2QB0B

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with an ala-gly-pro linker.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQAGPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase regulator
molecule keywords E80-TELSAM domain
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 75
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 Transcription Factor, Ets-1 2qb0B01
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qb0B02
182LA 4W59A 218LA 3DN4A 1L07A 4MHVA 1L61A 4I7RA 1QS5A 1L11A 175LA 4W54A 1L57A 2E8NA 147LA 1B6IA 2B6YA 3GULA 2QB0B 230LA 1QUDA 210LA 1QTCA 1L81A 1G06A 2OE4X 2LMRA 5J8YA 1L87A 177LA 1L89A 3BS5A 120LA 1X40A 165LA 1C63A 1L73A 1QTVA 2OTYX 4YXAC 3TADA 3GUKA 1C6DA 262LA 1L16A 1SWYA 1PQIA 141LA 1KY1A 2EAOA 1QT7A 205LA 3HTBA 163LA 3C83A 3DN2A 3DN3A 173LA 1L65A 1QSBA 1D3FA 4I7OA 201LA 1LKYA 1SXEA 128LA 152LA 1L53A 1OVKA 1P6YA 2L78A 3CDOA 4I7LA 1SGGA 148LE 1P46A 181LA 108LA 3L2XA 118LA 1NHBA 3SBBC 1CU0A 159LA 5JU5A 143LA 1P2LA 243LA 2B74A 3DNAA 111LA 3FADA 3G3WA 178LA 235LA 1C68A 257LA 3HH3A 3V2YA 151LA 1QT6A 112LA 1C6MA 1C6AA 1SWZA 1L13A 1C62A 144LA 4I7QA 199LA 1ZWNA 1WWUA 1L39A 1L88A 156LA 3DN6A 1K28A 1QTHA 5J8YC 2RAZX 102LA 3HT7A 1COKA 125LA 4ARPA 3BS7A 1CV6A 4DKLA 137LA 2F47A 3QAKA 2O79A 1L49A 5F3XB 1G0MA 3SB5A 1L71A 4IAPA 1LWKA 2IGCA 1LGXA 139LA 1P37A 1V38A 1QTDA 180LA 226LA 2RB1X 1L51A 4ARJA 1QS9A 196LA 2RBPA 1L33A 1DXSA 169LA 1LYFA 1SSWA 237LA 1L54A 161LA 1L08A 122LA 3HTGA 2E8MA 4EKPA 6LZMA 2F44A 2NTGA 236LA 4ARQB 2ANVA 3L64A 3TACB 3SN6R 1L02A 3HH5A 4ZPUA 1CUQA 3DMZA 2GLEA 1QTBA 185LA 2RBSA 155LA 1L97A 1OYUA 1L22A 1L64A 2B6WA 1QUHA 4LZMA 3C8QA 1L62A 2A4TA 140LA 3SENA 3C7WA 2OE9X 217LA 1L67A 1G0JA 7LZMA 2B72A 2QKQA 3SB6A 1CV5A 197LA 1L09A 1L35A 4EKQA 1L32A 104LA 1C64A 1G0PA 1LPYA 167LA 1PQMA 3EMLA 1KW4A 4S0WA 1XEPA 1KY0A 103LA 4W56A 2YTUA 1L20A 2OU8A 3DKEX 1D2WA 1LYGA 3OE6A 3K1RB 3H8MA 4NJ8A 1PQDA 1L34A 5KNIA 1L63A 3C7YA 1C6KA 123LA 1L12A 1C69A 1LI2A 1G1VA 157LA 4YX7C 3GUJA 1L28A 3LZMA 130LA 3CDQA 4PK0A 170LA 