1G54A

Carbonic anhydrase ii complexed with 4-(aminosulfonyl)-n-[(2,3,4,5,6-pentafluorophenyl)methyl]-benzamide
Total Genus 77

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H1 (13-18)3H2 (21-24)TIV9 (241-244)EMPTYAH1 (131-135)TIV3 (25-28)TIV10 (251-254)S1 (32-33)S8 (108-109)TI2 (34-37)S2 (39-40)TI4 (41-44)S6 (78-82)S3 (46-50)TVIII2 (75-78)TI5 (51-54)S9 (116-124)S5 (66-70)S4 (56-61)3H5 (164-166)AH3 (220-227)TIV4 (62-65)TVIII1 (72-75)S7 (88-97)TVIII3 (98-101)TI6 (100-103)TIV5 (105-108)TI'1 (109-112)S12 (191-195)TIV6 (108-111)3H3 (125-128)O1 (128-130)TIV7 (137-140)TVIa1 (200-203)S10 (141-150)S13 (208-212)AH2 (158-163)TII2 (233-236)TII1 (169-172)S11 (172-178)TIV8 (176-179)3H6 (181-184)S14 (216-218)TIV2 (18-21)3H4 (155-157)TI1 (8-11)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Contribution of Flourine to Protein-ligand Affinity in the Binding of Flouroaromatic Inhibitors to Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1g54A00
4PZHA 4RH2A 4YXOA 3T82A 3S77B 5HPJA 4E5QA 1CRMA 5EKJA 1BICA 1V9IC 4QSIA 2CABA 4RUYA 3P55A 1CAMA 3M04A 4QSJA 3OILA 1ZSAA 2GEHA 1G0FA 3B4FA 1RAYA 4KNIA 3M67A 3MNHA 4YWPA 5EHVA 5SZ4A 1XPZA 4M2RA 4ITPA 1UGFA 3CZVA 3V5GA 4KP5A 4YGLA 1T9NA 3RZ0B 1I9PA 1I9MA 3RG4A 5IPZA 2FNKA 4FL7A 1CZMA 5JEGB 1IF4A 4QJWA 1G1DA 1G46A 3V2JA 1I9OA 1UGBA 1J9WA 3S76A 3HKUA 5CA2A 1RAZA 5FL6A 4QJPA 3MMFA 4JSSA 1A42A 3JXHC 3KOIA 3M5TA 4Z1KA 5EH7A 1CA2A 3M5SA 2NMXA 1I90A 3M40A 8CA2A 2QP6A 5E2SA 1MOOA 1Z9YA 4Q07A 3PO6A 5AMLA 5LMDA 3EFIA 4WW8A 5SZ5A 3KOKA 3M3XA 4WR7A 4X5SA 4QJXA 5A25A 1IF6A 1I91A 3DVDA 4Q83A 4N0XB 4WW6A 1TB0X 1CVCA 5DOGA 1CCUA 1ZE8A 3DAZA 3MDZA 2HD6A 4E9OX 4QSBA 4ZWXA 1TG3A 12CAA 5BRWA 1CAKA 3RGEA 4Q78A 3KS3A 1YDBA 3R17B 1EOUA 1CIMA 1CILA 3V7XA 4ETQC 4DZ7A 3S74B 1TEQX 4ZX1A 5FDCA 1FSNA 3L14A 5JG3B 5CLUA 1KWRA 1FSQA 1XEGA 4WUQA 1TTMA 3M96A 5JG5B 3MHMA 2Q38A 3RZ7A 1CA3A 1CNCA 5DSRA 1CAIA 3W6IA 3U45X 1IF8A 4CNRA 4TWMA 4ZWYA 4Q09A 1CAYA 1I8ZA 4L5WA 3SAXA 1HEAA 4ZWZA 4MDMA 4YGKA 2O4ZA 3SBHA 5SZ3A 4MLXA 1V9EA 1CNKA 3RZ8A 5JQ0A 1OKMA 1RZCA 4CQ0A 1ZFKA 3HKQA 4KAPA 4Q87A 5FLSA 5FNHA 4QJMA 1FQRA 4XIXA 4QEFA 1CNGA 1G52A 5JEPB 5DSQA 3F8EA 4QJ0A 4Z1NA 1BCDA 1LUGA 3M2XA 3FFPX 4ZWIA 1UGDA 1CRAA 3K34A 1HECA 1HUGA 4KUWA 4M2UA 1YDAA 1FSRA 2WEJA 4Q06A 