The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| publication title |
Ultrahigh resolution protein structures using NMR chemical shift tensors.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| total genus |
14
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-07-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZXH A; 1XCT L; 2J53 A; 1PGA A; 5HHD G; 1PGB A; 2IGG A; 2IGD A; 2LHE A; 2N9K A; 4KGT A; 1IGD A; 4WH4 A; 5BMG A; 1XCQ L; 3UI3 A; 1FD6 A; 1YNT E; 2N7J A; 2PW9 A; 1QKZ A; 2GI9 A; 2KN4 A; 2KDM A; 3MP9 A; 4HJG E; 4MAC A; 2J52 A; 1XF5 L; 1K50 A; 2PTL A; 1GB1 A; 1YMH E; 1HZ5 A; 1FCL A; 1IBX A; 2RPV A; 2JXT A; 1MI0 A; 1UWX A; 2EEL A; 4KGR A; 4D2K A; 2LHD A; 2OED A; 1HEZ E; 2QMT A; 2JSV X; 2ZW0 A; 5HG2 A; 2NMQ A; 1MHX A; 4IKG A; 4IOI E; 1PGX A; 2JZP A; 1EM7 A; 1F2R C; 1K53 A; 1MHH E; 1K52 A; 4OZA A; 2ON8 A; 2K0P A; 1KH0 A; 1P7E A; 2ONQ A; 2PLP A; 2GB1 A; 2IGH A; 1IBX B; 3FIL A; 5BMI A; 4OZB A; 2I2Y A; 1K51 A; 1P7F A; 2I38 A; 5JXV A; 2RMM A; 1GB4 A; 1FCC C; 1HZ6 A; 2ZW1 A; 2N9L A; 1F2R I; 4HKZ E; 2KAC A; 2JWU A; 3GB1 A; 5BMH A; 4OZC A; 1MPE A; 2LGI A; 2LUM A; 5HFY A; 1Q10 A; 5HI1 A; 1MVK A; 2KQ4 X; 1C9F A; 4KGS A; 3V3X A; 3FIL B; 1JML A; 4GLS C; 2QSD A; 2JU6 X; 1IGC A; 1D4B A; 2KWD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1XCT L; 3VHT C; 2OHF A; 1PGB A; 4W9C A; 4DHZ E; 5IO9 A; 1LXD A; 1WYW B; 2MQJ A; 4S17 A; 1TS4 A; 4HCN B; 3RZW C; 2FCM A; 2J0M A; 3ZJT A; 3KW5 B; 5E6O A; 1T0Q C; 3QHT A; 2L32 A; 5CTR C; 3MTN B; 2GBN A; 4ZOH C; 3PLV A; 3R8B A; 3TUO A; 3TEX A; 2JSV X; 1Z2M A; 2D11 A; 1ENF A; 4AJY B; 1XEE A; 1VD2 A; 3KYC D; 1FFV A; 3V6C B; 5TSS A; 2BWE S; 1TIF A; 2C7H A; 3LXF A; 4DHJ D; 1QOB A; 1ZKH A; 3ONS A; 3FIL A; 4KSK C; 4DBG A; 2MBB B; 3R66 C; 2KJH B; 2JZ3 B; 2NTS A; 2ZVO A; 4TMA B; 1UD7 A; 3LYY A; 1KOT A; 3I57 A; 2Q5W D; 4W9J A; 4BVU C; 3IFW B; 2DYO A; 3IG3 A; 2BYT A; 2KMC A; 2O2V B; 1Y56 A; 4FHK A; 2KT7 A; 3DBS A; 