1CNHA

X-ray crystallographic studies of engineered hydrogen bond networks in a protein-zinc binding site
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIEFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title X-Ray Crystallographic Studies of Engineered Hydrogen Bond Networks in a Protein-Zinc Binding Site
pubmed rcsb
molecule tags Lyase (oxo-acid)
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cnhA00
5FDIA 3PYKA 1IF4A 3MYQA 4IDRX 1IF6A 3HKUA 3OKUA 1CNHA 3TVNX 3ZP9A 5JQ0A 1HCBA 4FL7A 5DSRA 2X7TA 3M14A 5EKHA 3TMJA 4LHIA 2H4NA 1THKA 2WEJA 4K13A 5JGSB 3MMFA 1MOOA 4QK3A 3GZ0A 2AW1A 1I90A 5FL5A 1TH9A 1RAYA 1G45A 3C7PA 3BL0A 1Z97A 2VVAX 4DZ7A 5BYIA 12CAA 4JS6A 1CVBA 4Q78A 3SAXA 1CNBA 4FIKA 4MLTA 3NB5A 1G53A 1IF9A 4QY3A 3KKXA 3S75B 4PXXA 4L5VA 1FSRA 3NJ9A 4FVOA 4Q6DA 1CCUA 1BN4A 3MHMA 3S97A 1CAHA 1HCAA 1IF7A 1H9QA 1J9WA 3D93A 1JV0A 5FNHA 4QK1A 3IBLA 3M5TA 3V3FA 3HLJA 1TG9A 4YWPA 1G1DA 4K0TA 5BNLA 4YHAA 3V3HB 4HF3A 1CZMA 1FSNA 4Q7WA 3LXEA 3V3IB 2QO8A 1CIMA 3JXFA 3PJJA 1CRAA 1OKLA 5FLPA 1RZBA 1HVAA 5DSQA 6CA2A 3T5ZA 2FMZA 4UOVA 4E4AA 3ML2A 4JSWA 3HS4A 4Q90A 3OY0A 5JEGB 1CNYA 1KWQA 1DMYA 4R5BA 3DVCA 1XQ0A 4RUZA 3S78B 4QJWA 4ITOA 2X7UA 4KAPA 2AX2A 4MO8A 3S76A 5EHEA 4YGLA 1CAOA 1H9NA 4YXOA 2WEOA 1G0EA 4L5WA 4Q8YA 2FOYA 1KOPA 4XZ5A 2FW4A 3T83A 5DSJA 3DCSA 2FMGA 3P44A 3S77B 1BCDA 4E9OX 1UGFA 1ZSAA 1TG3A 1I9NA 2X7SA 4PYXA 4HT2A 5SZ3A 2WEHA 4QJMA 5SZ6A 3MWOA 2CBBA 3R17B 5A6HA 4FPTA 2ZNCA 3DVBA 1CVFA 4MDGA 1OKNA 4QK2A 4M2UA 3BL1A 2EU2A 4R5AA 5JQTA 3MNKA 1XPZA 5EH5A 1RZCA 3RLDA 3M1JA 2HOCA 2FNNA 1I9QA 2NN7A 5IPZA 3RG4A 2FOQA 1ZSBA 3S72B 1H4NA 2F14A 5DVXA 1HUHA 1RZEA 4CNVA 3U7CA 4RIVA 5J8ZA 1JD0A 4Y0JA 1LGDA 5EHWA 3FW3A 3KS3A 4ZX0A 3IBIA 5DRSA 3SBHA 5SZ2A 4WUPA 3MNAA 1I91A 3DC3A 1FQLA 1G54A 5EZTX 3P3JA 1UGGA 4QSAA 5CACA 4Q8XA 3K7KA 4QIYA 4ETQC 2CBEA 1I9PA 4Q81A 3HKQA 3N3JA 4M2VA 4R59A 5FLTA 2FOUA 2QP6A 3IAIA 4QJOA 5EOIA 3M2XA 4CNXA 2FNKA 4HT0A 1OQ5A 4RN4A 4IWZA 4QJXA 4E49A 2H15A 4TWMA 5SZ1A 3DCCA 2OSMA 4KV0A 2Q1BA 3M04A 3T82A 4KUYA 3RZ7A 1DMXA 4YGKA 1BNNA 1CAIA 