1TB0X

Effect of shuttle location and ph environment on h+ transfer in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 74
Loading diagram...

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H1 (13-18)EMPTY3H2 (21-24)TIV10 (241-244)AH1 (131-135)TIV3 (25-28)TIV11 (251-254)S1 (32-33)S8 (108-109)TI2 (34-37)S2 (39-40)TI4 (41-44)S6 (78-82)S3 (46-50)TVIII1 (75-78)TI5 (51-54)S10 (116-124)S5 (66-70)S12 (172-175)S4 (56-61)3H5 (164-166)AH3 (220-227)TIV4 (62-65)TIV5 (72-75)S7 (88-97)TIV6 (98-101)TI6 (100-103)TIV7 (105-108)S9 (112-113)S13 (191-196)TIV8 (108-111)S11 (141-150)3H3 (125-128)O1 (128-130)TI7 (137-140)TVIa1 (200-203)S14 (207-212)AH2 (158-163)TII1 (169-172)S15 (216-218)TIV9 (233-236)TI1 (8-11)TIV2 (18-21)3H4 (155-157)3H6 (181-184)Updating...
connected with : NaN
publication title Structural and kinetic characterization of active-site histidine as a proton shuttle in catalysis by human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase II
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1tb0X00
3K7KA 3MNJA 5FLRA 1CAJA 3HKQA 5CA2A 4Z1NA 3T83A 1G54A 3OIKA 5FL4A 1Z93A 4PZHA 1KEQA 2NXSA 2FOUA 1OKNA 3TVNX 5E5UA 3KNEA 2H15A 3OILA 1XEVA 4Q7SA 3DCSA 2POUA 1G3ZA 3DA2A 3U45X 4CNWA 3V3IB 5EHWA 1CILA 3N0NA 4FU5A 3M5SA 1TTMA 1IF8A 4FIKA 5CJFA 5DRSA 4HEYA 1CNYA 1FSQA 1CVFA 1UGBA 2FOVA 3IBLA 4MLXA 5G0CA 1F2WA 1ZSCA 5SZ2A 3CAJA 3V3GB 5JESB 5HPJA 3V2MA 3U47A 5G03A 3RYJB 1OQ5A 1CINA 1URTA 5SZ7A 5JEGB 5DSLA 3P55A 4KNIA 1I9NA 4MDMA 1J9WA 1ZFQA 3M1WA 1AM6A 4RUZA 2FNMA 3W6HA 4Q99A 4MTYA 5BYIA 1BNUA 4RUXA 1YDAA 1A42A 5DOHA 3V3JA 3PYKA 4E4AA 5DSIA 3S8XA 3BL0A 4PYXA 3P3HA 2HFWA 1AVNA 4Z1KA 4R5AA 1YO0A 4L5WA 4M2UA 1CAZA 1HCAA 3F7BA 3T82A 4YXOA 1UGAA 2Q38A 3M5EA 1H9QA 3IBIA 8CA2A 1HUGA 4CNVA 3RZ7A 1KWQA 3N4BA 3BL1A 3MYQA 4N16A 3RZ8A 1CAYA 3GZ0A 3MNIA 3MMFA 3BETA 4CQ0A 4QJXA 4CNRA 1CVAA 1BN3A 3HKUA 5FL5A 2VVAX 2EU2A 4ZWIA 4BF1A 3KLDB 4GL1X 1HEBA 