The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
56
|
structure length |
52
|
Chain Sequence |
DTYKLILNGKTLKGETTTEAVDATAEVFQYADNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| publication title |
Comparison of design strategies for alpha-helix backbone modification in a protein tertiary fold.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
12
|
| structure length |
52
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-01-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JXT A; 1GB4 A; 2GB1 A; 4HJG E; 4WH4 A; 2LHD A; 4OZA A; 1IBX B; 2KWD A; 2ON8 A; 2ZW1 A; 2J52 A; 4KGS A; 1XCT L; 2JWU A; 5HG2 A; 1K51 A; 2KAC A; 2J53 A; 2KDM A; 1PGB A; 5HFY A; 2RMM A; 4OZC A; 4HKZ E; 2NMQ A; 1EM7 A; 1HZ6 A; 1MI0 A; 2PTL A; 2ZW0 A; 1GB1 A; 4IOI E; 1XF5 L; 2PLP A; 1C9F A; 1HEZ E; 1FCL A; 1P7F A; 2N9K A; 5BMI A; 1D4B A; 1KH0 A; 3UI3 A; 5JXV A; 4OZB A; 1MPE A; 2IGG A; 3MP9 A; 2PW9 A; 1JML A; 1Q10 A; 5HHD G; 1FD6 A; 1PGA A; 2I38 A; 1QKZ A; 1K53 A; 2GI9 A; 2JZP A; 1YNT E; 2RPV A; 1HZ5 A; 1MHH E; 1IGD A; 1K50 A; 4GLS C; 4IKG A; 1MHX A; 1IGC A; 2JU6 X; 5BMH A; 2LGI A; 2KQ4 X; 3V3X A; 1YMH E; 2EEL A; 4D2K A; 1IBX A; 2LHE A; 4KGR A; 3FIL A; 1F2R I; 1UWX A; 2KN4 A; 1FCC C; 2QSD A; 3GB1 A; 2I2Y A; 1MVK A; 2QMT A; 3FIL B; 5BMG A; 2K0P A; 1XCQ L; 2IGH A; 2N9L A; 4MAC A; 4KGT A; 2N7J A; 5HI1 A; 2IGD A; 2JSV X; 2LUM A; 1ZXH A; 1K52 A; 1PGX A; 1F2R C; 2OED A; 1P7E A; 2ONQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QCA A; 2ZVN A; 4TQ1 A; 2ZPN A; 2ZNV C; 1ZE3 D; 1N6Z A; 2HJ8 A; 2MP2 A; 4KGS A; 2N9E B; 4MM3 B; 1FXI A; 3KUD B; 2KDM A; 4DXF A; 3HIZ A; 4FJV B; 3D32 A; 2X8X X; 2D3G A; 4W9F A; 5L95 C; 3ABV B; 3NS1 A; 3AE5 B; 1E10 A; 3ZTC A; 1SJE D; 1XLN A; 4II2 B; 5D7G A; 3Q3M C; 1HEZ E; 2SAK A; 1GOZ A; 1P7F A; 3KUC B; 1V81 A; 3N3K B; 2IO2 B; 1ZGU B; 1ESF A; 4XE0 A; 2G45 B; 1B1Z A; 1KRH A; 3PZ8 A; 2K1F A; 5AZH A; 4J6I A; 2DYM A; 3R2T A; 2V3N A; 5HHD G; 2WDR B; 3NJT A; 4J3O D; 2CR5 A; 