The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
81
|
structure length |
81
|
Chain Sequence |
GSSGSSGLTVGDWLDSIRMGRYRDHFAAGGYSSLGMVLRMNAQDVRALGITLMGHQKKILGSIQTMRAQLTSTQGSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 8
|
| publication title |
NMR Structure of Sterile alpha motif (SAM) domain of ephrin type-A receptor 8
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
18
|
| structure length |
81
|
| sequence length |
81
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2003-04-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4NJ8 A; 5F3X B; 2KSO A; 1B4F A; 3BQ7 A; 2K4P A; 2D8C A; 1UCV A; 1WWV A; 2DKZ A; 1OW5 A; 4PZN A; 2E8P A; 5L1M A; 1V38 A; 1F0M A; 1SGG A; 1B0X A; 3H8M A; 2FE9 A; 2KIV A; 2QB1 A; 1Z1V A; 2E8N A; 2F3N A; 5JU5 A; 2QB0 B; 1DXS A; 2ESE A; 2EAN A; 2QB0 A; 2ES6 A; 2L5Y A; 2QAR B; 2F44 A; 2EAM A; 2QKQ A; 2DKX A; 2JV3 A; 3BS5 B; 4IS7 A; 1V85 A; 5J8Y C; 3TAD C; 1SV0 C; 1OXJ A; 2EAP A; 5KNI A; 2KG5 A; 1X9X A; 2Y9T A; 3TAC B; 5J8Y A; 1SXE A; 1SXD A; 3HIL A; 1COK A; 2DL0 A; 2EAO A; 3TAD A; 1SV0 A; 1X40 A; 2QAR A; 1PK1 B; 2F8K A; 4NL9 C; 4RQN A; 1PK1 A; 4PZO A; 5JTI A; 4MHV A; 1LKY B; 3IDW A; 3BS5 A; 1WWU A; 2K60 A; 1LKY A; 1KW4 A; 4NL9 A; 2E8M A; 5JRT A; 1RG6 A; 2D3D A; 3BS7 A; 2LMR A; 2LPE A; 2KMD A; 2KE7 A; 3K1R B; 2B6G A; 2E8O A; 2YTU A; 3KKA C; 1PK3 A; 2GLE A; 1SV4 A; 4RQM A; 3SEI A; 3SEN A; 1UQV A; 2Y9U A; 3KKA A; 1X66 A; 1JI7 A; 2KSO B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2XGQ A; 1J2N A; 7ICI A; 9ICW A; 4BJQ A; 3A0H U; 4AP9 A; 3BQ7 A; 2D8C A; 4ICA A; 4KIT B; 3HPO A; 1RQL A; 2A19 A; 2QLT A; 3MR6 A; 5KG6 A; 1TE2 A; 4DEZ A; 3H4B A; 4KTQ A; 3OJS A; 4P0P A; 3SV3 A; 4UB4 A; 3EYZ A; 5TZV A; 2YML A; 5DB9 A; 3SZ2 A; 3I76 A; 2DKX A; 4ED6 A; 4KLQ A; 4QZ9 A; 2RHF A; 1J2M A; 2W3R A; 5ALO A; 1QLN A; 9ICK A; 2J6T A; 4YN4 A; 4DF8 A; 3NVY A; 5ALE A; 4TUQ A; 2HSZ A; 1N48 A; 2YMP A; 2K8A A; 2BZF A; 4KLF A; 3PW4 A; 5AIC A; 2KD1 A; 4LJX A; 2QAR A; 3LWM A; 