2W82 A; 2N7D A; 2CHZ A; 2WLB A; 3C0R B; 1OEY A; 5DPS A; 1NYQ A; 3IVF A; 1KTK A; 1D6E C; 2FCN A; 2C7N B; 3VR9 B; 1JML A; 2BWF A; 4B9K A; 1JRO A; 3NZS A; 4PS3 A; 4RCO A; 1D4B A; 4ZYS A; 3AXC A; 1V9J A; 1P9D U; 2BKF A; 2L00 B; 3A9K A; 5D94 A; 1J8C A; 3VTU A; 3RT3 B; 4C4V B; 3BVG A; 1LQB A; 3ML9 A; 1PUT A; 3CST A; 2KD0 A; 4A55 A; 2V1Y A; 2WYQ A; 1L0Y B; 3O13 A; 1HTQ A; 2G4S A; 2GOW A; 4K3B A; 4RF1 A; 4EKU A; 1N63 A; 3BK2 A; 4DHJ B; 2V4L A; 3TCA A; 4OVU A; 2BPS A; 2HE7 A; 3I3T B; 1V49 A; 4MEM A; 3I5J C; 3SHQ A; 3AE6 B; 2KAN A; 5IOI A; 2MJE A; 4AUQ C; 2HTM E; 2JRH A; 2ZCB A; 1N62 A; 5D2M B; 1F0Z A; 4TQ0 A; 2LJI A; 1RLF A; 2ZEQ A; 3RUI B; 2I1J A; 2MEK A; 2ONQ A; 2PLP A; 3EHV A; 1WFY A; 3MC0 B; 1DOX A; 4N9F 4; 1HTO A; 4ANV A; 4EZJ A; 2QIL A; 3JVZ X; 4KIK B; 1SJE D; 3AU5 A; 3HUI A; 2KX0 A; 4A90 A; 3VR8 B; 2ICI A; 2KJR A; 3MC9 A; 1G6J A; 1IPG A; 1Q10 A; 2DZI A; 1B1Z A; 2KWV B; 1MG8 A; 1SF0 A; 3MFG A; 4DXF A; 4MM3 B; 2CHW A; 2REX A; 4EZK A; 4A3P A; 2DAF A; 2UU7 A; 4PS8 A; 1Q1O A; 2QEJ C; 3RN9 C; 4RGT A; 4KZC A; 2J53 A; 1V1O A; 3DHH C; 2CJO A; 4ZDV A; 2FCS A; 3P4S B; 3U4E G; 4FJY A; 1RRB A; 2KDM A; 2D5G A; 1AAR A; 3QWZ B; 4W9I A; 2INP E; 4B95 A; 4XX5 A; 3L16 A; 4HPL B; 3W9C B; 1YMH E; 3EA6 A; 4RFB A; 1V5T A; 2M56 B; 4P7I A; 1UWM A; 1SJH D; 1FEH A; 5H92 C; 4K81 A; 5IA7 A; 2IDY A; 3Q8C A; 4XZ4 A; 4MGY E; 1MHX A; 4GXB A; 1PGX A; 1F1H A; 1MHH E; 3U7D A; 1J7B A; 3IAS 1; 5AZG A; 4MJS A; 2DAJ A; 2CU3 A; 2IGH A; 2G9H D; 5DCN A; 3ZQ4 A; 3U8Z A; 1YN4 A; 3ZJU A; 1XD3 B; 2QJL A; 3A1Q B; 3AMZ A; 3P4Q B; 4WAA A; 2WXL A; 3QCA A; 3AED B; 1YQ3 B; 1L2N A; 2K5P A; 1T0R C; 1ZUD 2; 3NS1 A; 4GDL A; 1FCC C; 3W1S A; 2D3B A; 5E6J A; 1SE3 A; 1E7P B; 1WWT A; 4DDG D; 3U52 E; 4ZRQ A; 4IM0 A; 3P4P B; 2KTR A; 1JWU D; 2LUM A; 4YTM B; 3NVW A; 4YT0 B; 5AEK B; 2PPH A; 3FKY A; 3AEG B; 1ISN A; 3DQV A; 3UQA A; 2KFJ A; 1SXT A; 4KX6 B; 3SU8 X; 3AM9 A; 1B9R A; 3RNC C; 4NAW B; 4LK0 M; 1PFD A; 2AEH