The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
TTYKLILNLKQAKEEAIKELVDAGTAEKYFKLIANAKTVEGVWTYKDEIKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
|
| molecule keywords |
GB98
|
| publication title |
Mutational tipping points for switching protein folds and functions.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Artificial gene
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| total genus |
10
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2IGD A; 2LHE A; 4WH4 A; 1GB1 A; 3GB1 A; 1JML A; 2JXT A; 1GB4 A; 4MAC A; 2N7J A; 5BMH A; 2IGH A; 3V3X A; 2KWD A; 2KQ4 X; 2JSV X; 2N9L A; 1IGD A; 1HZ6 A; 3FIL A; 3FIL B; 1XF5 L; 1Q10 A; 3MP9 A; 1UWX A; 1KH0 A; 1D4B A; 2JWU A; 3UI3 A; 1IBX A; 1PGX A; 1IBX B; 1MHH E; 1YNT E; 1XCQ L; 2OED A; 1MPE A; 4KGS A; 2LUM A; 2QMT A; 1IGC A; 2K0P A; 1MVK A; 2GI9 A; 2KN4 A; 5JXV A; 2LHD A; 1ZXH A; 2ZW1 A; 5HFY A; 2QSD A; 4GLS C; 2PLP A; 2ONQ A; 1P7F A; 1K53 A; 1MHX A; 2NMQ A; 2IGG A; 4KGT A; 1FD6 A; 2I38 A; 1K51 A; 2PTL A; 1F2R C; 1QKZ A; 2JZP A; 2ZW0 A; 1YMH E; 4OZC A; 5HHD G; 4HJG E; 1MI0 A; 4D2K A; 1PGA A; 2EEL A; 2ON8 A; 2RPV A; 2RMM A; 1XCT L; 2J52 A; 4OZA A; 2KAC A; 2LGI A; 1PGB A; 2PW9 A; 5HI1 A; 1K52 A; 4KGR A; 2GB1 A; 1HEZ E; 1FCC C; 1K50 A; 1C9F A; 5BMI A; 2I2Y A; 2J53 A; 4IOI E; 4IKG A; 1P7E A; 1HZ5 A; 4HKZ E; 5BMG A; 2JU6 X; 1FCL A; 1EM7 A; 1F2R I; 4OZB A; 2KDM A; 5HG2 A; 2N9K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2JQR B; 4IW0 A; 4PS8 A; 3U8Z A; 2J4X A; 3DHI C; 1IPG A; 4ARC A; 1Z5S B; 2V3S A; 4DHZ E; 1VJK A; 4BKS D; 2CHX A; 2SAK A; 3CST A; 3MC9 A; 4ZRQ A; 3FIL B; 2BPS A; 2N1W A; 5IP4 D; 1D4B A; 3NJT A; 4N6E B; 4ZRK A; 3A9K B; 4URK A; 3LYY A; 3NZU A; 5CHF A; 1U4A A; 2HTM E; 1J7A A; 1IGC A; 4RMA A; 1FIQ A; 1YIW A; 3TEY A; 3VTV A; 2ONQ A; 2WXO A; 2AYO B; 4RFB A; 2RD0 A; 2BB6 A; 3PLV A; 2C7N B; 2AWT A; 3SR6 A; 1JWU D; 2ASQ A; 3NUH B; 3HVZ A; 4NPN A; 1G6J A; 1WXS A; 4HPP A; 3V62 A; 3N3K B; 3PO0 A; 1V1O