1NJW A; 1NJX A; 3D2Q A; 4DLE A; 1UT8 A; 4QJF B; 2DQN B; 3GDX A; 2ZJ5 A; 3MFI A; 4NL9 A; 1L7O A; 2DPI A; 3VC8 A; 3NVV A; 2JZB A; 5EWG A; 2W7O A; 2JH1 A; 8ICO A; 3IRU A; 3OSP A; 3E2E A; 2OYY A; 4J9P A; 4ED0 A; 4RQ1 A; 4KLD A; 2F8L A; 1VLB A; 1JRP A; 4YCX A; 2LKY A; 4IRD A; 2AQ0 A; 4ACO A; 4HAI A; 2CXY A; 2C28 A; 3KHR A; 4GIB A; 3KTQ A; 3PO4 A; 2BQR A; 5DGA A; 4DL7 A; 3AUO A; 4QWD A; 5J0O A; 3IN5 A; 1X9M A; 1FIQ A; 2PXI A; 1BPX A; 3TQ1 A; 5ALK A; 2W54 A; 3LVW A; 1L8L A; 3PW0 A; 3PX0 A; 1NK0 A; 1SWV A; 4EZ9 A; 2XID A; 4O0I A; 5ALF A; 1Z1B A; 5CP2 A; 1NJZ A; 5IIL A; 1X9S A; 1V97 A; 4U6P A; 3SAF A; 7ICL A; 1LVH A; 8ICW A; 2ZIX A; 5J2H A; 4IS7 A; 1A77 A; 2KFN A; 1XU4 A; 2FPM A; 3ZDD A; 3RRH A; 4CNQ A; 3FM9 A; 1T4G A; 2Y1J A; 5KNI A; 4IC9 A; 3QXG A; 4C8M A; 3S6J A; 2XY7 A; 1V9P A; 2F1I A; 2EAO A; 3C5F A; 9ICP A; 3F5A A; 5KT2 A; 4MF8 A; 4B9U A; 1QH9 A; 2K8C B; 1SL1 A; 2BCR A; 2I6X A; 5AKG A; 2KJ8 A; 4BUG A; 2W7P A; 4ELU A; 1ZQW A; 4F5N A; 3KD3 A; 2CN1 A; 3TFS A; 3FYH A; 4EX7 A; 1KBU A; 5AK3 A; 4C4R A; 3BS7 A; 4F4Z A; 4IRK A; 1ZJN A; 4JV1 A; 4R8U B; 3JPR A; 5HML A; 9ICI A; 2G06 A; 1SZP A; 2KZM A; 3H8W A; 3OTQ A; 5BPC A; 3RB6 A; 5E79 U; 4UB1 A; 8ICJ A; 1MQ2 A; 1N63 A; 3QUC A; 1T3Q A; 3K1Z A; 5KFH A; 1ZD4 A; 4I2E A; 5ALL A; 2ZXI A; 4RQM A; 4F5P A; 3SEI A; 3GV7 B; 1ZQR A; 3UM9 A; 3QU9 A; 5J0R A; 3JPS A; 3UQ0 A; 4DL4 A; 1TK0 A; 1BVS A; 5DB7 A; 2VJ4 A; 2RDJ A; 1ZQK A; 1BNO A; 3M9N B; 2I5H A; 4I27 A; 2DBY A; 2H3I A; 2AJQ A; 5KFW A; 3RJJ A; 2B21 A; 7ICS A; 2IOH A; 5KG1 A; 4B9M A; 3NS1 A; 4ECV A; 3PW2 A; 4PZN A; 4EBC A; 4O5C A; 2QB1 A; 4JK1 A; 4Z6C A; 1U9L A; 3QU5 A; 2ESE A; 4BXO A; 2W43 A; 4F91 B; 2GOL A; 3PV8 A; 5AKL A; 1ECW A; 4GLX A; 4DQS A; 1DRG A; 5AM5 A; 1ZQL A; 1QCK A; 2EAM A; 5AKI A; 4AYB F; 5J2K A; 1NKE A; 4P0Q A; 2J6U A; 2ZUD A; 1V85 A; 4YXJ A; 2ZIU A; 2NYV A; 4Y2P A; 1JMS A; 2JGA A; 5ALH A; 4O3O A; 4DSJ A; 1U47 A; 3RR8 A; 3ETR A; 5AI5 A; 4J9Q A; 5DBC A; 1U45 A; 3AU6 A; 5KTQ A; 3UXN A; 1RQN A; 2W04 