJG E; 2LUM A; 1K51 A; 1F2R C; 1MHH E; 2JU6 X; 2PTL A; 4WH4 A; 1FCC C; 1F2R I; 2ZW0 A; 5BMI A; 1K50 A; 2J53 A; 1YNT E; 2QMT A; 2ONQ A; 2ZW1 A; 1QKZ A; 2NMQ A; 4OZB A; 1D4B A; 1JML A; 5BMG A; 4MAC A; 2KWD A; 1PGB A; 1XCT L; 2I2Y A; 3V3X A; 1HEZ E; 3UI3 A; 1IGD A; 1C9F A; 4IKG A; 2RPV A; 4HKZ E; 1Q10 A; 1IBX B; 5HFY A; 2GI9 A; 5HHD G; 2JWU A; 1FCL A; 1UWX A; 4GLS C; 2KN4 A; 2N9L A; 2KQ4 X; 2GB1 A; 4OZA A; 2IGH A; 3FIL B; 1YMH E; 1MHX A; 5HG2 A; 2PW9 A; 1PGX A; 2KDM A; 2J52 A; 4OZC A; 1EM7 A; 2LHD A; 5BMH A; 1HZ6 A; 1ZXH A; 2PLP A; 1GB4 A; 5HI1 A; 1XCQ L; 5JXV A; 2LHE A; 1P7F A; 1IBX A; 2IGD A; 2ON8 A; 2K0P A; 1PGA A; 4KGT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4L23 A; 4EZL A; 3HHM A; 2DYM A; 2WQY B; 1J0G A; 4KIK B; 3PZD A; 1SEB D; 4KIK A; 1WIA A; 2KKC A; 1FEH A; 4K3B A; 4LCD E; 3N32 A; 4G3X B; 4US8 A; 3H6N A; 4RM9 A; 4K7W A; 2LVQ A; 1BT0 A; 4DHJ B; 2BB6 A; 1UF0 A; 3J9C A; 4AJW A; 1U4A A; 4LDT B; 2ZPN A; 1R4N I; 2KXJ A; 1UH6 A; 5D3I B; 3RNA C; 3C8Y A; 2AQ2 B; 2QSD A; 4JX1 C; 5FR3 A; 4ZOH C; 3ZNZ B; 4B6W A; 2KJ6 A; 1N63 A; 5AUI A; 3IAM 1; 2FCQ A; 4IW0 A; 3ZLZ A; 2MBO A; 2ZW0 A; 4XYC A; 2ONQ A; 1GPX A; 2X8X X; 2K6Q A; 1HTO A; 4FXC A; 3NJT A; 4S17 A; 1JML A; 2KWD A; 2NPT B; 3MJW A; 3VRA B; 2NCN A; 3QJZ A; 3PT2 B; 3UI3 A; 3ZTD A; 4TSS A; 4MJS A; 1ZE3 D; 3QX1 A; 1GOZ A; 2D3A A; 3KQ4 A; 1HE8 A; 1UWX A; 4ITK A; 1T0Y A; 2G45 B; 3Q69 A; 4RH6 A; 4W9I A; 1WYW B; 2M8S A; 1PYW D; 3R2T A; 2O2V A; 3B9J A; 1L6U A; 2PW9 A; 3NZ3 A; 3VAW A; 1STE A; 1EM7 A; 3NHE B; 2KDI A; 2AL3 A; 4PS7 A; 2WXP A; 3ZIM A; 1OEY J; 1SJH D; 1V86 A; 1IUE A; 1GB4 A; 2BWF A; 4N59 A; 2QCZ A; 2JY6 A; 3NOB A; 2DX5 B; 1JWB D; 3W5U B; 2ON8 A; 2WHI A; 3Q8B A; 1SF0 A; 5H92 C; 1KF6 B; 4TV3 A; 2KWU B; 2WXO A; 2KLG A; 2DLB A; 2J0M A; 4RGN A; 4A9A A; 2MHJ A; 4LTU A; 5BYQ A; 