The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
96
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structure length |
96
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Chain Sequence |
AKKVRFYRNGDRYFKGIVYAVSSDRFRSFDALLADLTRSLSDNINLPQGVRYIYTIDGSRKIGSMDELEEGESYVCSSDNFFDDVEYTKNVNPNWS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
NEURONAL MIGRATION PROTEIN DOUBLECORTIN
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| publication title |
The Dc-Module of Doublecortin: Dynamics, Domain Boundaries, and Functional Implications.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
22
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| structure length |
96
|
| sequence length |
96
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-04-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF03607 | DCX | Doublecortin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Doublecortin domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IP4 D; 5IOI A; 1MFW A; 5IN7 A; 2DNF A; 5IO9 A; 1UF0 A; 1MJD A; 1MG4 A; 5IKC M; 2BQQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2AWT A; 3L13 A; 2KHW B; 2J0J A; 4IM2 A; 3DPD A; 4DHJ D; 1TZO A; 2BYE A; 5AZH A; 5BO4 B; 1HXY D; 2DBY A; 3LXF A; 3RPF C; 1T5X D; 4TSS A; 1ENF A; 3DWG C; 3R66 C; 2M4N A; 3U52 E; 1WYG A; 2N7D A; 3I57 A; 3TCA A; 2ZZP B; 2V3N A; 4II3 B; 4A9A A; 5CTR C; 1AYF A; 4I6L B; 4ZHO A; 4ARC A; 1TS5 A; 1EF5 A; 3BK2 A; 2BPS A; 5AEK B; 1C4P A; 2JX5 A; 4BOS C; 2Y5B B; 1WM3 A; 3AE4 B; 1T3Q A; 5H92 C; 5MPO A; 3W5U B; 1YQ3 B; 4MGK E; 4OVU A; 2BYT A; 1Q5W B; 2YEP F; 4AOF A; 1UWX A; 2R2Q A; 5AZF A; 2IGH A; 1WXM A; 3QHT A; 3GE3 C; 1F0Z A; 2RMM A; 2MBB B; 4FJY A; 3V6C B; 1JCK B; 1QOB A; 2QJL A; 1WXV A; 4MDK E; 3DQV A; 4K7U A; 4B0M A; 1WY8 A; 3PVL A; 3HVD A; 4KDI C; 2CHZ A; 4ZYS A; 1SJE D; 4LCD E; 1WGK A; 3B0A A; 3PLV A; 3AE7 B; 4RGN A; 1PGX A; 2LGI A; 1YIW A; 4ASW C; 1KH0 A; 1S3S G; 2DEN B; 1SIJ A; 4REZ A; 2MSE D; 5D6J B; 2KD0 A; 2LZ6 A; 5EE0 A; 3VTW A; 2D07 B; 4XX5 A; 4YTN B; 5IP4 D; 2CHX A; 1WJ6 A; 2ZJD