1HEDA

Structural consequences of hydrophilic amino-acid substitutions in the hydrophobic pocket of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSATTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural consequences of hydrophilic amino acid substitutions in the hydrophobic pocket of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1hedA00
2OSMA 1BNQA 1G48A 4HT0A 3S74B 4CA2A 5AMDA 2FOYA 3RZ7A 5C8IA 3N4BA 3MDZA 1HEBA 3DVCA 3RYXB 3TVNX 1ZH9A 4MLXA 3D92A 5FL5A 5FLSA 5JEHB 4XZ5A 1FQLA 1CRAA 3KONA 1G4OA 1EOUA 4QIYA 4Z1JA 4COQA 4QK1A 2FOVA 1CVHA 1CNJA 1V9IC 4QJ0A 2WD3A 5FNMA 4QTLA 4E3DA 3M04A 4MDLA 1HEDA 1OKMA 5CACA 3KIGA 3W6HA 5EH7A 3V3JA 4Q7PA 3DA2A 3RZ1B 3FW3A 1BNWA 3KOKA 4Q81A 1Z97A 3ZNCA 1CCTA 5FNHA 5JQTA 4ZWYA 4KP5A 3V3GB 3V5GA 4Q0LA 1RZDA 5FL6A 4Q8XA 1DMYA 1CNWA 3M1KA 2QP6A 4WR7A 3S71B 3MNIA 5SZ4A 1V9EA 3RYYA 3DV7A 4YXOA 4GL1X 4HEWA 1CILA 3PJJA 5HPJA 1CNIA 4KUYA 2FNNA 3M1JA 5E5RA 2HFWA 1YO2A 1KOPA 3DBUA 5L3OA 3T83A 3HKNA 3MWOA 3BETA 3RG3A 2FOUA 1CA3A 3BL0A 4QY3A 4YHAA 1H4NA 3P3JA 1TEUX 3OILA 4N0XB 5G03A 4Z1EA 2NN1A 3P58A 1ZSCA 1CCUA 1BNTA 3T5ZA 3F8EA 4YGJA 1CAIA 5DSOA 5FNKA 1T9NA 4XIWA 5JQ0A 3SAPA 1CAYA 1UGAA 1TTMA 4E3FA 1ZNCA 4QSIA 4ILXA 3T5UA 4RH2A 1MUAA 4YYTA 3DCSA 3RGEA 2CBDA 1TG3A 2FW4A 4KNMA 4Q07A 3TMJA 5DSQA 5E2SA 2WD2A 4HU1A 5JEPB 2EZ7A 3IBIA 4Z1KA 2VVBX 1XEGA 3HS4A 5JG3B 4L5WA 3M1QA 4TWLA 3OYQA 1I9QA 3EFIA 3IBUA 3FE4A 5DVXA 1HUGA 3R16A 3C7PA 2CBBA 4E5QA 5E2MA 4WUQA 1BV3A 1LG6A 1BNVA 5CJFA 1BNNA 4PYXA 3LXEA 1HEAA 2X7SA 4G7AA 4Q78A 1RAYA 1FQRA 2NWYA 3M96A 4JS6A 4HEZA 2NXRA 3DCWA 1DMXA 4FU5A 4RN4A 3L14A 5EKMA 5FNLA 1CZMA 4DZ7A 3R17B 4Z0QA 3SBIA 7CA2A 1HUHA 4Q99A 1I9MA 5E28A 4G0CA 3U45X 5SZ6A 2HL4A 1G4JA 1IF4A 4FL7A 2QO8A 3RZ0B 3V7XA 3DD8A 3OYSA 1CVCA 1CAJA 1TBTX 3N3JA 3HKQA 3MYQA 5SZ3A 1YDBA 5G0CA 3U3AX 3S9TA 4PXXA 3CYUA 4ZWZA 5FLTA 4M2VA 1FSNA 1TE3X 4KUVA 3MHCA 5DSLA 1ZSBA 3D0NA 3P5AA 3S76A 3OKVA 2X7UA 1ZGEA 3V3IB 1BN4A 1UGCA 5FDCA 4CQ0A 4Y0JA 4JSWA 5CA2A 1DCBA 1CNHA 3F4XA 1RJ6A 4RIVA 4ZWXA 1CINA 4KV0A 1URTA 3D9ZA 4Q7SA 