2ILIA

Refine atomic structure of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Atomic crystal and molecular dynamics simulation structures of human carbonic anhydrase II: insights into the proton transfer mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2iliA00
3IBLA 5FNGA 3M1KA 3P4VA 3D0NA 4RFCA 1MUAA 4Q90A 4E5QA 5G01A 4QJMA 2Q1QA 1OQ5A 3QYKA 4K1QA 4RUXA 2X7UA 3C7PA 2WD3A 3RGEA 5JG3B 1OKNA 4R5AA 4K0ZA 1IF6A 3KOKA 3CZVA 1G0FA 5EKMA 4R59A 3MWOA 3S78B 5FDIA 1YO2A 3RZ1B 3UYNA 4RFDA 5FLOA 3IEOA 4ILXA 4QJPA 3V3IB 1TEUX 4BF6A 4XE1A 4KNNA 1TG3A 1CRAA 1FR7A 3IBIA 3IGPA 3KWAA 2GEHA 2NNOA 3OKUA 4MDMA 5A25A 1BNTA 4M2WA 1BNUA 4XIXA 3M04A 4MLXA 4KNJA 1CILA 1UGBA 1HVAA 1BNVA 1ZE8A 4E3GA 5JESB 2FOQA 4E3FA 3U3AX 4DZ7A 4MTYA 4PXXA 2FNMA 4MO8A 2EZ7A 4N16A 3LXEA 4YGKA 5EKHA 4UOVA 3BL0A 4M2UA 1CVCA 2CABA 3OILA 4JSWA 1I9QA 1IF9A 5E2RA 1ZGEA 4FVNA 3DVCA 4R5BA 1Z9YA 3MHOA 5DVXA 3T85A 3S74B 3DD8A 5JG5B 5DSIA 1HEBA 1ZSCA 1FSNA 3JXFA 4KNIA 4HT2A 4KP8A 3SAPA 5G03A 4E3DA 2H4NA 2NWOA 3RZ7A 3KIGA 4QSJA 3KONA 1YDAA 4G7AA 1UGFA 2CBDA 3MNKA 3M1JA 5HPJA 1JV0A 4RIVA 4Q8ZA 4HF3A 5A6HA 4YHAA 3N3JA 1CNWA 3B1BA 3FE4A 3OY0A 2O4ZA 1XEVA 5SZ2A 4RH2A 1G54A 3DCWA 4ZAOA 1CNXA 4ZX0A 4CQ0A 1UGEA 3P5LA 4YXUA 4E3HA 2OSMA 5DSMA 4Z1NA 5DSJA 4YGJA 5DSLA 5FLSA 4Q7SA 5FNKA 4FU5A 3V2JA 3S72B 5SZ6A 1Y7WA 1IF5A 2AW1A 3M5EA 4E49A 1CAKA 1CA3A 5AMLA 2ZNCA 5EHEA 2QP6A 5E5RA 4Q6DA 4K13A 3UYQA 4K0SA 3JXHC 4Q6EA 3MZCA 4WL4A 3MNAA 4CNWA 4MDLA 3T83A 5BRUA 2WEHA 4QSAA 3RZ8A 1HECA 3S76A 2WEJA 4YXIA 1BNQA 4KV0A 1ZGFA 2FW4A 1G4OA 2WEOA 7CA2A 4ITOA 5IPZA 4Q81A 4Q7WA 1CAOA 3S9TA 4QJWA 2IT4A 1RZEA 4IWZA 5BNLA 3T5ZA 1F2WA 4Q83A 3V7XA 1TEQX 1IF8A 3DAZA 5C8IA 2NN1A 1RAYA 4WR7A 3MHIA 3NB5A 4QSBA 3OYSA 5DRSA 3P44A 4YGFA 3RZ0B 1HCBA 4X5SA 5JGSB 2X7SA 3Q31A 1URTA 5E2NA 5E2SA 1CINA 1H9NA 1BNWA 3CYUA 1G52A 1BN1A 4Q8YA 5FDCA 3M2XA 1G6VA 1XPZA 2NWYA 1CNIA 3MHMA 3KLDB 4LHIA 3N2PA 1HUHA 3V3JA 2CBBA 2Q1BA 3F7UA 4Y0JA 4QIYA 1AVNA 1Z93A 4Q07A 4JSSA 1H9QA 4Q08A 3RJ7A 4Q78A 1CVAA 4GL1X 3S73B 