1CVHA

Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFCWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydro-lyase
source organism Homo sapiens
publication title Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 73
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1994-11-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cvhA00
5DSNA 2O4ZA 3IEOA 3M2NA 2NWZA 2POUA 1G6VA 2W2JA 3KWAA 4M2UA 3RZ5A 4JSSA 1G1DA 3N2PA 1DCBA 1HEBA 1IF7A 3IBUA 4Q99A 4CACA 2FOYA 1BNNA 2FNNA 4K0ZA 3R17B 1LG6A 1UGCA 2GEHA 1CNGA 4YGJA 1CVAA 5EOIA 1CVEA 1CVHA 3JXGA 3S76A 1I9LA 4Q87A 2QP6A 4Q7VA 4DZ7A 4QSJA 1THKA 1AZMA 1KOPA 1CCUA 4LP6A 1RZCA 3OILA 4ZX1A 3F7UA 5G01A 3KNEA 5CA2A 3F7BA 4N0XB 3V3HB 4Q8XA 3TMJA 1I90A 5DSRA 2NXRA 3TVNX 2POVA 5FLOA 4PZHA 3M5TA 1CAOA 4PYYA 3IGPA 4CNVA 4KUWA 3IBNA 3MNUA 1FQMA 3OY0A 2NNSA 1KWRA 4M2RA 5DVXA 3HKTA 1LZVA 2AX2A 3U7CA 4Q09A 4E3FA 2WD3A 4PYXA 4QJXA 3T84A 1CNIA 3KONA 3PJJA 4FPTA 1CNHA 2NWYA 2QOAA 4WW6A 5SZ5A 5JQTA 3LXEA 1YO1A 4YVYA 1XEVA 3IAIA 3MNAA 3CZVA 2WEHA 4XIWA 3MNKA 5DSPA 4HT0A 3CAJA 3MHCA 1G3ZA 1TG3A 3NB5A 4E3HA 1ZSAA 1HECA 1CALA 3HKUA 3JXHC 3S97A 1CAYA 5E5UA 1YDDA 3PO6A 4KUYA 3JXFA 1Z93A 1BN4A 3B4FA 4XZ5A 5FNJA 2ILIA 4FU5A 4KNIA 1G48A 5DSMA 5EHEA 3MNJA 4IDRX 3P5LA 1ZSBA 1CVCA 3T83A 4K0SA 5EH7A 4TWLA 3U45X 1UGAA 1I9PA 1F2WA 1JCZA 1LG5A 2ZNCA 1KWQA 3KIGA 3S72B 4QSAA 5JEGB 4QIYA 4LHIA 2HL4A 4ZWXA 5EH5A 4Q6EA 3MHMA 7CA2A 1CAMA 1CNYA 4YWPA 5AMDA 5CJFA 2X7TA 1BNWA 1HVAA 1DCAA 2POWA 2X7UA 3ML2A 4Q06A 1CNKA 3HFPA 1G54A 5EH8A 2HOCA 5DSJA 1LGDA 5DSLA 3D93A 2HD6A 1FSNA 3V3GB 1DMYA 3DCCA 1BNMA 1TH9A 5EKHA 4HEWA 3OKUA 2CBAA 4KNJA 3RYYA 1BNQA 3QYKA 3S73B 5JGTB 3OIMA 1G4JA 2CBDA 4IWZA 2FNMA 5G0BA 5FLSA 1CAZA 3V7XA 4QK3A 8CA2A 4JSZA 1I8ZA 3RZ1B 3KKXA 4KP8A 1BNUA 3P3HA 5FL4A 5FNMA 5SZ1A 4Q7WA 4QTLA 5IPZA 3NI5A 4WUQA 5DSQA 4ZWYA 1G53A 3M2ZA 4K13A 4KV0A 3MNIA 3N3JA 5L3OA 3V3JA 4E49A 1JD0A 3GZ0A 4CNXA 4E4AA 2CBCA 4ILXA 4UOVA 1CNXA 1HEAA 9CA2A 3M98A 1CRAA 4ITOA 4Q7SA 5FL5A 5FNIA 3P58A 4G7AA 4RIVA 1CVDA 4K0TA 4QJOA 4QSIA 5FNLA 