The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
KYDWFEFFLNCGVDVSNCQRYTINFDREQLTEDMMPDINNSMLRTLGLREGDIVRVMKHLDKKFGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Endocytosis
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| molecule keywords |
Actin cytoskeleton-regulatory complex protein SLA1
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| publication title |
Regulation of clathrin adaptor function in endocytosis: novel role for the SAM domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
27
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1LKY B; 3H8M A; 2K4P A; 3SEI A; 1RG6 A; 1F0M A; 2Y9U A; 1UCV A; 4NL9 C; 1SV0 C; 4PZO A; 1SXD A; 2D8C A; 3BS7 A; 2QAR A; 2LMR A; 1KW4 A; 2E8M A; 2KSO B; 2B6G A; 3KKA C; 2E8O A; 1OW5 A; 4NL9 A; 1SV0 A; 2FE9 A; 2KE7 A; 2KSO A; 4MHV A; 1X9X A; 1LKY A; 1V85 A; 1X66 A; 2E8P A; 2DKZ A; 2LPE A; 1SXE A; 2EAM A; 2K60 A; 5L1M A; 3KKA A; 5J8Y A; 1COK A; 1WWV A; 5JRT A; 2KMD A; 1B0X A; 2GLE A; 1OXJ A; 5J8Y C; 4PZN A; 3SEN A; 3HIL A; 1V38 A; 1SV4 A; 5JU5 A; 1Z1V A; 1UQV A; 5F3X B; 3BQ7 A; 1JI7 A; 2F3N A; 2E8N A; 1PK3 A; 2DKX A; 2EAN A; 5JTI A; 2ESE A; 2D3D A; 2Y9T A; 3BS5 B; 2QB1 A; 3IDW A; 4IS7 A; 1WWU A; 1X40 A; 1SGG A; 5KNI A; 2EAO A; 2QKQ A; 2YTU A; 2JV3 A; 3BS5 A; 2F44 A; 2EAP A; 2F8K A; 2QAR B; 3K1R B; 1PK1 B; 4NJ8 A; 2QB0 B; 2DL0 A; 2ES6 A; 1DXS A; 4RQN A; 3TAD A; 2KG5 A; 3TAC B; 1PK1 A; 4RQM A; 2QB0 A; 2KIV A; 3TAD C; 1B4F A; 2L5Y A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4UB8 U; 4I2J A; 4FFD A; 4F5N A; 5FP0 A; 4FBT A; 3QYP A; 5J0Q A; 5EWG A; 2R8I A; 3VCB A; 3NAS A; 3Q8R B; 3RJG A; 2WAQ C; 2ZJ5 A; 3IN5 A; 1Z3E B; 4KLD A; 2AGQ A; 3CRX A; 1X2I A; 2RDJ A; 3PST A; 5AI5 A; 3UMB A; 4UB3 A; 1ARO P; 2AJQ A; 7ICT A; 1QSY A; 3WKC A; 2AQ0 A; 1LKY A; 4QWE A; 4ECS A; 2DKZ A; 4Q43 A; 1RYS A; 4CNQ A; 3V6J A; 2JHD A; 5DBC A; 4QZG A; 2G09 A; 3CNH A; 4RQ8 A; 1U49 A; 1KKX A; 5IIN A; 4YN4 A; 4DL5 A; 4M9G A; 9ICX A; 5J8Y C; 2EZZ A; 2MA1 A; 