A; 2QSD A; 2H88 B; 1IGC A; 2KAJ A; 1GJZ A; 4MEL A; 5HHD G; 1VCB A; 1FNU A; 3VH4 B; 2M0A A; 3RNG C; 1KLU D; 3M63 B; 1TTN A; 2HJ1 A; 2QHO A; 2CHX A; 4PK1 A; 3S2A A; 1QOG A; 2MRP A; 1WXM A; 3BVM A; 2N9P C; 2J52 A; 1WRD B; 2KDE B; 2BB6 A; 1IUE A; 4HEA 1; 1KRH A; 3NHE B; 3VVW B; 2FCQ A; 4A20 A; 5G55 A; 3CF6 E; 4EFO A; 4ANW A; 3APD A; 2YLM A; 3PTF C; 5JHA A; 3MC8 A; 3MHZ A; 2MH7 A; 1C1Y B; 2NMQ A; 2W55 A; 3R7R A; 2W54 A; 3AE4 B; 4E71 A; 1K52 A; 4FA6 A; 1C4P A; 1VZ7 A; 3UGB B; 5JZE B; 4JL9 A; 1FMA D; 2SEB D; 3QIJ A; 3AE5 B; 2BB5 A; 4JQW C; 2JXX A; 3VFK A; 2JWZ A; 2JPH A; 1ZGU B; 3B0A A; 3QC8 B; 1QQR A; 1C78 A; 1WR6 E; 2GBK A; 2WDT B; 1VRA B; 1TS3 A; 2N9E B; 1XLO A; 5CX3 A; 4P6V F; 2HTH A; 2N9L A; 3Q6B A; 1F77 A; 4MDK E; 2R2Q A; 5KHO A; 1QT9 A; 2O6V D; 2IO0 B; 2KHW B; 4JLC A; 3U7Z A; 4FN2 A; 2KMA A; 4AQ7 A; 3RYT A; 4HPP A; 5D7G A; 3AE7 B; 4GU2 A; 2KMM A; 4UDU C; 5J2R A; 1NYR A; 1EO6 A; 2WDQ B; 3DCG A; 2JVC A; 3DHI C; 1SE4 A; 4GLS C; 1FM0 D; 2IO2 B; 4W9G A; 4OVZ A; 3GOE A; 2C9W B; 2XBB C; 3BWU D; 1PGA A; 2ZNV C; 3R3M A; 2KN5 A; 4GIV A; 2M1M A; 3ECI A; 1Z5S B; 1TKY A; 3AEC B; 2JYE A; 3MP9 A; 1QZE A; 1R4M B; 3CMM B; 3KWL A; 3BK1 A; 1VJK A; 2WU5 B; 4EZL A; 1ZXI A; 3CWI A; 3EGR A; 4JX1 C; 4WAF A; 4MSM B; 4D2K A; 2EEL A; 2J4X A; 3A9J B; 4KGR A; 3NJT A; 4Q2J A; 1R4M I; 1E7U A; 4OVV A; 4M0W B; 2K8B A; 2MBE A; 1NDD A; 3CIR B; 2IBI B; 1QF6 A; 3DVG X; 2Y5B B; 1KF6 B; 1Y8R C; 4NZL B; 1EF5 A; 3OJ4 B; 3KLS X; 1JRU A; 4ASW C; 1WXV A; 3I9V 1; 1E9M A; 3RNB C; 3ZTD A; 2BBC A; 1STE A; 4IM2 A; 1FO4 A; 1XLP A; 2RDG A; 5CHW A; 3L54 A; 3N1X C; 3AV8 A; 2PKO A; 2RMM A; 1OTR B; 1WJ6 A; 3UIN B; 4B0M A; 1OFF A; 1OQY A; 2LGY A; 2MP2 B; 1FFU A; 3L10 B; 5EE3 A; 2WWZ A; 1JCK B; 1D5M C; 2LAS A; 4JIO U; 3ZVV A; 4KGS A; 3V3X A; 4TQ1 A; 1PDX A; 2KQS A; 2NBU A; 4KKI A; 2LXC A; 3VDZ A; 1FRD A; 4BBN C; 1I7H A; 4IW0 A; 2D3C A; 1T3Q A; 4CO7 A; 3ZYY X; 1UZX B; 4K7S A; 4KGT A; 2L3Z A; 5TR5 A; 