4RH2A 5DSKA 3IGPA 2HD6A 4WL4A 5AMDA 2NWZA 4PQ7A 2VVBX 4FU5A 2NXRA 3F8EA 1UGCA 4E5QA 1EOUA 3SBIA 3OIKA 1CNWA 2CA2A 4X5SA 3DVDA 5CLUA 5FNLA 5FL6A 4Q87A 2FNMA 5FDCA 3CYUA 3KIGA 1MUAA 4QJPA 1BV3A 1KEQA 4JSZA 3S73B 3HKNA 1IF8A 3N4BA 3OYSA 5JEHB 3V2MA 1CAZA 5FLQA 1CRMA 1CCTA 2GD8A 3M3XA 4FRCA 1TB0X 3N2PA 4YGNA 4CQ0A 5CA2A 4RFCA 1CAJA 3B4FA 1RZDA 4BCWA 3V3JA 4MDLA 2IT4A 5FLOA 3RG3A 1YO1A 3OYQA 1TEQX 5EH8A 1XEGA 1YDAA 4RUYA 4QTLA 3V7XA 9CA2A 5SZ7A 5DOGA 3T85A 3Q31A 5JEPB 1BN3A 5G01A 4Q08A 5DSPA 3M1QA 3RYVB 1G46A 1Y7WA 2QOAA 1YO2A 2CBDA 3W6HA 3M96A 4XIXA 5FNKA 3K2FA 3N0NA 2POUA 2NXTA 4K1QA 1AZMA 4Q7SA 1RJ6A 2EU3A 4PZHA 5A25A 4ZWXA 4CNRA 3RJ7A 3MNJA 3PO6A 1RAZA 4HU1A 3DAZA 2O4ZA 2NNOA 5L6KA 2GEHA 3VBDA 2EZ7A 1ZNCA 3RYJB 2CBAA 3P3HA 5E2RA 4Q7VA 4YGJA 3P58A 4RUXA 5EKMA 3ZNCA 3UYNA 5AMGA 1FLJA 5LMDA 4ZWYA 1ZE8A 1ZFKA 1BNUA 4CNWA 4KUWA 1HEDA 4QEFA 4MLXA 4YX4A 2NN1A 2NNSA 1CVHA 2OSFA 4Q7PA 5EHVA 4Z1JA 3RZ0B 5DSLA 3V3GB 4E3DA 1G48A 4ITPA 5SZ4A 5CJFA 5SZ5A 1YDDA 3FFPX 1DCBA 5DSNA 3KLDB 1CCSA 1JCZA 4Q9YA 3HFPA 1UGAA 2W2JA 3KOKA 3M1WA 4COQA 1TBTX 3RGEA 1BNTA 1HECA 3K34A 5G0CA 1CVEA 1CNJA 2HKKA 1ZGFA 1V9IC 4MTYA 1ZH9A 4Q09A 3KOIA 1BN1A 4KNJA 3B1BA 1G4OA 3OKVA 1DCAA 1CNGA 1ZFQA 4Z0QA 3L14A 4E3HA 2WEGA 3W6IA 1CAYA 3M2YA 5JG5B 1BNMA 3MZCA 5DSIA 4MDMA 2NNGA 3P4VA 4QSBA 5DSOA 1UGDA 5EIJA 1HEBA 3FE4A 4BF1A 2NWYA 5SZ0A 4Q49A 3MHCA 8CA2A 3NI5A 3HKTA 4Q06A 3S9TA 2CABA 1UGBA 2NNVA 2FOVA 5JDVB 4WR7A 1G0FA 4Z1KA 4KNIA 5FLSA 4YGFA 2WD3A 5E2NA 3DD0A 4XFWA 4ZWZA 1ZGEA 1CNKA 1YO0A 3M5SA 3OIMA 3P5LA 3M40A 2Q38A 3CAJA 3M98A 3M67A 4TWLA 4RIUA 5JGTB 3DBUA 1AVNA 3MHIA 4M2WA 5FL4A 3S71B 3T5UA 1F2WA 4HBAA 1RJ5A 4KP8A 5FLRA 4N16A 5JESB 3F7BA 3UYQA 1I9MA 2HFWA 5E5RA 3P5AA 1TTMA 3DD8A 5L3OA 4JSSA 4YXIA 4KNMA 4CA2A 3TVOX 4KNNA 5DOHA 4BF6A 1FSQA 1CALA 4PYYA 5EH7A 3MNIA 1URTA 3IBUA 3S74B 3IBNA 4XE1A 2Q1QA 3M5EA 1CAKA 2FOSA 4WW6A 3U3AX 3V2JA 1CANA 5BRWA 1G4JA 5E2SA 1LG5A 2NMXA 3ML5A 1CINA 5HPJA 1CVDA 1G52A 5AMLA 1RZAA 3JXGA 1I9OA 1CA3A 1LZVA 3BETA 4ZAOA 2WD2A 4XIWA 1BICA 5E2KA 3DV7A 3T84A 4JSAA 3KONA 4Q0LA 3DC9A 