1G48A

Carbonic anhydrase ii (f131v) complexed with 4-(aminosulfonyl)-n-[(2,6-difluorophenyl)methyl]-benzamide
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDVGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Contribution of Flourine to Protein-ligand Affinity in the Binding of Flouroaromatic Inhibitors to Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 72
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1g48A00
3D8WA 1YO2A 3T84A 3OYSA 1DMYA 5HPJA 5SZ6A 5DSMA 2WEHA 2QP6A 4GL1X 4L5WA 2ILIA 3SBIA 3T82A 1CNBA 1RJ5A 5DVXA 3BETA 3S8XA 4E49A 3PJJA 3HFPA 3M1JA 4YWPA 2Q38A 5JG5B 1G0FA 3BL0A 3IGPA 1ZNCA 1HEBA 1BCDA 1LG5A 4Q0LA 4BF6A 4Q49A 5CLUA 3S77B 4Q09A 4QJXA 5G0BA 5FLTA 4YXUA 3M1KA 3RJ7A 4Z1JA 3RZ8A 2CA2A 4QIYA 4QSIA 1V9IC 5DSRA 3M3XA 4CNRA 4Q7WA 4M2WA 5EH5A 3U47A 2ZNCA 2EZ7A 2QO8A 1A42A 4PZHA 5SZ7A 2NWOA 4MDLA 5E2MA 1IF4A 1AM6A 4QY3A 5JESB 4M2UA 1CNJA 3KOKA 3OYQA 1UGAA 3JXHC 2HOCA 4CA2A 1G52A 5DSOA 3M1QA 4QEFA 3RYJB 1JV0A 3KKXA 5DSLA 5JEPB 3DCCA 1CNCA 4Q07A 2FNNA 1Z97A 1BN1A 3F7UA 3MWOA 5E5UA 3S74B 5AMDA 3RZ7A 5DOGA 1BICA 7CA2A 1FQNA 3DD8A 3M5SA 3W6IA 5EOIA 4Z1EA 1UGGA 4JSSA 1KOQA 3Q31A 5FLSA 4QTLA 1TEQX 1ZSBA 4M2VA 5BYIA 1CALA 3T83A 4E3HA 5FDCA 4QK2A 3V3HB 2X7UA 3KS3A 3RZ0B 12CAA 1KEQA 2FW4A 2NMXA 3HKNA 4QJPA 4E3GA 1HUHA 2QOAA 3IAIA 4PYYA 4E4AA 3HKTA 4HBAA 3UYNA 2NNSA 1TBTX 2FOUA 1CCSA 2HFWA 4ETQC 4YHAA 3P3JA 5FL4A 3V3GB 5FL6A 2W2JA 2X7SA 4YGJA 5FNIA 3S75B 4QJMA 1Z9YA 3C7PA 3OY0A 4QSJA 1CNWA 4FPTA 3N2PA 4ITOA 4BCWA 1J9WA 5E2SA 5G03A 2POVA 3NB5A 3OILA 4KAPA 4M2RA 3KOIA 4CACA 2FNMA 1CAOA 2FMGA 1Y7WA 1ZFQA 1BNMA 1HUGA 5EHVA 3B4FA 1DCAA 1V9EA 3OKUA 3B1BA 5CACA 3S72B 5G01A 4WUPA 5CJFA 5BRUA 5E28A 2AW1A 2HNCA 3NJ9A 1CAJA 4KP8A 4Q7SA 2NWZA 3L14A 4ZAOA 1YDBA 5DSIA 5EH8A 4ITPA 4L5VA 3S78B 1BNVA 5FLPA 3MMFA 4HEZA 1JD0A 2NWYA 3FE4A 1URTA 5SZ4A 1AZMA 1Z93A 3IBLA 2AX2A 3M5TA 4E5QA 1CILA 1IF9A 3M67A 4R5AA 1BNUA 1HECA 4KUWA 1IF6A 1OKNA 4Q99A 4QJ0A 1ZH9A 1MOOA 1LZVA 1RZEA 1CAZA 1ZFKA 4E9OX 3SBHA 1CVBA 3HLJA 3R16A 1YO0A 5FLRA 3S9TA 1T9NA 3RYYA 3S73B 3V2MA 1CAKA 4YGLA 