A; 2N1R A; 9ICF A; 8ICM A; 4FZN A; 1PVQ A; 1X6J A; 5BOL A; 4PL2 A; 5DB8 A; 3ALR A; 2H3Z A; 4KX3 A; 3D6J A; 2XY5 A; 2W9B B; 3NTU A; 4ED2 A; 2JHD A; 4QWB A; 5J2F A; 2BPC A; 3K1R B; 1ZRN A; 2YB4 A; 3H8S A; 4QZG A; 1SWW A; 1S0M A; 2KOB A; 1ZQY A; 4YMO A; 4J9K A; 5ALV A; 8ICP A; 3T5L A; 2KHV A; 3BZK A; 4JV0 A; 5B5E U; 4M6W B; 3GII A; 5EE3 A; 7ICV A; 9ICH A; 4FS2 A; 2XCP A; 3F5E A; 3GIJ A; 4MEX A; 1O03 A; 4Z6E A; 3SYZ A; 3IG5 A; 4FZL A; 5ALR A; 5AM1 A; 3G6V A; 1RXV A; 4F5Q A; 5DLF A; 1KRP A; 4BX9 C; 3UPQ A; 1ZQH A; 3QU7 A; 2C2R A; 4IRC A; 2LYA A; 1Z00 A; 5L1M A; 2NRX A; 4GXJ A; 5ALJ A; 5KFK A; 1NK7 A; 2V4R A; 4P4P A; 4IL6 U; 5KFM A; 5KG5 A; 7ICP A; 2WF7 A; 4O3S A; 2NRT A; 2ZUB A; 2L5Y A; 5AIA A; 5ALN A; 2BQU A; 2HMX A; 5DG9 A; 8ICQ A; 4QZC A; 1NKC A; 1D9F A; 1CEZ A; 5IIM A; 3BS5 B; 4Z6F A; 5BOM A; 4US8 A; 2ASJ A; 1L6N A; 1HUO A; 3TAN A; 4I2D A; 1S77 D; 3UMC A; 3IHQ B; 8ICB A; 7ICE A; 4YD2 A; 2UVW A; 5JUM A; 1SV0 A; 3JPT A; 4PHA A; 1X40 A; 2XY6 A; 3G6X A; 4I2B A; 3GIL A; 3WKD A; 3RJG A; 2OHF A; 3SV4 A; 2V4Q A; 3BQ0 A; 1LKY A; 1IG6 A; 1PVP A; 4DSL A; 1XS9 D; 2DF4 B; 3L3F X; 3ZD8 A; 2GO7 A; 3ISC A; 3K75 D; 1ZQI A; 8ICX A; 3F2B A; 3HKZ C; 4B9T A; 2K4E A; 4DCC A; 1ZET A; 3LYS A; 5DKW A; 2R8H A; 1J97 A; 4RQ5 A; 4NV0 A; 3SAG A; 3T5K A; 3EZ5 A; 5CJ7 A; 2ZJA A; 5KFG A; 8ICL A; 3PR5 B; 3Q8L A; 4I2G A; 1DK2 A; 2G07 A; 3A0B U; 2KSO A; 4Q8F A; 4QWE A; 4RQ2 A; 2K4P A; 2A3V A; 3TAP A; 2AGQ A; 4JV2 A; 2VA8 A; 3ZDE A; 4ECW A; 1QSY A; 1B0X A; 1YT3 A; 2WF8 A; 1ZQT A; 7ICK A; 3LVV A; 2F3N A; 2HHQ A; 3MGH A; 5CEH A; 2H3F A; 4J9S A; 1HEK A; 3M9O B; 1NZB A; 2RQ5 A; 3N28 A; 1ZQC A; 3RF9 A; 1ZQJ A; 5G5H A; 2ZTC A; 5KT7 A; 1SKS A; 2O6K A; 5AKJ A; 3BDP A; 3SQI A; 4M9N A; 3SAH A; 3BJY A; 1ZQB A; 2MUT A; 3TAD A; 8ICA A; 3PSP A; 3ONN A; 3C29 A; 4EBE A; 4DFM A; 2KV2 A; 3C1Z A; 8ICS A; 2KK0 A; 3PR4 A; 3M1Y A; 7ICJ A; 3GU3 A; 2I1Q A; 2W11 A; 3T5H A; 5KL8 B; 4FZM A; 1BPE A; 3WK7 A; 3PY8 A; 2C2E A; 4UB2 A; 4A8E A; 2RP5 A; 4C8K