1FFV A; 2FCN A; 2PE6 B; 2LGX A; 4Q2J A; 3LDZ E; 4MT5 A; 1QOA A; 1SXT A; 1QOB A; 5JZE B; 2IY1 B; 4JQW C; 1XXG A; 4D2K A; 3PRP B; 1RYJ A; 2RD0 A; 3PO0 A; 2KAN A; 2LD9 A; 1I35 A; 1I4X A; 4JGH B; 1Z5S B; 3EC8 A; 1SE4 A; 1P3Q U; 1WJ4 A; 2WDT B; 3SDL C; 1HA5 A; 2KK8 A; 1WSP A; 4DQO C; 2TSS A; 5HKH A; 1J0G A; 4ACF A; 3QX1 A; 4YTP B; 2DZI A; 1K52 A; 2DX5 B; 2OED A; 1TY2 A; 3T8M A; 1U4A A; 3L4P A; 2GBR A; 2LRW A; 3W1S A; 1IUE A; 4K3B A; 3PRM B; 2DYB A; 3N32 A; 1UGM A; 3VUX A; 2AL6 A; 4R3D A; 4FN2 A; 2DLB A; 3FAH A; 2MLB A; 3RZW C; 3BIN A; 2E6X A; 1RAX A; 2J52 A; 3UIO B; 2V3P A; 4BKS A; 2LZ6 A; 2KAC A; 1PGB A; 2ZPY A; 1G6J A; 1VZ7 A; 2MQJ A; 2LXA A; 2M0A A; 4DXG A; 3DVN U; 4P1C C; 3DQV A; 1N5X A; 1RFK A; 4HKZ E; 3U8Z A; 3WAP A; 3UF8 A; 1TY0 A; 3RD2 A; 4TKN A; 4NQK E; 3ZTD A; 5LXH A; 1WR1 A; 5JHA A; 1C9F A; 1N61 A; 1WJU A; 3P63 A; 4AS1 A; 1FNU A; 3VUW A; 2WWZ A; 3MJ5 A; 4YSZ B; 1FXT B; 4A20 A; 4HVB A; 3MHZ A; 4TUU A; 2WDQ B; 3MP9 A; 3AM9 A; 1BXT A; 2LEK A; 2KMA A; 2AQ3 B; 4ICV A; 4YXD B; 4KDL B; 2BWF A; 3C8Y A; 4RM8 A; 1MFW A; 2D11 A; 3VQI A; 2Z0D B; 3ZYY X; 2D10 A; 1V2Y A; 5D3I B; 5BMH A; 2L7R A; 4G0N B; 4NAM A; 4BFR A; 4TV3 A; 2GMI C; 3AE8 B; 1T0Q C; 2KQ7 A; 5DPT A; 1DOX A; 3QIJ A; 1UF0 A; 3W2D A; 2DAJ A; 4MAC A; 2KDF B; 2LRU A; 4XGA B; 3BVZ A; 3JW0 X; 3QC8 B; 2Z8L A; 1ZXH A; 4O1N A; 3AE2 B; 1UBI A; 3AED B; 1ET9 A; 2D3B A; 2KVZ A; 4GU2 A; 2DZK A; 4JWU C; 5J18 A; 1WYG A; 3CST A; 4WJO A; 3V6E B; 4NY0 A; 3OG5 A; 3B0A A; 2JQR B; 1J7A A; 2ASQ A; 2JWU A; 3GS2 A; 4PS7 A; 4HCN B; 4AOF A; 2J53 A; 3Q3O C; 1UZX B; 2DAF A; 1WX8 A; 3O65 B; 4K7U A; 1ZOY B; 3TJP A; 2BS3 B; 2Y3A A; 3MC0 B; 3U4E G; 1CZP A; 2LXC A; 1RWS A; 1TS3 A; 4YTM B; 4FBJ B; 2KFK A; 1SIF A; 1V8C A; 1V6E A; 3Q8E A; 3SEB A; 4M00 A; 4EZJ A; 5E6N A; 3PVL A; 3AEB B; 2NTT A; 2LAS A; 2V0G A; 3NVV A; 1FNV A; 2PLP A; 3IT6 B; 3QK0 A; 4HCP B; 1Y8R C; 2DHZ A; 3B2G A; 4EZL A; 1ZXI A; 4LNN A; 1P9D U; 3I3T B; 4PS3 A; 1ZPS A; 4PT5 A; 3H7S A; 4RMA A; 