1FQNA

X-ray crystal structure of metal-free f93i/f95m/w97v carbonic anhydrase (caii) variant
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQIHMHVGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural influence of hydrophobic core residues on metal binding and specificity in carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1fqnA00
5JG3B 3K34A 3TVNX 3MNIA 4K0SA 5E2SA 2X7SA 3MNKA 3MHLA 4R5BA 4XFWA 1FR7A 1OKLA 1TG9A 3V7XA 1V9EA 1CANA 5FNLA 1MOOA 4Q6DA 4MDMA 3DBUA 1HECA 4YXUA 4QJOA 5SZ3A 1ZSAA 3DVDA 4XIXA 5E2KA 3V3FA 3TMJA 5SZ5A 4KUWA 4X5SA 4KNJA 3D93A 5SZ1A 3DA2A 4WUQA 5DSQA 3R17B 1I90A 1UGBA 1FLJA 1BNMA 3M04A 4Q07A 5AMLA 3M2NA 1RJ5A 1RZDA 1LUGA 2AX2A 1MUAA 3M98A 4FVNA 4RN4A 4E3DA 3V3HB 3MWOA 1HEBA 2CBBA 2NWZA 3P3HA 3DC9A 4LP6A 1LZVA 1TB0X 2FW4A 4FPTA 4Z1JA 2POUA 1CCUA 5EIJA 3HKTA 2NXTA 4HT0A 4DZ9A 4WUPA 1FQMA 1G45A 1BN3A 1CAOA 1G1DA 3EFTA 4XE1A 1YO2A 3W6IA 3S9TA 3NJ9A 4XIWA 2FNMA 1CNBA 4PYYA 3MNUA 3KNEA 2CA2A 1KOPA 3L14A 3KLDB 1IF8A 2QO8A 5EH7A 1UGCA 5FLQA 5BRWA 4Q49A 3ZNCA 3T5ZA 1FQLA 4JSZA 3PJJA 4ZWXA 1CVAA 3HKNA 4QJMA 2NN1A 2Q38A 1CCSA 1CAYA 5E5UA 1LG6A 4RIVA 1DCBA 3M1KA 7CA2A 3P58A 3U7CA 3M3XA 2NMXA 3B1BA 3JXGA 4QK1A 3P3JA 4Q99A 3DCCA 4L5WA 5SZ7A 1Y7WA 4GL1X 4Q8ZA 1DMYA 1FR4A 2HFWA 1BCDA 3LXEA 2EZ7A 1XEGA 3MDZA 5FL5A 1UGEA 5FLPA 1ZNCA 2CABA 1I9MA 3OYSA 4YXIA 1KWQA 4M2WA 3S8XA 3K7KA 4RUXA 1YDBA 1G54A 2FNNA 3T83A 4ZX1A 4JSSA 3S75B 1CA2A 3V5GA 4FVOA 3BL1A 2NN7A 5FNHA 3DVCA 4MO8A 4Q8XA 5DSNA 1ZGEA 1CVHA 5JGTB 5AMGA 3M1QA 1BICA 1I91A 3DC3A 3SBHA 1TH9A 3OKUA 4KP8A 4QJPA 5G0CA 4TWLA 2IT4A 4JS6A 1FQNA 5SZ0A 3CAJA 4HEWA 1RZBA 3BETA 4YGFA 1HEAA 3MYQA 3NB5A 3T5UA 5JDVB 1CNKA 2W2JA 4YGLA 4M2UA 3KKXA 9CA2A 1CNCA 4ZWIA 1IF7A 4UOVA 8CA2A 4YGKA 5E2NA 3MNAA 3M5SA 4YGJA 2NWOA 3V3GB 5EKHA 5FDCA 1I9PA 5G03A 3PO6A 4QTLA 3W6HA 1HUHA 1UGAA 2X7TA 1G6VA 3M1JA 4QY3A 5LMDA 3KS3A 1FSQA 3TVOX 3M1WA 1CNJA 4RH2A 1CAZA 3IAIA 3K2FA 1CIMA 3NI5A 1CVFA 2HD6A 3B4FA 3CYUA 3DAZA 3RG4A 4E49A 1YO1A 3GZ0A 1G52A 2ABEA 3M5TA 1CVBA 3C7PA 3U47A 1BZMA 4C3TA 1HVAA 5FLRA 5JEHB 4ZX0A 