The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWCYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| total genus |
16
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2NMQ A; 3V3X A; 1IBX A; 1UWX A; 2K0P A; 4GLS C; 1XCQ L; 2J53 A; 1KH0 A; 2JXT A; 1HEZ E; 1JML A; 2ONQ A; 2PTL A; 2KN4 A; 1K51 A; 4KGT A; 5BMH A; 2OED A; 1PGA A; 4OZC A; 2I2Y A; 1IGC A; 1FCC C; 1FD6 A; 1F2R C; 5HG2 A; 1MPE A; 2EEL A; 2ZW0 A; 2JWU A; 2LHE A; 1XCT L; 1K52 A; 1Q10 A; 2IGD A; 2JSV X; 1MVK A; 3GB1 A; 1YNT E; 2GI9 A; 5JXV A; 4OZB A; 2KDM A; 2LHD A; 1HZ6 A; 5HI1 A; 2JZP A; 1PGB A; 2IGG A; 3FIL A; 5HFY A; 3MP9 A; 4OZA A; 1YMH E; 2RPV A; 4KGS A; 2I38 A; 2IGH A; 2PW9 A; 1MHX A; 1P7F A; 4HKZ E; 2N9L A; 1K50 A; 1PGX A; 2PLP A; 5BMI A; 1C9F A; 4D2K A; 4IKG A; 1FCL A; 4WH4 A; 5BMG A; 2GB1 A; 1IBX B; 4MAC A; 1K53 A; 2N7J A; 2ON8 A; 1MHH E; 2ZW1 A; 1GB1 A; 2JU6 X; 1HZ5 A; 2QMT A; 2LGI A; 2RMM A; 5HHD G; 1IGD A; 1P7E A; 4IOI E; 3UI3 A; 2KQ4 X; 1XF5 L; 2LUM A; 1MI0 A; 3FIL B; 1GB4 A; 1QKZ A; 1ZXH A; 2QSD A; 2J52 A; 2KWD A; 1EM7 A; 4KGR A; 1F2R I; 1D4B A; 2KAC A; 4HJG E; 2N9K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5AZG A; 2RSU A; 1D5X C; 2JQR B; 1F1H A; 2MCN B; 3R2I A; 1GC7 A; 1AW7 A; 4GDL A; 2J42 A; 1YN4 A; 2IO3 B; 4HDO A; 3TSS A; 2MEK A; 4ICU A; 3LYY A; 2L7R A; 3ZLZ A; 3ENE A; 4X57 B; 1YJI A; 2AL3 A; 1J8C A; 2BYV E; 3VRA B; 3VH3 B; 1IGC A; 5DPS A; 2QJL A; 3T8M A; 4E71 A; 1QQR A; 1BT0 A; 2B76 B; 3NVW A; 1D5Z C; 2WDT B; 3U8Z A; 3Q69 A; 1NYQ A; 3Q6B A; 2MWS B; 2Z59 B; 4MGI E; 5HI1 A; 3V05 A; 3QHT A; 2RDB C; 4IC7 B; 3DWM A; 2KTF A; 1A5R A; 3DDC B; 3AE9 B; 3NVZ A; 4FUL A; 1WMH A; 3M95 A; 2MP2 B; 2AEH A; 3TBL D; 2N9L A; 3DBR I; 5AUI A; 2KK8 A; 3HM6 X; 3MC0 B; 3P2B A; 4KSK C; 1KLV A; 1IUE A; 3UIN B; 4CYE A; 1I4Q A; 4DQO C; 4NJC A; 1KF6 B; 4YSZ B; 2CHZ A; 1I4G A; 2G45 B; 3PO0 A; 2M56 B; 2WXP A; 1IGD A; 4JQW C; 1P7E A; 1CJE A; 1MI0 