The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
EEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTADVADKGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Protein L
|
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
18
|
| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1K50 A; 1MHH E; 2GI9 A; 1UWX A; 2J52 A; 4OZA A; 1F2R C; 1IGD A; 2GB1 A; 1MI0 A; 4KGS A; 4WH4 A; 1JML A; 1FD6 A; 3FIL B; 1EM7 A; 1GB4 A; 4IOI E; 2QSD A; 2KDM A; 2JWU A; 2ZW1 A; 1D4B A; 1HZ5 A; 4D2K A; 2LHE A; 1IBX A; 3GB1 A; 2RPV A; 2JSV X; 3MP9 A; 4KGT A; 2LGI A; 1KH0 A; 1PGA A; 2IGH A; 1F2R I; 2JU6 X; 1P7F A; 5HFY A; 1XF5 L; 4IKG A; 1HEZ E; 1YNT E; 2ZW0 A; 1XCQ L; 4GLS C; 1K52 A; 2J53 A; 2ONQ A; 1HZ6 A; 5BMH A; 2QMT A; 1FCC C; 2KWD A; 3V3X A; 4OZB A; 5BMI A; 1MHX A; 1MPE A; 2N9L A; 1C9F A; 1QKZ A; 1K51 A; 1K53 A; 1PGX A; 2K0P A; 1GB1 A; 3FIL A; 5HG2 A; 2N7J A; 4HKZ E; 1Q10 A; 2N9K A; 2I38 A; 4KGR A; 5BMG A; 2PW9 A; 2I2Y A; 1ZXH A; 5HHD G; 2ON8 A; 1XCT L; 2LHD A; 5JXV A; 2KAC A; 2RMM A; 4MAC A; 3UI3 A; 4OZC A; 2NMQ A; 5HI1 A; 1IBX B; 1FCL A; 2EEL A; 2IGG A; 2JXT A; 2JZP A; 2OED A; 2LUM A; 2KQ4 X; 4HJG E; 1MVK A; 2PLP A; 1IGC A; 2PTL A; 1P7E A; 2KN4 A; 1YMH E; 2IGD A; 1PGB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1V2Y A; 2KFK B; 1A70 A; 1UEL A; 2GBR A; 4DQO C; 1KOT A; 2W55 A; 1T0Q C; 3M63 B; 3CWI A; 4W9F A; 5D2M B; 1KLU D; 4RMA A; 4G11 A; 2L0T A; 3Q8C A; 1JML A; 3AE3 B; 4RGN A; 4WWN A; 1R4N I; 4QAY A; 1FFU A; 1IBX A; 1XXG A; 3N1Y C; 4W9L A; 4E3C A; 1TGZ B; 2ZVN A; 5E6N A; 3EFC A; 2Y5B B; 4ANX A; 4MM3 B; 2BPS A; 3B1L X; 4WUR A; 4AOF A; 1F52 A; 1A5R A; 4EE2 A; 5IA7 A; 2G1E A; 4LTU A; 3N32 A; 1DOI A; 4MM3 A; 1YN5 A; 3MJW A; 3K9P B; 1KM7 A; 2YLM A; 2LVP A; 3A4R A; 1NYQ A; 3NY5 A; 2KMM A; 2QIE B; 4IW0 A; 1BML C; 4EFO A; 3ZJU A; 3EA6 A; 2RR9 A; 3CSF A; 1BUI C; 4E71 A; 2Z0E B; 1H4R A; 5BMG A; 1NEN B; 3X0W A; 4MJS A; 2DWQ A; 1EUV B; 1WGH A; 4TQ0 