158LA 1C60A 1C6LA 1L31A 1PK1A 2Q9EA 142LA 2O7AA 1L75A 2EAPA 1DYEA 1PK3A 3OE9A 1L18A 131LA 1JI7A 145LA 1G0QA 4E97A 3C8RA 1SV0A 1L37A 3SB9A 1P64A 3SBAA 4I7MA 2LZMA 3DN8A 2K4PA 3DMXA 1L85A 4W57A 1KW7A 4ARLA 215LA 187LA 1QT3A 221LA 1C61A 3GUIA 3HWLA 3ODUA 2QB1A 259LA 2QARA 195LA 1L94A 119LA 238LA 4I7KA 2LC9A 2D8CA 1QUGA 2B70A 1G07A 3HH4A 2Q9DA 3KKAA 2KG5A 2ANXA 1C6QA 183LA 1KNIA 3HT8A 5LZMA 1OWYA 3C8SA 3OE8A 4IS7A 1LGWA 229LA 2DKXA 2Z6BA 2KSOA 5L1MA 1L0JA 1CX7A 3UONA 1DYFA 1TLAA 1D3MA 1L23A 224LA 1L48A 2OU0X 3BS5B 1C6NA 1QT8A 3C82A 4EXMA 2NTHA 1L92A 189LA 4EPIA 1SX7A 3RZEA 1JQUA 1L04A 2F2QA 3HU9A 3TADC 1L36A 1DYDA 192LA 1XJTA 3DN0A 1SV0C 1L14A 172LA 1QSQA 1L15A 2K60A 1DYGA 1P56A 4I7JA 1LKYB 1PQKA 1RG6A 2RAYX 3SB8A 2CUUA 4AQNA 1QTZA 2B6TA 1DYBA 109LA 232LA 233LA 2RB2X 4I7SA 2B7XA 146LA 1CU6A 3HUQA 2QARC 1CU5A 184LA 253LA 1OW5A 1KW5A 188LA 3HT6A 1CU2A 1LLHA 3D4SA 4EJ4A 1L93A 249LA 2KE7A 3KKAC 252LA 164LA 216LA 4NL9A 1UQVA 3C7ZA 1T8GA 1L68A 5JTIA 1L76A 206LA 3OE0A 4DAJA 1PQOA 1PQJA 4GBRB 1D2YA 149LA 1L25A 3FI5A 213LA 1CV1A 2OEAX 1G0LA 1JTNA 1LYIA 168LA 1QUOA 255LA 3HTDA 138LA 1C6EA 1L03A 1SX2A 227LA 2QB0A 1L21A 246LA 1L27A 1OXJA 1L17A 1D3JA 1L05A 115LA 3IDWA 2EANA 3HUAA 1X9XA 2EAMA 261LA 1LI3A 4LDOA 3JR6A 2DKZA 1CX6A 186LA 2FE9A 200LA 3G3VA 2HUMA 1D9WA 1C6GA 160LA 4OO9A 190LA 1Z1VA 1L0KA 1L86A 1P3NA 1ZURA 4W58A 129LA 4PZNA 1T8FA 1L30A 212LA 2HUKA 3RUNA 2O4WA 248LA 2RBQA 3GUPA 4K5YA 3FA0A 2ES6A 258LA 2F3NA 241LA 1L56A 150LA 4EPFA 2OTZX 4LDLA 1L29A 1C6TA 3NY9A 1C67A 2B73A 1T97A 4RQNA 3C80A 4ARMA 1L70A 228LA 1KS3A 162LA 214LA 1CVKA 2E8PA 176LA 254LA 223LA 126LA 1OV5A 3NYAA 1C6JA 2DL0A 3HUKA 1P36A 1L19A 3NY8A 2E8OA 1CU3A 1L42A 3GUNA 4ARMB 4RQMA 1L59A 1L98A 1LI6A 3CDTA 2RBNA 2RBRA 1C6PA 256LA 1T6HA 1V85A 2B75A 4W55A 3HDEA 3GUMA 1LYDA 3DN1A 1OVJA 1C65A 1WWVA 5JRTA 3V2WA 1L99A 211LA 1OV7A 1F0MA 1C66A 2Y9UA 2RB0X 244LA 1CUPA 1ZYTA 231LA 225LA 3F8VA 3HH6A 245LA 2D3DA 1PK1B 1SXDA 1P2RA 2HULA 1D3NA 1CV3A 220LA 2JV3A 191LA 1L00A 1L84A 1C6HA 2B6XA 1DYAA 171LA 1L58A 