1RZAA 1CNGA 2GEHA 5A6HA 3M2ZA 1JCZA 4QSIA 1YDAA 2VVAX 3U3AX 4FRCA 4KUVA 1ZFQA 1Z93A 4L5UA 5FNKA 2EU3A 1CILA 2QP6A 5SZ2A 5DSPA 1H4NA 2NNSA 1BNNA 2AW1A 2OSMA 4WW6A 3RYXB 4G7AA 4E3FA 4Q87A 4MTYA 1I9NA 2FNKA 2NWYA 1RAZA 5E5RA 3DD0A 4DZ7A 2FOSA 3F7BA 1CNXA 1ZSBA 1RAYA 5EHVA 1CAJA 4HT2A 4ZWZA 4PXXA 3UYNA 4N0XB 4XZ5A 2WD2A 5A25A 1OQ5A 2GD8A 4Z0QA 1FSNA 1IF4A 3SAPA 4YGNA 1IF9A 1RZCA 1G0FA 4LU3A 1LG5A 2VVBX 4M2RA 1LGDA 4FL7A 1CAMA 1UGGA 6CA2A 5BYIA 3DVBA 1DMXA 1TEQX 2O4ZA 2WEHA 4QK2A 5FDIA 5EHWA 5BRUA 5BRVA 4Q08A 3MHIA 1THKA 3T84A 3IEOA 1HUGA 3RJ7A 4ETQC 1BNTA 1YDDA 3D92A 3T82A 3MHCA 5CACA 5FNMA 3S73B 1G53A 4FU5A 5EKMA 5SZ4A 5DRSA 5IPZA 4YX4A 5L6KA 3S74B 1G46A 3DCWA 2WD3A 2NNVA 3RZ8A 4BF1A 2Q1QA 2ZNCA 3IBIA 4JSAA 2WEJA 3M2YA 3MZCA 2NNGA 4BF6A 1G4OA 1URTA 4Q7WA 4G0CA 5G01A 2NWPA 1I9QA 3P44A 3P5LA 4R59A 4CNVA 3DCSA 3CA2A 3N2PA 2ILIA 3RYZA 2HL4A 3FE4A 3QYKA 3DD8A 1CNWA 4CA2A 1CALA 4LHIA 4RUZA 5JGSB 3V2MA 1CNYA 3S76A 3MMFA 3FW3A 3KOIA 5E2MA 1CVEA 4K0ZA 1HCAA 3N3JA 4PQ7A 1ZSCA 1ZGFA 1BN1A 4KNMA 3HS4A 4Q09A 1CCTA 3FFPX 5CJFA 4QJXA 4CNRA 1Z97A 5SZ6A 1J9WA 5E2RA 1TTMA 3SBIA 3MHMA 3Q31A 4Q6EA 5EZTX 4CQ0A 2X7UA 4K0TA 2FOYA 1Z9YA 4FIKA 3CZVA 5L3OA 3MHOA 5J8ZA 3V3JA 1YO0A 2CBCA 3MNHA 3OIMA 4RIUA 4HU1A 5DOHA 1G4JA 1ZH9A 3KOKA 5C8IA 5DSIA 3VBDA 1RJ6A 4ZWYA 1OKNA 3RZ0B 5JESB 3F8EA 4YYTA 1ZE8A 1CRAA 4YVYA 4ITPA 4RFDA 3RYVB 4YHAA 2EU2A 1BNVA 1UGFA 2WEGA 1EOUA 4HEYA 2CBAA 5DVXA 3ZP9A 3M2XA 5JQ0A 3P5AA 4YWPA 5E28A 3JXHC 5FNIA 1YDCA 4Z1KA 3S77B 4QSBA 1KEQA 5DSRA 4K13A 3S78B 4COQA 1I9LA 1HEDA 4KNIA 2CBEA 4Q8YA 3IBNA 1CAHA 1JD0A 1IF5A 3HLJA 5CA2A 3UYQA 3OILA 5FNJA 1DCAA 5HPJA 4Q06A 1ZFKA 4KNNA 1RZEA 3D9ZA 3IBLA 1UGDA 5EHEA 1XEVA 1CA3A 3HFPA 5DSMA 3D0NA 1AZMA 3MNJA 1H9QA 3ML2A 5JEGB 5BNLA 5EH5A 4RFCA 1BNUA 1BNQA 2NXRA 3RG3A 2NXSA 3KIGA 4E4AA 1HCBA 3T85A 1I8ZA 4TWMA 3JXFA 5JEPB 4QIZA 3RZ7A 4MLXA 4Q9YA 1A42A 4Q78A 3M14A 4MDGA 2NNOA 4IDRX 5G0BA 5FLSA 3RGEA 4Q90A 4WR7A 2HOCA 5DSLA 4PYXA 1TBTX 2H4NA 2F14A 4KAPA 4CACA 1TG3A 1XPZA 3P4VA 3S97A 3M67A 1IF6A 3M5EA 3P55A 3RYYA 4E3HA 3IGPA 12CAA 3M40A 