1CNHA

X-ray crystallographic studies of engineered hydrogen bond networks in a protein-zinc binding site
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIEFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title X-Ray Crystallographic Studies of Engineered Hydrogen Bond Networks in a Protein-Zinc Binding Site
pubmed rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase (oxo-acid)
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cnhA00
4KNIA 2QP6A 2Q38A 5IPZA 4E49A 1T9NA 4X5SA 1A42A 1BN1A 2NNSA 1TEUX 3RGEA 4ZWIA 4G7AA 4JSAA 1G53A 1TH9A 3C7PA 4R5AA 4M2VA 3DD0A 1CCSA 4HF3A 3JXGA 1KOQA 2WEHA 3RZ7A 1H4NA 5DSKA 1DMXA 4YXIA 3TVOX 3M1JA 4MDMA 2W2JA 2NWYA 1CAKA 2ABEA 4TWLA 4YHAA 2CA2A 3M1WA 5EHVA 1BNNA 3S9TA 4BF1A 1OKLA 4Q7VA 4YGLA 5DSRA 2POWA 4KUVA 5AMDA 3HLJA 1CVBA 4QJXA 3MNUA 4PYXA 1MUAA 1JD0A 5BRWA 3M5SA 4E3DA 3S72B 3T83A 4HT2A 1XEGA 3K2FA 4Q99A 3S76A 4GL1X 3W6HA 5DVXA 5BRUA 4CNRA 2HL4A 4K1QA 4YGFA 4M2WA 4QSIA 1KEQA 4YVYA 4Q7PA 3V2JA 4PQ7A 1CIMA 3P44A 1CNCA 1ZH9A 3RZ8A 3DC3A 1G48A 1RJ6A 9CA2A 1UGAA 5LMDA 3HS4A 4QJPA 5FNIA 2Q1BA 3T85A 3FFPX 1BNVA 4TWMA 1G0FA 1AZMA 4ZX1A 4Z1JA 1TG3A 3HKTA 2X7UA 5A6HA 1CVEA 1CAMA 4E5QA 5BNLA 4Q6EA 4XE1A 5E2RA 3M3XA 1CNYA 1YDDA 1G1DA 4QY3A 5E5RA 3OIMA 1BN3A 4ITPA 3KS3A 4FIKA 4K0ZA 3MNIA 1ZFQA 5E5UA 4YX4A 1H9NA 1HUGA 2VVAX 1CRAA 3KKXA 1CAJA 5EHWA 4ILXA 5E2NA 4YGNA 2POVA 1CNJA 3KLDB 1G3ZA 1TBTX 2VVBX 3D9ZA 1TB0X 1CNGA 5G0CA 6CA2A 2CBEA 3DD8A 1KOPA 1TG9A 5FL5A 3IAIA 1YDBA 4JSZA 3SAPA 2ZNCA 3M98A 2CBCA 3S74B 3MNJA 5BYIA 3MYQA 1UGGA 3VBDA 1G0EA 3F7UA 1LUGA 3P3JA 2FMGA 4PYYA 4ZWXA 4Z0QA 1LG6A 3M04A 2X7TA 3JXHC 3M67A 2X7SA 1CNWA 4ZX0A 2WEGA 5HPJA 5DSMA 3R16A 3HKQA 1HUHA 3MNAA 3DCSA 3OKVA 4N16A 1I9NA 1YDAA 3D8WA 1BNUA 3M5EA 4KP8A 2IT4A 4QK1A 1TE3X 4QJWA 3P5LA 5FLPA 5JDVB 1CRMA 5G03A 4QTLA 1G6VA 1ZFKA 3S73B 4FVNA 4XIWA 5DSJA 1IF5A 4FRCA 4ITOA 3S77B 4HEYA 1FQLA 5JGSB 5E28A 3T5UA 12CAA 1HCBA 3CYUA 2NWOA 4JS6A 2CBBA 1RJ5A 1CAYA 3KIGA 4Q7SA 4QIZA 4RUXA 2Q1QA 1CILA 1Z93A 3M2ZA 4RUYA 3RYYA 1FLJA 4CQ0A 1FQRA 4Q6DA 4QJMA 1RZAA 1CVAA 1BNMA 3T84A 2WD2A 4KUYA 5SZ4A 