The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
SLVSFLTGLGCPNCIEYFTSQGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRMTIWRGLQDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Gene regulation
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| molecule keywords |
P53-LIKE TRANSCRIPTION FACTOR
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| publication title |
Structure of the C-Terminal Sterile Alpha-Motif (Sam) Domain of Human P73 Alpha
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
18
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-01-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2D8C A; 3BQ7 A; 2QAR B; 3BS5 B; 2QB0 B; 1SXE A; 2KSO B; 3KKA C; 2EAO A; 5J8Y A; 3TAC B; 2DL0 A; 2DKZ A; 4PZN A; 1OXJ A; 2ESE A; 4NJ8 A; 2QB1 A; 2Y9U A; 2FE9 A; 1UCV A; 1LKY B; 1V85 A; 5KNI A; 2LPE A; 3BS5 A; 1SXD A; 1X66 A; 3KKA A; 4RQN A; 4NL9 C; 2QB0 A; 2KSO A; 2E8P A; 1UQV A; 2GLE A; 2B6G A; 1F0M A; 2EAM A; 2YTU A; 4RQM A; 1PK1 B; 3TAD A; 2L5Y A; 2E8M A; 1B4F A; 5F3X B; 1V38 A; 2DKX A; 5JTI A; 1LKY A; 5JU5 A; 1PK3 A; 2EAN A; 1SV0 C; 1Z1V A; 4NL9 A; 1WWV A; 1B0X A; 2QAR A; 1JI7 A; 2QKQ A; 1OW5 A; 2KG5 A; 1DXS A; 3HIL A; 1PK1 A; 2K4P A; 2KIV A; 2LMR A; 3K1R B; 2Y9T A; 1SV0 A; 5L1M A; 2JV3 A; 1COK A; 2E8O A; 1SV4 A; 2D3D A; 2F3N A; 3BS7 A; 1KW4 A; 1X9X A; 3SEN A; 2E8N A; 3SEI A; 2KMD A; 2F44 A; 2K60 A; 2ES6 A; 4MHV A; 4PZO A; 1SGG A; 1WWU A; 1X40 A; 1RG6 A; 4IS7 A; 5JRT A; 3IDW A; 2KE7 A; 3TAD C; 3H8M A; 5J8Y C; 2F8K A; 2EAP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2JEF A; 4RQ3 A; 1Q46 A; 5EE9 A; 4ECS A; 3GV5 B; 1S8O A; 3KKA C; 2W7P A; 4DCC A; 5ALY A; 4I2G A; 3PML A; 4WJ3 B; 2HDO A; 3GV7 B; 3N97 B; 4NXZ A; 4DSI A; 3GII A; 4O3O A; 1L6N A; 1KFT A; 1V9P A; 5KNI A; 2LPE A; 8ICN A; 5DB6 A; 3KHL A; 3DV9 A; 3QU4 A; 5DQG A; 2ZJ8 A; 3DDH A; 4TQS A; 2CN1 A; 4MFA A; 2JMG A; 2NV3 A; 4YD1 A; 2G08 A; 1U4B A; 2L5Y A; 2PFP A; 3BQ1 A; 4EX6 A; 5AKZ A; 4RQ6 A; 4HAI A; 2KZM A; 5ALJ A; 1BPD