The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
85
|
structure length |
85
|
Chain Sequence |
RVTVKYDRRELQRRLDVEKWIDGRLEELYRGREADMPDEVNIDELLELESEEERSRKIQGLLKSCTNPTENFVQELLVKLRGLHK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
CPI-17
|
| publication title |
Solution NMR Structure of the Myosin Phosphatase Inhibitor Protein CPI-17 Shows Phosphorylation-induced Conformational Changes Responsible for Activation
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Sus scrofa
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| total genus |
20
|
| structure length |
85
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| sequence length |
85
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | CPI-17 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RLT A; 1J2N A; 1K5O A; 1J2M A; #chains in the Genus database with same CATH topology 7ICL A; 3C2M A; 4KX3 A; 4DSF A; 2R8G A; 5KFJ A; 3SYZ A; 5B66 U; 3PY8 A; 3FDS A; 4CNQ A; 1ZJM A; 7ICP A; 2JGA A; 4I2D A; 4XRH A; 1QQ5 A; 1F0M A; 2BQU A; 2WF6 A; 2XY7 A; 1NZB A; 2Y1I A; 3V6J A; 1HUO A; 1D9F A; 4F8R A; 3GIM A; 1SXE A; 1SZH A; 4O5E A; 1BPB A; 2JXJ A; 1NI3 A; 4ECZ A; 4CF4 A; 5J0X A; 4AYB C; 9ICX A; 3ZDB A; 3ED5 A; 1CI4 A; 1LKY B; 1HJP A; 4KLE A; 1WYG A; 2HOQ A; 2W04 A; 4GC6 A; 4ECT A; 7ICE A; 5J2J A; 4FS2 A; 3RBE A; 4C7Y A; 1JAL A; 4Z6D A; 1A0P A; 9ICE A; 3V7J A; 5DG7 A; 3SAH A; 1WWV A; 1IV8 A; 1RDF A; 4KTQ A; 4RQ3 A; 3HKZ C; 3WK5 A; 3UPQ A; 4DOB A; 3WU2 U; 4YD1 A; 4YD2 A; 5AM3 A; 2K4I A; 4TQS A; 1YZ7 A; 5ALJ A; 1DRG A; 4DSI A; 1ZD2 P; 4DSE A; 5JUM A; 4QZG A; 3WK8 A; 5DLF A; 2QAR A; 2V9W A; 4KLI A; 4Y2Q A; 3KHH A; 2ZUD A; 3MR5 A; 4PHA A; 3MDC A; 2YY6 A; 5ALD A; 5KFF A; 4J9O A; 7ICO A; 9ICO A; 4I28 A; 3E2E A; 3OSN A; 5AKH A; 4IR1 A; 4YG2 A; 2HVI A; 5C0Y A; 1ZQA A; 8ICO A; 1ZQF A; 4I2H A; 1NOM A; 3ETL A; 2WAQ F; 2KNJ A; 5AKX A; 4M9L A; 2EAM A; 3IRU A; 3AQF A; 1QSS A; 3QU4 A; 4ELV A; 2KD1 A; 4NLC A; 5KT5 A; 4ECQ A; 1ZQV A; 3NRZ A; 3N7R C; 3Q8S B; 3TAN A; 1L7P A; 3V6H A; 1JI7 A; 5J0U A; 2PI5 A; 3V7K A; 5J8Y C; 5ALU A; 4M9G A; 4GIB A; 2HI0 A; 2KJ8 A; 1KLN A; 4UB6 U; 2OWO A; 4IRC A; 2GWS A; 4OO1 J; 2FE9 A; 5KFU A; 2YN4 A; 2DUY A; 4OJ6 A; 2XY5 A; 3RH5 A; 2BPG A; 1B22 A; 5AKE A; 2QB0 A; 2C22 A; 1Z00 A; 5EE9 A; 1RPL A; 2RDI A; 3E58 A; 2J6T A; 8ICC A; 4F5R A; 1U49 A; 4FZL A; 3F53 A; 3AU2 A; 1SV0 C; 1X6J A; 5AM1 A; 5J2D A; 3PST A; 4IRK A; 4HYK A; 1ZQM A; 4Y2X A; 4EEN A; 1KFS A; 3QUB A; 3OGU A; 4RPZ A; 1ZQQ A; 4DQI A; 2AGP A; 2DKZ A; 4WJ3 B; 4JV1 A; 2KZ3 A; 4K4I A; 4RQ7 A; 2A1J B; 4KN7 A; 3H4B A; 1S76 D; 4DQS A; 1N62 A; 2NV3 A; 4UBB A; 4YMN A; 4B9U A; 4M0A A; 4IRD A; 4M9H A; 3M8R A; 3G6X A; 2A1J A; 3L3F X; 4Z6C A; 3C5F A; 3KFU F; 1P7D A; 5TZV A; 3QUQ A; 4LJX A; 2I9G A; 3SAF A; 2KIV A; 2JZB B; 3QUT A; 4QIW C; 4O5K A; 5CA7 A; 1Z4N A; 2KN7 A; 2AQ0 A; 2W3R A; 3GV7 B; 2ZIU A; 3ETR A; 5DB6 A; 1VDV A; 3HRD D; 8ICF A; 1MN8 A; 2JH7 A; 3SQI A; 4EEK A; 3MR2 A; 2XC9 A; 5T14 A; 4IQU A; 4TUQ A; 3AEV A; 3PW4 A; 3LVW A; 1S97 A; 1NK9 A; 2BPF A; 3GV8 B; 3PW0 A; 4ED3 A; 4GXK A; 3IDW A; 4GLX A; 5AKK A; 4I2J A; 3AU6 A; 5J2G A; 2HHU A; 4O5C A; 3EW9 A; 2DWQ A; 3HIL A; 5KFK A; 3TQ1 A; 2J6S A; 5ALI A; 1Z4O A; 1ZQ1 C; 1PVP A; 2ODG A; 1UA1 A; 4QZC A; 1XU4 A; 4K4H A; 2WB1 F; 3HW8 A; 2YB4 A; 2E8P A; 4R8U B; 2C28 A; 3WK4 A; 2A3V A; 3PX0 A; 2ASJ A; 5J2B A; 2VJ4 A; 5B5E U; 2BGW A; 4UBC A; 3KD3 A; 3NVZ A; 2RRD A; 4R8U A; 1KW4 A; 2LPE A; 5HHI A; 3RB4 A; 1ZQL A; 1NK6 A; 4U6P A; 4MFA A; 1PK3 A; 3C5G A; 4US9 A; 2W9A A; 5L1K A; 1SIJ A; 3H8S A; 4F5Q A; 1Z1V A; 4ECY A; 1L3S A; 1DGS A; 3V7L A; 2W11 A; 3C29 A; 4F4Z A; 7ICK A; 4I2B A; 2OCE A; 3BS7 A; 5CEH A; 2D6F C; 4YMM A; 1O08 A; 4QW9 A; 3GIJ A; 5KT4 A; 2WTF A; 4F4X A; 