1BNQA

Carbonic anhydrase ii inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE
publication title Structural analysis of inhibitor binding to human carbonic anhydrase II.
pubmed rcsb
total genus 76
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1998-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1bnqA00
1CNXA 3DVBA 1RAYA 5EKJA 3BL0A 1FQLA 3U7CA 2POVA 5C8IA 4Q7SA 4Z1JA 4R5BA 4PQ7A 1CINA 4ZX1A 1ZFKA 1G52A 4WUPA 3HKTA 4UOVA 3KIGA 3RZ1B 3Q31A 1Z9YA 3P3HA 4MDMA 4YGNA 1TH9A 3D93A 4XIXA 4K0SA 5BYIA 4JSSA 1YDAA 4Q7WA 4YXOA 1LGDA 3NB5A 1CAJA 1V9IC 2NXTA 5E2KA 1HUHA 1RZEA 1Z93A 3M1WA 5DSOA 1UGBA 3OYQA 5E2SA 3T85A 4LHIA 5AMLA 5EKHA 3UYQA 1I90A 4QSIA 2HFWA 3S9TA 3C7PA 4WW8A 2CBCA 3FFPX 4LP6A 3N2PA 5CACA 4Q49A 2ABEA 3CA2A 1CAMA 1CVAA 1I9PA 5DSMA 3SAPA 4MLXA 1IF5A 2NN7A 2X7SA 3TVOX 4E9OX 2NNVA 3MZCA 4M2RA 1BNWA 1EOUA 4K0TA 3F7UA 3OIMA 4CNRA 3L14A 2X7UA 1I91A 1ZNCA 2W2JA 3IBUA 4KNMA 5FL5A 5FDCA 5FNKA 1H9QA 5SZ1A 5HPJA 1G4OA 3RYYA 9CA2A 4IWZA 5JGTB 4QK1A 4RUZA 4Y0JA 1CALA 2OSMA 5JDVB 1HEDA 1OKMA 2FMGA 4WR7A 5E5UA 4KP8A 1RJ6A 1BCDA 4L5WA 4CACA 2AX2A 1UGEA 3RYJB 2POUA 4Q06A 4ETQC 1A42A 1YO1A 3RYZA 4HEYA 1YO2A 3DVCA 1I9OA 3M98A 4YWPA 3KWAA 4Q90A 1CAKA 1ZH9A 1UGCA 5E2RA 1RZAA 4YGLA 1I9NA 1FR7A 1CAHA 1CNJA 1F2WA 2FOQA 1BN3A 2NNSA 1TTMA 3MWOA 4PYYA 3W6IA 3V3HB 1ZE8A 1G6VA 4QY3A 5EHWA 1FQMA 1JD0A 1MOOA 2NWOA 2Q1QA 3KNEA 4YXIA 1DCBA 2QP6A 3RGEA 3T82A 3MNJA 3HLJA 2EU2A 3M2XA 2FOVA 3M14A 3S75B 2OSFA 1KWRA 3MNIA 2FMZA 4YHAA 3S76A 4Z0QA 3MNHA 1HVAA 3D92A 4KNJA 1I9QA 5SZ7A 1URTA 1TG9A 5G0BA 4DZ7A 1H9NA 4YYTA 2HOCA 1HEAA 1CVEA 1HEBA 3OIKA 1LUGA 2GEHA 1CCSA 3N0NA 1JCZA 3P58A 3SBHA 3F7BA 5JEGB 1THKA 1BN1A 1CA3A 3UYNA 3N4BA 5E2MA 4BCWA 5DSNA 4ZWZA 5DVXA 3T83A 3JXGA 3P44A 5JGSB 3MDZA 1IF6A 1CAOA 3MMFA 4RN4A 2HL4A 3RG4A 1CAZA 3IGPA 4RIVA 3KKXA 3W6HA 4HT0A 2WEOA 1CZMA 3SAXA 3RZ7A 1CNWA 12CAA 4E5QA 4KUVA 3CAJA 4TWLA 1DMYA 2HNCA 2ZNCA 3HKUA 5EKMA 4Q87A 4E3HA 4FVOA 4QIYA 4E3FA 1CNCA 1I8ZA 3U3AX 1ZSBA 3FE4A 3M40A 5EH8A 4X5SA 2VVAX 4FIKA 4WUQA 3V3FA 