3RZ1B

Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the hydrophobic wall of carbonic anhydrase
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the "hydrophobic wall" of carbonic anhydrase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3rz1B00
2CBAA 3S77B 3TVNX 3MNHA 3MZCA 3KOIA 2NXSA 4QTLA 5DSQA 4HBAA 4IDRX 4ILXA 3MHOA 1BN4A 5J8ZA 1CCUA 2NWZA 2X7SA 4XIWA 1JD0A 1TG3A 1RJ6A 5EOIA 4QSIA 1FLJA 5G0CA 5SZ0A 5SZ2A 1RAYA 3FW3A 5EKHA 1YDCA 2WEHA 3M2XA 4KV0A 1YO2A 2FW4A 3M5SA 3PJJA 3DBUA 3P5AA 4YXUA 4Q90A 3RZ8A 5BRWA 3HKUA 1CAJA 2Q1QA 3MDZA 4Y0JA 5EKMA 3MHLA 4XE1A 2Q38A 3MHCA 3IBUA 4KP8A 4KUVA 4MDGA 5EH8A 3P58A 1UGFA 4QJOA 3SAPA 7CA2A 1G53A 3CYUA 4QIZA 4CQ0A 3EFTA 5DVXA 1CAYA 1G4JA 3MNIA 1HUGA 3CA2A 3KS3A 4QK3A 3OIMA 2GD8A 3FE4A 4QSJA 2NN1A 8CA2A 4HT2A 5FLPA 5FNHA 5E28A 1CAKA 5EHVA 1I9LA 3N2PA 4LP6A 1CVDA 1IF6A 5JG5B 1CA3A 4RH2A 2WEOA 1LG5A 1FR4A 4UOVA 5BNLA 3M04A 4BF1A 1CNJA 4KUYA 3K2FA 1G6VA 1THKA 4Q07A 3UYQA 4RUXA 4ZWZA 4RN4A 4YHAA 1BNNA 1CANA 4PYXA 4Z1JA 3M14A 1Z97A 3OYQA 5EHWA 4KUWA 5FL5A 4Q87A 5E5UA 1CVAA 1CZMA 3ML2A 3LXEA 3HS4A 4ZAOA 2QP6A 1CINA 3M1QA 4E9OX 4Q6EA 4QY3A 3DA2A 4MLTA 2WD3A 4MLXA 3F4XA 1Y7WA 1BICA 3CZVA 4HF3A 5DSMA 3RYZA 3C7PA 1G0EA 5HPJA 2QO8A 1CNHA 3DC3A 4Q8XA 2FOQA 1EOUA 3R16A 4KNJA 5DOGA 1CRAA 3IBNA 1HUHA 4HEWA 2AW1A 4FIKA 2CA2A 4CNRA 1ZSCA 3MYQA 5FNLA 4Z1EA 3DCWA 5A25A 3DVDA 3W6IA 2EU2A 2HL4A 3V5GA 3V3IB 3V3JA 2NWPA 1LG6A 3V3HB 2NNOA 4XIXA 3VBDA 1XPZA 1RZBA 3OY0A 5DRSA 1HVAA 3S9TA 1V9IC 3P44A 3MNUA 3Q31A 5EH5A 5A6HA 1BV3A 3S74B 1TEUX 3BL0A 5JGSB 5G01A 3NJ9A 1DMXA 4R5AA 3F7BA 1RZDA 3N3JA 5DSPA 3S71B 4YGKA 2EU3A 1TH9A 3U3AX 3K34A 5FLRA 4G7AA 2Q1BA 4Q78A 2NMXA 1G45A 2QOAA 2ZNCA 1G4OA 3MNKA 5SZ7A 4FPTA 4Q99A 4R59A 2CABA 1G3ZA 3KIGA 3PO6A 4CA2A 4ZX0A 2HD6A 3FFPX 3RZ1B 1BN3A 5JEHB 1TB0X 4KNMA 4XFWA 1CAOA 3OYSA 1DMYA 5EIJA 4ZWIA 2F14A 5JG3B 4XZ5A 3DV7A 4R5BA 3DD8A 4CNXA 3V3FA 3TMJA 2FOYA 1FQMA 3T82A 1HEDA 4Z0QA 3S76A 1OKLA 4WL4A 3P4VA 4X5SA 4Q49A 4FRCA 3M2ZA 5E2NA 1V9EA 5FDIA 4CACA 1F2WA 1KWRA 5G03A 