3K1Z A; 7ICI A; 2FPL A; 2KP7 A; 7ICS A; 4I27 A; 4P0Q B; 3SV3 A; 1EXN A; 3HWT A; 5KT3 A; 5HHH A; 1Q3V A; 1SWV A; 5HP4 A; 2HHW A; 3QNM A; 4F4K A; 4DFM A; 1FFV A; 5DBA A; 4Y2U A; 4P0Q A; 3Q8P B; 4C0Z A; 5DB7 A; 3UMG A; 4B9M A; 3IV6 A; 2KSO B; 2NYV A; 1X42 A; 2F76 X; 2HCF A; 4GXI A; 8ICH A; 4M47 A; 5HR7 A; 4MFC A; 2KSO A; 5L1I A; 3EPI A; 4Y2T A; 1ZQN A; 1ZQZ A; 4C4S A; 3RRH A; 2R8K A; 2ZTE A; 1ZQS A; 1T3Q A; 3MFH A; 3KBB A; 4OJL A; 5E79 U; 3C2L A; 4TUS A; 3AUO A; 1S0N A; 4RUA A; 2AGO A; 4Y2J A; 2F2A B; 2UVW A; 5AIC A; 1KFD A; 4CE6 A; 4FFD A; 4C8K A; 2HMX A; 4IQV A; 4KLD A; 1B43 A; 2PKE A; 2DFL A; 4ECX A; 2N1R A; 2D8C A; 5AIB A; 2BDU A; 3L5K A; 3PR4 A; 3TAD C; 2F8L A; 2KE7 A; 3RB6 A; 1T3N A; 5AM2 A; 5JU5 A; 1S77 D; 1L7M A; 1QSL A; 2PI4 A; 3TAR A; 3OTQ A; 4YCX A; 4A8E A; 1TVA A; 1X9X A; 3OJU A; 4ECW A; 1QH9 A; 3DDH A; 3RJI A; 5DBB A; 2MSN A; 5BOL A; 2JRZ A; 2L5Y A; 5CHG A; 1FFU A; 2DPJ A; 2MUT B; 5J29 A; 2ZIV B; 2OH2 A; 4QZE A; 4DSJ A; 3T3F A; 4IR9 A; 2V4Q A; 2XGQ A; 2MUT A; 2ZIV A; 2J6U A; 3QU7 A; 2AJQ A; 2F1H A; 1ECW A; 1T94 A; 7ICT A; 5AK3 A; 8ICI A; 1ZD5 A; 4C8O A; 1ZJN A; 2KV2 A; 3RBD A; 2NRT A; 4NV0 A; 1OUQ A; 2Z7J A; 3SMV A; 4OCZ A; 3KOO A; 4DL2 A; 2BKE A; 2F1J A; 1WCN A; 4U7C A; 2KZZ A; 1BPZ A; 4RT2 A; 5KFN A; 2KEY A; 5IIN A; 1ZXI A; 1NZP A; 4IC9 A; 3NS1 A; 4QW8 A; 2KZM A; 5KG3 A; 2K89 A; 1CRX A; 3F2D A; 4USA A; 5ALE A; 1FEZ A; 3HX0 A; 1GO3 F; 3FAH A; 2RLT A; 1N60 A; 4RNM A; 2ZTC A; 2IHN A; 5F9N A; 3PO5 A; 3AL0 B; 3PMN A; 5AKJ A; 4K4G A; 2NO5 A; 1TKD A; 1UHU A; 2FPM A; 4MHV A; 4P0P A; 5KFB A; 2IHM A; 4UW9 A; 1WCL A; 5KFD A; 3SV4 A; 3BJY A; 2BPC A; 5DGA A; 4Q44 A; 3QX7 A; 3SEI A; 3F2C A; 5AKL A; 4YFK A; 4RQ2 A; 3QEB Z; 4CF3 A; 4PGQ A; 2LM4 A; 2NRZ A; 1NK5 A; 3PZP A; 4ELT A; 1XC9 A; 3FYH A; 4JV2 A; 2RQ5 A; 1TK5 A; 8ICS A; 2LHT A; 3A0H U; 2H3I A; 3SZ2 A; 4BGD A; 1NJZ A; 3H8W A; 4IQT A; 5J2H A; 2E3T A; 3M8S A; 2EDU A; 3F5A A; 1PVQ A; 5ALY A; 4M9J A; 5ALW A; 2EQY A; 1WUD A; 4KLT A; 3Q8M A; 3GDX A; 1T8E A; 2PMZ F; 4TQR A; 1NJY A; 1BPX A; 2DPI A; 3AQE A; 2W9M A; 5KFA A; 4LZD A; 4FO6 A; 1RM6 C; 1N56 A; 3WKB A; 2ZIX B; 2F44 A; 5AI8 A; 4QZH A; 1CUK A; 1RYU A; 2KVS A; 5IIO A; 5KFW A; 2PXI A; 1UA0 A; 1PUZ A; 4RQ1 A; 9ICR A; 1OXJ A; 2YTU A; 3ONN A; 2B21 A; 4RUC A; 1V97 A; 8ICY A; 4GC7 A; 4M04 A; 2XIC A; 8ICX A; 3QU2 A; 1BPY A; 3IM1 A; 2A1A A; 1F5S A; 3ICX A; 4UAT A; 2VA3 A; 5AI5 A; 1TK0 A; 3G6Y A; 2G09 A; 3I1Y A; 3K75 D; 1SL2 A; 2W3S A; 1A6S A; 4XUS A; 5KFO A; 3H8J A; 2NRV A; 2YMQ A; 4J9P A; 3K1R B; 2FLL A; 2FJ6 A; 4P4O A; 2EZZ A; 2EAO A; 3KHR A; 2YML A; 1O03 A; 3C23 A; 1LKY A; 2JHD A; 3SD7 A; 4EEL A; 1BNO A; 2FPK A; 4C7Z A; 5EWF A; 4KLJ A; 2DKX A; 3H7I A; 4UAS A; 2K8C B; 1V85 A; 5KFZ A; 2BCS A; 3C2K A; 3LYS A; 1TAU A; 4B6J A; 2JH1 A; 2AQ4 A; 5DDY A; 5AKI A; 5EWG A; 3N97 B; 2ASL A; 8ICJ A; 5AM4 A; 3SAG A; 2KMD A; 3G6V A; 3Q8L A; 4KX5 A; 9ICL A; 4J9Q A; 1ZD4 A; 1ZQH A; 1NK4 A; 2OM6 A; 3RJF A; 4I2I A; 3WK7 A; 5J2E A; 2W9B B; 9ICS A; 4F5P A; 4KLO A; 4I29 A; 5KG5 A; 5HR6 A; 2JEJ A; 1PVR A; 2KG5 A; 1PZN A; 3BQ0 A; 2BDP A; 1ZQW A; 4P4M A; 4DFK A; 1H38 A; 1HIW A; 5D49 A; 3UMC A; 3KTQ A; 4HAI A; 1X6I A; 5DKW A; 2XID A; 3T5H A; 4NY8 A; 2KIC A; 1NKE A; 2K4E A; 5KNI A; 5J0T A; 2Y9T A; 4YN4 A; 5EE3 A; 2ZUC A; 3CP8 A; 4CRX A; 3UM9 A; 3F2B A; 2FLP A; 3ISB A; 4DFJ A; 1RXW A; 4EBE A; 3AN1 A; 9ICA A; 1A76 A; 2UVV A; 5C5J A; 9ICI A; 4DLG A; 2WAQ C; 4ED8 A; 9ICG A; 5ALP A; 2KFN A; 1UT8 A; 2HBM A; 3GU3 A; 4F4W A; 3TAC B; 1WWU A; 2H5X A; 3AM9 A; 4FS1 A; 1RZT A; 3QE9 Y; 3U26 A; 2KOB A; 4G3I A; 3RH4 A; 2G08 A; 2XCP A; 4YP3 A; 1NKB A; 2OEH A; 2W43 A; 3QUC A; 4UB1 A; 2HW3 A; 1V9P A; 2K60 A; 4UB8 U; 1BPD A; 1KDH A; 1Z19 A; 4EBD A; 1N61 A; 2HVH A; 3MC1 A; 2F1I A; 1LV5 