The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
TGSLSVDNKKFWATVESSEHSFEVPIYAETLDEALELAEWQYVPAGFEVTRVRPCVAPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transcription
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| molecule keywords |
Bacterial RNA polymerase inhibitor
|
| publication title |
Structural and Mechanistic Basis for the Inhibition of Escherichia coli RNA Polymerase by T7 Gp2.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Enterobacteria phage t7
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| total genus |
10
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| structure length |
59
|
| sequence length |
59
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-11-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF16857 | RNA_pol_inhib | RNA polymerase inhibitor |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4LK0 M; 4LLG M; 2LMC A; 2WNM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JE3 B; 1HQR D; 1QOA A; 3R7R A; 3R3M A; 2FNJ B; 3WAP A; 1E6E B; 4GN1 A; 2R2Q A; 2NTT A; 4GMV A; 4F8C B; 1L6V A; 3PT2 B; 4LDT D; 4KVG B; 3L13 A; 3RUL A; 4FUL A; 2O6V A; 1LGR A; 2K1F A; 1R4M I; 4P1B C; 1GOZ A; 5G55 A; 1WI0 A; 1E9M A; 2WXP A; 2V0G A; 2LWP A; 3RFZ B; 1L6U A; 4HCN B; 4OVV A; 4IWQ A; 4REZ A; 1WR6 E; 3TJP A; 1K8R B; 4FXC A; 3MTN B; 2KFK B; 3ENE A; 1BML C; 2Y5P A; 2ZPN A; 2DZM A; 2WXK A; 2ZCB A; 5BMG A; 2BT6 A; 3V62 A; 2MLB A; 3DVN U; 1RLF A; 1B1Z A; 2L05 A; 4GB9 A; 3R66 C; 3W1S C; 2HDE A; 2C7M B; 2JZ3 B; 4ANV A; 3EUB 2; 4US9 A; 3Q8A A; 1JWB D; 3GP7 A; 4F1S A; 2JXT A; 3N9Y C; 2JRI B; 3U2S C; 1MHX A; 2MBE A; 2K39 A; 2KC1 A; 3AM9 A; 2WXM A; 1LFD A; 1XXG A; 4TSS A; 2FBW B; 1J8C A; 1OEY J; 2GB1 A; 2IY1 B; 1BXT A; 1E7V A; 4MSQ B; 3SHQ A; 4B95 A; 4HLE A; 2IYD B; 2KWU B; 2WXQ A; 2QIL A; 3A1Q A; 4PYU A; 4C4V B; 1P7F A; 2UWQ A; 3N30 A; 1OQQ A; 1IBX A; 3ECI A; 2ASQ A; 3H7S A; 4I6P A; 2PVO D; 1WMH A; 2KN5 A; 4WJN A; 3KVF B; 1KJT A; 4BBN F; 5LNK 1; 1STE A; 3N1Z C; 1T0Q C; 2PEA A; 3HIZ A; 2KC2 A; 2C60 A; 2CHW A; 3EC8 