2EU2A 4FU5A 4ILXA 3N3JA 3D0NA 1TG9A 4E3FA 1RZBA 3MNKA 4QK1A 1CAMA 4RUZA 1I91A 4JSAA 4COQA 1G3ZA 2WEOA 4L5UA 3OIKA 5EKMA 4WUQA 3W6HA 2FNKA 1TG3A 4JSWA 5BRWA 5G0CA 1RZCA 4R59A 1BNTA 3P44A 4Q8ZA 3T5UA 2WD3A 1G46A 3M5EA 1KWRA 1EOUA 1MUAA 2NNVA 1CNIA 3FW3A 1CRAA 4Q8XA 4RFDA 4MDGA 4LP6A 3RZ5A 4XZ5A 2HKKA 2OSMA 3JXGA 4FIKA 5EKHA 4LHIA 3MNHA 3MHIA 1DCBA 1CVEA 1H9QA 5LMDA 4Q06A 5EHEA 3OIMA 4Q83A 3KWAA 3RYZA 1UGCA 3MHOA 4Q6DA 2NN1A 1CAYA 2NXSA 3RLDA 5C8IA 4KV0A 2GEHA 1FSNA 1TH9A 4RIUA 1ZGEA 4ZWZA 1YDDA 4CNWA 2CBDA 3KONA 1CANA 2IT4A 5E5RA 1CNKA 3DAZA 3RYVB 4CNXA 5EZTX 4RIVA 5DSJA 1CA2A 1JCZA 5DSKA 2FOQA 5FNMA 3EFIA 5EIJA 4C3TA 1CCTA 1IF8A 5EH7A 2HD6A 4K0TA 2CBCA 4RH2A 4Q87A 1ZGFA 4Q90A 4RN4A 4ZWYA 2WEJA 1IF5A 2ABEA 3F4XA 4FVOA 4HEYA 3DVBA 3DVDA 5FLQA 3MNUA 5E2RA 2NWPA 4Q81A 6CA2A 3DC9A 4X5SA 5DOHA 3P58A 3DCSA 2OSFA 1UGDA 3R17B 1OKMA 3V3JA 1THKA 4CNVA 3S71B 2CBAA 4Y0JA 3M96A 3V2JA 1FSRA 2H4NA 4ZWIA 3ML5A 4G0CA 4Q8YA 3V3FA 4E3DA 3M14A 4DZ7A 4K13A 3PYKA 3DBUA 3DV7A 3MDZA 5SZ3A 1TEUX 2WEGA 3RG4A 4YGNA 4QIZA 4Q6EA 4Z0QA 4XIWA 2NN7A 4WW8A 3BL1A 5DSPA 4YX4A 2FMZA 1I8ZA 3M40A 4XIXA 3V7XA 4XFWA 4QK3A 4PQ7A 2CABA 1IF7A 3ZP9A 4TWLA 1CNGA 1XEVA 4HT0A 4MLXA 5FNKA 3SAXA 4FRCA 1HVAA 2GD8A 3D92A 2F14A 1BNNA 3VBDA 1FQMA 3NI5A 4PYXA 3QYKA 3MZCA 1I9OA 4TWMA 1CZMA 3IBUA 4LU3A 5FNHA 3T85A 4JSZA 3KNEA 5JGSB 2Q1QA 3U45X 3CZVA 5A25A 1CA3A 5AMGA 1TB0X 2O4ZA 1I9LA 3PO6A 1UGEA 9CA2A 3SAPA 1RZDA 4IWZA 3MNAA 4N16A 5FDIA 3KIGA 1KOPA 3P55A 2EU3A 4KNNA 5JDVB 1G48A 1FR4A 3F8EA 1F2WA 4FVNA 4QJOA 1TTMA 2CBBA 3M2YA 4ZWXA 3P5AA 5EHWA 5L3OA 1XQ0A 1CNHA 2NXTA 1YDAA 3N0NA 1CVAA 3MHCA 3UYQA 1RZAA 3LXEA 3CA2A 1TE3X 3V3IB 1CNYA 4QSAA 2FOYA 3JXFA 4KUYA 3N4BA 4KNJA 1I90A 1G1DA 1AVNA 5FNLA 5DRSA 5IPZA 1HEAA 1BNQA 2POWA 3S97A 5BNLA 1I9QA 1XPZA 3V5GA 3DC3A 3ML2A 3D93A 5FL5A 4K0SA 5J8ZA 4R5BA 3K7KA 3DCWA 3OKVA 5E2KA 3U3AX 4RFCA 3FFPX 3HS4A 3RZ1B 1H9NA 4YGFA 1KWQA 3M1WA 5AMLA 5FLOA 5BRVA 3DD0A 1CINA 4KP5A 4KUVA 4K1QA 5DSNA 1FR7A 1G4OA 2NXRA 1CAIA 1ZSAA 1CVDA 3U7CA 5JEGB 4Z1KA 3DVCA 1I9MA 3RYXB 2H15A 3IBIA 4XE1A 1G45A 4Q7VA 1ZE8A 