The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
|
sequence length |
80
|
structure length |
80
|
Chain Sequence |
RPLPVCPNPLFVRWLTEWRDEAASRGRHTRFVFQKALRSLQRYPLPLRSGKEAKILQHFGDRLCRMLDEKLKQHLASGGD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
|
| molecule keywords |
Crossover junction endonuclease MUS81
|
| publication title |
Solution NMR structure and DNA binding mode of the Mus81 n-terminal helix-hairpin-helix domain
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
25
|
| structure length |
80
|
| sequence length |
80
|
| ec nomenclature |
ec
3.1.22.-: |
| pdb deposition date | 2009-10-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase beta, N-terminal domain-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3V7L A; 8ICJ A; 3RJI A; 4O5E A; 4I2A A; 3HX0 A; 5EOZ A; 4K4I A; 2PFO A; 1ZQI A; 2W9M A; 3ISC A; 4KLL A; 4PGQ A; 4M2Y A; 3JPN A; 4MF8 A; 4FO6 A; 8ICO A; 5D4B A; 7ICP A; 4R64 A; 3RJE A; 7ICM A; 4MFA A; 1BPY A; 1ZQC A; 4MFF A; 9ICG A; 2BPG A; 4KLD A; 5DDY A; 5J0Q A; 3ISD A; 4I2D A; 3JPP A; 1ZQO A; 1XSL A; 3TFS A; 4KLO A; 3JPS A; 4IQU A; 4O5K A; 4I2H A; 5J0W A; 5DB6 A; 9ICV A; 1MQ3 A; 9ICK A; 4LZD A; 4R65 A; 7ICJ A; 7ICT A; 1ZQQ A; 4R66 A; 4PGX A; 9ICM A; 2PXI A; 3PMN A; 4K4H A; 3MGI A; 4KLM A; 9ICJ A; 5J2I A; 5J2B A; 4JWM A; 4RT3 A; 3HWT A; 4RQ1 A; 1ZJN A; 3V7K A; 4XUS A; 4LZG A; 4KLJ A; 4YMN A; 4F5O A; 9ICQ A; 5CB1 A; 8ICG A; 8ICS A; 8ICY A; 5J0R A; 8ICT A; 9ICX A; 8ICN A; 1BNP A; 4QZH A; 4K4G A; 3RH4 A; 2FMP A; 4PHE A; 8ICH A; 8ICZ A; 7ICO A; 9ICO A; 1ZQG A; 5HHH A; 4I2F A; 1ZQB A; 5J2H A; 8ICQ A; 1ZQS A; 4KLT A; 3UPQ A; 4NXZ A; 3C2M A; 4QZG A; 1ZJM A; 1ZQR A; 4QZ9 A; 1ZQM A; 5DBB A; 9ICR A; 9ICS A; 4M04 A; 4KLH A; 3RJH A; 2IHM A; 5J2G A; 4YD1 A; 4F5N A; 4DOC A; 2PFN A; 7ICV A; 2BCV A; 5CWR A; 4RQ6 A; 8ICB A; 5J0X A; 3TFR A; 5J2K A; 4TUQ A; 5J2D A; 8ICU A; 1BPZ A; 9ICH A; 9ICF A; 5J0O A; 4QZB A; 4KLG A; 1ZQF A; 7ICG A; 5J2E A; 1ZQA A; 4TUR A; 1MQ2 A; 2BCU A; 2P66 A; 2FMQ A; 3UXN A; 1KDH A; 4I27 