A; 2ZJ5 A; 3BQT A; 2W7O A; 4FBU A; 5AK6 A; 1DGJ A; 1S10 A; 2YQE A; 4B9S A; 2Y0S F; 2RHF A; 1ZYQ A; 1K5O A; 3GV5 B; 1DXS A; 5DQI A; 4UB2 A; 5KFS A; 3UXO A; 2P66 A; 9ICJ A; 1RG6 A; 5ALZ A; 3SR6 A; 5KL1 B; 3WKA A; 4TUP A; 1ZQX A; 2R8J A; 4F50 A; 3IHQ B; 4KMO B; 1N5X A; 2JZB A; 3WKC A; 9ICN A; 3QZ8 A; 1RXV A; 5J2C A; 1V38 A; 4FBT A; 1KL9 A; 2JEI A; 4BX9 C; 3Q8Q B; 1U9L A; 2YMP A; 2W7P A; 8ICV A; 2E8O A; 2K8A A; 1ZQI A; 4CF5 A; 8ICA A; 5KG4 A; 4QWC A; 3ISD A; 8ICZ A; 4QZD A; 4YXM A; 3TAP A; 4UQG A; 2BCV A; 4MF8 A; 4O3S A; 4KLF A; 3ALR A; 5KFY A; 4MEX A; 1CEZ A; 2H3Z A; 4IL6 U; 1X9S A; 1KSP A; 5IIL A; 3NVY A; 1UT5 A; 1FO4 A; 4DL6 A; 1F44 A; 4Q8E A; 8ICB A; 3JPP A; 3HP6 A; 3H0R B; 3DV9 A; 1Q46 A; 1KRP A; 3K4G A; 1S9F A; 2G06 A; 5EOZ A; 3TFR A; 3QU5 A; 1QTM A; 5K4L A; 5AKZ A; 5A0L A; 5J8Y A; 3N28 A; 4I2F A; 1UQV A; 2B0C A; 2AHO B; 2E1F A; 2WHE A; 2WB1 C; 4QZB A; 2CPR A; 3PV8 A; 2ESE A; 2VA2 A; 5D46 A; 3H8M A; 4BJQ A; 4Q43 A; 5J0O A; 5JTI A; 3JPT A; 3RJK A; 4R64 A; 4UAU A; 1DK3 A; 1WG8 A; 1KFT A; 1RYS A; 5AHX A; 1IIP A; 2MAX A; 4DO9 A; 2R18 A; 1L3T A; 4XA5 A; 4NM1 A; 1YZ6 A; 5KL8 B; 2Y9U A; 3M6K A; 4FZN A; 5DQG A; 4F2S A; 4QWE A; 4PHD A; 3RR8 A; 4UAY A; 3GIL A; 1MQ3 A; 2VJ5 A; 4P2H A; 4MF2 A; 4UB3 A; 5KT7 A; 4B9L A; 4KLS A; 1SGG A; 2RP5 A; 4PZO A; 2ZXI A; 4ZOH C; 4DOC A; 5KFC A; 2HSZ A; 4BWJ A; 2IMW P; 1X2I A; 4O0I A; 3UMB A; 3V6K A; 4Y2V A; 2ISO A; 3H0M B; 1NNL A; 4JWN A; 4RNO A; 3Q8R B; 2YX8 A; 1QSY A; 5F3X B; 2EAN A; 2KK0 A; 5KAF U; 1HUZ A; 3RJG A; 1S0M A; 4NLG A; 3KKA C; 8ICQ A; 2I6X A; 1ARO P; 1XO0 A; 3GFK B; 5IIJ A; 4QJF B; 2VIX A; 2EZY A; 5KFH A; 2ISP A; 2ZXH A; 1MC8 A; 1JN3 A; 4J9R A; 9ICB A; 4ICA A; 3MR6 A; 2LMR A; 1UPH A; 4NJ8 A; 2FDR A; 2FI1 A; 2VAN A; 3LWL A; 2GH1 A; 5KT6 A; 2HHV A; 2FMS A; 2E8N A; 3I76 A; 1MQ2 A; 5ALO A; 1ZQD A; 5HNK A; 2BQ3 A; 4Z6E A; 3LDA A; 