The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MTYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immunoglobulin binding protein
|
| molecule keywords |
PROTEIN G
|
| publication title |
A novel, highly stable fold of the immunoglobulin binding domain of streptococcal protein G.
pubmed rcsb |
| source organism |
Streptomyces griseus
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| total genus |
10
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1991-05-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LHE A; 2IGG A; 1QKZ A; 4HKZ E; 2N9K A; 5HFY A; 1MHX A; 1IBX B; 2KWD A; 2K0P A; 4OZA A; 2IGH A; 2KN4 A; 2QMT A; 1HEZ E; 1XF5 L; 2GB1 A; 2KQ4 X; 4MAC A; 2ZW0 A; 1K52 A; 1PGA A; 1PGX A; 2RMM A; 1IGC A; 2JSV X; 1K53 A; 3MP9 A; 1MHH E; 5BMG A; 2RPV A; 4KGS A; 5BMH A; 1PGB A; 2I2Y A; 1D4B A; 2IGD A; 1YMH E; 1XCT L; 2OED A; 1XCQ L; 2JZP A; 2ONQ A; 2N9L A; 4D2K A; 2LGI A; 2EEL A; 2JWU A; 1UWX A; 1YNT E; 2ON8 A; 2PLP A; 2KDM A; 1IGD A; 2QSD A; 2KAC A; 5HG2 A; 4KGT A; 1HZ6 A; 2N7J A; 5BMI A; 1ZXH A; 1GB4 A; 3FIL A; 2J53 A; 1HZ5 A; 1F2R I; 1C9F A; 1FD6 A; 1EM7 A; 2PTL A; 3GB1 A; 5HHD G; 1MPE A; 2NMQ A; 2GI9 A; 1K51 A; 1MI0 A; 2I38 A; 1IBX A; 4HJG E; 1P7F A; 3V3X A; 1FCC C; 3UI3 A; 4GLS C; 4OZC A; 5JXV A; 2JU6 X; 1Q10 A; 4KGR A; 4OZB A; 1KH0 A; 1K50 A; 4WH4 A; 1FCL A; 5HI1 A; 1F2R C; 2JXT A; 2LHD A; 1MVK A; 2LUM A; 4IKG A; 1P7E A; 3FIL B; 1GB1 A; 2PW9 A; 4IOI E; 1JML A; 2J52 A; 2ZW1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2FCS A; 1WXS A; 2NBW B; 4PK1 A; 4I6L B; 2LJI A; 2KN4 A; 2D3A A; 3VR8 B; 4NJC A; 1DOX A; 1HXY D; 4G11 A; 2WU2 B; 1ZXI A; 3HM3 A; 1GAQ B; 2MJ3 A; 4JWU C; 4FJV B; 3DHG C; 3N30 A; 2LAS A; 5BMH A; 3L54 A; 1D4B A; 2GBR A; 2L0T A; 1TZO A; 4FLH A; 1BT0 A; 4WJQ A; 3ZRC A; 4ICU A; 2JZP A; 1QLB B; 4WAF A; 2NVU I; 3U30 A; 4J3O D; 2INN E; 1GG3 A; 4FHJ A; 4HPM B; 1S1Q B; 3L10 B; 2PLP A; 1IGD A; 3Q6B A; 2QSD A; 2I1J A; 1GB4 A; 2WXM A; 2UWQ A; 3QK0 A; 5JHB