5FNMA 4QIZA 4LP6A 3MHLA 4QSJA 4Q99A 3DA2A 3SAPA 1CNIA 1OKMA 1I8ZA 4Q6EA 5DSMA 1G6VA 3M2NA 3RYZA 5BRUA 3D0NA 3M2ZA 3R16A 3RYXB 4FVNA 4QJ0A 3V5GA 3D92A 4QSIA 3MDZA 1YDBA 5BRVA 4YXUA 2POWA 7CA2A 4ILXA 1Z93A 2NWOA 1LUGA 1BNWA 5FNGA 4YYTA 1HEAA 1CNCA 1TEUX 3DCWA 3KWAA 4L5UA 1CAMA 3P55A 4GL1X 4K0ZA 4Q8ZA 4ZX1A 4Q07A 4Z1EA 1FR7A 2ABEA 3M1KA 4Z1NA 4HEZA 1FQRA 3RZ5A 2NWPA 3CZVA 1Z9YA 2NXSA 2HL4A 4LU3A 4WW8A 4G7AA 3D9ZA 4E3FA 4CACA 2ILIA 1G3ZA 3OILA 2HNCA 1BNQA 1I9LA 5C8IA 3EFIA 1TE3X 4RFDA 1XEVA 3MNHA 5FNIA 1FR4A 3F4XA 3RZ8A 4E3GA 3IEOA 3MNUA 1BNVA 4K0SA 3QYKA 1A42A 5JG3B 3MHOA 2CBCA 1CNXA 5E5UA 1CILA 4HEYA 1UGEA 1AM6A 1CVAA 1CVCA 4G0CA 4YVYA 5FNJA 4KP5A 4Q83A 1T9NA 1HUGA 5E28A 5G0BA 1FQNA 1BZMA 3U47A 1YDCA 1FQMA 1KWRA 4WUQA 2POVA 4DZ9A 3S8XA 3F7UA 1CA2A 5E2MA 4N0XB 3D8WA 5EKJA 3EFTA 3RZ1B 4ZWIA 1V9EA 1KOQA 3KNEA 3U45X 1LG6A 1IF5A 5G03A 4C3TA 4HEWA 1ZSCA 3CA2A 4KUVA 3RYYA 3JXHC 4M2RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5FDI A;  3PYK A;  1IF4 A;  3MYQ A;  4IDR X;  1IF6 A;  3HKU A;  3OKU A;  1CNH A;  3TVN X;  3ZP9 A;  5JQ0 A;  1HCB A;  4FL7 A;  5DSR A;  2X7T A;  3M14 A;  5EKH A;  3TMJ A;  4LHI A;  2H4N A;  1THK A;  2WEJ A;  4K13 A;  5JGS B;  3MMF A;  1MOO A;  4QK3 A;  3GZ0 A;  2AW1 A;  1I90 A;  5FL5 A;  1TH9 A;  1RAY A;  1G45 A;  3C7P A;  3BL0 A;  1Z97 A;  2VVA X;  4DZ7 A;  5BYI A;  12CA A;  4JS6 A;  1CVB A;  4Q78 A;  3SAX A;  1CNB A;  4FIK A;  4MLT A;  3NB5 A;  1G53 A;  1IF9 A;  4QY3 A;  3KKX A;  3S75 B;  4PXX A;  4L5V A;  1FSR A;  3NJ9 A;  4FVO A;  4Q6D A;  1CCU A;  1BN4 A;  3MHM A;  3S97 A;  1CAH A;  1HCA A;  1IF7 A;  1H9Q A;  1J9W A;  3D93 A;  1JV0 A;  5FNH A;  4QK1 A;  3IBL A;  3M5T A;  3V3F A;  3HLJ A;  1TG9 A;  4YWP A;  1G1D A;  4K0T A;  5BNL A;  4YHA A;  3V3H B;  4HF3 A;  1CZM A;  1FSN A;  4Q7W A;  3LXE A;  3V3I B;  2QO8 A;  1CIM A;  3JXF A;  3PJJ A;  1CRA A;  1OKL A;  5FLP A;  1RZB A;  1HVA A;  5DSQ A;  6CA2 A;  3T5Z A;  2FMZ A;  4UOV A;  4E4A A;  3ML2 A;  4JSW A;  3HS4 A;  4Q90 A;  3OY0 A;  5JEG B; 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