1I9MA 3S74B 2FOUA 1MOOA 3T82A 5AMGA 3P5AA 2EZ7A 2NN7A 4YGFA 4K1QA 1CAHA 1FLJA 4MDMA 3RYXB 3RZ8A 1OKLA 4M2WA 3RYVB 1V9IC 1FR7A 4XFWA 4QEFA 1Y7WA 5BRVA 4Q81A 1FQRA 4Q8YA 1RZEA 2AW1A 3V2JA 1G0EA 3OIKA 2NMXA 3VBDA 1ZFKA 1UGDA 3DA2A 1A42A 1XQ0A 4Q49A 4Z1NA 3M1WA 1DMXA 4Z0QA 5J8ZA 2CBBA 1CA2A 3MDZA 2NNOA 3M1JA 3M2XA 1RZBA 4ZAOA 1CAIA 4Q78A 4R5AA 3D0NA 1KOQA 5DRSA 1RJ6A 4FVOA 4M2VA 5FDCA 1CVBA 4RFDA 2HNCA 3M1KA 3BL0A 3M67A 4E5QA 3DVBA 4YXIA 4CNWA 4L5WA 2NXSA 4FIKA 3RG3A 5BYIA 1RJ5A 5EKJA 3P3JA 3DC3A 3CYUA 4PXXA 1UGEA 4JSWA 5C8IA 4MTYA 3HS4A 1ZGFA 1BNVA 3N4BA 3ML5A 3S9TA 5JG5B 1IF6A 3T85A 4L5UA 4XE1A 1J9WA 2H4NA 3OKVA 2FOSA 5EHVA 4YGLA 5JESB 1UGGA 4YHAA 3F4XA 1CCTA 4RH2A 1UGFA 3FE4A 3KOIA 5DOHA 1Z9YA 3V2MA 2F14A 3FW3A 3V5GA 3RYZA 4C3TA 2FOQA 4FVNA 4HF3A 1TEUX 4YGNA 1TEQX 4Q08A 5CLUA 4YXUA 5EKMA 1HUHA 5BRWA 3ZP9A 1YDBA 2FNKA 3RZ7A 1BICA 4Q9YA 3DC9A 4X5SA 4Y0JA 3FFPX 1CVFA 2GD8A 1ZSCA 3T5ZA 4QJ0A 3U47A 4ETQC 3DD0A 4HU1A 4Q8ZA 5JDVB 1TBTX 4HT2A 1I9OA 5FNKA 2CABA 4PQ7A 5LMDA 1RAYA 4E3GA 4ZWIA 5AMLA 1RZDA 5BNLA 5EZTX 3SAXA 1G0FA 1YO2A 3SAPA 1T9NA 1HEDA 3S75B 5A6HA 3HLJA 3DCSA 3RLDA 3C7PA 1V9EA 3S77B 5JQ0A 1TB0X 1UGBA 3M40A 5FLQA 1XEGA 2IT4A 4BF1A 3BL1A 1URTA 2VVAX 3DD8A 3MYQA 3D92A 3DCWA 3U3AX 2CBEA 4Q7PA 1CNWA 1IF4A 1ZFQA 2NN1A 3V3FA 5SZ0A 5E2NA 2WEJA 2CA2A 4HBAA 5SZ7A 1BN3A 5JG3B 1ZGEA 1I91A 3CA2A 1CA3A 5FL6A 4MLXA 3N0NA 5SZ3A 3KOKA 4MDLA 4DZ9A 3HKNA 1BZMA 3M96A 3P44A 1YDAA 4QSBA 3P55A 4RUYA 3RGEA 3PYKA 5E2KA 4FRCA 1CANA 5JEPB 3RYJB 3DAZA 1KEQA 12CAA 1ZH9A 3L14A 4RUXA 4MDGA 5DOGA 1AM6A 1CAKA 1CZMA 1XPZA 1MUAA 1FR4A 4E3DA 1CINA 2WEOA 3W6HA 1LUGA 4CA2A 1H9QA 4RUZA 1FSRA 1YO0A 4YXOA 4HEZA 2NNVA 4BCWA 3UYQA 3MZCA 2HFWA 3P4VA 2NXTA 1CILA 1H9NA 3S71B 4CNRA 5G0CA 3OYSA 1OKNA 4KAPA 5FLRA 1YDCA 4YYTA 3RZ0B 3RJ7A 1CCSA 1FQLA 1HUGA 4WL4A 4LU3A 3M14A 4QJPA 3M1QA 4BF6A 2Q38A 2ABEA 5G03A 3V3IB 3M2YA 4RIUA 1EOUA 1G46A 5DSKA 5DSIA 1CIMA 3SBIA 4R5BA 4QJWA 3Q31A 5SZ2A 5DSOA 4G0CA 1BV3A 5EHWA 1TE3X 4L5VA 1G45A 4RFCA 1TG9A 1OQ5A 4WUPA 4JSAA 2FMZA 1BCDA 5FNHA 1CNJA 1I9QA 