A; 1TAM A; 5D46 A; 4B9S A; 4KLM A; 2ZUC A; 3KFU F; 2FMP A; 4DFP A; 1ZQA A; 4XRH A; 2YX8 A; 2ZIV A; 2NV3 A; 5F9N A; 2JEJ A; 2A1J B; 5ALX A; 2WF6 A; 2W9A A; 3KKA A; 2VIX A; 9ICJ A; 4EX6 A; 2HDO A; 2H5X A; 3PO5 A; 1XSL A; 1L5U A; 7ICU A; 3V72 A; 2LI6 A; 4NM2 A; 4GXK A; 1XNS A; 4Y2U A; 4KLG A; 3AL0 B; 2RRD A; 1OW5 A; 1JUD A; 4ED7 A; 5ALT A; 4FBT A; 5AI8 A; 2PMZ F; 4PHE A; 4F4W A; 3RTV A; 4F5R A; 5AI4 A; 4QZD A; 2EAN A; 5AI9 A; 1KEJ A; 3SD7 A; 3RAX A; 1NNL A; 1C20 A; 9ICS A; 1KSP A; 4RQ4 A; 2BCV A; 1XWL A; 4F50 A; 1L8O A; 1SB3 C; 2E1F A; 1ED1 A; 2BKE A; 3QZ8 A; 1KKX A; 4OD0 A; 4DOB A; 4DSF A; 3H0L B; 3RAQ A; 1XSP A; 4UAY A; 1YZ6 A; 3KZX A; 2KG5 A; 4IQT A; 5GTH U; 3E58 A; 1SXE A; 1SXD A; 1A6S A; 4RU9 A; 1S0O A; 1M6Y A; 1NI3 A; 1MA7 A; 1RZT A; 5J2D A; 1WYG A; 3IP4 B; 1U48 A; 3THV A; 2HBL A; 2CRX A; 3RFA A; 3KHH A; 3QUB A; 3PX4 A; 4JWM A; 4TUP A; 4CCH A; 1F5S A; 4Y2Q A; 3NVZ A; 9ICT A; 2Y0S F; 4B6J A; 1U4B A; 1CRX A; 1A76 A; 1ZRM A; 3V6H A; 5EE1 A; 2MU2 A; 1ZQ1 C; 4NLB A; 2W9M A; 9ICO A; 2R8I A; 1T3N A; 2B6G A; 4NWI A; 5KFT A; 1JIH A; 3TI0 A; 3AQE A; 1S76 D; 9ICN A; 1Q3V A; 3I28 A; 7ICT A; 1QSS A; 4I2A A; 4C80 A; 5DLG A; 5D49 A; 3T3F A; 2IOF A; 1SKW A; 2EZY A; 1TAU A; 1ZQE A; 3BZC A; 2FPL A; 5IIJ A; 3JPN A; 2W9C A; 1ZQN A; 4OO1 J; 2DKZ A; 2MA1 A; 1SGG A; 1QTM A; 4EYI B; 4C4S A; 2ZIW A; 2ZJ8 A; 2K4H A; 2JR5 A; 5KFC A; 4EEL A; 2WF9 A; 4KLS A; 4J9R A; 2QAR B; 3H7I A; 9ICG A; 4QZE A; 3OHB A; 4I2C A; 2E3T A; 1ZQM A; 2H3Q A; 2GWS A; 5FP0 A; 4UW9 A; 1NK6 A; 1OXJ A; 2ASL A; 3RH4 A; 2HHX A; 1S0V A; 2JZB B; 2MSN A; 3HKZ F; 1X9X A; 2Y9T A; 5G5G A; 3HIL A; 2G09 A; 4PHP A; 3LWL A; 4DL6 A; 3C2L A; 1PVR A; 3C21 A; 2LBO A; 5AI6 A; 2F2A B; 1KW4 A; 4EEN A; 1DGS A; 4EEY A; 2HW3 A; 2PFO A; 2C22 A; 3U26 A; 4YXM A; 2JEI A; 2JMG A; 3FDS A; 4QZF A; 3EPG A; 2HHS A; 4R8U A; 4EEK A; 2OCE A; 4ECX A; 2WB1 F; 2WAQ C; 2R8G A; 2HHV A; 5KFD A; 1PK3 A; 3MR3 A; 4MEY A; 4ED8 A; 2BCQ A; 4K4H A; 1N56 A; 3K4G A; 7ICF A; 4RT2 A; 1ZD5 A; 