1CAOA

Crystallographic studies of the binding of protonated and unprotonated inhibitors to carbonic anhydrase using hydrogen sulphide and nitrate anions
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystallographic studies of the binding of protonated and unprotonated inhibitors to carbonic anhydrase using hydrogen sulphide and nitrate anions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 259
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1caoA00
4RUZA 1MOOA 5FNKA 3M2NA 1XEVA 4C3TA 4TWMA 1G6VA 4KNNA 4Q08A 1CNIA 4L5VA 12CAA 3V3IB 3RGEA 3F4XA 3MHIA 4ETQC 1OKNA 3M1WA 1IF8A 2O4ZA 2HFWA 1TE3X 3P58A 4Q81A 2W2JA 5E5UA 4HEYA 5DOHA 3CA2A 3RZ8A 1CRAA 4Q06A 3K34A 2FW4A 5E28A 5JGTB 2NXTA 4Z1NA 2Q38A 1I9MA 2FOVA 2POVA 1UGGA 3CZVA 4MLTA 1YDBA 4WUPA 4DZ7A 3P4VA 5JEGB 3F7BA 4QJ0A 1JD0A 3CAJA 2NWZA 2NXSA 4PQ7A 1CAZA 4N0XB 4PZHA 2POUA 1I9PA 3EFIA 4ZWYA 3DBUA 4MDMA 4Q7WA 3S73B 1CNYA 1CNGA 5AMLA 4QIZA 1JV0A 3V3HB 3K2FA 3P3HA 3DVCA 1Y7WA 5EH5A 1XQ0A 5FLQA 6CA2A 4UOVA 1CVCA 3TVNX 3QYKA 5FL6A 1G4JA 3MNUA 4FRCA 1THKA 2POWA 1I9NA 5LMDA 3MHCA 3SBHA 4HT0A 1CNCA 1FSQA 1IF4A 4JSWA 5FL5A 3MZCA 5EHWA 3RYVB 1TTMA 3PYKA 1BCDA 4YX4A 2CBDA 1CNHA 1UGAA 3DCSA 5DSPA 3HLJA 3S75B 2HL4A 5A6HA 3MNHA 1RZBA 4CNXA 1CAKA 3MNKA 4YGJA 3EFTA 4Z0QA 4HEZA 3OIKA 1OKLA 3RZ7A 5SZ7A 1BNUA 2ILIA 5AMDA 2FNNA 3M2XA 4M2WA 1CAOA 3DVDA 1CINA 1FR7A 1V9IC 1T9NA 5FL4A 4QJXA 2WEJA 3UYNA 3W6HA 4QSJA 2EU3A 4QK3A 3RJ7A 5A25A 3MNJA 3D92A 4Q09A 1CVAA 1BNMA 4CACA 1I8ZA 2HD6A 3PO6A 3RZ1B 3T5ZA 3IBUA 3S9TA 5JDVB 1HUGA 4JSSA 4Q83A 7CA2A 1I9OA 3S74B 1JCZA 4YWPA 4Q49A 5EHVA 1OQ5A 4XZ5A 5DSJA 1BV3A 5AMGA 3N4BA 4CNRA 4BF6A 5CA2A 4Q7VA 1BNQA 2Q1QA 3GZ0A 4ZAOA 1TB0X 5JEHB 3MYQA 2HNCA 2NMXA 4CA2A 3KLDB 1HVAA 3KNEA 1HEDA 1BN3A 5L6KA 3OIMA 1ZSBA 1CA2A 3RZ0B 1YO0A 2OSFA 4M2RA 3RLDA 4E3HA 4K0TA 1DMXA 1TEQX 4PYYA 4Q6EA 4WW6A 5HPJA 4Q7PA 3KIGA 3M2ZA 4Q7SA 3OYSA 2FMZA 2AW1A 2FOQA 4M2UA 1XPZA 4RUYA 1OKMA 3P44A 4WUQA 1RAZA 4JS6A 3U45X 5FLRA 2NNVA 4HBAA 2GD8A 5DOGA 1A42A 3M98A 5BRWA 2CABA 5DSKA 3S71B 4LU3A 3DCWA 4Z1KA 3M5SA 1G48A 4HU1A 2FOYA 1RJ5A 