1KLG D; 2BWE S; 3KUZ A; 1Q10 A; 2NS5 A; 3AE6 B; 3B2F A; 4IUM B; 1JRP A; 1L0X B; 2KHW B; 3ZRF A; 4XZ4 A; 5KHQ A; 4W9K A; 2M17 A; 3PGE A; 4FLH A; 3MTN B; 3I57 A; 1MHX A; 3ZIM A; 3RYT A; 3AE3 B; 1YMH E; 1OQR A; 4JE3 B; 1SSN A; 4JIO U; 1GC7 A; 1DYQ A; 3VTV A; 1C4P A; 3R3M A; 4HLE A; 2QSD A; 2MJD A; 3IXS A; 1GAQ B; 4DHJ D; 4KIK B; 2XEW A; 2QIL A; 2FCM A; 1J7B A; 1ZW7 A; 5BYR A; 4XWT A; 3S2A A; 1WXM A; 2Z0E B; 1EF5 A; 2ICI A; 3NRZ A; 2JXT A; 3ZJT A; 2WXG A; 3LXF A; 3ZJU A; 3AH7 A; 2K25 A; 3ML8 A; 3ZXV A; 5BO4 B; 3TEX A; 3ZKJ C; 1CQV A; 1V1O A; 2INC C; 4YTN B; 3QJZ A; 3X23 A; 3A33 B; 3RN9 C; 1JAL A; 1ZKH A; 1AW7 A; 2XBB C; 2L00 B; 1YQB A; 2NCN A; 4W9G A; 4AJY B; 4ZRI A; 3DHG C; 5LLI A; 5EE9 A; 3AU5 A; 5CHF A; 2KJR A; 1I4H A; 4LLG M; 1K8R B; 1FFU A; 3TL5 A; 2W82 A; 3ZVV A; 3IG3 A; 1YN3 A; 4YWG G; 2K3U A; 5LXI B; 5AUI A; 1N63 A; 2WU2 B; 2J0M A; 2DWQ A; 3RI7 C; 1KH0 A; 3HRD D; 4EE2 A; 3A4S C; 1SF0 A; 4A90 A; 3CWI A; 2DZJ A; 3N30 A; 2JF5 A; 1QLB B; 3RCZ A; 1JML A; 4DHZ E; 3WA0 A; 1P1A A; 2L05 A; 2NPT B; 1L0Y B; 2RPV A; 1YJJ A; 2WXF A; 2RR9 A; 3HUI A; 1L5P A; 1Z2M A; 3AEC B; 3Q3F A; 1JWU D; 4YL8 A; 5D2M B; 3SFE B; 2XN9 C; 3Q8C A; 3NVW A; 2KDE B; 3KWL A; 3RNB C; 2KTR B; 3Q8B A; 2KD0 A; 2IGH A; 2EMS A; 1D3Z A; 3RFZ B; 2JUO A; 2W55 A; 1E5W A; 3IT4 B; 4HDO A; 4CQN A; 2BTE A; 4EOY A; 2KYW A; 2MCN B; 1JWA D; 2JX5 A; 3BZD B; 3P4P B; 5BYS A; 4WAA A; 2O6V D; 3KH0 A; 3WAO A; 2GBN A; 4C80 A; 1IBX B; 4GDL B; 3WAN A; 3L10 B; 1T0S C; 1LO5 D; 2GRI A; 5D6J B; 1ET6 A; 1EU4 A; 4OVU A; 3PRZ A; 2BVC A; 1WYW B; 2XNA C; 5DPR A; 4G11 A; 1C1Y B; 2LGS A; 3QHT A; 4FA6 A; 3JYU A; 2KN5 A; 1CK1 A; 1I7H A; 1RM6 C; 2H88 B; 4WWM A; 4HK2 A; 2G9H D; 3PT2 B; 2W54 A; 3BVM A; 4TMA B; 5LNK 1; 4YSX B; 3WIM A; 1WM2 A; 1WGH A; 2LWP A; 3R66 C; 1PUT A; 4E71 A; 3SD5 A; 1WI0 A; 4DHJ B; 2WLB A; 4L1B A; 2PKO A; 3NG0 A; 2AYO B; 1MPE A; 1XEE A; 4HPP A; 4IWQ A; 3A4R A; 2LMC A; 2O2V B; 1IGD A; 4MEM A; 4US9 A; 3KLS X; 5AEK B; 2LGI A; 4RF1 