4RNN A; 1JXE A; 1WUD A; 2LHT A; 2A1A A; 4DF4 A; 5CWR A; 4FFD A; 3H0R B; 4ED3 A; 1N62 A; 5F3X B; 1L3S A; 4KMU A; 3MBY A; 8ICI A; 2DUY A; 3NGD A; 3T5J A; 2K4I A; 4EZ6 A; 4NM1 A; 4GXI A; 1K5O A; 4BDP A; 4QNL A; 2ZIX B; 1ZQU A; 4DS4 A; 1WWV A; 3RB0 A; 2KEY A; 4IQV A; 1F0M A; 5DG7 A; 2JEG A; 3R9K A; 2KIV A; 4DLG A; 4Y2J A; 1Z1V A; 4MFF A; 3MAB A; 4YFK A; 3WKC A; 1PZN A; 2VKQ A; 5HNK A; 4F72 A; 3ORY A; 1NJY A; 4HYK A; 1JRO A; 5KFA A; 4NLG A; 5ALY A; 4R66 A; 4I2F A; 2ODG A; 7ICO A; 5DGB A; 3LK9 A; 3PML A; 1H38 A; 1ZXI A; 1F44 A; 2R18 A; 2EAP A; 5ALU A; 2F77 X; 3CW2 C; 5J8Y A; 4R63 A; 3V7J A; 1NKB A; 2NRW A; 3RJH A; 5L1J A; 4NLN A; 4UB8 U; 5ALP A; 5AM3 A; 2WHE A; 5L1I A; 5KT6 A; 3M8R A; 3F53 A; 3QYP A; 2FPK A; 2OXO A; 5J0P A; 4CF4 A; 1VDV A; 1RYR A; 1RG6 A; 4QIW F; 4F92 B; 1AQ6 A; 3MC1 A; 2LPE A; 4OJO A; 4M47 A; 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4IQW A; 4OJL A; 2D3D A; 2M0N A; 2B0C A; 2UVV A; 4C8O A; 4CDG A; 5L9X A; 4O3Q A; 4C7Z A; 3V6J A; 4PGX A; 1RXW A; 4UQG A; 1YZ7 A; 8ICZ A; 1PUZ A; 4CF3 A; 1Z4O A; 2P6U A; 2ZTD A; 2YTU A; 5AM2 A; 4KLJ A; 2UVR A; 1DGJ A; 2V9W A; 3HJE A; 4F4X A; 1L7N A; 9ICL A; 3AQF A; 3QZ7 A; 3MGV A; 1BPY A; 5KFZ A; 3RRG A; 5KFY A; 1ZQO A; 3ISD A; 3N7P D; 4NJ8 A; 4DFD A; 3CP8 A; 4DL2 A; 1ZQQ A; 4TUR A; 2MAX A; 3M8S A; 1KDH A; 1D8L A; 4DWI A; 1NK8 A; 3I1Y A; 5J2A A; 4JUZ A; 5AK4 A; 5J0Q A; 4IR1 A; 3HX0 A; 4DS5 A; 5H2F U; 3RH6 A; 5JU5 A; 1TK8 A; 2HHW A; 3WK9 A; 1URJ A; 5KFF A; 2F76 X; 5J2C A; 1ARO P; 2E1E A; 4UAS A; 4UAR A; 2G5I B; 2AXT U; 4Y2Y A; 4XA5 A; 3FAH A; 3QUQ A; 5GTI U; 3ZD9 A; 1FO4 A; 5KFQ A; 5C0Y A; 1JXL A; 4I28 A; 5HR7 A; 2AU0 A; 2XGP A; 4USA A; 4DSI A; 2YB1 A; 1COK A; 4CGZ A; 2W55 A; 2FLN A; 1QQ6 A; 4UAZ A; 1LB2 B; 2OWO A; 1N60 A; 1JX4 A; 3PZP A; 2PI5 A; 4GC7 A; 4RQN A; 4PZO A; 3MR5 A; 3GV5 B; 3IDW A; 3M9M B; 1UA1 A; 5KT3 A; 5ALQ A; 1D8B A; 3EWA A; 9ICQ A; 3C1Y A; 4FBU A; 5KG0 A; 3QNM A; 3Q8R B; 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