1EO6 A; 2MBB B; 1FM0 D; 4URK A; 1WGR A; 2PJH A; 4OVZ A; 4R3D A; 5DPT A; 2K8H A; 4A3P A; 1ROE A; 1J7B A; 1WR1 A; 3ZNI D; 1B1Z A; 3B08 A; 3DVG Y; 3GE3 C; 3P63 A; 1FD6 A; 1QT9 A; 2MSE D; 1D5Z C; 2TSS A; 3SHQ A; 1NEK B; 2IGG A; 3WIM A; 4JIO U; 3Q3F A; 4H2A A; 3X0W A; 3PHW B; 1GC6 A; 1UEL A; 2WYQ A; 4JGH B; 1WFY A; 2IYD B; 4GDK B; 4E71 A; 5BO4 B; 2C7M B; 2GBM A; 3V05 A; 3BK2 A; 1FXI A; 2FCM A; 2JYE A; 1LQB A; 2LXC A; 3OWE B; 3A9J A; 3I5J C; 1C4C A; 2KMC A; 4OZB A; 1I7H A; 2LMC A; 4JWS C; 3DVN V; 3KW5 B; 1DOI A; 2INN E; 1UGJ A; 3AE9 B; 4F7Z A; 5IO9 A; 1YQ4 B; 3CF6 E; 1CK1 A; 2J0K A; 3AEC B; 1Q10 A; 2CR5 A; 2NVU I; 1FXT B; 2K5P A; 3PGE A; 5IN7 A; 2IO2 B; 4WAF A; 4F8C B; 2N9L A; 2N9E B; 2KT7 A; 3FIL B; 4CYE A; 4KZC A; 4ZYS A; 1ISN A; 3P42 A; 4FUL A; 2CHX A; 2FAZ A; 3U8Z A; 2H89 B; 3IXS A; 4AOF A; 2IZV B; 1BXT A; 1YQ3 B; 3VTW A; 3U7D A; 4BKS D; 3VFK A; 2O6V B; 4WJP A; 2O6V A; 1WGG A; 2IY1 B; 1V1P B; 3ABV B; 1UWM A; 4GXB A; 3MJ5 A; 2DHZ A; 4KGS A; 4BBN F; 1E7V A; 5CTR C; 4TKN A; 1Z2M A; 2Z0E B; 1FFV A; 2MP2 A; 4ZRK A; 3HIZ A; 2RDG A; 3X23 A; 5JH5 C; 2WXF A; 3VDZ A; 1C1Y B; 2WXM A; 3W5V B; 2PIA A; 1E9M A; 4EUT A; 1T3Q A; 4GN1 A; 2WU2 B; 4AWJ A; 1OFF A; 4EOY A; 2M19 A; 1E8Z A; 1T6B X; 1KFY B; 5EE0 A; 4NY0 A; 3T8M A; 4W9J A; 3OAW A; 3ALB A; 3A1Q B; 2K39 A; 3A1Q A; 2LGX A; 3A9K B; 4XE0 A; 3AUL A; 3VR8 B; 5DPR A; 4NQL B; 1NVI D; 2KN5 A; 3KUC B; 2BS3 B; 3OJ3 A; 4IM0 A; 1GAQ B; 3GP7 A; 1PGB A; 3R2I A; 4MM3 A; 3VH3 B; 2BYE A; 2L0T A; 1IBX B; 1KLV A; 3PHX B; 2FCS A; 4ZRP A; 1JRO A; 3RI7 C; 3ONS A; 4ANV A; 3A33 B; 1FMA D; 3MTN B; 4HWI B; 1WGK A; 1J7C A; 3W1S A; 2HJ1 A; 4REZ A; 2M1M A; 5EE3 A; 1PGX A; 2UYZ B; 2M0X A; 1YD8 U; 2BT6 A; 4W9C A; 1GG3 A; 3NRZ A; 1S3S G; 3MC9 A; 3VUX A; 2W55 A; 2E3T A; 4AS1 A; 1R4M B; 2I1K A; 1R4M I; 4C56 C; 2WDQ B; 3W1Y