4QK3A 2WEOA 2GEHA 5AMLA 1HECA 2GD8A 2ABEA 4LP6A 1IF7A 3UYNA 5BRUA 2NWZA 3M5TA 3RZ8A 3U7CA 3M67A 1Z93A 4QSBA 3DC9A 4ZAOA 1RZBA 2H4NA 1BNUA 1CAMA 3S97A 4BF6A 1JD0A 1H9QA 2NNOA 2CBCA 1CVEA 1BN1A 3QYKA 5EKJA 4CNRA 4HF3A 4Q87A 1IF8A 4WL4A 1FSQA 4PQ7A 3CA2A 1HCAA 3S78B 4QJMA 1HVAA 5BRWA 2CABA 3S75B 4FIKA 4BF1A 1CCSA 1CVDA 1BICA 2FMZA 6CA2A 5JESB 3BL1A 1CNKA 4YVYA 3RG4A 3RJ7A 3V2JA 2OSFA 1LZVA 1IF5A 4Q90A 3RLDA 3KOIA 4E3GA 4QJWA 2ILIA 1G1DA 3DCCA 2AW1A 4KUWA 5DSNA 3MZCA 4YGNA 4R59A 1I9PA 3IAIA 5DSMA 4MLTA 3OKUA 3P4VA 2Q1BA 1JV0A 2VVAX 3PO6A 1LUGA 3S73B 1KWQA 2NXSA 1RZCA 4HBAA 1AVNA 1ZFKA 1Z9YA 1ZGFA 1H9NA 2NNGA 4PZHA 1CAZA 3B1BA 5E5UA 4Q7VA 3JXHC 1G46A 4R5BA 1CNBA 1IF6A 1A42A 1G53A 1BZMA 1YO1A 4MDGA 1YDAA 3M5SA 3P44A 3M98A 2H15A 3IGPA 3MNHA 3MNJA 4Q06A 4Q09A 2NNVA 3F7BA 1JCZA 3NB5A 1FLJA 1OKNA 4RFDA 3RYZA 1CAHA 4QIZA 4QSJA 1I91A 4ITPA 8CA2A 1FR4A 4KP8A 5FDIA 5EHEA 1MOOA 1AZMA 4MDMA 3HFPA 4WW8A 5DSRA 1FR7A 1THKA 4UOVA 5EIJA 3CZVA 3M3XA 5E2RA 3RYJB 3T84A 4CNWA 5SZ2A 1UGBA 3T85A 2F14A 3K7KA 5JGTB 4R5AA 4YGKA 4CNVA 1BNMA 3D8WA 2HKKA 3MHLA 5G0BA 4FRCA 3Q31A 1CAKA 1YO0A 3MMFA 4RIUA 1UGFA 1ZE8A 4M2UA 4XFWA 9CA2A 2FNKA 3HKTA 1CNCA 3IEOA 3KWAA 3S77B 5DSKA 1G45A 1KEQA 2WEHA 5A6HA 4Q7WA 3S8XA 5AMGA 1TEQX 1XQ0A 1J9WA 4ZX0A 3V3FA 4FPTA 1LG5A 4N16A 4Q6DA 2POVA 5SZ0A 4M2WA 5BRVA 4Q8ZA 4RUXA 3S72B 5E2NA 1RAZA 1UGEA 5FNJA 4ETQC 1CVFA 4QK2A 5G01A 12CAA 1UGDA 2QOAA 1YDCA 4KNJA 3M2YA 4KNNA 2Q1QA 5DRSA 1OKLA 5FNGA 3DVBA 2NWPA 5DSPA 4ITOA 4RFCA 1RZAA 3CAJA 3NI5A 4WUPA 3MNKA 1F2WA 2W2JA 3SBHA 4LU3A 5EH5A 3PYKA 1CIMA 2IT4A 1AM6A 3JXFA 3MHMA 4K0ZA 4YWPA 5JDVB 1XEVA 4Q83A 5BNLA 4HT2A 1RJ5A 3RZ5A 1I90A 2WEJA 5EHVA 5EKHA 3TVOX 4KNIA 3IBLA 1CVAA 3DC3A 1XPZA 2EU3A 1ZFQA 4QSAA 2NNSA 3SAXA 1G0FA 2NMXA 4L5UA 4YX4A 5L6KA 4JSAA 5EHWA 5SZ5A 1CRMA 1G52A 4CACA 3D93A 1KOQA 3V3HB 2CA2A 4QJXA 4MTYA 3IBNA 5FLOA 2FOSA 3VBDA 1BN3A 3P55A 3KNEA 4Z1NA 4Q9YA 1FQMA 5BYIA 3KS3A 4JSSA 1CNYA 4Q8YA 4QJOA 4XE1A 4K0TA 3U47A 4E9OX 2Q38A 1G54A 4WW6A 4QJPA 1UGGA 2NWOA 2EU2A 4C3TA 5SZ1A 1RZEA 3MHOA 1TH9A 