A; 2R18 A; 2W3S A; 2HBK A; 1KL9 A; 1ZD5 A; 4DF4 A; 3PSF A; 2WF8 A; 4KMO B; 2QKQ A; 1JN3 A; 1U45 A; 2HCF A; 4BDP A; 2XCP A; 2WB1 C; 4RZR A; 4F5P A; 5DG8 A; 1UHU A; 4RQ4 A; 4ACO A; 3D6J A; 4C7Y A; 5KT7 A; 4UAW A; 4PL2 A; 2F3N A; 9ICT A; 2ZIU B; 5KAI U; 3RH6 A; 2HOQ A; 4C8N A; 3HKZ C; 3CRX A; 5EWE A; 1MN8 A; 2KMD A; 4PZO A; 1RZT A; 3EUB 2; 2JEI A; 1KFS A; 1ZQX A; 2ZUB A; 1L7M A; 4ZOH C; 1NK5 A; 1RYS A; 5CWR A; 2HVH A; 3SYZ A; 2AGP A; 1S76 D; 1UT8 A; 4X5V A; 3H8J A; 2KHV A; 5KL8 B; 3V6K A; 3SAF A; 5ALF A; 1XO1 A; 1NJY A; 3NTU A; 4C4R A; 2NYV A; 2D6F C; 4IQW A; 1ZQL A; 1RXW A; 2ASJ A; 1LKY B; 3TAN A; 4QZG A; 2JXJ A; 4NL9 C; 3MR6 A; 3V6J A; 2W9B B; 4FZM A; 4DSE A; 3Q8L A; 2YX8 A; 2KJ5 A; 2BPC A; 1SKW A; 7ICQ A; 2FPM A; 5J2K A; 1X42 A; 4PGY A; 1MQ3 A; 4U7C A; 8ICE A; 5J0P A; 1RYR A; 2AJQ A; 1UA0 A; 5ALN A; 5EE1 A; 5ALS A; 5D46 A; 3H0R B; 5AK3 A; 2QLT A; 4FBT A; 1TAU A; 3RJI A; 2MA1 A; 2R8I A; 3C28 A; 9ICX A; 4J9O A; 3AN1 A; 3PR5 B; 4DSL A; 4F5N A; 2I1Q A; 5J0R A; 3JPR A; 1COO A; 1N5W A; 4QW8 A; 5J0O A; 3BS7 A; 4C7Z A; 3NVY A; 3PX6 A; 2GH1 A; 2XY5 A; 2FPL A; 1A0P A; 3MR2 A; 4BWM A; 1X9S A; 4DFP A; 2DF4 B; 4NM1 A; 2LYH A; 5AKX A; 2W55 A; 4RQ1 A; 1LV5 A; 3C2K A; 1JIH A; 3PW4 A; 1Q3V A; 2KIW A; 4C8M A; 3ED5 A; 2AQ4 A; 2BGW A; 2K4E A; 2ZIU A; 3I1Y A; 5AKG A; 2H5X A; 3PV8 A; 4GXI A; 1IV8 A; 1SWV A; 4PGQ A; 3S6J A; 8ICS A; 2QB0 B; 5C0Y A; 7ICT A; 4YQW A; 2IOH A; 2XVT A; 5DGA A; 9ICF A; 4FS1 A; 4XUS A; 4PZN A; 4I2C A; 2BZF A; 8ICL A; 3K1Z A; 5AKJ A; 5DDM A; 2HW3 A; 1QQ5 A; 1S5L U; 4YG2 A; 4YN4 A; 4J03 A; 5KT2 A; 3T5J A; 2R8H A; 4Y2X A; 4JB3 A; 5J2D A; 3LWM A; 4Y2V A; 5EWG A; 3MBY A; 3L3F X; 1JRO A; 4EZ6 A; 2K89 A; 3C21 A; 1XSN A; 1DRG A; 3IRU A; 4ICA A; 4YD2 A; 5J2J A; 1LKY A; 2AHO B; 4BGD A; 5AIB A; 2XCA A; 4GLX A; 3WK6 A; 1WWV A; 3ISB A; 1B0X A; 3ORY A; 1SL0 A; 2W9B A; 5IIN A; 2K4H A; 2K4P A; 1ZQK A; 1BPB A; 5KFZ A; 2ALZ A; 4O3S A; 2VA3 A; 1HUZ A; 4O3P A; 2XY6 A; 5HR6 A; 1WCN A; 1YT3 A; 1KKX A; 4QWD A; 4F2S A; 4O5E