1RZDA

X-ray analysis of metal substituted human carbonic anhydrase ii derivatives
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title X-ray analysis of metal-substituted human carbonic anhydrase II derivatives.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1993-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1rzdA00
1ZH9A 4R5BA 1IF5A 2CBAA 3IAIA 3MHLA 2WEHA 5JEPB 1XEVA 4HT0A 1I9NA 3UYNA 3PO6A 1CNWA 4PYYA 1CAIA 5DSKA 5LMDA 3U45X 2NXRA 4Q6EA 4RUZA 3V3IB 1Z93A 2WEOA 3DCWA 4XZ5A 1JD0A 4QK3A 3RLDA 3JXGA 3P3JA 3S73B 1CRAA 4M2UA 5DSNA 2HOCA 1V9IC 4UOVA 5JGSB 3NJ9A 4YXUA 3R16A 3RYYA 4YXOA 1HEDA 1DMXA 2WD2A 2OSMA 1CAKA 5DSRA 4YYTA 3RZ7A 4CNWA 1CVHA 2NWYA 4L5WA 5E2KA 5HPJA 5C8IA 3EFIA 3TMJA 3M1KA 2X7UA 4Q7VA 2POVA 3K34A 2VVAX 3KOKA 3CA2A 3OYSA 3MNJA 1AZMA 5JGTB 4HU1A 4M2VA 1UGBA 1G53A 2NNGA 3PJJA 1LGDA 4IWZA 4CACA 1TEQX 4M2RA 4E3HA 3N2PA 5E2RA 5FNHA 4Q08A 3P3HA 1DCAA 1JV0A 3S77B 2QO8A 4WUPA 3D93A 1CVEA 1BCDA 1FSNA 5DOGA 4Q81A 4FVOA 5AMGA 3D9ZA 4QJMA 4HEWA 4RUXA 1TBTX 2ILIA 5SZ4A 1OKNA 2NNSA 4DZ7A 3FE4A 1MUAA 1UGAA 5JEGB 2CBEA 1ZGFA 3MHCA 3HKTA 3SAXA 3MNAA 1AVNA 3MYQA 4R59A 4Z1KA 3S75B 1CAOA 3MNKA 3KS3A 1ZSAA 3S9TA 3V3FA 4K0ZA 1I90A 5EHWA 3MNUA 3P58A 1TG3A 8CA2A 3M1QA 2VVBX 4N0XB 2NXSA 1HUGA 2HL4A 4BF1A 2AX2A 1TEUX 4PXXA 4RFCA 3KKXA 4KAPA 4MDLA 3KONA 3FW3A 2X7TA 2FNKA 3DVBA 1UGGA 5AMLA 4KNMA 2IT4A 4K13A 3VBDA 1LZVA 3SBIA 3S74B 3F7UA 5L6KA 4MLTA 3MMFA 5FLOA 5BRUA 1CVDA 4E9OX 1G52A 4YGFA 5EZTX 2NWPA 4Q8ZA 2FOYA 5FLPA 1H9NA 4RFDA 4ZWIA 3RZ5A 3M14A 1YO2A 1CAMA 3B1BA 2NN7A 1UGCA 3ML2A 4QJXA 2QOAA 2H4NA 1YDDA 3S71B 3HFPA 4JSZA 4ZWYA 3W6IA 3TVNX 1YO1A 5IPZA 1AM6A 1HVAA 1H4NA 4LP6A 1XQ0A 1HEAA 4KUVA 2EU3A 5DSQA 1I9QA 4YWPA 5JG3B 4Q8XA 5L3OA 1G46A 3RYZA 3BETA 2FOSA 4ITPA 4HT2A 4ZX0A 4Q7SA 3OIKA 4Q83A 4KNNA 1IF8A 3OYQA 3QYKA 4Q49A 3T82A 3M98A 9CA2A 4CQ0A 3M67A 1CA3A 1UGFA 2WEGA 3KOIA 1FQLA 1G6VA 1G0EA 3V5GA 2NNOA 5JDVB 3Q31A 3DVCA 4E3DA 1FQRA 4K0SA 3W6HA 1FSRA 4L5UA 3BL0A 4TWLA 4DZ9A 1CCUA 4FPTA 1T9NA 1KWRA 1CCTA 3DCCA 1Z9YA 4XE1A 4K0TA 