A; 3FIL B; 2BS4 B; 3RMK C; 4ZRI A; 2DZJ A; 2K22 A; 4YXD B; 1WJU A; 1OQY A; 3N1Y C; 1E10 A; 1D4B A; 3NOB A; 3W1S C; 2DWQ A; 5DPT A; 4AJY B; 1X1M A; 2DYO A; 1UBI A; 1SSN A; 2INP E; 2GBN A; 2L83 A; 1VZ6 A; 2WQY B; 3MJW A; 5L95 C; 4RGN A; 2W3S A; 2REX A; 2KC1 A; 2L0F A; 2UWQ A; 2LRU A; 3AEF B; 1MG4 A; 5BYS A; 3RNB C; 4BKS D; 1EUV B; 4PS8 A; 2D3B A; 4WWP A; 4EZJ A; 1RWS A; 3ZIM A; 2I1J A; 3W2D A; 1SEB D; 4RNA A; 3ZW3 A; 2PVG C; 4HDQ A; 5BO4 B; 1J19 A; 1V80 A; 4OZB A; 2KMA A; 2DNF A; 4IDI A; 2MA9 B; 4GMV A; 2PVO D; 2NS5 A; 1PGB A; 3V61 A; 4NJ7 A; 2M0A A; 4IWP A; 1E8W A; 4QAY A; 4E74 A; 1TBE A; 4W9L A; 1YD8 U; 2L05 A; 3SR6 A; 2QC8 A; 2CU1 A; 4YT0 B; 4DXF A; 1E9M A; 1ZE3 D; 4W9K A; 3ML8 A; 3KUZ A; 1T0S C; 1PGX A; 4USA A; 2DAF A; 3V62 A; 1I35 A; 2AQ3 B; 2IYD B; 4KV2 A; 3AXC A; 1NI2 A; 3MJ5 A; 2NBW B; 1TS2 A; 4ASW C; 2BT6 A; 5H8Y E; 4A90 A; 1JWM D; 1PYW D; 2E6X A; 2QMT A; 3N20 C; 2LGI A; 2JYE A; 4L23 A; 5AUK A; 4RFB A; 3N1X C; 3ZRC A; 4BKT A; 4DWF A; 4MGK E; 3ECI A; 4A55 A; 3ZNZ B; 3QAQ A; 2DBY A; 3PRP B; 4GU2 A; 5E6N A; 1WGD A; 4C56 C; 4KGR A; 1TGZ B; 1WX8 A; 2LI5 A; 2MQJ A; 4AWJ A; 4K7U A; 4JWS C; 4REZ A; 1L6V A; 2GMI C; 5EDS A; 2RDG A; 3ML9 A; 3NY5 A; 3TMP B; 3NRZ A; 3AEB B; 1R4N B; 3VAW A; 5CX3 A; 2Q5W D; 2EMS A; 3VUX A; 2BBC A; 2GBK A; 2ZPN A; 4K81 A; 4MSM B; 4BBN F; 1UGJ A; 1XO3 A; 4XWW A; 3B08 A; 4RM9 A; 3NVV A; 1NYR A; 3WAL A; 2XK5 A; 4ZRJ A; 2JSV X; 4M0W B; 1C1Y B; 3ONS A; 4KKJ A; 1JRU A; 5TSS A; 4WJO A; 2WXG A; 2J7Q B; 2MRP A; 4AJW A; 5J17 A; 4BVU C; 3VUW A; 1C78 A; 1L5P A; 5JZE B; 4OZA A; 3PTF C; 4C7Z A; 2N7D A; 1YMH E; 3TEY A; 3W5V B; 2LRW A; 2NBU A; 1MHX A; 4HKZ E; 1MJD A; 2K6D B; 5D3I B; 2PLP A; 3Q3F A; 4KKI A; 3P1M A; 3AH7 A; 1U4A A; 5D94 A; 3PHW B; 5J18 A; 4MEL A; 3VFK A; 1TS3 A; 3RUL A; 3Q8C A; 4MAC A; 3LJ3 A; 3DOW A; 3IHP C; 1DOI A; 2JU6 X; 4BZA A; 4S17 A; 3N30 A; 3OLM D; 1WXM A; 4KDI C; 3NHE B; 2IY1 B; 1UGM