5C8IA 5JG3B 1CRAA 2EU3A 4C3TA 2NWYA 4KNMA 1HEDA 3HS4A 3M2XA 3VBDA 1CIMA 2NNOA 4XFWA 4ETQC 4QJPA 1I9LA 4Q09A 3T5UA 1G4OA 2FMGA 1H9NA 3P5LA 4HF3A 1LG5A 4BCWA 5CLUA 3DV7A 1CA2A 1TG3A 4YXUA 3V3FA 1CNBA 1CALA 3EFIA 3KONA 1I9QA 5DSPA 1YO1A 4ZAOA 4XIWA 2NXTA 2CABA 5DSRA 2NNGA 5DOGA 1MUAA 3ZP9A 1IF7A 2W2JA 4ILXA 1CVCA 1BNQA 4PXXA 5EIJA 5G01A 4QSAA 5FLSA 4HT2A 1IF6A 1CNCA 3B1BA 2NN1A 4RN4A 5IPZA 2CA2A 4WR7A 4ZX0A 4QEFA 1ZH9A 1H4NA 2WEHA 3DVBA 3S71B 4YYTA 3P4VA 3S74B 1Y7WA 3T5ZA 1RZCA 3M2ZA 3ZNCA 3MHCA 5JGSB 6CA2A 4FL7A 2FNKA 5JGTB 1FSRA 3NJ9A 3NI5A 3L14A 4YGLA 5AMLA 1CNGA 5SZ6A 2WEGA 2NNVA 3CYUA 2WEJA 3RZ1B 2FW4A 4K0TA 4YGKA 1RAYA 4YHAA 5DSOA 5G0BA 3IEOA 4M2RA 1CNJA 4WW6A 1DCAA 5SZ3A 3NB5A 4Y0JA 1UGFA 4Q83A 3P44A 1XPZA 1I9OA 4QTLA 4YVYA 2GD8A 4HU1A 4G0CA 3DBUA 3FE4A 2HOCA 3M98A 4K0SA 2FMZA 1CVDA 3JXFA 3MDZA 4KP8A 1TEUX 2NWOA 5EH5A 1I9MA 5E2RA 3SBHA 3S78B 2NN7A 4Q8ZA 3RJ7A 4LHIA 3OYQA 3DD0A 4Q87A 1I90A 4Q8YA 3M5TA 1HUHA 1ZSBA 5FNKA 3D8WA 1FR4A 3UYNA 4Q06A 1G0EA 3RYYA 2ILIA 2HL4A 3HKNA 5BRWA 2EZ7A 2CBBA 3S76A 3B4FA 1RZBA 1HECA 5FLOA 4BF6A 3D9ZA 1BNNA 2WD2A 3M67A 2AX2A 1OKLA 4Q49A 5EZTX 1CNKA 5EKHA 4M2VA 4E9OX 2Q1QA 4IWZA 5LMDA 1CVEA 4M2WA 3MHIA 1BNMA 1XQ0A 1CAMA 1ZE8A 5EKMA 5BRUA 3MWOA 3UYQA 2Q1BA 4WL4A 4QSIA 4Z1JA 1CVHA 4ZWYA 4KUWA 4ITOA 4YWPA 3M1QA 4QK1A 4Q7VA 3PJJA 5FLPA 4E3FA 1CAHA 4Q7WA 4COQA 1UGGA 3S77B 3JXHC 2HD6A 5EOIA 1TBTX 4LP6A 5DSMA 5DSQA 5EKJA 3IBNA 5JQTA 3HKTA 3KS3A 3SBIA 12CAA 3MNUA 4Q6EA 1FQNA 4QJMA 2FOSA 5FNIA 5L3OA 3K34A 1CANA 5FNJA 3JXGA 1CA3A 4TWLA 1ZNCA 3MHLA 3U3AX 1BNWA 1FSNA 1MOOA 4XZ5A 5DVXA 4DZ7A 5A6HA 4XE1A 3D0NA 3KKXA 4JSAA 1YDCA 4MO8A 5FDIA 3M2NA 3N3JA 3OKVA 5DSNA 1RZDA 4R59A 4WW8A 5AMGA 3M1JA 3P3JA 1BNTA 2NMXA 4L5UA 1CNWA 3SAXA 1IF4A 2POVA 3ML5A 4ZX1A 3R16A 1UGEA 5E2KA 4R5BA 5L6KA 1RZAA 1FQMA 3V2JA 4RH2A 4YGFA 3T85A 4MLTA 3M3XA 5E5RA 2CBAA 1FR7A 1LZVA 3HLJA 3CZVA 2O4ZA 1CRMA 3P5AA 2WD3A 3RG4A 4YGNA 3FW3A 5E2SA 