A; 4ICU A; 1PUT A; 3GZN B; 1WXA A; 4FA6 A; 3GZN I; 1TYG B; 1WXV A; 3AE1 B; 2G9H D; 3DVN U; 2D5G A; 1JWU D; 3VUY A; 4BFR A; 2N4F A; 4KDI C; 2KQS A; 3ZYY X; 3LXF A; 1BUI C; 3UQA A; 2J42 A; 2LRU A; 1QZE A; 3H8H A; 2VH2 A; 2KAN A; 2NR2 A; 3VTV A; 2J7Q B; 1WY8 A; 2Y3A A; 4K1R B; 1H4R A; 3L54 A; 4MGI E; 1YJ1 A; 4YSY B; 2KFK A; 2GMI C; 4C7Z A; 4EFO A; 3B2G A; 4PS8 A; 4LK0 M; 4IWQ A; 4DHJ D; 3APC A; 4NAW B; 4LDT D; 4ZDV A; 2AYO B; 2JXX A; 1TJE A; 5G5G A; 2Y5C A; 1QQR A; 1NYQ A; 2XN9 C; 2QMT A; 3IT6 B; 1N61 A; 3MFG A; 2GBK A; 3TUO A; 2L7R A; 2ZJD A; 2Y5P A; 4NNJ B; 1T0S C; 3QWZ B; 4ICV A; 3DBR B; 3DBR I; 4CHK A; 5EDS A; 1QOG A; 2Y5B B; 2WXK A; 3EEC A; 4GGQ A; 2RPQ A; 4HKZ E; 2KMM A; 4P6V F; 3NG0 A; 3I9V 1; 3DDC B; 4US9 A; 3ZJU A; 1E7U A; 5D94 A; 2KN4 A; 1WGY A; 3AV8 A; 2KYW A; 1Y8R C; 3P4S B; 3RFZ B; 3H9D A; 1D3Z A; 5E6P A; 4IDI A; 1UBI A; 3MC0 B; 4LNO A; 1ZKH A; 1WMH B; 1HZ6 A; 1WMH A; 5IKC M; 3U30 A; 1JW9 D; 2BKF A; 2W9N A; 2V4L A; 2KTF A; 1T5X D; 2JZ3 B; 4KGT A; 3ZJV A; 2KO3 A; 3FC4 A; 4ACF A; 1TS2 A; 3NS1 A; 2LAS A; 2N7J A; 2GBN A; 3EFU A; 3AE4 B; 1EWY C; 5EE1 A; 3QCA A; 3KUD B; 4E3C A; 1I4H A; 1JRP A; 2DAF A; 2LVP A; 1K8R B; 4LNI A; 3AEA B; 3N3K B; 1P7E A; 2KC2 A; 2DBY A; 1SGH A; 4L2Y A; 2A4Z A; 1TKY A; 4P1C C; 3V61 A; 3TL5 A; 4HPP A; 3NY5 A; 1WX8 A; 2CS4 A; 2KZR A; 3W1S C; 1UNS A; 2MBH A; 2EMS A; 2IO3 B; 2ZW1 A; 1WWT A; 1MG4 A; 4HVB A; 2PVG C; 1GNU A; 1QLB B; 2RR9 A; 2MQJ A; 1N5X A; 2KX3 A; 2V3P A; 3V3X A; 2L00 B; 4ZRQ A; 1C9F A; 3LYY A; 2KTR B; 2BS2 B; 1VZ8 A; 1L5P A; 4W9D A; 2ZVN A; 3ZUN A; 5DCN A; 2JWU A; 4ANW A; 2ZVO A; 1SE9 A; 4FLH A; 4FAD A; 4O1N A; 2M4N A; 4HEA 1; 3A4R A; 4GSW A; 4FHK A; 1QIL A; 3NVV A; 4N6E B; 3APD A; 1WXS A; 2J52 A; 4OZC A; 2ZNV C; 1EF1 A; 4YTP B; 5BMH A; 5HI1 A; 3VQI A; 3RUI B; 1LGR A; 3JSV A; 2W54 A; 1WE7 