A; 1ZQT A; 7ICU A; 4RQ2 A; 5IIK A; 3JPT A; 5III A; 9ICT A; 3RJJ A; 1ZQK A; 4NLN A; 4I2B A; 4YMO A; 3PML A; 2BCS A; 4I2G A; 8ICP A; 4I2I A; 8ICX A; 4NLK A; 5J2F A; 4UAW A; 4M9G A; 4QZC A; 4PH5 A; 4Z6E A; 4TUP A; 4IQW A; 3AU6 A; 1ZQD A; 3RH6 A; 4PHP A; 4QZI A; 1ZQN A; 9ICB A; 2KP7 A; 3RH5 A; 4RPZ A; 5J29 A; 1TV9 A; 4UB5 A; 2GWS A; 4KLE A; 4UBB A; 4P2H A; 9ICE A; 1BPE A; 9ICP A; 5J0S A; 4UB3 A; 4QZA A; 7ICF A; 4GXI A; 1TVA A; 2FMS A; 4RT2 A; 9ICA A; 5IIM A; 1XSP A; 1ZQH A; 5J2C A; 5BOL A; 4RQ8 A; 1DK2 A; 9ICI A; 5DBC A; 1BPD A; 4DO9 A; 1ZQJ A; 4GXJ A; 3JPQ A; 4KLQ A; 4NY8 A; 3C2K A; 4RQ4 A; 7ICR A; 4YCX A; 5J2A A; 8ICK A; 5HHI A; 5J0P A; 3MDA A; 4UAY A; 4RQ7 A; 7ICI A; 3C5F A; 4F5P A; 1NZP A; 5J2J A; 3OGU A; 4MFC A; 4NLZ A; 4QZ8 A; 3MGH A; 4Z6C A; 1HUZ A; 4PPX A; 7ICS A; 3C2L A; 4DOA A; 4XA5 A; 1RZT A; 4PGY A; 5IIN A; 2BCR A; 3LK9 A; 4DOB A; 1JMS A; 2PFQ A; 4LVS A; 4UB2 A; 1XSN A; 4QZF A; 4UB4 A; 3V7J A; 3UXP A; 4KLU A; 4X5V A; 4QZE A; 5DBA A; 4NM1 A; 3AUO A; 7ICH A; 9ICW A; 4UAZ A; 4O9M A; 5D46 A; 5DB9 A; 2PFP A; 4MF2 A; 8ICR A; 4Z6F A; 5IIL A; 4PHA A; 1ZQE A; 8ICI A; 4M9N A; 1BNO A; 1KEJ A; 7ICK A; 4JWN A; 4NM2 A; 4M9H A; 4I29 A; 5DB7 A; 3MDC A; 5J0Y A; 4YD2 A; 4F5Q A; 4RQ3 A; 8ICV A; 3JPO A; 4I28 A; 9ICL A; 8ICA A; 4M0A A; 4UBC A; 1ZQP A; 5D49 A; 5IIJ A; 4M47 A; 3V72 A; 3MBY A; 4UB1 A; 7ICN A; 4RPX A; 4Z6D A; 4R63 A; 7ICL A; 4TUS A; 3B0X A; 4IQV A; 3RJK A; 1BPX A; 3B0Y A; 5J0T A; 8ICE A; 1HUO A; 4I2J A; 3UXO A; 4F5R A; 5BOM A; 8ICF A; 3UQ2 A; 7ICQ A; 4KLI A; 8ICL A; 4RQ5 A; 9ICU A; 3C5G A; 4YMM A; 4GXK A; 9ICN A; 5IIO A; 4YN4 A; 2BPF A; 4RPY A; 4RQ0 A; 4O5C A; 4I2C A; 4IQT A; 3JPR A; 7ICE A; 3PNC A; 5DB8 A; 4QZD A; 5BPC A; 1ZQL A; 4M9J A; 4KLS A; 3HW8 A; 5TZV A; 2ISO A; 5DKW A; 3RJG A; 8ICC A; 3UQ0 A; 2BCQ A; 4I2E A; 4KLF A; 5J0U A; 8ICW A; 1DK3 A; 4PHD A; 3GDX A; 3AU2 A; 4M9L A; 3RJF A; 2ISP A; 9ICC A; 2I9G A; 3ISB A; 8ICM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3V7L A; 4F4Z A; 2XVT A; 3L5K A; 4JV1 A; 4C80 A; 