1J2N A; 4YR0 A; 1FO4 A; 2BPC A; 1HJP A; 1JIH A; 2E8N A; 4DQI A; 3MGV A; 3THV A; 3UPQ A; 2BCQ A; 2QB1 A; 1NK6 A; 7ICE A; 1T4G A; 1ZQV A; 2MU2 A; 1XO1 A; 2BPF A; 2XIC A; 1UHU A; 2XY7 A; 2OH2 A; 4MFA A; 3LWM A; 4DFD A; 3DEE A; 1BPY A; 2HHV A; 2CXY A; 2KIC A; 1C7Y A; 2R18 A; 2K4E A; 4F4X A; 4UW9 A; 3HW8 A; 1ZQE A; 4RQM A; 4O5E A; 3WKE A; 4EZ9 A; 5TZV A; 1ZQC A; 3JPO A; 4DFM A; 1TK8 A; 1CUK A; 1MQ3 A; 2Y9U A; 2W9M A; 2JR5 A; 4UAZ A; 2ZTE A; 4FS2 A; 3ICX A; 2ISO A; 9ICV A; 5KG3 A; 5DQI A; 2GH1 A; 5EWF A; 1KRP A; 1MC8 A; 1SZP A; 2AH5 A; 3ISD A; 4KLJ A; 1ZQI A; 5KG6 A; 3D2N A; 3FDS A; 5JUM A; 5L1I A; 2P35 A; 2ALZ A; 4P4P A; 1KDH A; 1FFV A; 3SMV A; 4DFP A; 1L3V A; 2WB1 F; 3K75 D; 3O0F A; 3MR5 A; 1C20 A; 4I27 A; 2ZIX B; 3H0R B; 4BWM A; 2H3F A; 4QZA A; 4YXJ A; 2KV2 A; 2W8K A; 4ED1 A; 7ICQ A; 3MDC A; 4ICA A; 4GFJ A; 5HR6 A; 4I2I A; 4G3I A; 3OJS A; 3E58 A; 3PZP A; 4XA5 A; 1UQV A; 3BQ7 A; 4JV2 A; 2KKP A; 1T3Q A; 3AQE A; 3OPX A; 4GC6 A; 4DOA A; 3RJJ A; 5AM0 A; 3H4B A; 4DSK A; 3MR3 A; 2I1Q A; 5CEH A; 3SAF A; 4I2D A; 1N2X A; 2ZIU A; 2EQY A; 2V4R A; 2IOF A; 4NJ8 A; 4QZH A; 4F4K A; 3PO5 A; 4O3O A; 4IR9 A; 5KFM A; 9ICB A; 2NYV A; 3TKA A; 4YXM A; 1PK1 A; 4P0P A; 8ICA A; 2EZX A; 2LYA A; 4B6J A; 4NLN A; 1COO A; 2L5Y A; 1FFU A; 4RQ3 A; 4F4W A; 1BPB A; 4B9N A; 4B9M A; 1K5O A; 3E0F A; 4ZOH C; 2EDU A; 3MAB A; 4C4T A; 1O08 A; 4IC9 A; 1XNS A; 1U47 A; 3ETR A; 3UXO A; 1DK2 A; 3MGH A; 4HYK A; 4C7Z A; 2NRX A; 1RYR A; 3GIJ A; 3ED5 A; 3RRH A; 2LKY A; 3B9J A; 4NLB A; 4NLG A; 4BWJ A; 2KP7 A; 9ICC A; 4NY8 A; 2HI0 A; 4DSJ A; 4F2S A; 1UT8 A; 4JWM A; 4US9 A; 5AI4 A; 1S0M A; 3HKZ C; 4MHV A; 4M9J A; 5G5H A; 2FPL A; 5ALU A; 2FJ6 A; 5KFC A; 2K60 A; 5E79 U; 3ETL A; 1J2M A; 2JEJ A; 4HAI A; 1COK A; 1MA7 A; 2A1J B; 4ED6 A; 8ICJ A; 2G07 A; 2HCF A; 4ACO A; 4QWD A; 3AU2 A; 3NVY A; 1BVS A; 4KLF A; 1KSP A; 4EZ6 A; 5ALT A; 5J2D A; 4F5P A; 2W3R A; 4DQS A; 3MBY A; 3LYS A; 5KAI U; 3V72 A; 2Y0S F; 4R8U B; 2EH9 A; 4KMO B; 3ISB A; 4A8E A; 2F8L A; 3RRG