A; 2IYD B; 4E3C A; 4FXC A; 2NMQ A; 4HDO A; 4JX1 C; 4RGO S; 1S3S G; 2B3A A; 2BTE A; 1P7F A; 2FCM A; 5E6N A; 3PLU A; 1TKE A; 3ZVV A; 2ZVN A; 3R2I A; 4B95 A; 1SGH A; 2Q5W D; 1UGM A; 2K22 A; 4NQL B; 1KH0 A; 4HPP A; 1HA5 A; 1JWB D; 2WU5 B; 1WGH A; 1WGY A; 2BWF A; 2DZI A; 2VH2 A; 3UQA A; 2PW9 A; 3AE5 B; 3PT2 B; 2BYT A; 2KJR A; 1WXM A; 4BOZ B; 3VRB B; 1EWC A; 1ZOY B; 2JWZ A; 4N6E B; 3IHP C; 1WRI A; 3P63 A; 4GGQ A; 1SE2 A; 2KNB A; 4FAD A; 4JL9 A; 1BUI C; 2W9N A; 2WP9 B; 1SEB D; 1L0V B; 4AWJ A; 1SB3 C; 1AW7 A; 3AMZ A; 1FRR A; 4NY0 A; 2O6V A; 2ZW0 A; 1N6Z A; 4HCN B; 5HKH A; 2V9H A; 4W9E A; 2ZCC A; 3B0A A; 1WE7 A; 3DWM A; 2C9W B; 3QC8 B; 1CMX B; 2A4Z A; 2J0K A; 3BZD B; 1FXI A; 2GBM A; 3R7R A; 3P4R B; 1UD7 A; 1XEE A; 4EE2 A; 1C1Y B; 1T3Q A; 3GS2 A; 4ZHO A; 2X8X X; 3I5J C; 4JPS A; 1Y56 A; 3ZKJ C; 3IAM 1; 3NZU A; 2WHI A; 1ET9 A; 3AE7 B; 2L76 A; 2VZK D; 1UWX A; 4K81 A; 2LI5 A; 1YJI A; 5CHF A; 3B2G A; 3HVZ A; 3FKY A; 2O6V B; 4HLE A; 5C23 A; 5HG2 A; 1HZ6 A; 1R7S A; 1TY2 A; 4JGH B; 2ASQ A; 4NQK E; 3EFU A; 4A20 A; 2NR2 A; 1FD6 A; 2PE6 B; 4BKG A; 2KTR A; 2KQ7 A; 4ARI A; 1T6B X; 2KDE B; 3ZNG C; 4F7Z A; 3AE1 B; 3B2F A; 2ZCB A; 4W9F A; 3PV1 A; 5EE9 A; 3ZXV A; 1XD3 B; 3VQI A; 4PS3 A; 4Q2J A; 5HI1 A; 4P16 A; 2DEN B; 3N3K B; 4KZ0 A; 1B9R A; 3KWV A; 2KTR B; 5JH5 C; 2M19 A; 2KYW A; 1RFA A; 2FID A; 1JWM D; 2KO3 A; 3RNG C; 2MRP A; 3MJ5 A; 2IGG A; 3Q3M C; 2MBQ A; 3ZNI D; 2N9K A; 1D5X C; 2D2Q A; 4E71 A; 5HFY A; 2R61 A; 2NCN A; 1LFD A; 2EMT A; 2HTH A; 2KQ4 X; 2ZNV B; 2PE9 A; 3NS8 A; 3ZQ4 A; 2N9E B; 2DZJ A; 1FIQ A; 2G3Q B; 3MTN B; 1YOV B; 3W5V B; 4HJK A; 4TMA B; 4KKJ A; 3PRM B; 2N4F A; 1WMH A; 3ZTD A; 4D2K A; 2RR9 A; 4BBN F; 4L2Y A; 2M0X A; 4MGK E; 1QQR A; 3PRZ A; 2KDM A; 4PS7 A; 1RM6 C; 1T0Y A; 4OVV A; 1UWM A; 3VUW A; 1WY8 A; 3B1L X; 4II3 B; 2PTL A; 2DYO A; 2D10 A; 4LNK A; 4US9 A; 3QHT A; 3P4S B; 4HJG E; 2XEW A; 3ZRF A; 4DQO C; 1V1O A; 2BB5 A; 5IAA C; 1WMH B; 1E9M A; 3VH4 B; 2KMC A; 4NZL B; 2WNM A; 1HQR D; 3GOE A; 4RF1 