A; 2PLP A; 5FR3 A; 1R4M I; 2UU7 A; 3UGB B; 1RRB A; 2K6Q A; 4HRS A; 3TBL D; 3C0R B; 4C4V B; 2YLM A; 3PRZ A; 3QAR A; 4DHZ B; 3Q8B A; 2DHZ A; 2PTL A; 4LK0 M; 4GOC A; 1ZPS A; 5JH5 C; 4PS3 A; 3R8B A; 5HKH A; 1LXD A; 1L0X B; 3Q3J A; 2PVG C; 5AZG A; 2LD9 A; 3APF A; 3LJ3 A; 2LFI A; 1E7U A; 1KLG D; 2AEH A; 3ZNZ B; 2PEA A; 4K3B A; 2KJH B; 3A33 B; 3N1X C; 3ZGZ A; 5DCN A; 5LXH A; 1JRU A; 1GB4 A; 3BY4 B; 2LAS A; 4CO7 A; 4W9G A; 1D4B A; 3SR6 A; 1JRO A; 2J0M A; 3GOE A; 1WGH A; 1I4R A; 2KT7 A; 1MG4 A; 1YD8 U; 3T3N A; 4US9 A; 1L5P A; 4HPP A; 3VVW B; 2Y3A A; 1IP9 A; 1TJE A; 2KMC A; 2WU2 B; 2RDB C; 1FXA A; 1TZ1 A; 1UWM A; 4BVU C; 3DVG Y; 4XC2 A; 1FFV A; 4GDL B; 2L1A A; 4A55 A; 3KWL A; 3NS1 A; 1V81 A; 4NZL B; 3Q14 C; 1E8W A; 3MFG A; 5C1Z A; 1PDX A; 3I63 C; 3QA8 A; 3NJT A; 3PSE B; 3LYY A; 1ROE A; 4NAW A; 3JVZ X; 3GP7 A; 1KLV A; 4MJS A; 3HUI A; 4TQ1 A; 2KKC A; 2IPK D; 2KO3 A; 3U7D A; 1FNW A; 2YVC A; 4IC7 B; 4YWG G; 4AJW A; 1J7C A; 4E3C A; 3FIL B; 2XEW A; 1FPY A; 1PYW D; 1Z2M A; 3WAL A; 2W82 A; 4PT5 A; 2K22 A; 2LVQ A; 4PS8 A; 2JWZ A; 2W55 A; 2MJD A; 4MGI E; 1V1P B; 2K25 A; 4W9F A; 2V4L A; 4BBN F; 2DWQ A; 2MHJ A; 3URY A; 2JZP A; 4EUT A; 2VH2 A; 3FIL A; 2GRI A; 1I4P A; 2ZPY A; 1FXI A; 3U4E G; 1WM2 A; 4IUM B; 3K9O B; 2NTT A; 3R7R A; 2XNA C; 2VZK D; 4BKS A; 4B0E A; 1C1Y B; 2LVP A; 1JWM D; 5G5H A; 3APD A; 1FNV A; 2ZVO A; 3B08 A; 3Q6B A; 3W9C B; 4H2A A; 1FFU A; 2BVC A; 2AX5 A; 1TKE A; 4S17 A; 4WJP A; 2J4X A; 3PRP B; 2QDF A; 2IBI B; 1I42 A; 1RLF A; 2ACZ B; 2D3G A; 3Q8E A; 3TMP B; 2D10 A; 4JLC A; 2M8S A; 2JQR B; 3NY5 A; 4HPM B; 3IXS A; 2D2Q A; 3VQI A; 3ZRF A; 5CX3 A; 3NVV A; 2K8B A; 4ZRJ A; 3KW5 B; 2KTF A; 4WWM A; 4DWF A; 3MJW A; 1XCQ L; 1T0Q C; 1UEL A; 4JQW C; 2N7J A; 2FBW B; 1D5M C; 1S1Q B; 1VD2 A; 2JUO A; 4HCP B; 4C7Z A; 4YSY B; 3U30 A; 4IKG A; 1XLQ A; 1H8C A; 3NVW A; 1IBX B; 2J42 A; 1V49 A; 2D5G A; 3MHZ A; 5GXG B; 2EKI A; 4X57 B; 2RR9 A; 2KWC A; 5D7G A; 4HRO A; 3QAQ A; 1V97 A; 5LNK 1; 4HCN B; 2GI9 A; 4A8X C; 1V8C A; 3N32 A; 1IBX A; 1QOA A; 3AE6 B; 4M0W B; 4US8 A; 2KLG A; 1MHH E; 3BYT B; 3ZVV A; 