The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
TTYKLILNLKQAKEEAIKEAVDAGTAEKYFKLIANAKTVEGVWTYKDEIKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Igg binding protein
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| molecule keywords |
DESIGNED PROTEIN
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| publication title |
From the Cover: A minimal sequence code for switching protein structure and function.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
12
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4OZC A; 1HEZ E; 1C9F A; 2N9L A; 1QKZ A; 5BMH A; 2ONQ A; 2PLP A; 2GI9 A; 2JZP A; 2RMM A; 1EM7 A; 2QMT A; 3FIL B; 1MHX A; 5JXV A; 2IGH A; 2LHE A; 3V3X A; 1UWX A; 4D2K A; 5HI1 A; 2JU6 X; 2JSV X; 2I2Y A; 1K50 A; 1YNT E; 2GB1 A; 2K0P A; 1GB1 A; 5HFY A; 4HJG E; 1IBX B; 4OZB A; 1ZXH A; 5BMI A; 4KGT A; 1PGX A; 1MI0 A; 1P7E A; 1Q10 A; 1F2R I; 2ZW0 A; 1XCT L; 2IGG A; 1PGA A; 2KDM A; 2LGI A; 2N9K A; 2PTL A; 1P7F A; 1HZ5 A; 5HG2 A; 2LHD A; 2LUM A; 5BMG A; 2OED A; 1XF5 L; 2JWU A; 1XCQ L; 2ON8 A; 2RPV A; 1YMH E; 4KGS A; 2KN4 A; 2PW9 A; 3GB1 A; 1JML A; 4HKZ E; 1HZ6 A; 5HHD G; 4MAC A; 1MPE A; 4KGR A; 1FD6 A; 1GB4 A; 3MP9 A; 1IGD A; 1KH0 A; 4GLS C; 2NMQ A; 2KWD A; 3FIL A; 1K51 A; 2KQ4 X; 2QSD A; 1MVK A; 4WH4 A; 2J52 A; 2J53 A; 4IKG A; 2ZW1 A; 1FCC C; 1K53 A; 4OZA A; 1F2R C; 3UI3 A; 2KAC A; 2JXT A; 1IGC A; 1IBX A; 2EEL A; 1D4B A; 2I38 A; 4IOI E; 2N7J A; 1FCL A; 1K52 A; 1PGB A; 1MHH E; 2IGD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2GOW A; 4BOZ B; 3ZW3 A; 2G9H D; 3A1Q A; 4REZ A; 3APF A; 3AE5 B; 2L32 A; 3ZRF A; 2N7D A; 3AEF B; 4YWG G; 3BYT B; 1RFA A; 2CJN A; 2J4X A; 1NVI D; 3RNE C; 1WM3 A; 2DYB A; 3GZN I; 4IM0 A; 1WZ3 A; 5FK9 C; 1V86 A; 1QF6 A; 2DYM A; 3IG3 A; 1NEK B; 2V3P A; 2K8B A; 1ZW7 A; 3GE8 C; 5G5H A; 2JXX A; 3OWE B; 3IXS A; 3LB8 C; 4BKS D; 1WX8 A; 2LUM A; 3DWM A; 2D3G A; 1JWM D; 4ICV A; 1V49 A; 4TQ1 A; 1I4P A; 1WM2 A; 3ECI A; 1WJ4 A; 2L52 A; 3ZQ4 A; 1KLV A; 5LXH A; 3GZN B; 1TS3 A; 3CST A; 2MX2 A; 4ACF A; 5CHW A; 4KSK C; 4EFO A; 1KOT A; 5DCN A; 4OHJ A; 1J19 A; 1FCC C; 4HEA 1; 4YXD B; 5J18 A; 3PO0 A; 2J42 A; 3Q6B A; 1D5M C; 3SDL C; 2EEL A; 2LFI A; 3I57 A; 1QOB A; 2IO2 B; 