3IEOA 3QYKA 4FL7A 3K34A 1UGBA 5SZ6A 4XIXA 4UOVA 1G4OA 1ZNCA 1ZSBA 4L5UA 1ZGEA 3R17B 4HEWA 4R5BA 3MMFA 1CVHA 3DAZA 4HU1A 4KAPA 5BRVA 1CNBA 4N0XB 3SAXA 4CNVA 4Q08A 4Q87A 2NMXA 1BN4A 1HEDA 1IF7A 1MOOA 3KWAA 5EIJA 4M2RA 1YO1A 4LU3A 4MDGA 3RG3A 4ETQC 4KP5A 3TMJA 4Q9YA 2H15A 4WUQA 5AMLA 3MHLA 3S97A 1G45A 3OILA 4E3FA 5L3OA 2FNKA 1UGFA 5FLSA 3OKUA 1FSRA 1LG5A 3MNKA 1CVDA 3UYNA 1CA2A 1I9MA 3RG4A 8CA2A 3OIKA 4WR7A 4K0TA 5FLQA 3RYJB 3OY0A 3N4BA 4E4AA 3P5AA 3RYXB 4YGJA 4QK3A 5JESB 3M14A 5JQ0A 4E9OX 4KNMA 5DSQA 1CAIA 3B4FA 5FNKA 4L5VA 1G52A 1BNQA 4QK2A 5DRSA 4KNJA 5DSOA 4QSBA 1DCBA 3DVDA 4C3TA 5A25A 2FW4A 1BZMA 4YYTA 1YO2A 3M2YA 1YO0A 4RH2A 1CNIA 1KWRA 4Q81A 1BNWA 4Q8XA 1RAZA 3EFTA 5CACA 3S75B 1JV0A 1ZSCA 2HNCA 5EH7A 4Q0LA 5C8IA 4HEZA 1IF9A 3DBUA 2EU2A 5E2KA 3DVCA 2FOVA 1HEAA 5FL4A 4WUPA 4FPTA 2WEOA 3PO6A 1IF6A 3PJJA 3KNEA 4XFWA 3OYQA 3ZNCA 3RZ0B 3Q31A 5SZ3A 5E2SA 4Q49A 3SBIA 1EOUA 1CZMA 1BV3A 5EH8A 1I9QA 1AVNA 3F7BA 4DZ7A 3MZCA 3U45X 4Z1EA 1Y7WA 5SZ5A 2NXRA 3CAJA 3IBNA 3MWOA 1RZEA 1THKA 2FOQA 4LHIA 3PYKA 3V3FA 1CINA 2OSMA 3KOIA 4LP6A 3S71B 3OYSA 2H4NA 1FSQA 1UGEA 5FDIA 5DSNA 3V5GA 5FNHA 1XQ0A 4XZ5A 1KWQA 3U47A 5SZ7A 1CA3A 3SBHA 3TVNX 4CNWA 4RFDA 3CA2A 4HBAA 2NWPA 4M2UA 3IGPA 5CLUA 3V7XA 1BICA 4Q7WA 3MDZA 2NXSA 4IWZA 4Q09A 5G01A 2QOAA 2FOYA 3MNHA 3RZ5A 3RYZA 3MHIA 5FLTA 1UGCA 5DSIA 5JGTB 4MDLA 2FOSA 3W6IA 1FQMA 3RZ1B 3S8XA 3V3GB 1G54A 3IBLA 4KV0A 5FNMA 2FOUA 3JXFA 5SZ2A 4FVOA 1I9PA 3DV7A 4RFCA 1OKMA 3BL1A 5JG3B 1TTMA 3T5ZA 5AMGA 1F2WA 3D0NA 3M5TA 4ZWZA 1V9EA 5FNGA 4Z1NA 2O4ZA 1JCZA 3U7CA 1XEVA 1YDCA 1I91A 1H9QA 1ZSAA 3K7KA 2NNOA 4KNNA 3B1BA 4WW8A 4JSWA 3P3HA 3N0NA 1HECA 5EOIA 4CACA 4ZWYA 3P58A 3FE4A 4YGKA 4RUZA 1FQNA 5EKHA 1CNHA 1J9WA 4YWPA 2QO8A 4BCWA 1RZCA 2CBAA 5DSLA 3DCWA 1DMYA 5L6KA 4E3GA 1CNXA 3MHCA 4E3HA 5CJFA 1CAHA 5JQTA 3F4XA 4JSSA 4BF6A 2HOCA 2ILIA 1BCDA 2CABA 5EKJA 1RZDA 2NNVA 3ML2A 4RIVA 4WL4A 1V9IC 2HKKA 3RLDA 1UGDA 1I9LA 3BL0A 1Z97A 3IBUA 1CALA 3GZ0A 4PXXA 3V3IB 4R59A 7CA2A 1CNKA 2NWZA 1FR7A 3NB5A 4Q90A 3FW3A 5EZTX 4Q8ZA 3M2NA 1Z9YA 4MLTA 5FL6A 1HEBA 2NN1A 3V3HB 4MO8A 3M1QA 4CA2A 4QJOA 5SZ0A 