5FL4A 3UYQA 3KKXA 3MNAA 3HLJA 2HNCA 5JG5B 4Q6EA 4YXUA 5DOGA 3M40A 4KAPA 1CNXA 3K2FA 2AX2A 4L5VA 3M2NA 2FMGA 3M2XA 5E2KA 2POWA 3GZ0A 1YDDA 3KLDB 1HCBA 4K0SA 4K13A 4RUZA 2HOCA 1CA2A 4BCWA 4IDRX 2FOQA 5FLRA 4CNXA 3M1WA 3V2MA 3EFTA 1I9OA 5DSJA 1OQ5A 4LHIA 5J8ZA 5DOHA 4E3HA 1Y7WA 1G6VA 2FNMA 3FFPX 5JGSB 5DSIA 2HD6A 1CVBA 3T82A 3P5LA 5FNIA 3M2ZA 3JXGA 3ZP9A 3DAZA 1CNGA 3K34A 1I9LA 2O4ZA 3DD0A 4FVNA 4XIXA 1G3ZA 1TB0X 3NJ9A 2CBEA 2POUA 3DVDA 5CLUA 4K1QA 1LGDA 5A25A 1KWRA 1ZSAA 4DZ9A 5IPZA 5FLPA 4JSZA 4ZWIA 1IF9A 1CAOA 4M2RA 4RUYA 5FLQA 4E49A 1TG9A 3M14A 3F7UA 4IWZA 5SZ7A 1CANA 1FSRA 1DCAA 4HEYA 2NN7A 4YGFA 3OIKA 1I8ZA 4MO8A 2X7TA 3OIMA 4X5SA 4ZX1A 4E4AA 1G0EA 3ML2A 3RYVB 3B4FA 3W6IA 3N2PA 5LMDA 3P3HA 3ML5A 3M5EA 5JEGB 2NXTA 4QEFA 4PYYA 5EOIA 1BCDA 1CALA 1I9NA 2CBAA 3MHIA 4FVOA 4YGLA 2WEGA 4YXIA 4Q08A 3N0NA 2ZNCA 5EZTX 4Q49A 3OY0A 4TWMA 1FQNA 3HKUA 3MNUA 5EH8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2OSM A;  1BNQ A;  1G48 A;  4HT0 A;  3S74 B;  4CA2 A;  5AMD A;  2FOY A;  3RZ7 A;  5C8I A;  3N4B A;  3MDZ A;  1HEB A;  3DVC A;  3RYX B;  3TVN X;  1ZH9 A;  4MLX A;  3D92 A;  5FL5 A;  5FLS A;  5JEH B;  4XZ5 A;  1FQL A;  1CRA A;  3KON A;  1G4O A;  1EOU A;  4QIY A;  4Z1J A;  4COQ A;  4QK1 A;  2FOV A;  1CVH A;  1CNJ A;  1V9I C;  4QJ0 A;  2WD3 A;  5FNM A;  4QTL A;  4E3D A;  3M04 A;  4MDL A;  1HED A;  1OKM A;  5CAC A;  3KIG A;  3W6H A;  5EH7 A;  3V3J A;  4Q7P A;  3DA2 A;  3RZ1 B;  3FW3 A;  1BNW A;  3KOK A;  4Q81 A;  1Z97 A;  3ZNC A;  1CCT A;  5FNH A;  5JQT A;  4ZWY A;  4KP5 A;  3V3G B;  3V5G A;  4Q0L A;  1RZD A;  5FL6 A;  4Q8X A;  1DMY A;  1CNW A;  3M1K A;  2QP6 A;  4WR7 A;  3S71 B;  3MNI A;  5SZ4 A;  1V9E A;  3RYY A;  3DV7 A;  4YXO A;  4GL1 X;  4HEW A;  1CIL A;  3PJJ A;  5HPJ A;  1CNI A;  4KUY A;  2FNN A;  3M1J A;  5E5R A;  2HFW A;  1YO2 A;  1KOP A;  3DBU A;  5L3O A;  3T83 A;  3HKN A;  3MWO A;  3BET A;  3RG3 A;  2FOU A;  1CA3 A;  3BL0 A;  4QY3 A;  4YHA A;  1H4N A;  3P3J A;  1TEU X;  3OIL A;  4N0X B; 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