1UGCA 3LXEA 4Q9YA 4XIWA 5FLTA 4ITOA 1Y7WA 4LU3A 2NWPA 5EH8A 3DCSA 3KKXA 4CNXA 4RUXA 4CNVA 5JGSB 4QJOA 3JXFA 5FNJA 4MDGA 2Q1BA 4IDRX 4Q0LA 4ILXA 2HOCA 4QTLA 3S72B 4BCWA 2NN7A 5G01A 1KOPA 3DA2A 3QYKA 5DVXA 1CVAA 5EOIA 2NN1A 3OYSA 3BL0A 9CA2A 1CNJA 1YDDA 5E5RA 4HT2A 1JD0A 4HBAA 4Q08A 4ZAOA 1LGDA 3BL1A 3P3HA 5FNLA 3RLDA 4Q81A 3N3JA 5FDIA 4E3DA 4K0TA 2X7SA 3MYQA 1BNNA 4R5BA 1CNWA 4Z1JA 2NXRA 3OIMA 3RZ5A 4YGFA 5JESB 1YO0A 4HT0A 1BNWA 3EFTA 2IT4A 3MHOA 3MNUA 3F7BA 4QK2A 2FNMA 4Q7WA 1TG9A 3DVCA 4Q6EA 6CA2A 3KONA 2ABEA 1DMXA 5DSNA 4KUYA 4MO8A 1CNHA 5DRSA 1BNUA 4KNNA 4HEZA 3T85A 5G03A 2HKKA 5JDVB 3DC3A 1Z97A 2CBAA 4R59A 2F14A 1RJ5A 1CALA 3V3HB 4Q7PA 1XEVA 3OKUA 3U47A 3ML5A 3N4BA 4MLTA 5EH5A 4CA2A 5DSIA 5SZ0A 3IEOA 3R16A 3HKNA 1G53A 3MWOA 1G45A 3P4VA 4FVNA 4RUZA 1ZGFA 5FLPA 4R5AA 4RFDA 2NXTA 4Q7SA 1XQ0A 1TE3X 1LZVA 4JS6A 3S9TA 3M1WA 5E2NA 3U3AX 3GZ0A 5J8ZA 5EKHA 1OQ5A 4Q6DA 7CA2A 4LHIA 3DCWA 3M2YA 4Q99A 2AW1A 3S75B 3RZ1B 1BN3A 1CVHA 5DSJA 5DSLA 4Q90A 3OKVA 4Q49A 4KNJA 1F2WA 1HEBA 1CNBA 3CA2A 5E2KA 3IBNA 3OY0A 5DSMA 4CNWA 3SAPA 4GL1X 1ZGEA 4RIVA 3D9ZA 1CINA 4M2WA 1BN1A 5SZ7A 4PYXA 1DMYA 5FNIA 4YX4A 4PQ7A 5FLOA 4MDLA 4PYYA 2FMGA 2NNSA 1URTA 4WL4A 4QSAA 3DCCA 4LP6A 5EHWA 5L6KA 4E4AA 2OSMA 3V3JA 3CYUA 1DCAA 3DBUA 1ZNCA 1I9NA 1Z93A 4JSAA 4Y0JA 1G6VA 3RJ7A 2ZNCA 3P58A 4YXIA 3BETA 3MHCA 5FNGA 3RYZA 1HUHA 2VVAX 3P3JA 3ZNCA 5DSPA 3S8XA 3OIKA 3HS4A 3HFPA 3IAIA 3K7KA 4L5UA 5E5UA 3T5UA 3FW3A 3P5AA 4G7AA 3PYKA 4HEYA 1FR4A 5G0BA 1G0EA 1G48A 3DD8A 4WUPA 4JSZA 1ZFQA 5BNLA 1RZDA 2NNGA 2FOYA 3ML2A 1LG6A 2FOUA 3MNJA 5EIJA 3V3FA 3S78B 1ZH9A 5BYIA 1I9QA 4YVYA 3T83A 3PJJA 1CAOA 4FU5A 4DZ9A 1ZSBA 3D92A 1FQLA 3JXGA 3MHLA 1AZMA 3HKTA 4QIZA 2FOSA 1HVAA 3TVOX 2Q1QA 2POUA 4Q8XA 1MUAA 3D93A 2WEHA 4UOVA 5AMGA 2W2JA 3IGPA 3RYXB 4C3TA 1BNQA 3M14A 1IF7A 3M5EA 3S97A 1CCTA 2CBEA 1UGAA 5E28A 1CVDA 1RZEA 5EKMA 3HLJA 3M98A 1FQMA 3V3GB 3KIGA 3T5ZA 4BF6A 2FOQA 3NB5A 1H4NA 3NJ9A 1H9NA 3MZCA 4YHAA 3UYQA 1AM6A 4K1QA 2HFWA 4QIYA 2NWYA 4M2VA 3P5LA 3S71B 2VVBX 2H15A 3M2NA 1RJ6A 3DD0A 1FQNA 2NNOA 5EHEA 4FIKA 4HEWA 5CJFA 2ILIA 1BNVA 1YDCA 5G0CA 1ZSCA 3DV7A 2X7TA 4RIUA 2WEOA 2WEGA 1CAHA 1OKNA 3M1KA 5FNMA 1CAJA 1IF5A 5JEHB 4MTYA 3U7CA 1CVEA 3C7PA 5DSOA 5AMDA 2FOVA 4QK1A 4XZ5A 4KV0A 3MNIA 1HCAA 3IBIA 5EZTX 1IF9A 