1IF9A 3M3XA 5SZ6A 2WEGA 3M5EA 4MO8A 2NNGA 1G52A 1I9NA 3RG4A 2NWOA 4Q6DA 4ZX0A 1IF5A 1BNTA 5HPJA 4WW8A 1JV0A 4HEYA 4QIZA 2HKKA 5FLTA 3S78B 4JS6A 4Z1KA 3K7KA 3EFTA 2H15A 2OSMA 3DV7A 3MHOA 2FOVA 3M5SA 1CNCA 2Q1BA 3MWOA 5CACA 3B1BA 1RZAA 2EU3A 3KS3A 3W6IA 1Z97A 3DVDA 3EFIA 3MMFA 4YX4A 4COQA 4Q83A 1IF8A 2VVBX 2FW4A 2X7SA 2EU2A 1CAJA 1OKMA 3MHIA 4QK1A 4E9OX 1RAZA 1FQNA 4KP5A 3SBHA 4Q90A 5E2SA 3D9ZA 3R16A 1H4NA 2FMGA 6CA2A 4Z1JA 3UYNA 1BN1A 4QK2A 3DVCA 4Q07A 1CRMA 5L6KA 2QO8A 5A25A 5FNGA 5JGSB 5E2MA 1ZNCA 4TWMA 5E5RA 1HCBA 2NWPA 4WR7A 2Q1QA 4MLTA 3MNHA 4KNNA 5EIJA 1ZE8A 3NJ9A 4RN4A 3TVOX 4ZWZA 1G4OA 5E28A 3F8EA 4ITPA 4KNMA 4FL7A 3OYQA 4XIXA 5FDIA 3KLDB 3IBIA 4Z1EA 2WD2A 5E2RA 5FLPA 5SZ4A 4KUVA 4QY3A 3M04A 3IBLA 3BETA 4QJMA 4YGKA 5BRUA 3S8XA 1CNBA 1HCAA 4GL1X 3T5UA 2OSFA 3D8WA 3HKQA 3K34A 3DBUA 4N16A 5JEHB 4CQ0A 1AVNA 1TTMA 3MHLA 3K2FA 4R59A 1FSQA 3ZNCA 4Q0LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5DSN A;  2O4Z A;  3IEO A;  3M2N A;  2NWZ A;  2POU A;  1G6V A;  2W2J A;  3KWA A;  4M2U A;  3RZ5 A;  4JSS A;  1G1D A;  3N2P A;  1DCB A;  1HEB A;  1IF7 A;  3IBU A;  4Q99 A;  4CAC A;  2FOY A;  1BNN A;  2FNN A;  4K0Z A;  3R17 B;  1LG6 A;  1UGC A;  2GEH A;  1CNG A;  4YGJ A;  1CVA A;  5EOI A;  1CVE A;  1CVH A;  3JXG A;  3S76 A;  1I9L A;  4Q87 A;  2QP6 A;  4Q7V A;  4DZ7 A;  4QSJ A;  1THK A;  1AZM A;  1KOP A;  1CCU A;  4LP6 A;  1RZC A;  3OIL A;  4ZX1 A;  3F7U A;  5G01 A;  3KNE A;  5CA2 A;  3F7B A;  4N0X B;  3V3H B;  4Q8X A;  3TMJ A;  1I90 A;  5DSR A;  2NXR A;  3TVN X;  2POV A;  5FLO A;  4PZH A;  3M5T A;  1CAO A;  4PYY A;  3IGP A;  4CNV A;  4KUW A;  3IBN A;  3MNU A;  1FQM A;  3OY0 A;  2NNS A;  1KWR A;  4M2R A;  5DVX A;  3HKT A;  1LZV A;  2AX2 A;  3U7C A;  4Q09 A;  4E3F A;  2WD3 A;  4PYX A;  4QJX A;  3T84 A;  1CNI A;  3KON A;  3PJJ A;  4FPT A;  1CNH A;  2NWY A;  2QOA A;  4WW6 A;  5SZ5 A;  5JQT A;  3LXE A;  1YO1 A;  4YVY A;  1XEV A;  3IAI A;  3MNA A;  3CZV A;  2WEH A;  4XIW A;  3MNK A;  5DSP A;  4HT0 A; 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