A; 3BS5 B; 3F5A A; 2F1H A; 5KFB A; 1D9D A; 5CHG A; 2JMG A; 4CE6 A; 4OCZ A; 4GIB A; 3U26 A; 3S6J A; 2E1F A; 3ONN A; 3N28 A; 4LZG A; 2HHS A; 8ICG A; 2KFZ A; 3H7I A; 5HHI A; 3RF9 A; 1UA0 A; 2DF4 B; 1SL1 A; 3RTV A; 5EE3 A; 2DPJ A; 4KLH A; 3CP8 A; 1LB2 B; 3OSN A; 1DRG A; 1NJY A; 9ICF A; 2G0A A; 4ZH4 A; 5D46 A; 2PI5 A; 3GII A; 3TFS A; 1UCV A; 5AIB A; 3QU9 A; 1SV0 C; 2LI6 A; 4B9T A; 1SIJ A; 2PMZ F; 2ASD A; 4JMU A; 3KHH A; 3DDH A; 2WAQ F; 4RPX A; 2LMR A; 1QQ6 A; 1B43 A; 5KFY A; 3JPQ A; 2JXJ A; 2ZIV B; 1A77 A; 2FLP A; 4R66 A; 5KFT A; 3E2E A; 2FE9 A; 4OJP A; 1L3S A; 4UB5 A; 4QW8 A; 2BDU A; 1RQL A; 2VA8 A; 2BDP A; 5KL1 B; 2UVV A; 4I2C A; 4Z6E A; 4M9N A; 3F2D A; 4ECQ A; 1U48 A; 4NLK A; 5AK5 A; 5AHX A; 4JUZ A; 3QX7 A; 2BHN A; 5AM1 A; 4Y2J A; 2IOH A; 7ICF A; 3KZI U; 1L7M A; 4DQR A; 5ALJ A; 4U7C A; 1OUQ A; 3FC4 A; 5J0W A; 4YVZ A; 2WF8 A; 2PI4 A; 5DQG A; 4I2G A; 3RAQ A; 8ICY A; 5KFZ A; 5ALH A; 3MFI A; 1N5X A; 4KLT A; 2KZM A; 1ZYQ A; 3OSP A; 8ICQ A; 1QLN A; 4NLZ A; 1A6S A; 1YZ6 A; 4XRH A; 5AK4 A; 1IV8 A; 1ZQP A; 4AYB C; 4EBD A; 2ATL A; 4IQU A; 5AI9 A; 2VIX A; 3WK7 A; 8ICF A; 2NRV A; 3QU7 A; 2DL0 A; 4F3O A; 2NRW A; 2XCP A; 4QZD A; 2PKE A; 2W7P A; 2FPK A; 3WK4 A; 2VA3 A; 2KOB A; 3C1Y A; 5KG1 A; 1B4F A; 4UAY A; 5DB9 A; 2HBK A; 3HP6 A; 1WCN A; 1N61 A; 4Q44 A; 1RG6 A; 4M6W A; 1F0M A; 1ZQT A; 3T5K A; 2ZUB A; 4IRC A; 3CW2 C; 3L4P A; 1S5L U; 5KFK A; 5KFU A; 3TQ1 A; 1RZT A; 3AEV A; 3M7D A; 3I76 A; 9ICE A; 3M1Y A; 2AXT U; 3FYH A; 3V7L A; 1QSL A; 3QU5 A; 4USA A; 3WU2 U; 7ICK A; 2XC9 A; 5BOM A; 3RR8 A; 1Q46 A; 1NKC A; 4PPX A; 1SB3 C; 3AM9 A; 3MC1 A; 5AI8 A; 5AKH A; 2Q4T A; 4DSL A; 4F72 A; 2HDO A; 3RJI A; 5KT5 A; 1Z00 B; 4DL2 A; 3NVZ A; 3RJF A; 1Y88 A; 4YP3 A; 9ICG A; 3SAH A; 1ZQB A; 1SL2 A; 1MQ2 A; 1ZD5 A; 2QLT A; 4EBC A; 5ALP A; 3M9M B; 4DS4 A; 1JN3 A; 4AP9 A; 2P66 A; 5KT6 A; 2DUY A; 4RUC A; 3MGI A; 1A76 A; 3BDP A; 2DBY A; 3RAX A; 3G6V A; 3UXN A; 5DGA A; 1N62 A; 3LDA A; 3MR6 A; 2GOL A; 5C0Y A; 1F5S A; 3LVV A; 3N7R C; 3H0M