A; 3S2A A; 4GN1 A; 4ZOH C; 2JY6 A; 2RPV A; 2ZNV C; 1FNW A; 4FN2 A; 2KDB A; 4GB9 A; 4KKI A; 4MGK E; 3P42 A; 1Q1O A; 1XLP A; 3L10 B; 4JL9 A; 4W9G A; 3I9V 1; 1NEK B; 3WAN A; 3WCQ A; 3P4Q B; 5G55 A; 3H1U A; 4REZ A; 1UWM A; 1YN3 A; 2MJE A; 4RGM A; 2OHF A; 2KDF B; 4IWP A; 3AI5 A; 4MGY E; 4TUU A; 1WGG A; 3QHT A; 4WWP A; 1WJ4 A; 2Z0E B; 3WAP A; 4P1C C; 4LDT B; 1GB4 A; 2PVO D; 2XN9 C; 4BKG A; 1P98 A; 1JWB D; 4JIO U; 5FKA C; 3AE9 B; 2KWD A; 4JE3 B; 3CIR B; 3Q3O C; 3ONS A; 3VAW A; 1E6E B; 1TZ1 A; 2LRU A; 4KZ0 A; 1QOB A; 3DVG X; 3OAW A; 1TIF A; 4FBJ B; 3N32 A; 1FRR A; 1UZX B; 4HDQ A; 4JGH B; 1F0Z A; 3RT3 B; 4WAF A; 4KGS A; 5C23 A; 3SFD B; 2G45 B; 2EMS A; 3Q8B A; 2XEW A; 2CHW A; 1QOF A; 1N6Z A; 5FK9 C; 1V49 A; 1ZXH A; 4BFR A; 4I6N B; 4C80 A; 5AZH A; 5HFY A; 2O6V D; 1SEB D; 2AQ1 B; 2MH7 A; 1SE2 A; 2KWV B; 4M00 A; 1KLG D; 1N63 A; 2H88 B; 3IAS 1; 4OHJ A; 2IGG A; 4GIV A; 2KDE B; 4NJ7 A; 3TIX A; 1K51 A; 2PTL A; 3RNF C; 1ZDX A; 3K9O B; 5H8Y E; 2ZW0 A; 2KDI A; 4LK0 M; 2LEK A; 1E5W A; 3PZD A; 2KYW A; 1EWC A; 2Y5C A; 3MJ5 A; 1P1A A; 1E8X A; 2LRW A; 1TS3 A; 4L23 A; 3QAR A; 4KGR A; 3P4R B; 3NOB A; 3MC8 A; 1C76 A; 5C2T B; 4ANX A; 1I4G A; 4FJY A; 4PYU A; 4DHJ B; 1TZO A; 4XDD A; 3GZN I; 2FID A; 4OVZ A; 4TKN A; 1KRH A; 4QAY A; 2REX A; 5AZG A; 3APC A; 3VH3 B; 4HK2 A; 3DDC B; 4WJO A; 3AMZ A; 1WY8 A; 3P63 A; 1DOY A; 4KX6 B; 3IVF A; 1XLO A; 4WWM A; 3WAL A; 4KDL B; 2AL6 A; 3AM9 A; 3A4S C; 1H8C A; 2AX5 A; 1I42 A; 4LJP B; 3FC4 A; 1HZ6 A; 4A20 A; 2ZVO A; 1XF5 L; 4EOY A; 1MJD A; 2N4F A; 1WE6 A; 3PZ8 A; 4ZRI A; 1JW9 D; 3HK0 A; 4FHK A; 2K0P A; 2CJO A; 1PYW D; 3RFZ B; 4DBG A; 3OJ4 B; 2V3N A; 3ZYY X; 3VR9 B; 1TT5 B; 1TYG B; 3BK1 A; 3PRE A; 4GDL B; 4WJQ A; 3BK2 A; 1I4H A; 2I1J A; 1N61 A; 4PT5 A; 3RZW C; 5LXH A; 1ZUD 2; 3R8B A; 2WXG A; 5D6J B; 1KLV A; 1K8R B; 3DBL B; 1DOI A; 1TY2 A; 1QZE A; 3RN9 C; 5EE1 A; 4ZHO A; 3P4S B; 3VRB B; 4OZA A; 1CK1 A; 2ZJD A; 4FHJ A; 1PGB A; 4BKS A; 2B3A A; 4HKQ A; 5BYR A; 4US8 A; 3PLU