1FEH A; 1KJT A; 1EWY C; 2I38 A; 1OEY A; 4P1C C; 4TV3 A; 2KN5 A; 3VFK A; 1WX7 A; 2JX5 A; 3JVZ X; 4BOS C; 1FCL A; 5CHF A; 3ZTD A; 3JSV B; 5E6O A; 4M8M A; 2V3S A; 2NBV B; 1V5T A; 2N9L A; 2V4L A; 2KHW B; 4BFR A; 1L6U A; 3ZDT A; 3FIL B; 3PRP B; 1L4D B; 2AQ2 B; 3P1M A; 2IZV B; 4A90 A; 2JU6 X; 1Z2M A; 1EWC A; 1AAR A; 1F9J A; 1FNW A; 4A3O A; 3EHV A; 3EFC A; 4HRS A; 3P4R B; 1WGG A; 1XXG A; 2ASQ A; 2ZNV C; 1F2R I; 1MG4 A; 2N4F A; 4B0M A; 3VR9 B; 1XCT L; 3BY4 B; 2PIA A; 1NI2 A; 3IAS 1; 4LTU A; 2PTL A; 5D6J B; 5C23 A; 3NHE B; 1QOG A; 2NBW B; 3TJP A; 2ZCB A; 3QAQ A; 1TY0 A; 3JSV A; 3WAO A; 1T3Q A; 3NZU A; 2AL6 A; 2FBW B; 4IW0 A; 2D07 B; 5HHD G; 2V3N A; 4LNI A; 4N6E B; 1E8X A; 3Q8B A; 2NMQ A; 2KWD A; 3FIL A; 4C80 A; 4QAY A; 3L13 A; 4IG7 B; 3RNF C; 4LDT B; 1E10 A; 3X23 A; 3B0A A; 3VDZ A; 1SF0 A; 1UD7 A; 1I4G A; 3ZJU A; 3IT4 B; 1N62 A; 2OJW A; 4XWW A; 3NS1 A; 2VZK B; 1WYW B; 3A4R A; 3DWG C; 3HM3 A; 3ZJT A; 2INN E; 4HPM B; 4MM3 B; 4B6W A; 1V5O A; 1KFY B; 2BYV E; 4GXB A; 3VHT C; 3HVZ A; 4DXG A; 3GP7 A; 4HRO A; 3AE6 B; 3AEA B; 3VTW A; 4KZ0 A; 3TEY A; 3LXF A; 4LJP B; 4PYZ A; 2PJH A; 4W9K A; 1WRI A; 4M0W B; 1PFD A; 2XEW A; 3KLS X; 4FJZ A; 2IND C; 2KD0 A; 1FNU A; 3NVZ A; 2G45 B; 3B9J A; 1OGW A; 4K7U A; 2G4S A; 1F1H A; 5HI1 A; 1JRO A; 3NVV A; 3V61 A; 1YJJ A; 1C3T A; 4HCP B; 1TS4 A; 1S3S G; 2A4Z A; 1UGJ A; 1PGX A; 2JWZ A; 2X38 A; 3PLV A; 1NI3 A; 3S2A A; 4K3C A; 4YSY B; 1XLP A; 4L2Y A; 4DQO C; 1GPX A; 3VQI A; 1FXA A; 3NRZ A; 2CKH B; 1HZ5 A; 1HTQ A; 2BKR B; 5KHO A; 1YN4 A; 3I63 C; 4KKJ A; 5IO9 A; 1GUA B; 2KWC A; 2JYT A; 2EKI A; 4MM3 A; 2LZ6 A; 2MJE A; 3V62 A; 2PW9 A; 3R3M A; 3OG5 A; 2MQJ A; 4HKZ E; 1M4V A; 1IUE A; 3IFW B; 3Q8C A; 5TR5 A; 1RRB A; 4B9K A; 1FD6 A; 5IAA C; 3GS2 A; 4ZYN A; 3BK1 A; 1WJ6 A; 3SD5 A; 1K51 A; 1WSP A; 2IJ0 A; 1WE7 A; 2W54 A; 2XK5 B; 5BO4 B; 4NJC A; 2LUE A; 2GBJ A; 2DZK A; 4FXC A; 1E8Z A; 1YX5 B; 1L5P A; 3U7D A; 4W9I A; 4M02 A; 1G6J A; 3AH7 A; 4WAF A; 1KLG D; 1LM8 B; 2WXR A; 4IC7 B; 3Q14 C; 1C76 A; 1UBQ A; 3E9S A; 3L54 A; 4AJW A; 5C1Z A; 3N30 A; 3NVY A; 1UUP A; 4N9F 4; 3R66 C; 5J2R A; 3VVW B; 4N58 A; 1U4A A; 1ZOY B; 2ZZP B; 4ANX A; 2KDB A; 4LDT D; 3K9O B; 3W5U B; 2D10 A; 2FID A; 2LHE A; 3AEB B; 3DVG Y; 