1KOQA 3ML5A 1CNYA 2NXRA 5DSJA 4N16A 2CBAA 5FLOA 3P3JA 2NWZA 3DAZA 1YDCA 4PZHA 3R16A 1RAZA 3MHCA 3DBUA 4HEZA 1G53A 5JEHB 6CA2A 5SZ4A 1BNUA 3S8XA 4LU3A 2IT4A 1CCUA 5FLSA 3V2MA 3DD8A 1IF7A 4QJMA 4CQ0A 1FSRA 5DSQA 5L6KA 3M1KA 4Q8YA 1FSNA 4KUWA 1FQNA 3T5UA 3DC3A 2FNNA 1UGAA 3CYUA 3HKNA 3D9ZA 5SZ5A 4XZ5A 2WEJA 3T84A 3DV7A 4L5UA 7CA2A 2QOAA 4CA2A 4YGFA 3DA2A 1FSQA 2GD8A 1I9LA 5EZTX 2F14A 1YO0A 2CBDA 1G4JA 1J9WA 1XPZA 2CBEA 4QK3A 4QSBA 4C3TA 1DCAA 2FW4A 1BNQA 3PJJA 4M2VA 1G1DA 5A6HA 4KNIA 4PXXA 3B4FA 1BNMA 1XEVA 3M2NA 5L3OA 3MNAA 1CAIA 2Q1BA 5FLRA 4QEFA 5G0CA 5JG5B 1CAYA 4WW6A 1UGDA 4BF1A 1CANA 1UGFA 1BNNA 5FDIA 1DMXA 2NXSA 1V9EA 1ZSCA 4KUYA 2VVBX 4QSJA 3DD0A 4Q8ZA 3BETA 5DSRA 1IF4A 2FOYA 4RH2A 5BNLA 5IPZA 3S78B 5E28A 5BRVA 4Q99A 3QYKA 1RZCA 3M3XA 4ZAOA 5FLTA 3B1BA 4KAPA 4BF6A 5DOGA 3S74B 3VBDA 3BL1A 3RYXB 1YDBA 1G45A 3MYQA 4ZWXA 5CA2A 1KEQA 4QSAA 3IBLA 3PYKA 5DSKA 4QJ0A 3M96A 2O4ZA 5BRWA 2QO8A 5FNJA 3KOKA 4JSZA 4Q7PA 1CILA 3DCWA 1AVNA 1IF9A 4Q83A 3RG3A 1Y7WA 3ZP9A 4YGKA 2HD6A 3V3JA 5JQ0A 1YDDA 3M2ZA 3RYVB 2EU3A 4E3GA 4FVNA 5E5RA 5G01A 5FNGA 3M5SA 2CA2A 3FW3A 5JQTA 5BRUA 1TEQX 2NWPA 4MTYA 2HKKA 3KLDB 3U45X 4KP5A 4MO8A 3V3GB 3K34A 2NNGA 3M04A 3ML2A 4ZX0A 3K2FA 5EHEA 4CNVA 5AMDA 4RUXA 1ZFQA 4JS6A 1CNHA 1CCTA 1CVCA 3EFTA 4ITOA 2H4NA 4YGJA 3JXHC 3RJ7A 2FOUA 3P5LA 1BNTA 3HS4A 3P5AA 4R5AA 4COQA 1CNKA 2NMXA 4CNXA 1I9MA 4Q09A 1G54A 4Q81A 2X7TA 5J8ZA 1RJ5A 1BNVA 4Q7VA 4YVYA 1G3ZA 1HCAA 4Q9YA 5SZ3A 5FNHA 3S72B 2POWA 4YXUA 2ILIA 5CLUA 2NNOA 3JXFA 5DSPA 4HU1A 4HT2A 1G48A 4IDRX 1TG3A 3M2YA 2CABA 3OYSA 3S71B 5A25A 1CVBA 1LG5A 3HFPA 3U47A 3HKQA 4HBAA 5G03A 3S77B 4Q0LA 4E4AA 3DCSA 4Q6DA 2WEHA 4FRCA 1CRAA 1XEGA 1ZSAA 1KWQA 3TVNX 4HEWA 3OKUA 1G0FA 2NWYA 3SBIA 4JSWA 1TB0X 3V5GA 5DOHA 4E3DA 5CJFA 3R17B 1BN4A 4Z1NA 5FL6A 4K13A 5EH5A 4YX4A 3CZVA 3S73B 4ITPA 4JSAA 4K0ZA 1OKLA 1HCBA 4Z1KA 3N3JA 1TBTX 3MHLA 4MDGA 1FR4A 1G46A 1RZBA 5AMGA 1CNIA 2WD3A 1RZDA 3DCCA 3GZ0A 3EFIA 4K1QA 2FNMA 4FPTA 4QTLA 3ZNCA 4Q8XA 2CBBA 5FNLA 3TMJA 4ZWYA 3M67A 3S97A 3DC9A 3P4VA 1IF8A 4G0CA 