2NS5 A; 2N7J A; 1TS5 A; 1VZ6 A; 1QKZ A; 5LLI A; 1TBE A; 3VRA B; 1XLQ A; 2KN4 A; 5BYR A; 1TZ1 A; 4PS7 A; 4DDI D; 2OOB B; 4A8X C; 2FIF A; 1IBX A; 5EE1 A; 3Q8A A; 1L6U A; 2DZM A; 2E3T A; 3NY5 A; 4RNA A; 3O65 B; 2KWU B; 3H9D A; 3TJP A; 3B2F A; 1TZO A; 3AUL A; 4ARI A; 2L0T A; 2MJ3 A; 1OQR A; 2LUE A; 3B9J A; 1WGG A; 3RNF C; 3KQ4 A; 2B76 B; 1EM7 A; 5IN7 A; 4LDT B; 1JW9 D; 1YOV B; 3PHW B; 5KHQ A; 5D3I B; 2FAZ A; 2Z8L A; 2R61 A; 3H7S A; 5L83 A; 5DPW A; 1ZOY B; 3AB5 A; 4YTP B; 2NBV B; 3PRE A; 4ZRK A; 2CJN A; 4BKS D; 2L8J A; 4R3D A; 1CQV A; 1GB4 A; 4URK A; 3N20 C; 3PZD A; 3TIX A; 2PJH A; 2LRU A; 3AEF B; 1ZP0 B; 1AYF A; 4NQK E; 2MBH A; 1YJJ A; 4I6P A; 3FIL B; 4DK5 A; 1WXQ A; 4FJZ A; 1GAQ B; 3LDZ E; 4GDK A; 3KYD D; 1F9J A; 1ZPS A; 3SR6 A; 1GOZ A; 2D3G A; 2KC2 A; 2N9X A; 3NG0 A; 1FD6 A; 2PMV A; 3Q14 C; 4KV2 A; 2GI9 A; 2BS2 B; 5JH5 C; 1YN5 A; 2BTE A; 1XT9 B; 4H2A A; 3Q3M C; 4NJC A; 3K9O B; 3X23 A; 4HJG E; 3OLM D; 3PRZ A; 4AS1 A; 3DPD A; 3M3J A; 3WAP A; 2RPQ A; 1ROE A; 2C60 A; 3N32 A; 3RUL A; 2Z0E B; 1QLB B; 4BKT A; 2JXT A; 2FNJ B; 2KZR A; 4MGZ E; 2LHD A; 4B0E A; 2RDB C; 2ZZP B; 3QAR A; 1DGJ A; 1R4N B; 3A9K B; 3SFE B; 5HG2 A; 2KK8 A; 3NZU A; 1I4G A; 3QQ8 B; 1EU3 A; 4IKG A; 3IHP C; 3ZDT A; 4LJP B; 3T8M A; 4ZYN A; 2V3S A; 3W1Y A; 1RAX A; 5D3D A; 5G5H A; 1OGW A; 2G4D B; 3WA0 A; 4YSZ B; 1PQS A; 1EF1 A; 3KUZ A; 1EWC A; 1FXI A; 1L0V B; 2FBW B; 4OZB A; 2D10 A; 1ET9 A; 1R4N I; 3E9S A; 2I2Y A; 5J18 A; 2BF8 B; 1KFY B; 2PVG C; 4LNF A; 1LM8 B; 3ZJV A; 3VTV A; 4J6I A; 3DVN V; 3GZN B; 1M94 A; 4IC7 B; 1L4D B; 2YEP B; 2KTF A; 3N1Z C; 3GB1 A; 2B3A A; 2M17 A; 1V81 A; 4C80 A; 3Q69 A; 2E6X A; 2WXI A; 2G45 B; 4RGO S; 1L0X B; 2KQ7 A; 3TMP B; 3IAM 1; 4W9L A; 1AW7 A; 2PEA A; 2OJR A; 2CR5 A; 1YQ4 B; 2NTT A; 3GZN I; 2BS4 B; 2KWD A; 4KSL C; 4AOF A; 2WS3 B; 4JGH B; 4ZRJ A; 3KUD B; 1GG3 A; 1LO5 D; 3APF A; 3DOW A; 5LNK 1; 1BXT A; 2LI5 A; 3ABV B; 5C23 A; 1WJU A; 4TV3 A; 3WAM A; 4XDC A; 5HKH