A; 2K9X A; 3ZO5 B; 2M8S A; 1A70 A; 2GLS A; 2AQ1 B; 1YX6 B; 4ZYS A; 4KSK C; 3PTF C; 3VFK A; 4PK1 A; 3UQB A; 4NAW A; 4M02 A; 4HKQ A; 2HTM E; 4XC2 A; 2C5L C; 1NYQ A; 5H8Y E; 2HDE A; 1WF9 A; 3L16 A; 1I42 A; 2QHO A; 1IP9 A; 4ZHO A; 1YX5 B; 2L0T A; 1C4A A; 4W9I A; 3V61 A; 3RNA C; 2XK5 B; 1E9M A; 1MG4 A; 3LJ3 A; 4GDK A; 2L1A A; 2CHX A; 3APC A; 3VXW A; 1TYG B; 3HVD A; 3ENE A; 3DBH B; 2RMM A; 4K7S A; 3ECI A; 4AWJ A; 1GG3 A; 5C23 A; 1JWB D; 2J0K A; 2D3A A; 3T9L A; 3QAQ A; 3QAR A; 1FEH A; 1I4Q A; 1PQS A; 2KT7 A; 3Q8F A; 4OVV A; 4C56 C; 2CHZ A; 1ZDX A; 1I4R A; 1FRD A; 4RNA A; 1V86 A; 1MG8 A; 4M01 A; 3R7Q A; 2BT6 A; 1TS5 A; 2CKH B; 3KYC D; 2D2Q A; 2IJ0 A; 2FAZ A; 2JRH A; 3AN1 A; 4OHJ A; 3A9K A; 4RFB A; 1VDV A; 4H2A A; 3NOB A; 1L6V A; 4P1B C; 3GZN B; 3APF A; 4USA A; 4BBN F; 1HZ5 A; 2O6V B; 3ZUN A; 1JWM D; 2MBB B; 3A1Q B; 4ZRP A; 1IBX A; 2K39 A; 2BKF A; 4P6V F; 4KDI C; 1WX9 A; 5AZF A; 3BII D; 1QIL A; 4IW0 A; 3ZNI D; 3ZQ4 A; 2LGY A; 4FJY A; 2BS4 B; 2RDH A; 1C78 A; 3AE4 B; 1E8X A; 2FCQ A; 3GE8 C; 4KGT A; 3RNC C; 1OGW A; 2N7J A; 1E8Y A; 2QC8 A; 3DBH I; 1AAR A; 2JPH A; 4EKU A; 1H8C A; 2ONQ A; 2BYF A; 4XWW A; 1JRU A; 1HXY D; 1P0R A; 1F1H A; 3U30 A; 2IY0 B; 4OZA A; 4E3C A; 1SE2 A; 4C4V B; 1UNS A; 1ZP0 B; 2LJ5 A; 2J4X A; 1ISN A; 3AE1 B; 2Y5B B; 1AWD A; 4DXA B; 2W9N A; 1GNU A; 2R2Q A; 2Y5P A; 2G3Q B; 4A9A A; 2WXQ A; 1QZE A; 2KWC A; 2FNJ B; 3KYD D; 5C2T B; 3N1Y C; 2MX2 A; 2C7N B; 1XQQ A; 1FCL A; 5L83 A; 1C4C A; 1D4B A; 3PLU A; 2AEH A; 3NY5 A; 2KKC A; 4JLC A; 3ZDM C; 3H9D A; 1T5X D; 2MHJ A; 3DBR B; 4EUT A; 1F9J A; 4F8C B; 1QKZ A; 2V1Y A; 2JZP A; 3TUO A; 4F1S A; 1XO3 A; 2KLC A; 2ZEQ A; 3EA6 A; 4ARC A; 4HWI B; 1V97 A; 3MHS D; 2V4L A; 3DVN V; 5CX3 A; 1GUA B; 1YQ4 B; 2N9P C; 3C19 A; 3QQ8 B; 2VH2 A; 3GB1 A; 2M1M A; 4MJS B; 4MGK E; 4WWP A; 2WP9 B; 1FO4 A; 2KFJ A; 2OJW A; 3UQA A; 2RGF A; 1L7Y A; 3KWV A; 3NHE B; 2IGD A; 2KWV B; 4M8M A; 1FIQ A; 3AV8 A; 4BKG A; 1QOF A; 3RZF A; 1C79 A; 1H4R A; 1RLF A; 2JWZ A; 5KHO