5FL6A 1H4NA 2NXTA 2W2JA 5DSPA 1HUGA 4YWPA 1UGDA 4PZHA 1OKMA 5DOGA 1DMXA 1HEDA 4ZWIA 2QOAA 1CNGA 3M2YA 5EH8A 3ZP9A 3M98A 1XQ0A 1I9NA 4L5UA 2H15A 2WD2A 3D9ZA 3MNUA 3N4BA 1CAMA 1G1DA 3CA2A 4HU1A 3F8EA 2NNVA 5DSOA 4YGNA 3HS4A 1ZSAA 3U47A 1A42A 5FL5A 1YO1A 2EU2A 3MHCA 4DZ9A 4L5VA 1CAYA 3B4FA 3V2MA 5BRWA 1I8ZA 5FL4A 1CZMA 1ZFQA 3TVOX 2NWZA 4FIKA 2FNNA 5G0BA 3IBUA 1XEGA 1CVDA 3RZ5A 3IAIA 3R16A 3ML5A 5E28A 3V3GB 1CALA 1UGAA 4YX4A 3HFPA 1CAIA 3DBUA 1HCAA 2NNSA 3P3HA 1BN4A 2F14A 2HKKA 1UGCA 4Q49A 3DC3A 1UGGA 4KUWA 4WW8A 4Z1JA 4Q0LA 4QIZA 5SZ0A 3K7KA 3OIMA 1ZFKA 1KOPA 5DSQA 1G0EA 3PO6A 4C3TA 1TE3X 5EOIA 5SZ4A 4ITPA 1G4JA 4YVYA 4KUVA 1LG6A 1RJ5A 3R17B 3MDZA 3V5GA 1BV3A 5JEPB 3K2FA 5EHWA 3DCCA 1LZVA 4Q99A 4ZWZA 4Z1KA 1G46A 1RZDA 1V9EA 2NXRA 4LU3A 4QEFA 1LGDA 4M2VA 4WUQA 1I9PA 3P5AA 3SBHA 4RUZA 3RYVB 3V3HB 4JSAA 1RAZA 4Q09A 4QJOA 3HLJA 3DD0A 2X7TA 1J9WA 3S97A 3W6HA 3P3JA 4G0CA 4TWLA 5JDVB 5FLPA 1CCTA 1FQNA 5FNIA 5EIJA 3RG3A 3DCSA 3M5TA 4Q7PA 3TMJA 3OYQA 4L5WA 3F4XA 2NWPA 1BCDA 2POUA 3V3FA 1CANA 3P55A 2FMGA 5FNHA 5JQTA 1G3ZA 4RUYA 5L3OA 4CNXA 1CAHA 3M2ZA 3OIKA 4Z0QA 1CA2A 3S71B 8CA2A 1CCUA 3RLDA 5J8ZA 1TBTX 5L6KA 1YDBA 4XIWA 2ABEA 4ZX1A 3FW3A 3SBIA 1IF7A 3L14A 3S8XA 3RYZA 4Q87A 1CNCA 3MYQA 4KP5A 3RG4A 1OKLA 4HEZA 4Q06A 4KNMA 3D8WA 3M96A 1CNHA 1KWRA 1JCZA 1V9IC 3GZ0A 1G53A 1CNKA 5JGTB 3BETA 1DMYA 1THKA 5CACA 1IF4A 1FSRA 1G48A 4CNRA 4YXOA 4COQA 3HKNA 1JD0A 4KAPA 4RIUA 1T9NA 3W6IA 3JXGA 4BCWA 1CRMA 1I9MA 5SZ1A 5DOHA 1FQMA 3SAXA 4FPTA 2OSFA 1RJ6A 1RZBA 4K0TA 4E4AA 3RYYA 3KNEA 5LMDA 3M1WA 4LP6A 1CAJA 5FNLA 1LG5A 6CA2A 4ETQC 2CA2A 1CNBA 5EHVA 2EU3A 4JSZA 1DCAA 3KKXA 1MOOA 5E2MA 4Q8XA 5DSNA 2WEGA 2FMZA 5EH5A 3DA2A 1Z97A 3U7CA 2AX2A 2POWA 2GD8A 3T84A 1YO0A 4KUYA 4N0XB 2HD6A 4PQ7A 3RYJB 4HBAA 5JQ0A 1KEQA 1LUGA 1BICA 3EFIA 3M3XA 2NMXA 5E5UA 3M2NA 3ZNCA 3MNJA 3T5UA 1I91A 1DCBA 3MNIA 4WW6A 3M40A 4HEWA 4MDGA 4QSIA 4CACA 3CAJA 2NNGA 4XZ5A 3NJ9A 3HKTA 2HNCA 4QK1A 1FR4A 5BRVA 9CA2A 3KOIA 5SZ3A 5G0CA 1FSQA 2POVA 2QO8A 4QK2A 1YDDA 5DSKA 1CCSA 5AMDA 