The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWCYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| total genus |
15
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4OZC A; 4KGT A; 4GLS C; 1UWX A; 4OZB A; 4IOI E; 2KAC A; 1KH0 A; 2IGD A; 1QKZ A; 3GB1 A; 4HKZ E; 2LHD A; 1FCL A; 1XCQ L; 2LHE A; 2J52 A; 2I38 A; 2PLP A; 4KGS A; 1Q10 A; 5HHD G; 2ZW0 A; 2JZP A; 2PW9 A; 4HJG E; 2PTL A; 2QSD A; 1FD6 A; 3MP9 A; 2J53 A; 5BMG A; 1XCT L; 2IGH A; 1P7F A; 1IBX A; 4MAC A; 1PGA A; 1HEZ E; 1C9F A; 1F2R C; 4IKG A; 1PGB A; 5BMI A; 3FIL B; 1GB4 A; 2ONQ A; 2K0P A; 1HZ6 A; 2ON8 A; 1IGD A; 3FIL A; 1HZ5 A; 1FCC C; 1F2R I; 1K52 A; 1XF5 L; 1IBX B; 1MHH E; 2JSV X; 2RPV A; 4KGR A; 1MVK A; 2KN4 A; 2ZW1 A; 2N9K A; 2N9L A; 2IGG A; 1MI0 A; 1K53 A; 2RMM A; 5HFY A; 1PGX A; 1YNT E; 2OED A; 2KQ4 X; 1ZXH A; 4D2K A; 2KDM A; 5JXV A; 1K51 A; 2KWD A; 2LUM A; 2NMQ A; 3V3X A; 5HI1 A; 1P7E A; 1MPE A; 4WH4 A; 2LGI A; 1D4B A; 5BMH A; 2EEL A; 1EM7 A; 1YMH E; 2GB1 A; 4OZA A; 2N7J A; 1GB1 A; 2JWU A; 2JU6 X; 5HG2 A; 2I2Y A; 2GI9 A; 2JXT A; 1K50 A; 1JML A; 3UI3 A; 1IGC A; 1MHX A; 2QMT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1N5W A; 1UD7 A; 1WGD A; 4ACF A; 2BWF A; 4OZB A; 4AP4 C; 1Q5W B; 2JF5 A; 1KH0 A; 1L7Y A; 1L6V A; 3RNA C; 3U30 A; 2RSU A; 4HK2 A; 2WS3 B; 1EWY C; 2V0G A; 4B0M A; 1HTQ A; 3ONS A; 1UF0 A; 4P16 A; 4W9G A; 4EUT A; 4FBJ B; 2FNJ B; 2JT4 B; 4DXG A; 4G11 A; 4KZC A; 5D7G A; 1ZXI A; 2BYT A; 3KYD D; 1L0V B; 2IPK D; 2ZCB A; 2IGH A; 3ZJV A; 2L05 A; 1V1O A; 3NRZ A; 2YEP B; 2KC1 A; 2Y3A A; 4MH8 A; 2CHZ A; 2BGF A; 5CHV C; 3PT2 B; 2G9H D; 1WE6 A; 1I4P A; 3ALB A; 2ZVN A; 2W55 A; 3FC4 A; 3CWI A; 4ICU A; 1CJE A; 1E6E B; 5HFY A; 3V05 A; 3WAM A; 2PIA A; 4AQ7 A; 2LMC A; 3HVZ A; 1ZKH A; 2ZNV B; 1C1Y B; 4ASW C; 2R2Q A; 4ITK A; 3JW0 X; 2KMM A; 4BBN C; 3B2G A; 4ZYS A; 1OEY A; 2AL6 A; 3Q3J A; 2Z0D B; 1DOY A; 2N7J A; 4FJV B; 4IWO A; 3ZGZ A; 4W9D