A; 3VUX A; 2VRR B; 2D5G A; 1QOB A; 4MEM A; 3IFW B; 2EEL A; 3Q3N C; 5IN7 A; 4WJQ A; 1VCB A; 3B2F A; 5CHW A; 2QIL A; 1MVK A; 4ICU A; 4HPM B; 2H88 B; 3DVN U; 2ZNV C; 1P7E A; 3DVN V; 1V86 A; 2CKH B; 3IG3 A; 1WYG A; 2MQJ A; 3RMK C; 3WAO A; 4OHJ A; 3ZXV A; 1WJ4 A; 1UNS A; 3PVL A; 4XZ4 A; 3DBL B; 4HDO A; 2MJE A; 3DCG A; 3DHG C; 2LMC A; 1SB3 C; 2VZK B; 3KWV A; 3RI7 C; 2JZ3 B; 2N9E B; 3EUB 2; 4CQN A; 3ZW3 A; 4FXC A; 3V62 A; 4TMA B; 3RFZ B; 4DDG D; 2WXO A; 1AWD A; 4RF1 A; 3BK1 A; 3VUW A; 3MFG A; 3T8M A; 2L00 B; 3TMP B; 2DZM A; 5EDS A; 1J0G A; 2RDB C; 4J6I A; 5AUI A; 4ANW A; 2BKR B; 4DHJ B; 4WQO B; 2KQS A; 3SR6 A; 4OVZ A; 4DK5 A; 1V97 A; 2BS2 B; 2J53 A; 3R2I A; 4K3C A; 5MPO A; 4AJY B; 4GB9 A; 2BW2 A; 2QJL A; 3V6E B; 2QCZ A; 2L0F A; 1JRP A; 3IAM 1; 3E9S A; 3L4P A; 3KUC B; 2N9L A; 1U4A A; 3AXC A; 4NY0 A; 2K8C A; 4LDT D; 1D5M C; 2NCN A; 3GP7 A; 4FJY A; 4HPP A; 4JLC A; 1V80 A; 1N62 A; 2KNB A; 4AUQ C; 1HTQ A; 2L1A A; 5JXV A; 2RMM A; 3UI3 A; 2AQ2 B; 1QT9 A; 2FBW B; 3DBS A; 2G4S A; 1NYR A; 4HJK A; 1L0V B; 4W9K A; 1UBI A; 3LB8 C; 2NBW B; 1FCL A; 1FM0 D; 4II3 B; 1KRH A; 2WDR B; 3FAH A; 2LUM A; 3OWE B; 4ZDV A; 1VD2 A; 1TKY A; 1UH6 A; 4YWG G; 1QF6 A; 2LZ6 A; 2PTL A; 3JVZ X; 2KO3 A; 5IKC M; 1LQB A; 1WJN A; 5FR3 A; 1WX8 A; 2N0S B; 3ALB A; 2WXJ A; 1N61 A; 2KMC A; 3VQI A; 3N20 C; 2DEN B; 2SEB D; 3BVM A; 1M94 A; 1IGD A; 1T3Q A; 2GB1 A; 1D5Z C; 4KGS A; 4NPN A; 4PS7 A; 3A9K B; 4WWO A; 4KZC A; 3VXW A; 3GZN I; 3LDZ E; 4WJO A; 4YSY B; 3L10 B; 1ZGU B; 3VDZ A; 3I5J C; 4FN2 A; 2AQ1 B; 4HPL B; 1AN8 A; 4YXD B; 2KVZ A; 1WM2 A; 3ABV B; 1KH0 A; 2AQ3 B; 3GE3 C; 1WXS A; 3A9K A; 3ML9 A; 3MC9 A; 4JX1 C; 4WJN A; 1VZ6 A; 1QLB B; 3IVF A; 4NJ7 A; 4M01 A; 2M0A A; 3H7P B; 1HZ6 A; 2KXJ A; 2L05 A; 1E6E B; 1FCC C; 1GUA B; 4IWP A; 1R4N B; 4BOZ B; 1WZ3 A; 4P7I A; 4YL8 A; 2PEA A; 2UWQ A; 1OQQ A; 1MPE A; 2LRU A; 3AH7 A; 2WDV B; 2K5P A; 3NZU A; 2RSU A; 3PRM B; 1V6E A; 4KGR A; 4ANU A; 1TS3 A; 