A; 4MH8 A; 1UF0 A; 3AB5 A; 1DOY A; 4TSS A; 2L52 A; 4P6V F; 3WIM A; 1C78 A; 4LTU A; 2CHX A; 2MLB A; 4YXD B; 3Q14 C; 3U4E G; 3MC9 A; 4GMV A; 2N9P C; 4O1N A; 1NEK B; 1I4X A; 2IPK D; 4RNA A; 3PZ7 A; 4W9I A; 1GPX A; 1SSN A; 3NG0 A; 3BVM A; 1F77 A; 1NEN B; 1QOG A; 4MT5 A; 2OJR A; 3RN9 C; 2I1K A; 2MP2 A; 4XWT A; 1EO6 A; 1JWS D; 2LRW A; 4B0E A; 2JRI B; 1N5X A; 2V3S A; 3KWL A; 1E6E B; 4YSX B; 3IXS A; 5FK9 C; 2TSS A; 1JWA D; 1D5M C; 2LXC A; 1E7V A; 3VR9 B; 4RH6 A; 3PZD A; 5LXH A; 4US8 A; 2RPQ A; 3ALB A; 4MGZ E; 2FUG 1; 1PFD A; 2QIE B; 4B6W A; 5AZF A; 3OLM D; 4EFO A; 2MP2 B; 4BFR A; 1XT9 B; 1MG8 A; 4KZC A; 3W9C B; 2PIA A; 3JVZ X; 4MEL A; 1F2R I; 5I4D A; 3N1Z C; 2IBI B; 4F8C B; 3PRP B; 1A70 A; 2HD5 B; 3TCA A; 3UIN B; 3GE8 C; 2M8S A; 5EE3 A; 4PYU A; 3C0R B; 4EOY A; 2MBO A; 1XQQ A; 1FPY A; 2RDB C; 1NI3 A; 4WWM A; 2AX5 A; 1X1M A; 3BYT B; 3CMM B; 2LMC A; 2IO1 B; 2NTS A; 4LNO A; 1JCK B; 2CHW A; 1HTQ A; 4G0N B; 2M1M A; 4MGI E; 4WIP A; 2D07 B; 3DBL I; 3T9L A; 3V60 A; 3DVN U; 1GB1 A; 1UGJ A; 2CKH B; 2KT7 A; 3P1M A; 1YJJ A; 1HTO A; 5G5H A; 4ASW C; 1WJ6 A; 2BKR B; 1MJD A; 5E6J A; 3TL5 A; 2YEP B; 3PPA A; 3H7P A; 3LJ3 A; 4ZRQ A; 2QMT A; 3NVZ A; 4URK A; 2JXX A; 3TJP A; 1WGK A; 4BAX A; 3K9P B; 1I4R A; 3APF A; 4YL8 A; 3ML9 A; 4MM3 A; 2BS4 B; 2X38 A; 3NRZ A; 4NAW A; 3U2S C; 2Z59 B; 2G45 B; 2AWT A; 2H89 B; 3DOW A; 3KUD B; 3VTU A; 4BVU C; 3UQB A; 2L05 A; 3E56 A; 1TT5 B; 2WDT B; 2GBJ A; 4HPL B; 1GOZ A; 3MFG A; 3H7P B; 3V6E B; 3LXF A; 2BT6 A; 5J2R A; 2Y5B B; 3VTV A; 2WXN A; 3DBH I; 1RAX A; 2LJ5 A; 2FE8 A; 1WR6 E; 4MM3 B; 1C4A A; 1V9J A; 1H4R A; 4L23 A; 4PS8 A; 4W9D A; 2BKF A; 2WX0 A; 3TEZ A; 1J0G A; 4C7Z A; 5H92 C; 2K39 A; 1QOB A; 4AUQ C; 4I6N B; 1GUA B; 4XZ4 A; 2DYM A; 5BYR A; 5IKC M; 5DPW A; 2KMA A; 1AYF A; 2ICI A; 3AEE B; 3I63 C; 2M4N A; 3Q69 A; 1FXA A; 1L7Y A; 2BWE S; 1V97 A; 2HE7 A; 1WZ0 A; 2BS2 B; 4YTN B; 3RNB C; 3QJZ A; 3C8Y A; 2N7D A; 2JXT A; 2OHF A; 2KLG A; 5D2M B; 1YQB A; 2NBV B; 3GZN I; 3W2D A; 4RGN A; 