2NWYA

Structural and kinetic effects of hydrophobic mutations on the active site of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFLVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords carbonic anhydrase 2
publication title Speeding Up Proton Transfer in a Fast Enzyme: Kinetic and Crystallographic Studies on the Effect of Hydrophobic Amino Acid Substitutions in the Active Site of Human Carbonic Anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nwyA00
2HFWA 1CCSA 1CNKA 1XEGA 4ITOA 2POWA 1BCDA 5FLPA 3RGEA 4E4AA 3T5ZA 4Q09A 3CYUA 4PYYA 2NXRA 4PQ7A 1CVCA 1AVNA 2WD3A 1LUGA 3S73B 1HEDA 4KNNA 5EHWA 3MNIA 3V3GB 3HKNA 2OSMA 3M1QA 4CNRA 5EH5A 4KUWA 3M1JA 4HF3A 4QSIA 5E2RA 3V5GA 5DSJA 2FOYA 1CVFA 1G45A 2QO8A 5EKHA 3NI5A 5FNLA 3M2XA 2HD6A 5EH7A 1CAZA 1G0FA 5FLTA 1HVAA 1FSNA 5SZ5A 1BNUA 5AMLA 1HEBA 2NN7A 3D8WA 4MDMA 1UGFA 4KV0A 3RZ5A 4JSWA 2FOQA 3M96A 4Q90A 4Q7PA 4WW6A 1A42A 3IBIA 5DOHA 3HFPA 1CNXA 3V7XA 3F4XA 3OKUA 1ZNCA 5FNIA 4E9OX 1YDBA 3EFTA 1IF7A 1ZE8A 1YDAA 4G0CA 5SZ6A 1ZGEA 1ZGFA 4FU5A 5G01A 4YXOA 4HT0A 4IDRX 5FDCA 3P3HA 1CNIA 4ZWYA 2CBCA 1G53A 3RYYA 3CA2A 4E5QA 5FDIA 3R16A 3N3JA 5BNLA 1CVDA 1IF8A 3D0NA 1UGBA 4YGJA 5SZ2A 3M40A 4HT2A 2F14A 1IF9A 1FQLA 4RUYA 1RJ5A 3KONA 4PZHA 1CANA 5DSOA 5EOIA 1HUHA 3UYNA 3M2ZA 3S8XA 1RZEA 4QJPA 5FNJA 3SAXA 5CA2A 4LU3A 2HL4A 4COQA 4WR7A 4WUQA 1TTMA 4ZWXA 3F7BA 4YGFA 4YGNA 4QK3A 4RFCA 4KUYA 4XZ5A 1RZCA 4PYXA 4ILXA 4CA2A 5E2MA 3TMJA 5E2NA 3S9TA 5SZ3A 2W2JA 2GEHA 4QSBA 1JV0A 5J8ZA 4Z1NA 3P58A 4QJ0A 4CNXA 3HKQA 2IT4A 1CZMA 1IF4A 4FVNA 4KNJA 2VVAX 4KP8A 4Q6EA 4TWLA 1XEVA 1OKMA 3T85A 1BN1A 5EKMA 1CA2A 1H9NA 3M2YA 4Z0QA 3KIGA 1XPZA 4KNMA 5E2KA 4K0ZA 2X7UA 5E28A 2NMXA 1FR7A 2ABEA 4HEYA 4Q99A 3RG3A 1CNBA 4JS6A 1CAHA 4RH2A 5E5RA 3MHLA 1FQMA 1ZFQA 3BETA 3P55A 1BN4A 3CZVA 4ITPA 3N2PA 4Q78A 1KOPA 4Q6DA 4Q8YA 4Q49A 3S71B 4CQ0A 3V3HB 1HCBA 3M04A 8CA2A 4KAPA 4PXXA 4QSAA 5IPZA 3U45X 2WEJA 3M3XA 5JG3B 3S75B 3M67A 3UYQA 3FW3A 3DD0A 3JXGA 4RN4A 3D92A 1Y7WA 3OIMA 4YHAA 3MHCA 5JQ0A 4KNIA 1ZSAA 5EH8A 5CJFA 2GD8A 3P5LA 4MTYA 5FL5A 2FW4A 4QIYA 5SZ1A 4CNWA 1I91A 