A; 3SD5 A; 2WXN A; 4N58 A; 1VDV A; 4C56 C; 5IO9 A; 1I35 A; 1I42 A; 4HJK A; 1UWM A; 5FR3 A; 1UNS A; 1LQB A; 2DYB A; 4FAD A; 2GOW A; 3U8Z A; 4IOI E; 1FNV A; 1WXA A; 3W2D A; 3NZS A; 3NRZ A; 2LXC A; 3HVD A; 1DGJ A; 4FJV B; 1C77 A; 2JRH A; 1YQB A; 5H8Y E; 3U52 E; 3VTW A; 3PRE A; 2K0P A; 2NR2 A; 5L83 A; 3VVW B; 4ZDV A; 2M19 A; 1WGG A; 3ZNZ B; 1A5R A; 1QQR A; 2IO1 B; 3VUX A; 1E7P B; 3P1M A; 1MI0 A; 3IFW B; 3TIX A; 2MQJ A; 3ONS A; 2QMT A; 1N63 A; 3WAO A; 2PVG C; 1WRD B; 2KLC A; 4MGK E; 3MJ5 A; 2BVC A; 1UZX B; 3DBR B; 2L0F A; 3GOE A; 4LNK A; 5D2M B; 4HJG E; 1XCT L; 4KIK A; 3ZVV A; 1EWY C; 2PE6 B; 4MM3 B; 2WGS A; 1I7H A; 5T8I A; 4HKZ E; 4US8 A; 1KLG D; 2BW2 A; 2L32 A; 4ZHO A; 2PPH A; 3Q3O C; 1ZDX A; 5C2T B; 1AAR A; 2KQ4 X; 3H7P B; 2D2Q A; 3ZNH B; 5D3I B; 3DHH C; 4WJP A; 3A9K A; 3QCA A; 3BK1 A; 4K7U A; 2NBU A; 4LTU A; 4EEW A; 4HRO A; 1IGC A; 1RYJ A; 2DZK A; 4MEM A; 3VDZ A; 1WXM A; 4QAY A; 1E8W A; 3KWV A; 4Q2J A; 3ZJV A; 3AEF B; 3ZRF A; 2INC C; 3ML9 A; 2MJD A; 3W1Y A; 2LVO A; 4BOZ B; 4MJS B; 1EO6 A; 4OZC A; 2HTM E; 3VUW A; 2WX0 A; 3LXF A; 1TS3 A; 3Q3F A; 2NPT A; 4J3O D; 3A4R A; 1IPG A; 3GS2 A; 3VR9 B; 2N9P C; 2D11 A; 3SEB A; 4LNN A; 1XCQ L; 2DEN B; 5BYR A; 3M63 B; 2EKI A; 2PMV A; 3GE8 C; 3V61 A; 4K3B A; 3T3N A; 2IGH A; 3PSE B; 4OZB A; 1FXA A; 4J6I A; 5HHD G; 3ZGZ A; 4G11 A; 1T0R C; 3LJ3 A; 4MDK E; 4MM3 A; 1UF0 A; 2KJH B; 2JU6 X; 1DOX A; 1PDX A; 1J0G A; 2KQ7 A; 2PJH A; 5D3D A; 1YMH E; 1JW9 D; 4LNF A; 2V3N A; 3PLU A; 1D5X C; 4OVZ A; 3JSV A; 2JY6 A; 3H7P A; 2DAF A; 3AE7 B; 2AL6 A; 5EE3 A; 2MRP A; 4B0E A; 2WX1 A; 4YSZ B; 1YN4 A; 3OG5 A; 3W1S A; 1C4C A; 4AP4 C; 1GPX A; 1UWX A; 1JAL A; 1V97 A; 1T0Y A; 3RYT A; 3S2A A; 5D6J B; 2JX5 A; 2NCN A; 1TJE A; 4K3C A; 4NJ6 A; 2WDR B; 1J7C A; 2WU5 B; 3W5V B; 1V1P B; 1RAX A; 4RF0 A; 4NQL B; 1OQY A; 3Q8C A; 1I4P A; 4WIP A; 2AQ3 B; 4O1N A; 2OHF A; 3RT3 B; 4FN2 A; 1YNT E; 1NI2 A; 2W3S A; 2E3T A; 4AS1 A; 1DYQ A; 4MGI E; 3AEB B; 3NZ3 A; 1UBQ A; 2BGF A; 2LGS A; 2KOX A; 5LXI B; 3PRP B; 2C5L C; 4ANX A; 1KF6 B; 1SEB D; 5CHV C; 1XLP A; 1ZOY