A; 4P1C C; 4P6V F; 3ZKJ C; 3L17 A; 3AU5 A; 2KZR A; 4K3B A; 1WJU A; 1B1Z A; 3VUY A; 4CYE A; 5IN7 A; 2L7R A; 5TR5 A; 3RNG C; 4XDC A; 1H8C A; 4A3O A; 3GP7 A; 4DDG D; 2WXN A; 1E0Z A; 4N58 A; 4YTP B; 3PSE B; 2PE9 A; 1WMH B; 3AED B; 3AV8 A; 2RD0 A; 2J52 A; 2KKC A; 4II2 B; 3VXW A; 2X8X X; 1TJE A; 2BS3 B; 3K9P B; 3AE4 B; 4IM0 A; 2ASQ A; 3NVY A; 3J9C A; 1LO5 D; 2IY0 B; 2KWV B; 1ZW7 A; 2DZM A; 2QIE B; 1E9M A; 3IAS 1; 3QJZ A; 4DXF A; 2N7D A; 2D3C A; 2C5L C; 1WM2 A; 2KMA A; 1XCT L; 4E74 A; 4N59 A; 1QOA A; 2FCM A; 4X57 B; 2KJR A; 4IKG A; 1WGK A; 3EHV A; 2ONQ A; 3KLS X; 2FCN A; 1XLP A; 4KDI C; 1L0Y B; 2L1A A; 5G5H A; 2DZI A; 1RLF A; 2X38 A; 4RNA A; 2C60 A; 1MVK A; 2KN4 A; 4A55 A; 1FIQ A; 5I4D A; 2ZEQ A; 3BWU D; 2ZW1 A; 2UU7 A; 3PRP B; 4RH6 A; 4XX5 A; 3S2A A; 3NZU A; 4ICV A; 5HKH A; 1FNU A; 1RFK A; 1MI0 A; 1IYF A; 3DDC B; 1LGR A; 1L4D B; 2K8H A; 4BOS C; 4A20 A; 4ANU A; 4CQN A; 1L6U A; 2LEK A; 2AWT A; 2LGI A; 4Q2J A; 3UQA A; 2R2O A; 1VCB A; 1GB1 A; 1TS5 A; 3VH4 B; 5DPS A; 1L0X B; 1ET6 A; 2OOB B; 3T3N A; 2JVC A; 3LDZ E; 3MTN B; 1WMH A; 2MP2 B; 3AE3 B; 4FUL A; 4KZ0 A; 1D5Z C; 2HDE A; 3SHQ A; 3SR6 A; 3ZXV A; 3QQ8 B; 1J8C A; 2ZPN A; 3KUZ A; 3PRE A; 1EF1 A; 3ZXR A; 1VDV A; 3EFC A; 3Q8C A; 2CU3 A; 1RRB A; 4XDD A; 3RT3 B; 3PTF C; 5G55 A; 2Y5B B; 2IGD A; 2M8S A; 4YSX B; 4ZRK A; 4B0E A; 2LHD A; 3MC8 A; 1N6Z A; 1H4R A; 2V9H A; 4KGS A; 1HXY D; 1Q10 A; 1UWM A; 2FIF A; 3TCA A; 1V81 A; 4PS7 A; 2DLB A; 1STE A; 2XEW A; 3RNF C; 1HA5 A; 3ZNH B; 4XE0 A; 1WJ6 A; 3L08 A; 3AE9 B; 3N9Y C; 2LUE A; 4MGK E; 1FFU A; 3DHG C; 5BYQ A; 5BMI A; 4FXC A; 3RNC C; 1YJJ A; 4MT5 A; 2V1Y A; 3P4R B; 1FCC C; 3DVG Y; 1SE3 A; 5EDS A; 2NTS A; 3MJ5 A; 4WWO A; 1IPG A; 3QX1 A; 4C4V B; 3T8M A; 2MBB B; 3CF6 E; 5C23 A; 4K7W A; 1L2N A; 2BBC A; 2IDY A; 4GDL B; 3GE8 C; 4MM3 B; 2RGF A; 2MP2 A; 3EUB 2; 3PLU A; 3BYY B; 2BYE A; 2GB1 A; 3NHE B; 2HTM E; 4P1B C; 2D2Q A; 2MRP A; 1NEN B; 3EC8 