4Q08A 4XFWA 2EZ7A 1CVDA 2H15A 5DSLA 4MLTA 3V7XA 4KNNA 3M1JA 1OQ5A 4N0XB 4ILXA 5EIJA 3V2JA 4MDLA 2FOSA 1AM6A 1ZGEA 3LXEA 1TEUX 3F8EA 3D8WA 4FU5A 3V3IB 4QIZA 5JESB 4G7AA 5EOIA 3MNKA 3F4XA 3M5TA 4E49A 4QJPA 2Q38A 4XE1A 4Q78A 3D0NA 4L5VA 4M2UA 4XIWA 3IBNA 2NN1A 4M2WA 5DSIA 3KS3A 3KOIA 5FL4A 5SZ2A 3MHMA 5JEPB 1FQRA 4Q07A 1AZMA 4HF3A 1CRMA 3PO6A 3NJ9A 5FLQA 3M5EA 5JG3B 1T9NA 3DVDA 8CA2A 4TWMA 3RZ8A 5FNMA 3OY0A 1G0EA 5EH7A 5LMDA 4RFDA 3MHIA 5FLPA 1HUGA 2AW1A 2FNKA 3OKVA 4RUYA 5E2NA 4QJXA 4R59A 4KV0A 5DRSA 4Z1EA 3T5ZA 3NI5A 5SZ0A 4ZWIA 1JV0A 1UGGA 1H4NA 1LG6A 3IEOA 4DZ9A 5EHVA 3OILA 1Z97A 2WEGA 4GL1X 1CNGA 4Q6EA 4QJOA 3K7KA 1FLJA 1LZVA 3M1QA 1XQ0A 3MNUA 3IAIA 5SZ6A 4WL4A 3P55A 4RIUA 5FNIA 1CNBA 3KONA 3RZ5A 4PYXA 3RLDA 1CA2A 1KOPA 1BV3A 1CVFA 4QJWA 1MUAA 1CIMA 4FL7A 2WD2A 1HECA 1TE3X 4QK2A 1BZMA 1BICA 3MHOA 3RZ0B 1CVHA 1OKNA 1ZGFA 4RFCA 4CNWA 3IBIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CNX A;  3DVB A;  1RAY A;  5EKJ A;  3BL0 A;  1FQL A;  3U7C A;  2POV A;  5C8I A;  4Q7S A;  4Z1J A;  4R5B A;  4PQ7 A;  1CIN A;  4ZX1 A;  1ZFK A;  1G52 A;  4WUP A;  3HKT A;  4UOV A;  3KIG A;  3RZ1 B;  3Q31 A;  1Z9Y A;  3P3H A;  4MDM A;  4YGN A;  1TH9 A;  3D93 A;  4XIX A;  4K0S A;  5BYI A;  4JSS A;  1YDA A;  4Q7W A;  4YXO A;  1LGD A;  3NB5 A;  1CAJ A;  1V9I C;  2NXT A;  5E2K A;  1HUH A;  1RZE A;  1Z93 A;  3M1W A;  5DSO A;  1UGB A;  3OYQ A;  5E2S A;  3T85 A;  4LHI A;  5AML A;  5EKH A;  3UYQ A;  1I90 A;  4QSI A;  2HFW A;  3S9T A;  3C7P A;  4WW8 A;  2CBC A;  3FFP X;  4LP6 A;  3N2P A;  5CAC A;  4Q49 A;  2ABE A;  3CA2 A;  1CAM A;  1CVA A;  1I9P A;  5DSM A;  3SAP A;  4MLX A;  1IF5 A;  2NN7 A;  2X7S A;  3TVO X;  4E9O X;  2NNV A;  3MZC A;  4M2R A;  1BNW A;  1EOU A;  4K0T A;  3F7U A;  3OIM A;  4CNR A;  3L14 A;  2X7U A;  1I91 A;  1ZNC A;  2W2J A;  3IBU A;  4KNM A;  5FL5 A;  5FDC A;  5FNK A;  1H9Q A;  5SZ1 A;  5HPJ A;  1G4O A;  3RYY A;  9CA2 A;  4IWZ A;  5JGT B;  4QK1 A;  4RUZ A;  4Y0J A;  1CAL A;  2OSM A; 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