A; 1XLN A; 1WFY A; 1WX7 A; 4M02 A; 2O2V A; 2DNF A; 2J53 A; 2CS4 A; 3QX1 A; 4JLC A; 3AE2 B; 1MG8 A; 3AE3 B; 2LVQ A; 2KVZ A; 4P7I A; 2BKR B; 2INC C; 4WWO A; 2C60 A; 3O65 B; 4EUT A; 2MLB A; 2MHJ A; 4MH0 E; 1YD8 U; 1FXA A; 3ENE A; 3PSE B; 2KHW B; 2LJI A; 3UGB B; 3OJ3 A; 1PFD A; 2KX0 A; 4K7U A; 1S1Q B; 2GBM A; 3IAM 1; 3KUD B; 3L16 A; 4HVB A; 1CMX B; 1JRO A; 5IKC M; 2D11 A; 1WXM A; 1VZ6 A; 4A9A A; 1E8Y A; 2Q5W D; 3EFC A; 5FR6 A; 3TEW A; 1L4Z B; 1E9M A; 1UUP A; 2KWC A; 2WHI A; 4LJO B; 2LVO A; 1M4V A; 3QAQ A; 3B08 A; 4MT5 A; 1B9R A; 4XC2 A; 2BBC A; 5AUK A; 3ZQ4 A; 2GI9 A; 3VVW B; 3AE6 B; 1FPY A; 1TS5 A; 1WIA A; 4GDK B; 4F8C B; 4MM3 A; 1EU4 A; 1BXT A; 3PGE A; 3NG0 A; 1RYJ A; 2VZK B; 1QQR A; 2KD0 A; 5IO9 A; 4HWI B; 4LCD E; 2LGS A; 5LNK 1; 1SSN A; 2KNB A; 1BUI C; 2KXJ A; 2L1A A; 4B95 A; 3IFW B; 4MJS A; 4PYZ A; 1V8C A; 1D6E C; 1WZ0 A; 1T0Q C; 3KYC D; 4I6P A; 4A8X C; 4BBN F; 1QOA A; 1K52 A; 3N1Y C; 1OGW A; 1RM6 C; 1D5M C; 2FUH B; 1OFF A; 1T0R C; 5AZF A; 2VRR B; 2DZI A; 1JCK B; 2LI5 A; 4BOS C; 4HKZ E; 3A1Q A; 4JQW C; 3MHS D; 1DYQ A; 4NJ6 A; 1H4R A; 2JXX A; 5E6O A; 3H8H A; 2N7J A; 2O6V A; 2L76 A; 5G5H A; 3DWM A; 4NQL B; 1WMH A; 4W9C A; 1YQ3 B; 1YN4 A; 3U30 A; 5GXG B; 1IGD A; 3RZF A; 1C4C A; 3SFE B; 5L95 C; 2D3B A; 3QWZ B; 2NBU A; 2R2O A; 4MDK E; 1ET6 A; 2GMI C; 3TEZ A; 4FXC A; 3T3O A; 1XD3 B; 3RNE C; 2LWP A; 2MBH A; 2UYZ B; 3ALB A; 2W55 A; 2IZV B; 5T8I A; 3ZTC A; 5EDS A; 4HJK A; 4FA6 A; 1L6V A; 1RAX A; 5D94 A; 5JZE B; 4KGT A; 3Q69 A; 4DQO C; 2MCN B; 3NZ3 A; 1J0G A; 3L13 A; 1XEE A; 1E8W A; 4ICV A; 1LGR A; 2PIA A; 1OEY J; 2WXK A; 3DHG C; 3GOE A; 3U7D A; 2AEH A; 2ZCC A; 4WWN A; 3Q3N C; 1XCT L; 2J52 A; 3KH0 A; 3MJW A; 5D3I B; 4IWQ A; 1WXQ A; 3QJZ A; 3VRA B; 4WUR A; 2GLS A; 1FCC C; 5FR3 A; 3I5J C; 3AEA B; 5E6N A; 3I57 A; 5CX3 A; 4KIK B; 4PS7 A; 1HA5 A; 4A90 A; 2DZM A; 4Q2J A; 4HRO A; 4AJW A; 2PE6 B; 3QCA A; 4MGZ E; 3Q2A C; 2KT7 A; 2INN E; 3RNG C; 3LDZ E; 4W9F A; 4LNK A; 1WYG A; 2M1M A; 3DHH C; 