1HE8 A; 4EZL A; 3UIP B; 5KHO A; 1GG3 A; 2MLB A; 1DOX A; 1UZX B; 2D3C A; 1C4C A; 4TMA B; 4RCO A; 1DGJ A; 2L0T A; 1WJN A; 5TR5 A; 2JZZ A; 3IT4 B; 1L2N A; 2BS2 B; 2K9X A; 3L08 A; 1R4M B; 3NVY A; 2G9H D; 1NYR A; 3X23 A; 4BAX A; 3SU8 X; 4IM0 A; 4RFB A; 1V5O A; 2QMT A; 5C23 A; 2NBW B; 3VH4 B; 2INN E; 4PK1 A; 4BFR A; 4P6V F; 2G3Q B; 4BZA A; 4ZRP A; 3HHM A; 1WXQ A; 2INP E; 4N59 A; 5G55 A; 4N9F 4; 2C7H A; 1DOY A; 3NRZ A; 3P1M A; 3S2A A; 2BS3 B; 3R3M A; 3Q2A C; 3AED B; 1XCT L; 3BVG A; 3NOB A; 1BML C; 3E56 A; 2QIE B; 2C9W B; 1NBF C; 4E71 A; 3K9P B; 3RCZ A; 2KOX A; 1CMX B; 2GLS A; 2IY1 B; 2RPV A; 3PGE A; 3L16 A; 2KZR A; 3DBR I; 2PIA A; 4RF1 A; 1C9F A; 1KTK A; 4P1C C; 1HZ6 A; 5FR6 A; 2NBU A; 4OZB A; 4DHJ B; 5L83 A; 1WYW B; 4WUR A; 2WXH A; 3ENE A; 3HVZ A; 1V5T A; 3VFK A; 3P4Q B; 3GE8 C; 3NZU A; 4AQ7 A; 4GLS C; 1F52 A; 1I4G A; 3TSS A; 4DXA B; 1ZUD 2; 1I35 A; 5JHA A; 2ASQ A; 2CHW A; 2BGF A; 1YN3 A; 4K3C A; 5TSS A; 4CHK A; 3AXC A; 1L4D B; 2G4S A; 1HZ5 A; 1WFY A; 2INC C; 2PE6 B; 2MX2 A; 1L4Z B; 1WI0 A; 3ZW3 A; 3H8H A; 3RZW C; 1WXA A; 1LM8 B; 1WF9 A; 3AEE B; 1JWS D; 4AS1 A; 2JWU A; 1H4R A; 1ET9 A; 2O2V A; 1UF0 A; 2WXM A; 2HE7 A; 2B76 B; 2N7E A; 2B3A A; 2LGX A; 1FRR A; 3W2D A; 1SEB D; 4EFO A; 1FRD A; 3DBL I; 1L7Y A; 4WJN A; 3HIZ A; 4GXB A; 1WX9 A; 1CJE A; 2KN4 A; 1WRI A; 1WH3 A; 2C7M B; 2ZNV C; 1DYQ A; 2A4Z A; 4HDQ A; 3L10 B; 1YOV B; 1B1Z A; 1LFD A; 2GBR A; 1ESF A; 2QHO A; 4MH0 E; 3D32 A; 2FUG 1; 1ZXH A; 3RUI B; 4K7S A; 1E9M A; 2PMV A; 1B9R A; 2MBH A; 1IGC A; 3VTV A; 2Z0E B; 2CJO A; 2KMA A; 4PYU A; 1RYJ A; 3PTF C; 5HFY A; 4W9E A; 1ZP0 B; 1WZ0 A; 5E6N A; 4ZRQ A; 2ZEQ A; 3QIJ A; 2K39 A; 4XWW A; 2LHE A; 2BTE A; 2WQY B; 3CF6 E; 1N5W A; 5FK9 C; 1GPX A; 1NEN B; 4URK A; 1QKZ A; 4ITK A; 3UI3 A; 3ZTD A; 3ZXV A; 3UIO B; 2C5L C; 1XQQ A; 4L2Y A; 2NTS A; 4YTP B; 2GMI C; 4B9K A; 3AEB B; 2RDH A; 3ZKJ C; 5DPW A; 2EEL A; 4MEL A; 2K1F A; 2WDV B; 1I4X A; 1OQR A; 4WAF A; 2IY0 B; 2LI5 A; 1V1O A; 5DPT A; 2NPT B; 1AN8 A; 2KX3 A; 5C3J B; 1P0R A; 2BYV E; 3IAM 1; 1N63 A; 4P16 A; 4RGO S; 2DYB A; 1QOG A; 2NPT A; 2WDR B; 