B; 1WE7 A; 4I6L B; 2J53 A; 1HA5 A; 4P1C C; 3ABV B; 3N20 C; 2D5G A; 1JCK B; 1ZP0 B; 3K9O B; 3CSF A; 4NNJ B; 4YSX B; 1WRI A; 3QX1 A; 1TT5 B; 3IBE A; 4BKS D; 2IGG A; 3OWE B; 2KMC A; 3RNA C; 5BMH A; 3KYC D; 1F9J A; 1L2N A; 3ZKJ C; 1WGR A; 1WIA A; 2KHW B; 2MBB B; 3HUI A; 3NY5 A; 3QJZ A; 4FA6 A; 3AU4 A; 1T0S C; 2BF8 B; 1FPY A; 1YN5 A; 1PUT A; 3KYD D; 4WQO B; 3NUH B; 5E6O A; 2ONQ A; 1S1Q B; 2D07 B; 3Q8E A; 3L16 A; 1CK1 A; 4IW0 A; 1UD7 A; 4XYC A; 2MJ3 A; 4YTM B; 1NBF C; 1Z5S B; 3H8H A; 2BYV E; 1NVI D; 2WXR A; 2BKF A; 3Q3N C; 2ZEQ A; 4A20 A; 1VLB A; 4WWM A; 2IDY A; 1C76 A; 3PZD A; 4ANU A; 2CU3 A; 2QDF A; 3FKY A; 2B3A A; 3RNE C; 4YTN B; 5JHA A; 1I4Q A; 1AWD A; 4NJC A; 4DHJ B; 1OFF A; 3VHT C; 2IZV B; 1KOT A; 1OTR B; 1V80 A; 3VQI A; 1QOF A; 2G9H D; 2RD0 A; 2KAJ A; 4G0N B; 1UGM A; 1C1Y B; 1M4V A; 1UUP A; 4NY0 A; 2ZVO A; 3A9J B; 4II2 B; 1N61 A; 5AEK B; 2MHJ A; 1B9R A; 1WR1 A; 4HDQ A; 3ZLZ A; 4TKN A; 4EZK A; 4DXA B; 1MJD A; 5CX3 A; 3DVN V; 3FIL A; 4II3 B; 1R4N B; 2RPQ A; 3FAH A; 2LUE A; 3PRZ A; 1ZUD 2; 3P63 A; 2I38 A; 3EGR A; 1V1O A; 4BKG A; 2M17 A; 4HKQ A; 2FUH B; 5TR5 A; 3DBL B; 4JLC A; 2K8H A; 1KTK A; 2AQ1 B; 2N7J A; 4LLG M; 3DBR I; 2MJE A; 4HXD A; 4PT5 A; 4USA A; 2YLM A; 3MHS D; 2IPK D; 3DBH I; 2MCN B; 2CJO A; 1EF5 A; 3PO0 A; 2L76 A; 3RNC C; 4XDD A; 1E8Z A; 1WM3 A; 2I2Y A; 2X8X X; 4S17 A; 1PQS A; 3RPF C; 3V05 A; 1NYR A; 2V9H A; 4XC2 A; 2ZCC A; 4XDC A; 1I4G A; 3OLM D; 5GMV A; 3T8M A; 3DPD A; 2XN9 C; 4W9E A; 3NVZ A; 1SE2 A; 3R8B A; 1WH3 A; 3Q3M C; 4NPN A; 1N5X A; 4YL8 A; 2BS3 B; 5IN7 A; 1VJK A; 2W55 A; 3WAM A; 5AUK A; 2XEW A; 4RM8 A; 1ZXH A; 3TBL D; 3IG3 A; 3V60 A; 3U7Z A; 2Z0D B; 5G2N A; 1IBX B; 1HZ6 A; 2G45 B; 1SE4 A; 3BY4 B; 2ZVN A; 1WMH B; 1JWM D; 2NTS A; 1HE8 A; 4XZ4 A; 1MVK A; 4WAA A; 3A9J A; 3L54 A; 2O6V D; 2VZK D; 2KO3 A; 4ICV A; 4AQ7 A; 1HTO A; 2B76 B; 2N9X A; 2D3C A; 2JSV X; 1GG3 A; 1NI3 A; 2KJ6 A; 1TZ1 A; 1YQ3 B; 4N59 A; 2LGY A; 2BWE S; 2KKC A; 1SSN A; 5EE1 A; 3P4P B; 4RM9 A; 2KN4 A; 2D10 A; 2KK8 A; 4W9G A; 1F2R I; 5DCN A; 5BMI A; 4ZRP A; 2WXH A; 3OJ4 B; 