3UIO B; 1V5T A; 4C4V B; 1L0X B; 3IT4 B; 3V3X A; 4ICU A; 4YSX B; 2IBI B; 2MRP A; 1EO6 A; 3KVF B; 5IOI A; 4WAA A; 3ZDM C; 3KQ4 A; 3P2B A; 3RNC C; 3U2S C; 3VDZ A; 1J7B A; 2K25 A; 1LO5 D; 4NAW B; 2DYM A; 4TMA B; 3CMM B; 3JSV B; 1WXV A; 4KSL C; 1N5X A; 3MC0 B; 1TKY A; 4FLH A; 1IBX A; 3EUB 2; 1PGX A; 5DPT A; 2BYV E; 1V1P B; 1TJE A; 3C0R B; 1LFD A; 3ZRC A; 3VH4 B; 2OED A; 2OJW A; 2WP9 B; 4L2Y A; 4AJY B; 2XBB C; 4DXG A; 4HPL B; 3NVZ A; 2UU7 A; 3DCG A; 1WGR A; 2QSD A; 4EE2 A; 2MEK A; 3C19 A; 2Y5B B; 1N60 A; 2Y5P A; 5KHO A; 2YLM A; 3ZXV A; 2W54 A; 4R3D A; 3DBH I; 1R4N I; 4KZC A; 2HD5 B; 3URY A; 3BII D; 1KOT A; 1MHX A; 2IY0 B; 3C8Y A; 3ZO5 B; 2AQ3 B; 2MA9 B; 3ZLZ A; 4EFO A; 3AEE B; 4NAM A; 2C9W B; 4N59 A; 3AE8 B; 1ZP0 B; 4HCP B; 2WGS A; 1RFK A; 2JT4 B; 4P6V F; 4OW0 A; 4XYC A; 2K8C A; 3M95 A; 2N9P C; 4J3O D; 2JYT A; 1WX9 A; 3DBR B; 2RMM A; 1JWA D; 3H7P A; 5HI1 A; 4A6Q A; 1HTO A; 3HVD A; 4GOC A; 4W9E A; 2DYO A; 1RLF A; 1E0Z A; 3GP7 A; 3AE5 B; 3TEX A; 1L6U A; 4HXD A; 2R2Q A; 4K3C A; 2XK5 A; 3BYT B; 3W5V B; 1VZ7 A; 4TV3 A; 1C79 A; 2SEB D; 4RCO A; 2N9X A; 4AUQ C; 1VDV A; 1ZKH A; 4OZB A; 2K39 A; 4HLE A; 1YN5 A; 1KLU D; 1J8C A; 3FAH A; 3U7Z A; 2D3A A; 3RYT A; 2KC1 A; 4W9L A; 2WNM A; 4IG7 B; 2BVC A; 1Q0W B; 3UIP B; 2KWU B; 1V2Y A; 3PS6 A; 1UGM A; 2ZPY A; 1F9J A; 1Q5W B; 3AE7 B; 4US9 A; 3V61 A; 1T3Q A; 1KFY B; 1C4A A; 2KQS A; 2WDR B; 5C3J B; 2K6Q A; 2NBV B; 4DXF A; 4GXB A; 2NPT A; 2NR2 A; 3NVW A; 1NYQ A; 4C7Y A; 2LHD A; 2M0A A; 3B9J A; 5G2N A; 4A3P A; 2L32 A; 1WJ6 A; 2HDE A; 1V81 A; 5IA7 A; 1K53 A; 2BTE A; 1ESF A; 3R3M A; 3RMK C; 5DPW A; 4OVU A; 2JX5 A; 3BZD B; 3ZIM A; 1SJE D; 2WDT B; 3DVG Y; 1T0Y A; 2BWE S; 3A9J B; 2PKO A; 2D3C A; 3Q3M C; 2MSE D; 4XGA B; 5MPO A; 2D10 A; 2QC8 A; 5JHB A; 2HJ8 A; 1E90 A; 4ZYN A; 2QJL A; 4W9H A; 2GBN A; 5EE3 A; 1E10 A; 2MBQ A; 1ZPS A; 2BS3 B; 3ZNG C; 2DAJ A; 2KN5 A; 2EKI A; 3DBS A; 3L0W B; 2ZPN A; 1FMA D; 2IND C; 2JZ3 B; 4IOI E; 3B1L X; 3QIJ A; 2HE7 A; 2KJH B; 