A; 2L32 A; 4ANU A; 2ZVN A; 2MP2 A; 3UGB B; 4RF1 A; 1EM7 A; 1YQ3 B; 1SF0 A; 1UH6 A; 1V97 A; 3HVZ A; 1VJK A; 3ZTC A; 3N9Y C; 4ZYN A; 1WGY A; 1Z2M A; 2LAS A; 4NY0 A; 4HK2 A; 1JQ4 A; 2PPH A; 1V9J A; 3Q3J A; 1VLB A; 1FMA D; 2HJ1 A; 3ZTD A; 2FIF A; 1ZDX A; 2O2V B; 2ZPY A; 3BY4 B; 2BKR B; 4ZYS A; 3B1L X; 2V0G A; 3P42 A; 2JY6 A; 3H8H A; 2FCS A; 3SDL C; 4L2Y A; 5G5H A; 3A1Q A; 5GXG B; 3SHQ A; 1T0R C; 5JXV A; 4MGY E; 3U52 E; 4US8 A; 1SXT A; 3AU4 A; 1C4A A; 2A4Z A; 4RGM A; 2W3R A; 2KTR A; 1FFU A; 1WR6 E; 2KJR A; 2M0X A; 3EUB 2; 4WQM A; 4IM3 A; 2O6V B; 2BYT A; 3MTN B; 2K8C A; 2MHJ A; 2AL6 A; 3QJZ A; 5LXI B; 1DOX A; 1NVI D; 2KDF B; 3KYD D; 2Y5C A; 4TMA B; 1IBX B; 2BF8 B; 2O6V D; 1MHH E; 3AE2 B; 1HZ5 A; 3IG3 A; 2EMT A; 2HJ8 A; 4IUM B; 2JVC A; 4MSQ B; 1KOT A; 1D3Z A; 2H88 B; 4JL9 A; 2YEP F; 3APF A; 1FRD A; 1KJT A; 2KO3 A; 1CMX B; 4P6V F; 2NMQ A; 2KAN A; 2KHW B; 5T8I A; 3FAH A; 2LGX A; 3IT6 B; 4KIK B; 1SIF A; 1WGG A; 3PT2 B; 3DVG Y; 2OHF A; 4DHJ D; 4FA6 A; 1YN3 A; 1WY8 A; 1N6Z A; 3PSE B; 1WYG A; 2UU7 A; 4URK A; 1PGA A; 3SD5 A; 1ET9 A; 2WDV B; 2I2Y A; 1K8R B; 3L4P A; 1F2R C; 3V60 A; 1IPG A; 1H8C A; 2BGF A; 1R4N I; 2ZW0 A; 2WXL A; 2KLC A; 2XNA C; 1XCT L; 3ZGZ A; 1Q10 A; 3ABV B; 2DX5 B; 2QHO A; 3UQB A; 2M19 A; 3O13 A; 2GI9 A; 1G6J A; 4XDC A; 2MJD A; 3A4R A; 3BIN A; 2JZ3 B; 3UIP B; 5IAA C; 4LJP B; 3VR8 B; 3MP9 A; 3QC8 B; 4LDT D; 3QA8 A; 5D3D A; 3W1Y A; 2WX0 A; 2RDH A; 1NBF C; 1HE8 A; 1Z5S B; 1C77 A; 1XLP A; 1T0Q C; 5GMV A; 1WWT A; 2JWZ A; 3VDZ A; 1R4M B; 1UUP A; 2K39 A; 5BMI A; 1R7S A; 1E8Y A; 3AE1 B; 4OVZ A; 4FHK A; 1I42 A; 1KFY B; 1SJE D; 2LEK A; 1WGH A; 3RPF C; 1UWM A; 1EO6 A; 2KX3 A; 4FAD A; 5HHD G; 2IBI B; 3FKY A; 2WU2 B; 5TR5 A; 3U4E G; 2K8B A; 1GG3 A; 3I3T B; 1QKZ A; 1OQQ A; 3Q3N C; 2CR5 A; 1FXI A; 2KMM A; 5LLI A; 3AV8 A; 3HHM A; 3OG5 A; 5D6J B; 3W5U B; 1E5W A; 3BK2 A; 1STE A; 1J7B A; 1ZPS A; 1FM0 D; 1WM2 A; 2KKC A; 3BYT B; 2W82 