2LXC A; 3R7Q A; 4ZRI A; 2HJ1 A; 2PJH A; 3AED B; 2K8H A; 2IDY A; 2KDF B; 3MC8 A; 2G45 B; 4F8C B; 3NVV A; 3QK0 A; 4DHZ E; 3DOW A; 1JWM D; 2LXA A; 5EE1 A; 1L6U A; 4USA A; 1V81 A; 2M19 A; 1NEK B; 2KN4 A; 1YMH E; 2DNF A; 2Y3A A; 1PGB A; 3SDL C; 1TY2 A; 1FXT B; 3HVZ A; 3DBH I; 2GBN A; 3AN1 A; 1TZ1 A; 2OJW A; 1YX6 B; 2REX A; 3V60 A; 4DXA B; 2V3S A; 1G6J A; 3QA8 A; 1ESF A; 5D94 A; 1HZ5 A; 4IG7 B; 5BYQ A; 3GE8 C; 3RCZ A; 4FBJ B; 1C76 A; 1STE A; 2LGI A; 3GOE A; 2G9H D; 1P7F A; 3KUD B; 2FCQ A; 2QC8 A; 3AE6 B; 2NVU I; 2ZW0 A; 1WMH B; 1XCQ L; 4HLE A; 2INC C; 1V1P B; 4PYU A; 4YSX B; 5J17 A; 5D3I B; 1JWU D; 5G5G A; 3V3X A; 5C23 A; 3ZLZ A; 1XT9 B; 4ANV A; 2BGF A; 1ZDX A; 1WMH A; 1FO4 A; 1FXI A; 1L5P A; 1VR9 A; 1V1P A; 4FUL A; 4RM8 A; 4RM9 A; 4NAM A; 3VH4 B; 1WJ6 A; 5LXH A; 3PSE B; 2DLB A; 3VTV A; 2GBK A; 2Q5W D; 1WSP A; 4S0R A; 2AWT A; 4LNI A; 3RPF C; 3EGR A; 3BY4 B; 1KLV A; 4MAC A; 4LLG M; 5D3D A; 1QOA A; 4HEA 1; 2EMS A; 2O2V B; 2L52 A; 4K1R B; 2NMQ A; 4BVU C; 2IYD B; 4B95 A; 1E7U A; 3OG5 A; 3PV1 A; 4H2A A; 3AE8 B; 2WXF A; 1JWB D; 2O2V A; 1SEB D; 1Q5W B; 2K39 A; 2L76 A; 4KSL C; 1BXT A; 2KWV B; 1QOG A; 3DHI C; 4OVU A; 2V3N A; 4G0N B; 2N4F A; 3ZUN A; 4B0M A; 4MSQ B; 4OZA A; 2WXH A; 2NR2 A; 2LEK A; 2BB6 A; 5FR6 A; 1PYW D; 1E8W A; 2KHW B; 3W9C B; 4GMV A; 1C4A A; 4XDD A; 2WXR A; 3LXF A; 4KSK C; 1E9M A; 1P3Q U; 3R8B A; 2GRI A; 5DPW A; 4AWJ A; 1ET6 A; 1V9J A; 2DBY A; 3ZNZ B; 5IO9 A; 1YQ3 B; 5LXI B; 3ZJV A; 1HEZ E; 2HD5 B; 1T0S C; 4HWI B; 2ZZP B; 3SFE B; 1I4R A; 1RFA A; 2CS4 A; 3GZN B; 4WIP A; 2XNA C; 3A1Q A; 2PIA A; 2WDQ B; 4EUT A; 5AUK A; 1GC7 A; 4CYE A; 4A8X C; 4ZOH C; 3KW5 B; 2N1W A; 3VR9 B; 1J8C A; 2FID A; 1SE9 A; 1MFW A; 2MBQ A; 2DAJ A; 2KWU B; 4EEW A; 1E8Y A; 3Q8B A; 1R4M I; 2PW9 A; 1XLP A; 1FNW A; 3BK2 A; 2ON8 A; 4BBN C; 1I42 A; 3TBL D; 2ZPY A; 4BKG A; 2KQ7 A; 4MH0 E; 3UIO B; 2C60 A; 1SJE D; 1CMX B; 3JSV B; 2W3R A; 2JXT A; 1NI2 A; 1D3Z A; 4JGH B; 1AW7 