3D8WA 4CNVA 3RG4A 2QOAA 3KWAA 4ZX0A 4M2VA 4Q90A 4MDLA 3K7KA 3IBIA 4K13A 3OKVA 3T82A 1YO1A 5JQTA 3R16A 3T5UA 3TMJA 3ML5A 3M1QA 4MDGA 3ZP9A 3JXFA 3MNAA 4FVNA 3SAXA 3BL1A 1YDAA 4X5SA 1CNKA 3TVOX 1UGBA 4QJOA 5JG5B 4R5BA 4ILXA 4WL4A 3HS4A 1KOQA 5G01A 1HCBA 1UGEA 1RZAA 1ZSAA 5FNGA 5DRSA 1AZMA 3V7XA 2CBEA 4CNWA 3ZNCA 1G3ZA 1CAMA 3KOKA 5G03A 1G54A 2X7TA 2HKKA 5CACA 2VVBX 3FFPX 4COQA 1G45A 4KV0A 4WR7A 3N3JA 2X7SA 5E2MA 1ZFKA 2NNSA 8CA2A 1UGCA 4QJPA 1EOUA 1LZVA 5DSMA 1TH9A 3U47A 4YGLA 4QIYA 3JXHC 4JSAA 2H4NA 4Q0LA 3OKUA 4KP8A 1CVHA 1CVEA 4KNIA 4LP6A 3L14A 1LG5A 4RUXA 1G0EA 5FDIA 5EKHA 4E3DA 5EIJA 1H4NA 3KONA 3RYJB 1J9WA 5SZ0A 1XEGA 4PYXA 1ZE8A 3MMFA 3U7CA 3CYUA 3M2YA 2OSMA 5BNLA 4MO8A 5JQ0A 3ML2A 5FLSA 2FNMA 3M5TA 2NXRA 4Q78A 1CA3A 3M3XA 5FNHA 3RZ5A 5SZ2A 5SZ1A 3V2JA 3T84A 3VBDA 1DCAA 3PJJA 4ZX1A 4IWZA 5BRVA 1CILA 5E2RA 1I91A 4R59A 1ZNCA 2WEGA 3RYXB 3W6IA 4ITOA 3RG3A 2NWOA 3IGPA 5DSRA 2GEHA 4TWLA 3N2PA 3D93A 3V5GA 3DD8A 5EHEA 1KOPA 2NNOA 3F8EA 1FR4A 5DSLA 1G0FA 5FNLA 4FPTA 5DSNA 1CCSA 3M14A 4KNJA 4KP5A 4XIXA 1CNJA 4QK1A 5BYIA 1CIMA 4WW8A 1BNVA 3V2MA 3UYQA 3N0NA 3S97A 4DZ9A 4FVOA 3HKTA 1V9EA 5IPZA 3JXGA 4QSAA 2WEHA 1HECA 4E9OX 5EZTX 5G0BA 2ZNCA 3P5LA 1BNTA 1DCBA 1RZEA 1KWRA 3S72B 5DSQA 2QO8A 4L5WA 3OY0A 2WD3A 1FQRA 4YGFA 4YGNA 1Z9YA 2F14A 1TG9A 4PXXA 3V3JA 5J8ZA 2EZ7A 3KOIA 4LHIA 1FQNA 1UGFA 4YXIA 4ZWZA 4KAPA 3DC9A 4Q87A 1FLJA 1RZDA 5JESB 5FNIA 4IDRX 2CBBA 2CBCA 3DV7A 3OILA 3MHMA 1FSRA 4R5AA 4ZWIA 1RZCA 4ZWXA 3C7PA 1CRMA 3IBNA 3S8XA 4KUWA 2H15A 3SAPA 4HT2A 9CA2A 1AVNA 1TBTX 4QSIA 1ZSCA 3BL0A 3DCCA 2HOCA 3Q31A 1G46A 1YDCA 3T83A 3RYYA 1I9QA 1CCTA 5JEPB 5C8IA 5JG3B 3F7UA 5DSOA 3FW3A 4BCWA 5SZ3A 1CNXA 3M40A 4MLXA 3V3GB 2WD2A 1IF6A 3RYZA 4QY3A 4Y0JA 5FNMA 1CANA 5CLUA 1G1DA 4ITPA 1YDDA 4E3GA 3P5AA 2AX2A 4YXUA 3MWOA 3NB5A 5EOIA 1CNWA 2FOSA 3M04A 2EU2A 3KS3A 1G4OA 1HUHA 1RJ6A 3IBLA 4KNMA 1CNBA 2NN7A 1IF5A 5DSIA 4BF1A 2WEOA 3DA2A 4E4AA 1UGDA 4RFDA 4YVYA 2FNKA 4GL1X 4QEFA 3MNIA 4K0ZA 3BETA 3D0NA 1FSNA 1HEBA 3MHLA 4HEWA 4YGKA 3S77B 1CAYA 5L3OA 4N16A 2NN1A 1TG3A 4Q9YA 5CJFA 1CALA 1FQMA 2X7UA 5E5RA 4RN4A 