1BNWA 3M98A 4KNIA 1FQLA 4MO8A 5L6KA 4Q08A 4N0XB 3T5ZA 3MYQA 4HEWA 3MNJA 1FQRA 1CVCA 1HEDA 2WD2A 3HKQA 1RAZA 1G0EA 1BN4A 3M2XA 3CAJA 1G53A 1RJ6A 5JG3B 1ZSCA 4K0ZA 2VVBX 4MDMA 3HKUA 2CBEA 4JS6A 5EKJA 1CRMA 1CVHA 4YVYA 4BF1A 3M2ZA 2HL4A 3GZ0A 3IBNA 1H4NA 4MTYA 5JQTA 2FOSA 1BN3A 4FL7A 5CA2A 5JEHB 3EFTA 3MHMA 4CQ0A 4HU1A 1LGDA 2POUA 1G54A 4WR7A 4YGKA 8CA2A 1G4JA 4QJWA 1I9PA 2Q1BA 1I9NA 5SZ0A 4ZX1A 2NNGA 1LUGA 3K34A 4Q9YA 5JQ0A 4QSBA 4WW6A 4YXOA 3TVNX 1YDCA 3S76A 4YXIA 3F7BA 1CAHA 3K2FA 1UGBA 3KLDB 4Z1NA 1CCUA 2X7TA 1CNXA 1BZMA 1OKLA 3P3HA 3P4VA 3D9ZA 4WL4A 3TMJA 4HF3A 1HCAA 3CYUA 3P5LA 1BV3A 4Q7PA 5SZ2A 3IEOA 4Q78A 4UOVA 3TVOX 4KNMA 4PXXA 4DZ9A 1UGFA 3RGEA 5JGTB 4G7AA 5DSQA 1XEGA 2FOVA 3M2NA 3DA2A 4MLTA 1LG6A 5FNGA 4RUXA 5A6HA 5SZ5A 3RG3A 5FNJA 1CIMA 1RAYA 1CVFA 1FSQA 2VVAX 1G6VA 4HT2A 5E2NA 5SZ1A 2NNOA 4ZX0A 3MNIA 3ZNCA 1OQ5A 1DMXA 3M04A 4RUYA 1FLJA 3MHLA 1YO1A 4YYTA 4IDRX 1HCBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3D8W A;  1YO2 A;  3T84 A;  3OYS A;  1DMY A;  5HPJ A;  5SZ6 A;  5DSM A;  2WEH A;  2QP6 A;  4GL1 X;  4L5W A;  2ILI A;  3SBI A;  3T82 A;  1CNB A;  1RJ5 A;  5DVX A;  3BET A;  3S8X A;  4E49 A;  3PJJ A;  3HFP A;  3M1J A;  4YWP A;  2Q38 A;  5JG5 B;  1G0F A;  3BL0 A;  3IGP A;  1ZNC A;  1HEB A;  1BCD A;  1LG5 A;  4Q0L A;  4BF6 A;  4Q49 A;  5CLU A;  3S77 B;  4Q09 A;  4QJX A;  5G0B A;  5FLT A;  4YXU A;  3M1K A;  3RJ7 A;  4Z1J A;  3RZ8 A;  2CA2 A;  4QIY A;  4QSI A;  1V9I C;  5DSR A;  3M3X A;  4CNR A;  4Q7W A;  4M2W A;  5EH5 A;  3U47 A;  2ZNC A;  2EZ7 A;  2QO8 A;  1A42 A;  4PZH A;  5SZ7 A;  2NWO A;  4MDL A;  5E2M A;  1IF4 A;  1AM6 A;  4QY3 A;  5JES B;  4M2U A;  1CNJ A;  3KOK A;  3OYQ A;  1UGA A;  3JXH C;  2HOC A;  4CA2 A;  1G52 A;  5DSO A;  3M1Q A;  4QEF A;  3RYJ B;  1JV0 A;  3KKX A;  5DSL A;  5JEP B;  3DCC A;  1CNC A;  4Q07 A;  2FNN A;  1Z97 A;  1BN1 A;  3F7U A;  3MWO A;  5E5U A;  3S74 B;  5AMD A;  3RZ7 A;  5DOG A;  1BIC A;  7CA2 A;  1FQN A;  3DD8 A;  3M5S A;  3W6I A;  5EOI A;  4Z1E A;  1UGG A;  4JSS A; 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