6CA2A 4Q06A 4G7AA 12CAA 1BN1A 5FNMA 2POUA 1RZEA 1KOPA 1CIMA 3RYJB 5DSPA 5SZ2A 1RZDA 1RJ6A 4WUQA 4YHAA 4LHIA 1YDCA 1LG5A 5FNKA 1IF9A 2WEJA 4COQA 5CJFA 4HEYA 1BNVA 5FNJA 1OKLA 4QEFA 4G0CA 3IBLA 5EH8A 4HBAA 1TB0X 4PZHA 3S78B 1HCAA 2HNCA 2CABA 1FSQA 2GD8A 4RH2A 4QJOA 1FQNA 3IBNA 4E5QA 3IGPA 3S72B 4RN4A 1BNWA 3BL1A 3S8XA 4YGJA 4QJWA 5DSMA 2NWOA 1XPZA 4BCWA 1G0FA 4MDMA 1CINA 4RUYA 3K2FA 5BYIA 1G45A 2FMGA 3KNEA 4ZWZA 2FNNA 3M1JA 4JSWA 3RG4A 3CYUA 1RAZA 3P5AA 3M5EA 2EU2A 4LU3A 4FIKA 1HECA 4TWMA 4MO8A 5EKHA 3M3XA 3RJ7A 1A42A 1JCZA 4Q7PA 1HUHA 3MDZA 4KNIA 3M04A 1RZAA 1I91A 3M2NA 3N3JA 4ITOA 3D92A 5SZ7A 4Q90A 3U47A 4YGLA 2EZ7A 3DBUA 5G0CA 1H9QA 3D8WA 1ZFKA 3U7CA 4KP5A 5E28A 2FOVA 3TVOX 4E49A 3LXEA 1KEQA 1UGDA 4XIXA 5SZ1A 2CBBA 2CBDA 1TH9A 3OKVA 4HF3A 4KNJA 1LG6A 4Q0LA 4Q8YA 3V2JA 1IF4A 1BICA 1Y7WA 4Q09A 3JXFA 3DA2A 4QSBA 3T84A 1I9MA 3HKQA 3OILA 5SZ5A 2AW1A 3KLDB 5E2NA 4Z0QA 5E2MA 5BRVA 1I9OA 4QIZA 1CAJA 5DRSA 3HS4A 5SZ6A 4E3GA 5DSLA 1BNNA 2X7SA 2O4ZA 4ZAOA 4MLXA 3MZCA 4ZWXA 1TE3X 1TTMA 1OQ5A 2NMXA 1FLJA 1CNGA 3M2ZA 4PQ7A 3GZ0A 5FNIA 4CA2A 3S97A 4M2WA 4C3TA 3IBUA 3T83A 4XFWA 4Z1JA 1CNCA 5JG5B 5EHEA 3R17B 5J8ZA 5AMDA 5EH5A 5CLUA 1CRMA 4QSJA 1BNMA 2ZNCA 3V2MA 1CNJA 3F8EA 1KOQA 1J9WA 1CNHA 4MDGA 3DD8A 4YXIA 3B4FA 3CZVA 4WL4A 1RZBA 1OKMA 2Q38A 3MHOA 4N16A 1CCSA 4GL1X 1EOUA 3DD0A 2FW4A 2HKKA 1ZSBA 3RZ1B 4QK2A 5E5UA 2CBCA 2HFWA 4Q07A 2FOUA 4YVYA 3HKUA 1CNBA 1CVFA 5A6HA 1CAHA 3DVDA 4X5SA 5JQ0A 4YGKA 4L5VA 4QY3A 1URTA 4Q99A 5FNLA 1CVAA 3ML5A 3IBIA 4QJ0A 4QSAA 1CAYA 1KWQA 3DV7A 1G4OA 3CAJA 3DC9A 4RIVA 3T85A 5FL4A 3UYQA 4YX4A 2NNVA 3N4BA 4FRCA 4IDRX 3V3HB 3F4XA 1CNYA 1DCBA 3V3JA 4E4AA 1DMYA 2OSFA 2NWZA 5EOIA 5DSIA 1CZMA 2ABEA 1FQMA 1I9PA 3DC3A 3T5UA 4QJPA 5JQTA 1BZMA 2NN1A 3MHIA 3FFPX 2W2JA 3P5LA 3RZ8A 5FLSA 2HD6A 5EKMA 4ILXA 1I9LA 4R5AA 2Q1BA 3MHMA 2WD3A 3SAPA 1CILA 1IF7A 4KP8A 4CNXA 3V3GB 1ZSCA 3RYVB 1CNIA 5EIJA 1CVBA 1RZCA 2H15A 5EKJA 3P4VA 3MWOA 1G4JA 4Q78A 4JS6A 2F14A 5FNGA 1BNUA 2FNMA 4KUYA 4Q9YA 4Q87A 1TG9A 3JXHC 4CNVA 7CA2A 1G3ZA 3MNHA 1V9EA 4Z1EA 