4G7AA 4Q8ZA 4Q06A 5FNKA 1RAYA 4YXIA 4L5WA 3RG4A 1G52A 1XQ0A 3HS4A 3R17B 1CNJA 4RUXA 3DCSA 1I9NA 3U47A 4Q87A 5BRWA 3QYKA 4LHIA 1KEQA 3SBIA 3TVNX 5JG5B 4ETQC 5EKJA 3GZ0A 3V3IB 5FNGA 4QSJA 3T82A 3M98A 1V9EA 2WEHA 2H15A 3SAPA 5SZ7A 1MUAA 3IEOA 3M5SA 4YGKA 4ZX1A 2FNKA 3MNAA 4YX4A 2AX2A 5FNMA 1CNCA 1CCUA 1YO2A 1OQ5A 1CA3A 1CRMA 4BF6A 4E49A 4MLTA 2NWZA 3IBLA 4M2UA 3RZ7A 3P3JA 3OYSA 3T5UA 5AMDA 1DCBA 2NWYA 2NN1A 3OY0A 5DSLA 2NWOA 4LP6A 2NNOA 4N0XB 3JXHC 3S72B 3FE4A 3PYKA 2Q1QA 3N0NA 5FLRA 5C8IA 3KOKA 1BNTA 1FSQA 5DSIA 1CIMA 2CBAA 4Q7SA 5DSQA 1G3ZA 4HBAA 1CAMA 4M2RA 3VBDA 1CNYA 3PJJA 1G1DA 2FMGA 4Z1JA 3Q31A 1OKNA 2CABA 3P44A 4IWZA 4MLXA 1DMXA 5JEPB 3T83A 3MNJA 4YYTA 2WEOA 3ML2A 1CAJA 1TEUX 1BNVA 2QOAA 1UGGA 3V2JA 5SZ0A 1BNNA 5FLQA 1I9QA 1Z9YA 3RZ1B 5JESB 3M1KA 3RYZA 3K2FA 3BL1A 1H9QA 3ZNCA 3S97A 4N16A 5EIJA 4BCWA 5AMGA 1KWQA 4JSSA 5DSMA 4WUPA 3HLJA 1HCAA 1UGCA 2NNSA 2POUA 5DSRA 1RJ6A 4HEZA 5DRSA 4R5AA 5BRUA 2X7TA 4YGLA 1CCTA 3HKUA 4GL1X 4MDLA 5FL4A 4YWPA 1AM6A 3MNHA 4HEWA 3MYQA 2CBEA 4ZX0A 1CVHA 2HKKA 3F7UA 12CAA 1YO1A 4CNVA 2NXSA 3W6HA 4Z1EA 1JD0A 4E3HA 3FFPX 5JDVB 3M5TA 2Q38A 3MNKA 1ZFKA 1RZBA 3JXFA 1KOQA 4K1QA 4QY3A 3RZ0B 4QK2A 1UGAA 1FR4A 3W6IA 4DZ9A 1FLJA 1J9WA 1Z97A 5DSPA 3T84A 1DMYA 1TBTX 4KP5A 3RZ8A 5JQTA 3KKXA 4UOVA 1UGDA 3S77B 3P4VA 1I9MA 1BNQA 3U3AX 1TE3X 5G03A 4WW8A 3NJ9A 1G6VA 4QK1A 3EFIA 4L5UA 3OILA 3DC9A 4ZWZA 1MOOA 5FLSA 3DC3A 1Z93A 3RYJB 3V3FA 5FNHA 3MDZA 1G46A 1BNMA 1G0EA 4Q7WA 1IF5A 3V2MA 4RIUA 1TEQX 4XFWA 4BF1A 4XIWA 3RJ7A 4K0TA 3P5AA 3U7CA 3B4FA 5JEGB 4QJOA 1ZSBA 1V9IC 1BNWA 5BRVA 5JGSB 2OSFA 1G4OA 2HNCA 3S78B 3PO6A 1CAIA 5A6HA 2X7SA 1CALA 3IAIA 4QTLA 1CNGA 1I9PA 2HOCA 2NWPA 3DVCA 3F8EA 5E5UA 4Q08A 3M1WA 2CBBA 3OIKA 1AZMA 2FMZA 4JSAA 1CVEA 3CAJA 1URTA 3SBHA 4E3DA 1JCZA 2EU3A 5G0BA 1I90A 1T9NA 4FRCA 5DSKA 3IBUA 5DVXA 1CVBA 3DVBA 5EHEA 6CA2A 3KLDB 3DVDA 1FQRA 1G48A 3MMFA 4Q7VA 3DCWA 3RLDA 1UGEA 4FL7A 3B1BA 3D93A 4ZWIA 1KWRA 3S76A 1F2WA 3IBNA 7CA2A 2FOSA 5CACA 3KWAA 4XIXA 3IGPA 5E2SA 3LXEA 2O4ZA 4MDGA 1FSRA 2ZNCA 4R5BA 4Q83A 4YVYA 5DOGA 1ZSCA 3OKVA 4Q07A 4K13A 1FQNA 