The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
26
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
LPPSLPSDPRLWSREDVLVFLRFCVREFDLPKLDFDLFQMNGKRLCLLTRADFGHRCPGAGDVLHNVLQMLIIESHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transcription
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| molecule keywords |
Ets DNA-binding protein pokkuri
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| publication title |
Derepression by depolymerization; structural insights into the regulation of yan by mae.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Drosophila melanogaster
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| total genus |
26
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| structure length |
77
|
| sequence length |
77
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SV0 C; 2Y9T A; 2D3D A; 2YTU A; 2KSO A; 4PZO A; 3TAD A; 1Z1V A; 1UQV A; 4MHV A; 2LPE A; 2F44 A; 2QB1 A; 2FE9 A; 2QAR A; 1PK3 A; 1SXD A; 4NJ8 A; 3H8M A; 1PK1 B; 1WWU A; 5L1M A; 4NL9 A; 2QB0 B; 1SXE A; 1F0M A; 1KW4 A; 5J8Y C; 4RQN A; 4RQM A; 3SEN A; 3BQ7 A; 1PK1 A; 2EAO A; 1V85 A; 1X66 A; 2QB0 A; 2E8O A; 2KMD A; 3TAD C; 3HIL A; 2GLE A; 1X9X A; 1OXJ A; 2DKX A; 1COK A; 3TAC B; 2JV3 A; 1LKY B; 3IDW A; 1OW5 A; 2KE7 A; 4NL9 C; 3SEI A; 2QKQ A; 2ES6 A; 2K4P A; 3BS5 B; 1LKY A; 3K1R B; 2B6G A; 2EAN A; 5JTI A; 2EAP A; 2E8N A; 3BS5 A; 2LMR A; 1V38 A; 1B4F A; 5JU5 A; 2ESE A; 1SGG A; 1DXS A; 2F8K A; 2L5Y A; 5JRT A; 2KIV A; 2Y9U A; 2E8M A; 3KKA A; 4IS7 A; 3BS7 A; 2DL0 A; 1X40 A; 2DKZ A; 2F3N A; 1SV0 A; 2EAM A; 2D8C A; 2QAR B; 1B0X A; 5F3X B; 1UCV A; 2E8P A; 2KG5 A; 1JI7 A; 1SV4 A; 1RG6 A; 1WWV A; 2K60 A; 5KNI A; 2KSO B; 4PZN A; 3KKA C; 5J8Y A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2W54 A; 4DFM A; 2XC9 A; 5J0P A; 2KK0 A; 3H40 A; 2HOF A; 2I9G A; 2UVU A; 2KSO A; 4LZG A; 1SZH A; 2Z7J A; 2KZ3 A; 4B9L A; 3KZX A; 2WB1 F; 5CA7 A; 1NKE A; 5D4B A; 1WWU A; 1K1S A; 5ALV A; 8ICP A; 1IM4 A; 3EUB 2; 4LZD A; 9ICE A; 1XNS A; 1FFU A; 5AIB A; 5DQH A; 1YZ6 A; 8ICH A; 2W9B B; 3EPG A; 1X66 A; 5EWF A; 3D6J A; 5G5H A; 3F5E A; 2W55 A; 5AI8 A; 1XC9 A; 4UW9 A; 1ZQJ A; 1ZQS A; 2CRX A; 2EZZ A; 5CR0 A; 2K4P A; 4UAT A; 5KFP A; 4JMU A; 5DBC A; 3ZD8 A; 4QNL A; 4DEZ A; 4YQW A; 3F2D A; 4I2A A; 3I28 A; 5KG6 A; 4EBE A; 3TAP A; 5DBB A; 4QW9 A; 4C8N A; 4YCX A; 3FC4 A; 8ICX A; 1F44 A; 5DG8 A; 4YXJ A; 3GDX A; 8ICJ A; 5D49 A; 1ZQV A; 4O3O A; 5EOZ A; 1JIH A; 3RJK A; 4F5Q A; 2KJ5 A; 3PW5 A; 3NGD A; 4F8R A; 4RUC A; 1QQ6 A; 4ECX A; 5AM0 A; 4NWI A; 2XO7 A; 4IL6 U; 4C4S A; 3C2K A; 1UCV A; 3ETR A; 4UAU A; 4M9J A; 2OXO A; 3PR5 B; 2A3V A; 5J0R A; 2OHF A; 3ZI4 A; 7ICT A; 9ICA A; 1NJY A; 1NJZ A; 1RQN A; 4ED7 A; 2F77 X; 4DF8 A; 8ICG A; 1B22 A; 4QZF A; 8ICA A; 3HRD D; 8ICE A; 5KFW A; 5CRX A; 3GIL A; 2FE9 A; 2W8K A; 5KT6 A; 2ZTC A; 4I2C A; 2GO7 A; 2LYH A; 2AU0 A; 5CB1 A; 4KMU A; 2H3F A; 2W9C A; 3C1Z A; 1NZB A; 4NLK A; 5GTH U; 1XSL A; 2JGA A; 5ALQ A; 2FMQ A; 4J9S A; 4ELU A; 1KFS A; 4OCZ A; 1PK1 A; 7ICV A; 8ICQ A; 4KLI A; 3DEE A; 1X9X A; 3IHQ B; 1FIQ A; 3UMC A; 1SKS A; 3PY8 A; 1DGJ A; 3HKZ C; 4NL9 C; 3H8J A; 4Z6C A; 5HNK A; 5AM4 A; 2WAQ C; 5J0S A; 3H0L B; 3F2C A; 2KTQ A; 3GFK B; 5KFX A; 5J0U A; 4DF4 A; 5FP0 A; 7ICE A; 5AKH A; 1V38 A; 3PST A; 2KN7 A; 4TUR A; 1L3S A; 2G07 A; 3H0R B; 4ELV A; 1RXW A; 1SL2 A; 4DL2 A; 4R65 A; 1ZQH A; 3IV6 A; 3RJF A; 1JRP A; 2XVT A; 2PFP A; 4KLS A; 3I1Y A; 1SKW A; 1S0M A; 1A6S A; 4EEN A; 3IN5 A; 4NLB A; 4IRD A; 1ZQR A; 3H0M B; 1FFV A; 8ICY A; 4MEY A; 5G5G A; 3FM9 A; 2JXJ A; 1L8L A; 4YD1 A; 4RZR A; 5AK5 A; 4YXM A; 2BCU A; 1UT8 A; 2YX8 A; 1Z00 B; 1ARO P; 3SV4 A; 4US9 A; 3TAR A; 2YML A; 3PX4 A; 3C29 A; 1WYG A; 1PVP A; 3KBB A; 3CW2 C; 1ZQI A; 4Y2U A; 4EX6 A; 2KV2 A; 4OO1 J; 1V9P A; 2GH1 A; 2YMQ A; 3IM1 A; 5IIM A; 2YMM A; 5DBA A; 3T5L A; 1L7O A; 3Q8M A; 4MEX A; 3M6Z A; 4UAZ A; 5HML A; 2KMD A; 3TAD C; 4I2D A; 4ZH4 A; 1DRG A; 3THV A; 1ZD4 A; 7ICJ A; 3MBY A; 4R8U A; 3WKE A; 5AI9 A; 1LKY B; 4NXZ A; 1PVQ A; 1HUO A; 5DKW A; 5ALN A; 1SKR A; 3RH6 A; 4RPX A; 4JUZ A; 4O9M A; 1ZQU A; 3K1R B; 4QIW C; 2RP5 A; 1ZQ1 C; 