1XT9 B; 2ICI A; 3C19 A; 4MH0 E; 4NZL B; 4IWP A; 4HK2 A; 5HI1 A; 1ISN A; 3N1Y C; 3ZTD A; 3H6N A; 1WZ3 A; 1F0Z A; 5L95 C; 3I63 C; 3U7D A; 4DDG D; 1CMX B; 1U4A A; 4IUM B; 3H1U A; 3GB1 A; 1BUI C; 2KNB A; 1J19 A; 4DHZ E; 3AED B; 2BS2 B; 1WY8 A; 5CTR C; 2XBB C; 3UIO B; 4HPM B; 1V2Y A; 1TS4 A; 3PS6 A; 2WWZ A; 3PTF C; 2DYO A; 1OGW A; 3NVW A; 2PIA A; 1V6E A; 3PHX B; 3UIP B; 4GOC A; 4P16 A; 4KIK B; 1XEE A; 5EE9 A; 3KW5 B; 1YJJ A; 5DPT A; 3O13 A; 3BVG A; 2Z0E B; 4YTP B; 3DBS A; 4BFR A; 2BWF A; 3Q3J A; 4CO7 A; 1P9D U; 1GJZ A; 3A9K B; 1RFA A; 2KWV B; 4IWO A; 4XGA B; 2A5U A; 5EE0 A; 2JWU A; 2CKH B; 3R2T A; 4HEA 1; 2KMA A; 4HDO A; 2LXA A; 2JZP A; 1YIW A; 4RCO A; 4L23 A; 2JPH A; 3VH3 B; 2V4L A; 5LXH A; 2DZJ A; 2JYT A; 1A70 A; 2L1A A; 4EZJ A; 2K22 A; 4I6N B; 1L0X B; 2WDQ B; 2KVZ A; 3SFE B; 1Y56 A; 2BTE A; 4DDI D; 2NPT B; 3AEE B; 3X0W A; 2KDB A; 1YX6 B; 4IM0 A; 3D32 A; 1QLB B; 2WYQ A; 1SB3 C; 3QAR A; 4LJO B; 4NAW A; 2K6Q A; 2W9N A; 4YXD B; 5J2R A; 4YSY B; 4OW0 A; 1DOI A; 2ZPY A; 2IND C; 1QT9 A; 1TS5 A; 3ZXR A; 3BZD B; 4DK5 A; 2MBQ A; 3H9D A; 2L00 B; 4W9C A; 2W54 A; 2LRU A; 5AZH A; 1FNW A; 3CIR B; 3BVZ A; 1E8X A; 3RD2 A; 2RDH A; 4A55 A; 3NS1 A; 5AZG A; 2AX5 A; 4M00 A; 2MEK A; 1RWS A; 3JSV B; 3ZYY X; 1VRA B; 4IKG A; 3I9V 1; 2GBN A; 4W9I A; 2SAK A; 3QHT A; 5AZF A; 1H4R A; 3MJW A; 3PLV A; 2JZZ A; 3QA8 A; 2V4I B; 4BZA A; 5DPR A; 1DOY A; 1F77 A; 5C23 A; 3TEY A; 1V5T A; 2M56 B; 2L8J A; 4N9F 4; 1VZ6 A; 4TUU A; 3AE1 B; 3X23 A; 2INP E; 2IJ0 A; 1C78 A; 1UEL A; 5CHF A; 4AJW A; 4RF1 A; 3APC A; 1WGY A; 4W9F A; 3RNG C; 3HRD D; 4ZRQ A; 2KDM A; 3RNB C; 1D5M C; 3A4S C; 2EMS A; 2K3U A; 1TIF A; 2EKE C; 4RGO S; 2KXJ A; 4K7W A; 1WM2 A; 4UDU C; 4ZRK A; 2MW5 A; 4M8N A; 4CHK A; 2KDI A; 3DVG X; 1X1M A; 2WDV B; 3ZQ4 A; 3T3O A; 2WXG A; 2C7N B; 4MEL A; 2PLP A; 1PGA A; 1J7A A; 4FJZ A; 2DYM A; 3AMZ A; 2WS3 B; 1RRB A; 1TZO A; 4RGN A; 1L7Y A; 4AUQ C; 4GSW A; 1V5O A; 2Q5W D; 1TTN A; 1TGZ B; 1Y8R C; 2KAN A; 2NBW B; 4CQN A; 1WJN A; 4AWJ A; 3P2B A; 1V9J A; 2IO3 B; 3LYY A; 4W9H A; 1HXY D; 5G5H A; 3EA6 A; 