3RUL A; 4ZYN A; 1LXD A; 4ARC A; 3A1Q A; 1OQY A; 2LHE A; 5LLI A; 4DWF A; 3RNC C; 1KOT A; 4NPN A; 3RYT A; 5G5G A; 1MHX A; 2KWD A; 1TYG B; 2VH1 A; 4JWS C; 1OEY J; 3Q8A A; 1P98 A; 4W9C A; 1HEZ E; 2NTT A; 1JRP A; 1BML C; 1K52 A; 1PGA A; 2RMM A; 1XLN A; 4M01 A; 4I6P A; 3PHX B; 1WYG A; 4IM2 A; 1CK1 A; 3V6C B; 1J7C A; 2XBB C; 2JVC A; 3NOB A; 1YMH E; 2JT4 B; 2AYO B; 1XCT L; 3Q8F A; 2J42 A; 3SR6 A; 1SBB B; 3HHM A; 3N1X C; 2N9L A; 1D3Z A; 3A1Q B; 4LNI A; 2LZ6 A; 2KQS A; 1PQS A; 3EC8 A; 4M0W A; 4REZ A; 1I4H A; 1XLP A; 2MH7 A; 2V4I B; 2XK5 A; 2V1Y A; 1IUE A; 3NZS A; 2MSE D; 2BS3 B; 3DHI C; 4FN2 A; 3GP7 A; 1YQ4 B; 2O2V A; 1L6V A; 2N7J A; 2JPH A; 4N59 A; 2AL3 A; 2KX3 A; 2WXK A; 4JLC A; 4FJZ A; 5C1Z A; 3DBL B; 2K6Q A; 1E7P B; 3KLS X; 1ZDV A; 2LRU A; 2MJE A; 2W3R A; 1FO4 A; 1TY0 A; 3Q8C A; 1WZ3 A; 4MEM A; 2FUH B; 5GMV A; 3HM6 X; 4AJW A; 2IDY A; 3LB8 C; 2KWU B; 4M0W B; 4OZC A; 2WDR B; 4WWP A; 2XK5 B; 1DGJ A; 4WH4 A; 2KAN A; 2LXA A; 4MSM B; 3SU8 X; 4A8X C; 4HDQ A; 1Y8R C; 2O2V B; 4XGA B; 4DXG A; 2FBW B; 2YEP F; 2FAZ A; 3BWU D; 3VXW A; 4IOI E; 2BYE A; 2QJL A; 4P7I A; 3AI5 A; 1QZE A; 4XE0 A; 3T3O A; 1WGG A; 2EKI A; 3H6N A; 2WXF A; 2E3T A; 2WS3 B; 1FNW A; 2EKE C; 1PGX A; 2HDE A; 3DBH B; 1MG4 A; 1YD8 U; 2BW2 A; 1SE4 A; 1V6E A; 1XLQ A; 3WAN A; 3WAP A; 2KKC A; 5GXG B; 1VZ7 A; 2LGS A; 2I2Y A; 1KM7 A; 1LGR A; 3RNF C; 1R4M I; 1PDX A; 4J6I A; 4XDD A; 3AEF B; 3BVZ A; 3ZUN A; 1ZP0 B; 1DYQ A; 2CHZ A; 4TQ0 A; 4A90 A; 3N20 C; 2J0M A; 4GDK A; 1JRU A; 2KC2 A; 1WXA A; 2Y5P A; 2GBN A; 1OGW A; 4WJN A; 3Q2A C; 1TS3 A; 3H1U A; 3VUX A; 5HHD G; 2DNF A; 3VRA B; 2AEH A; 4C4V A; 3GZN B; 1MI0 A; 4XDC A; 2WXO A; 4EUT A; 3V61 A; 2DAF A; 1AN8 A; 1KJT A; 3PRE A; 3S2A A; 3AUL A; 4A9A A; 3AEB B; 1P3Q U; 3QAR A; 3M95 A; 1Q0W B; 3NVY A; 4GDK B; 2MBE A; 4WUR A; 4A55 A; 1L0Y B; 2W55 A; 5FR6 A; 3P4P B; 5CHV C; 1FEH A; 5EE1 A; 5G2N A; 3QCA A; 5FR3 A; 1YQ3 B; 4IM0 A; 4JIO U; 2H88 B; 3VUY A; 1JML A; 4DHZ B; 3SEB A; 5EDS A; 2QEJ C; 2HJ8 A; 3TEY