A; 2BTE A; 4WJN A; 1UBQ A; 2OJW A; 1CMX B; 2KLC A; 1TS3 A; 2MBQ A; 3GB1 A; 1A70 A; 3QK0 A; 5CHV C; 2BYT A; 3IAS 1; 4N58 A; 4GDL A; 2DAJ A; 1C79 A; 2KAC A; 1LXD A; 3DBL I; 1XQQ A; 3M3J A; 3PS6 A; 4G0N B; 1FPY A; 2Q5W D; 2O6V D; 2PVO D; 3BWU D; 2N9X A; 1V49 A; 3HVZ A; 4JL9 A; 1V5O A; 4WJO A; 4FN2 A; 5IAA C; 1XLQ A; 3ZGZ A; 4II2 B; 4IM3 A; 1VLB A; 2AWT A; 1V81 A; 2CU3 A; 2L52 A; 4RF0 A; 2YEP F; 4KKI A; 3V6C B; 1AN8 A; 4W9K A; 3PLU A; 2K9X A; 2G4S A; 3R66 C; 4W9G A; 5C3J B; 2WU5 B; 1R4N B; 1L0Y B; 1TS5 A; 2RGF A; 2KDF B; 2DNF A; 3M95 A; 2Z0D B; 1ZUD 2; 2L05 A; 1TKE A; 2JPH A; 2IPK D; 3AU5 A; 3CIR B; 2IBI B; 1F1H A; 4XC2 A; 4JWU C; 4WWN A; 4EEW A; 4NJ6 A; 2FID A; 2RDH A; 1F77 A; 2KQ4 X; 4IG7 B; 1VRA B; 3I3T B; 4JE3 B; 5AZG A; 2B3A A; 3ML9 A; 2BQQ A; 1MHX A; 3SU8 X; 1SIJ A; 3V62 A; 4EZJ A; 4LJP B; 2NPT A; 2V3N A; 2GRI A; 1AYF A; 4DHZ E; 2LHD A; 3AH7 A; 1RAX A; 2PPH A; 3AEE B; 1VJK A; 4PK1 A; 3MHZ A; 2HE7 A; 1Q1O A; 2DYO A; 4IOI E; 2WNM A; 3PRZ A; 2C9W B; 2LWP A; 4HJK A; 4EE2 A; 1AAR A; 1Q0W B; 1Q5W B; 1FNV A; 5E6J A; 3OJ4 B; 2JRI B; 3RYT A; 2D11 A; 4ARI A; 2AX5 A; 3MC8 A; 5D3D A; 2BGF A; 4BBN C; 1TIF A; 2JSV X; 3HM6 X; 2J0J A; 4GOC A; 4MH0 E; 3DBS A; 2D3B A; 3WAM A; 1JCK B; 2FE8 A; 2EKI A; 2QDF A; 3RZW C; 3Q8E A; 2IO0 B; 1F2R C; 2BYF A; 3QIJ A; 5LLI A; 3Q14 C; 5IP4 D; 1VCB A; 1FCC C; 1NEN B; 4TUU A; 1P1A A; 3BYT B; 2XBB C; 3BVM A; 5AZH A; 3FAH A; 2KFJ A; 4LNK A; 2NMQ A; 2JWZ A; 3BVG A; 4A3O A; 3AE8 B; 3HVD A; 2AQ1 B; 1EWC A; 3JYU A; 1XCT L; 1UD7 A; 5KHQ A; 2LGS A; 4A8X C; 1FRR A; 3DQV A; 3B0A A; 4IKG A; 3PRP B; 1WXM A; 4XX5 A; 4GDK A; 5D2M B; 1XD3 B; 3WAN A; 2DZI A; 1FCL A; 2FUH B; 2L76 A; 1QOB A; 1KM7 A; 4OZA A; 3UIO B; 4X57 B; 2FIF A; 3ENE A; 1PQS A; 2K1F A; 1OQR A; 2L83 A; 3RT3 B; 1V9J A; 1J7A A; 3Q8A A; 3LJ3 A; 3AU4 A; 1ZXH A; 4IM2 