1CVDA 4IWZA 5DSJA 4JSWA 4QEFA 5CLUA 4ILXA 1AM6A 4HEZA 4L5VA 4E5QA 3OKVA 2HKKA 4Q7VA 4Y0JA 5FNGA 3F4XA 4KUYA 5EKJA 2H15A 3RLDA 1TEUX 1XQ0A 4Q0LA 4QK3A 3KWAA 4R5AA 4WL4A 2OSFA 3M96A 5DOGA 1OKMA 5FLOA 3SAXA 3OY0A 3F7UA 1CAKA 2Q1BA 4QJWA 3BL0A 1BNWA 3IBUA 2HNCA 1CZMA 1CNIA 1CAIA 5FL4A 1I9OA 3EFIA 1CINA 3D8WA 3R16A 4Z1NA 1BV3A 3ML5A 4KV0A 4QJ0A 4QSAA 3V2JA 4Q83A 5DSOA 3RYJB 3KONA 1CRMA 1V9IC 4Q81A 2FMGA 5FLTA 4Q7SA 4PZHA 4QIYA 4WW8A 1G0EA 5JG5B 1KOQA 1FSRA 2POWA 5DSKA 4CNWA 4M2VA 5FL6A 4HF3A 1T9NA 1G3ZA 2WEOA 3HKUA 4QSJA 3OIKA 3PYKA 4E9OX 1H9NA 4KP5A 3RZ5A 2CBDA 1CVCA 1TE3X 4E3GA 1G48A 5EH8A 2FOVA 3S72B 4HBAA 2QOAA 4ITOA 1FQRA 3DV7A 3V3IB 1AVNA 2FOUA 4ZAOA 4MDLA 4YXOA 3OYQA 4BCWA 3S71B 4K1QA 1BN4A 4RUYA 5EOIA 4MLTA 3N0NA 4CNXA 5AMDA 3HKQA 2POVA 1JV0A 2FOQA 1KWRA 1CNHA 2FMZA 4N16A 5JQTA 3U45X 4Z1EA 1F2WA 3N4BA 3RZ1B 4Q7PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5JG3 B;  3K34 A;  3TVN X;  3MNI A;  4K0S A;  5E2S A;  2X7S A;  3MNK A;  3MHL A;  4R5B A;  4XFW A;  1FR7 A;  1OKL A;  1TG9 A;  3V7X A;  1V9E A;  1CAN A;  5FNL A;  1MOO A;  4Q6D A;  4MDM A;  3DBU A;  1HEC A;  4YXU A;  4QJO A;  5SZ3 A;  1ZSA A;  3DVD A;  4XIX A;  5E2K A;  3V3F A;  3TMJ A;  5SZ5 A;  4KUW A;  4X5S A;  4KNJ A;  3D93 A;  5SZ1 A;  3DA2 A;  4WUQ A;  5DSQ A;  3R17 B;  1I90 A;  1UGB A;  1FLJ A;  1BNM A;  3M04 A;  4Q07 A;  5AML A;  3M2N A;  1RJ5 A;  1RZD A;  1LUG A;  2AX2 A;  1MUA A;  3M98 A;  4FVN A;  4RN4 A;  4E3D A;  3V3H B;  3MWO A;  1HEB A;  2CBB A;  2NWZ A;  3P3H A;  3DC9 A;  4LP6 A;  1LZV A;  1TB0 X;  2FW4 A;  4FPT A;  4Z1J A;  2POU A;  1CCU A;  5EIJ A;  3HKT A;  2NXT A;  4HT0 A;  4DZ9 A;  4WUP A;  1FQM A;  1G45 A;  1BN3 A;  1CAO A;  1G1D A;  3EFT A;  4XE1 A;  1YO2 A;  3W6I A;  3S9T A;  3NJ9 A;  4XIW A;  2FNM A;  1CNB A;  4PYY A;  3MNU A;  3KNE A;  2CA2 A;  1KOP A;  3L14 A;  3KLD B;  1IF8 A;  2QO8 A;  5EH7 A;  1UGC A;  5FLQ A;  5BRW A;  4Q49 A;  3ZNC A;  3T5Z A;  1FQL A;  4JSZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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