1KEQA

Crystal structure of f65a/y131c carbonic anhydrase v, covalently modified with 4-chloromethylimidazole
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
GTRQSPINIQWKDSVYDPQLAPLRVSYDAASCRYLWNTGYAFQVEFDDSCEDSGISGGPLGNHYRLKQFHFHWGATDEWGSEHAVDGHTYPAELHLVHWNSTKYENCKKASVGENGLAVIGVFLKLGAHHQALQKLVDVLPEVRHKDTQVAMGPFDPSCLMPACRDYWTYPGSLTTPPLAESVTWIVQKTPVEVSPSQLSMFRTLLFSGRGEEEDVMVNNYRPLQPLRDRKLRSSFRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of F65A/Y131C-methylimidazole carbonic anhydrase V reveals architectural features of an engineered proton shuttle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords F65A/Y131C-MI Carbonic Anhydrase V
molecule tags Lyase
source organism Mus musculus
total genus 73
structure length 238
sequence length 238
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2001-11-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1keqA00
1LGDA 4CACA 3NI5A 5FLSA 4RIUA 3M5SA 1EOUA 4CNXA 1THKA 5DSRA 1BNNA 1IF8A 2HD6A 1AVNA 3K34A 1CNHA 1IF9A 3D93A 3MNIA 4Q0LA 3DCWA 4Q06A 1Z9YA 5E2SA 5JQTA 1G53A 2OSMA 1G0FA 3S73B 2NNSA 3S9TA 3KOIA 1F2WA 3HKQA 3F7BA 3MNAA 4G7AA 5J8ZA 1RAYA 4KNIA 4KNMA 1CVFA 2X7SA 3KWAA 5EIJA 3T83A 1CAYA 4YXOA 1URTA 3IGPA 5EKJA 1CNCA 4HEYA 5FLOA 3RYXB 4QJWA 3HFPA 3M5EA 4E3GA 4BCWA 1KEQA 5FNMA 4XIWA 2W2JA 2QOAA 4BF1A 3CAJA 1CAZA 2CBAA 4L5UA 1CAKA 2CBEA 3M96A 4FPTA 5DVXA 5FNIA 4HBAA 1FR7A 3IAIA 4QSAA 3BETA 4RFDA 3HLJA 4C3TA 3EFTA 3F8EA 3DC3A 1DMXA 1KOPA 1HCAA 4JSZA 4Q7SA 3W6HA 2FMGA 4YYTA 3S72B 3T5UA 1FSQA 1KOQA 5FNKA 3T84A 3V3HB 1UGFA 1Y7WA 4WR7A 3FE4A 1CVCA 1AZMA 4FIKA 4PYYA 1HUGA 5JGTB 2HL4A 4K13A 4LHIA 1CNJA 1G3ZA 4M2VA 3IEOA 4ETQC 2OSFA 8CA2A 5IPZA 4MLTA 1XEGA 4R5AA 1I90A 5SZ1A 5JG3B 5DSMA 4JSAA 1CNIA 4YGJA 5E5RA 3N2PA 3M04A 4PZHA 2X7UA 2FMZA 1ZGFA 3DC9A 1YDAA 3S71B 1ZE8A 5BRVA 2POVA 4JSSA 2CABA 5L6KA 1G1DA 1FQNA 5FNLA 4QIYA 3N4BA 3MHOA 1I9MA 3L14A 1G4JA 1TB0X 2WEGA 3UYQA 1T9NA 2ZNCA 1DMYA 1OKMA 3PO6A 3N0NA 5FLQA 4QJ0A 3IBUA 1RZDA 3MNKA 1TG3A 1HCBA 2GD8A 4E3FA 1FQLA 4Q8ZA 3RZ5A 3RLDA 2NNGA 5FLPA 4YHAA 3V3IB 3M5TA 2NWPA 9CA2A 4YGKA 2WEJA 1OKNA 2F14A 4QJOA 4WW6A 2FNKA 1XQ0A 3ZNCA 3NB5A 5SZ7A 4QJMA 3MNHA 4FRCA 3JXGA 3V3FA 1TBTX 1TH9A 1HEAA 5EOIA 4KV0A 5LMDA 5CLUA 1BZMA 1JD0A 1Z97A 3B4FA 