4QWA A; 5L9X A; 2WAQ C; 1H38 A; 2NRZ A; 2ATL A; 3ZDB A; 2HHV A; 2ZJ5 A; 2V4Q A; 1NK6 A; 1NI3 A; 4ECW A; 2PFO A; 3T5H A; 1PUZ A; 5HNK A; 1JIH A; 1ED1 A; 2W9M A; 4FO6 A; 3NVY A; 5D4B A; 5AI0 A; 5KFA A; 3RJE A; 1D9F A; 4MFA A; 3BS5 B; 4UAT A; 3HKZ F; 3CP8 A; 2E8M A; 4DS5 A; 3K4G A; 5DDY A; 1SL1 A; 3GIK A; 4US8 A; 4CRX A; 4XQ8 A; 3JPS A; 1RG6 A; 4IQU A; 5AI6 A; 1SWW A; 2FJ6 A; 3NVV A; 4O3R A; 4R8U A; 3FDS A; 2FPM A; 4DFK A; 1P7D A; 4R65 A; 7ICT A; 1YZ6 A; 1VLB A; 2VA3 A; 1F5S A; 1Z1B A; 5KT2 A; 4PGX A; 5KFY A; 1D8B A; 1KTQ A; 2HMX A; 2FDR A; 2KZZ A; 3SAG A; 3MGI A; 4DF8 A; 3B9J A; 9ICJ A; 4Y2T A; 1ZRM A; 1NJZ A; 1PZN A; 4J9R A; 4JWM A; 2H3V A; 2ZG6 A; 4J03 A; 5DQG A; 1ZJN A; 2OEH A; 3ZDD A; 2YQE A; 2DKZ A; 5CB1 A; 4MHV A; 2J6S A; 4DL7 A; 2G08 A; 5ALF A; 9ICX A; 2LMR A; 4UW9 A; 2OHF A; 3RH4 A; 2W3S A; 2WTF A; 2HOQ A; 5HR7 A; 5ALD A; 8ICZ A; 1ZQG A; 1QCK A; 4WJ3 B; 4FS1 A; 1UT5 A; 2F8L A; 4YG2 A; 4RUA A; 4UAS A; 2W9A A; 2IBK A; 2DGZ A; 3FC4 A; 1X9M A; 2UVV A; 1V85 A; 1SXD A; 5KT6 A; 5DBB A; 9ICR A; 4RNM A; 3V6H A; 1ZOL A; 3IDW A; 2M9N A; 3QU2 A; 3N4M B; 2DWQ A; 2QKQ A; 4NLC A; 3NGD A; 5CWR A; 3TI0 A; 4O3N A; 2KIC A; 2VAN A; 4UAR A; 1UHU A; 1BPZ A; 9ICH A; 3IHQ B; 1ZD4 A; 4QZB A; 2NRX A; 3KHG A; 3SR6 A; 1ZQV A; 4YR2 A; 2K8B B; 4ELT A; 2HBJ A; 5J2E A; 4B9M A; 2ZUD A; 1ZQA A; 4B6J A; 4TUR A; 1MQ2 A; 2KFN A; 1DGJ A; 4C7Y A; 2AH5 A; 1KDH A; 2JMG A; 1ZQT A; 7ICU A; 4IRD A; 2XY7 A; 3RB4 A; 4US9 A; 4RQ2 A; 5III A; 3WK6 A; 9ICT A; 1S9F A; 1ZQK A; 3D6J A; 2BCS A; 3BJY A; 2MUT B; 4Q44 A; 3SZ2 A; 4UAW A; 2WB1 C; 4M9G A; 4KN4 A; 1T3N A; 3TAD C; 3NTU A; 3QNM A; 3MGV A; 4BGD A; 5H2F U; 3C1Z A; 3LWL A; 3CNH A; 3H0L B; 3LVV A; 4PL2 A; 3C28 A; 4PHP A; 5EE0 A; 1U4B A; 9ICB A; 2KKP A; 5CP2 A; 1TV9 A; 3SAH A; 4RZR A; 1IM4 A; 5EWG A; 4DQS A; 4UAU A; 2ZUC A; 3KOO A; 4ED1 A; 1Z4O A; 4DL6 A; 4RUC A; 2FMS A; 2VKQ A; 3UMC A; 1TFR A; 2QAR B; 4YXJ A; 4DSK A; 1QSS A; 1ZQU A; 2AGP A; 1XSP A; 1ZQH A; 2IHN A; 3Q8L A; 2E1F A; 1Q3V A; 3DEE A; 1JAL A; 2W03 A; 5DBC A; 