B; 9ICL A; 3WK6 A; 5D4B A; 4MEY A; 5EE9 A; 2RDI A; 5AK3 A; 2VA2 A; 3L3F X; 4F92 B; 4KMU A; 2IA6 A; 2JRZ A; 5AM4 A; 4ELT A; 1HIW A; 5J0X A; 4NXZ A; 1XU4 A; 8ICZ A; 5AM3 A; 3N4M B; 1S76 D; 2QB0 B; 1Z4O A; 2KK0 A; 1SKS A; 5J0S A; 2KEY A; 4IQT A; 5DQH A; 4ELV A; 1ZJM A; 4Z6C A; 2VKQ A; 2YQE A; 3TAD A; 3N7S C; 4C7Y A; 7ICL A; 4DWI A; 1BGX T; 1NK8 A; 3KBB A; 4KLS A; 4DOB A; 1BNP A; 2CPR A; 4UBB A; 3VC8 A; 4YCX A; 2J6T A; 2ZTD A; 3UMC A; 3TAQ A; 1RXW A; 5L9X A; 2KTQ A; 4ELU A; 4IL6 U; 3F2B A; 4J9M A; 4F91 B; 3T5L A; 5CJ7 A; 1SXD A; 4PGY A; 3T3F A; 4K4G A; 1D9F A; 1ZQM A; 2M9N A; 4EYH B; 9ICN A; 1ZRM A; 1VDV A; 2W9C B; 8ICC A; 3QE9 Y; 2H3Q A; 2KFN A; 4XQ8 A; 2IHM A; 3ISC A; 3IRU A; 4OO1 J; 2KHV A; 7ICM A; 2R8G A; 7ICG A; 5KAF U; 1X9X A; 2VJ5 A; 2O6K A; 2XVT A; 4Y2S A; 3KD3 A; 2J6S A; 1PZN A; 4KLQ A; 3T79 A; 4CRX A; 5GTI U; 5KT2 A; 3HPO A; 3I28 A; 2ZIX A; 2PFN A; 4OJL A; 4O3N A; 5EOZ A; 3RR7 A; 1DOQ A; 5HR7 A; 1K1Q A; 4O0I A; 4F93 B; 1SV4 A; 4YQW A; 3PY8 A; 5F3X B; 2BCV A; 1S77 D; 4C8M A; 1SL0 A; 1KEJ A; 2D6F C; 5AKI A; 1M6Y A; 3WKB A; 3AUO A; 4IRK A; 5F9L A; 5DBB A; 5ALW A; 2YN4 A; 3KHR A; 1L7N A; 2KNJ A; 4C80 A; 4J9K A; 2E5S A; 2QKQ A; 3D2Q A; 4QWB A; 2YMP A; 3OTQ A; 2Y1J A; 5KFI A; 2K4H A; 1XWL A; 3GV7 B; 4LZD A; 4PL1 A; 4FZL A; 9ICH A; 4FZN A; 3JPN A; 3HRD D; 2HBM A; 5DB8 A; 5ALY A; 3TAD C; 2HVI A; 3WK8 A; 4BXO B; 4M04 A; 3EUB 2; 3UM9 A; 4JK1 A; 3RH4 A; 4Y2T A; 3H8M A; 2BCS A; 2KD1 A; 3NVV A; 4PHP A; 3TAR A; 2JH7 A; 1NOM A; 3PW4 A; 4RNN A; 4F2R A; 4PL2 A; 7ICJ A; 4ECY A; 3TFR A; 1S0N A; 5J2F A; 3BQT A; 1EXN A; 4ED3 A; 1QQ7 A; 3I1Y A; 8ICV A; 3QEB Z; 1TFR A; 4Y2V A; 4FS1 A; 3K1Z A; 4DCC A; 3ZDB A; 3PX4 A; 3RBE A; 3PX6 A; 2BPG A; 5DKW A; 3LK9 A; 2I9G A; 5J2G A; 2LYH A; 5C5J A; 4TUP A; 5KG4 A; 2GLE A; 4UAR A; 5KFJ A; 3AQF A; 3PR4 A; 1ZQG A; 3IG8 A; 2A1J A; 2OHF A; 2GO7 A; 5JU5 A; 3JPR A; 1NI3 A; 5J0R A; 4Y2Q A; 2IHN A; 1Z1V A; 4QZ8 A; 4DFK A; 3N97 B; 1ZQQ A; 3C28 A; 2F3N A; 2KN7 A; 3Q8Q B; 1RXV A; 1T3N