4FU5A 3NI5A 5EKMA 1YO2A 3U3AX 4Z1EA 4Q8YA 4G7AA 2VVAX 4RFCA 4KUVA 5EKJA 1HEAA 3HKQA 3M1KA 5E2SA 4JSZA 1BN4A 1LG6A 5EH8A 1FQLA 3S76A 1CVBA 2CA2A 1ZFQA 5FLPA 1CVFA 1BNNA 3SBIA 1F2WA 3B1BA 3M1JA 3HKNA 3FE4A 4XFWA 2FOUA 5EH7A 3T85A 4CQ0A 4Z1JA 4FL7A 1CCUA 1IF9A 4E3FA 2CBAA 3P3JA 4Q07A 4HF3A 4QJWA 1AM6A 1CZMA 2Q1BA 2FMGA 5E2NA 4QSBA 5FDCA 3B4FA 4YYTA 2IT4A 5FLOA 4YXOA 4QJMA 4Q6DA 1H9QA 1KEQA 4E49A 4K1QA 4RIUA 4L5UA 3R17B 5BRUA 2ABEA 3S78B 3M5EA 5E2KA 1CAJA 4G0CA 1ZGEA 3IAIA 1H9NA 4QTLA 5FNJA 5G0CA 1RAYA 3D9ZA 4RIVA 3HFPA 4Q99A 1BICA 1CAHA 3MDZA 3V3FA 4Q8ZA 1HCAA 1URTA 3MHOA 1MUAA 3OYQA 1G52A 3M67A 1IF7A 1Z93A 2QP6A 5JGSB 5SZ6A 1I90A 4YHAA 1KWQA 3DAZA 5SZ4A 5FLTA 1CAIA 2NWPA 3M96A 1G53A 1DMYA 3DD0A 1LGDA 1CVDA 3NJ9A 3IEOA 3LXEA 1BNWA 1I9LA 4XE1A 1BN1A 1Z97A 1LUGA 2NWYA 1BZMA 3P55A 3HKUA 5DVXA 5SZ5A 3KKXA 4E5QA 3DC3A 1ZH9A 2NNGA 4FIKA 4RH2A 1TEUX 4KUYA 3DVBA 4Q8XA 4QK2A 4K0SA 4MTYA 4XIWA 1ZGFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RUZ A;  1MOO A;  5FNK A;  3M2N A;  1XEV A;  4C3T A;  4TWM A;  1G6V A;  4KNN A;  4Q08 A;  1CNI A;  4L5V A;  12CA A;  3V3I B;  3RGE A;  3F4X A;  3MHI A;  4ETQ C;  1OKN A;  3M1W A;  1IF8 A;  2O4Z A;  2HFW A;  1TE3 X;  3P58 A;  4Q81 A;  2W2J A;  5E5U A;  4HEY A;  5DOH A;  3CA2 A;  3RZ8 A;  1CRA A;  4Q06 A;  3K34 A;  2FW4 A;  5E28 A;  5JGT B;  2NXT A;  4Z1N A;  2Q38 A;  1I9M A;  2FOV A;  2POV A;  1UGG A;  3CZV A;  4MLT A;  1YDB A;  4WUP A;  4DZ7 A;  3P4V A;  5JEG B;  3F7B A;  4QJ0 A;  1JD0 A;  3CAJ A;  2NWZ A;  2NXS A;  4PQ7 A;  1CAZ A;  4N0X B;  4PZH A;  2POU A;  1I9P A;  3EFI A;  4ZWY A;  3DBU A;  4MDM A;  4Q7W A;  3S73 B;  1CNY A;  1CNG A;  5AML A;  4QIZ A;  1JV0 A;  3V3H B;  3K2F A;  3P3H A;  3DVC A;  1Y7W A;  5EH5 A;  1XQ0 A;  5FLQ A;  6CA2 A;  4UOV A;  1CVC A;  3TVN X;  3QYK A;  5FL6 A;  1G4J A;  3MNU A;  4FRC A;  1THK A;  2POW A;  1I9N A;  5LMD A;  3MHC A;  3SBH A;  4HT0 A;  1CNC A;  1FSQ A;  1IF4 A;  4JSW A;  5FL5 A;  3MZC A;  5EHW A;  3RYV B;  1TTM A;  3PYK A;  1BCD A;  4YX4 A;  2CBD A; 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