1JXL A; 4DO9 A; 1XO1 A; 5JRT A; 4GXJ A; 4JMU A; 2IOF K; 3ALR A; 2N1R A; 1LB2 B; 2UVU A; 3PO5 A; 2QLT A; 2YB1 A; 3ZD9 A; 5J0P A; 3FAH A; 3OHB A; 2FPK A; 3IV6 A; 1NNL A; 3RFA A; 1KFS A; 3IRU A; 3KHR A; 2EAM A; 1CEZ A; 2LYB A; 2OCE A; 3C5F A; 2LBO A; 4BUG A; 5J2J A; 4KN7 A; 3AM9 A; 1RXV A; 1SB3 C; 5T14 A; 3RR8 A; 3RAQ A; 5ALV A; 2RRD A; 2W9C A; 4PPX A; 5KG6 A; 2I6X A; 2W7P A; 2IOH A; 2XY5 A; 5EE1 A; 2YMQ A; 5AI8 A; 5AI9 A; 4DOA A; 2LHT A; 3E58 A; 4XA5 A; 2H3F A; 4NV0 A; 4ECZ A; 5AKE A; 1SGG A; 3UMG A; 4LVS A; 4ECS A; 4J9Q A; 4FE3 A; 4UB2 A; 3RAX A; 3V7J A; 3NS1 A; 4X5V A; 1GO3 F; 4RQN A; 4QZE A; 7ICH A; 4DQR A; 3K1R B; 1J2M A; 5DB9 A; 2JH7 A; 1N60 A; 2YMM A; 2KSO A; 4J9L A; 5DQH A; 2DQN B; 4F50 A; 1X9W A; 8ICI A; 4M9N A; 5DLG A; 2F8K A; 4JWN A; 2OYY A; 1JRP A; 1RQN A; 2EH9 A; 5CJ7 A; 3WKD A; 4YD2 A; 4RQ3 A; 1SXE A; 3M6Z A; 2BQ3 A; 2RP5 A; 3QUB A; 2A1J B; 4YR3 A; 2R8H A; 2AGQ A; 3SEI A; 3ZDA A; 2HHU A; 2LPE A; 2DL0 A; 4DFD A; 1ZQX A; 3PW2 A; 1ZQP A; 5D49 A; 4GC6 A; 4DSI A; 4M47 A; 4QWB A; 5KFB A; 3V72 A; 4QWE A; 4UB1 A; 1S97 A; 5JTI A; 4R8U B; 4NLB A; 1RXW A; 3MR3 A; 1TE2 A; 7ICL A; 2R8K A; 3AL0 B; 5ALH A; 2VJ5 A; 2W8K A; 5J0T A; 5CA7 A; 3KTQ A; 4EBC A; 2WF9 A; 2LYH A; 1JXE A; 5DG8 A; 4I2J A; 4ECY A; 5KFL A; 4ECX A; 4F5R A; 1OXJ A; 1ZD5 A; 1NKB A; 2P6R A; 1URJ A; 4AYB C; 4KLI A; 5KG4 A; 4B9N A; 3QUC A; 2DF4 B; 4RQ5 A; 3WK5 A; 3C5G A; 2ASD A; 3A0H U; 4EBD A; 4YMM A; 2EQY A; 3PR4 A; 2CRX A; 5IIO A; 4CF4 A; 3PR5 B; 2FLN A; 4O5C A; 2ZIU B; 3SAF A; 4RU9 A; 4IQT A; 7ICE A; 3G6Y A; 4DFJ A; 2YX8 A; 3ZD8 A; 3BQ0 A; 5DB8 A; 2GLE A; 4RNN A; 5BPC A; 4KLS A; 3H0R B; 2Y9T A; 2JZB A; 4F2R A; 5DKW A; 2BR0 A; 2NO4 A; 2BCQ A; 4B9L A; 1A76 A; 1ZD3 A; 8ICW A; 1TK5 A; 1DK3 A; 2R18 A; 3PX0 A; 1SIJ A; 3GV8 B; 5GTI U; 2YTU A; 2OM6 A; 3AQE A; 2ISP A; 2ASL A; 8ICM A; 5KFR A; 2MRL A; 4O3M A; 3PSP A; 3I1Y A; 2V4R A; 4O5E A; 4I2A A; 2KG5 A; 3L3F X; 3HX0 A; 4CGZ A; 2HHQ A; 4Q43 A; 4C8K A; 5KFN A; 2CXY A; 3M1Y A; 4KLL A; 4YR0 A; 1RM6 C; 4HAI A; 2F1H A; 4KMU A; 