A; 1X6J A; 1ZD4 A; 2RLT A; 1ZQW A; 4Z6D A; 3EW9 A; 1ZQ1 C; 3IDW A; 4UAU A; 3KZX A; 2WF7 A; 4BX9 C; 1NK0 A; 4KLE A; 4Q8E A; 9ICW A; 4R8U A; 1SGG A; 4FZM A; 2EAO A; 3C29 A; 3BS5 A; 3PSF A; 2HSZ A; 4TQS A; 4J9N A; 3QUB A; 1TVA A; 1FIQ A; 5J0P A; 4M47 A; 8ICR A; 3B0Y A; 4MEX A; 3ORY A; 2ES6 A; 4F5R A; 4UB6 U; 4YD1 A; 5CA7 A; 3PVX A; 2WF5 A; 2FMS A; 2W55 A; 5ALE A; 3SYZ A; 3PW0 A; 4XUS A; 2B21 A; 2KIV A; 5ALO A; 3C23 A; 2W8L A; 2ZIW B; 4C8N A; 4UAW A; 1LKY B; 5D49 A; 1ZQL A; 4QZB A; 2K4P A; 4J03 A; 1VJ5 A; 2YY6 A; 4OD0 A; 4ED7 A; 5KFX A; 2BR0 A; 3LWL A; 4EEY A; 4K4H A; 2D8C A; 3SAG A; 1L3T A; 2QAR A; 4KN4 A; 5KTQ A; 3BZC A; 2KSO B; 2B6G A; 1X6I A; 4DQQ A; 1V9P A; 3V7J A; 1TV9 A; 1SV0 A; 5ALV A; 2IMW P; 2ZIV A; 8ICL A; 4ECV A; 3AMZ A; 4QIW C; 7ICU A; 4Z6F A; 4C4S A; 3AU6 A; 2KZ3 A; 3BQ0 A; 5A0L A; 2PFO A; 1ZQA A; 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2EAN A; 4C0Z A; 4NLC A; 4UB1 A; 4YMO A; 4UB4 A; 3KFU F; 1NZP A; 3GIM A; 3QUQ A; 5L1L A; 3OHB A; 4ECZ A; 2ZJ8 A; 5ALK A; 1RPL A; 9ICJ A; 4EX6 A; 4J9P A; 4KLM A; 4F8R A; 2F8K A; 4RNO A; 1Q3V A; 4KLL A; 4WJ3 B; 4DL3 A; 2OM6 A; 3FAH A; 1ZQX A; 2F76 X; 4R63 A; 5DG7 A; 2HW3 A; 2A3V A; 2QB0 A; 3B0X A; 4KIT B; 4U6P A; 3H0L B; 4YD2 A; 4UB2 A; 3C2L A; 2ZUC A; 5KFL A; 2G08 A; 3ZI4 A; 4US8 A; 2W03 A; 2WB1 C; 9ICK A; 1L5U A; 4Y2Y A; 2K89 A; 8ICK A; 8ICS A; 5J2J A; 2VAN A; 1ZQR A; 1KW4 A; 3M8R A; 4PH5 A; 3KKA C; 2E8O A; 4J9S A; 4TUR A; 2P6U A; 2YB1 A; 1TAQ A; 4F5Q A; 4GXI A; 2W9C A; 3Q8M A; 3EYZ A; 4YG2 A; 2KJ8 A; 1HUO A; 4B9U A; 2A19 A; 1NK9 A; 1V97 A; 3QU2 A; 3MR2 A; 4GXK A; 4QW9 A; 4ED0 A; 2A1A A; 1XO0 A; 4F5O A; 4UQG A; 3PV8 A; 4F50 A; 5ALR A; 4JV0 A; 5F9N A; 5CP2 A; 4G9B A; 7ICN A; 1CEZ A; 3Q8P B; 3J81 j; 1KQQ A; 4M0A A; 2NRZ A; 5AKX A; 2HOI A; 5KFN A; 3JPT A; 3MDA A; 1JX4 A; 4DFJ A; 4NWI A; 4O5C A; 2OEH A; 2FLN A; 3KHG A; 9ICA A; 2JEF A; 2UVW A; 4RQ2 A; 1MN8 A; 3M8S A; 2FDR A; 3BQ1 A; 2EAP A; 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