A; 3PO4 A; 4UB5 A; 4J9L A; 3F2C A; 2E8N A; 5J0T A; 3SEI A; 3D2S A; 5KFX A; 2BQU A; 2W03 A; 3GIJ A; 2BR0 A; 2DFL A; 2CRX A; 7ICG A; 5KAF U; 4QW9 A; 2F1H A; 2YMP A; 1SWW A; 4M0A A; 2H3Q A; 4J9Q A; 3SD7 A; 4P4O A; 3FAH A; 4F92 B; 5J2H A; 2EZZ A; 4XA5 A; 4P4P A; 3Q8K A; 3RR8 A; 2LBO A; 3KHH A; 4OCZ A; 3UM9 A; 1ZQ1 C; 2OEH A; 5KG6 A; 3ZI4 A; 3RB4 A; 4M9H A; 4QZC A; 2ATL A; 2AQ0 A; 4M2Y A; 5KL1 B; 5AM5 A; 1OXJ A; 4ECR A; 4KLH A; 4DL3 A; 1XU4 A; 2IOF K; 1N56 A; 3WK7 A; 2F76 X; 3AMZ A; 4F93 B; 2QB0 A; 4UB1 A; 1CI4 A; 1Z1B A; 2HBL A; 2B6G A; 4E0D A; 4I2D A; 3RJH A; 3V7L A; 8ICT A; 2E8M A; 1S0V A; 1V38 A; 4DLE A; 4RNN A; 2NRT A; 3GIK A; 5IIL A; 1ZQV A; 3OHA A; 2E3T A; 2PXI A; 4B9N A; 3RAX A; 1ZQP A; 2UVR A; 2V9W A; 1X9M A; 2LM1 A; 4F5R A; 3HIL A; 4OJO A; 1ZQF A; 4UB4 A; 2XY7 A; 2LMR A; 4NLG A; 3L5K A; 5KFA A; 3HX0 A; 3T5L A; 3ZDD A; 4QIW C; 4LVS A; 4O3Q A; 3MFH A; 5GTH U; 1QCK A; 3N7S C; 4KLU A; 3MR5 A; 8ICC A; 4ECU A; 1KW4 A; 2CXY A; 3Q8S B; 4F72 A; 3A0H U; 1L7N A; 3N7P D; 4BUG A; 1SL2 A; 1N61 A; 3RH5 A; 2F44 A; 1N5X A; 2FJ6 A; 3KHG A; 1T3Q A; 4B6J A; 1MC8 A; 1WWU A; 9ICM A; 3LYS A; 4RQ2 A; 4PHE A; 3AU6 A; 4MFC A; 2EZY A; 5J8Y C; 4K4G A; 8ICK A; 4ECZ A; 2V4Q A; 2R8K A; 4FO6 A; 1KLN A; 1P7D A; 1BPE A; 1D8Y A; 4GXJ A; 4EYI B; 5FP0 A; 3BS5 B; 2DUY A; 3WKC A; 2W8L A; 2HHX A; 4Y2J A; 4QZE A; 4BWJ A; 7ICH A; 5KT4 A; 2NRV A; 5KG4 A; 4IRD A; 5J2B A; 5HHH A; 2RDI A; 1PUZ A; 4JWN A; 4QNL A; 3NVZ A; 1B43 A; 5KFV A; 3GU3 A; 1ZOL A; 5BOM A; 2OYY A; 4GC6 A; 8ICQ A; 3QZ7 A; 3C23 A; 4G3I A; 5AKL A; 9ICC A; 4YP3 A; 3LDA A; 1UQV A; 4QWA A; 4EBC A; 3DEE A; 3WKA A; 1H38 A; 4UAY A; 3RRH A; 4EZ9 A; 3H4B A; 4QZB A; 5AI0 A; 4ED3 A; 3Q8M A; 4RNM A; 1BPZ A; 4I2A A; 4Z6E A; 4KN7 A; 5ALQ A; 8ICP A; 3RBD A; 2QAR A; 1WUD A; 1FO4 A; 3ZD9 A; 2XID A; 1J2M A; 2OH2 A; 4LZG A; 4DOC A; 2FPK A; 2KG5 A; 2UVW A; 2EQY A; 4C0Z A; 4F50 A; 3RAQ A; 3G6X A; 4Y2Y A; 4QJF B; 2WB1 F; 2WTF A; 2E8O A; 3PW2 A; 3OGU A; 3I76 A; 1QTM A; 1B22 A; 2W43 A; 3IHQ B; 1IM4 