3PLU A; 4MSM B; 1GNU A; 1JRP A; 2BBC A; 3L0W B; 3AE5 B; 1XD3 B; 4WWP A; 3DHI C; 2WXR A; 3QJZ A; 4NQK E; 1E5W A; 2WLB A; 2K6D B; 2PE9 A; 4WQM A; 1SF0 A; 2WXP A; 1C79 A; 4DHZ E; 4PYZ A; 1P7E A; 3KLS X; 4HVB A; 2KTR B; 3IAS 1; 3T9L A; 3AMZ A; 1HTQ A; 4WQO B; 3PHW B; 4OVZ A; 1CQV A; 2WWZ A; 1D5Z C; 2WXN A; 3BII D; 2KTR A; 1MG8 A; 4KKJ A; 2JRH A; 1ZKH A; 3MJ5 A; 1E90 A; 2KYW A; 1XF5 L; 2AQ3 B; 2KJ6 A; 2KC2 A; 1ISN A; 2BS4 B; 2MJ3 A; 4JGH B; 3VAW A; 2EMS A; 3APC A; 3DHH C; 2LJ5 A; 1YJJ A; 3DBR B; 3H1U A; 3N20 C; 2D11 A; 4IM3 A; 2WX1 A; 1VRA B; 1TS3 A; 2BB5 A; 3AEG B; 4AJY B; 3VUY A; 5CHF A; 2NVU I; 4NNJ B; 2L52 A; 3RD2 A; 4FLH A; 3MC8 A; 1P9D U; 4AP4 C; 3WCQ A; 2MQJ A; 3DHG C; 1V6E A; 3EA6 A; 2XN9 C; 3RZF A; 5EE3 A; 1GUA B; 1T0Y A; 4JWU C; 3VDZ A; 3KUC B; 1ZXI A; 4KKI A; 4HPL B; 1JML A; 1Y8R C; 3AV8 A; 4A3O A; 4C4V A; 4XGA B; 1E7P B; 1UUP A; 2KDE B; 4HEA 1; 2M56 B; 3KQ4 A; 2N1V A; 4OW0 A; 3L17 A; 3A1Q B; 4FN2 A; 4TKN A; 1E8Y A; 2DYM A; 4GU2 A; 3WAP A; 2KN5 A; 2MH7 A; 2AQ1 B; 2JXX A; 2JYE A; 3RN9 C; 3NVZ A; 2IO0 B; 2NMQ A; 2MJE A; 2M0X A; 3QCA A; 4TQ0 A; 3A1Q A; 2HDE A; 2WXO A; 1M94 A; 3ML8 A; 1AW7 A; 1FCC C; 1TKY A; 2HJ8 A; 1WMH B; 2E6X A; 1FEH A; 4RGT A; 1Y56 A; 1ZE3 D; 2JYT A; 3OJ3 A; 2BF8 B; 1OEY J; 4FA6 A; 3Q3F A; 2LGY A; 2SAK A; 1BXT A; 2WXF A; 3PS6 A; 2FUH B; 1WMH A; 3E9S A; 3MC9 A; 4N6E B; 3U7Z A; 2UWQ A; 1JWB D; 1WR1 A; 4GDL A; 1KJT A; 1D3Z A; 1EM7 A; 1TYG B; 1XT9 B; 1A70 A; 1RWS A; 1I7H A; 3ZJT A; 3T8M A; 3L54 A; 2X8X X; 4GB9 A; 4NJ6 A; 3ABV B; 2BYF A; 4MGZ E; 2KFK B; 3O65 B; 3VR8 B; 3P2B A; 4D2K A; 1Q10 A; 1PGA A; 1WZ3 A; 3EC8 A; 4K81 A; 1MPE A; 3N9Y C; 1YQ4 B; 3DBH I; 4HKQ A; 3IVF A; 1RFA A; 2ZW0 A; 2N9P C; 2KFK A; 4B95 A; 1X1M A; 4F8C B; 3AM9 A; 1KM7 A; 2XK5 B; 4MEM A; 2IGD A; 4RNA A; 3GS2 A; 1V1P A; 3RYT A; 3ZTC A; 3A4S C; 2HTH A; 2WYQ A; 1C76 A; 3WAO A; 4QAY A; 1R4N I; 3GB1 A; 2KWV B; 2C7N B; 1SGH A; 1J7B A; 4LLG M; 4RH6 A; 4AWJ A; 4W9D A; 1TY2 A; 3ZRC A; 1EWC A; 3OJ4 B; 3NUH B; 1PQS A; 3KWV A; 2FCN A; 5LXI B; 3RNG C; 3N3K B; 1GB1 A; 4II2 B; 3IT6 B; 2JF5 A; 1YN5 