1HIW A; 8ICF A; 4RPY A; 2ZJ8 A; 5AK4 A; 4M9H A; 4I2J A; 1YT3 A; 2LMR A; 3GIK A; 4Z6D A; 1NK5 A; 2L5Y A; 1U45 A; 4KX3 A; 4F5R A; 1ZET A; 3NRW A; 2RRD A; 4QW8 A; 5IIO A; 5L1I A; 3O0F A; 1LV5 A; 2JEI A; 1UPH A; 4PHP A; 5TIS U; 9ICX A; 3ALR A; 3F5A A; 4DS5 A; 2BCQ A; 5L1L A; 4J9M A; 3AQF A; 2FI1 A; 1PZN A; 4O3Q A; 3LYS A; 4G3I A; 2G5H B; 3N97 B; 5DLG A; 4PZN A; 1H38 A; 4DQP A; 4C4T A; 4FE3 A; 4C4R A; 3RB3 A; 5J2J A; 2ZXH A; 4F5P A; 2HVI A; 2BCR A; 1F5S A; 4YD2 A; 1JRO A; 3GV5 B; 1ZJM A; 5EWG A; 1FEZ A; 2QLT A; 4QWA A; 3ETL A; 8ICN A; 2C2E A; 3KHL A; 2NO4 A; 4I2H A; 4UAW A; 4X5V A; 3C1Y A; 3SEN A; 4ECR A; 4DQS A; 2EAO A; 3EYZ A; 3QU7 A; 5ALL A; 3SYZ A; 4Y2S A; 2PI5 A; 2E5S A; 2HHQ A; 1KQQ A; 5KFL A; 3Q8K A; 4I2B A; 1OW5 A; 2HDO A; 1NI3 A; 2E3T A; 3PR4 A; 3H4D A; 1ZQM A; 3PSP A; 3M9N B; 1ZQO A; 4M9L A; 3HW8 A; 4RNN A; 1U4B A; 5B5E U; 4RQ5 A; 3ICX A; 2WB1 C; 4BXO A; 2KZM A; 3EPI A; 3LDA A; 2I6X A; 2KIV A; 3KKA A; 1RDF A; 2IOF A; 2DKZ A; 4F50 A; 1UA0 A; 2XI9 A; 1BPY A; 3H4B A; 2P66 A; 2ZIU A; 2BQU A; 2EZX A; 4P0Q B; 1IG6 A; 2A19 A; 2I5H A; 2OWO A; 3JPQ A; 4P0P A; 5EE3 A; 5KL8 B; 4Q44 A; 3N28 A; 1KTQ A; 1N5W A; 4M04 A; 2IHM A; 2Y0S F; 2XCA A; 3QU9 A; 5J8Y A; 4IRC A; 3QU5 A; 1J97 A; 2KIW A; 2DGZ A; 3LVV A; 1S76 D; 3OSP A; 4MFF A; 5AKZ A; 3SV3 A; 3TKA A; 1KSP A; 4C8O A; 4YFK A; 1IXR A; 5KG0 A; 1TKD A; 3V6J A; 1HUZ A; 4KLD A; 5L1M A; 2CXY A; 2J6T A; 1JXL A; 1QTM A; 4IRK A; 1KW4 A; 3H8W A; 9ICP A; 1HJP A; 2GWS A; 1ZQC A; 1WG8 A; 4F2S A; 3GV8 B; 2E8O A; 3ISC A; 3UXP A; 2BCV A; 5ALK A; 2C2D A; 1KL9 A; 2GLE A; 3OPX A; 4FBT A; 4MF2 A; 1BPB A; 4C0Z A; 1ZQW A; 4ECS A; 2HOI A; 1NNL A; 2AGQ A; 1ZOL A; 3F53 A; 3WK7 A; 3HJE A; 1D9D A; 4TUS A; 2W7P A; 3M8S A; 4PGQ A; 2FDR A; 2N1R A; 3BS5 B; 1Q3V A; 2ZUD A; 3F2B A; 5ALE A; 3JPT A; 2LKY A; 3M9O B; 3AUO A; 4GC6 A; 1KEJ A; 4J9O A; 3TAQ A; 3RJE A; 4RQ1 A; 1Q46 A; 4M6W B; 5KFH A; 1SGG A; 5JUM A; 3MR5 A; 1ZRM A; 5EE0 A; 3C5F A; 4XQ8 A; 4MFC A; 2XCP A; 5KFB A; 1TAU A; 1NZP A; 3GZF A; 5J2B A; 2KVS A; 4DS4 A; 8ICK A; 5KG1 A; 