The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
98
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structure length |
96
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Chain Sequence |
KHTVPYTISVDGITALHRTYFVFNKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNSIDPSTIKQIQIVVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| molecule keywords |
Neutrophil elastase
|
| publication title |
Staphylococcus aureus secretes a unique class of neutrophil serine protease inhibitors.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Staphylococcus aureus subsp. aureus
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| total genus |
29
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| structure length |
96
|
| sequence length |
98
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF03642 | MAP | MAP domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FNW A; 1JWM D; 1GOZ A; 1YN3 A; 1TY2 A; 3EA6 A; 3MC0 B; 3R2I A; 1YN5 A; 5D3D A; 1FNV A; 1SJH D; 4DXF A; 2R61 A; 1TS2 A; 1SJE D; 3BZD B; 1L0X B; 4RCO A; 1HA5 A; 1B1Z A; 5FK9 C; 3V05 A; 1V1O A; 2AQ1 B; 4OHJ A; 5D3I B; 3W2D A; 1I4R A; 2AQ2 B; 1SXT A; 4NZL B; 1CK1 A; 1SE3 A; 3R8B A; 1FNU A; 1SBB B; 1ENF A; 2ICI A; 3R2T A; 4RGO S; 2J4X A; 1AN8 A; 1AW7 A; 1D5Z C; 3TSS A; 2QIL A; 1DYQ A; 3GP7 A; 1TS4 A; 1TS3 A; 1I4Q A; 2NTS A; 1HQR D; 1L0Y B; 1SEB D; 1JCK B; 1V1P B; 2XN9 C; 2AQ3 B; 1I4G A; 1XXG A; 1TS5 A; 1YN4 A; 1UNS A; 1D6E C; 2IJ0 A; 5TSS A; 1F77 A; 3BVM A; 4RGT A; 1ESF A; 1QIL A; 1I4H A; 2NTT A; 4UDU C; 5FKA C; 1SE4 A; 1UUP A; 3O13 A; 2SEB D; 2RDH A; 1JWU D; 3SEB A; 5I4D A; 1HXY D; 2QEJ C; 1ET6 A; 3KLS X; 1EU3 A; 4RGN A; 4O1N A; 4RGM A; 2XNA C; 4C56 C; 1TY0 A; 1I4X A; 3OWE B; 1JWS D; 1CQV A; 4RH6 A; 2IPK D; 1SE2 A; 3BYT B; 1STE A; 1D5X C; 1T5X D; 2G9H D; 2RDG A; 2TSS A; 1M4V A; 4DXG A; 1EWC A; 1D5M C; 4ZYS A; 4RFB A; 3MFG A; 4TSS A; 3BYY B; 1ET9 A; 1EU4 A; 1PYW D; 1LO5 D; 1KLU D; 1BXT A; 3BVZ A; 1I4P A; 1KLG D; 3BVG A; 2Z8L A; 1KTK A; 1V1P A; 3URY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1GOZ A; 3QA8 A; 2G1E A; 2KFK A; 4LJP B; 5D3D A; 1N5X A; 3RZF A; 3TEZ A; 4WAA A; 4PYZ A; 4DWF A; 3A9J A; 2BYF A; 2NBW B; 1Q1O A; 4HRO A; 1OQQ A; 2MX2 A; 2BW2 A; 2KC1 A; 2KN5 A; 3C0R B; 2QHO A; 1ZDX A; 3SFD B; 1MFW A; 3U7Z A; 1QZE A; 3B1L X; 3VTV A; 2PJH A; 4BBN C; 3QC8 B; 2C60 A; 2CHX A; 1L0Y B; 1P98 A; 3ZVV A; 1F52 A; 2AL3 A; 1E6E B; 2XN9 C; 1JRP A; 2MEK A; 4ZRP A; 3KUD B; 3I5J C; 3MHZ A; 2N9P C; 1FM0 D; 2KFK B; 3H6N A; 3CSF A; 4K3B A; 1GNU A; 1WI0 A; 2BS3 B; 1OQR A; 1SE4 A; 3A9J B; 4M8M A; 1FXA A; 4ZOH C; 3QK0 A; 3V60 A; 4P16 A; 3A4R A; 4XGA B; 3PT2 B; 1UZX B; 2DHZ A; 1TY0 A; 3QAR A; 3OWE B; 4XC2 A; 1R4M I; 4C00 A; 2QMT A; 3OJ4 B; 3AB5 A; 1HZ6 A; 1L4Z B; 2DYO A; 1SIF A; 1XCT L; 3IBE A; 1WFY A; 2FUG 1; 4TSS A; 3BYY B; 3N32 A; 1QLB B; 3ZNI D; 3WAO A; 1ZGU B; 4BKS A; 2C9W B; 3PPA A; 3DHG C; 1S3S G; 2WXR A; 3KUC B; 4LLG M; 2WXL A; 4YSZ B; 3VAW A; 4L23 A; 3UIO B; 1FNW A; 4BOZ B; 3P4R B; 1YN3 A; 2ZZP B; 4W9K A; 4NAM A; 2MJ3 A; 2WYQ A; 3TCA A; 3T3N A; 4DHJ D; 1P7F A; 2AQ1 B; 3RNB C; 4NAW A; 1EUV B; 2N1V A; 2M8S A; 2JVC A; 3RNE C; 4IM2 A; 2YLM A; 4X57 B; 3ZTD A; 1NYR A; 2WXJ A; 3O65 B; 4G0N B; 3DPD A; 1KJT A; 2LZ6 A; 2M1M A; 2CKH B; 2HDE A; 3E9S A; 1EF1 A; 3ZNH B; 3AV8 A; 3J9C A; 3VVW B; 4TKN A; 3ZYY X; 2QJL A; 4A90 A; 2ZW1 A; 1NEN B; 1SF0 A; 1E7V A; 2HTM E; 3W1S C; 1ZDV A; 4PYU A; 5CHV C; 4AWJ A; 1UNS A; 2ZVN A; 2QIE B; 2WXM A; 1F77 A; 2KX0 A; 3BVM A; 2M56 B; 4JL9 A; 2WU2 B; 2KDB A; 1QF6 A; 1Q5W B; 2KFJ A; 2GBJ A; 3NUH B; 4HPM B; 4NAW B; 4L2Y A; 3Q6B A; 2UYZ B; 1UUP A; 4P1B C; 3O13 A; 1XLP A; 1ZW7 A; 4E71 A; 1V8C A; 4TUU A; 1I7H A; 4CO7 A; 4ZRK A; 1EU3 A; 2WXH A; 2KK8 A; 3B2F A; 3ZW3 A; 3DQV A; 3PS6 A; 1J7C A; 1V6E A; 2IYD B; 1VZ7 A; 3W5U B; 2L05 A; 4BOS C; 3DVN U; 1T5X D; 2DWQ A; 2TSS A; 3RN9 C; 4RMA A; 4IKG A; 2XK5 A; 3VHT C; 2KMM A; 2EKE C; 3DHI C; 1C4A A; 1I4P A; 3TBL D; 4KVG B; 1WIA A; 2N9X A; 1V1P A; 3K9P B; 5BYQ A; 2WHI A; 3HVZ A; 2AYO B; 2WXI A; 3L4P A; 2R61 A; 4I6N B; 2Q5W D; 1OEY J; 4C4V A; 4NQK E; 3V6C B; 1SB3 C; 1WYW B; 2KAJ A; 3L16 