3KOKA 1JV0A 4K0ZA 4IDRX 3M2YA 4MDGA 4QIYA 3RG3A 1BICA 4E3DA 2ABEA 3OIMA 4Q0LA 3U7CA 3KOIA 4CA2A 4Q6DA 4UOVA 4HT0A 1FQRA 1CCUA 4N0XB 2FOQA 1BNVA 4Z0QA 1I91A 1I8ZA 4JSWA 4RUYA 5EH8A 3S97A 4CNXA 2X7UA 4RFDA 3RYZA 1G48A 3DCWA 3OY0A 1KOQA 1YDBA 3DAZA 1KWRA 1G45A 5FLQA 3V7XA 2OSMA 1ZSAA 4X5SA 4E5QA 5DSJA 5FNGA 1ZGFA 3MHOA 3MZCA 3IGPA 4Q81A 3TMJA 4G7AA 1HVAA 3KIGA 9CA2A 5JDVB 3OYSA 2QO8A 3DC3A 1ZFKA 4ZWZA 2POWA 1T9NA 3TVOX 7CA2A 3RLDA 4K1QA 5JEPB 4QJOA 4RFCA 4Q07A 4CACA 1TE3X 1V9EA 1BV3A 1CAIA 3MNAA 4QJ0A 5BNLA 1G0FA 2HNCA 4XIXA 4E3GA 1KOPA 3RZ0B 3MHMA 1CZMA 4Z1EA 1DCBA 1JCZA 1UGDA 4K13A 3HFPA 1G1DA 4WUPA 2NXRA 3F8EA 1YDDA 3M14A 3ML2A 1RJ5A 3RGEA 3S72B 3SAPA 2F14A 3M04A 4Q8XA 1G6VA 2QP6A 3DVCA 3MNKA 5EH7A 3CA2A 2FNNA 5E28A 5FNLA 4Q08A 1XEGA 3M1KA 1I9PA 5AMDA 1G52A 2QOAA 5FDCA 4E49A 3W6IA 3V3HB 3DVDA 4QY3A 4QK2A 3C7PA 3T84A 4FPTA 2IT4A 1BN4A 1UGCA 3MNHA 2OSFA 3M40A 1BCDA 1V9IC 3D92A 2X7TA 2CBEA 5SZ0A 2FOYA 4ITPA 3K2FA 3OKUA 2GEHA 3RYXB 4YGJA 3QYKA 3F4XA 3P58A 4JS6A 2X7SA 1IF5A 5SZ4A 3S73B 4WUQA 3KWAA 5EHEA 4FVNA 4HBAA 3S9TA 2NWPA 4QSBA 1RAZA 4Q90A 1OKMA 1TB0X 1HCBA 5SZ1A 5BRVA 4L5VA 1FQLA 1CNIA 1BZMA 1LGDA 1CVBA 1JD0A 1CAOA 4KP5A 3D93A 2HKKA 3IAIA 1CCTA 5FNHA 4E3HA 4QK3A 2CBCA 4KV0A 3EFTA 3LXEA 3M96A 2NWZA 1FLJA 3R17B 4JSSA 1Z9YA 1LG6A 4Q7PA 3RZ5A 1HEAA 1TEQX 4MDLA 3DC9A 1BN1A 3Q31A 4QIZA 3DD8A 4Q78A 4Q9YA 1RJ6A 2AW1A 1G46A 3FFPX 4LU3A 4ZWXA 3V5GA 5JG5B 5JQ0A 4YX4A 1DMYA 1CAKA 1EOUA 5FLTA 3IBUA 4QSJA 1AZMA 1CNXA 4PYYA 5J8ZA 5CACA 5FL6A 2CBDA 3DCCA 2WEOA 2ZNCA 5JEHB 3F7UA 4HEZA 5SZ5A 1TH9A 4PQ7A 4RIVA 1G53A 1ZGEA 4FVOA 3RYVB 5E2MA 2H4NA 1CCSA 4HEWA 4QJWA 4RIUA 5EHVA 4DZ9A 5DSKA 1Z97A 2VVBX 5A25A 5E2NA 2NNSA 4YXIA 4FRCA 5FNMA 4KAPA 3S75B 1G4JA 1LUGA 4KNJA 4KUYA 1YO2A 4JSZA 1TG9A 1IF9A 1RZEA 3PO6A 4KNNA 1THKA 4TWMA 1CNHA 4KUVA 3N2PA 1DMXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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