A; 2JXT A; 4G3X B; 1E10 A; 4NNJ B; 1JAL A; 5AZG A; 4HPL B; 3UI3 A; 3L13 A; 2KDF B; 1DYQ A; 4EE2 A; 2J7Q B; 5IKC M; 1UNS A; 2KHW B; 3JYU A; 3DWM A; 3AE6 B; 4IOI E; 1WZ3 A; 4KV2 A; 2MBO A; 4I6L B; 5H92 C; 4FLH A; 3R3M A; 4EOY A; 1GAQ B; 1JWA D; 1WWT A; 4RGM A; 3BIN A; 3IXS A; 1YN4 A; 1IP9 A; 3ZNG C; 3Q3M C; 2BS4 B; 2IJ0 A; 3PGE A; 4HJG E; 4C7Z A; 4TQ0 A; 1FXT B; 2QSD A; 3HUI A; 5AEK B; 4HWI B; 3RCZ A; 4ARC A; 2LGD A; 3B08 A; 1F77 A; 4C4V A; 4GXB A; 2M1M A; 3DBS A; 1T0Y A; 1HTO A; 3U7D A; 2K0P A; 2KNB A; 1HZ6 A; 2GRI A; 1WXV A; 2CJO A; 2IO1 B; 3R7R A; 3PRZ A; 4LLG M; 2XNA C; 1SGH A; 3B2F A; 4MM3 A; 1XLO A; 2LGS A; 2MQJ A; 3Q8E A; 1MHH E; 2KTR B; 2WYQ A; 2WXR A; 4HPP A; 2DWQ A; 2IYD B; 2LRW A; 3VHT C; 2M0X A; 2RMM A; 4WJO A; 2OED A; 3ZRC A; 3AE5 B; 5C2T B; 1E7U A; 2K39 A; 2K5P A; 2LRU A; 4GMV A; 2L52 A; 4OVZ A; 1E5W A; 1TS3 A; 2L0T A; 2FBW B; 1NDD A; 2GI9 A; 4W9J A; 1VZ7 A; 4IC7 B; 3P1M A; 2KQ7 A; 2GBM A; 2BVC A; 1CQV A; 1SF0 A; 1N63 A; 2H89 B; 1P98 A; 3AEC B; 4GLS C; 1N5X A; 2WXJ A; 1V1P A; 1UH6 A; 1C3T A; 2LXA A; 2M4N A; 2ZZP B; 2PE6 B; 2FCS A; 3GB1 A; 1WR6 E; 3AH7 A; 3B1L X; 3SDL C; 1FCL A; 3U7Z A; 3A33 B; 1JWU D; 1B9R A; 1QIL A; 3QWZ B; 2WDQ B; 3P4S B; 1X1M A; 3RI7 C; 2RDB C; 1QOF A; 4NQK E; 3NJT A; 3RNE C; 1J7C A; 5BMG A; 2KX3 A; 3UGB B; 4YXD B; 2KTR A; 5IO9 A; 4HDO A; 2WXO A; 2KWU B; 1A5R A; 1GB4 A; 1XO3 A; 3R66 C; 1LQB A; 4KIK B; 4IM3 A; 1MFW A; 1QF6 A; 4US9 A; 5CHW A; 4LNI A; 2QIL A; 1NYR A; 4WIP A; 2W9N A; 2CR5 A; 2M56 B; 3AUL A; 2KN5 A; 1QOB A; 5EE0 A; 3P63 A; 5IP4 D; 4LTU A; 3P4P B; 2DAF A; 1GC7 A; 3IG3 A; 2EMT A; 1WX9 A; 4B6W A; 3ABV B; 2GOW A; 1V80 A; 2GLS A; 3VRB B; 2R61 A; 1V8C A; 1PQS A; 1E8W A; 1R4N I; 2DNF A; 3PHW B; 4DHJ B; 1PFD A; 3C0R B; 3EEC A; 3VR9 B; 2KO3 A; 1J0G A; 3AEF B; 1WYW B; 3M62 B; 2N1V A; 4L1B A; 1YX5 B; 5D94 A; 3U4E G; 2SEB D; 3RNB C; 1GC6 A; 3O65 B; 2MH7 A; 2INC C; 2J0M A; 2L32 A; 4BAX