1WTHA 2OU9A 1L74A 4ARQA 1L01A 260LA 4EKRA 1UCVA 5I14A 1L66A 1L96A 1L55A 240LA 1G0KA 3HDFA 3VW7A 209LA 1CV4A 219LA 2KMDA 1JTMA 2QARB 4I7TA 1L47A 4I7PA 114LA 1C6CA 4W51A 239LA 3CDRA 4EKSA 1L24A 4W52A 1L79A 1LYHA 3C81A 1P7SA 1CV0A 1QT5A 1L52A 3PDSA 107LA 1B0XA 1LW9A 110LA 4W53A 4DJHA 1B4FA 3HT9A 2KSOB 1L26A 1C6IA 3GUOA 1L10A 234LA 3SB7A 3HU8A 1OVHA 1LYEA 113LA 3G3XA 222LA 4I7NA 2ESEA 1L60A 4YXCA 2RBOA 1L77A 4GRVA 3BQ7A 3HILA 1L83A 1G0GA 1L50A 1QT4A 2F32A 1L44A 2KIVA 1L43A 251LA 3CDVA 1L40A 166LA 198LA 4LDEA 4PZOA 1DYCA 1LGUA 1L38A 1L91A 1SV4A 1L69A 1SSYA 1C6BA 1P5CA 2OE7X 242LA 1T8AA 1L41A 4PJZA 3F9LA 1L90A 2LCBA 247LA 2LPEA 2B6GA 1X66A 2F8KA 1LWGA 1L46A 3DMVA 3HTFA 1LYJA 1L80A 1I6SA 1OWZA 2L5YA 2Y9TA 127LA 1G1WA 174LA 3SEIA 3K2RA 1L82A 1L06A 1C6FA 1EPYA 1XJUA 1L95A 4NL9C 2B6ZA 250LA 1L72A 1L45A 3PBLA 2RH1A 1CTWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ECSA 1TAQA 1F10A 1QDRA 1YROA 1QSWA 1RYRA 1LKRA 1LCNA 4DQSA 4B9TA 1QSLA 4XJBA 4HPEA 1HSXA 4WLDA 175LA 4R0FA 4QZEA 3GULA 3H8WA 2ZXHA 2QB0B 2DQJY 230LA 2JEGA 4LZGA 5KFEA 5LINA 1L81A 5LIOA 4US9A 2VKQA 2YVBA 1L87A 2W8LA 2HCFA 1ECWA 4DQQA 4NLZA 1OUCA 1QDTA 1H6MA 5D5CA 2DQNB 3BS5A 4KMOB 2JXJA 4NM2A 8ICBA 2KKVA 1Z3EB 120LA 1L73A 1QTVA 1LYOA 3TI0A 4NLNA 3TADA 3AU6A 1C6DA 4QWAA 5J0TA 4ECQA 3J81j 5KFDA 1ZQPA 3QU2A 2HHTA 1LSPA 3T5KA 1C45A 1KY1A 1NF5A 5KFGA 5AKXA 4QGZA 163LA 3RT5X 4YXJA 1NJXA 3K3TA 7ICNA 4IQUA 1IORA 5A3ZA 3DN3A 1L65A 1RFPA 3CSRA 4R65A 4DD2A 4DCCA 3MGIA 4I7OA 1IP7A 3RNXA 3GV8B 1SXEA 128LA 2K4IA 5B1FA 4H92A 4II8A 3W6CA 1BB5A 1CKHA 4JMUA 4O3QA 2W03A 5I54A 4DQ7A 2H5XA 3ZDDA 118LA 3SBBC 1XO0A 3HBEX 1JJ1A 2LYBA 2BQFA 3UXOA 3PSPA 5JU5A 5EWFA 3DNAA 4XJIA 4KLHA 2ZQ4A 3V6KA 4KLIA 4WMGA 178LA 4A7DA 1LSYA 4RQ8A 2MU2A 4RLNA 2QLTA 5CB1A 4EZ6A 1H87A 1SWZA 1T3PA 1GE3A 4H9HA 2K4HA 1LMQA 4I7QA 3M8RA 2ZG6A 9ICAA 2KVSA 4NLGA 3DN6A 4KX5A 3I1YA 3Q8SB 2ASLA 5AM5A 1QTHA 5J8YC 4M0AA 4EEKA 1PZYA 3H0RB 1COKA 4BJQA 1N2XA 125LA 3BS7A 4IRKA 9ICQA 4N9RA 3PR5B 2F47A 4DLGA 1J2MA 4I2GA 1Q8KA 4MSTA 1DGJA 3WW5A 3SB5A 4YFKA 