A; 1T0S C; 5BYS A; 4C4V B; 4N9F 4; 1VDV A; 3JSV A; 5DPT A; 4HKZ E; 1WXQ A; 4IWQ A; 4PYZ A; 1SIF A; 1E5W A; 2LGX A; 2IY0 B; 2LWP A; 3VAW A; 2O6V D; 1PUT A; 5H8Y E; 1FNV A; 3M62 B; 2IZV B; 3TUO A; 1YJ1 A; 2C7N B; 1E0Z A; 2KLC A; 4KGS A; 2KDI A; 3ZO5 B; 4IM3 A; 1FRD A; 5BO4 B; 1WFY A; 1XCQ L; 2MEK A; 2N9X A; 1QOA A; 2ONQ A; 3ECI A; 1ESF A; 4WWO A; 3JSV B; 4C7Y A; 2A5U A; 3SHQ A; 2G9H D; 3R8B A; 5DPR A; 4M8M A; 4C00 A; 2KJH B; 1I4P A; 3O13 A; 5MPO A; 4MDK E; 1NYR A; 2JYT A; 3D32 A; 2RGF A; 4USA A; 2MWS B; 1IYF A; 3ONS A; 3O65 B; 1KLV A; 1RFK A; 2LGD A; 3AN1 A; 3ZNH B; 1H8C A; 2K8C A; 1I4Q A; 3PZ8 A; 4KSL C; 3ZGZ A; 1WJ4 A; 4WQM A; 3KYD D; 5EE0 A; 1F0Z A; 4DXF A; 2WXJ A; 3QIJ A; 4OVZ A; 3DVN V; 2JUO A; 2IND C; 4AS1 A; 2REX A; 3DVG Y; 4ACF A; 3OJ3 A; 1GNU A; 1F2R C; 3B08 A; 3P4Q B; 3SFE B; 1P7E A; 1JAL A; 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4MAC A; 4RGT A; 5D3I B; 2LFI A; 1KLU D; 2Z8L A; 4II2 B; 1TTN A; 1LM8 B; 4HKQ A; 3AEG B; 4YWG G; 3A4S C; 4RMA A; 3A9J A; 3V62 A; 1E8X A; 1A5R A; 2OED A; 3CST A; 3WCQ A; 3EEC A; 2OOB B; 4C80 A; 2L1A A; 2MX2 A; 4LLG M; 4NNJ B; 4LDT B; 2LVQ A; 2WDV B; 4TV3 A; 3AE4 B; 2SAK A; 2N0S B; 3RZW C; 3NZ3 A; 1F52 A; 4P1C C; 3NJT A; 2LUE A; 4HK2 A; 4LNF A; 4HWI B; 1WXV A; 2YVC A; 3A9J B; 3IVF A; 1J19 A; 2K8H A; 4AP4 C; 4X57 B; 1IBX A; 4ZRK A; 3X23 A; 1OEY A; 4OVU A; 3V3X A; 4GXB A; 3Q8B A; 2QIL A; 3DBR B; 2WXH A; 2FIF A; 3A9K A; 4KGR A; 1K8R B; 4DHJ B; 4BOS C; 4C56 C; 2KDB A; 2LHD A; 4IKG A; 4RM8 A; 3HRD D; 5BYQ A; 2HJ1 A; 4YTP B; 4IUM B; 1R4N I; 4AQ7 A; 5FKA C; 1WIA A; 2ZPN A; 2ZNV C; 2NPT A; 3DWG C; 1IBX B; 3QAQ A; 1V5T A; 2K9X A; 3ML8 A; 1ZE3 D; 1V5O A; 3BVG A; 2PVO D; 2BF8 B; 4YSZ B; 5IA7 A; 1JQ4 A; 2KVZ A; 3QX1 A; 3A9K B; 1Z2M A; 2JSV X; 2Z0E B; 1VZ6 A; 3Q3N C; 1B1Z A; 1MHH E; 1WGR A; 2IO0 B; 1YIW A; 1FFV A; 4ZOH C; 3PLV A; 1VLB A; 2N7E A; 1KLG D; 3A4R A; 1L5P A; 4W9J A; 3TEW A; 5DPS A; 1EU3 A; 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