5FNLA 2WD3A 1G4JA 5JEPB 3UYQA 4QSJA 1LGDA 3V3JA 4Q07A 2EU3A 1G46A 4QSAA 5JEGB 3DC9A 4L5WA 1I9OA 3F8EA 2WEJA 5SZ1A 4KUWA 3M1KA 4Q78A 4DZ9A 2POUA 3HFPA 2GD8A 3V2MA 5JG5B 4Q06A 1FSNA 1CVFA 3NI5A 1RAYA 3M2XA 3P55A 1HVAA 1I90A 4ZAOA 3HKNA 5DSPA 1CAOA 1ZGFA 1OKNA 1IF4A 2HD6A 1CCTA 5EHEA 2CBDA 3N3JA 3BETA 2EZ7A 4Q83A 3ML5A 5DOGA 4MLXA 4Y0JA 4YXUA 3KOKA 4YXOA 4PZHA 4QEFA 2NN7A 1HCAA 2GEHA 5FDCA 1FR4A 2HFWA 3T82A 2NXTA 2OSFA 5J8ZA 3RYVB 3DCCA 3S78B 2FNNA 4COQA 1DCAA 3P4VA 1ZE8A 2AX2A 4QJ0A 3RJ7A 2NNGA 5DOHA 5G0BA 1RZBA 1AM6A 3ZP9A 4WW6A 3N2PA 4IDRX 1OQ5A 3M96A 1CAZA 3LXEA 4FU5A 1CVCA 2AW1A 5EKMA 1CCUA 3M40A 2FMZA 3D93A 4K13A 5E2MA 4MTYA 5FLOA 5CA2A 4HT0A 4RIUA 3IBIA 3DVBA 3KONA 4RN4A 3L14A 4QIYA 1XPZA 4G0CA 2F14A 5JEHB 4Q8YA 3MHOA 3EFIA 5FLRA 4K0SA 1TEQX 1LZVA 3D92A 4CNXA 5FNJA 1BNTA 3HKUA 3NJ9A 4Z1KA 3MHMA 3CZVA 3U3AX 1CANA 1I8ZA 1IF8A 1URTA 5EH5A 3DA2A 2FNMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KNI A;  2QP6 A;  2Q38 A;  5IPZ A;  4E49 A;  1T9N A;  4X5S A;  1A42 A;  1BN1 A;  2NNS A;  1TEU X;  3RGE A;  4ZWI A;  4G7A A;  4JSA A;  1G53 A;  1TH9 A;  3C7P A;  4R5A A;  4M2V A;  3DD0 A;  1CCS A;  4HF3 A;  3JXG A;  1KOQ A;  2WEH A;  3RZ7 A;  1H4N A;  5DSK A;  1DMX A;  4YXI A;  3TVO X;  3M1J A;  4MDM A;  2W2J A;  2NWY A;  1CAK A;  2ABE A;  4TWL A;  4YHA A;  2CA2 A;  3M1W A;  5EHV A;  1BNN A;  3S9T A;  4BF1 A;  1OKL A;  4Q7V A;  4YGL A;  5DSR A;  2POW A;  4KUV A;  5AMD A;  3HLJ A;  1CVB A;  4QJX A;  3MNU A;  4PYX A;  1MUA A;  1JD0 A;  5BRW A;  3M5S A;  4E3D A;  3S72 B;  3T83 A;  4HT2 A;  1XEG A;  3K2F A;  4Q99 A;  3S76 A;  4GL1 X;  3W6H A;  5DVX A;  5BRU A;  4CNR A;  2HL4 A;  4K1Q A;  4YGF A;  4M2W A;  4QSI A;  1KEQ A;  4YVY A;  4Q7P A;  3V2J A;  4PQ7 A;  1CIM A;  3P44 A;  1CNC A;  1ZH9 A;  3RZ8 A;  3DC3 A;  1G48 A;  1RJ6 A;  9CA2 A;  1UGA A;  5LMD A;  3HS4 A;  4QJP A;  5FNI A;  2Q1B A;  3T85 A;  3FFP X;  1BNV A;  4TWM A;  1G0F A;  1AZM A;  4ZX1 A;  4Z1J A;  1TG3 A;  3HKT A;  2X7U A;  5A6H A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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