A; 1VR9 A; 4ARC A; 2ONQ A; 1WYW B; 2DZM A; 1TZ1 A; 1TS5 A; 4GIV A; 3KQ4 A; 2YEP B; 1GAQ B; 4CHK A; 2N9X A; 1WIA A; 1WJN A; 5MPO A; 1DYQ A; 4OZC A; 1H4R A; 2NBV B; 2JZZ A; 4UDU C; 1YIW A; 2IZV B; 1MPE A; 3P4Q B; 4ZRQ A; 2N9P C; 1WX7 A; 2LXA A; 5HKH A; 3V6C B; 3I5J C; 4BAX A; 3AED B; 1YQ4 B; 1YX5 B; 1QOA A; 3UIO B; 5FR3 A; 2BWF A; 1E7V A; 2CS4 A; 2G4D B; 2N1V A; 2KN5 A; 1PFD A; 4G0N B; 1FRR A; 1GOZ A; 1Q5W B; 3KH0 A; 1WZ3 A; 3M62 B; 1L4D B; 3NJT A; 2O2V A; 4ANX A; 2MBQ A; 1P7F A; 4FBJ B; 1WI0 A; 2WXQ A; 4L1B A; 4LJO B; 4A20 A; 3I9V 1; 2GRI A; 4H2A A; 2KQ7 A; 2CHX A; 5C3J B; 3BII D; 3RZW C; 4WH4 A; 4K3C A; 1AWD A; 2DLB A; 2OJR A; 2X38 A; 1XLQ A; 2KWC A; 2JRH A; 3RYT A; 4AOF A; 3EFC A; 1P0R A; 3TEZ A; 2M1M A; 3HVD A; 4LNO A; 3AE6 B; 2D11 A; 1TKE A; 1RFA A; 4JLC A; 4JX1 C; 3ZYY X; 5AZH A; 1N5W A; 5DPR A; 2SEB D; 3CMM B; 1V5O A; 3MC9 A; 3AE7 B; 1IBX A; 2MW5 A; 2ACZ B; 1XQQ A; 1DGJ A; 3BYY B; 3OJ3 A; 1L4Z B; 1TJE A; 3TCA A; 2KN4 A; 3VH4 B; 3T3O A; 1PUT A; 3K9P B; 4AS1 A; 4JPS A; 3AE5 B; 1TKY A; 3QAR A; 2E3T A; 2KDB A; 4PYU A; 4B0M A; 4DK5 A; 2MBH A; 4G11 A; 3KVF B; 2IGD A; 3MFG A; 2K1F A; 2CKH B; 4NZL B; 1YNT E; 5G2N A; 4HKQ A; 2LHD A; 1JRP A; 4YTM B; 3TEW A; 4KIK A; 3U7Z A; 4PS7 A; 4FJZ A; 1V86 A; 3ZRF A; 3NZ3 A; 4ICV A; 1J7C A; 3DBH B; 3HUI A; 2FID A; 2QDF A; 2MH7 A; 1QOG A; 1K50 A; 4M02 A; 1QF6 A; 2KNB A; 1ESF A; 2N1W A; 2N7J A; 2WXF A; 2BS2 B; 1J7A A; 4A9A A; 2LMC A; 2KQS A; 1D5M C; 1R4M I; 1L2N A; 2J0J A; 3QWZ B; 1T3Q A; 2WXK A; 1WZ0 A; 1XF5 L; 4ZDV A; 1YJJ A; 3PGE A; 1WX9 A; 2KZR A; 1M94 A; 4C80 A; 3R8B A; 3IFW B; 2KLG A; 1YX6 B; 2VH1 A; 1P9D U; 2KJ6 A; 2JUO A; 3U7D A; 1QT9 A; 3B9J A; 5IP4 D; 1TIF A; 4FXC A; 1Y56 A; 3GE8 C; 2INN E; 1L0V B; 2Y3A A; 1KH0 A; 2JXT A; 3R7R A; 1HQR D; 1FFV A; 2AX5 A; 1ZKH A; 3L0W B; 3Q2A C; 3BK1 A; 4FJV B; 3ZDT A; 2NPT B; 1K51 A; 1S1Q B; 4KGT A; 3PRZ A; 1M4V A; 2OED A; 2R2Q A; 2V3S A; 3H9D