A; 3PHW B; 1NBF C; 2MJ3 A; 1S1Q B; 2DX5 B; 2LJ5 A; 1RWS A; 1J19 A; 2FUH B; 3BII D; 5BYS A; 1V49 A; 2JZZ A; 2X8X X; 3WA0 A; 4P6V F; 2CHX A; 3A4S C; 2CHW A; 3ONS A; 1FEH A; 3HVD A; 1C4C A; 3IXS A; 4CHK A; 2WU2 B; 3HHM A; 3TEZ A; 1BT0 A; 1ZP0 B; 2KWC A; 2MBE A; 2UU7 A; 1VJK A; 3AMZ A; 2J0J A; 1QZE A; 1WXQ A; 3M3J A; 1XEE A; 3SEB A; 1XLN A; 2RPV A; 2XEW A; 5DPT A; 3NS1 A; 4W9D A; 1I35 A; 2IGH A; 2M17 A; 4II2 B; 5AZF A; 3Q3M C; 2K22 A; 3DBR B; 3MTN B; 1ZE3 D; 2J0M A; 2KFK A; 2W9N A; 2QMT A; 2BYT A; 4KKI A; 3AE1 B; 1MG4 A; 2BF8 B; 1RRB A; 1C9F A; 2AX5 A; 2N7E A; 2K6Q A; 2N9K A; 1ZKH A; 4A3P A; 1DOY A; 1EF5 A; 3RNF C; 3VHT C; 3J9C A; 3U30 A; 2DZI A; 4X57 B; 3AI5 A; 2DAF A; 3ZKJ C; 2NS5 A; 1WFY A; 3NHE B; 5CHV C; 3UIP B; 2WXQ A; 3B0A A; 1RLF A; 4NJC A; 2GBM A; 3Q69 A; 2JWZ A; 3I9V 1; 2WDT B; 2B3A A; 1I4G A; 4JPS A; 1VDV A; 1OQY A; 1XLQ A; 1WX9 A; 3I57 A; 3AEE B; 2DYM A; 2MEK A; 1H8C A; 2BVC A; 4JQW C; 4IM2 A; 1XO3 A; 1T0Y A; 2WWZ A; 2I1J A; 1T5X D; 3UQB A; 1Z2M A; 4DXF A; 4URK A; 3DHH C; 5E6J A; 2WLB A; 2WU5 B; 3H1U A; 1Q1O A; 2FAZ A; 1ZXI A; 1YOV B; 4GDK B; 3BVG A; 2ZVO A; 5E6O A; 2JT4 B; 4KIK B; 3ETR A; 2L8J A; 5G55 A; 4N9F 4; 4IM3 A; 5CHF A; 4KV2 A; 3HK0 A; 1F1H A; 5T8I A; 2KOX A; 3AU4 A; 1XQQ A; 5JHB A; 3P4R B; 4KIK A; 2JQR B; 4TQ1 A; 2ACZ B; 2RDH A; 2GOW A; 3AE7 B; 4W9E A; 3RD2 A; 3ZRC A; 1C77 A; 2BWF A; 3ECI A; 2V3P A; 1J7C A; 4LNN A; 4ICV A; 1WWT A; 4LJO B; 1QIL A; 4EOY A; 3AEG B; 3AB5 A; 2NBV B; 1XCT L; 3SD5 A; 4XDC A; 3HRD D; 4IWO A; 3A9J B; 1E7P B; 4B6W A; 3KWL A; 1JCK B; 1WXA A; 2N9P C; 3R2T A; 3U52 E; 2WX0 A; 4ASW C; 3WAL A; 1Z5S B; 2J4X A; 3NG0 A; 2G3Q B; 2OED A; 1IP9 A; 1JWS D; 1R4M B; 2TSS A; 3P4Q B; 2Z0D B; 1KJT A; 3PZ7 A; 2CJO A; 1SBB B; 5LNK 1; 4O1N A; 3LYY A; 1EF1 A; 1I4X A; 3O13 A; 2R2O A; 3KH0 A; 1FXA A; 4A6Q A; 3ZGZ A; 5FK9 C; 2N9X A; 1P98 A; 1TS2 A; 2PPH A; 1Y8R C; 1UWM A; 3KLS X; 3OAW A; 1AYF A; 4UDU C; 2MP2 B; 1EM7 A; 1MG8 