4RNO A; 3U26 A; 4DFP A; 8ICL A; 2F1J A; 3PZP A; 1SIJ A; 3BQT A; 2B21 A; 4C8M A; 4F2R A; 4CRX A; 2PFQ A; 5AM1 A; 1NK7 A; 4GC7 A; 5J2K A; 1BPD A; 3OHA A; 2RDJ A; 1SV0 C; 3RBD A; 4YMN A; 3VCB A; 3MGV A; 5AI4 A; 1X6J A; 4TQS A; 3M6K A; 3Q8S B; 3SR6 A; 3MFH A; 1ZQT A; 1CI4 A; 1PK3 A; 2JR5 A; 1L3V A; 4CGZ A; 2HHX A; 9ICB A; 5III A; 4EYI B; 4KLF A; 2MUT A; 2BGW A; 1O03 A; 4YR0 A; 4QWE A; 3M9M B; 3G6Y A; 3QUT A; 1ZD2 P; 5EE1 A; 2YY6 A; 2E1F A; 5DG7 A; 2MA1 A; 4Q8E A; 2OCE A; 4TUQ A; 4QJF B; 1NJX A; 2ZIX A; 2W04 A; 4B6J A; 3C28 A; 3ZDC A; 3PW0 A; 4B9M A; 2FLP A; 1DGS A; 2HHS A; 4UB6 U; 3NUQ A; 8ICC A; 3IG8 A; 4F5N A; 1B4F A; 5IIK A; 2J6S A; 4RU9 A; 1JMS A; 3LK9 A; 5J2C A; 3T3F A; 2E1E A; 4FO6 A; 4DSI A; 3EZ5 A; 4KMO B; 3QXG A; 9ICT A; 1NK6 A; 2PXI A; 4P2H A; 4F4Z A; 3UQ0 A; 1S77 D; 5AI0 A; 4C8K A; 3FAH A; 4I29 A; 9ICW A; 2KZZ A; 5DG9 A; 2NYV A; 1BPE A; 1EXN A; 2DBY A; 3NVV A; 3RB4 A; 3WU2 U; 1SV4 A; 2EDU A; 3QUQ A; 2NRW A; 2BZF A; 3WK4 A; 2LM1 A; 4UB4 A; 2ZIV B; 2RLT A; 4DLE A; 1RQL A; 2HI0 A; 4WJ3 B; 1RYS A; 2ZUC A; 4J9P A; 4FZM A; 2HBL A; 4I2F A; 2YMP A; 2HBM A; 1ZQK A; 5ALJ A; 3I76 A; 2A1J B; 4QZH A; 4HAI A; 2KKP A; 5KT7 A; 3TQ1 A; 2DFL A; 3UMG A; 3BQ2 A; 2FMS A; 4Y2P A; 4BUG A; 4XRH A; 4RQM A; 2JEG A; 1Q8K A; 2VA3 A; 3GV7 B; 4KLG A; 5AM3 A; 3E2E A; 1LB2 B; 2W03 A; 3LWM A; 3HIL A; 1GO3 F; 5KFY A; 1Z1B A; 1ZQN A; 5ALW A; 9ICO A; 4ECU A; 2KEY A; 1X42 A; 4JK1 A; 2W9A A; 1MN8 A; 2F2A B; 2BPF A; 4LVS A; 2W3S A; 2ZIU B; 3QX7 A; 4FS1 A; 9ICN A; 1M6Y A; 2V9W A; 2WFA A; 1NK0 A; 2NRZ A; 5AK6 A; 1RM6 C; 4P0P B; 4ED2 A; 1U47 A; 2AGO A; 2BPC A; 3AL0 B; 4BGD A; 4G9B A; 2OYY A; 9ICG A; 4EBC A; 2Q0Z X; 4J9N A; 1X9W A; 4B9S A; 1IV8 A; 4NLG A; 5HR6 A; 4YP3 A; 3HP6 A; 2D6F C; 2JZB B; 4DFK A; 1X9S A; 3PNC A; 4KLM A; 2BKE A; 3OJU A; 4Y2J A; 3RJH A; 4C7Y A; 1LVH A; 1U49 A; 1D9F A; 3SI8 A; 1T3Q A; 1ZRN A; 3JPS A; 4DCC A; 1TAM A; 2W3R A; 4RT3 A; 1K1Q A; 2D3D A; 4OJO A; 2RQ5 A; 4QWD A; 4F5O A; 2B0C A; 1S8O A; 5HHH A; 1BNO A; 8ICR A; 5KAF U; 3RR7 A; 3Q8R B; 4AYB F; 5BOM A; 