A; 3WAM A; 4W9G A; 4W9F A; 5IA7 A; 3AMZ A; 1QOF A; 4I6N B; 5HG2 A; 4EUT A; 1BXT A; 4GOC A; 1LO5 D; 3EGR A; 4ZRP A; 2WWZ A; 2JWU A; 2HTH A; 1FIQ A; 4HRO A; 2JF5 A; 4KDL B; 1C4C A; 2ZJD A; 2HD5 B; 4HCP B; 1ZOY B; 4XZ4 A; 1NI3 A; 2DEN B; 4LCD E; 2BYE A; 2K5P A; 4WWO A; 3LDZ E; 1ZUD 2; 4XX5 A; 2JXX A; 3ZVV A; 3B2F A; 4DHZ B; 1WXQ A; 4TSS A; 3AI5 A; 4JGH B; 1F9J A; 4KGS A; 3PRE A; 2KWU B; 3O65 B; 4IWQ A; 4W9I A; 5FR6 A; 2FBW B; 2LFI A; 2LJ5 A; 1XXG A; 4G3X B; 1V5T A; 4XC2 A; 4D2K A; 5LXH A; 5E6J A; 4FHJ A; 3JVZ X; 5EE3 A; 3ZNH B; 4BOZ B; 4RM8 A; 3PPA A; 3P4S B; 2BYF A; 4IG7 B; 4N58 A; 2ZNV B; 1SBB B; 2WNM A; 2LGD A; 2XN9 C; 2LUM A; 2SAK A; 4M8M A; 3EHV A; 1YJ1 A; 3IBE A; 1RYJ A; 3TEX A; 1A70 A; 3QQ8 B; 1OEY A; 4II3 B; 3ALB A; 2WYQ A; 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2K9X A; 2PJH A; 4PT5 A; 4GLS C; 3GOE A; 3NZU A; 1DOY A; 2ZVO A; 2BWE S; 3TUO A; 1JML A; 2GBM A; 4KZC A; 4HEA 1; 5FKA C; 2CJN A; 3EEC A; 4EEW A; 2WXH A; 2WLB A; 4CO7 A; 3MHZ A; 1XT9 B; 2KT7 A; 5IO9 A; 4DHJ B; 2KMC A; 3WAO A; 3V6E B; 1I4P A; 2LHE A; 1KLU D; 5EE1 A; 1ACC A; 2KDM A; 1N61 A; 3DBS A; 3AUL A; 4M8N A; 3LB8 C; 1GPX A; 3DVG X; 5L83 A; 2V3P A; 2AQ2 B; 1JRO A; 4YSY B; 2JX5 A; 2OJW A; 2FCQ A; 4RF0 A; 4IM2 A; 2WXN A; 2XBB C; 2LVP A; 3DCG A; 2LUE A; 4LDT B; 1C9F A; 3C0R B; 4MH0 E; 3SFE B; 3ZJU A; 4I6L B; 2K8H A; 3RFZ B; 1LFD A; 3KW5 B; 3C19 A; 2H89 B; 2V3N A; 3ZKJ C; 3FC4 A; 2N7E A; 3RCZ A; 2Z0E B; 1WE7 A; 3AM9 A; 4S0R A; 2LXC A; 1RRB A; 2EKI A; 4BBN C; 1QOB A; 3RNC C; 3EC8 A; 1OQR A; 3X23 A; 1YQB A; 3A33 B; 5JHA A; 2EKE C; 4II2 B; 1I7H A; 1XEE A; 4M0W A; 2KWD A; 3A4S C; 1V81 A; 3IXS A; 2DYB A; 3NG0 A; 1CZP A; 4K1R B; 1E6E B; 4TUU A; 3MC8 A; 1LXD A; 3IAS 1; 1UWX A; 3L08 A; 3RNF C; 1V1P B; 1WE6 A; 3WAP A; 1LM8 B; 1I4X A; 2A5U A; 2PTL A; 1OTR B; 1GC6 A; 2MJE A; 1SE4 A; 5BMH A; 2L1A A; 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