A; 2KXJ A; 5GXG B; 2NS5 A; 3C19 A; 5LXH A; 1SJE D; 3DCG A; 2L83 A; 2AQ1 B; 3MHS D; 4RMA A; 3ZDM C; 5KHQ A; 2D5G A; 1CMX B; 4RM8 A; 3SEB A; 2HD5 B; 4REZ A; 4RGN A; 4GB9 A; 1WM3 A; 1V5T A; 2IO2 B; 3RZW C; 5AZF A; 4S17 A; 1DOX A; 4O1N A; 2C9W B; 4WUR A; 4M8N A; 4KIK A; 2KDB A; 2UYZ B; 3L54 A; 2LXC A; 1P9D U; 1UBI A; 2AQ3 B; 1XXG A; 3ML9 A; 2L76 A; 5CHF A; 4NJ7 A; 3X23 A; 1QLB B; 3VQI A; 1KF6 B; 5IAA C; 1FMA D; 3H6N A; 2J42 A; 3FIL A; 1LFD A; 3RD2 A; 1V9J A; 3VTV A; 3AM9 A; 2WXP A; 3AE8 B; 3W1S A; 4EZK A; 5J2R A; 2IO3 B; 4YTM B; 3HM3 A; 2HTH A; 1M94 A; 5C1Z A; 3DBR B; 2KQ4 X; 4MJS B; 4E71 A; 4KKI A; 1R4M B; 3OWE B; 1NI3 A; 3I5J C; 2K25 A; 1MG4 A; 2NPT B; 3V3X A; 2NMQ A; 5E6N A; 1R7S A; 3TEW A; 1P7E A; 4PYZ A; 2MJD A; 4AS1 A; 1E7P B; 2LJI A; 1YD8 U; 1BXT A; 1DGJ A; 2J0J A; 4RCO A; 4A90 A; 4ZDV A; 2EKI A; 2KVZ A; 4RF1 A; 1ZE3 D; 2M17 A; 1T6B X; 4XGA B; 2AQ2 B; 4PK1 A; 1KLG D; 1Y56 A; 3DHI C; 1T0S C; 4FHJ A; 4WAF A; 3AEA B; 2LWP A; 4MGY E; 1I4R A; 1UZX B; 2W3R A; 2N9X A; 2JZ3 B; 4ANV A; 2SAK A; 4LDT B; 5EE3 A; 3QAR A; 1XCQ L; 3AEB B; 2D11 A; 4NAW B; 2QCZ A; 4BKG A; 2ICI A; 5LXI B; 3AEG B; 5E6P A; 3HK0 A; 1IUE A; 3AE7 B; 3ZJT A; 2QEJ C; 4FAD A; 2JZP A; 3OAW A; 4EFO A; 2BKR B; 2WDV B; 1V49 A; 4R3D A; 1MG8 A; 1TYG B; 3MP9 A; 2J53 A; 3N30 A; 4F8C B; 1T0R C; 2WXG A; 3RPF C; 5AUK A; 2WX1 A; 1HEZ E; 1XT9 B; 4OVU A; 3W5U B; 4QAY A; 3ZTC A; 4MGZ E; 1AW7 A; 2RDH A; 5G2N A; 4C56 C; 5MPO A; 2KFK B; 3HRD D; 2IY1 B; 4MJS A; 1HZ5 A; 2NPT A; 3GZN I; 2B3A A; 3P2B A; 2HJ1 A; 2JQR B; 3PS6 A; 4HXD A; 3EGR A; 2V4I B; 4KSL C; 1PDX A; 1XEE A; 3Q8F A; 4WWM A; 1R4N B; 4ZHO A; 2IND C; 1V6E A; 3ECI A; 4PS3 A; 2KDM A; 4EZJ A; 3QCA A; 2WXQ A; 4WWP A; 2KAN A; 4A9A A; 4HDQ A; 3I9V 1; 1FM0 D; 3UIN B; 3VUX A; 3ZNI D; 1FRD A; 1RWS A; 2MHJ A; 1Z2M A; 3DBH B; 3UQB A; 1TS4 A; 1CZP A; 2JX5 A; 2KLG A; 3ZQ4 A; 4JWU C; 1FO4 A; 3KWV A; 4IUM B; 1MHX A; 1PGX A; 4NAW