1V9J A; 4RF1 A; 1HZ5 A; 3PT2 B; 1FFU A; 2X8X X; 3VR8 B; 2WXL A; 2DYB A; 2W3R A; 4EZJ A; 1EM7 A; 2J0J A; 4W9D A; 4G11 A; 2QIL A; 1FNU A; 1SJH D; 3RNA C; 3N1X C; 2RR9 A; 3OWE B; 4KDI C; 2UWQ A; 2KFK B; 2WU5 B; 1YJ1 A; 1L0V B; 5D3D A; 3FIL A; 2FNJ B; 4NY0 A; 2ZCB A; 3Q3F A; 3AV8 A; 2IO1 B; 2PPH A; 5H92 C; 1CZP A; 3A9K A; 2JVC A; 5CHV C; 4EKU A; 1HE8 A; 4ZRP A; 1TS4 A; 4ASW C; 4MH8 A; 1E7V A; 4YT0 B; 1YQB A; 2KKC A; 4H2A A; 2KLG A; 2VH2 A; 3UQB A; 3B0A A; 2PLP A; 3UQA A; 3Q8E A; 4LLG M; 1SE4 A; 4ARI A; 2IDY A; 5D7G A; 3JW0 X; 1JAL A; 5BYQ A; 3JVZ X; 3PTF C; 1GOZ A; 3ZJT A; 1F2R C; 1QKZ A; 1WZ3 A; 1ZOY B; 2C7H A; 1B1Z A; 1QIL A; 3RUI B; 4JPS A; 1EWY C; 2KVR A; 1VZ8 A; 4CYE A; 2NS5 A; 2V1Y A; 3CF6 E; 4C00 A; 2W9N A; 1BML C; 3M63 B; 4ITK A; 1TKG A; 2X38 A; 3SD5 A; 2VZK D; 2K9X A; 1VRA B; 1L0Y B; 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4YXD B; 2QDF A; 3GB1 A; 1KM7 A; 1MG4 A; 4LNI A; 3NY5 A; 2MJ3 A; 2KAN A; 4TQ0 A; 3Q8A A; 3N20 C; 3QC8 B; 2QEJ C; 2Z59 B; 1T6B X; 1WRI A; 5AEK B; 2KQ7 A; 4DDG D; 2WXQ A; 1UEL A; 1LM8 B; 4A55 A; 2LMC A; 3TSS A; 1I4P A; 2RGF A; 4GMV A; 3EGR A; 4J6I A; 4XE0 A; 4ANW A; 1QT9 A; 5JXV A; 2MBE A; 1SIF A; 2W3S A; 1JQ4 A; 2INP E; 4LNO A; 2LXA A; 4BAX A; 4IDI A; 3EA6 A; 4OVV A; 2KC2 A; 5L83 A; 3DVN U; 1F77 A; 4GDL A; 1YQ4 B; 2JUO A; 5DPR A; 1NEN B; 2NMQ A; 3TJP A; 3A33 B; 2KZR A; 3Q14 C; 3W1Y A; 4RF0 A; 4IM0 A; 3UF8 A; 2FUG 1; 3Q8C A; 5J17 A; 3HRD D; 1GPX A; 4D2K A; 3PHX B; 1PGA A; 2EEL A; 4BZA A; 1A70 A; 2L05 A; 3FKY A; 4K3B A; 1OQQ A; 2NTS A; 3MTN B; 4K7W A; 3WA0 A; 4WQO B; 1HEZ E; 2BKF A; 2L52 A; 2RDG A; 1F1H A; 4MEM A; 1ZXI A; 2NCN A; 2BWF A; 1GG3 A; 3D32 A; 1A5R A; 1NBF C; 1ZE3 D; 2JU6 X; 3AEG B; 3NVY A; 1ISN A; 2KDM A; 3SDL C; 4O1N A; 4G50 A; 2LUE A; 2IGD A; 3NS1 A; 3DBL I; 2I1K A; 2IO0 B; 1SB3 C; 1R4M I; 4P16 A; 4HEA 1; 2WX1 A; 2N9L A; 3K9P B; 2MW5 A; 2WXM A; 3ZNZ B; 3MP9 A; 3AB5 A; 3J9C A; 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