1L71A 3HBDA 4IAPA 4TUNA 2HOQA 3Q8QB 5AKYA 1P37A 4H8YA 180LA 2RB1X 3CQLA 1TDYA 1DOQA 4FS2A 1ZVHL 3HW8A 1UBZA 3GXRA 4F4XA 2FI1A 1QSYA 2RBPA 4I29A 1LYFA 169LA 1SSWA 4RQ1A 122LA 1GO3F 1JN3A 1KXXA 6LZMA 2F44A 1NK4A 2ANVA 3TMWA 3L64A 5JUMA 2WF9A 4DLEA 3AGIA 8ICKA 1TCYA 2ZIXA 3TACB 1PS5A 3HWTA 4IL6U 1CUQA 1YILA 3LYZA 4WM4A 1LZ9A 1Z4NA 4W94A 7ICFA 4LT1A 4GC6A 1L97A 1UACY 3RTVA 4D9ZA 2GH1A 1DK3A 4Y2QA 1L22A 2FMQA 1LTMA 3H8JA 1S0VA 1QUHA 4NV0A 4UQGA 4B4JA 4NIJA 3NUQA 2A4TA 3SENA 4XA5A 2OE9X 3WK4A 153LA 4H9EA 1JKBA 4UARA 3B6LA 4AYBF 2IHMA 3LYOA 4ETEA 4FS1A 7LZMA 1ZD4A 3KHHA 2QKQA 4B0DA 1CV5A 1SQ2L 1L35A 2W9BB 4G4CA 4O3PA 2YY6A 104LA 4USAA 4GLAA 1B5ZA 4DT3A 4RQ7A 3RH6A 3S6JA 5KFSA 1G7IC 167LA 5CHGA 1TAUA 3EMLA 3RBDA 2ZIKA 2BQEA 2YTUA 1ZQJA 2OU8A 9ICJA 3RRHA 1LYGA 3H8MA 4P2HA 1I56A 1DGSA 1B2KA 1XU4A 2G06A 4MF2A 1MC8A 1FLYA 1GF4A 2FPKA 170LA 1GFAA 1C60A 2CDSA 4WLXA 1L31A 1HEKA 1PK1A 2YQEA 1BB6A 142LA 2Q9EA 1V9PA 4Y2YA 4YD1A 4EZ9A 3C2LA 2W7OA 7ICOA 4NLKA 5ILFA 3UMBA 131LA 3W6FA 3WPJA 1U47A 145LA 4BAFA 2WF5A 3A93A 2IHNA 1SV0A 4DSLA 1NK8A 3EMSA 5BOLA 1L37A 2H3FA 9ICHA 1SKWA 1LZ1A 4I7MA 1XO1A 2ZIVA 7ICMA 2BDUA 2K4PA 2Y8PA 3DMXA 1L85A 4XJDA 2AH5A 5I4WA 2BQGA 9ICEA 1GFEA 3M9MB 3PR4A 4P4OA 4IC9A 2W9CA 4I2HA 5IDDA 4TQSA 3BJYA 3PW4A 119LA 5GTIU 5GTHU 4I7KA 2LC9A 1ZQRA 1J2NA 5AM4A 1G07A 1QTKA 4C4SA 1TV9A 1N56A 3WUMA 2WFAA 3H8SA 2ANXA 1PVRA 1C6QA 2HDOA 4MFAA 2BQKA 4FBTA 2R8GA 1OWYA 1HNLA 1KN5A 3ATOA 3C8SA 4EBCA 1RE2A 3NRWA 2JH7A 3TXKA 3WU7A 4EYIB 2KSOA 2C22A 4FE3A 5HMMA 3F2CA 5ALZA 2ZTDA 2OU0X 3BS5B 1CJ6A 3RF9A 1FIQA 4Y2TA 1QT8A 3RB6A 189LA 1FBIX 1LV5A 7ICVA 1SX7A 1V97A 2HBMA 3TADC 1L36A 3KTQA 192LA 4MFCA 4DFPA 4UATA 5EE1A 2ZYPA 3DN0A 2F4AA 3WULA 4UASA 1IIPA 1QSQA 4OD0A 4ELUA 5J0QA 1D0KA 2DFLA 6LYTA 6LYZA 1LYZA 5APEA 2NO4A 2KTQA 2CUUA 3SB8A 2W1LA 4N1EI 2YB4A 3Q8MA 3HPOA 3MC1A 4CHXA 5L9XA 233LA 4UB5A 2RB2X 1ZQDA 5IIIA 4PPXA 7ICLA 5KJ9A 3ICXA 4UW9A 184LA 1CU5A 3AZ4A 4CGZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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