1Z1V A; 2W11 A; 1UQV A; 1XS9 D; 9ICU A; 1Z4O A; 2G0A A; 3C2L A; 2DQN B; 4IQT A; 2R8H A; 5AKJ A; 5ALD A; 3H8S A; 2EQY A; 2AQ0 A; 7ICP A; 2QB0 B; 1A76 A; 3T5K A; 1F0M A; 3RH5 A; 3SAG A; 4ELT A; 5KFE A; 2ZG6 A; 4QZD A; 5J2G A; 2CPR A; 2CN1 A; 3ONN A; 1N5X A; 1T4G A; 3PW4 A; 1OXJ A; 5KFQ A; 2K8C B; 1J2M A; 4F4Y A; 5J0T A; 4DOA A; 3GQC A; 5AM2 A; 4PGX A; 2FPK A; 5KFZ A; 2HMX A; 5CJ7 A; 2Y0S C; 4Y2Y A; 2ALZ A; 4UB3 A; 4M9G A; 5C5J A; 5AHX A; 2JEJ A; 3E58 A; 3QYP A; 5F9L A; 8ICS A; 1U48 A; 2A1A A; 3CP8 A; 5KFV A; 2W43 A; 1PVR A; 2KFZ A; 3RJJ A; 7ICF A; 2V4R A; 3OGU A; 1L6N A; 4J9K A; 4RNM A; 1NKB A; 2XY7 A; 2HHU A; 2F8K A; 1JX4 A; 1SZP A; 2AXT U; 1NKC A; 5D46 A; 1TK8 A; 3MR6 A; 2ZIW B; 4UQG A; 4JV0 A; 1CRX A; 3ISD A; 5ALY A; 4DL7 A; 2ASL A; 2OH2 A; 4U6P A; 2H3I A; 1KDH A; 2KG5 A; 3R9K A; 1JI7 A; 2VIX A; 7ICS A; 4P4M A; 2NV3 A; 5AI5 A; 3JPN A; 1Z19 A; 7ICO A; 3PVX A; 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2JMG A; 9ICR A; 2W9C B; 1SXD A; 3LVW A; 3H8M A; 5AKY A; 1PK1 B; 3V7K A; 3BZC A; 3T5J A; 1BPX A; 2IHN A; 1L7N A; 3SAF A; 2C22 A; 3KTQ A; 4ECT A; 4K4I A; 5DQI A; 1TV9 A; 1X6I A; 1V85 A; 3HWT A; 3EW9 A; 1D8L A; 4CCH A; 4QWB A; 4FZN A; 1QH9 A; 2JV3 A; 4IC9 A; 4MFA A; 3UMB A; 4KLO A; 2KE7 A; 2UVV A; 3M8R A; 3AM9 A; 2EH9 A; 1ECW A; 1ZXI A; 1K5O A; 2C28 A; 5ALM A; 4RPZ A; 2DPI A; 1FO4 A; 1X2I A; 3WK9 A; 5DGB A; 4CF5 A; 4I2G A; 5T14 A; 1Z3E B; 3GII A; 4ZOH C; 4OJL A; 2KNJ A; 2W8L A; 2P6U A; 3BQ0 A; 4DQI A; 4KLE A; 3FDS A; 3SMV A; 2Y9U A; 3MDA A; 1XSP A; 3QEB Z; 2NRT A; 3ORY A; 1X40 A; 5KT2 A; 3TI0 A; 3V6H A; 2JH1 A; 3NTU A; 5HR7 A; 2HOQ A; 5ALS A; 3ZDB A; 9ICM A; 2O6K A; 3RRH A; 1XWL A; 4KN4 A; 2I1Q A; 4KLL A; 4JWM A; 5ALZ A; 2VKQ A; 4B9V A; 2ZUB A; 1N63 A; 5KAI U; 2LBO A; 2ODG A; 2R18 A; 2K60 A; 4RT2 A; 1VJ5 A; 3SD7 A; 8ICB A; 2LI6 A; 9ICF A; 4BWJ A; 3AQE A; 4NLZ A; 2WTF A; 1QSS A; 3BZK A; 4YG2 A; 2KVC A; 5ALR A; 1JXE A; 5DB6 A; 5DQG A; 1UA1 A; 1MQ2 A; 1Z00 A; 7ICI A; 5J0O A; 2QB1 A; 4M2Y A; 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