4YGNA 2VVAX 1TG9A 4Q0LA 1RZEA 3DC9A 3TVOX 4MDLA 2CBCA 1CAHA 1CVBA 4WW6A 4ITOA 4K0TA 4CNWA 4MTYA 3S75B 2GEHA 4E4AA 5CJFA 1G0FA 3RG4A 3SBIA 4E3HA 3M96A 3M1KA 5DSNA 5L3OA 5JESB 5FNGA 4BCWA 3M67A 4YGFA 1T9NA 1FQRA 1FSRA 4QSBA 3RYJB 1G52A 2ILIA 4YXIA 4FVOA 4N0XB 3EFIA 3IBIA 3RG3A 4YVYA 4KP5A 3JXFA 2NWYA 4Z1KA 1MUAA 1YDBA 3S78B 1YO1A 2X7UA 4JSWA 5SZ3A 4PQ7A 5C8IA 1LUGA 2WEGA 1OKMA 1CAMA 5L6KA 1TEQX 3V7XA 5DOHA 2CBEA 4Q9YA 1AZMA 4WR7A 1BNWA 1URTA 5CLUA 3MHMA 3B1BA 1CAZA 5JQTA 5EZTX 1AVNA 3ZP9A 1J9WA 1HECA 3IAIA 4N16A 4HT0A 5FLOA 3UYNA 1H9NA 3W6HA 4JSZA 4JSAA 3DCSA 1FSQA 3K7KA 2FMGA 4K0SA 4E3FA 4Q7WA 3M1JA 3HFPA 4Q83A 1CNGA 1HEBA 2NNVA 5DSLA 1ZGEA 1ZFQA 3T85A 3T5UA 4QJPA 5E2SA 3F8EA 4GL1X 5FNKA 5BRUA 1YDDA 3B4FA 4E3DA 1G46A 3P3JA 3OKUA 3HKQA 1BCDA 1I9NA 3V2JA 2EZ7A 4ETQC 2X7TA 4K1QA 1YO0A 5AMDA 5JEGB 1CNXA 4G0CA 4E3GA 1FQLA 5SZ6A 1Z93A 1LZVA 4Q08A 4Q6DA 1CALA 5E2RA 2HKKA 4YX4A 3HKNA 3U7CA 1BNTA 5IPZA 1CAIA 2ABEA 1ZE8A 3U45X 4QK1A 2OSMA 1CVFA 1JV0A 1CIMA 3KKXA 2FNKA 1BZMA 2POVA 3V3GB 1I90A 3N4BA 5G0BA 4LHIA 5CA2A 3S8XA 3D9ZA 1UGBA 3M5TA 5FNJA 4M2UA 1CILA 5E2KA 3RZ0B 4E5QA 3T83A 9CA2A 4TWLA 1CNKA 5E2MA 3SBHA 3M40A 5FL4A 5FLTA 4ZWXA 3D93A 3M3XA 3S97A 1IF7A 5FNIA 4ITPA 3RZ7A 4MDMA 3BETA 1UGAA 3MHIA 1CVCA 3S72B 3ML5A 3M98A 2HNCA 1TE3X 2CBDA 4LU3A 1KEQA 1Z9YA 1XEGA 3GZ0A 1YDAA 5EKJA 1HCBA 4Q7PA 4WUQA 1RZCA 5BRVA 3RZ5A 4KNNA 3RLDA 4YGJA 3D0NA 5FDCA 2H4NA 5JDVB 1DCBA 3HLJA 3M1WA 1HCAA 3JXHC 3IGPA 1RJ5A 3OILA 2HFWA 3IEOA 3DD0A 1G48A 1UGEA 4Q7VA 5FLQA 1KOQA 2WEJA 4COQA 4YXOA 1BNVA 1ZNCA 4K0ZA 3T5ZA 4Q06A 3MNAA 5DSIA 3NI5A 1UGCA 1UGDA 2OSFA 5DSRA 1CNWA 3IBLA 3M5EA 3RYVB 3U47A 4HU1A 1H9QA 3D8WA 3SAXA 1CCSA 4PZHA 1A42A 4QJMA 4RFDA 2O4ZA 1IF8A 3KNEA 1CNCA 5SZ5A 1CCTA 1CNBA 4QJWA 4FVNA 1KOPA 1FQNA 1G54A 5EHEA 4KNIA 3P3HA 3KLDB 3P55A 1TBTX 4QEFA 4RIVA 5DSKA 4HEYA 2W2JA 2FOVA 1LGDA 4L5UA 5FLSA 5LMDA 5JGTB 1I9QA 3KWAA 3L14A 1OQ5A 1I9OA 4RUZA 3OKVA 3OIKA 3RYYA 4QK2A 3QYKA 2VVBX 2POUA 3MNJA 4KAPA 4Z1NA 5FNMA 4QJ0A 4C3TA 1H4NA 3MMFA 1CA2A 4JSSA 2FNNA 3RJ7A 