5DSJA 3N0NA 3RYXB 5E2SA 3DAZA 4RIUA 5DSOA 4CNRA 1BN3A 3C7PA 4JSAA 4BF6A 1ZNCA 1IF6A 5BNLA 1HEBA 2FOQA 1G48A 1THKA 5BRWA 3K7KA 2POWA 1HCBA 3KIGA 4QIYA 4FVNA 4WR7A 5G01A 1I8ZA 3RZ0B 1CAZA 5FLRA 4ETQC 3ZP9A 4WW8A 5CA2A 3OIMA 1ZFQA 4K1QA 5FL5A 2CA2A 3T5ZA 1ZGEA 4FU5A 5G03A 3ZNCA 3OKUA 3MNIA 3RG3A 4Q6DA 3U3AX 4XIWA 4YGNA 5FLQA 4E3FA 1LUGA 3IEOA 1G54A 1ZE8A 3EFTA 4QK1A 5JEHB 3M5TA 2GEHA 2FMZA 3KWAA 4WW6A 4Z1NA 5EHVA 1BV3A 1BNTA 1CNKA 4QSIA 4HEZA 3M1WA 3SBHA 5SZ3A 1MOOA 4ZX1A 3HLJA 3M2YA 1Z97A 3M2XA 1BNQA 5FL6A 5A25A 1XEGA 1YDBA 5FDIA 3NB5A 5CACA 1CVCA 1YO0A 3HKNA 1CNXA 1G1DA 4KV0A 3P44A 2Q1QA 4QTLA 5FLTA 3V7XA 1RAYA 3F7BA 1BN4A 4Y0JA 3PYKA 5DOHA 1CALA 3S76A 3L14A 3M40A 2NXTA 1FR7A 2QP6A 3D0NA 3M96A 3NI5A 5FDCA 3DCSA 5JESB 1F2WA 1YDAA 3M5SA 3P55A 4KUWA 4JSSA 5E5RA 1CANA 4Q7WA 5EH7A 4PYXA 1CA2A 1UGEA 4MTYA 1RJ5A 4FL7A 3RGEA 5G0BA 3OY0A 5SZ0A 1FR4A 5DVXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZH9 A;  4R5B A;  1IF5 A;  2CBA A;  3IAI A;  3MHL A;  2WEH A;  5JEP B;  1XEV A;  4HT0 A;  1I9N A;  3UYN A;  3PO6 A;  1CNW A;  4PYY A;  1CAI A;  5DSK A;  5LMD A;  3U45 X;  2NXR A;  4Q6E A;  4RUZ A;  3V3I B;  1Z93 A;  2WEO A;  3DCW A;  4XZ5 A;  1JD0 A;  4QK3 A;  3RLD A;  3JXG A;  3P3J A;  3S73 B;  1CRA A;  4M2U A;  5DSN A;  2HOC A;  1V9I C;  4UOV A;  5JGS B;  3NJ9 A;  4YXU A;  3R16 A;  3RYY A;  4YXO A;  1HED A;  1DMX A;  2WD2 A;  2OSM A;  1CAK A;  5DSR A;  4YYT A;  3RZ7 A;  4CNW A;  1CVH A;  2NWY A;  4L5W A;  5E2K A;  5HPJ A;  5C8I A;  3EFI A;  3TMJ A;  3M1K A;  2X7U A;  4Q7V A;  2POV A;  3K34 A;  2VVA X;  3KOK A;  3CA2 A;  3OYS A;  3MNJ A;  1AZM A;  5JGT B;  4HU1 A;  4M2V A;  1UGB A;  1G53 A;  2NNG A;  3PJJ A;  1LGD A;  4IWZ A;  4CAC A;  1TEQ X;  4M2R A;  4E3H A;  3N2P A;  5E2R A;  5FNH A;  4Q08 A;  3P3H A;  1DCA A;  1JV0 A;  3S77 B;  2QO8 A;  4WUP A;  3D93 A;  1CVE A;  1BCD A;  1FSN A;  5DOG A;  4Q81 A;  4FVO A;  5AMG A;  3D9Z A;  4QJM A;  4HEW A;  4RUX A;  1TBT X;  2ILI A;  5SZ4 A;  1OKN A; 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