4BF6A 4YGNA 1MOOA 1G48A 3DVBA 4Q7PA 3M2YA 2CBBA 2NNVA 1HECA 4MDLA 4CNRA 1I9PA 3MHLA 3P3JA 1BNQA 1G6VA 3Q31A 1CAIA 4DZ7A 3MHMA 3RJ7A 2CBCA 4JS6A 4X5SA 5DSNA 1CVHA 7CA2A 3KIGA 2AW1A 3IBNA 3N3JA 1JCZA 5FL4A 5FDIA 5SZ2A 3P58A 3S8XA 4N0XB 4QIZA 1BN4A 4WW8A 3M2NA 2FOSA 3V2MA 4QJPA 4CQ0A 5JDVB 1CCTA 5JEGB 2NWOA 3OY0A 4YX4A 1G46A 4ZX0A 1CA3A 1RZEA 3M1WA 5EH7A 1H4NA 3GZ0A 1ZFQA 4Q08A 2EU2A 3SAPA 4LP6A 1G45A 4WUPA 3D92A 3RZ7A 4E4AA 4QSIA 4TWLA 4KNJA 4G0CA 4K0SA 4N16A 5DOGA 3HKNA 4ZAOA 3TVNX 2NMXA 3LXEA 3P4VA 5SZ4A 2HFWA 1CA2A 1YDBA 3P5AA 3SBIA 1CVEA 1UGAA 2AX2A 3DVCA 4Q8XA 4FU5A 1CCSA 4M2UA 4R5BA 5E2RA 1UGGA 3MZCA 1IF7A 4XIXA 2CA2A 1BV3A 5AMDA 2IT4A 5G0BA 2FOUA 1G4OA 5AMGA 4ZWXA 2ABEA 5HPJA 4MLXA 5DSJA 1CAOA 4K1QA 5L3OA 3RYJB 2HOCA 1BN1A 1G54A 2VVAX 4KP8A 2HKKA 5BRUA 3S76A 4ZWYA 2GEHA 3V3GB 1CAMA 2EU3A 5E2KA 1ZNCA 3MNJA 1IF6A 1HUHA 5JEPB 3KNEA 5DSIA 1H9QA 4QK2A 3MDZA 1I9NA 1RZBA 1FQMA 3V5GA 4HEWA 3RYVB 4KP5A 1CNBA 1CAHA 3OYSA 1YO1A 3MHIA 3T5ZA 4QK1A 1KWQA 4YGLA 4XFWA 3P44A 5EHEA 5EZTX 4E49A 1OQ5A 3OIKA 5FL5A 1BN3A 4WL4A 2ILIA 2NWYA 5FLRA 1RZAA 1V9IC 3M40A 4K0ZA 5JEHB 4Z1JA 1FQRA 3RYZA 2WEHA 1H9NA 2EZ7A 4YWPA 1UGDA 1JV0A 4Z1NA 1Z93A 4WUQA 5SZ0A 3S97A 3D9ZA 5EH8A 2O4ZA 4M2WA 1FR4A 3MMFA 3CZVA 1CINA 4GL1X 4Q07A 1BCDA 4YXIA 5DSPA 3RGEA 2FOYA 4CNVA 4TWMA 5CA2A 3M67A 4QY3A 4Q7VA 3DCSA 4XE1A 2FOQA 1V9EA 3M14A 4KUWA 4L5WA 3DD0A 1RJ6A 4Q87A 3MHCA 3U47A 3KONA 1RZCA 4YGFA 4QK3A 5FNJA 4FVOA 5BNLA 3BL1A 1XPZA 1HEDA 1ZGEA 4K0TA 4Q6DA 1YO2A 2WEOA 1I9QA 5C8IA 4RIVA 4IDRX 3U45X 4ZWZA 12CAA 3RZ0B 4Q6EA 1LUGA 5JGSB 4RUXA 3DCCA 3DAZA 1IF4A 2POUA 1RJ5A 4HT0A 4LU3A 5FNHA 3CYUA 4JSWA 4M2RA 2FW4A 2QP6A 1CVBA 5E28A 4Q09A 5DOHA 4YVYA 4CA2A 4RN4A 3M1KA 1LG5A 4CNWA 4KUYA 6CA2A 2NN7A 4DZ9A 3SAXA 5DRSA 4HF3A 4L5VA 1MUAA 3OIMA 1CANA 5A6HA 4ZX1A 5EHVA 2HNCA 3F7UA 1RAZA 1A42A 1BNTA 1OKLA 3F4XA 1LG6A 2FOVA 1KWRA 3QYKA 1XEVA 2NNOA 4RH2A 5FL6A 2Q1BA 3D0NA 3M2XA 4MDGA 4QSBA 5G01A 3TMJA 3S78B 3PJJA 1DCBA 5E2NA 3M2ZA 5CJFA 3S74B 3P5LA 5SZ5A 4ZWIA 1HVAA 3KS3A 4MDMA 5SZ6A 1J9WA 2NWZA 4COQA 3P55A 5E5UA 1CIMA 3DV7A 1ZH9A 3P3HA 3KKXA 1CVDA 1LZVA 3SBHA 5DSKA 3W6IA 2NN1A 3OYQA 1FSRA 3S77B 1ZFKA 3V2JA 2QO8A 1CZMA 1UGBA 5EHWA 3M1JA 4MO8A 2NXTA 4UOVA 1CCUA 1CNXA 1ZSCA 3DA2A 2FNMA 3ML5A 