3T84A 3P5LA 1DCAA 4FL7A 3N0NA 3NB5A 1TTMA 1ZSBA 3S73B 5JQ0A 4M2VA 2AX2A 2WD2A 4HEZA 4PXXA 3RGEA 1ZFKA 3PYKA 5DSOA 1AM6A 4ZX1A 5EH7A 2NNGA 1BNMA 1RZAA 2H15A 1BN1A 5E5RA 5FL6A 4TWMA 4Q09A 4YYTA 1XEVA 4DZ9A 4PYYA 1I9PA 1XQ0A 3DAZA 1JCZA 3M2YA 1HEAA 1I8ZA 5SZ1A 1FR7A 4K13A 1RAZA 2NN7A 2NXTA 4DZ7A 3F7UA 1OKNA 1CNYA 3DVCA 4FU5A 2FOUA 1CRMA 1IF5A 3MWOA 4JS6A 4M2WA 4WUPA 4CNVA 1I9MA 2NWOA 4MO8A 2POWA 1UGGA 3DVBA 4Q7SA 3HKTA 3D92A 5AMLA 3R17B 4RUYA 4Q8ZA 4YGLA 4QSAA 1CNIA 3DCCA 3KOKA 5DSJA 1I91A 1KWQA 2FMZA 1G1DA 2NNSA 1IF4A 4QIYA 1FSNA 5SZ4A 2IT4A 1CVHA 4YWPA 1MOOA 4WW8A 4BF6A 4IWZA 3M2NA 1ZSAA 12CAA 2NXRA 3KONA 6CA2A 3CAJA 4L5VA 1BNUA 4E49A 1IF9A 1ZH9A 5AMGA 5BYIA 2FNMA 4ZWYA 1ZGFA 4M2RA 4Q81A 4Q8YA 3V2MA 4RIUA 2FOSA 1BNQA 2HOCA 1CVEA 3RYXB 4QJXA 5JEPB 2CBBA 3ZNCA 5CACA 4L5WA 4RFCA 3JXGA 3BL1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2CBA A;  3S77 B;  3TVN X;  3MNH A;  3MZC A;  3KOI A;  2NXS A;  4QTL A;  5DSQ A;  4HBA A;  4IDR X;  4ILX A;  3MHO A;  1BN4 A;  5J8Z A;  1CCU A;  2NWZ A;  2X7S A;  4XIW A;  1JD0 A;  1TG3 A;  1RJ6 A;  5EOI A;  4QSI A;  1FLJ A;  5G0C A;  5SZ0 A;  5SZ2 A;  1RAY A;  3FW3 A;  5EKH A;  1YDC A;  2WEH A;  3M2X A;  4KV0 A;  1YO2 A;  2FW4 A;  3M5S A;  3PJJ A;  3DBU A;  3P5A A;  4YXU A;  4Q90 A;  3RZ8 A;  5BRW A;  3HKU A;  1CAJ A;  2Q1Q A;  3MDZ A;  4Y0J A;  5EKM A;  3MHL A;  4XE1 A;  2Q38 A;  3MHC A;  3IBU A;  4KP8 A;  4KUV A;  4MDG A;  5EH8 A;  3P58 A;  1UGF A;  4QJO A;  3SAP A;  7CA2 A;  1G53 A;  3CYU A;  4QIZ A;  4CQ0 A;  3EFT A;  5DVX A;  1CAY A;  1G4J A;  3MNI A;  1HUG A;  3CA2 A;  3KS3 A;  4QK3 A;  3OIM A;  2GD8 A;  3FE4 A;  4QSJ A;  2NN1 A;  8CA2 A;  4HT2 A;  5FLP A;  5FNH A;  5E28 A;  1CAK A;  5EHV A;  1I9L A;  3N2P A;  4LP6 A;  1CVD A;  1IF6 A;  5JG5 B;  1CA3 A;  4RH2 A;  2WEO A;  1LG5 A;  1FR4 A;  4UOV A;  5BNL A;  3M04 A;  4BF1 A;  1CNJ A;  4KUY A;  3K2F A;  1G6V A;  1THK A;  4Q07 A;  3UYQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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