8ICO A; 5L1J A; 3E0F A; 7ICP A; 4R64 A; 7ICM A; 1BPY A; 1XNS A; 5TIS U; 4ZH4 A; 5AKZ A; 4MFF A; 2C2D A; 2HVH A; 2ZXH A; 3N7P D; 4CCH A; 3ISD A; 4I2D A; 4IR9 A; 3JPP A; 1ZQO A; 3EPI A; 3KFU F; 4KLO A; 4BJQ A; 1S0O A; 5KFD A; 1NZB A; 1BGX T; 1ZYQ A; 5DB6 A; 9ICV A; 7ICJ A; 3HRD D; 4R66 A; 9ICM A; 4NL9 A; 4JK1 A; 1SZH A; 3IN5 A; 2MSN A; 4K4H A; 1TK8 A; 5AKG A; 2WF8 A; 4KLM A; 3SQI A; 2LM4 A; 1U45 A; 3OHA A; 3HWT A; 2ALZ A; 4GC7 A; 3QE9 Y; 3M8R A; 3V7K A; 1X66 A; 1COK A; 5F3X B; 2G06 A; 2Q4T A; 4YMN A; 3GV5 B; 2KIW A; 2ZIX A; 4B9T A; 1L8O A; 3NRW A; 4PJ0 U; 4F4Y A; 2ZIV B; 4NJ8 A; 1BNP A; 1L7O A; 4FZN A; 2M0N A; 3PX6 A; 1KSP A; 3KZX A; 2KVC A; 4K4G A; 2FMP A; 3K1Z A; 3GIL A; 1A77 A; 1Q8K A; 7ICO A; 3NAS A; 9ICO A; 4I2F A; 1ZQB A; 3IG5 A; 2F44 A; 3QU9 A; 4C7Z A; 2KV2 A; 4O3O A; 1PK1 A; 2OWO A; 4C4R A; 3F2B A; 5KFX A; 1PK3 A; 4QZG A; 4FFD A; 1L3S A; 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3QX7 A; 2KJ8 A; 2XID A; 4ACO A; 1ZQJ A; 3NVW A; 3GV7 B; 2NRV A; 4DL2 A; 2PMZ F; 2WFA A; 4QIW F; 4DL3 A; 1NK4 A; 4IC9 A; 1KFT A; 2BDP A; 1QLN A; 4Q45 A; 3ED5 A; 4F5P A; 3ETL A; 3UM9 A; 4BX9 C; 3EPG A; 3OGU A; 1WYG A; 4F8R A; 4QZ8 A; 3OJS A; 4PZN A; 1UA0 A; 2KZM A; 3C2L A; 1RZT A; 2BCR A; 4OJP A; 3LK9 A; 2PFQ A; 4ELV A; 4YVZ A; 1XSN A; 4QZF A; 2RDI A; 2G07 A; 5AM2 A; 2C22 A; 1SKR A; 3TAN A; 4P0P A; 2UVR A; 3TAC B; 4O3P A; 4O9M A; 1XO0 A; 1COO A; 3R9K A; 4Z6F A; 1S5L U; 4JV2 A; 5ALN A; 2IOF A; 4PHA A; 2W11 A; 2XGP A; 4F4K A; 2JRZ A; 1X2I A; 4DL4 A; 4M9H A; 3MDC A; 1B22 A; 2EZX A; 4Y2V A; 4P0Q A; 2XCA A; 2QB0 B; 8ICA A; 2P35 A; 2KZ3 A; 4U7C A; 2E8N A; 5IIJ A; 1WCN A; 7ICN A; 4RPX A; 4Z6D A; 4R63 A; 1ZD2 P; 3Q8S B; 2G0A A; 3B0Y A; 5A0L A; 2KN7 A; 5ALP A; 3F5A A; 5L1M A; 4F72 A; 1OW5 A; 1NKE A; 3IG8 A; 4CF3 A; 4M6W A; 1T7P A; 4ED8 A; 9ICN A; 3DV9 A; 1ZXI A; 1ZQZ A; 3QUQ A; 5KG2 A; 4Y2R A; 2E8O A; 4ED0 A; 3WK7 A; 4IL6 U; 1BPB A; 2BPF A; 4RPY A; 5AI4 A; 5CRX A; 2J6T A; 3IP4 B; 3JPR A; 1X9S A; 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