3NG0 A; 3MC8 A; 4GSW A; 4YTN B; 3K9P B; 1YNT E; 3N3K B; 4PS7 A; 2VZK D; 4OVV A; 1QIL A; 4FJV B; 3TEX A; 1J0G A; 1HXY D; 3IAM 1; 3ZGZ A; 3H1U A; 2PVG C; 2XK5 A; 2K6D B; 3NJT A; 1A70 A; 4NAW B; 1V8C A; 3P2B A; 1PQS A; 5G55 A; 4ANU A; 4AUQ C; 2N1W A; 4WUR A; 3ETR A; 3TIX A; 5EE9 A; 4KGS A; 2L0F A; 4WIP A; 3RZF A; 2KJR A; 1LXD A; 1L0V B; 2PE6 B; 1DYQ A; 2J0K A; 3I5J C; 2XNA C; 4ZHP A; 2V0G A; 1FXI A; 3N1Y C; 2RGF A; 3W2D A; 2C7M B; 1SXT A; 4YT0 B; 5H8Y E; 4WH4 A; 2Z0D B; 4W9C A; 2J53 A; 3DQV A; 4OW0 A; 3WAL A; 2ZW1 A; 1T0S C; 3Q8F A; 3OLM D; 2ZCC A; 3ZXV A; 4F8C B; 1XT9 B; 2R61 A; 3R2T A; 1WFY A; 2I1J A; 2BQQ A; 5I4D A; 5BYR A; 3UIN B; 2BT6 A; 3TEW A; 4WWN A; 1WJU A; 1QLB B; 3VUX A; 2C7N B; 4C7Y A; 2KJH B; 1JWU D; 4RGN A; 4ARI A; 2LXA A; 2QDF A; 2VRR B; 2QCZ A; 2Y5P A; 4NAW A; 4KKI A; 2L83 A; 1IPG A; 2J0J A; 4PT5 A; 3W1S C; 2RMM A; 3BVM A; 1V9J A; 3AE2 B; 4P1B C; 1YX6 B; 2M1M A; 2AYO B; 4EKU A; 2E6X A; 1OEY J; 2SEB D; 1CJE A; 2WDT B; 4NZL B; 3UF8 A; 1E5W A; 2KKC A; 2K5P A; 1ISN A; 2QEJ C; 3AI5 A; 1XEE A; 3VH3 B; 3DBR B; 4KGT A; 1V97 A; 1AN8 A; 5EDS A; 4UDU C; 4GDL B; 2Y5B B; 1MI0 A; 1Q10 A; 3KUZ A; 1JRP A; 1PGA A; 5JHA A; 3BVZ A; 2LJ5 A; 2WDV B; 2QC8 A; 4O1N A; 1WXQ A; 4IWP A; 1UZX B; 1ENF A; 2AEH A; 2N9P C; 1F0Z A; 4GIV A; 2RDB C; 4ASW C; 4A55 A; 2JWU A; 4A9A A; 1E0Z A; 4GOC A; 2K39 A; 4MGY E; 1VR9 A; 2IY0 B; 3WIM A; 4JPS A; 1GB4 A; 1FFU A; 3MP9 A; 2CJO A; 2MP2 B; 2DWQ A; 2WWZ A; 1R4M I; 2DZM A; 2L3Z A; 4NAM A; 2BS2 B; 1DOI A; 2DBY A; 3V60 A; 4AS1 A; 3TSS A; 3PGE A; 2KC2 A; 3VR8 B; 3AUL A; 2MBO A; 3UI3 A; 2CR5 A; 2KYW A; 5G5G A; 3P42 A; 4BBN F; 3H7P B; 3TL5 A; 4DHZ B; 4GDL A; 5E6P A; 4MT5 A; 2NPT B; 2XBB C; 2YEP B; 5DPW A; 2N7J A; 1N5X A; 2JPH A; 3NUH B; 2NS5 A; 2AX5 A; 4OZC A; 2WX1 A; 2BTE A; 3URY A; 1KRH A; 3HM6 X; 4W9J A; 4I6N B; 1SE2 A; 3QWZ B; 2LGX A; 5KHQ A; 3RPF C; 1R4M B; 1ZP0 B; 2MSE D; 1TKY A; 3DBL I; 4Q2J A; 2LGS A; 3M3J A; 2M19 A; 3DPD A; 4TQ0 A; 3VAW A; 5JXV A; 1CZP A; 2IGH A; 4EUT A; 3KYD D; 1E8W A; 2CU1 A; 4CYE A; 4FAD A; 3OJ3 A; 4MGI E; 1N60 A; 2FE8 A; 2MP2 A; 2K0P A; 1V2Y A; 4YTP B; 1ACC A; 4OZB A; 4GB9 A; 4LK0 M; 3PV1 A; 4JWU C; 4W9G A; 3DHG C; 3DBH B; 3TEZ A; 2LJI A; 2BB5 A; 4FHK