A; 5ALK A; 4F4K A; 3WKB A; 4RQ5 A; 2MU2 A; 1JMS A; 2ES6 A; 4Z6D A; 5HNK A; 3GIM A; 3HKZ F; 1T3N A; 1NK7 A; 3I28 A; 9ICS A; 9ICQ A; 3PNC A; 1OUQ A; 2KIC A; 2P6U A; 3ICX A; 4MF8 A; 2YB4 A; 4YR3 A; 2RP5 A; 5TIS U; 3ZD8 A; 1UT5 A; 4CE6 A; 4GXK A; 4EEL A; 2BKE A; 2KZ3 A; 3NS1 A; 3ISD A; 2HOF A; 7ICU A; 4BX9 C; 4R8U B; 3PST A; 4R64 A; 1ZQJ A; 1JXE A; 2VA8 A; 5AIA A; 5J2F A; 1O08 A; 1ZQY A; 2BCR A; 5DBC A; 4FS2 A; 2JGA A; 4I28 A; 1X2I A; 4KLJ A; 2ZIX B; 5ALW A; 3Q8P B; 3BS5 A; 4UAZ A; 3MDA A; 3KHR A; 3QU2 A; 2BCS A; 4YXJ A; 2OM6 A; 3OSN A; 5KT6 A; 1NZP A; 2YML A; 3NAS A; 3UPQ A; 4J9S A; 3WK5 A; 9ICK A; 5E79 U; 1XS9 D; 5F9L A; 5HHI A; 1J97 A; 4Q43 A; 1Z1V A; 5BPC A; 1ZET A; 3HPO A; 3CW2 C; 3HW8 A; 1L3V A; 4IC9 A; 2KD1 A; 9ICE A; 1D8B A; 3ETR A; 1KQQ A; 5KT5 A; 3H0L B; 5ALT A; 5AHX A; 1XSP A; 1SV0 A; 2FDR A; 4HYK A; 4DEZ A; 5DB7 A; 1RDF A; 2RDJ A; 1SV4 A; 1S77 D; 4EX7 A; 4Z6F A; 2V4R A; 5J2C A; 4RQ0 A; 2RHF A; 1ZD4 A; 1JRP A; 5AI8 A; 5ALD A; 1PVP A; 1ZQN A; 4UB2 A; 2ZTD A; 1SGG A; 3RF9 A; 3PSI A; 3PW5 A; 4CDG A; 5AI5 A; 4RPX A; 4TUS A; 4YFK A; 3ONN A; 3K4G A; 1HIW A; 5A0L A; 2H3V A; 2EZX A; 2OHF A; 4DQQ A; 3C2M A; 8ICR A; 7ICM A; 3SI8 A; 2PFQ A; 1T7P A; 4I2J A; 2CPR A; 2KSO B; 3K75 D; 1NK9 A; 4UAR A; 4QZA A; 1TK8 A; 1SKR A; 2HHS A; 4NLC A; 2IHN A; 3ETL A; 2KEY A; 1Z19 A; 4RQ7 A; 4KLQ A; 5G5G A; 4DFD A; 2RLT A; 2RRD A; 3HP6 A; 1S10 A; 4C4S A; 4ECY A; 2GLE A; 2ZUC A; 4R8U A; 2DPI A; 1XSL A; 3PO5 A; 4IQV A; 2KVC A; 4DFJ A; 4YCX A; 1Z00 B; 1ZQD A; 5J0Q A; 5ALM A; 5KG0 A; 3AM9 A; 5JTI A; 3TFS A; 2ZIX A; 1ZQO A; 3RRG A; 1ZQB A; 2K8C B; 1TAM A; 4LJX A; 4F3O A; 7ICI A; 8ICJ A; 3UMG A; 1T94 A; 3JPQ A; 3RR7 A; 1BNO A; 4QZI A; 5KFK A; 2BHN A; 4RQ8 A; 7ICJ A; 2O6K A; 1ZQZ A; 1QQ7 A; 4CNQ A; 1N48 A; 2XO7 A; 5KFL A; 2ASL A; 3V7K A; 3CYM A; 2R8J A; 1MA7 A; 2HHT A; 3B0X A; 1WG8 A; 4KLS A; 1ZQW A; 2K60 A; 1SZH A; 3GFK B; 3LWL A; 5J2E A; 3THV A; 2FMQ A; 4IS7 A; 4PGX A; 5CEH A; 5JRT A; 2ZTE A; 1PZN A; 3EYZ A; 5ALE A; 2XGP A; 3M9N B; 