A; 4WQM A; 1ET6 A; 4LJO B; 3KH0 A; 2KOX A; 2L1A A; 1GC7 A; 2K8C A; 3UQB A; 3L0W B; 4JPS A; 4OVU A; 1E10 A; 3AE7 B; 3B1L X; 3Q3N C; 4AUQ C; 1I4R A; 3FIL A; 3TBL D; 4XWW A; 1HZ5 A; 2GBJ A; 1FXA A; 4I6L B; 2KC1 A; 1WXQ A; 2I38 A; 4IUM B; 4BAX A; 1G6J A; 2HD5 B; 1TY0 A; 3ZQ4 A; 1YJI A; 3AE3 B; 3KUZ A; 5CX3 A; 4CQN A; 3MHS D; 3L4P A; 3AM9 A; 2AEH A; 3N20 C; 3JVZ X; 1LM8 B; 3FKY A; 4HRS A; 3NUH B; 3PRM B; 1SBB B; 3PZ7 A; 1YN5 A; 4RM8 A; 2C7N B; 2JXT A; 3PLV A; 3P4P B; 1V1P A; 2V1Y A; 5CHF A; 2WGS A; 3BZD B; 1E0Z A; 3EA6 A; 2KJR A; 4RFB A; 2JUO A; 2LUE A; 2ASQ A; 4K3C A; 2KK8 A; 3N1X C; 4K7S A; 2W3S A; 4WIP A; 3URY A; 3L10 B; 2MH7 A; 3OG5 A; 3WCQ A; 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2DYB A; 2H88 B; 1WF9 A; 1FIQ A; 3SD5 A; 1NDD A; 1WSP A; 1CZP A; 1V97 A; 3EHV A; 4FJY A; 4G50 A; 4XZ4 A; 3RCZ A; 1N5W A; 2N0S B; 2NS5 A; 3BYY B; 4M8M A; 2XEW A; 1WM2 A; 4GU2 A; 3GOE A; 4JQW C; 1UGM A; 1YX6 B; 4USA A; 2VH1 A; 4HXD A; 4D2K A; 3ZVV A; 4K81 A; 3UIP B; 4Q2J A; 1DOY A; 4HCP B; 1WR6 E; 3AXC A; 3E9S A; 3N1Z C; 2KD0 A; 4BKG A; 1XO3 A; 4NPN A; 4E74 A; 4LNN A; 4A6Q A; 4ZRI A; 4OW0 A; 1WYG A; 2WX1 A; 1TGZ B; 1PDX A; 4MH8 A; 1ZDV A; 2CU1 A; 2J4X A; 1K53 A; 2HJ8 A; 2N9K A; 3AED B; 5EE9 A; 3ETR A; 4W9E A; 3IFW B; 3Q8C A; 3PZ8 A; 4C80 A; 4GIV A; 3AE5 B; 4F1S A; 2D3C A; 2XK5 B; 3OLM D; 1HXY D; 2WXN A; 3SFD B; 2WXH A; 2AL6 A; 2LGD A; 2WXI A; 4DXF A; 2JF5 A; 3QAQ A; 3U4E G; 2J53 A; 5JHA A; 1I4G A; 1J19 A; 2L32 A; 4B95 A; 4AQ7 A; 4A55 A; 5AEK B; 3R8B A; 3LB8 C; 3ECI A; 4RF1 A; 4W9F A; 3R7Q A; 3BY4 B; 2QIE B; 4YTM B; 2BBC A; 2KX0 A; 3HUI A; 3Q6B A; 4HDO A; 2QIL A; 1JWA D; 2B76 B; 4WWP A; 2JX5 A; 2D2Q A; 2LJ5 A; 5T8I A; 1UZX B; 4NJ7 A; 1J8C A; 1P98 A; 1T0R C; 4JLC A; 4M0W B; 3JW0 X; 1PFD A; 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