1CRAA 4Q81A 3T82A 3K2FA 3U3AX 3DBUA 4ITPA 4QSJA 3RZ1B 3S75B 3RYYA 3OKVA 3MNUA 3BL0A 4KUVA 1TTMA 4Q99A 4Q8YA 2POWA 3KOKA 4Z1EA 4YXUA 4PYXA 2Q38A 4KAPA 3HKTA 1YDDA 4Z0QA 5G0CA 3R16A 3VBDA 3HKUA 1TE3X 1CNKA 5DSQA 4PXXA 2FNNA 1I9OA 1UGCA 1TEQX 5DSOA 3DVDA 5JG5B 1AM6A 4ITOA 2WD2A 3C7PA 4E5QA 5EH5A 1I91A 2X7TA 3IBIA 4Z1KA 1FLJA 3JXHC 3ML2A 4FVNA 3FFPX 3B1BA 5EKMA 1FSNA 1YO0A 5FDCA 4ILXA 4HEZA 3KLDB 2NXSA 1DCAA 4E3HA 1TEUX 3NJ9A 5A25A 4QJXA 1IF5A 1HEBA 4KNNA 4Q83A 3M98A 5BYIA 1I8ZA 1CVAA 3MWOA 1CNGA 5E2MA 4RUYA 5AMLA 3DD8A 3FW3A 3K7KA 2VVBX 1G0EA 4Q9YA 4PQ7A 1YDCA 3MYQA 3RG4A 2NXRA 2WD3A 1CRMA 5SZ3A 1BNMA 3U7CA 3IBLA 5CACA 3CA2A 1BICA 4MTYA 4Q49A 5DSLA 3PYKA 1BNWA 1I9LA 5EKHA 2H4NA 2Q1QA 1ZSBA 3RZ8A 1CALA 5FLTA 3R17B 3EFIA 5JQ0A 4QEFA 1UGEA 1CILA 5JESB 4HT2A 1BNUA 3V3JA 3M3XA 1TG9A 4RFCA 1CNWA 4IWZA 4Q7WA 3HS4A 3M1QA 5BRWA 3RG3A 1G52A 3ZP9A 4XZ5A 4HU1A 3OKUA 5FNGA 3JXFA 1CNYA 4FL7A 4E9OX 2CBDA 1BNVA 3OILA 3TVOX 3UYNA 4QTLA 1ZSAA 5G03A 4Y0JA 4Q78A 1CAJA 4RUZA 3V7XA 3T85A 4R59A 4E3DA 4Q90A 2H15A 3D8WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LGD A;  4CAC A;  3NI5 A;  5FLS A;  4RIU A;  3M5S A;  1EOU A;  4CNX A;  1THK A;  5DSR A;  1BNN A;  1IF8 A;  2HD6 A;  1AVN A;  3K34 A;  1CNH A;  1IF9 A;  3D93 A;  3MNI A;  4Q0L A;  3DCW A;  4Q06 A;  1Z9Y A;  5E2S A;  5JQT A;  1G53 A;  2OSM A;  1G0F A;  3S73 B;  2NNS A;  3S9T A;  3KOI A;  1F2W A;  3HKQ A;  3F7B A;  3MNA A;  4G7A A;  5J8Z A;  1RAY A;  4KNI A;  4KNM A;  1CVF A;  2X7S A;  3KWA A;  5EIJ A;  3T83 A;  1CAY A;  4YXO A;  1URT A;  3IGP A;  5EKJ A;  1CNC A;  4HEY A;  5FLO A;  3RYX B;  4QJW A;  3HFP A;  3M5E A;  4E3G A;  4BCW A;  1KEQ A;  5FNM A;  4XIW A;  2W2J A;  2QOA A;  4BF1 A;  3CAJ A;  1CAZ A;  2CBA A;  4L5U A;  1CAK A;  2CBE A;  3M96 A;  4FPT A;  5DVX A;  5FNI A;  4HBA A;  1FR7 A;  3IAI A;  4QSA A;  3BET A;  4RFD A;  3HLJ A;  4C3T A;  3EFT A;  3F8E A;  3DC3 A;  1DMX A;  1KOP A;  1HCA A;  4JSZ A;  4Q7S A;  3W6H A;  2FMG A;  4YYT A;  3S72 B;  3T5U A;  1FSQ A;  1KOQ A;  5FNK A;  3T84 A;  3V3H B;  1UGF A;  1Y7W A;  4WR7 A;  3FE4 A;  1CVC A;  1AZM A;  4FIK A;  4PYY A;  1HUG A;  5JGT B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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