A; 1WZ0 A; 3BWU D; 4AUQ C; 4MM3 A; 3VVW B; 2QCZ A; 4XYC A; 2HTH A; 2L3Z A; 3ZRC A; 2GBM A; 2JYT A; 4WJP A; 3AEA B; 2WS3 B; 1KTK A; 2RPQ A; 1E7V A; 2BYT A; 2KJ6 A; 4A55 A; 2MBQ A; 4W9C A; 3TEW A; 3AEG B; 4LCD E; 3UIP B; 1VCB A; 5J2R A; 3U7Z A; 3DBR I; 2PTL A; 1EWC A; 3AUL A; 3EFU A; 4EZK A; 4A6Q A; 4JPS A; 2MH7 A; 1RFA A; 1XLP A; 2HJ1 A; 2RSU A; 3PHW B; 3LB8 C; 4IDI A; 1D5M C; 1P98 A; 3L08 A; 4WWO A; 3Q8A A; 4JWS C; 3GOE A; 3NZU A; 2IGG A; 3HVZ A; 1ZDV A; 3H8H A; 3U52 E; 2J7Q B; 4B0M A; 1YNT E; 1S1Q B; 4QAY A; 3EUB 2; 3VDZ A; 1M4V A; 2M4N A; 4G3X B; 1E7U A; 1R4N B; 2ACZ B; 3W9C B; 4GN1 A; 4OVZ A; 2QDF A; 2BQQ A; 1ENF A; 2V4I B; 4HEA 1; 2LI5 A; 1VZ8 A; 4WUR A; 3W5V B; 2BKR B; 4N59 A; 1UWX A; 3BY4 B; 4C7Z A; 2NBW B; 2YEP B; 2C9W B; 3FIL B; 3OWE B; 3Q14 C; 2RDG A; 4IC7 B; 5J17 A; 1WJN A; 5EDS A; 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3E9S A; 2ZW1 A; 2WXK A; 3PSE B; 3HHM A; 1N62 A; 4A3O A; 2WHI A; 4YT0 B; 3ZGZ A; 2KTF A; 2KDI A; 3P4Q B; 2IZV B; 2Z59 B; 1B9R A; 3DHH C; 1FXA A; 2M56 B; 2EKE C; 4HPM B; 2AL3 A; 1HZ6 A; 1MI0 A; 5DPS A; 4AP4 C; 4GOC A; 1FMA D; 2KC2 A; 4IWO A; 5DPW A; 3BYY B; 1V80 A; 2EMT A; 4GXB A; 1WXQ A; 3DBL B; 2W3R A; 3J9C A; 4ZRK A; 1S3S G; 1YIW A; 1SJH D; 3X0W A; 4RH6 A; 4NNJ B; 3HM3 A; 1KM7 A; 3L0W B; 1DOY A; 5IOI A; 3WAL A; 2BBC A; 1Q1O A; 4S17 A; 4GLS C; 3M63 B; 4MGY E; 1VJK A; 1VR9 A; 4FAD A; 2LHE A; 3TEZ A; 4US8 A; 1EO6 A; 2B76 B; 4KIK A; 4ANW A; 1HQR D; 2B3A A; 4IM2 A; 1QOG A; 4RGM A; 4W9E A; 2K0P A; 5IAA C; 4RGO S; 5BMG A; 3W1Y A; 1T0R C; 2YEP F; 1SB3 C; 3FC4 A; 3ZDT A; 2KX3 A; 2FIF A; 2KO3 A; 2MWS B; 3NUH B; 3SU8 X; 3RNF C; 1WFY A; 3M3J A; 1V5T A; 3DWG C; 4CYE A; 4RM9 A; 1TT5 B; 1RRB A; 4BAX A; 4A3P A; 1Q0W B; 5T8I A; 2NBV B; 4LNK A; 1J8C A; 3L54 A; 1ACC A; 3Q3J A; 1XCT L; 4WAF A; 4LNI A; 4BOS C; 3PZD A; 4LNF A; 1PFD A; 2HD5 B; 3OAW A; 3IHP C; 2NR2 A; 4HXD A; 4MDK E; 2L76 A; 3DBL I; 5E6J A; 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