A; 3WAN A; 2KDM A; 2O6V B; 2ZW1 A; 1FNU A; 4PK1 A; 1I4Q A; 2M4N A; 3L13 A; 3ENE A; 2KTR B; 2MX2 A; 4K7W A; 4KX6 B; 1P0R A; 2JSV X; 3B2G A; 1WR6 E; 4WAF A; 5D6J B; 1JQ4 A; 4KDI C; 3SHQ A; 4C7Y A; 2JF5 A; 1DYQ A; 3DQV A; 3HM6 X; 2MSE D; 1SGH A; 3ZIM A; 4LK0 M; 2XK5 B; 3U4E G; 2KDE B; 1EU3 A; 1E0Z A; 2YEP B; 2NPT B; 5BMI A; 2VZK D; 1UBQ A; 1J7A A; 4US9 A; 2CU1 A; 1K53 A; 1B1Z A; 4HXD A; 1C3T A; 2KAJ A; 1FRR A; 1OFF A; 4L1B A; 4ZYS A; 2NPT A; 3D32 A; 1CJE A; 2AYO B; 4WQM A; 1M4V A; 1HQR D; 1V1O A; 4TKN A; 3HIZ A; 3RNB C; 1D5X C; 1LFD A; 3WIM A; 5JHA A; 2D3C A; 1LGR A; 2IY1 B; 4B0E A; 5HI1 A; 2IBI B; 3H7P A; 3WAP A; 1PFD A; 3VVW B; 4EZK A; 2KFJ A; 4HJG E; 2ICI A; 2PLP A; 2HE7 A; 4NZL B; 1WM3 A; 1IGC A; 3AU5 A; 2A5U A; 3Q8E A; 3I63 C; 4I6N B; 1KTK A; 4PYZ A; 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4C80 A; 2D2Q A; 1XLO A; 2ZCC A; 3Q2A C; 4MGY E; 1TS4 A; 4IOI E; 2JWU A; 3TEW A; 3ZDT A; 4EZJ A; 1KFY B; 1FIQ A; 4AS1 A; 1ZOY B; 3W1S C; 2BT6 A; 1YQ4 B; 3PZ8 A; 2UYZ B; 4K7S A; 3ZYY X; 1WZ0 A; 3ZNH B; 3VUY A; 4A55 A; 1N63 A; 2HTM E; 1YJJ A; 2ASQ A; 3IBE A; 3OJ3 A; 1N6Z A; 2EKI A; 1YD8 U; 2WXM A; 1WGD A; 3S2A A; 4DBG A; 2V9H A; 2HJ8 A; 1V5T A; 3PLU A; 3QJZ A; 2VH1 A; 4YTM B; 4BKS A; 5CX3 A; 1F77 A; 2K0P A; 1R7S A; 2N7D A; 1T0R C; 2LFI A; 2KJ6 A; 2I38 A; 4C56 C; 2IND C; 1WGY A; 1V5O A; 2NTS A; 3WCQ A; 3N1X C; 3OJ4 B; 2MW5 A; 4NQL B; 4ZHP A; 2KAC A; 3CIR B; 4W9H A; 1OGW A; 3AEA B; 3U7Z A; 1OTR B; 3IT6 B; 2KX3 A; 2L7R A; 3O65 B; 4LCD E; 3U2S C; 2DYO A; 1AAR A; 2JYE A; 4YTN B; 2H89 B; 3ML8 A; 3N30 A; 4EKU A; 2KLC A; 3ZTD A; 3Q3F A; 3SFD B; 4IWQ A; 5GXG B; 2KZR A; 1TBE A; 2FUG 1; 4BZA A; 1FNV A; 4L2Y A; 2IY0 B; 3TJP A; 1SE3 A; 3WAM A; 1YX5 B; 3W1S A; 2OJR A; 4BFR A; 3FIL B; 3OLM D; 2QSD A; 1YJI A; 2BS4 B; 2JX5 A; 3JSV A; 1HXY D; 2LGD A; 2FE8 A; 4HCP B; 1L2N A; 1ET9 A; 5BO4 B; 1DOX A; 2V1Y A; 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