1ZQR A; 3MFI A; 3ISC A; 4NWI A; 2C2E A; 3OHB A; 4DS5 A; 4E0D A; 5KFG A; 4I2E A; 4NLZ A; 4UAW A; 1XSN A; 4J9L A; 4P4P A; 3T79 A; 4EBC A; 3LK9 A; 4C4R A; 3CW2 C; 2KJ5 A; 5CP2 A; 4EYI B; 2MRL A; 2G07 A; 2KFZ A; 2K8B B; 4OJP A; 3EYZ A; 4KLG A; 1ZQK A; 9ICQ A; 5IIK A; 7ICV A; 1AQ6 A; 5KFT A; 3RFA A; 4DQQ A; 3CNH A; 4PHP A; 4J9K A; 1U45 A; 4FE3 A; 4YR2 A; 4QZA A; 1UCV A; 4PGX A; 3GZF A; 3PML A; 5J0Q A; 1L8L A; 5ALS A; 2HOF A; 1B4F A; 4NM2 A; 5ALK A; 1KTQ A; 4NL9 A; 2XO7 A; 5KFP A; 4LVS A; 3BQ1 A; 4RQ4 A; 3M6Z A; 3NRW A; 4F93 B; 3MDA A; 3ZDE A; 4QZI A; 2XCA A; 2JV3 A; 4BUG A; 1FIQ A; 2HBK A; 4O3N A; 1J2N A; 4DLE A; 3ZI4 A; 4J03 A; 8ICR A; 3ZD8 A; 3S6J A; 5BOM A; 1KBU A; 1KKX A; 4F92 B; 2JMG A; 3MGH A; 5CB1 A; 3H0L B; 8ICT A; 5ALT A; 4DCC A; 4PZN A; 4GXJ A; 9ICC A; 1JXE A; 2W54 A; 3MBY A; 5ALH A; 3RB3 A; 3IG5 A; 5J0P A; 4RQ8 A; 3M9O B; 9ICT A; 2KTQ A; 3D6J A; 4KLU A; 9ICW A; 2HHT A; 3HT3 A; 8ICE A; 5DBC A; 2DBY A; 8ICL A; 3M9M B; 3IG8 A; 3T5L A; 3ZDC A; 4M9N A; 3RH6 A; 5TIS U; 2C2D A; 1J2M A; 3N7P D; 1BPE A; 3PR5 B; 4F71 A; 4KMU A; 3A0B U; 5KFV A; 2DF4 B; 3MGI A; 4OJO A; 3M1Y A; 5CRX A; 1LB2 B; 4AP9 A; 4KLQ A; 3RF9 A; 4RNN A; 3V72 A; 3QXG A; 1S8O A; 2M9N A; 4DWI A; 9ICM A; 5J2K A; 7ICF A; 4OJ5 A; 2IBK A; 2ZIX A; 1L3V A; 1N63 A; 1SKS A; 4UAR A; 3BZC A; 1ZQP A; 4DEZ A; 5DDM A; 1NK8 A; 4AYB F; 5ALL A; 1ZRM A; 4RPX A; 5IIM A; 3PW5 A; 9ICF A; 1L5U A; 3L4P A; 3TAD A; 4ECV A; 3IP4 B; 1ED1 A; 2JEG A; 3AMZ A; 5L1L A; 1VLB A; 5ALF A; 3VC8 A; 2BCR A; 3T5J A; 2PMZ C; 5DB8 A; 5III A; 4C8M A; 1TAM A; 3HKZ F; 3BS5 B; 1N48 A; 3B0Y A; 5KTQ A; 2OXO A; 2P6R A; 1IM4 A; 8ICK A; 2Q0Z X; 3RJH A; 2WFA A; 4BDP A; 3J81 j; 3N7S C; 2W8L A; 3BS5 A; 4FZM A; 2EAP A; 3EPG A; 4NXZ A; 5JRT A; 4UB5 A; 2FMP A; 2XI9 A; 2PFO A; 4QNL A; 5EWE A; 4YXJ A; 5BPC A; 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