1BN4A 5JGTB 3MNKA 3TMJA 4E3HA 4XFWA 2CA2A 1YO1A 4YYTA 2EZ7A 5FLQA 3VBDA 1CNIA 3KNEA 5SZ6A 2CBDA 1KWQA 2QOAA 2NWOA 4FVOA 3DC9A 2HL4A 4XE1A 1G3ZA 4COQA 5E2MA 3N2PA 3M1JA 2NXSA 4Z0QA 5BRVA 5L3OA 2FW4A 1TEUX 4K13A 1JV0A 1G4JA 5DOHA 4TWLA 3N0NA 5FNKA 3M1QA 3MNAA 4FPTA 2EU2A 1THKA 3K2FA 1AVNA 5DSKA 4KUVA 1DCBA 4YGNA 2CBCA 3DVBA 2FMZA 1LG5A 1CNXA 4Q8ZA 3KWAA 2AX2A 4HF3A 5FL4A 1JCZA 3TVNX 5FL5A 4HU1A 2QO8A 2NWZA 2POWA 4K0SA 2X7UA 4Z1EA 1BNMA 1BZMA 4CACA 4QK3A 3F4XA 4IWZA 1CCSA 1G4OA 3RYYA 3RG3A 4E3FA 3S73B 1HEDA 1UGEA 2H4NA 2WD2A 4Q7VA 1BNTA 3D0NA 4KP8A 3IBUA 4N16A 4QY3A 1KOQA 4ZX0A 5JQTA 1CANA 1KEQA 4Q8YA 3V3IB 2WD3A 3RYJB 1I9LA 4K0ZA 2HNCA 3CAJA 5E2RA 2FNNA 1RZBA 2OSFA 1OKLA 3Q31A 4RFCA 4G0CA 2POVA 4FRCA 4JSWA 1CVFA 3SBIA 2NNVA 4PXXA 1TBTX 3ZP9A 3M2ZA 5SZ2A 3OYQA 3NI5A 3MHIA 3D8WA 4YGJA 1UGGA 1CNYA 1BV3A 1YO2A 4RN4A 4BF1A 3V2MA 3W6HA 1RZAA 5A6HA 3P44A 3UYNA 1CAZA 5BRUA 3IBLA 4YXUA 3T84A 1FR7A 4E3GA 4E49A 5CACA 2EU3A 4KNMA 3RYVB 5C8IA 3KLDB 1G54A 1FLJA 1CVBA 2GD8A 4L5VA 5FLRA 1HCBA 1TH9A 2CBBA 5SZ1A 1H9QA 3F7UA 3B1BA 3FE4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4PZH A;  4RH2 A;  4YXO A;  3T82 A;  3S77 B;  5HPJ A;  4E5Q A;  1CRM A;  5EKJ A;  1BIC A;  1V9I C;  4QSI A;  2CAB A;  4RUY A;  3P55 A;  1CAM A;  3M04 A;  4QSJ A;  3OIL A;  1ZSA A;  2GEH A;  1G0F A;  3B4F A;  1RAY A;  4KNI A;  3M67 A;  3MNH A;  4YWP A;  5EHV A;  5SZ4 A;  1XPZ A;  4M2R A;  4ITP A;  1UGF A;  3CZV A;  3V5G A;  4KP5 A;  4YGL A;  1T9N A;  3RZ0 B;  1I9P A;  1I9M A;  3RG4 A;  5IPZ A;  2FNK A;  4FL7 A;  1CZM A;  5JEG B;  1IF4 A;  4QJW A;  1G1D A;  1G46 A;  3V2J A;  1I9O A;  1UGB A;  1J9W A;  3S76 A;  3HKU A;  5CA2 A;  1RAZ A;  5FL6 A;  4QJP A;  3MMF A;  4JSS A;  1A42 A;  3JXH C;  3KOI A;  3M5T A;  4Z1K A;  5EH7 A;  1CA2 A;  3M5S A;  2NMX A;  1I90 A;  3M40 A;  8CA2 A;  2QP6 A;  5E2S A;  1MOO A;  1Z9Y A;  4Q07 A;  3PO6 A;  5AML A;  5LMD A;  3EFI A;  4WW8 A;  5SZ5 A;  3KOK A;  3M3X A;  4WR7 A;  4X5S A;  4QJX A;  5A25 A;  1IF6 A;  1I91 A;  3DVD A;  4Q83 A;  4N0X B;  4WW6 A;  1TB0 X;  1CVC A;  5DOG A;  1CCU A;  1ZE8 A;  3DAZ A;  3MDZ A;  2HD6 A;  4E9O X;  4QSB A;  4ZWX A;  1TG3 A;  12CA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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