A; 3ZVV A; 1I4X A; 4TKN A; 2MJD A; 5LXI B; 3DBL B; 3MHS D; 4RGO S; 3UGB B; 3H7P A; 4K3B A; 2NPT A; 1YIW A; 3HIZ A; 4C00 A; 4OVU A; 3BIN A; 2KK8 A; 2WLB A; 4JWS C; 3PHW B; 3GB1 A; 3MTN B; 4G11 A; 4AWJ A; 2WXQ A; 4MEL A; 1N5W A; 2L7R A; 4BZA A; 2DHZ A; 2CHZ A; 2IPK D; 1WI0 A; 3RNB C; 2MRP A; 4CO7 A; 1WXA A; 3M62 B; 4HKQ A; 1SGH A; 1SE3 A; 4E74 A; 4RGT A; 1WRD B; 1ZDX A; 1FNV A; 4AOF A; 1IGC A; 4FUL A; 4KVG B; 4P6V F; 4P7I A; 4L1B A; 4EZJ A; 4LNN A; 4RF1 A; 3QAR A; 2MWS B; 3C0R B; 2WXI A; 1PGB A; 1MHH E; 3ZUN A; 1HEZ E; 2K9X A; 4ZRI A; 4HLE A; 1J7B A; 2KX0 A; 4XWT A; 3FKY A; 3W9C B; 2LD9 A; 1Q0W B; 1DGJ A; 3T9L A; 1VD2 A; 2TSS A; 4II2 B; 1XD3 B; 4WWO A; 2MCN B; 1L0X B; 2WXF A; 4LNO A; 2B3A A; 3APD A; 5TSS A; 1QOF A; 3NY5 A; 2V9H A; 1IBX B; 3Q3O C; 1YQ3 B; 3BWU D; 1VJK A; 3PVL A; 2BKF A; 1D5Z C; 3MC0 B; 3RUL A; 1I4H A; 3P4S B; 2Y5C A; 3RFZ B; 4HPP A; 3VRA B; 1E7V A; 2LGI A; 2Q5W D; 2N9K A; 2YVC A; 1XQQ A; 1RYJ A; 2BS4 B; 2MBB B; 2IDY A; 3AE3 B; 1WZ0 A; 5E6N A; 2IO1 B; 3PZD A; 1WJN A; 2C60 A; 2RPV A; 5GMV A; 3DHH C; 1IYF A; 5C2T B; 1N61 A; 1UNS A; 3L08 A; 3R8B A; 4TUU A; 4KGR A; 3B08 A; 1TS5 A; 4XE0 A; 4US9 A; 5D94 A; 3W5V B; 3N1Z C; 1YQ4 B; 4DDG D; 3PRM B; 1CQV A; 4ZRP A; 5D3D A; 5T8I A; 3RI7 C; 1V81 A; 4OZA A; 4RNA A; 4S0R A; 3JYU A; 4RGM A; 1IBX A; 3KYC D; 3EEC A; 5D7G A; 3EFU A; 5AEK B; 2W55 A; 1P0R A; 4DK5 A; 2LRU A; 1RLF A; 3QC8 B; 5JZE B; 2K25 A; 5JHB A; 3V6E B; 2W3R A; 5CTR C; 1GG3 A; 4PYU A; 4KX6 B; 4S17 A; 2ONQ A; 4I6L B; 3SFE B; 1JQ4 A; 1LFD A; 3ENE A; 1P9D U; 1KLU D; 2QMT A; 3Q3M C; 1ZKH A; 3ZNG C; 4US8 A; 2D3C A; 4F1S A; 1KTK A; 1CK1 A; 1PUT A; 4JE3 B; 2WGS A; 3U4E G; 5G2N A; 3V3X A; 4N59 A; 4WAA A; 1WYG A; 2ACZ B; 3N1X C; 2C5L C; 5HFY A; 4WJQ A; 2PEA A; 2GMI C; 2WQY B; 3U7Z A; 2XN9 C; 3AV8 A; 3QIJ A; 2OOB B; 4DWF A; 2KDM A; 3IBE A; 3M63 B; 2WDQ B; 1T5X D; 2WYQ A; 4URK A; 3AU5 A; 3KUC B; 2BYT A; 4MGZ E; 3PT2 B; 3ZNH B; 1Z5S B; 1FRD A; 5BYS A; 3H9D A; 4BKG A; 4IDI A; 3FAH A; 4WQM A; 3ONS A; 4RM9 A; 4A20 A; 4XDC A; 1OTR B; 4BBN C; 1T0Y A; 4GLS C; 3SU8 X; 2KLC A; 2INP E; 2PPH A; 4RF0 A; 2C9W B; 2PE9 A; 4IKG A; 1XO3 A; 4E71 A; 3VTU A; 3A9K B; 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