A; 4HVB A; 1YD8 U; 2KTF A; 3AE1 B; 1JWA D; 3KWL A; 1NEK B; 1XLQ A; 2ICI A; 4IM0 A; 3E56 A; 1N61 A; 2PIA A; 4HJK A; 3BK2 A; 3ZLZ A; 4REZ A; 1WMH B; 4B0M A; 4ICU A; 2G4S A; 1KFY B; 2D5G A; 2LD9 A; 2BYV E; 1V1P B; 2AX5 A; 5EE9 A; 2IGG A; 4JLC A; 3DVG Y; 3ZJT A; 5TSS A; 1WM2 A; 2BKF A; 1K50 A; 4G3X B; 3VR8 B; 2VZK B; 5GXG B; 2B76 B; 1E9M A; 2KYW A; 2OED A; 3APC A; 3M62 B; 3C19 A; 2MQJ A; 3RT3 B; 1KM7 A; 1LXD A; 4B95 A; 2R2Q A; 2V3P A; 2Y3A A; 2N4F A; 1PGX A; 2ZW0 A; 2FIF A; 1H8C A; 4TQ1 A; 2RR9 A; 2HTH A; 4A20 A; 4HK2 A; 1GUA B; 3NJT A; 5DPR A; 4ANX A; 3DBS A; 4IWO A; 3R7R A; 3LXF A; 4N9F 4; 1DOX A; 4XDD A; 5DPW A; 3LDZ E; 2DNF A; 2D07 B; 1C9F A; 3URY A; 1JWM D; 2REX A; 1XD3 B; 2I2Y A; 4AOF A; 1T0Y A; 4NQL B; 1TY2 A; 2LJ5 A; 4A55 A; 1WXS A; 3NZU A; 2K9X A; 3PO0 A; 2HJ8 A; 5BO4 B; 2CHZ A; 3ZKJ C; 2PE6 B; 4URK A; 1PUT A; 4F1S A; 2NVU I; 1UWX A; 4W9H A; 2LUM A; 2KC2 A; 1R4M B; 1Y56 A; 4Q2J A; 3VUX A; 2JRI B; 3Q3M C; 1MHH E; 4FUL A; 4LNF A; 1K53 A; 4KZ0 A; 3DWM A; 2E6X A; 1FXT B; 1KF6 B; 3IAM 1; 1PFD A; 3Q2A C; 2MBQ A; 4XWW A; 1N62 A; 2IO2 B; 4ARC A; 4K7S A; 3IT4 B; 2NBU A; 3EFU A; 2IJ0 A; 3OJ3 A; 3AEE B; 2GRI A; 4KKI A; 5D94 A; 2KDE B; 4MGZ E; 2K3U A; 2BWF A; 2O6V D; 3NVZ A; 2N9L A; 3AU4 A; 3WAL A; 1VRA B; 5H92 C; 1DGJ A; 2L0T A; 3WA0 A; 3A1Q B; 2ZNV C; 3ZIM A; 3ZQ4 A; 5IAA C; 4II2 B; 2L3Z A; 4KGT A; 4W9E A; 2V3S A; 4KDI C; 2GOW A; 1SE2 A; 4PK1 A; 2G45 B; 3PRP B; 2FCM A; 1STE A; 1C77 A; 4R3D A; 1EWC A; 2L8J A; 2KT7 A; 2L32 A; 3S2A A; 3VFK A; 2C7H A; 4B0E A; 3RI7 C; 1XLO A; 2N7J A; 3N20 C; 1Q10 A; 3ZXV A; 3BVZ A; 4W9D A; 2LGX A; 1K51 A; 1Q0W B; 4GMV A; 2MP2 B; 3K9O B; 3VQI A; 3EEC A; 2MLB A; 1FNV A; 4JQW C; 2O2V B; 2NS5 A; 4ZRJ A; 1YOV B; 4YL8 A; 1V1O A; 4A9A A; 1L0V B; 1FO4 A; 1GB1 A; 3BWU D; 3OG5 A; 2KLG A; 4F8C B; 5EE3 A; 3D32 A; 4BKT A; 2WGS A; 2IY0 B; 2GB1 A; 3EC8 A; 1VJK A; 2LHD A; 1N63 A; 3H7S A; 1P1A A; 2KQ7 A; 2LEK A; 1AN8 A; 1DYQ A; 1WR6 E; 5FR6 A; 2H89 B; 1WX7 A; 2PPH A; 2RMM A; 2NTS A; 1XF5 L; 1XLN A; 2JWU A; 3L17 A; 1JML A; 4GDK A; 1MPE A; 1YX6 B; 