A; 4TSS A; 3KH0 A; 3I3T B; 2AEH A; 2MLB A; 2NR2 A; 4NJC A; 4IM2 A; 3NVV A; 1VR9 A; 1E7V A; 3PRM B; 3NG0 A; 4HKZ E; 5D2M B; 2KDI A; 3SFD B; 2I1K A; 2LAS A; 2B76 B; 1WGH A; 3SFE B; 3EFU A; 4HPM B; 2BTE A; 4BKS A; 1TKY A; 2KFK A; 1UBQ A; 3WAL A; 1VZ8 A; 2XN9 C; 2KYW A; 2GBR A; 2JPH A; 2BQQ A; 4MAC A; 1T0Q C; 3DWG C; 5JHB A; 2DYB A; 2KJ6 A; 3APF A; 2FID A; 3K9O B; 1WE7 A; 3D32 A; 2LFI A; 3AMZ A; 5TSS A; 2D10 A; 3V6C B; 5C3J B; 4B9K A; 5EE1 A; 5D3I B; 3TEY A; 3UIP B; 1UGM A; 2KDE B; 4KGR A; 2MBE A; 3PVL A; 3A9K B; 3R7Q A; 5IA7 A; 1WSP A; 3HIZ A; 2WGS A; 2G4S A; 1J19 A; 1N61 A; 2PJH A; 2HJ8 A; 2LVQ A; 4NZL B; 2V3S A; 3RFZ B; 2ZVO A; 3CSF A; 1K51 A; 4IWP A; 5LLI A; 1MPE A; 4H2A A; 2E3T A; 3AN1 A; 3R2T A; 1ZP0 B; 3A1Q B; 4CO7 A; 4NY0 A; 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3BVZ A; 2N7E A; 1SEB D; 2LI5 A; 4M0W A; 3IT4 B; 3OJ3 A; 2GBN A; 4LK0 M; 1ZDX A; 2NCN A; 3Q8A A; 3UIO B; 2NBU A; 4BKS D; 2KMC A; 2JUO A; 1C4A A; 1ZUD 2; 4MEL A; 1KFY B; 2W82 A; 3ZDT A; 1EO6 A; 3KW5 B; 4BZA A; 1YX6 B; 2PTL A; 2Y5C A; 2KWC A; 1WX8 A; 1JWS D; 1OQQ A; 1IBX A; 1ROE A; 4LNO A; 1C9F A; 3JSV A; 1ESF A; 1UGJ A; 1SE9 A; 3PZD A; 1PYW D; 2K6Q A; 4MGI E; 3SU8 X; 3A9J B; 5LNK 1; 2ZNV C; 5FK9 C; 1SBB B; 4I6N B; 1XQQ A; 2ON8 A; 3VR8 B; 3NY5 A; 4HVB A; 1PUT A; 1K52 A; 1T5X D; 2G3Q B; 1C78 A; 3TL5 A; 3APC A; 3BYT B; 1KOT A; 2V3N A; 2N9L A; 4BKT A; 4JX1 C; 4ZHP A; 1G6J A; 4DBG A; 4DK5 A; 1TZ1 A; 1UUP A; 1NVI D; 1E8Y A; 3MJW A; 3BK1 A; 3NUH B; 2Y5P A; 5HI1 A; 3PV1 A; 2K9X A; 4F7Z A; 1VZ6 A; 4NAM A; 1D4B A; 3CST A; 2BB5 A; 4PT5 A; 4GDK B; 5E6O A; 2GBJ A; 3VRA B; 3LJ3 A; 4C00 A; 3B9J A; 5J17 A; 3ZJU A; 1AYF A; 3N32 A; 4LNF A; 2IZV B; 2WXH A; 4TQ1 A; 2BS2 B; 2DZK A; 1SXT A; 2G1E A; 2FAZ A; 3DOW A; 3Q3N C; 4PYU A; 2INP E; 2M0A A; 3FAH A; 3VVW B; 3BVG A; 2KK8 A; 3LXF A; 3Q3O C; 2KJH B; 2LHE A; 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