1EOUA 3BL0A 3D9ZA 4MO8A 2AW1A 4TWMA 4HU1A 1CNWA 1H4NA 2FOVA 4RFDA 4M2VA 1LGDA 2EU2A 1HUGA 4FPTA 2FOUA 4Y0JA 5SZ4A 1DCAA 3NB5A 5FLOA 4Q0LA 3MHMA 1YDCA 3MHIA 2Q1BA 2QP6A 4RIVA 1OKLA 3DBUA 1TG9A 1G54A 5CLUA 1HECA 3DA2A 3M14A 2WEGA 4JSZA 3DD8A 1CAYA 3K7KA 3M2NA 3MNUA 4KUVA 5EHVA 2CBDA 1LG6A 1CILA 5BYIA 4FVOA 2WD2A 4X5SA 5JEHB 1LZVA 4XE1A 1CAOA 2NNGA 3KNEA 1BZMA 2NXTA 1CINA 1BICA 1TH9A 5FL6A 2POVA 3MHOA 2EZ7A 4YXUA 3ML5A 1CVAA 3OYQA 9CA2A 3DV7A 4Q9YA 5L6KA 5EZTX 4QJMA 1RZAA 3DCCA 4QEFA 3KS3A 4E3GA 1TB0X 3DAZA 1HEAA 1I9OA 1BN3A 3C7PA 1RZDA 1THKA 1TG3A 4FIKA 3L14A 3S74B 2H4NA 3KOIA 4C3TA 1YO0A 2ILIA 4Q8XA 5DSNA 3K34A 4Q81A 3N4BA 1I9LA 3ZP9A 1RAZA 1BV3A 4CACA 3RYXB 5JGTB 3V3JA 3RYVB 2FNMA 1YDDA 4L5VA 4E3FA 4Z1KA 4QJWA 1G4JA 3MWOA 4QJXA 5LMDA 4QIZA 3TVOX 1I8ZA 1CAKA 4DZ7A 3M5EA 4WL4A 4ZAOA 1LG5A 1ZH9A 4K0SA 5A25A 2VVBX 1CRAA 4R59A 5HPJA 4RUZA 2FNNA 2NNVA 3HKTA 4M2WA 5G0CA 5L3OA 2CA2A 3MZCA 1CNHA 1IF6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HFW A;  1CCS A;  1CNK A;  1XEG A;  4ITO A;  2POW A;  1BCD A;  5FLP A;  3RGE A;  4E4A A;  3T5Z A;  4Q09 A;  3CYU A;  4PYY A;  2NXR A;  4PQ7 A;  1CVC A;  1AVN A;  2WD3 A;  1LUG A;  3S73 B;  1HED A;  4KNN A;  5EHW A;  3MNI A;  3V3G B;  3HKN A;  2OSM A;  3M1Q A;  4CNR A;  5EH5 A;  4KUW A;  3M1J A;  4HF3 A;  4QSI A;  5E2R A;  3V5G A;  5DSJ A;  2FOY A;  1CVF A;  1G45 A;  2QO8 A;  5EKH A;  3NI5 A;  5FNL A;  3M2X A;  2HD6 A;  5EH7 A;  1CAZ A;  1G0F A;  5FLT A;  1HVA A;  1FSN A;  5SZ5 A;  1BNU A;  5AML A;  1HEB A;  2NN7 A;  3D8W A;  4MDM A;  1UGF A;  4KV0 A;  3RZ5 A;  4JSW A;  2FOQ A;  3M96 A;  4Q90 A;  4Q7P A;  4WW6 A;  1A42 A;  3IBI A;  5DOH A;  3HFP A;  1CNX A;  3V7X A;  3F4X A;  3OKU A;  1ZNC A;  5FNI A;  4E9O X;  1YDB A;  3EFT A;  1IF7 A;  1ZE8 A;  1YDA A;  4G0C A;  5SZ6 A;  1ZGE A;  1ZGF A;  4FU5 A;  5G01 A;  4YXO A;  4HT0 A;  4IDR X;  5FDC A;  3P3H A;  1CNI A;  4ZWY A;  2CBC A;  1G53 A;  3RYY A;  3CA2 A;  4E5Q A;  5FDI A;  3R16 A;  3N3J A;  5BNL A;  1CVD A;  1IF8 A;  3D0N A;  1UGB A;  4YGJ A; 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