3GZF A; 3D2Q A; 2BCQ A; 2Q4T A; 3H0M B; 4DQI A; 3QZ8 A; 1NZB A; 4UB3 A; 4KLT A; 2J6T A; 3M7D A; 1ZRM A; 3F53 A; 1IXR A; 4QZF A; 1NNL A; 2KN7 A; 1XNS A; 2BPF A; 4TUQ A; 3C5G A; 1D9D A; 4US8 A; 3KZX A; 2YY6 A; 2Y9U A; 1A77 A; 3MAB A; 2F2A B; 2G06 A; 2EH9 A; 4ED8 A; 2PMZ C; 2OCE A; 1ZQR A; 1NI3 A; 3KD3 A; 2KSO A; 4PHA A; 4EEK A; 2HOI A; 5AKE A; 5CB1 A; 3SZ2 A; 2G5I B; 3A0B U; 3AQF A; 5DDY A; 3TAD A; 7ICR A; 4KLG A; 1IG6 A; 1B4F A; 1VLB A; 1SIJ A; 2ISO A; 4DL2 A; 4U6P A; 3BDP A; 1KN5 A; 4EYH B; 5AKI A; 5T14 A; 3Q8Q B; 5AIC A; 4QWE A; 1QQ6 A; 4RUA A; 1C20 A; 4KLI A; 1TK5 A; 4ECV A; 5KFY A; 4IR1 A; 4KIT B; 1D8L A; 4KTQ A; 2A1A A; 3R9K A; 2EDU A; 2I9G A; 1Z00 A; 1O03 A; 4QZD A; 2NO4 A; 1BVS A; 1A6S A; 4UAU A; 9ICP A; 3C5F A; 4CRX A; 1RM6 C; 4F4Y A; 1ZXI A; 4XQ8 A; 1RQL A; 2HBJ A; 4NLB A; 2AGQ A; 4I2I A; 4DSK A; 4QZ8 A; 1NJZ A; 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3KZI U; 4DL5 A; 2ZIW B; 3HRD D; 3OJU A; 4ECX A; 7ICE A; 3RB3 A; 2G0A A; 3FYH A; 1X6J A; 2I5H A; 4J9K A; 1N62 A; 1KSP A; 3OSP A; 2J6U A; 5HR7 A; 5J0W A; 1JUD A; 5ALV A; 2Y1J A; 4CGZ A; 5KFU A; 5B66 U; 5J0X A; 3E0F A; 2BDU A; 2EAM A; 5HML A; 2KHQ A; 9ICG A; 1ZQE A; 1ZQC A; 1PK1 B; 2W3R A; 2W8K A; 5KFF A; 1ED1 A; 7ICO A; 4ECQ A; 3OJS A; 3JPP A; 5DQI A; 4UAS A; 3UQ0 A; 4EEN A; 2MUT B; 1L8L A; 4ECW A; 3M1Y A; 2JEJ A; 1URJ A; 1GO3 F; 5AI6 A; 4I2E A; 3QE9 Y; 5KT3 A; 3PVX A; 2HBM A; 3QXG A; 2OXO A; 4M04 A; 2PI4 A; 2JV3 A; 5IIK A; 2C2E A; 2DWQ A; 5IIJ A; 3RJF A; 2W9M A; 4GIB A; 4UB8 U; 3QU5 A; 2HHQ A; 3EZ5 A; 4BXO A; 3BQ2 A; 4EBD A; 5DLG A; 2W9C B; 2IHM A; 3T5K A; 5GTI U; 2P6R A; 3QYP A; 4B9T A; 3MR3 A; 3BZC A; 1TV9 A; 2YMQ A; 2J6S A; 3HT3 A; 1BGX T; 3C1Y A; 4K4I A; 3RJJ A; 4AP9 A; 3IN5 A; 4I2F A; 3UXO A; 1NKB A; 4O9M A; 4UQG A; 3FDS A; 4UAV A; 4G9B A; 1N63 A; 2HSZ A; 1J2N A; 1AQ6 A; 3OHB A; 3F2B A; 1SXE A; 3N28 A; 7ICV A; 2LM4 A; 5DKW A; 7ICK A; 2WF7 A; 4NLZ A; 3PW0 A; 4PPX A; 1S9F A; 2C28 A; 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