3ZXV A; 4B6W A; 3N3K B; 1WSP A; 3JW0 X; 3PVL A; 3TL5 A; 3MP9 A; 1WZ0 A; 3AE6 B; 5BO4 B; 4DXF A; 4WAF A; 4JL9 A; 2PTL A; 1J7B A; 1UBI A; 4L2Y A; 3EFC A; 4URK A; 1H8C A; 3URY A; 1D4B A; 1L4D B; 4HCP B; 2GRI A; 1F1H A; 1N6Z A; 1BT0 A; 2REX A; 3AU5 A; 2LVQ A; 3P4Q B; 3VRA B; 2GBM A; 4XWT A; 1PGX A; 1MG8 A; 2N1V A; 4OZA A; 2MBH A; 1SE9 A; 2MA9 B; 3VUY A; 5C3J B; 1P1A A; 4ZHP A; 3PRM B; 3DWM A; 1Z2M A; 4MT5 A; 4HVB A; 4G50 A; 4GIV A; 5G5G A; 5I4D A; 3N1X C; 4OVU A; 2K8B A; 1C4P A; 2DLB A; 2LI5 A; 1JRO A; 2RDB C; 3CMM B; 3PGE A; 3VTV A; 3HM3 A; 3Q14 C; 4EFO A; 4A6Q A; 3O65 B; 4ZYS A; 1WGK A; 3KUC B; 3BYY B; 1ZE3 D; 3FIL B; 2FAZ A; 3TSS A; 4ARI A; 4S0R A; 1CZP A; 2ZW0 A; 4XE0 A; 1PYW D; 1JQ4 A; 1TS2 A; 1QF6 A; 3BII D; 4KGT A; 1Q1O A; 3AV8 A; 3NG0 A; 2OJW A; 2IO2 B; 4JWU C; 5J18 A; 3I57 A; 1VR9 A; 3HVZ A; 4K1R B; 1VZ7 A; 3KLS X; 2NS5 A; 2CJN A; 5TSS A; 4B0M A; 2N9E B; 1T6B X; 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1FEH A; 1SBB B; 3R7Q A; 3EHV A; 2D3B A; 2Z8L A; 4AOF A; 4HWI B; 1TBE A; 3VRB B; 4XWW A; 2V1Y A; 4XX5 A; 3MC9 A; 4DHJ D; 2QCZ A; 2N9L A; 4W9K A; 1LO5 D; 1NEK B; 2DHZ A; 3I5J C; 3QIJ A; 2N9K A; 2K5P A; 2XK5 B; 3UF8 A; 4PS7 A; 3RZF A; 1MHH E; 3V6C B; 1SJE D; 1GC6 A; 2LGX A; 4JIO U; 2XNA C; 4H2A A; 4A3O A; 2I1K A; 3SDL C; 2KFJ A; 2KTR A; 2UYZ B; 3HK0 A; 3U4E G; 1E7U A; 1R7S A; 3PZ7 A; 4PS3 A; 1GC7 A; 2W3R A; 4JX1 C; 1YD8 U; 3QAQ A; 1IP9 A; 1QIL A; 3ETR A; 2FCQ A; 5JH5 C; 3TEX A; 4YWG G; 3DVG Y; 1VD2 A; 3AI5 A; 4WH4 A; 2ZNV C; 1HEZ E; 1FM0 D; 3MC8 A; 3DOW A; 2R2O A; 4WQM A; 2IGD A; 2BKR B; 5KHO A; 3JYU A; 4ASW C; 3GZN B; 2WHI A; 1UGJ A; 1ZW7 A; 4NAW B; 1EM7 A; 1KFY B; 1IGD A; 4PYZ A; 2KVR A; 3BWU D; 2L3Z A; 2KJR A; 2Z59 B; 5D94 A; 2KT7 A; 5HFY A; 3SR6 A; 2L0T A; 2AQ2 B; 4AJY B; 3I3T B; 2LHD A; 2A4Z A; 3AN1 A; 3RCZ A; 2KQS A; 4HPP A; 3KWL A; 2BB5 A; 4C80 A; 4GDL B; 1HZ5 A; 4KKJ A; 5HG2 A; 3VAW A; 1D6E C; 1C3T A; 2PE9 A; 2K25 A; 3VTU A; 1OEY A; 2WXF A; 1FRR A; 4LNO A; 1GNU A; 2LMC A; 1SJH D; 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