A; 2LGS A; 4K1R B; 2Y5P A; 2FIF A; 2XBB C; 4EEW A; 3Q8A A; 5E6O A; 1K52 A; 1SE9 A; 2MBO A; 2V1Y A; 2M19 A; 4LNO A; 1D6E C; 1P3Q U; 3Q8C A; 4AUQ C; 3C19 A; 1E7V A; 1IUE A; 3UF8 A; 2V0G A; 4KGS A; 2G1E A; 2L8J A; 2MWS B; 1OFF A; 2FCS A; 2PPH A; 2V9H A; 5KHQ A; 5IN7 A; 2KX0 A; 4RF0 A; 1SBB B; 1SB3 C; 2AL3 A; 2FCM A; 4KSL C; 2PW9 A; 3BYY B; 2LXC A; 3IFW B; 2O6V B; 3MP9 A; 1TS4 A; 3BIN A; 2KXJ A; 3B2G A; 5JXV A; 1YJ1 A; 3BVM A; 2ZPN A; 5BMH A; 3PT2 B; 1XLP A; 4LNN A; 1XO3 A; 2L0F A; 4WWO A; 1J7A A; 2O6V A; 1PUT A; 1T0S C; 4G11 A; 3TUO A; 4FAD A; 2X38 A; 1WX7 A; 2RPQ A; 1N62 A; 3ZIM A; 1FMA D; 2N9K A; 3RNA C; 1L6V A; 4M0W A; 1OQQ A; 3TJP A; 3I9V 1; 5CHW A; 2DZI A; 2IJ0 A; 1QLB B; 2HD5 B; 3QX1 A; 2WP9 B; 5H8Y E; 4E74 A; 2ZW1 A; 3VRA B; 4ANV A; 1BUI C; 3TEZ A; 4NY0 A; 4OZA A; 2KQ4 X; 2WXJ A; 5IA7 A; 3ALB A; 3ECI A; 4L23 A; 3RNF C; 2RSU A; 2Q5W D; 1FCL A; 1K51 A; 2L05 A; 2NCN A; 3VUX A; 3VUW A; 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2LMC A; 2WNM A; 4F7Z A; 1IGD A; 4KSK C; 2J53 A; 3MC0 B; 3MTN B; 3NG0 A; 2GOW A; 5EE1 A; 2QC8 A; 3H7P B; 4ARI A; 2KK8 A; 2LJI A; 1SE3 A; 1GAQ B; 4LJO B; 3W5V B; 5IO9 A; 3P42 A; 2MEK A; 4C80 A; 4C7Y A; 1I4Q A; 2Z59 B; 3NZS A; 3H7P A; 1F2R C; 1A5R A; 4CQN A; 4DK5 A; 1TTN A; 2WXL A; 4YSZ B; 1TGZ B; 1KF6 B; 3KUD B; 1WGD A; 3PZ8 A; 2H89 B; 3DBS A; 4ICU A; 2ZNV B; 2KWD A; 4O1N A; 1ZDX A; 4KIK B; 4IOI E; 2MP2 B; 1U4A A; 1J8C A; 2DNF A; 2LGD A; 3Q8F A; 3VHT C; 3NHE B; 4HKZ E; 1P1A A; 4YT0 B; 3BWU D; 3QC8 B; 3BVZ A; 3KH0 A; 2JU6 X; 1TIF A; 4BBN C; 4KZ0 A; 4FBJ B; 4KIK A; 2MP2 A; 3JW0 X; 3PRM B; 2KDI A; 1VZ6 A; 1NYQ A; 5AUK A; 2L83 A; 5D2M B; 1N61 A; 4ANW A; 2HTM E; 4OHJ A; 1NI3 A; 2EMT A; 3B2F A; 2PJH A; 4ZRI A; 4MM3 B; 2J0K A; 4R3D A; 2IDY A; 1SE2 A; 1IPG A; 3AE8 B; 3V05 A; 2FID A; 3N1Z C; 4YSX B; 1KFY B; 3RNE C; 3EFU A; 4W9K A; 1XLO A; 1QZE A; 1GOZ A; 4B6W A; 2LUE A; 4MGY E; 4MM3 A; 1JWU D; 4BKG A; 1STE A; 1UH6 A; 1TS2 A; 2MA9 B; 2K5P A; 2KNB A; 3P63 A; 1SSN A; 2M17 A; 2PVO D; 3A9K B; 4NJC A; 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