1TTMA 4BF1A 2NN7A 3FFPX 5FNJA 1BZMA 1BNMA 4QY3A 3MNHA 3M67A 1RZAA 1HEAA 2HFWA 3OKVA 4FL7A 3MHLA 1YDCA 1KOQA 3DVBA 4CNVA 1G45A 5JEHB 12CAA 3NI5A 3VBDA 1I9OA 1CIMA 1KWQA 3BL1A 2VVAX 4IDRX 5FNMA 1RZCA 3DVDA 5EKJA 3HKQA 4ZWXA 5EH7A 3T82A 3P58A 3MMFA 5SZ7A 4FVOA 1CVEA 4HT0A 3TVNX 2FOVA 4PYYA 5CLUA 3S75B 5AMGA 3EFTA 1EOUA 3M1QA 1BNNA 4PYXA 3PJJA 1ZNCA 1TH9A 4HEYA 1CVHA 4QJ0A 3DC9A 4MLTA 4M2RA 2NXSA 5DSRA 1FQRA 4QK3A 2HOCA 3F7BA 5JEGB 4Q9YA 2VVBX 1CAZA 1ZH9A 2FOYA 4TWMA 1CNJA 3ML2A 3N0NA 1I9LA 3PYKA 3U45X 3HKUA 3K34A 1I90A 3S77B 1CNYA 1AM6A 2FOUA 4E9OX 1CVBA 4QJXA 5FLTA 5SZ5A 3RYXB 2Q38A 4JS6A 4Z1EA 2ILIA 5BYIA 1TB0X 4YGLA 5CA2A 5CJFA 3D92A 2CBAA 4WUPA 4YYTA 2CBEA 2HL4A 4Q7VA 5E2KA 2FNKA 2FOSA 3D93A 3IBNA 4CA2A 4FRCA 1FQLA 5EZTX 5FLRA 1AZMA 5FLQA 1FLJA 1TG9A 1BN3A 3M5SA 4RN4A 1ZSBA 4ZWYA 4XFWA 3M14A 3KS3A 2CBCA 1CVFA 4QTLA 3DV7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3IBL A;  5FNG A;  3M1K A;  3P4V A;  3D0N A;  4RFC A;  1MUA A;  4Q90 A;  4E5Q A;  5G01 A;  4QJM A;  2Q1Q A;  1OQ5 A;  3QYK A;  4K1Q A;  4RUX A;  2X7U A;  3C7P A;  2WD3 A;  3RGE A;  5JG3 B;  1OKN A;  4R5A A;  4K0Z A;  1IF6 A;  3KOK A;  3CZV A;  1G0F A;  5EKM A;  4R59 A;  3MWO A;  3S78 B;  5FDI A;  1YO2 A;  3RZ1 B;  3UYN A;  4RFD A;  5FLO A;  3IEO A;  4ILX A;  4QJP A;  3V3I B;  1TEU X;  4BF6 A;  4XE1 A;  4KNN A;  1TG3 A;  1CRA A;  1FR7 A;  3IBI A;  3IGP A;  3KWA A;  2GEH A;  2NNO A;  3OKU A;  4MDM A;  5A25 A;  1BNT A;  4M2W A;  1BNU A;  4XIX A;  3M04 A;  4MLX A;  4KNJ A;  1CIL A;  1UGB A;  1HVA A;  1BNV A;  1ZE8 A;  4E3G A;  5JES B;  2FOQ A;  4E3F A;  3U3A X;  4DZ7 A;  4MTY A;  4PXX A;  2FNM A;  4MO8 A;  2EZ7 A;  4N16 A;  3LXE A;  4YGK A;  5EKH A;  4UOV A;  3BL0 A;  4M2U A;  1CVC A;  2CAB A;  3OIL A;  4JSW A;  1I9Q A;  1IF9 A;  5E2R A;  1ZGE A;  4FVN A;  3DVC A;  4R5B A;  1Z9Y A;  3MHO A;  5DVX A;  3T85 A;  3S74 B;  3DD8 A;  5JG5 B;  5DSI A;  1HEB A;  1ZSC A;  1FSN A;  3JXF A;  4KNI A;  4HT2 A; 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