A; 4WUR A; 4II2 B; 5C2T B; 1K50 A; 2DYB A; 2IO1 B; 1SIJ A; 3PO0 A; 4IWO A; 3AE9 B; 5FK9 C; 2WP9 B; 3NS8 A; 3ZIM A; 1CZP A; 4N6E B; 2K9X A; 1E5W A; 3PLU A; 4IDI A; 4ZHP A; 2MLB A; 2BVC A; 3KH0 A; 3EFC A; 3D32 A; 1VR9 A; 1VDV A; 1ACC A; 3JW0 X; 3P2B A; 4K7W A; 1OQQ A; 3ETR A; 4WJP A; 3B1L X; 2WXK A; 4MSQ B; 2WXG A; 1MFW A; 1BML C; 3MJW A; 1UUP A; 1NBF C; 1K51 A; 4N59 A; 3UIP B; 2IYD B; 3QX1 A; 4A9A A; 2UYZ B; 3NUH B; 5LXH A; 1EWY C; 4DXA B; 1E8W A; 2AYO B; 2Y3A A; 1FPY A; 2DX5 B; 4M8M A; 1UF0 A; 1V6E A; 3H1U A; 1TJE A; 2NPT A; 4HJK A; 1UBQ A; 2G1E A; 1QOA A; 1V2Y A; 3Q3F A; 4BAX A; 2XN9 C; 3RNA C; 2LGI A; 4CQN A; 4MJS B; 4OHJ A; 3MJ5 A; 4A3O A; 1WIA A; 2ZVN A; 2GBJ A; 1Q0W B; 2LRW A; 2MX2 A; 2UWQ A; 5EDS A; 2JRI B; 4CHK A; 3PZ7 A; 1WE7 A; 3RZF A; 3W1S C; 2K8H A; 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4P16 A; 4LNN A; 2GLS A; 3RD2 A; 3H7P A; 3PVL A; 2PE9 A; 3TL5 A; 2K1F A; 1UWX A; 1YN3 A; 1ZDV A; 4TUU A; 2K8C A; 4O1N A; 2MHJ A; 1WM3 A; 3V62 A; 4MGI E; 4W9F A; 4HLE A; 1HXY D; 2WXQ A; 3BIN A; 4I6N B; 2V0G A; 2RDH A; 3ZDM C; 4LNO A; 2WDR B; 3ENE A; 4YSY B; 4WJQ A; 4YWG G; 2WXR A; 2MBQ A; 2JZZ A; 2WX1 A; 3JYU A; 1WGY A; 4F7Z A; 1PYW D; 4FUL A; 1V97 A; 4YL8 A; 4F1S A; 3BY4 B; 4W9E A; 2K22 A; 2WXF A; 1WGR A; 3JSV A; 2RSU A; 1FNW A; 4WJO A; 2MCN B; 4LTU A; 5BMH A; 4KKJ A; 1RFA A; 2A5U A; 1YQB A; 2KC1 A; 1JWM D; 1IYF A; 1AN8 A; 3IBE A; 4LDT D; 1JWS D; 3BZD B; 4CYE A; 1E8X A; 1NI2 A; 2BQQ A; 3C8Y A; 2O6V A; 4C7Z A; 4L1B A; 1ZXH A; 5GMV A; 4NY0 A; 3VXW A; 3PRP B; 2PW9 A; 4HVB A; 2IPK D; 3VAW A; 4JWU C; 4JPS A; 4M02 A; 4RF0 A; 4MAC A; 2JT4 B; 2QIE B; 2N4F A; 3AEE B; 4DQO C; 1I4R A; 4BOS C; 3ZTC A; 2IY1 B; 1TGZ B; 4US9 A; 4DXG A; 4TSS A; 1WRI A; 1DOY A; 2SAK A; 3N3K B; 4J3O D; 3UF8 A; 3GS2 A; 4MT5 A; 3RFZ B; 4NJ7 A; 2XK5 A; 2DZJ A; 5G5G A; 3ALB A; 1ESF A; 1UGJ A; 1V1P A; 4IOI E; 2K3U A; 3OWE B; 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