4WJN A; 4GDL A; 3EUB 2; 2DLB A; 3B08 A; 1ESF A; 5C1Z A; 2LJI A; 1F1H A; 3ALB A; 2A5U A; 5BYR A; 4LDT D; 3W9C B; 2M0X A; 3UIN B; 1L4D B; 2NR2 A; 2V4I B; 4I6L B; 2M19 A; 1JWU D; 4W9L A; 3SEB A; 3M3J A; 4EFO A; 3Q8B A; 5E6O A; 2W54 A; 1MHX A; 2INP E; 4OZC A; 4BFR A; 3GZN B; 4BBN F; 2DBY A; 4LNO A; 3PZ8 A; 1MG8 A; 3GOE A; 4MM3 A; 1AWD A; 1D5X C; 3EHV A; 5JXV A; 5G2N A; 2PEA A; 1M4V A; 3M63 B; 2INN E; 1VDV A; 2Z0D B; 4MEL A; 5KHQ A; 2BT6 A; 3UQB A; 3VUW A; 2K39 A; 2KQ4 X; 4WWP A; 4DDG D; 4GDL B; 3DBR I; 3JSV B; 3H1U A; 4MJS A; 2CJO A; 4DHJ B; 1BXT A; 4WJQ A; 4OVV A; 2DX5 B; 3U4E G; 1XEE A; 4JWU C; 2L1A A; 1BT0 A; 1HA5 A; 1V9J A; 4OHJ A; 3CF6 E; 4MM3 B; 2KTR B; 1GPX A; 2FAZ A; 2JT4 B; 4GIV A; 3WCQ A; 4WJP A; 2AQ2 B; 1Y8R C; 1SBB B; 3RZW C; 2FID A; 4HEA 1; 1L7Y A; 2M0A A; 1ZOY B; 1TS4 A; 1TS3 A; 2IND C; 1UF0 A; 4G11 A; 4GN1 A; 2N9E B; 2I1J A; 1YQB A; 3VRB B; 2N1W A; 2KKC A; 2PW9 A; 2K0P A; 4CYE A; 3UF8 A; 1I35 A; 1LQB A; 4RGT A; 2GI9 A; 2C7N B; 5JHB A; 4BAX A; 3V6E B; 4DQO C; 5FKA C; 1MI0 A; 2FCN A; 2BWE S; 5I4D A; 1YIW A; 3MC8 A; 4L1B A; 4KV2 A; 3ML8 A; 2X38 A; 4W9C A; 3RCZ A; 3QAQ A; 2X8X X; 2LAS A; 1J8C A; 2GBK A; 5HI1 A; 3NS8 A; 2W55 A; 3CST A; 2JZZ A; 5HFY A; 4FXC A; 1IYF A; 3AI5 A; 4HCN B; 2FBW B; 2WNM A; 2EMS A; 3SU8 X; 4ZYS A; 1C4C A; 3ML9 A; 4KGR A; 3NZ3 A; 4MAC A; 4M0W A; 1KLU D; 1WSP A; 2RPV A; 3NY5 A; 5CTR C; 1KLG D; 4P6V F; 1IUE A; 2W3R A; 2Z8L A; 3VR9 B; 1KLV A; 3AH7 A; 1PDX A; 3W5V B; 4AP4 C; 4IWQ A; 2QSD A; 5D7G A; 3RPF C; 3MC0 B; 1TS2 A; 4HXD A; 2LRW A; 4IWP A; 2YEP B; 1WH3 A; 3RD2 A; 5D3I B; 2NBV B; 2JX5 A; 2N7E A; 1P0R A; 1FMA D; 1T0S C; 1WY8 A; 1V97 A; 3ZRC A; 3PZD A; 1D5Z C; 4GU2 A; 2JXX A; 2QIL A; 3DOW A; 4EOY A; 1T6B X; 2XBB C; 4RF1 A; 4OZA A; 2WXO A; 1SSN A; 1IPG A; 1FPY A; 5J2R A; 2I1K A; 4EKU A; 2JSV X; 4A8X C; 1NBF C; 5J17 A; 1RYJ A; 2MA9 B; 1CZP A; 4DHZ B; 3M95 A; 1J7A A; 5C3J B; 3HUI A; 2RDH A; 4ICV A; 2Y5B B; 2SAK A; 3Q3F A; 2N0S B; 1ZP0 B; 2JQR B; 4BZA A; 3N1X C; 3NOB A; 3CMM B; 2KDI A; 2KJ6 A; 4FN2 A; 4YWG G; 1RRB A; 3ZO5 B; 1TZ1 A; 2WQY B; 3FKY A; 4WQO B; 4KDL B; 3P4P B; 3MFG A; 3RNG C; 3NVW A; 2K8H A; 4K7W A; 5MPO A; 1EU4 A; 1YQ3 B; 1JW9 D; 2JPH A; 1PYW D; 2KAC A; 4PT5 A; 4USA A; 5KHO A; 3ETR A; 1V81 A; 2BTE A; 2O6V A; 2JY6 A; 5EE1 A; 2JZP A; 2ZNV B; 3L13 A; 4OW0 A; 2ASQ A; 2YEP F; 4RCO A; 1UGM A; 3APD A; 3QHT A; 3DWG C; 1V2Y A; 3IFW B; 3TMP B; 4CQN A; 1JRU A; 3EFC A; 1I4R A; 2D3A A; 5JHA A; 1WZ0 A; 1SE3 A; 1OQY A; 1FIQ A; 3R2T A; 3U8Z A; 3VTU A; 2BQQ A; 2MWS B; 4FHJ A; 5J18 A; 3VUY A; 1JRO A; 4NJC A; 2BF8 B; 1UWM A; 2MH7 A; 4JGH B; 1AAR A; 3DBR B; 1SEB D; 3RNF C; 3GE3 C; 4PS8 A; 1R4N B; 2MJE A; 4NNJ B; 2KQS A; 1HTO A; 3TEW A; 2IO1 B; 1SGH A; 2MW5 A; 3GZN I; 4RF0 A; 2XK5 B; 3GS2 A; 1FD6 A; 3Q8F A; 3RNC C; 1K8R B; 2SEB D; 2MSE D; 2V4L A; 4XZ4 A; 1HXY D; 1VZ6 A; 1ZUD 2; 2L00 B; 2OHF A; 1G6J A; 3KLS X; 2C5L C; 3L08 A; 3PHX B; 2XNA C; 3VDZ A; 1I4X A; 1WGH A; 2WXG A; 4JPS A; 4C4V B; 4HWI B; 2DAJ A; 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4HKQ A; 4XWT A; 2JRH A; 4TQ0 A; 3B9J A; 4F7Z A; 1M94 A; 2BVC A; 2KOX A; 3DHH C; 4A3P A; 4JIO U; 1YNT E; 1E90 A; 4ARI A; 2WDR B; 3FAH A; 2DYM A; 1GB4 A; 2NPT A; 3SD5 A; 5CHW A; 3V61 A; 1A70 A; 3RUL A; 2KX3 A; 3KYD D; 4MT5 A; 2BB5 A; 4WQM A; 2BKR B; 5IA7 A; 1E8W A; 2KJR A; 3OLM D; 3HM6 X; 2Y5P A; 1FNU A; 3PLU A; 4M8N A; 4B9K A; 2J4X A; 1EO6 A; 1D4B A; 3H9D A; 1WXM A; 3I3T B; 2WXF A; 2KLC A; 4W9F A; 1FXI A; 3KUZ A; 2DZJ A; 3A9K A; 1HQR D; 2DZK A; 2KWC A; 4N6E B; 2MBE A; 4EZK A; 4N58 A; 3WAN A; 3X23 A; 2WDT B; 2V0G A; 1WGR A; 1QOF A; 2LGS A; 3ABV B; 3FIL A; 1GC6 A; 4OVZ A; 1YJ1 A; 2G4D B; 4HRS A; 3QJZ A; 1TYG B; 3ZNG C; 2NPT B; 2LVP A; 5TR5 A; 3UGB B; 5LXI B; 1V5O A; 4P7I A; 4BKG A; 3N1Z C; 3MC9 A; 1XQQ A; 2N7D A; 3ZGZ A; 1TT5 B; 1AYF A; 3DBH B; 1BUI C; 2ONQ A; 2WS3 B; 3W1Y A; 3AEC B; 5LNK 1; 1VLB A; 1XT9 B; 2ZCB A; 2KWV B; 2INC C; 3ZDT A; 3A9K B; 2J42 A; 1LM8 B; 3AEB B; 3ECI A; 5BMH A; 4KZC A; 1MVK A; 3FIL B; 2WWZ A; 2GBR A; 5DCN A; 3NHE B; 5HKH A; 2JYT A; 4MDK E; 3TEX A; 4MEM A; 3R66 C; 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